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VIROLOGIE

Elments de base sur la structure et la multiplication


des virus des eucaryotes suprieurs
Virus de la mosaque du tabac Virus de la grippe Adenovirus

Virus Ebola

Herpesvirus Papillomavirus Rtrovirus de Moloney

Laboratoire de Microbiologie et Biologie Molculaire


LMBM belkadibouchra@yahoo.fr
Facult des Sciences Rabat - Agdal
Intrt Intrt
mdical Virologie fondamental
60% des modle de biologie
maladies molculaire
infectieuses

Intrt en gnie gntique


vectorologie, thrapie gnique, vaccination
Virologie et intrt mdical en quelques chiffres
Maladies infectieuses : 17 millions de dcs par an
soit 1/3 de la mortalit humaine
6 maladies reprsentent 90% des dcs / infection dans le monde :
Maladies respiratoires bactriennes (pneumocoque) et 3 millions de dcs / an
virales (grippe, virus respiratoire syncitial)
Syndrome dimmunodficience humaine acquise 3 millions de dcs / an
(SIDA d au HIV)
Diarrhes bactriennes (shigellose, colilose, cholra, 2,5 millions de dcs / an
fivre typhode) ou virales (rotavirus)
Tuberculose (Mycobacterium tubertulosis) ~ 2 millions de dcs / an
Paludisme (Plasmodium falciparum) ~ 1 million de dcs / an (300 500 millions
de cas annuels)
Rougeole ~ 900 000 de dcs / an (alors quil existe
un vaccin efficace!)

Au moins 16% des cancers sont dorigine infectieuse :


bactrienne (Helicobacter pylori) ou
virale (virus des hpatites, virus dEpstein Barr, papillomavirus)
I GENERALITES

Mise en vidence
Microbiologie Microorganismes bactriens
fin du XIXme sicle responsables de maladies

Tuberculose, Diphtrie, Cholra des poules, Charbon (anthrax)...

La rage, la fivre aphteuse, la grippe,... : Aucune bactrie na pu


tre mise en cause
l'agent responsable est plus petit qu'une bactrie
>>>> Invisible au microscope optique

Pasteur a labor des vaccins contre


ces agents infectieux (variole et rage)
I.1 Historique
Dcouverte des virus: Filtre de Charles Chamberland
??? Existence dagents infectieux particuliers

lagent infectieux responsable de la rage est:


* invisible au microscope
* impossible de lisoler sur des milieux de VIRUS
Pasteur 1881 culture artificiels

1892: IVANOVSKI dcouvre


Mosaque du tabac (VMT) transmise par la sve
dun plant malade passe sur filtre et inocule
une plante saine
Caractre ULTRAFILTRABLE
>>> Toxine
BEIJERINCK (1898): inoculation dun 3me plant

Caractre infectieux du filtrat

Apparition de tches >>> Agent infectieux nest pas une toxine

>>> se multiplie dans les cellules de son hte


(Contagium virum fluidum en srie)

Le caractre d'agent ULTRAFILTRABLE est dmontr pour


d'autres maladies: Fivre aphteuse(1898)
Fivre jaune (1901)
Rage (1903)
Vaccine (1906)
Poliomylite (1909)
A la diffrence des bactries, un virus :
- ne se voit pas,
- ne se cultive pas,
- nest pas retenu par le filtre Chamberland

Toute cellule vivante peut tre la cible de virus spcifiques

>>>> Distinction de 3 classes de virus:

* virus des vgtaux


* virus des animaux
* virus des bactries
1917, DHerelle: Ncessit dune bactrie au dveloppement
du virus

1935, Stanley : purification du VMT, prcipite slectivement au


sulfate dammonium une protine cristallisable prsentant toutes
les proprits infectieuses du virus

1936, Browden montre que le VMT est une nucloprotine

1940, linvention du Microscope lectronique

1947, Shramm: Dissociation du VMT en une protine et un ARN

1949, La culture des cellules des tissus in vitro


1954, Fraenkel-Conrat russit reconstituer des virus infectieux
en mlangeant protines et ARN purifie
>>>> 1956, pouvoir infectieux de lARN isol

1977, Eradication officielle de la variole selon lOMS grce


la vaccination base sur la dcouverte de Jenner (1796)

