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UNIDAD DE POSGRADO
TESIS
Para optar el Grado Acadmico de Magister en Ciencias Fisicas con
Mencion en Fisica del Estado Solido
AUTOR
Abraham Pablo Aslla Quispe
ASESOR
Pablo Hector Rivera Riofano
Lima Per
2014
A Marisol y Albert
i
Agradecimientos
Abrahan.
ii
Resumen
iii
que son caracteristicos para cada tipo de molcula en el espectro de coecientes de
transmisin, estas resonancias y antiresonancias son evaluadas en trminos de variacin
del coeciente de transmisin.
iv
Abstract
In this work we show the tools used to study the band structure of graphene
and graphene nanoribbons with zigzag edge (ZGNR), armchair (AGNR) and bearded
within the tight-binding model. The electronic transport in graphene nanodevices is
described within the Landauer and Landauer -Bttiker formalism, within we use as
main tool the Greens functions. We take in consideration that each nanodevice is
formed by the nanodevice connected to ideal semi-innite contacts, in such cases we
reduce the eect of contact by using the self-energy that are calculated using the
contacts Greens functions. The contacts of nanodevices are formed by vertical chains,
each chain interacts with the parallel and neighbors chains, this property allows to use
the recursive method for quickly calculate the Greens functions of contacts and the
decimation method for the calculation of the nanodevices Greens function. We evaluate
the band structure and electric conductance of nanoribbons with zigzag, armchair and
bearded edges, nding that the ZGNR nanoribbons have conductor behavior, AGNR
nanoribbons have semimetallic behavior if M = (N + 1)/3 (with N number of dimers
per chain unit) is an integer and otherwise the AGNR nanoribbons are semiconducting
behavior where the energy gap E are inversely related to the nanoribbons width.
The bearded nanoribbons have conductor behavior as the ZGNR nanoribbons, however
nanoribbons with mixed edge zigzag and bearded have semiconducting behavior, where
the energy gap decreases as the width nanoribbons increases. We also study the
electronic transport in rectangular nanopores on square networks and graphene, we
calculate too the eect on the electron transport induced by dierent molecules located
in the center of the nanopores, the results show that the presence of molecules produce
resonances and antiresonances in dierent energy values that are characteristic for
each molecule type in the transmissin prole, these resonances and antiresonances are
evaluated in terms of vatiarion of the transmission coecient.
v
ndice general
1. Introduccin 1
2. Grafeno 6
2.6.2. Grafeno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
3. Transporte electrnico 26
vi
3.2. Formalismo de la funcin de Green . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
4. Nanoribbons de grafeno 48
5. Nanoporos 75
5.1.1. Modelo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
vii
5.2. Nanoporos de grafeno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
5.2.1. El modelo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90
6. Conclusiones 101
. Bibliografa 104
viii
Captulo 1
Introduccin
1
origin una intensa investigacin de posibles materiales puros de carbono. En 1991 se
realiza el descubrimiento ocial de los nanotubos de carbono con paredes multiples
MWCNT y en 1993 nanotubos de carbono monocapa SWCNT, los nanotubos son
sistemas unidimensionales, debido a que su relacin longitud - radio es muy grande.
En el 2004, en la Universidad de Manchester, el grupo liderado por Andrei Geim y
Konstantin Novoselov obtuvo experimentalmente, por primera vez, una monocapa de
tomos de carbono sobre la supercie de un substrato de dixido de silicio SiO2 [1, 2],
a esta monocapa se le denomina grafeno. Una sucesin de grafeno forma el grato,
el material ms conocido por el hombre desde que se encontraba en las cavernas. La
tcnica desarrollada por el grupo de Geim es relativamente simple y est considerada
dentro de las tcnicas de escisin micromecnica, y consiste en pegar una cinta adhesiva
sobre un pedazo de grato de ptima calidad para luego colocarla sobre un substrato
de dixido de silicio. Luego de una bsqueda con un microscopio ptico y electrnico
se detecta el grafeno en monocapas, bicapas y terrazas de varios niveles.
Figura 1: Andre Geim (iquierda) y Konstantin Novoselov (derecha) ganadores del Premio
Nobel de Fsica 2010, por el descubrimiento y caracterizacin del grafeno.
2
Figura 2: Construccin terica de otros altropos del carbono a partir del grafeno:
fullerenos (0D), nanotubos (1D) y grafito (3D) [1].
3
De acuerdo a la propuesta de L. Pauling [8] los tres estados hbridos sp2 son:
2 1 2
|2spa i = |2si + |2px i (1.1)
3 3
1 1 1
|2sp2b i = |2si |2px i + |2py i (1.2)
3 6 2
1 1 1
|2sp2c i = |2si |2px i |2py i (1.3)
3 6 2
La estructura electrnica del grafeno dada por los orbitales pz presenta dos puntos
K y K , en la primera zona de Brillouin, donde las bandas de valencia y conduccin
coinciden puntualmente, los portadores de carga en dichos puntos no poseen masa y la
relacin de dispersin de la energa en las proximidades de los puntos K y K es lineal
respecto a la magnitud de vector de onda k, es decir E = ~kvF , donde vF 106
m/s, es la velocidad de Fermi, una velocidad que es 0.33 % respecto a la velocidad de
la luz, siendo considerado casi relativstico, esta propiedad es una de las razones por
el cual se considera al grafeno como el primer material de estado slido para realizar
experimentos de electrodinmica cuntica, que permite probar por ejemplo, la paradoja
de Klein. A los puntos K y K se les denomina puntos de Dirac y a los portadores que
se mueven al rededor de dichos puntos se les denomina fermiones de Dirac.
4
En el capitulo 2 describimos la estructura electrnica del grafeno, la aproximacin
en las proximidades de los puntos de Dirac para evaluar el efecto del campo magntico
uniforme sobre el grafeno. Se hace tambien una revisin de las mariposas de Hofstadter
para redes nitas e innitas en redes cuadradas y el grafeno.
5
Captulo 2
Grafeno
Los electrones en los orbitales perpendiculares al plano del grafeno son relevantes
para las propiedades de transporte elctrico, por lo que consideramos solo estas en el
clculo de la estructura de bandas de energa. La estructura hexagonal no constituye
una red de Bravais, pero se puede describir por medio de dos redes de Bravais
triangulares formada por tomos A ( ) y B ( ) respectivamente. De acuerdo a
la gura 3 los vectores primitivos de cada red triangular del grafeno son dados como:
3 3
~a1 = 3ax, ~a2 = ax + ay (2.1)
2 2
siendo |~a1 | = |~a2 | = 3a la constante de red y a = 1.42 A la distancia entre dos tomos
de carbono prximos.
6
Figura 3: Red cristalina del grafeno, representado por dos redes cristalinas triangulares de
tomos A ( ) y B ( ), donde ~a1 y ~a2 son los vectores primitivos de la red real.
7
B (o A), esta interaccin se describe dentro del modelo del tight-binding, modelo en el
cual el hamiltoniano tight-binding en primera cuantizacin se escribe como [2123]
X
|A B B A
H = t j ihi | + |j ihi | (2.3)
hi,ji
siendo t = 2.8 eV el parmetro de Hopping y hi, ji una notacin que establece que la
suma en (2.3) se efecta solamente sobre los vecinos prximos.
Las funciones de onda que describen a los electrones en la red triangular A/B es
dado por
A/B A/B
hr|j i = (r Rj ). (2.4)
Siguiendo la propuesta de Wallace [24], las funciones de onda de Bloch kA y kB
asociadas a las redes triangulares A y B se expresan en trminos de las funciones
de onda de los orbitales atmicos como:
A
X
kA (r) = eikRj (r RA
j ) (2.5)
j
B
X
kB (r) = eikRj (r RB
j ) (2.6)
j
de donde los estados cunticos |kA i y |kB i asociados a las redes triangulares A y B
tienen la forma
A
X
|kA i = eikRj |A
j i, (2.7)
j
B
X
|kB i = eikRj |B
j i. (2.8)
j
Considerando (2.7) y (2.8) escribimos el estado cuntico |k i del grafeno como una
combinacin lineal de los estados |kA i y |kB i,
|k i = cA A B B
k |k i + ck |k i. (2.9)
8
Para calcular la estructura de bandas hacemos que el estado |k i satisfaga la ecuacin
de Schrdinger independiente del tiempo
H|k i = k |k i (2.10)
y
hkA |H|kB i = tf (k) (2.13)
~ ~ ~
donde f (k) = eik1 + eik2 + eik3 .
