UNIVERSITE INTERNATIONALE ABULCASIS DES SCIENCES DE LA SANTE RABAT

PLAN DU COURS
ELEMENT DE MODULE : VIROLOGIE
1. Identification du module

UPR UPR Microbiologie

Titre du module Microbiologie-Immunologie
Code du module 2S3MD15
Elment du module Virologie
Coordinateur Pr El Ouenass
Population cible Etudiants concerns : 2me anne Mdecine
Enseignants participants au Pr M. SEFFAR
Module
Session 1er Semestre
Volume horaire total : 22 h
Nb dheures / sance : 2h
Volume horaire
Localisation des sances dans la semaine : Vendredi de
8h 12h
Salles 14-15, Universit internationale Abulcasis des
Lieu
Sciences de la sant de Rabat (UIASS)
Site Web :
Pr Myriam SEFFAR
Contact e mail : myriamseffar@yahoo.fr
m.seffar@chis.ma

2. Introduction
Place de llment de module Virologie dans le cursus de formation :

Prsentation de llment de module Virologie

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Llment de module Virologie est dispens la deuxime anne de Mdecine et

fait partie du module Microbiologie-Immunologie qui englobe en plus la
Bactriologie et lImmunologie.
Cet lment de module vise faire acqurir aux futurs mdecins les connaissances
de base en Virologie, indispensables lacquisition de comptences pour la prise en
charge des maladies infectieuses dorigine virale.

But de llment de module Virologie :

Le but de lenseignement de Virologie est de permettre au futur mdecin de situer

les virus pathognes pour lhomme dans le monde du vivant, de dfinir leur
structure, rplication, modes de transmission, de dcrire les mthodes
diagnostiques dune infection virale et matriser les principes de base de leur
prvention et de leur traitement.

Description gnrale :
Llment de module Virologie comporte 13 cours : 8 cours de 2 h et 5 cours de 1
h

1. Structure et classification des virus (2h)

2. Multiplication intracellulaire des virus (2h)
3. Mcanismes gnraux des infections virales (1h)
4. Diagnostic virologique : mthodes classiques et molculaires (2h)
5. Orthomyxoviridae (2h)
6. Paramyxoviridae (1h)
7. Herpesviridae (2h)
8. Picornaviridae (1h)
9. Virus des hpatites transmission entrale (2h)
10. Virus des hpatites transmission parentrale (2h)
11. Retroviridae (2h)
12. Togaviridae (1h)
13. Rhabdoviridae (1h)

3. Les objectifs dapprentissage

Objectifs gnraux
1- Acqurir les connaissances virologiques fondamentales.
2- Comprendre les maladies infectieuses virales.
3- Dcrire les mthodes de diagnostic virologique.

Programme et objectifs spcifiques

Prsentation de llment de module Virologie

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Cours n1 : Structure et classification des virus Dure : 2 h

Objectifs Contenus essentiels (titres de chapitres)

- Dfinir un virus.
- Citer les particularits des virus dans le monde
du vivant (bactries, parasites,..).
- Dcrire la structure gnrale dun virus.
- Citer les critres de classification des virus.
- Structure des virus : gnome, capside, enveloppe.
- Classification des virus ( International Committee on
Taxonomy of Viruses , ITCV).

Cours n2 : Multiplication intracellulaire des virus Dure : 2 h

Objectifs Contenus essentiels

- Prciser les conditions ncessaires la
multiplication dun virus.
- Expliquer les tapes de la multiplication virale
dans une cellule.
- Multiplication dun virus : Elments ncessaires la
biosynthse cellulaire des virions (rplication).
- Cycle de multiplication virale : attachement, pntration,
dcapsidation, rplication, assemblage, libration.
- Consquences de la multiplication virale pour la cellule
infecte.

Cours n3 : Mcanismes gnraux des infections virales Dure : 1 h

Objectifs Contenus essentiels

- Dcrire les modes de propagation des virus
dans lorganisme.
- Distinguer entre virus nus et virus enveloppe
en termes de rsistance aux conditions physico-
chimiques
- Expliquer laide dexemples les modes de
transmission et les diffrents types dinfections
virales.
- Propagation du virus dans lorganisme : voies de
pntration, diffusion du virus, organes cibles, voies
dexcrtion.
- Les diffrents types dinfection virale : infections aiges,
infections persistantes.
-Facteurs intervenant dans la pathognse : facteurs lis au
virus, facteurs lis lhte.

