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Enferm Infecc Microbiol Clin.

2016;34(Supl 2):53-8

ISSN: 0213-005X

Enfermedades

Enfermedades Infecciosas
Infecciosas y
Microbiologa
Clnica
Volumen 34, Extraordinario 2, Junio 2016
Publicacin mensual

PUBLICACIN OFICIAL

y Microbiologa Clnica
DE LA SOCIEDAD ESPAOLA
DE ENFERMEDADES INFECCIOSAS
Y MICROBIOLOGA CLNICA

Espectrometra de masas en microbiologa


clnica: de la ficcin a la realidad
Editores invitados: Rafael Cantn y Julio Garca-Rodrguez

www.elsevier.es/eimc
Incluida en: Index Medicus/MEDLINE
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www.elsevier.es/eimc

Perspectivas de futuro de la espectrometra de masas en microbiologa


Jordi Vilaa,*, Yuliya Zboromyrskaa, Almudena Burillob y Emilio Bouzab
a
Servicio de Microbiologa, Hospital Clnic, Instituto de Salud Global de Barcelona (ISGlobal), Centre de Recerca en Salut Internacional de Barcelona (CRESIB), Facultad de Medicina,
Universidad de Barcelona, Barcelona, Espaa
b
Servicio de Microbiologa Clnica y Enfermedades Infecciosas, Hospital General Universitario Gregorio Maran, Facultad de Medicina, Universidad Complutense de Madrid, Instituto de
Investigacin Sanitaria Gregorio Maran (IiSGM), CIBER de Enfermedades Respiratorias (CIBERES CB06/06/0058), Madrid, Espaa

RESUMEN

Palabras clave:
Espectrometra de masas La espectrometra de masas (EM) MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight) se ha
MALDI-TOF introducido con fuerza en muchos laboratorios de microbiologa clnica para la identificacin rpida y
Muestras clnicas precisa de bacterias y hongos. De hecho, podemos considerar la implementacin de esta metodologa como
Toxinas una revolucin en dichos laboratorios. Adems de la identificacin microbiana, la EM MALDI-TOF se est
Antgenos utilizando para la deteccin de algunos mecanismos de resistencia a los antibiticos y para la tipificacin
Virologa
molecular de bacterias. Sin embargo, existe una serie de aplicaciones actuales y futuras que aumentan la
Parasitologa
versatilidad de esta metodologa. Entre estas cabe destacar la aplicacin directa a partir de muestras
clnicas; la deteccin de toxinas o de antgenos microbianos especficos, y las aplicaciones en el campo de
la virologa y de la parasitologa.
2016 Elsevier Espaa, S.L.U. Todos los derechos reservados.

Future applications of mass spectrometry in microbiology


ABSTRACT

Keywords:
Mass spectrometry MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight) mass spectrometry (MS) has been
MALDI-TOF vigorously introduced in many clinical microbiology laboratories for the rapid and accurate identification
Clinical samples of bacteria and fungi. In fact, the implementation of this methodology can be considered a revolution in
Toxins these laboratories. In addition to microbial identification, MALDI-TOF MS is being used for the detection of
Antigens some mechanisms of antibiotic resistance and for the molecular typing of bacteria. A number of current
Virology and future applications that increase the versatility of this methodology may also be mentioned. Among
Parasitology
these are its direct application on clinical samples, the detection of toxins or specific microbial antigens,
and its application in the fields of virology and parasitology.
2016 Elsevier Espaa, S.L.U. All rights reserved.

Introduccin la tipificacin molecular para investigar la clonalidad de los aisla-


mientos de una misma especie. Sin embargo, la EM MALDI-TOF per-
En los ltimos aos la espectrometra de masas (EM) MALDI-TOF mite otras aplicaciones que se contemplan en esta revisin.
(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight) ha sido im-
plementada en muchos laboratorios de microbiologa clnica como Aplicacin directa a partir de producto patolgico
una tcnica rpida y fiable para la identificacin de bacterias y hon-
gos. Adems, otras aplicaciones son una realidad en el da a da de La identificacin de microorganismos aislados mediante EM
muchos laboratorios, como la deteccin de mecanismos de resisten- MALDI-TOF es ya una realidad ampliamente utilizada no solo para la
cia a los antibiticos, fundamentalmente la deteccin de betalacta- identificacin de microorganismos a partir de una colonia aislada,
masas, tanto de espectro extendido como carbapenemasas, as como sino que adems permite la identificacin de diferentes complejos
clonales de la misma especie1. Otra de las aplicaciones de la EM MALDI-
TOF es la identificacin de microorganismos a partir de la muestra
*Autor para correspondencia. directa, sin esperar a su crecimiento en medios de cultivo. Sin embar-
Correo electrnico: JVILA@clinic.ub.es (J. Vila). go, en la identificacin de microorganismos mediante EM MALDI-

0213-005X/ 2016 Elsevier Espaa, S.L.U. Todos los derechos reservados.


