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Universidade de Sao Paulo

Instituto de Qumica
QBQ2500 - Bioqumica e biologia molecular: realizacoes e
perspectivas

Comentarios das Palestras


Aluno: Rodrigo Dias Garcia (IF-USP) 8658798
Professora: Shirley Schreier

Primeiro Semestre de 2017

Conteudo
1 28/03/2017 - Peptdeos e polmeros: exemplo de interacao ciencia basica-aplicada 1

2 04/04/2017 - Mecanismo e funcao da bioluminescencia em fungos 2

3 18/04/2017 - Os mecanismos moleculares do olfato: a delecao do gene Ric-8b resulta


em um camundongo anosmico 3

4 25/04/2017 - O caso do ATP 4

5 02/05/2017 - Protenas intrinsecamente desordenadas 5

6 09/05/2017 - Mecanismo de Metastase de Tumores Infantis para a Medula Ossea 6

7 16/05/2017 - Percepcao da Luz: dos Microrganismos a Visao Humana 7

8 23/05/2017 - Saturnismo: uma pandemia milenar, silenciosa e devastadora 8

9 30/05/2017 - Abordagens omicas integrativas em uma perspectiva de biologia de siste-


mas 9

10 06/06/2017 - Estrategias de Virtual Screening aplicadas a descoberta de compostos


bioativos 10

11 13/06/2017 - Funcoes mitocondriais associadas com mecanismos de controle de vida e


morte das celulas 11

12 20/06/2017 - Biologia Estrutural - o que e e porque importa 12


QBQ2500 - Bioqumica e Biologia Molecular: Realizacoes e Perspectivas
Professora: Shirley Schreier
Aluno: Rodrigo Dias Garcia (IF-USP) NUSP: 8658798

Palestra 01
Data: 28/03/2017 Palestra: Peptdeos e polmeros: exemplo de interacao ciencia
basica-aplicada
Palestrante: Dr. Clovis R. Nakaie Instituto: UNIFESP

Comentario
Dr. Clovis R. Nakaie da UNIFESP apresentou sua experiencia na area de sntese de peptdeos
e o desenvolvimento de novos metodos, atraves do uso de novas resinas, para garantir um maior
rendimento no processo de sntese.
Peptdeos sao biomoleculas formadas por aproximadamente 50 aminoacidos. Acima disso, a
molecula e classificada como protena. Os peptdeos possuem alta atividade biologica e baixas con-
centracoes nas fontes naturais. Um dos maiores problemas dos peptdeos e que sua sntese qumica
e complexa e cara.
Um dos objetivos do palestrante era se tornar autonomo nesse processo de sntese peptdica. A
intencao e desenvolver uma nova resina, diferente da usualmente usada na industria, a qual possa
melhorar o rendimento da producao peptdica.
O palestrante segue contando como seu estudo foi de encontro ao senso comum, pois e de conhe-
cimento geral que Resinas de Alta Substituicao implicariam em Impedimento Espacial. Porem, para
lidar com esse problema, Dr. Clovis desenvolveu um estudo sobre inchamento de resinas.
O palestrante finaliza com aplicacoes de peptdeos, como autonomia na producao de diferentes
tipos de peptdeos e producao de patentes. Alem disso, o desenvolvimento de snteses ineditas e de
possveis medicamentos genericos e uma possibilidade.

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Professora: Shirley Schreier
Aluno: Rodrigo Dias Garcia (IF-USP) NUSP: 8658798

Palestra 02
Data: 04/04/2017 Palestra: Mecanismo e funcao da bioluminescencia em fungos
Palestrante: Prof. Cassius Stevani Instituto: QFL-IQ-USP

Comentario
A palestra comeca com o Professor Stevani expondo que sua pesquisa sobre a bioluminescencia em
fungos se divide em duas partes: o trabalho de campo e o de laboratorio. Somos, entao, contemplados
com diversos exemplos de especies pertencentes ao reino Fungi e onde sao encontrados.
Em seguida, fomos apresentados a estrutura qumica dos reagentes responsaveis pela emissao de
luz. Longas estruturas e reacoes complexas foram mostradas, porem de forma clara, mesmo para os
alunos que nao pertencentes a area.
Tambem pode ser visto que os perodos e as relacoes da intensidade luminosa com as respectivas
protenas responsaveis se comportam de forma cardiana, mostrando uma correlacao entre ambos.
Outro ponto interessante foram os provaveis motivos da emissao de luz: atrair dispersores de
esporos; atrair predadores de fungvoros; repelir insetos fotofobicos; ou sinal de aviso (no caso de
fungos venenosos).
Por fim, a palestra se mostrou esclarecedora e divertida dadas todas as informacoes e a forma na
qual foi ministrada.

