UNIVERSIDAD TCNICA DE MACHALA

UNIDAD ACADMICA DE CIENCIAS AGROPECUARIAS

CARRERA DE INGENIERA AGRONMICA

Portafolio de Bioqumica
Alumno:
Marcos Vinicio Siguencia Medina
Ciclo:
Tercer ciclo
Paralelo:
A
Profesor:
Ing. Jadan Verias Eudaldo Fales.
Machala-El Oro-Ecuador
2017
 ndice

Contenido
1. Introduccin .......................................................................................................................... 3
1.1 Objetivos ....................................................................................................................... 4
1.1.1 General .................................................................................................................. 4
1.1.2 Especficos ............................................................................................................. 4
2. Generalidades Bioqumicas. .................................................................................................. 5
2.1 Importancia de la Bioqumica para la agronoma ......................................................... 6
2.2 Composicin de la Materia viva. ................................................................................... 6
2.3 Descripcin bioqumica de tipos de clulas. ................................................................. 7
2.3.1 Clula eucariota animal. ........................................................................................ 7
2.3.2 Clula eucariota vegetal. ....................................................................................... 9
2.3.3 Clula Bacteriana................................................................................................. 11
3. El agua y su bioqumica. ...................................................................................................... 13
3.1 El agua. ........................................................................................................................ 13
3.2 Ley de accin. .............................................................................................................. 13
3.3 Disociacin. ................................................................................................................. 13
3.4 pH. ............................................................................................................................... 13
3.5 Ionizacin. ................................................................................................................... 13
3.6 Ecuacin de Henderson............................................................................................... 14
4. Bioqumica de los iones. ...................................................................................................... 14
 1. INTRODUCCIN
La bioqumica estudia la base molecular de la vida. En los procesos vitales
interaccionan un gran nmero de substancias de alto peso molecular o
macromolculas con compuestos de menor tamao, dando por resultado un
nmero muy grande de reacciones coordinadas que producen la energa que
necesita la clula para vivir, la sntesis de todos los componentes de los
organismos vivos y la reproduccin celular.

Al conjunto de reacciones que suceden dentro de los seres vivos se le llama

metabolismo.

Actualmente se conoce a detalle la estructura tridimensional de las

macromolculas de mayor importancia biolgica, los cidos nucleicos y las
protenas, lo que ha permitido entender a nivel molecular sus funciones
biolgicas.

Gracias al conocimiento de la estructura de los cidos nucleicos, se

esclarecieron los mecanismos de transmisin de la informacin gentica de
generacin a generacin, y tambin los mecanismos de expresin de esa
informacin, la cual determina las propiedades y funciones de las clulas, los
tejidos, los rganos y los organismos completos.

Conocer a detalle la estructura de varias protenas ha sido muy til en la

elucidacin de los mecanismos de las reacciones enzimticas. Prcticamente
todas las reacciones que integran el metabolismo son reacciones enzimticas.
1.1 Objetivos

1.1.1 General

- Conocer los fundamentos de la bioqumica relacionada a las plantas

cultivadas y que son de inters para la agricultura incluyendo ciertas
partes de la amplia rama de la bioqumica vegetal.

1.1.2 Especficos

- Revisar los procesos tericos de la estructura y dinmica molecular de los

organismos a nivel celular, su importancia y relaciones internas y
externas.
- Desarrollar prcticas de investigacin que permita comprender como se
puede observar con evidencia experimental la dinmica molecular.
 UNIDAD I
2. GENERALIDADES BIOQUMICAS.
2.1 Importancia de la Bioqumica para la agronoma
La bioqumica es una subdisciplina de la qumica. Es muy importante, porque es
la rama de la qumica que estudia los seres vivos, especialmente la estructura y
funcin de sus componentes qumicos especficos, como son las protenas,
carbohidratos, lpidos y cidos nucleicos, adems de otras pequeas molculas
presentes en las clulas.