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TOF a partir de muestras directas hay que tener en cuenta una serie para la identificacin mediante EM MALDI-TOF como para el antibio-
de limitaciones. Primero, se necesita una cantidad suficiente de mi- grama mediante el mtodo de disco-placa. De este modo, se poda
croorganismos para el anlisis, lo que hace difcil el uso de esta tc- disponer de la identificacin microbiana el mismo da de la recep-
nica en las muestras con baja densidad microbiana. Segundo, se re- cin de la muestra y, adems, adelantar el resultado del antibiograma
quiere un volumen suficiente de muestra que es inversamente 24 h.
proporcional a la densidad bacteriana. La tercera limitacin es la
presencia de sustancias que pueden interferir en el anlisis de espec- Muestra de lquido cefalorraqudeo
tros (p. ej., restos celulares, distintas protenas en los lquidos biol-
gicos, restos de meconio en lquido amnitico, etc.) y que no se eli- Son varias las publicaciones donde se describe la identificacin
minan completamente durante el proceso de preparacin de la directa de microorganismos en lquido cefalorraqudeo (LCR). Se ha
muestra. Por otra parte, las muestras demasiado espesas o purulen- identificado Streptococcus pneumoniae en el LCR de un paciente con
tas en las cuales es casi imposible separar las clulas humanas de meningitis bacteriana9 o tambin Klebsiella pneumoniae de una pa-
los microorganismos, sobre todo los leucocitos son tambin pro- ciente que desarroll una meningitis bacteriana 2 semanas despus
blemticas. Adems, la presencia de microorganismos intracelulares de ser operada de un tumor cerebral10. En 2011, en el congreso anual
puede requerir la inclusin de un paso adicional de lisis celular para de la ESCMID (Sociedad Europea de Microbiologa Clnica y Enferme-
liberarlos. dades Infecciosas) se present un trabajo en el que los autores obtu-
Por ltimo, las muestras polimicrobianas no son aptas para la vieron por EM MALDI-TOF los espectros de 183 muestras consecuti-
identificacin directa, ya que no se dispone de herramientas que per- vas de LCR, de los cuales 14 fueron positivos por cultivo11. Se
mitan discriminar ms de un microorganismo en un mismo espectro. analizaron las muestras tras su centrifugacin, as como sin centrifu-
A pesar de las limitaciones comentadas, en los ltimos aos se gar. Las 14 muestras positivas se procesaron sin y con la extraccin
han publicado numerosos trabajos centrados en la identificacin mi- previa de protenas. En ningn caso se obtuvo una identificacin
crobiana mediante EM MALDI-TOF a partir de muestra directa. vlida. Adems, los autores realizaron un estudio de sensibilidad de
la tcnica de EM preparando los inculos de distintos microorganis-
Muestra de orina mos a diferentes concentraciones en muestras de LCR negativas por
cultivo convencional y concluyeron que se necesita una densidad
Hasta el momento, la muestra clnica en la que se ha demostrado importante de microorganismos para usar esta tcnica y que su sen-
una mejor eficacia en la identificacin directa mediante EM MALDI- sibilidad es comparable con la de la microscopa ptica. Segn nues-
TOF es la orina. Esta muestra presenta varias ventajas y permite sol- tra experiencia, la principal limitacin de este tipo de muestra es el
ventar muchas de las limitaciones antes mencionadas: las muestras escaso volumen de LCR que suele llegar al laboratorio. No obstante,
positivas suelen tener una alta densidad microbiana (> 105 unidades las muestras obtenidas a travs de drenajes ventriculares externos
formadoras de colonias [UCF]/ml); habitualmente se dispone de un permiten la identificacin directa con EM MALDI-TOF-MS con alta
volumen suficiente de la muestra ( 10 ml), no suele ser espesa y, probabilidad de xito en caso de infeccin (tabla 1) (datos no publi-
finalmente, ms del 80% de las infecciones urinarias son monomicro- cados). Esto se explica por 2 razones principales: se dispone de un
bianas. mayor volumen de muestra y la densidad bacteriana suele ser alta,