As mismo se encuentra
ik~ ik~ ik~
hkB |H|kA i = t e 1
+e 2
+e 3
= tf (k) (2.14)
det(EI H) = 0
E tf (k)
=0
tf (k) E
E 2 t2 |f (k)|2 = 0
Ek = t|f (k)| (2.16)
p p
siendo |f (k)| = |f (k)|2 = f (k)f (k), obtenida en el apndice A.2 y expresado
como
v ! !
u
u 3 3 3
|f (k)| = t1 + 4 cos2 kx a + 4 cos kx a cos ky a (2.17)
2 2 2
9
es decir la estructura de bandas del grafeno (2.16) es
v ! !
u
u 3 3 3
Ek = t|f (k)| = t 1 + 4 cos
t kx a cos ky a + 4 cos2 kx a (2.18)
2 2 2
Figura 4: Bandas de valencia y conduccin del grafeno dada por la Ec. (2.18)
10
expresando el vector de onda k como k = K + q, donde q = (qx , qy ) es el vector de
onda respecto a los puntos de Dirac podemos escribir f (k) como
~ ~ ~
X X
f (k) = f (K + q) = ei(K+q)i = eiKi eiqi (2.20)
i i
4 a 2
iK ~1 = i x 3x y = i
3 3a 2 3
4 a 2
iK ~2 = i x 3x y = i
3 3a 2 3
4
iK ~3 = i x (ay) = 0
3 3a
h 2 a 2 a
i
f (k) = i ei 3 3qx qy + ei 3 3qx qy + aqy
2 2
2
donde ei 3 = cos 2 i sin 2 = 21 1 i 3
3 3
a 1 1
f (k) = i 1 i 3 3qx qy + 1 + i 3 3qx qy + 2qy
2 2 2
a h i
f (k) = i 3qx + qy + i3qx + i 3qy 3qx + qy + i3qx i 3qy + 4qy
4
a a
f (k) = i [6iqx + 6qy ] = [6qx + i6qy ]
4 4
3
f (q) = a(qx iqy ) (2.22)
2
con este resultado el elemento de matriz hkA |H|kB i se expresa como
A B 3 3
hk |H|k i = tf (k) = t a(qx iqy ) = at(qx iqy ) (2.23)
2 2
11
luego el hamiltoniano (2.11) en las proximidades del punto de Dirac K es
!
3 0 qx iqy
H = at
2 qx + iqy 0
!
0 qx iqy
H = ~vF (2.25)
qx + iqy 0
3ta 3(2.8eV)(1.42 1010 m)
donde vF = = 106 m/s es la velocidad de Fermi.
2~ 6.58 1016 eV-s
Los eigen estados correspondientes a la banda de energa E+ = ~vF |q| dado por
(2.26), se expresan como |k+ i = cA |kA i + cB |kB i donde los coecientes cA y cB se
obtienen de
! ! !
0 qx iqy cA cA
~vF = ~vF |q|
qx + iqy cB cB
cB = ei cA
asumiendo la condicin de normalizacin |cA |2 + |cB |2 = 1 y cA = 1 ei/2 el eigen
2
estado correspondiente a E+ se escriben como
1
|k+ i = ei/2 |kA i + ei/2 |kB i
(2.27)
2
12
qy
donde tan = .
qx
E = ~vF |q | (2.30)
1
|k i = |ei/2 kA i ei/2 |kB i .
(2.31)
2
!
p 0
H = vF (2.33)
0 p
13
la banda de valencia. Bajo la presencia de un campo magntico uniforme de magnitud
B la energa para el movimiento perpendicular al campo es cuantizado en un conjunto
de niveles de Landau En = E ~c (n + 1/2), con n = 0, 1, 2, . . . y c = eB/m la
frecuencia ciclotrnica [25]. Este modelo falla cuando es aplicado a los electrones del
grafeno, por tanto es necesario utilizar las ecuaciones relativistas de Dirac, considerando
que los electrones del grafeno son fermiones de Dirac, caso en el cual de acuerdo a
(2.26) la estructura de bandas es proporcional al vector de onda, para analizar el
comportamiento de los electrones del grafeno bajo la accin de un campo magntico
B uniforme, asumimos que B = B0 z, con B0 constante y teniendo en cuenta que z es
un vector unitario perpendicular al plano del grafeno. Utilizando el potencial vector A
tenemos que B = A donde A = B0 yx es el gauge de Landau. La sustitucin de
Pierls [26,27], px p0x = px qA = px eB0 y, con q = e carga del electrn, permite
escribir el hamiltoniano (2.33) como:
0 p0x ipy 0 0
p + ip 0 0 0
0x y
H = vF (2.34)
0 0 0 p0x + ipy
0 0 p0x ipy 0
luego la ecuacin de Dirac para H es
A A
0 p0x ipy 0 0 K K
p + ip B B
0x y 0 0 0 K K
vF = (2.35)
A A
0 0 0 p0x + ipy K K
B B
0 0 p0x ipy 0 K K
A B A B
donde K y K son los espinores asociados a los tomos A y B en K y K y K los
A B
Las soluciones de K y K al rededor del punto K se obtienen de las dos primeras
ecuaciones de (2.35),
A B
K = vF (p0x ipy )K
B A
K = vF (p0x + ipy )K
A B
desacoplando K y K de las ecuaciones anteriores, tenemos
2 K
A
= vF2 (p0x ipy )(p0x + ipy )K
A
(2.36)
2 K
B
= vF2 (p0x + ipy )(p0x ipy )K
B
(2.37)
B
con la nalidad de encontrar los niveles de energa para los estados K , consideramos
que el hamiltoniano (2.34) es independiente de x, es decir [H, px ] = 0, en consecuencia
14
px es una integral de movimiento, [px , py ] = 0, [y, py ] = i~.
2 K
B
= vF2 (p20x ip0x py + ipy p0x + p2y )K
B
2 K
B
= vF2 (p20x i[p0x , py ] + p2y )K
B
2 K
B
= vF2 ((px eB0 y)2 i [px eB0 y, py ] + p2y )K
B
2 K
B
= vF2 ((px eB0 y)2 ~eB0 + p2y )K B
2 2 !
B 2 2 px
2
+ ~eB0 K = e B0 y + p2y K B
vF eB0
2 !
2 2 2 2
p
1 B e B 0 p x y B
2
+ ~eB0 K = y + K
2m vF 2m eB0 2m
2 p2y
1 B k 2 B
+ ~eB0 K = (y y0 ) + K (2.38)
2m vF2 2 2m
e2 B02 px
donde k = m
, y0 = eB0
.
Los niveles de Landau n pueden ser positivos o negativos, los valores positivos
corresponden a electrones (banda de conduccin) mientras los valores negativos
corresponden a huecos (banda de valencia). Ademas dichos niveles no son equidistantes
como en el caso convencional de materiales 2D, teniendo la mxima separacin de
energa Emax = ~ Dirac entre n = 0 y n = 1.
15
2.5. Mariposa de Hofstadter
16
hamiltoniano correspondiente a red nita de la gura 5 es
0 t 0 t 0 0 0 0 0
0 te2i
t 0 t 0 0 0 0
0 4i
t 0 0 0 te 0 0 0
t 0 0 0 t 0 t 0 0
2i
H= 0 te 0 t 0 t 0 te2i 0 (2.41)
4i
0 0 te 0 t 0 0 0 te4i
0 0 0 t 0 0 0 t 0
0
0 0 0 te2i 0 t 0 t
4i
0 0 0 0 0 te 0 t 0
17
Figura 7: Espectro de energa para una red cuadrada finita de 15 15 tomos en funcin
de .
Figura 8: Espectro de energa para una red cuadrada finita de 25 25 tomos en funcin
de .
18
2.5.2. Red ladrillo finito en campo magntico uniforme
19
Figura 10: Espectro de energa de la red ladrillo de 3 3 tomos dado por el hamiltoniano
(2.42) en funcin de .
20
Figura 12: Espectro de energa de la red ladrillo de 25 25 tomos en funcin de .
