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TEMA: AMINOACIDOS
SEMESTRE: 3
INDICE
Los aminocidos son un grupo heterogneo de molculas que poseen unas caractersticas
gentico .aunque hay otros aminocidos menos frecuentes que se forman por modificaciones
producen un gran nmero de protenas diferentes. El tamao puede ser variado, desde pptidos
formados por un nmero pequeo de aminocidos hasta polmeros de una elevadsima masa
Adems de ser las unidades estructurales de las protenas, existen aminocidos que son
intermediarios de ciertas rutas metablicas, como las citrulinas y la ortinina en el ciclo de la urea.
Otros son precursores de muchas sustancias biolgicas que contienen nitrgeno (grupo hemo,
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de 135). Todos los aminocidos a-aminocidos son cido orgnicos (a-COOH) que contienen un
grupo amino (NH2) y un tomo de hidrogeno unidos al carbono a. difieren unos de otros por la
composicin qumica de sus grupos R ( cadenas laterales). Sus a-COOH y a-NH2 estn ionizados
en solucin a pH fisiolgico, con una carga negativa sobre el grupo carboxilo desprotonado y
una carga positiva sobre el grupo amino protonado. Un aminocido en su estado dipolar se
denomina zwytterion.2
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Bioqumica conceptos esenciales feduchi
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Bioqumica Frank braley armstrong
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ANTECEDENTE HISTORICOS
los necesitan para sintetizar la mayora de sus componentes.. Hasta la fecha, los cientficos han
separar y estudiar los componentes de las protenas (Gordon, Martin y Synge 1943), y hubo un
gran avance que contribuy a la rpida identificacin de los veinte aminocidos en las protenas
utilizados por todos los organismos vivos. Despus de esta explosin inicial de descubrimientos,
dos aminocidos adicionales, que no son utilizados por todos los organismos, se han aadido a la
Aparte de su papel en las protenas que forman, los aminocidos tienen muchas funciones
biolgicas importantes. Tambin son metabolitos de energa, y muchos de ellos son nutrientes
comunicacin entre las clulas. Por ejemplo, Arvid Carlsson descubri en 1957 que la amina 3-
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En 1953, Miller y Urey intentaron recrear las condiciones de la Tierra primitiva. En un matraz
1953). Ellos encontraron las molculas que se formaron nuevas, e identificaron estas molculas
como once aminocidos estndar. A partir de esta observacin, se postula que los primeros
Supongo que el xido orgnico que constituye la base de la fibrina y de la albmina (y al que
hay que dar un nombre; por ejemplo, protena) est compuesto de un radical terciario combinado
con oxgeno...Parece ser la molcula primitiva o principal de la nutricin animal, que las plantas
preparan para los herbvoros y que luego stos proporcionan a los carnvoros (1835).
distintas y, por tanto, poda ser considerado como un compuesto primario (1838). Del griego:
Como hiptesis de trabajo asumiremos que la teora del enlace peptdico es vlida. Es decir,
que una protena est constituida por una cadena de -aminocidos unidos mediante enlaces
peptdicos a travs de sus grupos -amino y -carboxilo. A pesar de que esta teora es vlida casi
con certeza (...). Se debe recordar que todava no ha dejado de ser una hiptesis que no ha sido
sustancias como la Gly o la Leu En casi todos los casos, el descubrimiento y caracterizacin de
Se descubre una sustancia con carcter de aminocido, muy abundante en alguna fuente
Se comprueba que es idntica a alguna de las sustancias liberadas tras la hidrlisis de las
protenas.
Se lleva a cabo la sntesis orgnica de la misma sustancia que haba sido obtenida a partir
de la fuente natural.
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Los aminocidos se clasifican por las caractersticas de su cadena lateral. La unin covalente
de los aminocidos para formar las protenas hacen que los grupos funcionales anima y carboxilo
formacin del enlace peptdico. Por este motivo, en los polipeptidos la naturaleza qumica de la
laterales de los diferentes aminocidos pueden ser de naturaleza hidrofbica (apolar) , polar sin
Los aminocidos estrictamente apolares e hidrofbicos son: Ala, Val, Leu, Hile, Pro, Phe,
Trp y Meth. Todos tienen cadenas laterales alifticas, menos Phe y el Trp que, por presentar
estructura cclica rgida de un grupo amina secundaria que le confiere un papel esencial en la
formacin de estructuras secundarias. El aminocido Gly, que tiene un solo hidrogeno como
cadenas laterales, se suele incluir en este grupo, aunque tiene unas caractersticas especiales. La
presencia de azufre permite diferenciar dos aminocidos: Met y Cys. La Met es totalmente apolar
que es dbilmente polar ya que las electronegatividades del S y del H son muy similares con
2,58 y 2,2 respectivamente. Esta leve polaridad le permite formar puentes de hidrogeno, aunque
no son tan estables como los formados por grupos ms polares, como por ejemplo el hidroxilo.
