Comparacin de mapas

Los 147 mtDNA mapeados(analizados) fueron divididos dentro de 133 tipos. Siete de esos tipos
fueron encontrados en ms de un individuo; ningn individuo contuvo ms que un tipo. Ninguno de
los siete tipos compartidos ocurri en ms que una de las cinco regiones geogrficas. Un tipo, por
ejemplo, fue encontrado en dos Australianos. Entre caucasianos, otro tipo ocurri tres veces y dos
tipos ms ocurrieron dos veces. En Nueva Guinea, dos tipos adicionales fueron encontrados tres
veces y el sptimo caso implic un tipo encontrado en seis individuos, .
Dan un histograma mostrando al nmero de diferencias de sitio de restriccin entre los pares de
individuos en la figura.1; el nmero medio de diferencias observadas entre cualquier par de
humanos tiene 9.5 aos. La distribucin es aproximadamente normal, con un exceso de
comparaciones por parejas que involucran grandes nmeros de diferencia.
Del nmero de restriccin de diferencias de ubicacin, estimamos el grado de secuencia de
nucletido divergente para cada par de individuos. Estas estimaciones alcanzan un rango de cero a
1.3. substituciones por 100 pares bajos, con una divergencia de secuencia media del 0.32 %, que
est de acuerdo con l de Brown. quin examin slo a 21 humanos.
La tabla 1 da tres medidas de secuencia divergente dentro de y entre cada una de las cinco
poblaciones examinadas. Estas medidas estn relacionadas el uno con el otro por la ecuacin (1):
= 0.5( + )

donde x es la principal divergencia entre parejas (en porcentajes) entre individuos dentro de una
poblacin sola (X), y es el correspondiente valor para otra poblacin (Y), xy es la principal
divergencia entre parejas entre individuos pertenecientes a dos diferentes poblacions (X y Y), y
es una medida de la divergencia interdemogrfica correjida para la divergencia intrademogrfica.
Los africanos como un grupo son ms variable (x =0.47) que otros grupos, De verdad, la variacin
dentro de la poblacin africana es tan grande como entre estos Africanos y cualquier otro grupo
(xy = 0.40-0.45). dentro de la variacin del grupo de los asiticos ( x = 0.35) es tambin
comparable a esto que existe entre grupos, Para Australiana, caucasianos, y de nueva guinea,
quienes muestran la variacin dentro del grupo de cantidades casi idntica (x = 0.23 - 0.25), la
variacin entre grupos ligeramente excede esto dentro de grupos.
Cuando las distancias interdemogrficas (xy ) son corregidas para la variacin interdemogrfica (la
tabla .1), ellos se hacen muy pequeos ( = 0.01 - 0.06). el valor medio del valor corregido entre
poblaciones ( = 0.04) es menos que un sptimo de la distancia media entre individuos dentro de
una poblacin (0.30). la mayor variacin de la mtDNA en la especie humana es, por lo tanto,
compartido entre poblaciones. Un anlisis ms detallado apoya esta vista(opinin).
LIMITACIONES FUNCIONALES
La Figura 2 muestra la divergencia de secuencia (x ) calculada para cada poblacin a lo largo de
siete regiones funcionalmente distintivas del genoma del ADNmt. Como se ha visto antes, la regin
ms variable es el la repeticin del desplazamiento ( = 1,3), la porcin no codificante principal de
la molcula de ADNmt y la regin menos variable es el gen del ARN ribosmico

( = 0,2). En general, los africanos son los ms diversos y los asiticos son los siguientes, en todas
las regiones funcionales.
RBOL EVOLUTIVO
Un rbol que relaciona los 133 tipos de ADNmt humano y la secuencia de referencia (Fig. 3) fue
construido por el mtodo de parsimonia. Para interpretar este rbol, hacemos dos suposiciones, las
cuales tienen un amplio apoyo emprico: (1) un modo estrictamente maternal De la transmisin de
ADNmt (de modo que cualquier variante que aparezca en un grupo de linajes debe ser debido a una
mutacin que ocurre en el linaje ancestral y no a la recombinacin entre genomas materno y
paterno) y (2) cada individuo es homogneo para sus mltiples genomas de mtDNA. Por lo tanto,
podemos ver el rbol como una genealoga que une los linajes maternos en las poblaciones humanas
modernas a una hembra ancestral comn (que lleva el ADNmt a).