Se han publicado varios trabajos en los que se ha llevado a cabo la debido principalmente a la colonizacin de la superficie interna del
identificacin de microorganismos mediante EM MALDI-TOF a partir tubo de drenaje.
de orina, aunque todos ellos requieren de algn paso de preparacin
de la muestra2-4. La aproximacin mediante EM MALDI-TOF ha de- Otro tipo de muestras
mostrado una concordancia de aproximadamente el 90% con la iden-
tificacin convencional. Hay que destacar que la aplicacin directa de En cuanto a otros tipos de muestras, segn nuestra experiencia, la
EM MALDI-TOF a la muestra de orina requiere usar alguna tcnica de posibilidad de aplicar la tcnica EM MALDI-TOF depender en cada
cribado para descartar las muestras negativas, que representan ms caso de las caractersticas de la muestra, del volumen disponible y de
de dos tercios de las muestras procesadas en los laboratorios de mi- la densidad bacteriana. En la tabla 1 se recoge una serie de casos
crobiologa. En algunos estudios anteriores el mtodo de cribado em- donde la identificacin directa se llev a cabo con xito, lo que per-
pleado fue la citometra de flujo. En el estudio de Burillo et al5 se miti adelantar el resultado al menos 18-24 h (datos no publicados).
emple la tincin de Gram como mtodo para identificar las mues- La concordancia con la identificacin convencional realizada a partir
tras de orina positivas aptas para ser procesadas directamente. En del cultivo fue del 100%. Como se puede ver en la tabla 1, la muestra
cuanto a los procedimientos de la preparacin de la muestra para el ms rentable era el lquido amnitico, ya que presenta las mismas
anlisis mediante EM MALDI-TOF, la mayora de los autores emplea- ventajas que la muestra de orina (alta densidad bacteriana, suficien-
ron centrifugaciones tanto para separar las clulas humanas como te volumen de la muestra y ser una muestra poco densa). Adems,
para sedimentar los microorganismos. No obstante, se han descrito una vez identificado el microorganismo causante de la infeccin, se
otras tcnicas (p. ej., diafiltracin) para recuperar los microorganis- puede realizar el antibiograma con el mismo sedimento bacteriano
mos de la muestra directa de orina6 o tambin un pretratamiento de recuperado para el anlisis con EM MALDI-TOF, siempre y cuando
la muestra basado en la lisis de los leucocitos con una disolucin al haya suficientes bacterias para obtener un inculo en solucin salina
10% de dodecilsulfato sdico para liberar las bacterias intracelulares7. con una turbidez equivalente a un 0,5 de la escala de McFarland.
La orina es una muestra que, gracias a las caractersticas mencio- Hay que destacar que un nmero importante de las muestras no
nadas anteriormente, no solo permite obtener una identificacin di- son aptas para la identificacin directa, ya que presentan una o varias
recta mediante EM MALDI-TOF sin esperar al cultivo, sino tambin de las limitaciones discutidas con anterioridad. Por eso es necesario
realizar un antibiograma con el mismo sedimento bacteriano. En un el desarrollo de tcnicas de fraccionamiento y/o captura que permi-
estudio se ha desarrollado un protocolo de procesamiento directo de tan la recuperacin de los microorganismos de muestras purulentas
las muestras de orina para adelantar el resultado microbiolgico8. o viscosas y, de esta manera, anticipar el diagnstico microbiolgico.
Para ello, primero se analizaron todas las muestras mediante citome-
tra de flujo para detectar las muestras de orina con altos recuentos Deteccin de toxinas o antgenos microbianos especficos
bacterianos. Despus, las muestras presuntamente positivas se cen-
trifugaban para separar las clulas inflamatorias y sedimentar las Aparte de las protenas ribosomales, mayoritariamente represen-
bacterias y, a continuacin, el sedimento obtenido se usaba tanto tadas en el espectro generado mediante EM MALDI-TOF y utilizadas
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Tabla 1 Tras la reaccin especfica antgeno-anticuerpo se procedera a la de-