Esta caracterstica hace que la Cys pueda clasificarse dentro de los grupos de aminocido
apolares; adems, el grupo sulfhdrico es muy reactivo y su principal caracterstica es que puede
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reaccionar con otro grupo igual de otra Cys y formar puentes desulfuro, que es un enlace
covalente apolar.
Los aminocidos apolares sin carga son: Ser, Thr, Tyr, Asn, Gln. Los tres primeros tienen en
comn la presencia de un grupo hidroxilo, aunque hay que descartar el carcter aromtico de la
Tyr. La Ser es con frecuencia unos de los aminocidos fundamentales de la catlisis enzimtica,
debido a su actuacin como reactivo nucleofilo. Gln y Asn se caracteriza por la presencia de un
Los aminocidos ionizables a pH fisiolgicos son: Glu, Asp, Lys, Arg, His. Los dos primeros
COO-) y los tres ltimos poseen grupos funcionales con carcter bsico con lo que pueden
captar protones del medio adquiriendo carga positiva. Tanto la Lys como la Arg se encuentran
ionizadas a pH fisiolgico; y la His, con un grupo imidazol con un pH, de 6, solo estar cargada
llamados los aminocidos estndar (o comunes) merecen una atencin especial. Los 20 son los
aminocidos codificados en la sntesis de las protenas dirigidas por el ADN y todos, excepto la
prolina se caracteriza por la forma general que se muestra donde R es una cadena literal. La
prolina tiene una cadena lateral cclica que incluye la funcin a amino
Se usan ampliamente dos formatos diferentes para abreviar el nombre de los aminocidos
naturales (o estndar) uno de estos formatos usa tres letras el otro, una. Nuestro cuerpo produce
12 de los aminocidos sales; los otro 8 se les llama aminocidos esenciales, que tenemos que
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Bioqumica concepto esenciales
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obtener en nuestra dieta, mientras que los 20 aminocidos comparten la propiedad comn de ser
1. Tamao y forma
enlaces inicos, enlaces covalentes, puentes de hidrogeno y fuerza de van der Waals.
aminocido ms pequeo. Agrega longitud y flexibilidad a una cadena polipptido sin sacrificar
Despus de la glicina los siguientes cuatro aminocidos: alanina, valina, Lucina e isoleucina,
tiene todos grupos alquilo simple como cadenas laterales: metilo, isopropilo, isobutilo y sec-
butilo, respectivamente. Estas cadenas laterales son hidrofbicas y, aunque son electrnicamente
fuerzas de dispersin.
La prolina, que tiene una cadena lateral cclica que comparte su carbono y su nitrgeno
amino, es relativamente compacta, con flexibilidad conformacional limitada. Las aminas de las
prolina, como las de una cadena de pptido, carecen de enlaces N_ H , de manera que no
polizable y menos comn en las protenas que la mayora de los otros aminocidos estndar.
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Aminocidos con cadenas laterales polares, pero no ionizada.Entre los aminocidos con
cadenas laterales polares, la serina es el menor. No es mucho ms grande que la que la alanina :
con una cadena lateral _CH2OH , participa bien en los puentes de hidrogeno y con frecuencia se
presenta en regiones de un pptido que estn compuestas de agua . la treonima tiene un grupo
metilo en lugar de uno de los hidrgenos del grupo _ CH2OH de la serina , que obstaculiza
La asperagina y la glutamina son amidas. Las cadenas laterales de ambas terminan en CNH3
difieren solo por un grupo CH2 .Las funciones amida son bastante polares , e interacciones
decisteina de una protena debe ser relativamente pequea, pero su efecto sobre su forma
CH2SH en un puente de disofluro CH2S-SCH2- entre ellas. Esto une entre s a dos aminocidos
que con frecuencia estn alejados, y ayuda a guiar el dobles de las protenas para tener una forma
especfica.
