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Regulacin de la

expresin gnica
VOG MSc.
La expresin de genes en diversos tejidos
permite la adaptacin a condiciones variables
de ingesta alimenticia o del ambiente
La expresin de genes en respuesta a cambios
en el estado nutricional y cambios en el
ambiente son eventos bien caracterizados en
Procariontes.
Clulas nicas son capaces de ajustar sus
capacidades metablicas en respuesta a
variaciones en la administracin de nutrientes
o a cambios ambientales en el medio de
cultivo.
En organismo multi-celulares, el control de
la expresin gnica difiere en varios aspecto
con respecto a como opera una clula nica e
involucra complejas interacciones
hormonales, factores neurales y
nutricionales.
Dogma de la biologa molecular
Flujo de Informacin en la Clula
Expresin Gnica

El proceso por el cual la informacin de los genes es


convertida dentro de estructuras con funciones
celulares. En este proceso se generan molculas
biolgicamente funcionales tales como Protenas o RNA.

La expresin gnica es controlada en varios punto desde


la secuencia de DNA a la sntesis de protenas.
DNA Sntesis de Protenas:
Cuatro estados

Transcripcin
Procesamiento del RNA
Traduccin
Procesamiento Post-transduccional
Expresin Gnica
El ADN

Francis Harry Compton


Crick y James Dewey
Watson en 1953
ADN

Formado por genes: fragmentos cortos de ADN, que


contiene la inform
Las instrucciones para formar cualquier ser vivo, ya
sea una bacteria o una manzana se localizan en las
molculas de ADN, que se encuentran como ya hemos
visto en el cromosoma de la clula.
Estas instrucciones estn ordenadas en base a un
cdigo gentico, que consiste en la diferente
ordenacin de cuatro unidades qumicas denominadas
bases nucleotdicas.
Estructura bsica
Nuclesidos y nucletidos
Componentes
Los cidos nucleicos
ADN
ADN y ARN
ARN: tipos
GEN: Trozo de ADN capaz
de codificar una protena
Proceso
https://www.youtube.com/watch?v=gG7uCskUOrA
Gen: Trozo de ADN que
codifica a una protena
1.Bases Nitrogenadas (letras)

2. Codones (palabras)

3. Genes (frases)
La expresin de genes es
diferente entre procariontes y
eucariontes
Procariontes
Organelos sin membrana (sin nucleo)
Organismos mas primitivos
Solo un cromosoma circular

Eucariontes
Organelos unidos a membranas (especializados en
funciones nucleo, mitocondria, cloroplasto)
Cromosomas estn en pares y no es circular
Comparacin del nmero de genes en
una simple bacteria con el nmero de
genes en un humano.
Transcripcin gnica

Transcripcin
Sntesis de un RNA que es complementario a una de las
hebras de DNA.
Transcripcin

RNA
Hebra simple
La Timina es
reemplazada por
Uracilo
tRNA
Lleva un cdigo de 3
bases que codifican
para un aminocido
especfico.
RNA Polimerasas
Enzimas de diferente tipo involucradas en la sntesis de
RNA, catalizan la unin de nucletidos trifosfato para originar
una cadena de nucletidos monofosfato, copiando una hebra
de DNA (templado), de acuerdo a las reglas de la
complementariedad de bases: A con U, G con C.
RNA polimerasa de Procariotes: Una enzima nica cataliza la
sntesis de todos los RNA. La rifampicina inhibe a la RNA pol.
y bloquea la sntesis de todos los RNA.
RNA polimerasas de eucariotes: existen tres diferentes RNA
polimerasas:
RNA pol I: Transcribe los RNA ribosomales (excepto el 5S)
RNA pol II: Transcribe los precursores de los mRNAs que codifican
para protenas y micro RNAs
RNA pol III: Transcribe RNA ribosomales 5S, los tRNA y otros RNA
pequeos.
La transcripcin est dividida
en tres faces
Iniciacin

La unin de la polimerasa causa un desenrrollamiento de


la doble hebra de DNA lo cual expone al menos 12 bases
del templado
Esto es seguido por la iniciacin de la sntesis de RNA en
este punto de partida.
La RNA polimerasa comienza a construir la hebra de RNA,
esta ensambla los ribonucleotidos trifosfato.
Despus de que el primer nucleotido est en su lugar, la
polimerasa une un segundo nucleotido al primero
formando el enlace fosfodiester inicial en la cadena de
RNA
Elongacin

La RNA polimerasa dirige la unin secuencial de


ribonucleotidos para ir alargando la hebra de RNA en la
direccin 5 al 3.
Cada ribonucleotido es insertado dentro de la hebra de
RNA que est en crecimiento. Este proceso es repetido
hasta que el RNA alcanza el largo deseado
Terminacin

Terminadores al final de los genes. Seal de trmino .


Estos trabajan en conjunto con la RNA pol para reducir
la unin del producto de RNA y la hebra de DNA
templado. El resultado es que el RNA se disocia desde la
RNA pol y el DNA detiene la transcripcin.
En eucariontes el producto se conoce como RNA
inmaduro o pre-mRNA.
El mRNA de eucariontes es
modificado en su extremo 5

Necesario para:
El proceso normal de traduccin del ARN
Mantener estabilidad del mRNA
Para el reconocimiento y el acceso
apropiado del ribosoma
El mRNA de eucariontes presenta
poli adenilacin en su extremo 3