21
Figura 13: Parte de una red cuadrada infinita en el que se denotan la posicin del tomo
(n, m) y sus vecinos proximos
2t cos(2) t 0 ... 0 ... t
t 2t cos(4) t ... 0 ... 0
0 t 2t cos(6) ... 0 ... 0
.
.. .
.. .. .. .. .. ..
. . . . .
..
0 0 0 . t 2t cos(2(q 1)) t
...
t 0 0 0 t 2t cos(2q)
22
Figura 14: Mariposa de Hofstadter red cuadrada infinita
2.6.2. Grafeno
23
Figura 15: Parte de una red ladrillo infinita en el que indica la posicin del sitio (n, m) y
sus vecinos prximos
Aplicando la ecuacin de Schrdinger sobre los electrones de los tomos de las sub
redes A y B situados en la posicin (n, m) de la gura 15 tenemos
n,m = tn,m + tei2m n+1,m1
+ tei2m n,m1
(2.45)
n,m = tn,m + tei2(m+1) n,m+1 + tei2(m+1) n1,m+1 (2.46)
con n,m y n,m funciones de onda de los electrones en las sub redes A y B ubicados
en los sitios (n, m) respectivamente y = /0 .
m = tm + tei2m m1
+ te2im m1
m = tm + tei2(m+1) m+1 + tei2(m+1) m+1
m = tm + 2t cos(2m)m1 (2.47)
m = tm + 2t cos(2(m + 1))m+1 (2.48)
24
2q, siendo por tanto el problema de eigenvalores (2.47) y (2.48) expresado por una
matriz de dimensin 2q 2q dada en (2.49) con condiciones de frontera peridicas
2q+1 = eiky 2q 1 .
0 t 0 ... 0 ... 2t cos(0)
t 0 2t cos(2) ... 0 ... 0
0 2t cos(2) 0 ... 0 ... 0
.. .. .. .. .. ..
..
.
. . . . . .
0 0 0 ... 0 2t cos(2q) 0
0 0 0 . . . 2t cos(2q) 0 t
2t cos(0) 0 0 ... 0 t 0
(2.49)
25
Captulo 3
Transporte electrnico
26
transporte en sistemas mesoscpicos. Para un sistema de longitud nita L, el transporte
es coherente siempre y cuando la longitud L sea menor que la longitud de coherencia
de fase L (L < L ).
Rgimen Difusivo: en este rgimen, el camino libre medio le entre colisiones elsticas
es menor que L, F le L.
27
Figura 17: Modelo de nanodispositivo conectado a dos contactos semi-infinitos
La corriente neta que pasa por cada canal n a travs del punto cuntico se obtiene
calculando la diferencia entre la corriente ILn producido por los electrones del contacto
izquierdo y la corriente IRn producidos por los electrones del contacto derecho
2e X
In = |ILn IRn | = v(k)Tn (E) [f (E L ) f (E R )] . (3.3)
W k
de modo que la corriente total a travs del punto cuntico es la suma las corrientes In
sobre todos los canales permitidos:
X 2e X
I= In = v(k)Tn (E) [f (E L ) f (E R )] . (3.4)
n
W n,k
28
que permite reescribir (3.4) como
eX
Z
I= dkv(k)Tn (E) [f (E L ) f (E R )] . (3.6)
n
y considerando que
1 dE
v(k) = ,
~ dk
encontramos
2e X
Z
I= dETn (E) [f (E L ) f (E R )] . (3.7)
h n
a bajas temperaturas y pequeos voltajes aplicados eV = L R , podemos hacer una
expansin en serie de Taylor de f (E L ) f (E R ) al rededor de la energa de
Fermi EF , que conduce a f (E L ) f (E R ) (E EF )(L R ), resultado
que permite expresar la Ec. (3.7) como
2e X
Z
I= dETn (E)(E EF ) (L R ) . (3.8)
h n
2e X
I= (L R ) Tn (EF )
h n
2e2 X
I= V Tn (EF )
h n
Las funciones de Green son una herramienta poderosa para resolver muchos
problemas de la fsica, en la presente seccin describimos el mtodo de la funcin de
Green para calcular los coecientes de transmisin, tiles para calcular las propiedades
de transporte de sistemas nanoscpicos como el grafeno.
29
3.2.1. Funcin de Green
1 X X |n ihn |
G(E) = |n ihn | = (3.16)
EH n n
E En
donde los En son reales debido a que H es hermitiano. Por tanto G(E) es analtica en
el plano complejo, con excepcin a aquellos puntos en las cuales E toma valores reales
E = En , puntos en las cuales G(E) presenta una discontinuidad (es decir el lmite de
G(E) cuando E se aproxima a En tiende al innito).
30
La Ec. (3.13) permite expresar G (E) como
Las funciones de Green fuera de equilibrio NEGF son regularmente utilizados para
calcular intensidad de corriente y densidad de carga en dispositivos a escala nanometrica
bajo un cierto voltage aplicado. Este metodo es usado principalmente para el transporte
balistico, pero puede ser extendido para incluir dispersion inelastica [42]. En esta
seccin derivamos la ecuacin de NEGF para la corriente elctrica y su relacin con el
coeciente de transmisin.
0 HRD HR |R i |R i
donde HD es el hamiltoniano del nanodispositivo, HL y HR los hamiltonianos de los
contactos izquierdo y derecho, HD con = L, R son las matrices de acoplamiento
entre el contacto = L, R y el nano-dispositivo, |D i, |L i y |R i los estados cunticos
asociados a HD , HL y HR respectivamente.
31
de modo que la respuesta a la perturbacin es
|i = [E H]1 |vi
|i = G(E)|vi (3.22)
La funcin de Green nos permite determinar muchas propiedades de un sistema
fsico, tales como la funcin espectral, la densidad de estados (DOS), la funcin de
transmisin, etc. Por ejemplo calculamos los estados |L i asociado al contacto izquierdo
y |R i asociado al contacto derecho en funcin de los estados del punto cuntico |D i
a partir de la ecuacin de Schrdinger (3.19), que se reescribe como:
Auto-energas
32
obteniendo GLD de (3.29) y GRD de (3.31) y reemplazando en (3.30) se tiene
[L + ( HD ) R ]GD = I, (3.35)
GD (E) = (I HD L R )1 (3.36)
Las matrices de acoplamiento L (E) y R (E) se denen como la diferencia entre las
auto-energas avanzadas y retardadas de los correspondientes contactos
33
Figura 18: Las autoenergas permite reducir el sistema completo (a) de dimensin infinita
a un sistema finito (a) de dimension igual a la del nano-dispositivo.
Sea |L,n i un estado que corresponde al contacto L que para cierta energa E es
reejado completamente en la interface entre el contacto y el punto cuntico con n un
modo de propagacin y | + i el estado retardado obtenido como respuesta del sistema
completo, entonces el estado total |L,n i + | + i satisface la ecuacin de Schrdinger
34
debido a que |L,n i es una estado que corresponde solo al contacto L
luego
| + i = [E H]1 HDL |L,n i = GHDL |L,n i (3.40)
Con este resultado el estado del punto cuntico |D i se escribe como
35
modos n, considerando la degeneracin de espn es
2e
Z X
I21 = dEf (E L ) (E En )hL,n |HLD GD R GD HDL |L,n i
~ n
Z
2e X
= dEf (E L ) (E En )hL,n |HLD |mihm|GD R GD HDL |L,n i
~ m,n
Z
2e X
= dEf (E L ) (E En )hm|GD R GD HDL |L,n ihL,n |HLD |mi
~ m,n
Z !
2e X X
= dEf (E L ) hm|GD R GD HDL 2 (E En )|L,n ihL,n | HLD |mi
2~ m n
Z
2e X
= dEf (E L ) hm|GD R GD HDL gL gL HLD |mi
2~ m
Z
2e X
= dEf (E L ) hm|GD R GD L L |mi
2~ m
Z
2e X
= dEf (E L ) hm|GD R GD L |mi
2~ m
Z
2e
I21 = dEf (E L )T r[GD R GD L ]. (3.46)
2~
De manera equivalente se encuentra que la corriente total que pasa del contacto derecho
al contacto izquierdo es
Z
2e
I12 = dEf (E R )T r[GD R GD L ]. (3.47)
2~
La corriente total a travs del punto cuntico es entonces:
Z
2e
I= dE (f (E L ) f (E R )) T r[GD R GD L ] (3.48)
2~
comparando las corrientes en el punto cuntico dadas por las Ecs. (3.7) y (3.48) se
tiene que
T (E) = T r[GD R GD L ]. (3.49)
La Ec. (3.49) es equivalente a la relacin de Fisher-Lee [45,46] que expresa el coeciente
de transmisin en trminos de las matrices de transmisin como:
T = T r(t t). (3.50)
36
dimensin nita. La aplicabilidad del mtodo de recurrencia se debe a que tanto los
contactos y el nano-dispositivo se pueden descomponer en sub redes verticales nitas
en serie como muestra la gura 19, donde cada sub red es llamada en adelante como
cadena unidad, dentro del modelo del tight-binding cada cadena unidad interacta
solamente con las cadenas unidad laterales prximas.