La esparagina y glutamina son aminas. Las cadenas laterales de ambas terminan en CNH2-
y difieren solo por un grupo CH2. Las funciones amidas son bastante polares, e interacciones
fuertemente con molculas de agua mediante puentes de hidrogeno. Al igual que la cerina la
asparagina y la glitamina se encuentran con frecuencia en las regiones de un pptico que estn en
Aminocidos con laterales acidas. Los mapas de potencia electrosttica del cido aspatico y
del cido glutamidico son dos de los ms prominentes. Las cadenas laterales COO2H de esos
dos cido estn desprotonadas casi por completo hasta CO2 en el pH biolgico, haciendo casi
que esas especies sean las unidades ms ricas en electrones de todos los aminocidos comunes.
Su funcin ms importante es formar enlaces inicos con especies con carga positiva como
Aminocidos con cadenas laterales especficas. Los aminocidos bsicos lisina, arginina e
istidina son lo opuesto de los aminocidos. Forman enlaces inicos con iones negativos como
Adems de los 20 aminocidos corrientes y de varios otros pocos frecuentes de las protenas
se conocen unos 150 aminocidos mas que se encuentra en diferentes clulas y tejidos en forma
libre o combinada pero nunca en las protenas la mayor parte de ellos son derivados de los
proteicos actan como agentes qumicos para la trasmisin de los impulsos nerviosos tal como
celulares De muchas bacterias . La d- alamina halladas en las larvas o pupas de algunos insectos
Los hongos y las plantas superiores contienen una variedad extraordinaria de aminocidos no
proteicos algunos de los cuales poseen estructuras muy curiosas las funciones metablicas de la
por ejemplo algunos como la canavanina el cido de dyencolico y B-cianolanina son toxicas para
Las reacciones que experimentan los aminocidos son las de sus grupos funcionales ms las
asociadas con la cadena lateral. Muchas reacciones, como la acilacion del grupo amino, son
familiares.
A menudo ocurre que la acilacin se lleva acabo para el propsito de proteger el grupo
amino mediante la supresin temporal de su reactividad. Tres grupos protectores que usan
BOC se remueve por particin con cidos, el FMOC por base y el Z ya sea por participacin
Lina, como las de una cadena de pptido, carecen de enlaces N_ H , de manera que no
triptfano es ms grande, mas polizable y menos comn en las protenas que la mayora de los
construccin para las protenas, los aminocidos intervienen en muchos otros procesos
bioqumicos. Almacenan energa, si bien formados menos eficientes que los carbohidratos y los
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neurotransmisores.
(PLP) , forma activa de las vitaminas B , como coenzimas . Antes de actuar sobre un
aminocido, el PLP usa su funcin aldehdo para formar una amina con el grupo amino de una
La reacciones del LPL, unido a la enzima, une al aminocido y al LPL con un nuevo enlace
de imina.
El anillo de piridina del LPL, en especial cuando se protona , facilita varios tipos de
PRECURSORES METABOLICOS
(fenilalanina, tirosina, leucina, etc) pueden dar cuerpos cetnicos en el hgado, en donde el
Estos son los aminocidos cetogenicos. Su capacidad para producir cuerpos cetnicos es
grandes cantidades de cuerpos cetnicos, tanto a partir de cidos grasos como de los aminocidos
cetogenicos.
Los aminocidos que son degradados a piruvato, a-cetoglutarato, succinil-CoA, fumarato y/u
interesantes. Las reacciones de transaminacionque requieren piridoxal fosfato. Otro tipo comn
en que intervienen normalmente uno de los tres cofactores siguientes: biotina, tetrahidrofolato s-
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reducido del carbono. Estos dos ltimos cofactores son especialmente importantes en el
Las mezclas recemicas de aminocidos se producen a partir de cada uno de los tres mtodos
descritos.
Esta tcnica emplea un catalizador quiral y puede utilizarse para preparar aminocidos con
exceso enantiomero muy alto. Muchos de los catalizadores quirales que se han desarrollado
contienen un tomo de rutenio (RU) que forma un complejo con un ligando quiral , como el
BINAP.
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CONCLUSIONES PERSONALIZADAS
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BIBLIOGRAFIA
https://cajalesygalileos.wordpress.com/2012/10/01/la-evolucion-de-los-aminoacidos-aprender-
ciencias-en-scitable/
http://www.bbm1.ucm.es/public_html/divul/HistoriadeProteinas.pdf