A partir de los datos se pueden hacer muchos rboles de mnima o mnima longitud; Todos los
rboles que hemos examinado comparten las siguientes caractersticas con Fig.3. (1) dos ramas
primarias, una compuesta enteramente de africanos, la otra incluyendo todas las 5 poblaciones
estudiadas; Y (2) cada poblacin proviene de mltiples linajes conectados al rbol en posiciones
muy dispersas. Desde la presentacin de este manuscrito, /Horai et al.29/ construyeron un rbol
para nuestras muestras de poblaciones africanas y caucsicas y su muestra de una poblacin
japonesa por otro mtodo; Su rbol comparte estas dos caractersticas.
Entre los rboles investigados se encontraban cinco ramas primarias, cada una de las cuales
conduca exclusivamente a una de las cinco poblaciones. Este rbol, que llamamos el rbol
especfico de la poblacin, requiere 51 mutaciones ms puntuales que el rbol de longitud mnima
en la Fig. 3. El rbol de longitud mnima requiere menos cambios en 22 de los 93 sitios de
restriccin filogenticamente informativos que el rbol poblacional-especfico, mientras que el
ltimo rbol requiere menos cambios en cuatro sitios; Ambos rboles requieren el mismo nmero
de cambios en los 67 sitios restantes.
El rbol de longitud mnima es favorecido por una puntuacin de 22 a 4. La hiptesis de que los dos
rboles son igualmente compatibles con los datos se rechaza estadsticamente, ya que 22: 4 es
significativamente diferente de la esperada 13:13. La longitud mnima libre es as
significativamente ms parsimoniosa que rbol especifico de la poblacin.
ORIGEN AFRICANO
Se deduce del rbol de longitud mnima (Fig. 3) que frica es una fuente probable de la reserva
gentica mitocondrial humana. Esta inferencia viene de la observacin de que una de las dos ramas
primarias conduce exclusivamente a los ADNmt africanos (tipos 1-7, Fig. 3), mientras que la
segunda rama primaria tambin conduce a los ADNmt africanos (tipos 37-41, 45, 46, 70 , 72, 81,
82, 111 y 113). Al postular que el ADNmt ancestral comn (tipo a en la figura 3) era africano,
minimizamos el nmero de migraciones intercontinentales necesarias para explicar la distribucin
geogrfica de los tipos de ADNmt. se sigue que b es un ancestro comn probable de todos los no
africanos Y muchos ADNsmt africanos (tipos 8-134 en Fig.3)

LINAJE MULTIPLE POR RAZA

La segunda implicacin del rbol (Fig. 3) de que cada poblacin no africana tiene mltiples
orgenes se puede ilustrar ms simplemente con los nuevos guineanos. Tomemos, como ejemplo de
arte, el ADNmt tipo 49, un linaje cuyo pariente ms cercano no est en Nueva Guinea, sino en Asia
(tipo 50). El linaje asitico 50 est ms cerca genealgicamente a este linaje de Nueva Guinea que a
otros linajes mtDNA asiticos.
Otros seis linajes conducen exclusivamente a ADNmt de Nueva Guinea,
Cada uno originando en un lugar diferente en el rbol (tipos 12, 13,
26 - 29, 65, 95 y 127 - 134 en la Fig. 3). Esta pequea regin de Nueva
Guinea (principalmente la provincia de las Tierras Altas Orientales) parece haber sido colonizada
por al menos siete linajes maternos (Cuadros 2 y 3).
De la misma manera, calculamos los nmeros mnimos de linajes femeninos que colonizaron
Australia, Asia y Europa (Cuadros 2 y 3). Cada estimacin se basa en el nmero de grupos de
regiones especficas en el rbol (Fig. 3, Cuadros 2 y 3]. Estos nmeros, que van de 15 a 36
(Cuadros 2 y 3), probablemente aumentarn ms tipos de ADNmt humano.
ESCALA DE TIEMPO PROVICIONAL
Una escala de tiempo se puede fijar al rbol en la Fig. 3 suponiendo que la divergencia de la
secuencia del ADNmt se acumula a una velocidad constante en los seres humanos. Una forma de
estimar esta tasa es considerar el grado de diferenciacin dentro de los grupos especficos de Nueva
Guinea (Tabla 2, ver tambin las referencias 23 y 30), Australia y el Nuevo Mundo.