H2 H2,1 0 0 0
H2,1 H1 H1,0 0 0
H=
0 H1,0 H0 H0,1 0
(3.51)
0 0 H0,1 H1 H1,2
0 0 0 H1,2 H2
donde Hn , con n = 2, 1, 0, 1, 2 es el hamiltoniano correspondiente a la n-sima
cadena unidad, Hn,n+1 es la matriz de acoplamiento de la cadena n con la cadena n + 1
y Hn,n+1 es la matriz de acoplamiento de la cadena n + 1 con la cadena n. La funcin
de Green asociado al hamiltoniano (3.51) se dene de acuerdo a (3.13) por
H2 0 0 0
H2,1 G2 G2,1 G2,0 G2,1 G2,2
1 0 0 0 0
H H1 H1,0 0 0
2,1 G1,2 G1 G1,0 G1,1 G1,2
0
1 0 0 0
0 0 H0,1
G2,2 G2,1 G2,0 G2,1 G2 0 0 0 0 1
0 0 0 H1,2 H 2
(3.52)
37
esta ecuacin matricial se reescribe como
38
3.2.5. Funciones de Green de contacto derecho
H00 H01 0 0 ... G00 G01 G02 G03 ... 1 0 0 0 ...
H01 H11 H12
0 . . . G10
G11 G12 G13 . . . 0
1 0 0 . . .
0
H12 H22 H23 . . .
G20 G21 G22 G23 . . . =
0 0 1 0 . . .
0 0 H23 H33 . . . G30 G31 G32 G33 . . . 0 0 0 1 . . .
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . .
. . . . . . . . . . . . . .
(3.61)
considerando que H01 = Hn,n+1 , H10 = Hn+1,n y Hnn = H00 para todo n tenemos
( H00 H01 ( H00 )1 H10 )G00 = I + H01 ( H00 )1 H01 G20 (3.70)
39
Despejando ahora G30 de (3.65) se obtiene
H10 [( H00 )1 (H10 G00 + H01 G20 )] + ( H00 )G20 H01 [( H00 )1 ](H10 G20 + H01 G40 ) = 0
reordenando
[ H00 H10 ( H00 )1 H10 H01 ( H00 )1 H10 ]G20
(3.72)
= H10 ( H00 )1 H10 G00 + H01 ( H00 )1 H10 G40
si despejamos G50 de (3.67) y tomamos G30 de (3.71) para reemplazar en (3.66) y seguir
el mismo procedimiento seguido para deducir (3.74) encontramos
Para hacer una segunda iteracin despejamos G20 de (3.74) y reemplazamos en (3.73)
obteniendo
40
despejando G20 de (3.74) y G60 de (3.76) y reemplazando ese obtiene
H2 = H1 + 1 ( H1 )1 1
2 = 1 ( H1 )1 1
2 = 1 ( H1 )1 1
H2 = H1 + 1 ( H1 )1 1 + 1 ( H1 )1 1
con
Hn = Hn1 + n1 ( Hn1 )1 n1 (3.94)
n = n1 ( Hn1 )1 n1 (3.95)
n = n1 ( Hn1 )1 n1 (3.96)
Hn = Hn1
+ n1 ( Hn1 )1 n1 + n1 ( Hn1
)1 n1 . (3.97)
41
Si el nmero de iteraciones n es sucientemente grande entonces se encuentra que
n es considerablemente pequea, de modo que la funcin de Green aproximada del
contacto derecho es dado por:
G00 ( Hn )1 . (3.98)
luego I es
" #
2e df df
Z X
I = dE (M R ) eV T eV (3.101)
h dE 6=
dE
42
asumiendo que
2e2 2e2
df df
Z Z
G = dE (M R ); G = dE T (3.102)
h dE h dE
tenemos
2e2 X
I = G V . (3.103)
h
2e2 2e2
G = (M R ); G = T (3.104)
h h
cabe recalcar en esta parte que M es el nmero de canales permitidos a travs del
P n
contacto , es decir que R = R es la probabilidad total de reexin de las ondas
P n
incidentes por los M canales permitidos en el contacto , as mismo T = T es
el coeciente de transmisin total de las ondas que inciden por el contacto y pasan
al contacto .
Considerando que toda la corriente que ingresa a travs del contacto 1 pasa al
contacto 3 y toda la corriente que ingresa por el contacto 2 pasa al 4, es decir I1 = I3
43
y I2 = I4 a partir de (3.105) encontramos que
donde
(T21 + T41 )(T12 + T14 )
11 = (M1 R11 ) (3.109)
S
T12 T34 T32 T14
12 = (3.110)
S
T21 T43 T23 T41
21 = (3.111)
S
(T21 + T23 )(T32 + T12 )
22 = (M2 R22 ) (3.112)
S
para la medida de la resistencia Hall, consideramos I2 = 0 en los contactos 2 y 4, de
modo que (3.108) se reescribe como
2e2
I1 = [11 (V1 V3 ) 12 (V2 V4 )]
h
2e2
0 = [21 (V1 V3 ) + 22 (V2 V4 )]
h
resolviendo para I1 encontramos
2e2 2e2 11 22 21 12
22
I1 = 11 (V2 V4 ) 12 (V2 V4 ) = (V2 V4 )
h 21 h 21
44
siendo el ancho de los contactos izquierdo (1) y derecho (3) igual a 23a y el ancho de
los contactos superior (2) e inferior (4) igual a 21
2
3a. El campo magntico uniforme
aplicado sobre el sistema es representado por el potencial vector A = B0 yx y su efecto
sobre el punto cuntico es dado por la sustitucin de Pierls. Para nes de obtener los
resultados calculamos primero las funciones de Green de los contactos por medio del
mtodo recursivo rpido descrito en 3.2.5, luego calculamos las auto-energas y las
acoplamos al punto cuntico siguiendo las matrices de transformacin propuestas por
Jayasekera [55], seguidamente determinamos la funcin de Green, nalmente utilizando
la funcin de Green calculamos la resistencia Hall RH por medio de la ecuacin (3.113),
la resistencia longitudinal RL usando la ecuacin (3.114) y DOS respectivamente, el
programa numrico utilizado para estos clculos es la que proponemos en [56]. Otra
alternativa de tratamiento de las auto-energas para sistema nanoscpicos mas grandes
es utilizar las propuestas de Thorgilsson [57].
45
Figura 21: Resistencia Hall RH dado por la ecuacin (3.113) para un punto cuntico de
Grafeno con cuatro contactos
46
Figura 22: Resistencia longitudinal RL dado por la ecuacin (3.114) para un punto
cuntico de Grafeno con cuatro contactos
Figura 23: Densidad de estados de punto cuntico de Grafeno con cuatro contactos
47
Captulo 4
Nanoribbons de grafeno
Los nanoribbons de grafeno son bandas (cintas) de grafeno con anchos muy
pequeos (< 50 nm) como muestra la gura 24. En estos sistemas la distribucin de
los tomos en los bordes del nanoribbons juegan un rol importante en la caraterizacin
de sus propiedades electrnicas. En el presente estudio clasicamos lor bordes de
los nanoribbons de grafeno en bordes zigzag, armchair y bearded (barbado) como se
muestra en la gura 25 [19, 27, 58, 59]. A continuacin describimos analticamente la
estructura electrnica y los estados electrnicos de nanoribbons de borde zigzag y
armchair utilizando la ecuacin de Dirac y el modelo de tight-binding, calculamos
la conductancia elctrica y analizamos el efecto del campo magntico sobre los
nanoribbons de diferentes bordes.
48
Figura 25: Red finita de grafeno que muestra los tipos de borde zigzag, armchair y
bearded utilizados en la descripcin de los nanoribbons.