Muestras directas procesadas por espectrometra de masas MALDI-TOF con la identi- teccin de la protena antignica mediante EM MALDI-TOF despus
ficacin fiable ( 1.700) y su correlacin con el cultivo convencional
de la disociacin del complejo antgeno-anticuerpo. Esta tcnica
Muestra Tincin de Cultivo Crecimiento Identificacin aplicada al campo de la microbiologa permite inmunocapturar y
Gram en el cultivo directa por EM
concentrar las protenas de inters diagnstico (como pueden ser la
MALDI-TOF
toxina de Clostridium difficile15, las toxinas termoestable y termolbil
LAM BGN Capnocytophaga +++ C. sputigena
de Escherichia coli enterotoxignico16, etc.) para su posterior detec-
sputigena
cin mediante EM MALDI-TOF. Soo et al17 describieron una estrategia
LAM BGP Listeria monocytogenes +++ L. monocytogenes
similar mediante la utilizacin de nanodiamantes generados me-
LAM BGP L. monocytogenes +++ L. monocytogenes diante detonacin (ultradispersed diamonds) para capturar el antge-
LAM BGN Proteus mirabilis +++ P. mirabilis no secretado al medio de cultivo por Mycobacterium tuberculosis
complex durante su crecimiento, seguido de su deteccin e identifi-
LAM CPC Streptococcus agalactiae ++ S. agalactiae
cacin mediante EM MALDI-TOF.
LAM CPC S. agalactiae, Prevotella +++ S. agalactiae
bivia
Aplicaciones en virologa
LAM CPR Staphylococcus aureus +++ S. aureus