Les annes 80, dcouverte du virus dimmunodficience


humaine (VIH) par Gallo et Montagnier

2003, dcouverte du virus gant Mimivirus dans une culture


damibes et leur squenage en 2004

2008, Dcouverte de Mamavirus infect par un petit virus


le sputnik (premier virus des virus, 1er virophage)
Rsum
XIX me sicle PASTEUR et Robert Koch

des maladies pouvaient atteindre


l'homme
les vgtaux (les algues et les champignons)
les animaux (tous les genres mme les arthropodes)
les bactries : bactriophages
les virus : viophages
taient dues des agents ultra-filtrables
==> 100 fois plus petit que les bactries
I.2 Diversit
a) Taille relative des virus et des bactries

Taille varie de: 300 nm poxvirus (virus de la vaccine)


20 nm parvovirus (fivre aphteuse)
Rsolution de l'oeil et des microscopes et tailles des tres
vivants microscopiques
b) Diversit au niveau pathologique
200 virus sont pathognes pour lhomme

Certaines affections frquentes et bnignes: diarrhe, coryza,


Hpatite A
D'autres plus rares et graves: Encphalites, Hpatite chronique,
Sida
Certaines redoutables quand elles atteignent des terrains
particuliers comme le ftus, le nouveau-n (Herps- rubole,
parvovirus, HIV ........), limmunodprim

Des virus sont responsables de cancers : tumeurs malignes


chez l'homme:
Papillomavirus et cancers utrins,
Hpatite B et C et cancer du foie...
OBJECTIFS
DEFINITION VARIATION
GENETIQUE
Critres de VIRUS
classification Consquences sur
- pidmiologie
- Traitement
CYCLE DE Modes de diffusion - Prvention
dans lorganisme
REPLICATION MOYENS DE
Types dinfection DEFENSE DE
Chimiothrapie
antivirale (localise ou gnralise) LORGANISME

Cls du dveloppement de mthodes effectives dans


la prvention et le traitement des maladies virales
I.3 Dfinition des virus
Parasites intracellulaires obligatoires ne pouvant se multiplier qu'
l'intrieur d'une cellule hte en dviant leur profit le mtabolisme
cellulaire

- Une information gntique sous forme d'ADN (Acide


Dsoxyribonuclique) ou ARN (Acide Ribonuclique):
Gnome
- Une structure de protection souvent protique, compacte, pour
protger son Acide Nuclique :
Capside et parfois Enveloppe
I.4 Caractristiques gnrales
En 1953, Lwoff >>> Concept de virion

Particule virale mature et infectieuse libre dans le milieu


extrieur, phase ultime de la biosynthse des virus

Un virion a 4 caractres essentiels :

1- Un seul type d'acide nuclique, ADN ou ARN

Le gnome contient lintgralit de l'information


gntique du virus: maximum 100 aine de gnes

Capacit de codage faible


2- Reproduction partir de son matriel gntique par
rplication ou duplication de son gnome

les bactries : se divisent par scissiparit


les cellules eucaryotes : se divisent par mitose

Pour les virus, chaque molcule d'acide nuclique sert


de matrice pour la synthse d'un brin complmentaire
grce une enzyme d'ADN polymrase
3- Parasitisme intracellulaire obligatoire ou strict
- Le virus ne se multiplie qu'au sein des cellules vivantes
- Il utilise le systme de biosynthse de la cellule qu'il parasite
pour se multiplier (les ribosomes, les activits enzymatiques ..)
- Il ne se multiplie pas sur des milieux inertes comme les bactries

>>> Ncessit dun systme biologique vivant dit


permissif, capable d'assurer sa rplication
Consquences : Mode de reproduction des virus
Difficults de mise au point de thrapeutiques
antivirales spcifique, non dangereuses et efficaces

Insensibilit aux antibiotiques, aux antibactriens


Cibles pharmacologiques diffrents vis--vis des drogues
4- Une structure particulaire

Structure non cellulaire

Symtrie caractristique

Symtrie hlicodale

Symtrie cubique

En rsum: 4 caractres de dfinition du virion

* un seul type d'acide nuclique (ADN ou ARN)


* une reproduction par rplication du gnome
* un parasitisme intracellulaire absolu
* une structure particulaire.
I.5 Structure
Une particule virale est compose de 2 lments obligatoires:

Gnome
>>>> Unit fonctionnelle, la nuclocapside
Capside
Pour certains virus seulement,
Enveloppe ou Peplos la nuclocapside est elle-mme
entoure d'une structure

Il existe donc des virus nus et des virus envelopps


I.5.1 Gnome viral
Contient l'intgralit de l'information gntique de la particule
De 3 200 gnes: capacit de codage faible
ADN ou ARN
Il existe des virus gnome
monocatnaire: linaire ou segment
bicatnaire: linaire, segment, circulaire complet ou
partiellement bicatnaire et rarement morcel (grippe)
Virus ADN Virus ARN
le plus souvent : le plus souvent :
ADN bicatnaire ARN monocatnaire :
soit ADN linaire soit ARN linaire
soit ADN circulaire soit ARN segment
rarement : rarement :
ADN partiellement ARN bicatnaire
bicatnaire et segment
circulaire
ADN monocatnaire
Exemple de gnome ADN
Virus Symtrie Lin./Circ. Taille en kb Maladie
Hepadna I lin./circ. 3.2 Hpatite /(B)
Papilloma I circ. 7 Carcinomes
Adeno I lin. 35 Maladies respiratoires
Herpes I lin. 200 Herps, varicelle

Papillomavirus Hepatitis B virus


ADENOVIRUS

Rotavirus Enteroviruses HERPESVIRUS PAPOVAVIRUS


Exemple de gnome ARN
Virus Symtrie Sens ARN Taille en kb Maladie
Hpatite D - 1.6 Hpatite
Rougeole,
Parymyxo H - 15
Oreillons
Rhabdo H - 11 Rage
Polio, hpatite,
Picorna I + 7
Rhume
Alpha I + 9 Rubole
Retro I + 10 SIDA, Lymphomes
Corona H + 30 Rhumes
Arena H - 11 Fivre hmorragique
Bunya H - 12 Encphalites
Orthomyxo H - 12 Grippe
Rota I +/- 15 Diarrhes

Pour les virus RNA monocatnaire on a deux situations :


le RNA est lui mme un RNA messager (polarit positive) direction 5>>3
le RNA doit tre transcrit pour donner un RNA messager (polarit ngative)
Virus ARN

ARENAVIRUS CORONAVIRUS
PARAMYXOVIRUS
(rougeole, oreillons, VRS)

RHABDOVIRUS
(rage)
ORTHOMYXOVIRUS
(grippe)

RETROVIRUS FILOVIRUS
Synthse de RNA messagers
Lexpression passe par (cas du virus polarit -)
Synthse des protines
(assemblage d' AA)

- protines structurales : enveloppe et capside


- protines non structurales qui interviennent
dans la multiplication du virus (enzymes)
Remarque: (virus de la grippe)

La disposition en plusieurs segments ARN favorise les


recombinaisons gntiques entre diffrents virus de la mme famille
et augmente ainsi la variabilit gntique et donc antignique
I.5.2 Capside
- De nature protique entourant le gnome viral
- Fruit dune polymrisation de sous-units protiques identiques
codes par le gnome
Assemblage constitue des Capsomres
Rles
Protection dans le milieu extracellulaire pour le virus non envelopp

Porte des dterminants viraux qui se lient spcifiquement aux


rcepteurs cellulaires quand le virus est nu

la capside sorganise selon 2 types de symtrie:

Nuclocapside symtrie hlicodale (en btonnet)

Nuclocapside symtrie icosadrique (forme cubique)


a) Les nuclocapsides symtrie hlicodale
D'aspect tubulaire, les sous-units s'assemblent en un ruban
autour de l'acide nuclique, et le ruban enroul autour d'un
axe central constitue un tube plus ou moins rigide.

Virus vgtaux: VMT


Nuclocapside rigide Disposition en hlice des
sous-units autour du gnome : aspect de tronc
de palmier

Virus animaux:
Le virus de la rage (rhabdoviridae)
Nuclocapside plus ou moins flexible, enroule
sur elle-mme et toujours incluse dans une
enveloppe.
b) Les nuclocapsides icosadriques

Il s'agit d'un polydre comprenant 12 sommets et 20 faces


gales qui sont des triangles quilatraux entourant une sphre.
Un icosadre possde 3 axes de symtrie.