0 kx iky 0 0
k + ik 0 0 0
x y
H = ~vF . (4.1)
0 0 0 (kx + iky )
0 0 (kx iky ) 0
49
que debido a la invariancia traslacional en el eje x las funciones de onda deben cumplir
la condicin de Bloch
(r) = eikx x (y). (4.4)
A B
de (4.5) las ecuaciones para evaluar K y K en el punto K son
! ! !
A A
0 kx y K K
~vF B
= B
(4.6)
kx + y 0 K K
B A
(kx y )K = K
A B
(4.7)
(kx + y )K = K
con = /~vF , desacoplando las ecuaciones
A 1 B
K = (kx y )K (4.8)
1 B B
(kx + y ) (kx y )K = K
(kx y2 )K
2 B
= 2 K
B
y2 K
B
+ (2 kx2 )K
B
= 0, (4.9)
la solucin general de la ecuacin (4.9) es
B
K (y) = ey + ey (4.10)
50
p B
con = kx2 2 que puede ser real o imaginario. Reemplazando K (y) en (4.7), se
obtiene que kA (y) es
A
K (y) = (kx )ey + (kx + )ey (4.11)
Debido a que el ancho del nanoribbon en el eje y es nita, asumimos que los bordes
estn dados por y = 0 y y = W , entonces las funciones de onda deben satisfacer
B (y = 0) = 0, A (y = W ) = 0 (4.12)
B
0 = eiKx K (y = 0) + eiK x K
B
(y = 0)
A
0 = eiKx K (y = W ) + eiK x K
A
(y = W )
=
A
luego usando K (y = W ) = 0 en (4.11) tenemos
A
K (y = W ) = 0 = (kx )eW + (kx + )eW
La ecuacin (4.14) tiene soluciones reales para si kx > 1/W , soluciones que
corresponden a funciones de estado de borde (edge states) localizados en la frontera
del nanoribbon, con energas
p
= kx2 2 , (4.15)
51
el resultado (4.15) no puede ser predicho a partir de la estructura de bandas del grafeno.
En otro caso si kx < 1/W las soluciones de la Ec. (4.14) son puramente complejas
de la forma = ikn , entonces
kx ikn
= e2ikn W
kx + ikn
(kx ikn )eikn W = (kx + ikn )eikn W
kx (eikn W eikn W ) = ikn (eikn W + eikn W )
kx sin(kn W ) = kn cos(kn W )
quedando
kn
kx = (4.16)
tan(kn W )
las soluciones de (4.16) corresponden a estados connados en la nanocinta, que tienen
energas
p
= kx2 + kn2 (4.17)
52
0 2t cos(kx a) 0 0 0 0 ...
2t cos(kx a) 0 t 0 0 0 . . .
0 t 0 2t cos(kx a) 0 0 . . .
H=
0 0 2t cos(kx a) 0 t 0 . . .
0 0 0 t 0 2t cos(kx a) . . .
0 0 0 0 2t cos(kx a) 0 . . .
.. .. .. .. .. .. ..
. . . . . . .
(4.18)
53
Figura 26: Espectro de energa de nanoribbons de diferentes anchos (a) 7-zgnr, (b) 8-zgnr,
(c) 9-zgnr, (d) 10-zgnr, (e) 30-zgnr y (f) 100-zgnr
54
Figura 27: Nanoribbons de borde armchair con ancho en la direccin del eje y.
La deduccin del hamiltoniano de Dirac (4.1) se hizo considerando que el borde del
nanoribbon era la direccin zigzag, entonces para el estudio de nanoribbons armchair
introducimos una rotacin de /2 en el vector de onda, es decir hacemos kx ky y
ky kx , luego si consideramos que ky iy entonces el hamiltoniano (4.1) se escribe
como:
A A
0 iy + ikx 0 0 K K
B
B
i ik 0 0 0 K
y x
~vF A = KA (4.19)
0 0 0 iy ikx K K
B B
0 0 iy + ikx 0 K K
A B
de (4.19) las ecuaciones para obtener K y K en el punto K son
B A
i(y + kx )K = K
A B
(4.20)
i(y kx )K = K
A B
con = A, B. Las soluciones para K y K son
A
K (y) = Aein y + Bein y , (4.22)
B
K (y) = Cein x + Dein y (4.23)
como en los bordes del nanoribbon existen tomos del tipo A y B, las funciones A
K y
B
K denidas por (4.3) deben cumplir las condiciones
A (y = 0) = B (y = 0) = 0 (4.24)
A (y = W ) = B (y = W ) = 0 (4.25)
55
entonces tenemos
0 = ein x K
A
(y = 0) + ein x K
A
(y = 0) (4.26)
0 = ein x K
B
(y = 0) + ein x K
B
(y = 0) (4.27)
0 = eiKW ein x K
A
(y = W ) + eiKW ein x K
A
(y = W ) (4.28)
0 = eiKW ein x K
B
(y = W ) + eiKW ein x K
B
(y = W ) (4.29)
A+B+C +D =0 (4.32)
Aei(n +K)W + Bei(n K)W + Cei(n K)W + Dei(n +K)W = 0 (4.33)
escogiendo B = C = 0, se tiene A = D y
sin[(n + K)W ] = 0
(n + K)W = n
n n 4
n = K = (4.34)
W W 3 3a
A
Reemplazando K = Aein y en la Ec. (4.21), se encuentra
A
y K = in Aeiy , y2 K
A
= (in )2 Aeiy = n2 K
A
(n2 ) + kx2 K
A
= 2 K
A
n2 + kx2 = 2
p
= n2 + qx2 (4.35)
dado que todas las soluciones de n conducen a soluciones oscilatorias, se concluye que
no existen estados de borde localizados.
56
4.2.1. Mtodo del tight-binding
0 t 0 0 teikx a 0 0 ...
teikx a
t 0 t 0 0 0 . . .
ikx a
0 t 0 t 0 0 te . . .
0 0 t 0 0 0 0 . . .
H=
teikx a
(4.36)
0 0 0 0 t 0 . . .
0 teikx a 0 0 t 0 t . . .
teikx a
0 0 0 0 t 0 . . .
.. .. .. .. .. .. .. ..
. . . . . . . .
57
Figura 28: Espectro de energa de nanoribbons armchair cuyo ancho es formado por
diferente cantidad de tomos (a) 8-agnr, (b) 11-agnr, (c) 14-agnr, (d) 17-agnr, (e) 20-agnr y
(f) 98-agnr.
58
Figura 29: Espectro de energa de nanoribbons armchair cuyo ancho es formado por
diferente cantidad de tomos (a) 9-agnr, (b) 10-agnr, (c) 12-agnr, (d) 13-agnr, (e) 18-agnr y
(f) 100-agnr.
59
0 t 0 0 0 0 ...
t 0 2t cos(kx a) 0 0 0 . . .
0 2t cos(kx a) 0 t 0 0 . . .
0 0 t 0 2t cos(kx a) 0 . . .
H= (4.38)
0 0 0 2t cos(kx a) 0 t . . .
0 0 0 0 t 0 . . .
.. .. .. .. .. .. ..
. . . . . . .
60
La estructura de bandas de nanoribbons de borde beardeb obtenidos al diagonalizar
el hamiltoniano (4.38) se presenta en la gura 30 para diferentes anchos del
nanoribbons, los resultados muestran que el espectro de energa es equivalente a los
nanoribbons de borde zizag, pero dieren su comportamiento para energas prximas
a E = 0.
61
Figura 31: Espectro de energa de nanoribbons de borde zigzag-bearded con diferente
nmero de tomos por celda unidad (a) 7-zgbearded, (b) 8-zgbearded, (c) 9-zgbearded, (d)
10-zgbearded, (e) 30-zgbearded y (f) 100-zgbearded
De acuerdo a los espectros de energa observados en las guras 26, 28, 29, 30
y 31 los nanoribbons de grafeno presentan cuantizacin de estados permitidos [64],
esta cuantizacin trasladada a la conductancia elctrica produce la cuantizacin de
la conductancia elctrica que depende directamente del ancho del nanoribbons. Para
el clculo de la conductancia elctrica utilizamos la formula de Landauer (3.1) y las
funciones de Green fuera de equilibrio [65]. A continuacin presentamos resultados de
conductancia elctrica que arman la naturaleza conductora o semiconductora de los
62
nanoribbons predicha por el espectro de energa.