LAR CPC Streptococcus pneumoniae +++ S. pneumoniae El uso de la EM en virologa ha avanzado menos de lo que lo ha
LCR BGN Pseudomonas aeruginosa +++ P. aeruginosa hecho para la identificacin de bacterias y de hongos y, en la actuali-
dad, no ha dado todava el salto desde los laboratorios de investiga-
LCR BGN P. aeruginosa +++ P. aeruginosa
cin a los de diagnstico clnico. Se empez a emplear a mediados de
LCR BGN P. aeruginosa +++ P. aeruginosa
los aos noventa, acoplada a otras tcnicas diagnsticas (p. ej., con
BGN: bacilos gramnegativos; BGP: bacilos grampositivos; CPC: cocos positivos en ca- amplificacin previa de cidos nucleicos mediante PCR [polymerase
denas; CPR: cocos positivos en racimos; EM: espectrometra de masas; LAM: lquido
chain reaction]). Las razones para este retraso pueden deberse al rela-
amnitico; LAR: lquido articular; LCR: lquido cefalorraqudeo; MALDI-TOF: matrix-
assisted laser desorption ionization time-of-flight.
tivo bajo contenido en protenas de los virus18; al peso molecular ms
alto de las protenas virales (por encima de los 20.000 Da), o a la pre-
sencia de restos de las clulas empleadas como sustrato para el culti-
vo in vitro de los virus19,20. Adems, se ha estimado que el lmite infe-
para la identificacin microbiana, el anlisis de espectros permite rior para la deteccin de virus en muestras clnicas est en 104 copias
identificar otro tipo de protenas de relevancia clnica o epidemiol- del genoma/ml21. Hoy por hoy, parece que la sensibilidad de MALDI-
gica. Por ejemplo, en 2007, Camara y Hays12 publicaron un estudio TOF se queda corta (unas 100 veces por debajo de este lmite de de-
sobre la discriminacin entre las cepas de Escherichia coli sensibles y teccin) por lo que, en muchos de los estudios publicados, se hace
resistentes a ampicilina mediante EM MALDI-TOF, basndose en la necesario cultivar previamente los virus en lneas celulares y, poste-
deteccin de un pico especfico de 29 kDa presente exclusivamente riormente, identificarlos mediante esta tecnologa22. Pese a ello, sor-
en el espectro de las cepas resistentes y que corresponda a su beta- prende que su uso experimental sea muy prometedor tanto en algu-
lactamasa. Gagnaire et al13 detectaron toxina delta mediante EM nas muestras clnicas directas como para identificar virus cultivados
MALDI-TOF en el espectro de Staphylococcus aureus. La toxina delta en lneas celulares. Por ejemplo, para la identificacin de Herpesvi-
es un indicador del funcionamiento de uno de los sistemas de quo- rus23, virus del papiloma humano24 o hepatitis B25,26, entre otros. Para
rum sensing de S. aureus, el sistema del gen regulador accesorio (agr, la identificacin de virus tambin se ha empleado la combinacin de
accessory gene regulator) que, a su vez, es responsable de regular la la amplificacin de cidos nucleicos por PCR con su posterior identi-
expresin de factores de virulencia, como distintas exotoxinas y pro- ficacin mediante EM, empleando equipamiento que se basa en la
tenas involucradas en la adherencia y formacin de biopelculas. En ionizacin de las molculas mediante electronebulizacin27. Al igual
este trabajo, los autores identificaron el pico de la toxina delta (3.005 que en otros estudios que emplean esta tecnologa, la sensibilidad
5 Da) usando la toxina purificada y comprobaron su deteccin en aument a medida que aumentaba el nmero de copias por mililitro.
las cepas isognicas de S. aureus positivas y negativas para la produc- Una ventaja importante es que se diagnosticaron infecciones mixtas
cin de esta toxina. Cabe resaltar que el mtodo propuesto por Gag- que la PCR de rutina no detect.
naire et al13 permite la identificacin de la produccin de toxina del- Entre otros campos de la virologa en los que se ha empleado EM
ta mediante el anlisis por EM MALDI-TOF de clulas bacterianas MALDI-TOF, est la epidemiologa. Se ha destinado a tipificar, subtipi-
intactas, es decir, el mismo mtodo empleado en la rutina para la ficar y detectar polimorfismos y mutaciones (como en el caso del virus
identificacin microbiana a partir de colonias. de la influenza y de los virus de la hepatitis B y C)28-30; a estudiar la
Aparte de la identificacin de protenas directamente involucra- transmisin de una determinada cepa viral o la relacin gentica entre
das en la patognesis o resistencia, como la toxina delta o las betalac- varias cepas31, y tambin a estudiar la resistencia a antivirales32-35.
tamasas, es posible detectar ciertas protenas que sirven como bio- En cuanto a las ventajas del uso de MALDI-TOF para el anlisis de
marcadores para la identificacin rpida de cepas de inters clnico virus que se recogen en los estudios publicados, cabe mencionar las
y/o epidemiolgico. As, en el trabajo de Lu et al14 publicado en 2012, siguientes: permite la caracterizacin de una variedad amplia de vi-
los autores reportaron la presencia de 2 modulinas solubles en fenol rus y el diagnstico de coinfecciones y la identificacin es fiable y
(PSM, phenol soluble modulin) _1 y _2 en los aislados de S. aureus rpida en comparacin con los mtodos de referencia, mucho ms
resistente a meticilina (SARM) con SCCmec (staphylococcal cassette laboriosos. Se trata de un mtodo exacto y reproducible que permite
chromosome mec) tipo IV y V, que se suelen asociar con infecciones la automatizacin del proceso y es coste-eficaz en comparacin con
comunitarias por SARM. Este hallazgo permite discriminar rpida- otros mtodos ms complejos, como los ensayos de neutralizacin.
mente entre cepas de SARM comunitarias (SCCmec, tipos IV y V) e Adems, la EM MALDI-TOF mejora el manejo clnico de los pacientes
intrahospitalarias (SCCmec, tipos I-III). Adems, se observ la asocia- al ofrecer un diagnstico etiolgico rpido. Las desventajas ms im-
cin de otros 2 picos (m/z 1.835 y 1.863) en el espectro de S. aureus portantes estn en la sensibilidad de la tcnica, lo que por el momen-
con resistencia intermedia a la vancomicina. to se obvia con tcnicas previas de amplificacin del material gen-
Una alternativa para la deteccin de antgenos bacterianos direc- tico, y en que la identificacin viral est limitada por la base de datos
tamente del producto patolgico sera utilizar anticuerpos frente al del fabricante del aparato, que puede no incluir todos los espectros
antgeno en cuestin que estuvieran unidos a partculas magnticas. virales necesarios.
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Se remite al lector a una excelente revisin36 sobre el uso de esta