2.2 Composicin de la Materia viva.

Elementos qumicos: 110
Bioelementos: 25 30
- Forman parte de la materia viva, aunque no son exclusivos de ella.
- No son los ms abundantes, pero si son los ms idneos para formar las
molculas de la materia viva.
Bioelementos primarios: C, H, O, N, P, S.
Bioelementos secundarios: Na, K, Mg, Ca, Cl.
Oligoelementos: Fe, Cu, Co, I, Li, Cr, Zn
Biomolculas.
Inorgnicas:
- Agua.
- Sales minerales.
Orgnicas:
- Glcidos.
- Lpidos.
- Protenas.
- cidos Nucleicos.
2.3 Descripcin bioqumica de tipos de clulas.
2.3.1 Clula eucariota animal.

Membrana plasmtica.
Asla el contenido de la clula, mientras permite la comunicacin con el
ambiente. Bsicamente, su estructura contiene protenas que flotan en una doble
capa de fosfolpido. Son mosaicos fluidos, diferentes protenas que estn en
constante movimiento El fosfolpido tiene una funcin aislante. La protena regula
el intercambio de informacin de sustancias y la comunicacin con el ambiente.

Citoplasma.
Comprende todo el volumen de la clula, excepto el ncleo. Apariencia viscosa,
donde estn disueltas muchas sustancias alimenticias. Consiste en una
emulsin coloidal muy fina de aspecto granuloso.
Mitocondria.
Generalmente asociadas a microtbulos y se encuentran en lugares cercanos
donde se consume gran cantidad de ATP. Las mitocondrias poseen 2
membranas: una membrana externa lisa y una membrana interna muy plegada.
Membrana externa lisa: Est formada por una bicapa.
Capa lipdica y numerosas protenas asociadas.
Membrana interna plegada: Esta muy plegada en crestas, es
impermeable a las sustancias polares e iones. En ella se da la ATP-
SINTETASA.

Lisosoma.
Son orgnulos celulares con forma de vesculas membranosas que contienen
enzimas hidrolticos para la digestin intracelular controlada de macromolculas.
Contienen hidrolasas acidas, con actividad ptica cerca de pH 5 el cual se
mantiene en su interior.
 Aparato de Golgi.
Contiene 60% de protenas y 40% de lpidos. Tiene una composicin fosfolpido
intermedia entre el retculo endoplasmtico y la membrana plasmtica.
Contienen enzimas que estn relacionadas con la transferencia de
oligosacridos a protenas, es decir son glucosiltransferasas para formar
glucoprotenas.
Centriolo.
Est integrado por polipetidos de alfaaminoacidos dispuestos en tubulinas
protena del centriolo, llevan formas simples de hidratos de carbono y un poco
de ADN para su duplicacin.
Retculo endoplasmtico liso.
Se presenta en forma de tbulos interconectados y vesculas. Est formado por
protenas y lpidos que constituyen membranas, y por protenas enzimticas.
Ribosomas.
Son carentes de membrana con una textura porosa. Cada ribosomas contiene
aproximadamente un 10% de ARNr, 10% de protenas y 80% de agua.

Retculo endoplasmtico rugoso.

Se denomina as porque lleva adheridos a la cara citoslica de sus membranas.
Est constituido por sacos aplanados o cisternas de 40 a 50 nm de espesor.
Poro nuclear.
Es una estructura que permite el intercambio de molculas entre el citosol y el
ncleo de la clula, tiene forma de cesta de baloncesto y atraviesa la envoltura
nuclear. Est formado por unas 100 protenas ordenadas en forma ortogonal.
Presenta unos canales acuosos que estn permanentemente abiertos y por ellos
difunden libremente sustancias.
Membrana nuclear.
Compuesta por diferentes tipos de compuestos entre ellos fosfolpidos y
protenas. Su estructura es sencillas y se basa en una lmina de molculas
lipdicas de 5nm de espesor.
Nuclolo.
El componente mayoritario son la protena, que constituyen el nuclolo, se trata
de fosfoprotenas y otras protenas muy diversas, algunas las cuales son
bsicas. La composicin de RNA en el nuclolo es muy variable y depende del
tipo celular y del estado funcional.
2.3.2 Clula eucariota vegetal.