La gente coloniz estas regiones relativamente recientes: hace un mnimo de 30.000 aos para
Nueva Guinea hace 46.000 aos para Australia y hace 12.000 aos para el Nuevo Mundo. Estos
tiempos nos permiten calcular que la tasa media de divergencia de ADNmt dentro de los seres
humanos se encuentra entre dos y cuatro por ciento por milln de aos; Una cuenta detallada de este
clculo aparece en cualquier lado.
Esta tasa es similar a las estimaciones anteriores de animales tan dispares como monos, monos,
caballos, rinocerontes, ratones, ratas, aves y peces. Por lo tanto, consideramos que la estimacin
anterior del 2% al 4% es razonable para los seres humanos, aunque se necesita un trabajo
comparativo adicional para obtener una calibracin ms exacta,
Como muestra la Fig. 3 muestra, el mtDNA ancestral comn (tipo a) vincula los tipos de ADNmt
que han divergido en un promedio de casi 0,57%. Suponiendo una tasa del 2% -4% por milln de
aos, esto implica que el antepasado comn de todos los tipos sobrevivientes de ADNmt exista
hace 140.000-290.000 aos. De manera similar, los tipos ancestrales b-j pueden haber existido hace
62.000-225.000 aos (Tabla 3).
Cundo ocurrieron las migraciones de frica? El ms antiguo de los grupos de tipos de ADNmt
para no contener ningn miembro africano se deriva de antepasado 'c' e incluye los tipos 11-29 (Fig.
3). La edad aparente de este grupo (calculada en la Tabla 3) es de 90.000 180.000 aos. Sus
fundadores pudieron haber salido de frica en ese tiempo. Sin embargo, es igualmente posible que
el xodo ocurri tan recientemente como hace 23-105 mil aos (Tabla 2). Los resultados del
mtDNA no nos pueden decir exactamente cundo ocurrieron estas migraciones.

OTROS ESTUDIOS DE ADNmt

Dos estudios previos de ADNmt humano han incluido individuos africanos21 28; Ambos apoyan
un origen africano para el grupo gentico humano de mtDNA. Johnson et al. Encuest alrededor de
40 sitios de restriccin en cada uno de 200 ADNmt de frica, Asia, Europa y el Nuevo Mundo, y
encontr 35 tipos de ADNmt. Este nmero mucho ms pequeo de tipos de ADNmt probablemente
refleja la incapacidad de sus mtodos para distinguir entre ADNmt que difieren en menos del 0,3%
y puede explicar la mayor agrupacin de tipos de ADNmt por origen geogrfico que observaron,
(Por el contrario, nuestros mtodos distinguen entre MtDNAs que difieren en un 0,03%). Aunque
Johnson et al. Favorecieron un origen asitico, tambin encontraron que los africanos poseen la
mayor cantidad de variabilidad del mtDNA y que un enraizamiento de su rbol en el punto medio
da lugar a un origen africano.
Greenberg et al.28 secuenciaron la gran regin no codificante, que incluye el bucle de
desplazamiento (bucle D), de cuatro caucsicos y tres negros americanos. Un rbol de parsimonia
para estas siete secuencias de bucle D, enraizado por el mtodo de punto medio, aparece en la Fig.
4. Este rbol indica (1) una alta tasa evolutiva para el bucle D (al menos cinco veces ms rpido que
otras regiones de intDNA), (2) una mayor diversidad entre las secuencias de bucle D de los negros
americanos, y (3) que el antepasado comn era africano.
ESTUDIOS DEL ADN NUCLEAR
Las estimaciones de distancia gentica basadas en estudios comparativos de genes nucleares y sus
productos difieren en especie de las estimaciones de ADNmt. Estos ltimos se basan en el nmero
real de mutaciones entre los genomas mtDNA, mientras que los primeros se basan en las diferencias
en. Las frecuencias. De las variantes moleculares medidas entre y dentro de las poblaciones. Las
frecuencias genticas pueden estar influenciadas por la recombinacin, la deriva gentica, la
seleccin y la migracin, por lo que la relacin directa encontrada entre el tiempo y la distancia
mutacional para el ADNmt no se esperara para las distancias genticas basadas en el ADN nuclear.