tecnologa para la identificacin de virus. Se puede especular que, Paso 1: descubrimiento de biomarcadores
dado el potencial que tiene esta tecnologa en el campo de la virolo-
ga, en un futuro prximo todas estas aplicaciones se implementarn
en los laboratorios hospitalarios de diagnstico clnico.
Pacientes *OEJWJEVPTTBOPT

Aplicaciones en parasitologa y deteccin


de biomarcadores 4VFSP 4VFSP

El uso de EM MALDI-TOF en parasitologa est menos desarrolla- Unin


do que en la identificacin de otros microorganismos. No obstante, Fraccionamiento Fraccionamiento
esta tecnologa se ha empleado con xito en varios campos. En cuan- -BWBEP
to al diagnstico etiolgico de enfermedades parasitarias, se puede
identificar Plasmodium spp. en hemates, mediante ionizacin direc- &.."-%*50' &.."-%*50'
ta con lser ultravioleta de la protoporfirina IX (grupo hemo) en el
interior del parsito37. Con este sistema, el lmite de deteccin es
#JPJOGPSNUJDB #JPJOGPSNUJDB
nicamente de 10 parsitos por microlitro de sangre. Tambin ha de-
mostrado su utilidad en la identificacin a nivel de especie en culti-
vos de promastigotes de Leishmania spp. aislados de pacientes en
quienes la identificacin fue correcta en 66 de 69 casos38. Asimismo, 1BUSOEFJOGFDDJO Patrn normal
se ha aplicado para tipificar Blastocystis spp. en cultivo lquido, que
fue correcto en todos los casos (n = 19)39. Paso 2: evaluacin para determinar:
En cuanto a la metodologa, si bien hoy en da existen otras estra- (utilizando otro conjunto de muestras de casos y controles)
tegias para la bsqueda de biomarcadores, la EM MALDI-TOF se ha
empleado tambin con dicha finalidad en el campo de la protemica r4FOTJCJMJEBE
clnica. Mientras que el suero/plasma es una muestra valiosa para la r&TQFDJGJDJEBE
investigacin de biomarcadores proteicos, especialmente en el rea r7BMPSQSFEJDUJWPQPTJUJWP
r7BMPSQSFEJDUJWPOFHBUJWP
de las enfermedades infecciosas, el rango dinmico del proteoma
presenta un desafo tcnico. El contenido proteico del suero/plasma
est constituido por protenas que se encuentran en elevadas canti-
Figura 1. Esquema de la identificacin de posibles biomarcadores en plasma/suero
dades, tales como albmina, inmunoglobulinas o transferrina, las
humano. EM: espectrometra de masas; MALDI-TOF: matrix-assisted laser desorption
cuales constituyen casi el 90% del total de protenas del suero/plasma ionization time-of-flight.
y hacen que la deteccin e identificacin de las protenas poco abun-
dantes sea metodolgicamente difcil. Por ello son esenciales mto-
dos de fraccionamiento y separacin eficaces para detectar, median-
te EM, protenas presentes en pequeas cantidades que puedan ser Papel futuro de la espectrometra de masas MALDI-TOF en la
potenciales biomarcadores. Existen diversos mtodos para deshacer- cadena de diagnstico rpido de un servicio de microbiologa y
se de las protenas mayoritarias. Una vez limpiada la muestra de es- en la poltica de los antimicrobianos de un hospital
tas protenas mayoritarias, el resto de protenas se analiza mediante
EM MALDI-TOF. La identificacin de biomarcadores se lleva a cabo La EM MALDI-TOF ha demostrado que identifica correctamente la
comparando el anlisis protemico de muestras de suero de pacien- mayora de los patgenos causantes de bacteriemias y fungemia mo-
tes que presentan la infeccin objeto de estudio y sueros de indivi- nomicrobianas, directamente de un hemocultivo positivo48. Son va-
duos control que no tienen la infeccin. Posteriormente, el anlisis rios los estudios publicados sobre este uso49-51 y, en algunos, se asocia
de los espectros proteicos de los 2 grupos permite definir el patrn con recomendaciones de experto para la optimizacin del uso de
de biomarcadores que hace posible la discriminacin entre pacientes antimicrobianos52. Se ha demostrado que permite optimizar el trata-
infectados y sanos. En una segunda fase, una vez definido el patrn miento antibitico hasta en un 35% de los pacientes con bacteriemia
de biomarcadores, se procede a determinar la sensibilidad, la especi- por bacilos gramnegativos49; acorta el tiempo hasta la instauracin
ficad y los valores predictivos mediante la utilizacin de una segunda del tratamiento antibitico eficaz en casi 2 das, y disminuye el con-
coleccin de muestras de suero tambin procedentes de pacientes sumo de antimicrobianos, la estancia en la unidad de cuidados inten-
con la infeccin, de pacientes con otro tipo de infecciones y de indi- sivos en casi 7 das, la estancia hospitalaria en ms de 2 das, la
viduos sanos (fig. 1). mortalidad hospitalaria en aproximadamente un 10% y el coste en un
Dicha metodologa se ha empleado para identificar biomarcado- 40%50,53-55. Adems, permite suspender el tratamiento antibitico
res sricos que permitan diagnosticar la infeccin por Trypanosoma cuando el microorganismo aislado de los hemocultivos es un conta-
cruzi40, Plasmodium falciparum41 u Opisthorchis viverrini42. minante y, por lo tanto, se solicitan menos determinaciones de con-
Otro uso ha sido el de buscar nuevos antgenos para el desarrollo centraciones de vancomicina54,56.
de vacunas o de nuevos tests diagnsticos rpidos, como en el caso No en todos los estudios se obtienen estos excelentes resultados.
de Schistosoma japonicum43, Leishmania spp.44 o Brugia malayi45. La Se acaba de publicar un pequeo estudio de 2 meses de duracin en
EM MALDI-TOF se ha empleado tambin para comprender el meca- el hospital de la Universidad de Wisconsin en pacientes de riesgo
nismo de accin de algunos frmacos antiparasitarios46, as como (unidad de cuidados intensivos, hematolgicos y trasplantados) con
para el desarrollo de nuevos frmacos antiparasitarios47. bacteriemia57. Este hospital tiene una prevalencia baja de resistencias
Aun as, es necesario optimizar tcnicamente los protocolos de antibiticas y tiene implantado un programa muy slido de reco-
trabajo y ampliar el nmero de espectros incluidos en las bases mendaciones de experto para la optimizacin del uso de antimicro-
de datos para permitir la identificacin de un nmero mayor de bianos. Los autores no encontraron diferencias en la evolucin entre
organismos. Se espera que estas aplicaciones se puedan trasladar los pacientes a los que se les aplic esta tecnologa diagnstica y los
a los laboratorios de diagnstico clnico en un futuro no muy le- que no, si bien el coste de identificacin del laboratorio de microbio-
jano. loga fue inferior con el uso de EM MALDI-TOF.
J. Vila et al. / Enferm Infecc Microbiol Clin. 2016;34(Supl 2):53-8 57