- Pared celular.
Es una cubierta extracelular gruesa y rgida que rodea a las clulas vegetales.
Se encuentra compuesta por dos tipos de elementos:
Una red de fibras de celulosa.
Una matriz en la que se encuentra una gran cantidad de agua, sales
minerales, hemicelulosa y pectina; es un hidrato de carbono; son
unidades de glucosa en cadenas.

- Membrana plasmtica.
Es una bicapa lipdica que delimita toda la clula, es una estructura formada
por dos lminas de fosfolpidos, glucolpidos y protenas.
- Citoplasma.
Tiene una consistencia viscosa y est compuesto por una mezcla
heterognea de protenas enzimas y es el lugar donde se dan importantes
reacciones metablicas. Como la gluclisis.
- Vescula.
Llamada vescula pinoctica, se forman a partir de la membrana plasmtica.
Son pequeo sacos de sacos en forma ms o menos esfrica que aparecen
en el citoplasma.
- Aparato de Golgi.
Llamado Dictiosoma, est formado por varias cisternas o sculos formados
membrana, estas tienen una forma aplanada, con su cara convexa hacia el
retculo endoplasmtico.
- Cloroplasto.
Compuesta por el 50% de protenas, 35% de lpidos, 5% de clorofila, agua y
carotnoides.
- Vacuola.
Es una vescula muy grande, llena de lquido y rodeado por una membrana,
llamada tonoplasto. Principalmente compuesta por agua, que puede contener
sales, azucares y protenas en disolucin.
- Microtbulos.
Estn formadas por la polimerizacin de un dmero de dos protenas
globulares, la alfa y la beta tubulina.
- Mitocondrias.
Limitadas por una membrana mitocondrial externa, que la separa del
hialoplasma, y la membrana mitocondrial interna. Compuesta por molculas
ADN, molculas de ARN mitocondrias, los mitorribosomas.
- Ribosomas.
Grnulos compuestos de ARN y protenas; algunos unidos al retculo
endoplsmico, otros libres en el citoplasma.

- Retculo endoplasmtico liso.

Red de membranas internas que se extienden a travs de citoplasma, carece
de ribosomas en su superficie externa.
- Retculo endoplasmtico rugoso.
Red de membranas internas que se extienden a travs de citoplasma, los
ribosomas tapizan su superficie externa.
- Nucleoplasma.
Es el medio interno semilquido del ncleo celular, en el que se encuentran
sumergidas las fibras de ADN o cromatina y fibras de ARN conocidas como
nuclolos.
- Cromosomas.
La cromatina est constituida por el ADN asociado a protenas especiales
llamadas histonas.
- Nuclolo.
Compuesto mayoritariamente por protenas. La proporcin de RNA en el
nuclolo es muy variable y depende del tipo celular y del estado funcional.
2.3.3 Clula Bacteriana.

- Pili.
Son estructuras en forma de pelo, ms fina y ms corta que los flagelos que
se encuentran en la superficie de muchas bacterias.
- Capsula.
Se puede definir como una estructura superficial, consiste en acumulacin de
material mucoso o viscoso, situado externamente respecto a la pared celular.