63
Figura 32: Conductancia, DOS y bandas de energa para (a) 8-zgnr y (b) 12-zgnr.
64
la diferencia que los valores permitidos de T (E) varan de 0 a 7.
Figura 33: Conductancia, DOS y bandas de energa para (a) 11-agnr y (b) 14-agnr.
65
son enteros que varan de 0 a 6. La gura 34-b muestra el coeciente de transmisin,
DOS y el espectro de energa de un nanoribbons 15-agnr, donde T (E) vara de 0 a 7.
Figura 34: Conductancia, DOS y bandas de energa para (a) 12-agnr y (b) 15-agnr.
66
observandose que en el rango de energas 0.54t < E < 0.54t tenemos T (E) = 1, en el
rango de energas 0.54t < E < 0.82t tenemos T (E) = 3, as mismo los valores de T (E)
varan de 0 a 7, ocurriendo el valor mximo en el rango de energas 0.98t < E < 1.18t.
Figura 35: Conductancia, DOS y bandas de energa para (a) 8-bearded y (b) 12-bearded.
67
el hecho de que estos nanoribbons tienen comportamiento semiconductor, donde el gap
de energa tiene una relacin inversa con el ancho del nanoribbons.
Figura 36: Conductancia, DOS y bandas de energa para (a) 8-zgbearded y (b)
12-zgbearded.
68
donde ij es el ujo magntico por unidad de ujo cuntico 0 = h/e dado por
j
e
Z
ij = dl A. (4.40)
h i
69
Figura 37: Estructura de bandas de energa de un nanoribbons 20-zgnr (a) = 0.0, (b)
= 1/500, (c) = 1/250, (d) = 1/100, (e) = 1/50, (f) = 1/20, (g) = 1/10, (h)
= 1/4 y (i) = 1/2
70
convierten en subandas de Landau.
Figura 38: Estructura de bandas de energa de un nanoribbons 20-agnr (a) = 0.0, (b)
= 1/500, (c) = 1/250, (d) = 1/100, (e) = 1/50, (f) = 1/20, (g) = 1/10, (h)
= 1/4 y (i) = 1/2
71
Figura 39: Estructura de bandas de energa de un nanoribbons 22-agnr (a) = 0.0, (b)
= 1/500, (c) = 1/250, (d) = 1/100, (e) = 1/50, (f) = 1/20, (g) = 1/10, (h)
= 1/4 y (i) = 1/2
72
Figura 40: Estructura de bandas de energa de un nanoribbons 20-bearded (a) = 0.0,
(b) = 1/500, (c) = 1/250, (d) = 1/100, (e) = 1/50, (f) = 1/20, (g) = 1/10, (h)
= 1/4 y (i) = 1/2
73
Figura 41: Estructura de bandas de energa de un nanoribbons 20-zgbearded (a) = 0.0,
(b) = 1/500, (c) = 1/250, (d) = 1/100, (e) = 1/50, (f) = 1/20, (g) = 1/10, (h)
= 1/4 y (i) = 1/2
74
Captulo 5
Nanoporos
En los ltimos aos los nanoporos se han presentado como herramientas poderosas
para el anlisis de molculas individuales, ellos han sido utilizados para caracterizar
rpida y ecientemente biopolmeros de ADN usando nanoporos de estado slido
[69, 70], se examinaron tambin el efecto local de protenas a lo largo de la longitud
75
del ADN, usando el hecho de que el transporte de corriente a travs el ADN, as
como del ADN con protenas a lo largo de su longitud son distintas [71]. Estos y
otros resultados experimentales son un paso crucial para la exploracin del genoma, y
permiten visualizar la viabilidad de la lectura de la informacin a lo largo del ADN a
alta resolucin con un nanoporo de estado slido es posible.
Figura 42: Nanoporos para la secuenciacin del ADN. (a) el ADN se inserta en un
nanoporo, con control de velocidad proporcionado por una ADN polimerasa 29 (marrn).
Un nanoporo -hemolisina (gris) est incrustado en una bicapa de lpidos. El sustrato de
ADN (columna vertebral rojo) se inserta en el poro por un campo elctrico aplicado. Su
movimiento dentro o fuera del poro (flechas) puede ser controlado por el campo elctrico
aplicado y la actividad de la polimerasa. (b) Estructura de un nanoporo -hemolisina
insertado en una bicapa lipdica. (c) Estructura de un nanoporo MspA insertado en una
bicapa lipdica. (d) Un nanoporo grafeno dibujado en la misma escala que la -hemolisina y
poros proteicos MspA [72].
76
semiconductoras, que depende del segmento de ADN y en particular de la secuencia
de las molculas de ADN [7376]. Estos resultados permiten tambin entender que la
utilizacin de nanoporos de grafeno es perfectamente posible para la lectura directa de
diversos tipos de molculas por ser el grafeno un material conductor por excelencia [77].
Los cambios que generan cada tipo de las secuencia nitrogenada de ADN, conocidos
tambin como nucletidos, que son la adenina, guanina, citosina y timina producen
al pasar por los nanoporos un cambio caracterstico en la conductancia elctrica del
nanoporo, cualidad que permitir en el futuro realizar una lectura rpida y ecaz de
secuencias completas del ADN.
77
Se han reportado estudios tericos sobre el transporte de carga a travs de algunas
secuencias de ADN [73, 74] que pueden ser considerados desde el punto de vista de la
fsica como nanohilos conectados a electrodos que en algunos estudios son nanoribbons
de grafeno [75]. Los resultados sustentan que esas secuencias de ADN tienen un
comportamiento semiconductor y muestran que la relacin corriente-voltage de los
segmentos depende de la longitud del nanohilo y en particular de la secuencia de los
nucletidos [75, 76].
Por otro lado, se ha sugerido que cuando un sistema conductor no son molculas
sino una red cristalina bidimensional como el grafeno con un nanoporo conectado a dos
contactos mtalicos semi-innitos debe presentar una conductancia que podra sensar
molculas que atraviesen el nanoporo de modo que la conductancia dependiese del tipo
de molcula y la orientacin de la misma al atravezar el nanoporo. De esa forma se
podra identicar los nucletidos del ADN sensando las bases que presentaran una
sea particular y caracterstica en la conductancia para cada base [77].
5.1.1. Modelo
78
ser emulados por redes rectangulares semi-innitas de stios atmicos en el primer
caso y por una red rectangular nita de stios atmicos en el segundo. Esto es posible
porque, cuando un portador de carga se mueve en una dimensin el hamiltoniano
est conformado por la energa cintica y la energa potencial que sufre el portador.
Cuando se discretiza la energa cintica se genera una matrix tridiagonal y cuando se
hace lo mismo con la energa potencial se obtiene una matriz diagonal. Los elementos
no diagonales de la matriz de energa cintica est dado por
~2
t= (5.1)
2m a2
donde m es la masa efectiva de los portadores de carga, a es el parmetro de red
de la cadena lineal y ~ la constante de Planck dividido entre 2. Y los elementos
diagonales de la matriz estn dados por Uj + 2t, donde Uj es la energa potencial del
punto de discretizacin j y a t se le denomina el trmino de acoplamiento entre los
puntos que resultan de la discretizacin de un sistema unidimensional (1D) [46]. Esta
matriz producida por la discretizacin por diferencias nitas del hamiltoniano de un
ujo de portadores de carga a travs de un conductor unidimensional es equivalente
al hamiltoniano de una cadena unidimensional de sitios atmicos que se acoplan
considerando orbitales atmicos tipo s a primeros vecinos en la aproximacin de
ligaciones fuertes (tight-binding) con un parmetro de hopping t [46].
Por otro lado, para una red rectangular nita de stios atmicos con orbitales tipo
s y acoplamiento a primeros vecinos, el hamiltoniano en primera cuantizacin est
denido como
79
X X
H= Es + tx |i, jihi + 1, j| + |i + 1, jihi, j| +
i,j i,j
ty |i, jihi, j + 1| + |i, j + 1ihi, j| (5.2)
Para simular el efecto de las molculas -que se encuentran en el centro del nanoporo-,
sobre la conductancia del sistema construmos un algoritmo que incluye el hamiltoniano
de la molcula en el nanoporo considerando la interaccin entre tomos de la propia
molcula, as como la interaccin entre la molcula con los stios del borde que denen
el nanoporo dentro de la aproximacin tight-binding.