Cours n4 : Diagnostic virologique : mthodes classiques et molculaires Dure : 2 h

Objectifs
- Dcrire le mode de recueil et dacheminement
au laboratoire des prlvements pathologiques
destins lanalyse virologique.
- Dcrire les techniques de diagnostic direct et
indirect des infections virales.
-Dcrire le principe de lhybridation molculaire
et son application en virologie humaine.
-Dcrire le principe des mthodes
damplification gnique et leurs applications
en virologie humaine.
Contenus essentiels
- Nature, recueil et transport des prlvements virologiques
-Techniques de diagnostic direct : microscopie lectronique,
dtection immunologique des constituants antigniques du
virus, culture cellulaire.
-Techniques de diagnostic indirect : technique
immunoenzymatique de type ELISA, technique dimmuno-
empreinte (Western Blot, Immunoblot), technique
dimmunofluorescence indirecte.
-Mthodes dhybridation molculaire et damplification
gnique : principe, intrt, limites et applications en
virologie clinique

Prsentation de llment de module Virologie

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Cours n5 : Orthomyxoviridae
Objectifs
- Dcrire le schma gnral de la structure des
virus influenza.
-Dcrire l'organisation gnomique et les
caractres antigniques des virus influenza.
-Dcrire lpidmiologie et la physiopathologie
de linfection grippale.
- Dcrire les indications et la mise en uvre du
diagnostic virologique.
Cours n6 : Paramyxoviridae
Objectifs
-Dcrire le schma gnral de la structure des virus
de la famille des Paramyxoviridae.
- Dcrire l'organisation gnomique et les caractres
antigniques des virus de la famille des
Paramyxoviridae.
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie des
infections Paramyxoviridae.
- Dcrire les indications et la mise en uvre du
diagnostic virologique des infections
Paramyxoviridae.
Cours n7 : Herpesviridae
Objectifs
- Dcrire le schma gnral de la structure des
virus de la famille des Herpesviridae.
- Dcrire l'organisation gnomique et les
caractres antigniques des herpesvirus
humains.
- Expliquer l'pidmiologie et les particularits
de la physiopathologie des diffrents
herpesvirus humains.
- Dcrire les indications et la mise en uvre
des diffrents examens virologiques pour le
diagnostic.
Prsentation de llment de module Virologie
Dure : 2 h
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des virus influenza
2. Multiplication des virus influenza
3. pidmiologie
4. Physiopathologie de linfection grippale
5. Diagnostic virologique
5.1. Indications
5.2. Diagnostic direct : prlvements et transport, Isolement
viral, identification des virus influenza (types, sous-types et
variants), dtection des antignes viraux, dtection du
gnome viral par RT-PCR
5.3. Diagnostic srologique : prlvements et techniques
Dure : 1 h
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des Paramyxoviridae
2.Multiplication des virus : VRS, PIV, oreillons, rougeole
3.pidmiologie : VRS, PIV, oreillons, rougeole
4. Physiopathologie : VRS, PIV, oreillons rougeole
5. Diagnostic virologique
5.1. Indications
5.2.Diagnostic direct : prlvements et transport,
isolement viral, dtection des antignes viraux,
dtection du gnome viral par RT-PCR
5.3.Diagnostic srologique : prlvements et techniques
Dure : 2 h
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des Herpesviridae
2. Epidmiologie
3. Physiopathologie : tropisme cellulaire, organes cibles,
sige de l'infection latente.
4. Diagnostic virologique
4.1. Indications
4.2. Diagnostic direct : prlvements et transport, isolement
viral, dtection des antignes viraux
(immunocytodiagnostic, ELISA), dtection du gnome viral
par PCR qualitative et quantitative
4.3.Diagnostic indirect : prlvements, techniques et
interprtation des rsultats
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Cours n8 : Picornaviridae
Objectifs
- Dcrire le schma gnral de la structure des
virus de la famille des Picornaviridae.
- Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie
des infections entrovirus.
- Dcrire les indications et la mise en uvre du
diagnostic virologique des infections
entrovirus et rhinovirus.
Cours n9 : Hpatites transmission entrale
Objectifs
- Dcrire le schma gnral de la structure des
virus responsables dhpatites entrales.
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie,
des infections virus de lhpatite A et E
- Dcrire les indications et la mise en uvre du
diagnostic virologique des infections virus de
lhpatite A et E.
Cours n10 : Hpatites transmission parentrale
Objectifs
- Dcrire la structure et lorganisation gnomique
des virus HBV, HDV, HCV.
- Dcrire lpidmiologie et la physiopathologie des
virus HBV, HDV, HCV.
- Dcrire les indications, la mise en uvre des
diffrentes techniques utiles pour le diagnostic et la
surveillance virologique des infections par HBV, HDV
et HCV.
Prsentation de llment de module Virologie