- Pared celular.
El principal componente y diferenciador de la pared bacteriana es el
peptidoglicano; es un polmero constituido por unidades repetidas del
monmero formado por dos derivados de carbohidratos: un heteropolmero
de N-acetil glucosamina y cido N-acetil murmico.
- Membrana celular.
Compuesta en su mayor parte de fosfolpidos y luego de protenas. Bicapa
lipdica. No posee esteroles.
- Plsmidos.
Son elementos genticos constituidos por secuencias de ADN cortas
circulares que se replican de forma autnoma.
- Episomas.
Son elementos genticos extracrosmicas que pueden existir en forma
autnoma o incorporada al material gentico.
- Flagelo.
Compuestos por cerca de 20 protenas, sirve para impulsar la clula.
- Citoplasma.
Es la masa de materia viva delimitada por la membrana citoplasmtica. Es un
sistema coloidal.
- Ribosomas.
Es similar a la de las plantas y animales, compuesta primariamente de
protenas y fosfolpidos. Es la barrera osmtica de la clula.
- Nucleoide.
Genoma o masa nuclear formado por ADN de doble cadena en forma circular.
Es de forma regular.
- Mesosoma.
Son estructuras membranosas intracitoplsmicas, constituida por
invaginaciones de la membrana citoplsmica.
- Cuerpos de inclusin.
Comprende un polipptido caracterizado porque el cuerpo de inclusin est
en forma partculada. Polipptido: Se tratan de pptidos compuestos, por al
menos, 10 aminocidos.

- Lipopolisacrido.
Es un componente mayoritario de la membrana externa de las bacterias
GRAM NEGATIVAS; est compuesto por una parte lipdica y cadenas
caractersticas de oligosacridos y polisacridos.
- Espacio periplsmico.
Es el compartimiento que rodea al citoplasma, aparece comprendido entre la
membrana plasmtica, por dentro, y la membrana externa de las Gram
negativas, por fuera.
- Pectidoglucano.
Es un copolmero formado por una secuencia altamente de N-acetil-
glucosamina y el cido N-acetilmuramico unidos mediante enlaces B- 1,4.
Copolmero: se forma por medio de uniones ente si de un solo tipo de
molcula pequea.
 3. EL AGUA Y SU BIOQUMICA.
3.1 El agua.
El agua es la sustancia que ms abunda en la Tierra con el 71% de la superficie
de la corteza terrestre y es la nica que se encuentra en la atmosfera en estado
lquido, slido y gaseoso.
La mayor reserva de agua est en los ocanos, que contienen el 97% del agua
que existe, se trata de agua salada. Mientras que el 3% es agua dulce, pero no
toda esta disponible.

3.2 Ley de accin.

El principio que explica la propulsin de un cohete de agua es la ley de la
conservacin de la cantidad de movimiento, que es otra forma de llamar a la 3
ley de Newton o principio de accin-reaccin. Este principio establece que en
ausencia de fuerzas externas la cantidad de movimiento de un sistema, p, que
es el producto de su masa por su velocidad, permanece constante o lo que es lo
mismo su derivada es igual a cero.

3.3 Disociacin.
El agua es un electrolito dbil y es capaz de disociarse en una proporcin muy
escasa y originar tanto H^+ como OH^- . Se comporta, por tanto, como cido y
como base. Por esto se dice que el agua es una sustancia anftera o anfolito.

Equilibrio de disociacin del agua. Constante de equilibrio.

3.4 pH.
El pH es un ndice de la concentracin de los iones de hidrogeno en el agua. Se
define como log (H^+). Cuanto mayor sea la concentracin de los iones de
hidrogeno en el agua, menor ser el valor de pH.

3.5 Ionizacin.
Es un tomo o una molcula que tiene carga elctrica, ya sea positiva o negativa.
Ionizar hace referencia a la disociacin de una molcula en diferentes iones o a
la transformacin de una molcula o de un tomo en un ion.
 3.6 Ecuacin de Henderson.
La ecuacin de Henderson - Hasselbach tiene una gran utilidad para predecir en
qu condiciones se hallan los cidos disueltos en las soluciones que se
encuentran en los seres vivientes. Para deducirla se parte de la Ecuacin:

4. BIOQUMICA DE LOS IONES.

5. GRUPOS QUIMICOS
 UNIDAD II
6. CARBOHIDRATOS Y METABOLISMO
6.1 Generalidades y estructura de los hidratos de carbono
6.1.1 Concepto

6.2 Metabolismo primario

6.2.1 Fotosntesis

7. BIBLIOGRAFA