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Professora: Shirley Schreier
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Palestra 03
Data: 18/04/2017 Palestra: Os mecanismos moleculares do olfato: a delecao do gene
Ric-8b resulta em um camundongo anosmico
Palestrante: Prof. Bettina Malnic Instituto: QBQ-IQ-USP

Comentario
A professora Malnic comeca a palestra mostrando a ligacao entre o epitelio olfativo e a o sistema
nervoso central em ratos. A partir disso, uma discussao sobre o funcionamento dos sensores olfativos.
Ficamos sabendo que, enquanto seres humanos possuem por volta de 400 genes de receptores de
odores, ratos possuem por volta de 1000.
Com essa introducao, seguimos a palestra compreendendo como a grande quantidade de receptores
de odores geram diversas interacoes neuroqumicas. Dentre elas, a interacao e coexpressao do gene
Ric-8B com a protena Golf (uma das grandes responsaveis pelo receptores olfativos), sendo que o
primeiro intensifica a acao do segundo.
Para entender melhor isso, a palestrante conta que utilizou o metodo Cre-Lox para desativar o
gene Ric-8B e analisar o comportamento olfativo das cobaias.
Concluiu-se que o gene Ric-8B desativado nao so trouxe a falta da expressao do Golf, como
trouxe a morte de celulas olfativas, tornando as cobaias anosmicas.

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Professora: Shirley Schreier
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Palestra 04
Data: 25/04/2017 Palestra: O caso do ATP
Palestrante: Prof. Bayardo Torres Instituto: QBQ-IQ-USP

Comentario
A palestra inicia com o pedido do palestrante para que respondamos a perguntas sobre alguns casos
medicos e a um questionario sobre conceitos basicos, em teoria, do ATP e seus usos na fisiologia
humana. Apos correcao da atividade, momento no qual percebemos as falhas que temos sobre a
concepcao de algumas definicoes, o palestrante mostra sua real intencao com a atividade proposta.
Apresentando alguns graficos, produziddos da pesquisa com 107 alunos do Ensino Medio, 52 alu-
nos de graduacao e 47 de Pos-Graduacao, Dr. Bayardo discursa sobre como os conceitos apresentados
sao comuns de engano geral. Os graficos mostram como os mesmos erros se propagam ao longo
da vida academica, indo do ensino medio a pos-graduacao. Assim, somos apresentados ao termo
concepcoes alternativas. Vemos que essas concepcoes alternativas veem tanto do senso comum
(aceitacao acrtica de informacoes) tanto do meio academico (transposicao didatica inadequada).
Por fim, pensamos na estrategia abordada conosco a fim de remediar a situacao, e vemos que
passamos por um processo de conflito cognitivo seguido de uma mudanca do perfil conceitual. Tudo
isso ocorreu num processo de apenas 1hora, o que mostra que o processo pode ser simples. Ao
mesmo tempo, devemos levar em consideracao que o ambiente era propcio, tendo em vista que todos
estavam no auditorio com a intencao de aprender o que fosse apresentado.
Sendo assim, e necessario pensar em como pode-se aplicar esse processo em cada ambiente ou se
o ja aplicado e valido para todos.

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Palestra 05
Data: 02/05/2017 Palestra: Protenas intrinsecamente desordenadas
Palestrante: Prof. Jose S. Lopes Instituto: IF-USP

Comentario
O Prof. Jose Luiz Lopes, do Instituto de Fsica da USP, cursou Ciencias Exatas com habilitacao em
Fsica em Sao Carlos. Apesar da area de origem, seu trabalho e experiencia sao na area de biologia
estrutural.
A ideia das diferentes areas se unido se mostra de forma bem simples: o estudo da forma e
estrutura das moleculas atraves da espectroscopia, tecnica de levantamento de dados fsico-qumicos
atraves da transmissao, absorcao ou reflexao da energia radiante incidente em uma amostra.
Apesar disso, o topico levantado foi o porque do conhecimento das estruturas proteicas. O qual foi
rapidamente respondido pelo palestrante, expondo que o maior conhecimento da estrutura proteica
permite o maior conhecimento de suas funcoes. Tais funcoes poderiam estar associadas ate mesmo a
problemas geneticos, permitindo possveis estudos que combatam os mesmos.
Seguindo a apresentacao, o Prof. Lopes finaliza apresentando as chamadas Protenas Intrinse-
camente Desordenadas, as quais sao caracterizadas pela falta de estrutura terciaria estavel quando
sob a forma de cadeia peptdica isolada sob condicoes fisiologicas in vitro. As mesmas tem multiplas
funcoes como interagir com acidos nucleicos e ons metalicos.