Dure : 1 h
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des Picornaviridae
2. Epidmiologie : rservoir, transmission, zone de diffusion
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Contexte du diagnostic
4.2. Diagnostic direct : prlvements et transport, isolement
viral, identification du srotype viral, dtection du gnome
viral par RT-PCR
4.3. Diagnostic srologique: raction de sroneutralisation
du pouvoir infectieux en culture cellulaire utilisant la souche
du malade
Dure : 2 h
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des virus
2.Epidmiologie: rservoir, transmission, zone de diffusion
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Indications
4.2. Diagnostic indirect : diagnostic srologique par
mthode ELISA (IgM et IgG).
4.3. Diagnostic direct : dtection du gnome par RT-PCR
dans le plasma et/ou dans les selles
Dure : 2 h
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des virus HBV, HDV et HCV
2. Epidmiologie
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Diagnostic direct : mise en vidence du virus et/ou
de ses constituants (techniques ELISA,
immunohistochimie, techniques damplification par PCR
qualitative et quantitative, techniques de gnotypage,
squenage)
4.2. Diagnostic indirect : prlvements, techniques
ELISA, cintique des marqueurs virologiques dans le
srum en cas dhpatite aigu et chronique.
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Cours n11 : Retroviridae- Les virus de l'immunodficience humaine (VIH1 et 2)
Objectifs
-Dcrire la structure, lorganisation gnomique,
et le mode de rplication du VIH.
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie,
de l'infection par le VIH.
-Dcrire les diffrentes techniques de diagnostic
virologique utilises pour le diagnostic et le
suivi thrapeutique des sujets infects par les
VIH.
Cours n12 : Togaviridae- Rubivirus
Objectifs
- Dcrire le schma gnral de la structure du
virus de la rubole.
- Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie,
de l'infection virus de la rubole
- Dcrire les indications et la mise en uvre de
la srologie virale.
Cours n13 : Rhabdoviridae- Lyssavirus
Objectifs
- Dcrire le schma gnral de la structure des
Lyssavirus.
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie
de la rage humaine.
-Dcrire les indications et la mise en uvre des
examens virologiques utiles pour le diagnostic
de la rage.
Prsentation de llment de module Virologie
Dure : 2 h
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des virus HIV
2. Epidmiologie
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Indications
4.2.Diagnostic indirect: prlvements, tests de
dpistage/ELISA, tests rapides, tests de confirmation par
Western Blot ou Immunoblot.
4.3. Diagnostic direct : mise en vidence du virus et/ou de
ses constituants (antignmie p24, recherche qualitative et
quantitative de lARN viral par PCR, surveillance biologique
des traitements antirtroviraux)
Dure : 1 heure
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux du virus de la rubole
2. Epidmiologie
3. Physiopathologie
3.1. La rubole de lenfant et de ladulte (notions de primo-
infection et rinfection).
3.2. La rubole congnitale
4. Diagnostic virologique
4.1. Contexte du diagnostic: dpistage systmatique,
dpistage effectu dans un contexte clinique vocateur,
diagnostic de linfection congnitale.
4.2. Diagnostic srologique : prlvements et techniques de
diagnostic
Dure : 1 heure
Contenus essentiels
1. Caractres gnraux du virus de la rage
2. pidmiologie
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Objectifs du diagnostic
4.2. Diagnostic direct : prlvements et techniques
4.3. Diagnostic srologique
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4. Les mthodes denseignement et les activits dapprentissage

Mthodes denseignement de la Virologie

Cours magistral illustr

Sances de rvision
Contrles continus

Mthodes dapprentissage :

Cours magistral illustr interactif: la prsence est obligatoire, le

contenu du cours et le support dimages permettra de mieux
mmoriser les cours de virologie fondamentale sous tous ses aspects.

5. Modalits dvaluation

En fin de semestre, date fixe par lUniversit: preuve de

Microbiologie-Immunologie incluant les programmes de
Bactriologie, Virologie et Immunologie.
Dure : 30 min / 2h (dure totale de lpreuve)
Modalits: QCM
Note de lpreuve de Virologie : sur 20 (30% du module)

6. Autres informations

Personnes ressources : coordinateur du module et enseignant

de llment de module
Rfrences recommandes
*Trait de Virologie mdicale. Jean-Marie Huraux, Jean-
Claude Nicolas, Henri Agut, Hlne Peigue-Lafeuille. Editions
ESTEM De Boeck, 2003.
* Virologie mdicale. Collection Azay. A. Mammette.
Presses universitaires de Lyon, 2002.
* Prcis de Virologie humaine. Coordonn par Alain Le
Faou. Biosciences et techniques 2012.

Prsentation de llment de module Virologie