Sin embargo, los estudios basados en grupos sanguneos polimrficos, en las enzimas de los
glbulos rojos y en las protenas del suero muestran que (1) las diferencias entre grupos raciales son
ms pequeas que las de esos grupos y (2) las mayores diferencias de frecuencia gentica entre
africanos y otras poblaciones, Origen del grupo gentico nuclear humano
Estudios ms recientes de polimorfismos de sitio de restriccin en el ADN nuclear apoyaron estas
conclusiones
RELACIN CON EL REGISTRO FOSIL
Nuestra interpretacin tentativa del rbol (Fig. 3) y la escala de tiempo asociada (Tabla 3) encaja
con una vista del registro fsil: que la transformacin de formas arcaicas a formas anatmicamente
modernas del Homo sapiens ocurri primero en frica,
Los arquelogos han observado que las hojas eran de uso comn en frica hace 80-90 mil aos,
mucho antes de que reemplazaran las herramientas de escamas en Asia o Europa.
Pero el acuerdo entre nuestra visin molecular y la evidencia de paleoantropologa y arqueologa
debe ser tratado con cautela por dos razones. En segundo lugar, nuestra colocacin del ancestro
comn de toda la diversidad humana del ADNmt en frica hace 140.000 - 280.000 aos no
necesariamente implica que la transformacin al Homo sapiens anatmicamente moderno ocurri
en frica en este momento . Los datos del mtDNA no nos dicen nada de las contribuciones a esta
transformacin por los rasgos genticos y culturales de los machos y hembras cuyo ADNmt se
extingui.
Una visin alternativa de la evolucin humana descansa en la evidencia de que el Homo ha estado
presente tanto en Asia como en frica durante al menos un milln de aos y sostiene que la
transformacin de los humanos arcaicos a anatmicamente modernos ocurri en paralelo en
diferentes partes del Viejo Mundo . Esta hiptesis nos lleva a esperar diferencias genticas de gran
antigedad dentro de partes ampliamente separadas de la piscina moderna de ADNmt. Es difcil
conciliar los resultados del ADNmt con esta hiptesis, Las mayores divergencias dentro de los
grupos especficos de las partes no africanas del mundo corresponden a pocas de 90.000 a 180.000
aos. Esto podra implicar que el "homo asitico temprano" (tal como el hombre de Java y el
hombre de Pekn) no aport ningn linaje de mtDNA sobreviviente al grupo gentico de nuestra
especie. Consistente con esta implicacin son rasgos, encontrados recientemente en los esqueletos
de las antiguas formas asiticas, que hacen improbable que el erectus asitico fuera ancestral del
Homo sapiens. Tal vez la poblacin erectus no africana fue reemplazada por Sapiens migrantes de
frica; Fsiles incompletos que indican la posible presencia de los primeros humanos modernos en
el oeste de Asia en Zuttiyeh (75 000-150 000 aos) y Qafzeh (50 000-70 000 aos atrs) podra
reflejar estas primeras migraciones.
Si hubo hibridacin entre las formas arcaicas residentes en Asia y las formas anatmicamente
modernas que emergen de frica, debemos esperar encontrar tipos extremadamente divergentes de
ADNmt en los actuales asiticos, ms divergentes que cualquier ADNmt encontrado en frica. No
hay evidencia de estos tipos de mtDNA entre los asiticos estudiados. Aunque tales tipos arcaicos
de mtDNA podra haberse perdido de la poblacin hibridante, la probabilidad de que los linajes de
ADNmt se extingan en una poblacin en expansin es baja. As, proponemos que el Homo erectus
en Asia fue reemplazado sin mezclarse mucho con el invasor Homo sapiens de frica.
CONCLUSIONES Y PERPECTIVAS
Los estudios del mtDNA sugieren una visin de cmo, dnde y cundo surgieron los humanos
modernos que encaja con una interpretacin de la evidencia de antiguos huesos humanos y
herramientas. Se necesitan comparaciones moleculares ms extensas para mejorar nuestro
enraizamiento del rbol de ADNmt y la calibracin de la tasa de divergencia de ADNmt dentro de
la especie humana. Esto puede proporcionar una escala de tiempo ms confiable para la
propagacin de poblaciones humanas y mejores estimaciones del nmero de linajes maternos
involucrados en la fundacin de las poblaciones no africanas.
Tambin es importante obtener ms estimaciones cuantitativas de la extensin general de la
diversidad de ADN nuclear en las poblaciones de simios humanos y africanos. Al comparar las
diversidades de ADN nuclear y mitocondrial, puede ser posible averiguar si un cuello de botella
transitorio o prolongado en el tamao de la poblacin acompa el origen de nuestra especie.