La capside est forme par lassemblage


dunits morphologiques: Capsomres

252 capsomres pour un Adnovirus


70 capsomres pour un Poliovirus
Structure icosadrique

Remarque: Le gnome est plus indpendant de la capside


>>> prsence de capsides vides. Ex: l'hpatite B
c) les virus symtrie complexe

Une symtrie binaire ou mixte


Virus nu avec capside en 2 parties:
une tte symtrie cubique forme de 152
capsomres contenant un ADN

une queue symtrie hlicodale relie


la tte par le collier
Bactriophages T queue

Queue Constitue dune gaine contractile


dlimitant un canal creux central
Termine par une plaque basale
porteuse de spicules et de fibres caudales
I.5.3 Enveloppe ou Peplos .

* Membrane qui entoure certains virus (virus envelopps)

* Nature lipido-glucido-protique

* Lenveloppe contient des phospholipides et des protines


glycosyles: neuramidase et hmagglutinine qui
apparaissent sous forme de spicules

* Fonctions: - Site d'attachement des rcepteurs cellulaires

- Reconnaissance de rcepteurs

- Antignique, hmagglutinante, enzymatique


L'enveloppe virale est acquise par bourgeonnement du

virion travers une des membranes cellulaires de la cellule

hte pendant la rplication du virus

3 origines possibles

- Membrane nuclaire (herps)

- Membrane cytoplasmique (grippe)

- Membrane intra cytoplasmique:

- appareil de Golgi ou
- rticulum endoplasmique
(rubole Togavirus)
* Trs sensible aux actions physico-chimique. Elle ne constitue
pas un lment de protection de la particule virale.
C'est un lment de fragilit
d son caractre lipidique

Consquences Sur le plan pidmiologique

Virus nu : >>> Survivent dans le milieu hydrique ( les entrovirus


survivent 4: 10 15 jours, 20 : 296 jours )
>>> Rsistent aux solvants des lipides y compris le
savon
>>> Ne sont actifs que les antiseptiques halogns:
l' eau de javel (Hpatite A rsiste)
>>> Sensibles aux ultraviolets qui provoquent
l'altration des acides nucliques
Virus envelopp :
>>> Ne persiste pas dans le milieu extrieur
>>> Ne se retrouve pas dans les selles: limination par les sels
biliaires
>>> Sensibles aux solvants des lipides
>>> Inactivs par les antiseptiques et les dsinfectants
>>> Eau de Javel est le meilleur virulicide
>>> Sensibles aux ultraviolets qui provoquent l'altration
des acides nucliques
>>> Sa transmission se fait par contact direct, immdiat et
rapproch entre les individus
>>> Transport rapide et dans un milieu de survie du produit
pathologique au laboratoire pour le diagnostic
Conclusion
La perte de lenveloppe inactive le virus puisqu il a perdu
en mme temps les dterminants qui lui permettent de se fixer
aux cellules sensibles.

Virus nus sont assez rsistants


Virus poliomylitiques (isoler de leau des gouts)

Virus responsables dinfection intestinales


(transmission oro-fcale)

Virus envelopps sont fragiles


Virus de lherps ou du sida
Transmission sexuelle ou sanguine

Exceptions : les Poxvirus (variole) et les Hepadnavirus (hpatite B)


Virus envelopps mais rsistants
Protines de
l'enveloppe pouvant
se lier des
protines spcifiques
de la cellule
parasite.

Seules les cellules


possdant les protines
auxquelles les protines
du virus peuvent se lier
peuvent tre infectes
par le virus.

Virus HIV ( VIH en franais, virus de limmunodficience humaine )


Responsable du SIDA (syndrome de limmunodficience acquise)
I.6 Classification des virus
4 critres (Lwoff Horne et Tournier)
A- Nature de l'acide nuclique: ADN, ARN, simple ou double brins,
un ou plusieurs segments, taille

B- Capside avec (virus envelopp) ou sans (virus nu) enveloppe

C- Symtrie de la capside: hlicodale (comme le virus de la


mosaque du tabac) ou icosadrique (ou encore hexagonale)

D- Taille et forme du virus


Le nombre de capsomres et le diamtre de la particule
virale pour les virus symtrie cubique.
La longueur et l'paisseur des nuclocapsides pour
les virus symtrie hlicodale.
Elments de classification des virus
plus de 4000 virus
plus de 1550 espces
56 familles
233 genres
3 ordres