80
Funciones de Green
Para determinar las auto-energas de los contactos semi-innitos usamos las ideas
propuestas por Lee y Joannopoulos [60, 61] quienes consideran que los conductores
semi-innitos estn formados por cadenas verticales nitas de stios, hl,r , que se acoplan
a las cadenas verticales laterales y vecinas a izquierda y a derecha mediante una
matriz diagonal, Vl,r , cuyos elementos incorporan las interacciones a primeros vecinos
entre cada stio de las cadenas verticales. Por tanto, las funciones de Green de los
contactos izquierdo y derecho estn dados por gl = Vl (1/hl )Vl y gr = Vr (1/hr )Vr ,
respectivamente.
81
(DOS) que proporciona la cantidad de estados disponibles en un intervalo de energa,
1 h h ii
(E) = Tr Im GD (E) . (5.5)
82
transporte elctronico se muestran en las guras 44(c), (e) y (g), donde se observan
que el coeciente de transmisin disminuye con respecto al coeciente de transmisin sin
poros Fig. 44(a), dicha disminucin se acenta a medida que el ancho W del nanoporo
aumenta. Tambin se observa que la cuantizacin en nmeros enteros de e2 /h del
coeciente de transmisin se va perdiendo, adems se observa que el coeciente de
transmisin es independientes de la longitud D del nanoporo, corroborando el aspecto
balstico del transporte.
Figura 44: Se muestran los coeficientes de transmisin (izquierda) y DOS (derecha) para una
red rectangular sin poros (a) y (b); para redes rectangulares con poros de D=9ax y W=3ay ,
(c) y (d); D=9ax y W=5ay , (e) y (f); y D=9ax y W=7ay , (g) y (h), respectivamente.
83
Los resultados para las DOS que muestran las guras 44(d), (f) y (h) indican una
disminucin progresiva respecto a la DOS sin poros, gura 44(a), principalmente en
aquellos valores de energa donde la DOS presenta las discontinuidades de Van-Hove,
es decir, que el nmero de estados permitidos en el sistema disminuye por la presencia
del nanoporo y el aumento del tamao del nanoporo en la direccin y.
Figura 45: Representacin esquemtica de un nanoporo cuadrado con D=W y una molcula
de cuatro tomos colineales orientados en direccin paralela (a) y en la direccin perpendicular
(b) al flujo de la corriente.
84
molcula, mientras que las curvas azules corresponden a los coecientes de transmisin
del sistema con nanoporo sin la presencia de molculas. La gura 46(a) corresponde al
coeciente de transmisin asociado al nanoporo con una molcula orientada paralelo
al ujo de la corriente, Figura 45(a), donde la presencia de la molcula en el nanoporo
produce resonancias (ver en el inset de la Fig.46(a)) en el coeciente de transmisin
en cuatro valores de energa E/t = 0.62; 1.62, que corresponden al acoplamiento
entre los tomos que componen la molcula. En la gura 46(b) observamos que el
coeciente de transmisin para el sistema con nanoporo y con molcula orientada
perpendicularmente al ujo de corriente, Figura 45(b), los coecientes de transmisin
prximos al potencial qumico (T=0) o energa de Fermi presentan antiresonancias (ver
inset de la Fig.46(b)) mientras que para energas no muy prximas al nivel de Fermi,
las resonancias son muy bajas.
85
para una molcula compuesta con cuatro tomos, la Fig. 47(b), muestra los picos
correspondientes a cuatro energas E/t = 0.62; 1.62; para una molcula con 5 tomos,
la Fig. 47(c), presenta los picos en E/t = 0.0; 1.0; 1.73; y nalmente, para una
molcula compuesta por seis tomos, la Fig. 47(d), presenta los picos en los seis valores
de energas dados por E/t = 0.46; 1.25; 1.80. Estos resultados indican exactamente
la distribucin espectral de la energa de acoplamiento de un nmero dado de tomos
que conforman la molcula, asimismo observamos que la altura de los picos son mayores
a medida que el nmero de tomos de la molcula aumenta.
Figura 47: Variacin del coeficiente de transmisin, T , para un conductor con un nanoporo
de dimensiones D=W=9a y con la presencia de molculas lineales con varios tomos idnticos
(a) 3 tomos, (b) 4 tomos, (c) 5 tomos y (d) 6 tomos, paralelos a la corriente de portadores.
86
Figura 48: Variacin del coeficiente de transmisin, T , para un conductor con un nanoporo
de dimensiones D=W=9a y con la presencia de molculas lineales con varios tomos idnticos
(a) 3 tomos, (b) 4 tomos, (c) 5 tomos y (d) 6 tomos, perpendiculares a la corriente de
portadores.
Figura 49: Diferentes tipos de molculas que se consideran en el centro del nanoporo
87
Figura 50: Variacin del coeficiente de transmisin T de nanoporo con D = W = 9a
bajo la presencia de molculas representadas en la figura 49 respectivamente.
Conclusiones
88
5.2. Nanoporos de grafeno
89
del esqueleto de segmentos de ADN y el transporte de carga en cada nucletido en
la direccin transversal al esqueleto del ADN. La nalidad de la secuenciacin del
ADN es la determinacin del orden de los nucletidos (A, C, G y T) que constituye
la informacin gentica heredable del ncleo celular en plantas y animales, por tanto
es til en el estudio de los procesos biolgicos fundamentales que permiten determinar
mutaciones, presencia de clulas cancergenas, etc. Las primeras pruebas experimentales
de translocacin de molculas de ADN fueron reportados en 1996 usando nanoporos
biolgicos [82].
5.2.1. El modelo
90
toda carga elctrica que procede del contacto izquierdo con energa igual a L y que
alcanza el contacto derecho no regresa hacia el contacto izquierdo, de la misma forma
toda carga elctrica que ingresa por el contacto derecho con energa R y alcanza al
contacto izquierdo no volver hacia el contacto derecho.
2e2
G= T (EF ), (5.7)
h
91
la red nita de grafeno, y el tercer paso es calcular la conductancia considerando la
presencia de molculas de diferentes conguraciones en el centro del nanoporo.
X
H = t |A B
j ihi | + h.c., (5.8)
hi,ji
Para simular el efecto de las molculas - que se encuentran en el centro del nanoporo
- construimos un algoritmo que incluye en el hamiltoniano del nanoporo al hamiltoniano
correspondiente a la molcula y la interaccin de la molcula con el nanoporo. La
interaccin entre los tomos de la propia molcula, as como la interaccin de la
molcula con el borde que dene al nanoporo se efecta dentro de la aproximacin
tight-binding.
G = [EI HD L R ]1 (5.9)
aqu I es la matriz identidad, HD el hamiltoniano del nanodispositivo en estudio y L ,
R son las autoenergas asociadas a los contactos izquierdo y derecho respectivamente.
Cuarto calcula el coeciente de transmisin del sistema completo como
92
y la densidad de estados, DOS, que proporciona la cantidad de estados disponibles por
cada energa permitida E como
1
(E) = T r[Im(G(E))]. (5.11)
Simulamos primero una red nita de grafeno de longitud X = 20 3a y ancho
Y = 28a con dos contactos, considerando interaccin a primeros vecinos con parmetro
de acoplamiento de Hopping t = 2.8 eV. Los contactos semi-innitos se consideran
cintas de grafeno de ancho Y con el mismo parmetro de Hopping que la red nita.
Debido a las pequeas dimensiones de la red nita los coecientes de transmisin
encontrados se encuentran cuantizados en valores enteros que van de 0 hasta 18 como
se muestran en la gura 52(a), la densidad de estados correspondiente a este sistema
muestra que los saltos en el coeciente de transmisin ocurren en las discontinuidades
de Van-Hove como se observa en la gura 52(b). Los resultados del coeciente de
transmisin y la DOS son equivalentes al de un nanoribbons de borde zigzag 18-zgnr,
debido a las condiciones de transporte balstico [59, 65] asumidas en el formalismo de
Landauer, es decir el resultado de T (E) es independiente de la longitud X del sistema,
dependiendo la cuantizacin solamente del ancho Y . El nanoribbons tiene naturaleza
conductora debido a que en las proximidades de EF = 0 tenemos que T (E) 6= 1, es
decir no existe presencia de un gap de energa entre la banda de conduccin y valencia.