Entonces una interaccin ms completa entre paleoantropologa, arqueologa y biologa molecular
permitir un anlisis ms profundo de cmo surgi nuestra especie.
Damos las gracias a la Fundacin para la Investigacin en el Origen del Hombre, la Fundacin
Nacional de la Ciencia y el NIH de apoyo. Tambin agradecemos a P. Andrews, K. Bhatia, F. C.
Howell, W. W. Howells, R. L. Kirk, E. Mayr, E. M. Prager, V. M. Sarich, C. Stringer y T. White
para la discusin y ayuda en la obtencin de placentas.
Figura. 3 a, rbol genealgico para 134 tipos de ADNmt humano (133 mapas de restriccin ms
secuencia de referencia); B, lista completa de sitios de restriccin polimrficos utilizados. El rbol
explica las diferencias de sitio observadas entre los mapas de restriccin de estos ADNmt con 398
mutaciones. Ningn otro orden de ramificacin probado es ms parsimonioso que ste. Este orden
de ramificacin se obtuvo (usando el programa de computadora PAUP, diseado por el Dr. David
Swofford) ignorando cada sitio presente en un solo tipo de ADNmt o ausente en un solo tipo y
limitando la atencin a los 93 sitios polimrficos restantes. El programa de computadora produce
una red no desarraigada, que convertimos en un rbol colocando la raz (flecha) en el punto medio
del camino ms largo que conecta los dos linajes (vase la referencia 58). Los nmeros se refieren
a los tipos de mtDNA, no. 1 de la lnea de clulas aborgenes de Sudfrica (! Kung) (GM 3043), no.
45 de la lnea celular HeLa y no. 110 siendo la secuencia humana publicada barras negras, grupos
de tipos de ADNmt especficos de una regin geogrfica dada; Asteriscos, tipos de mtDNA
encontrados en ms de 1 individuo: el tipo 134 estaba en seis individuos, los tipos 29, 65 y 80
ocurrieron cada uno tres veces, y otros tipos marcados con asteriscos ocurrieron dos veces. Para
colocar los nodos en el rbol en relacin con el porcentaje de divergencia escala, hemos tenido en
cuenta las diferencias observadas en todos los 195 sitios polimrficos. B, La numeracin de sitios
es de acuerdo con la secuencia humana publicada. Con 12 enzimas de restriccin indicadas por el
siguiente cdigo de una letra:
A, AluI; B, AvaII; C, DdeI; D, FnuDII; E, HaeIII; F, HhaI; G, HinfI; H, HpaI; I, HpaII; J. MboI;
K, RsaI; 1, TaqI. Los sitios en cursiva estn presentes en los tipos de ADNmt indicados y los sitios
no-centralizados estn ausentes en los tipos indicados; Los parntesis se refieren a ubicaciones
alternativas de sitios inferidos; Los sitios separados por una barra diagonal son polimrficos para
dos enzimas de restriccin diferentes causadas por una sola sustitucin de nucletidos inferida;
Las letras en negrita se refieren a regiones y genes no codificantes para ARN de transferencia,
ARN ribosmico y protenas (ND, NADH deshidrogenasa, CO, citocromo oxidasa, ATP, adenosina
trifosfatasa, CYTb, citocromo b). Por ejemplo, Si indica un sitio MboI que comienza en la posicin
8 del nucletido en el bucle D que no se encontr en el ADNmt tipo 1, pero estaba presente en el
tipo 2, etc. Tenga en cuenta que dado que este sitio no est presente en la secuencia de referencia
(tipo 110) , La secuencia que comienza en la posicin 8 es en realidad una semisita, que difiere de
la secuencia de reconocimiento MboI en una posicin (vase la referencia 23 para una descripcin
detallada del mtodo de mapeo de dichos sitios inferidos). No todos los sitios fueron puntuados en
todos los individuos: 8j, 1484e y 7750c no se determinaron para los tipos 1, 31, 59, 63, 68 y todos
los ADNmt de Nueva Guinea; MtDNAs 114 y 121 no se puede escribir con RsaI. Las ubicaciones de
algunos sitios difieren de las reportadas anteriormente, al igual que las personas en las que
ocurren algunos sitios; Estas revisiones se basan en el reexamen de los ADNmt previamente
estudiados.