Esta cola de poliA protege


al mRNA frente a la
degradacin, y aumenta
su vida media en el
citosol, de modo que se
puede sintetizar mayor
cantidad de protena
Edicin del mRNA
En procariontes el transcrito de mRNA va directo a los
ribosomas del citoplasma
En eucariontes el transcrito de mRNA fresco en el
ncleo es de alrededor de 5000 nucletidos de largo
Cuando este mismo mRNA es usado para la traduccin
en el ribosoma es de solo 1000 nucletidos de largo
El mRNA ha sido editado
Las partes que son conservadas para la expresin de
genes son llamadas EXONES (exons = expressed)
Las partes que son editadas (por snRNP molculas) son
llamadas INTRONES.
Sntesis de protenas
Solo algunas regiones del DNA
codifican para protenas
Tipos de RNA

RNA mensajero (mRNA) <5%


RNA Ribosomal (rRNA) Sobre 80%
RNA Transferencia (tRNA) Cerca de15%
En eucariontes pequeas ribonucleoproteinas (snRNP).
Traduccin
Cdigo gentico: Cuntas
combinaciones??

Si una base representa 1 aminocido esto slo sera capaz de


producir 4 diferentes combinaciones. (A, C, G y U)
Si un par de bases representa cada aminocido esto sera capaz
de producir

4 x 4 = 16 combinaciones. (AA, AC, AG, AU, CA, CC, CG, CU etc)


Si tripletes de bases representan cada aminocido, esto podra
ser capaz de producir

4 x 4 x 4 = 64 combinaciones Estas son suficientes combinaciones


para codificar 20 aminocidos, pero el cdigo actualmente hace
un mayor nmero de tripletes?
El cdigo gentico es degenerado:
existen ms tripletes o codones que aminocidos, de
forma que un determinado aminocido puede estar
codificado por ms de un triplete.
El marco de
lectura define
la secuencia de
la protena
producida a
partir del mRNA
Iniciacin: La subunidad
pequea del ribosoma se
une a la regin lder del
ARNm y el ARNm se desplaza
hasta llegar al codn AUG,
que codifica el principio de
la protena. Se les une
entonces el complejo
formado por el ARNt-
metionina (Met). La unin se
produce entre el codn del
ARNm y el anticodn del
ARNt que transporta la
metionina (Met)
Elongacin I: A continuacin se une la
subunidad mayor a la menor
completndose el ribosoma. El
complejo ARNt-aminocido 2, la
glutamima (Gln)[ARNt-Gln] se sita
enfrente del codn correspondiente
(CAA). La regin del ribosoma a la que
se une el complejo ARNt-Gln se le
llama regin aminoacil (A)
Elongacin II: Se forma el enlace
peptdico entre el grupo carboxilo de
la metionina (Met) y el grupo amino
del segundo aminocido, la glutamina
(Gln)
Elongacin III: Unin del pptido Met-Gln-Cys-Leu con el 5
aminocido, la arginina (Arg). Liberacin del ARNt de la
leucina (Leu). El ARNm se desplaza a la 6 posicin, se trata
del un codn de finalizacin o de stop
Finalizacin I: Liberacin del pptido o
protena. Las subunidades del ribosoma se
disocian y se separan del ARNm
Finalizacin II: Despus unos minutos los ARNm
son digeridos por las enzimas del hialoplasma
Niveles de Control de la
Expresin gnica en Eucariontes
Regulacin del procesamiento
del RNA
Regulacin de la transcripcin en
eucariontes:

RNA polimerasas no pueden iniciar transcripcin por s solas.


Requieren de un grupo de protenas, los factores generales de
transcripcin, que deben ensamblarse al promotor para que
se inicie la transcripcin.
El ensamble de los factores de transcripcin permite varios
niveles de regulacin para acelerar o frenar la iniciacin de la
transcripcin por medio de protenas reguladoras.
Muchas de estas protenas reguladoras pueden actuar unidas
al DNA a miles de nucletidos de distancia del promotor que
influencian.
Modificaciones de histonas se extiende, induce
compactacin de la cromatina e induce represin
masiva de la actividad transcripcional

Modificaciones post transduccionales: Metilacin,


acetilacin, fosforilacin, ubiquitinacin Patrones
especficos de modificaciones de las histonas estn
presentes en diferentes tipos de clulas juegan un
papel clave en la determinacin de la identidad celular
Silenciamiento de genes: metilacin de lisina
Activacin de genes: acetilacin de lisina

Patrones especficos de modificaciones de las histonas estn presentes


en diferentes tipos de clulas juegan un papel clave en la
determinacin de la identidad celular
Metilacin del DNA modula negativamente
la actividad transcripcional, es heredable
Epigentica

Corresponde la perpetuacin de diferencias en la


expresin de uno o mas genes sin generar un cambio en
la secuencia del DNA.
Ello generalmente por que las modificaciones
covalentes de DNA pueden ser perpetuadas, ello genera
diferentes propiedades en la expresin de genes.
Qu son las modificaciones post-
traduccionales ?

Modificaciones en las protenas una vez ha terminado


su sntesis.
Se han descrito ms de 100 modificaciones
postraduccionales.
Ejemplos de modificaiones post-
traduccionales
Cmo cuantificar los niveles de
expresin de un gen?

Cuantificando los niveles de mRNA


RT-PCR
Transcripcin reversa acoplada a PCR
Es un mtodo sensible para deteccin de mRNA
Involucra 2 pasos:
1. Transcriptasa reversa: se aisla el RNA total y se
transcribe a cDNA.
2. Se amplifica la seal a partir del cDNA mediante el uso de
partidores especficos para un gen.

Microarray
Qu es un Microarray?
Se conocen como chip de DNA
Permiten determinar de forma simultnea los niveles de
transcripcin para cada gen en un genoma (expresin
gnica).
Microarray de expresin detecta mRNA, o mas estable el
cDNA.

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