Los estudios que evalan el impacto del uso de esta tecnologa pathogens from urine samples by matrix-assisted laser desorption ionization-
time of flight mass spectrometry. J Clin Microbiol. 2010;48:2110-5.
tienen un nivel de evidencia bajo, dado que parece obvio que la EM
3. Wang XH, Zhang G, Fan YY, Yang X, Sui WJ, Lu XX. Direct identification of bacteria
MALDI-TOF permite adelantar considerablemente el diagnstico causing urinary tract infections by combining matrix-assisted laser desorption
etiolgico de muestras positivas (p. ej., hemocultivos, urocultivos, ionization-time of flight mass spectrometry with UF-1000i urine flow cytometry.
J Microbiol Methods. 2013;92:231-5.
etc.), y que ello resulta beneficioso para los pacientes. La mayora de
4. March Rossello GA, Gutirrez Rodrguez MP, Ortiz de Lejarazu Leonardo R, Ordua
los estudios publicados son observacionales, con un diseo pre-post. Domingo A, Bratos Prez MA. New procedure for rapid identification of
Sera deseable tener estudios de mayor calidad, aunque ticamente microorganisms causing urinary tract infection from urine samples by mass
spectrometry (MALDI-TOF). Enferm Infecc Microbiol Clin. 2015;33:89-94.
es imposible justificar un ensayo clnico con un grupo control al que
5. Burillo A, Rodrguez-Snchez B, Ramiro A, Cercenado E, Rodrguez-Creixems M,
no se le aplique esta tecnologa diagnstica. Hasta ahora, solo hay Bouza E. Gram-stain plus MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption
una revisin sistemtica de la bibliografa publicada en este campo53. ionization-time of flight mass spectrometry) for a rapid diagnosis of urinary tract
De igual forma, la EM MALDI-TOF permite la identificacin directa de infection. PLoS One. 2014;9:e86915.
6. Demarco ML, Burnham CA. Diafiltration MALDI-TOF mass spectrometry method
los uropatgenos causantes de infeccin urinaria cuando el punto de for culture-independent detection and identification of pathogens directly from
corte de las bacterias por mililitro de orina llega a un dintel, que os- urine specimens. Am J Clin Pathol. 2014;141:204-12.
cila entre especies2. La mejor sensibilidad se obtiene con recuentos 7. Snchez-Juanes F, Siller Ruiz M, Moreno Obregn F, Criado Gonzlez M, Hernndez
Egido S, De Frutos Serna M, et al. Pretreatment of urine samples with SDS improves
de 105 UCF/ml. Su uso permitira orientar al clnico sobre la mejor direct identification of urinary tract pathogens with matrix-assisted laser desorption
decisin teraputica con un margen de error de solo un 4%5. En los ionization-time of flight mass spectrometry. J Clin Microbiol. 2014;52:335-8.
laboratorios de microbiologa actuales no se discute ni la convenien- 8. Zboromyrska Y, Rubio E, Alejo I, Vergara A, Mons A, Campo I, et al. Development
of a new protocol for rapid bacterial identification and susceptibility testing
cia ni la eficacia del uso de EM MALDI-TOF. Lo que es necesario resol- directly from urine samples. Clin Microbiol Infect. 2016. Disponible en: http://
ver es su uso inmediato y continuo directamente en muestras clni- dx.doi.org/10.1016/j.cmi.2016.01.025
cas y en aislados relevantes (en el momento en que se produce su 9. Nyvang Hartmeyer G, Kvistholm Jensen A, Bocher S, Damkjaer Bartels M, Pedersen
M, Engell Clausen M, et al. Mass spectrometry: pneumococcal meningitis verified
positividad) o su uso en un momento determinado del da (por nece- and Brucella species identified in less than half an hour. Scand J Infect Dis. 2010;
sidades de la organizacin del laboratorio). Es importante tener en 42:716-8.