93
mltiplos enteros de la conductancia cuntica e2 /h se va perdiendo.
Los resultados mostrados en las guras 52(d), (f), y (h) muestran que la DOS del
sistema con presencia de poros es menor que la DOS del sistema sin presencia de
94
poros, dada en la gura 52(a), la disminucin se acenta principalmente en aquellos
valores de energa donde sin la presencia de poros se presentaban las discontinuidades
de Van-Hove, esto se debe a medida que se incrementa el tamao del poro el nmero de
estados permitidos en el sistema disminuye. En los nanoporos rectangulares estudiados
la disminucin en la DOS del sistema con poros depende de la medida del ancho
W del nanoporo y es independiente de la longitud D del nanporo, ello debido a las
caractersticas de transporte balstico considerado.
A continuacin dentro de nanoporo de longitud D = 7 3a y ancho W = 7a, cuyos
coecientes de transmisin y DOS son dados en la gura 44(c) y (d) respectivamente
emulamos la presencia de una molcula lineal orientada en la direccin del eje x,
esta molcula lineal es una red unidimensional nita como muestra la gura 53.
Consideramos que la interaccin entre sitios atmicos de la molcula es dada dentro
de la aproximacin tight-binding con el parmetro de Hopping tm , de modo que el
P
hamiltoniano molcular es dado por Hm = tm [|iihi + 1| + |i + 1ihi|] siendo |ii los
estados cunticos asociados a los orbitales tipo s de los sitios atmicos de la molcula.
Del mismo modo la interaccin entre el nanoporo y la molcula se asume tambien dentro
del modelo del tight-binding, de modo que que cada sitio de la molcula interacta con
el primer sito mas prximo del nanoporo por medio del parmetro de hopping tmp dado
por
~2 ~2 t
tmp = 2
= 2
= 2 , (5.12)
2mb 2m(rx,y ax,y ) rx,y
95
siendo b = rx,y ax,y la distancia de cada sitio de la molcula en la direccin paralela
x y perpendicular y a la coriente elctrica, hacia el sitio atmico mas prximo del borde
que dene el nanoporo.
96
coeciente de transmisin T en lugar del coeciente de transmisin T (E), T mide
la diferencia del coeciente de transmisin del sistema con nanoporo y el coeciente de
transmisin del sistema con nanoporo y la presencia de la molcula, de modo que las
resonancias se representan por picos negativos en T y las antiresonancias por picos
positivos en T . Para las guras siguientes consideramos un nanoporo de longitud
D = 7 3a y ancho W = 7a, cuyo coeciente de transmisin es representado en la
gura 52(e). Los resultados mostrados en la gura 55 representan T en funcin de
energa del sistema con nanoporo y la presencia en el centro del nanoporo de molculas
lineales compuesta por distinto nmero de tomos. Los tomos que constituyen a la
molcula se consideran idnticos e interactan entre s con un parmetro de Hopping
tm = t.
97
si la molcula se compone de seis tomos T presenta seis picos, que ocurren en las
energias E = 0.98; 2.78; 4.0 eV mostrados en la gura 55(d). Estos resultados
indican que la distribucin espectral de la energa de acoplamiento de un nmero de
tomos que componen la molcula lineal generan exactamente el mismo nmero de
picos en el perl de T , asmismo la intensidad de los picos en T son mas intensos
para determinados valores de energa.
98
gura 56(d) corresponde al caso cuando los tomos de la molcula lineal interactan
entre s con el parmetro de Hopping tm = 1.4t apareciendo los picos en T en las
energas E = 2.5; 6.4 eV. De acuerdo a estos resultados inferimos que el nanoporo
permite leer molculas con estructuras similares pero compuesta por tomos distintos,
dado que los picos que aparecen en T ocurren para valores de energa totalmente
diferentes.
99
en general un incremento de la resistencia elctrica y consecuentemente provoca la
disminucin de la corriente elctrica del nanoporo, as mismo debido a las formas en
las cuales fueron tomados los modelos de molcula el nmero de picos no coincide con el
nmero de tomos de constituyen la molcula, pero los resultados son particularmente
caractersticos del tipo de molcula considerada.
Conclusiones
100
Captulo 6
Conclusiones
101
Pierls, que produce la aparicin de niveles de Landau que se observan cuando los
campos magnticos aplicados son dbiles, estos niveles de Landau se transforman en
subbandas de Landau cuando el campo magntico aplicado es extremadamente alto y
el ancho del nanoribbons es mucho mayor al radio ciclotrnico.
102
siendo el mtodo recursivo de convergencia rpida mas eciente que el mtodo de
decimacin para determinar las funciones de Green de los contactos, pero para el
anlisis del nanodispositivo en s es ms recomendable el mtodo de decimacin por
ser aplicable incluso cuando las cadenas verticales consideradas tienen estructuras
diferentes, casos en las cuales el mtodo recursivo de convergencia rpida no es
aplicable, es decir una condicin necesaria para la utilizacin del mtodo recursivo
de convergencia rpida es que las cadenas verticales que constituyen el nanodispositivo
sean exactamente iguales.
103
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111
Apndice A
Relaciones importantes
ikRA ikRA
X XX
= t e l e m hB A
i |m i = 0
l hii m
112
hkA |H|kA i = 0 (A.1)
de manera similar se encuentra
A B
X X X
hkA |H|kB i = eikRl hA |A B B A
eikRm |B
l |
t j ihi | + |j ihi | mi
l hi,ji m
A X ikRB B
X X
= eikRl t hA A B A B A
l |j ihi | + hl |j ihi | e m |m i
l hi,ji m
A B
X X X
= eikRl t lj hB
i |
eikRm |B
mi
l hi,ji m
ikRA B
X X X
= t e l ll hB
i | eikRm |B
mi
l hii m
ikRA ikRB
X XX
= t e l e m hB B
i |m i
l hii m
ikRA B
X XX
= t e l eikRm im
l hii m
ikRA B
X X
= t e l eikRi
l hii
A B
XX
= t eikRl eikRi
l hii
B RA )
XX
= t eik(Ri l
l hii
donde RB A
i Rl representa la posicin relativa de los tomos de la red B respecto a
las posiciones de los tomos A.
Para un solo tomo A tenemos que las posiciones relativas de los primeros vecinos
son RB A ~ ~ ~
i Rl = 1 , 2 , 3 , de modo que
B A ~ ~ ~
X
hkA |H|kB i = t eik(Ri R ) = t eik1 + eik2 + eik3
hii
113
~ ~ ~
con f (k) = eik1 + eik2 + eik3 .
para un solo tomo B las posiciones relativas de los primeros vecinos son RA B
i R =
~1 , ~2 , ~3 , entonces
A B ~ ~ ~
X
hkB |H|kA i = t eik(Ri R ) = t eik(1 ) + eik(2 ) + eik(3 )
hii
~ ~ ~
hkB |H|kA i = t eik1 + eik2 + eik3 = tf (k) (A.4)
Sustituyendo los resultados (A.1), (A.2), (A.3) y (A.4) en la ecuacin (2.11), la
expresin matricial de H es
!
0 f (k)
H = t . (A.5)
f (k) 0
114
! !
3 1 3 1
~1 ~2 = ax ay ax ay = 3ax
2 2 2 2
!
~1 ~3 = 3 1 3 3
ax ay ay = ax ay
2 2 2 2
!
~2 ~3 = 3 1 3 3
ax ay ay = ax ay
2 2 2 2
entonces
! ! !
3 3 3 3 3 3
cos kx a + ky a + cos kx a + ky a = 2 cos kx a cos ky a
2 2 2 2 2 2
!
2
3 3
|f (k)| = 3 + 2 cos 3kx a + 4 cos kx a cos ky a (A.6)
2 2
1
si cos2 = 2 (1 + cos 2) entonces cos 2 = 2 cos2 2 1
2
!
3
cos 3kx a = 2 cos2 kx a 1 (A.7)
2
! !
3 3 3
|f (k)|2 = 1 + 4 cos2 kx a + 4 cos kx a cos ky a (A.8)
2 2 2
de donde
v ! !
u
u 3 3 3
|f (k)| = t1 + 4 cos kx a cos ky a + 4 cos2 kx a (A.9)
2 2 2
115