cuenta que si la EM MALDI-TOF se usa para procesar los hemoculti- 10. Segawa S, Sawai S, Murata S, Nishimura M, Beppu M, Sogawa K, et al. Direct
application of MALDI-TOF mass spectrometry to cerebrospinal fluid for rapid
vos positivos en tandas (es decir, 2 o 3 veces diariamente), el retraso pathogen identification in a patient with bacterial meningitis. Clin Chim Acta.
en la emisin de la informacin puede llegar a las 5 h58. La automati- 2014;435:59-61.
zacin de los laboratorios de microbiologa y las nuevas posibilida- 11. Bjrnholt V, Nilsen SM, Noorland I, Wigemyr M, Lken CH, Mller CS, et al. MALDI-
TOF mass spectrometry ID of bacteria directly from cerebrospinal fluidwhat you
des diagnsticas exigen adaptaciones del laboratorio y hoy (a nuestro
see is what you get. 21th European Congress of Clinical Microbiology and
juicio) es posible crear rutinas en las que, por ejemplo, los crecimien- Infectious Diseases. 2011. p. O-345.
tos que se produzcan en hemocultivos a cualquier hora sean inme- 12. Camara JE, Hays FA. Discrimination between wild-type and ampicillin-resistant
Escherichia coli by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass
diatamente examinados con EM MALDI-TOF, identificados y comuni-
spectrometry. Anal Bioanal Chem. 2007;389:1633-8.
cados al clnico responsable en el acto. En el caso de muestras de 13. Gagnaire J, Dauwalder O, Boisset S, Khau D, Freydiere AM, Ader F, et al. Detection
orina con deteccin de microorganismos (mediante tincin de Gram of Staphylococcus aureus delta-toxin production by whole-cell MALDI-TOF mass
o por citometra de flujo) se puede procesar estas muestras inmedia- spectrometry. PLoS One. 2012;7:e40660.
14. Lu JJ, Tsai FJ, Ho CM, Liu YC, Chen CJ. Peptide biomarker discovery for identification
tamente de manera automtica con la identificacin del patgeno of methicillin-resistant and vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus
responsable mediante EM MALDI-TOF y comunicar al clnico la infor- strains by MALDI-TOF. Anal Chem. 2012;84:5685-92.
macin. Adems, la incubacin robtica y la lectura automatizada de 15. Kiyosuke M, Kibe Y, Oho M, Kusaba K, Shimono N, Hotta T, et al. Comparison of two
types of matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometer
las placas permitirn sealar qu colonias precisan pasar automti- for the identification and typing of Clostridium difficile. J Med Microbiol. 2015;64:
camente a identificacin por EM MALDI-TOF. 1144-50.
Todo ello nos llevar a cambiar muchas rutinas de trabajo micro- 16. Kuo FY, Chang BY, Wu CY, Mong KK, Chen YC. Magnetic nanoparticle-based
platform for characterization of Shiga-like toxin 1 from complex samples. Anal
biolgico; a decidir qu muestras deben ser examinadas inmediata- Chem. 2015;87:10513-20.
mente en tiempo real; a seleccionar estudios de antibiograma rpido, 17. Soo PC, Kung CJ, Horng YT, Chang KC, Lee JJ, Peng WP. Detonation nanodiamonds
y a elegir las pautas de comunicacin ms eficientes con los clnicos. for rapid detection of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis complex in
broth culture media. Anal Chem. 2012;84:7972-8.
La automatizacin se enfrenta a mltiples problemas de orden 18. Kliem M, Sauer S. The essence on mass spectrometry based microbial diagnostics.
prctico59, de los que nos gustara resaltar uno en particular. La auto- Curr Opin Microbiol. 2012;15:397-402.
matizacin puede aumentar la disponibilidad de resultados fuera del 19. Cobo F. Application of MALDI-TOF mass spectrometry in clinical virology: a review.
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Estos son retos a los que no solo la EM MALDI-TOF, sino tambin
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