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Professora: Shirley Schreier
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Palestra 06
Data: 09/05/2017 Palestra: Mecanismo de Metastase de Tumores Infantis para a Medula
Ossea
Palestrante: Prof. Dra. Claudiana Lameu Instituto: QBQ-IQ-USP

Comentario
A Prof. Dra. Claudiana Lameu comeca a palestra falando sobre nomes importantes para a area como
Maurcio Rocha e Silva e Sergio Henrique Ferreira. Alem disso, cita tres influencias em sua carreira
academica: Antonio Carlos Martins de Camargo, Alexander Henning Ulrich e Mariusz Ratajczak,
sendo os dois primeiros da USP.
Em seguida, temos uma meta bem estabelecida na pesquisa: entender os mecanismos que celulas
cancergenas usam para sair do tecido de origem para semear tecidos distantes e formar metastase.
A partir disso, ficamos sabendo que para isso sao estudados os sistemas Pirunergico, Nitrergico
e Cininergico. Todos sao estudados no Laboratory of Microstructure Studies and Mechanics of
Materials (LEM3 ).
A ideia e utilizar essas cadeias energeticas, juntamente a marcadores geneticos, para acompanhar
e, com isso, procurar entender o processo de metastase e mostrar que a utilizacao de certas protenas
pode contribuir para que o tratamento de canceres nao tenha celulas cancergenas sobreviventes,
evitando o processo de metastase.
A palestra se mostrou interessante, porem confusa, possivelmente pelo nvel de complexidade da
pesquisa.

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Palestra 07
Data: 16/05/2017 Palestra: Percepcao da Luz: dos Microrganismos a Visao Humana
Palestrante: Prof. Suely Lopes Gomes Instituto: QBQ-IQ-USP

Comentario
A palestrante Dra. Suely Lopes Gomes deixa claro de inicio que seu objetivo e conectar a percepcao
de luz por microrganismos e animais.
Porem a metodologia foi difcil de entende e acompanhar. O que podemos entender e que ha uma
reacao proteica, cujos principais componentes sao as Rodopsinas foto receptoras, e ionica semelhante
em diversos organismos ao serem expostos a luz.
As conclusoes se mostraram mais compreensveis e interessantes:

Rodopsinas de microrganismos e de animais possivelmente tem uma origem comum.


Olhos de animais podem ter evoludo de proto-olhos de organismos unicelulares.

Outras conclusoes apresentadas se mostraram difceis de compreender. Acredito que o topico foi
demasiado complexo para alunos nao pertencentes a area.

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Palestra 08
Data: 23/05/2017 Palestra: Saturnismo: uma pandemia milenar, silenciosa e devastadora
Palestrante: Prof. Etelvino Bechara Instituto: QFL-IQ-USP

Comentario
O Professor Etelvino Bechara dissertou sobre sua experiencia com o estudo do envenenamento por
chumbo.
O palestrante, hoje professor titular senior na USP, estudou inicialmente reacoes quimiolumines-
centes e fez doutorado em bioqumica na USP.
Saturnismo ou plumbismo refere-se a intoxicacao por chumbo de um organismo. O nome se da
por conta de que na mitologia romana, o deus Saturno era quem concedeu o chumbo aos romanos.
O chumbo pode se acumular no organismo adulto por varios meses ou anos antes de causar
sintomas. Porem, criancas menores de 6 anos de idade sao especialmente vulneraveis a contaminacao
por chumbo, pois mesmo pequenas quantidades podem afetar gravemente seu desenvolvimento fsico
e mental. A toxicidade do chumbo pode causar danos no cerebro, sangue, fgado, rins, pulmoes e
esperma.
Foram apresentados alguns casos famosos de saturnismo, dentre eles Calgula, Beethoven e Por-
tinari.

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Palestra 09
Data: 30/05/2017 Palestra: Abordagens omicas integrativas em uma perspectiva de
biologia de sistemas
Palestrante: Dra. Flavia V. Winck Instituto: QBQ-IQ-USP

Comentario
A Dra. Flavia comeca a palestra contando um pouco de sua vida academica. Fala de seu amor pela
ciencia desde crianca e de como sempre estudou em escola publica, culminando em seu curso tecnico
em Bioqumica. No ensino superior, o destaque se deu por sua graduacao em Biologia na UNICAMP
e seu doutorado no Instituto Max Planck na Alemanha.
A palestrante explica que a Biologia de Sistemas e o ramo que estuda um sistema biologico como
um todo, estudando suas etapas e a contribuicao para cada uma das mesmas. Alem disso, procura-se
compreender a nvel molecular as relacoes dinamicas as quais definem os serem vivos.
O objetivo da pesquisa da palestrante era o entendimento da biomassa para a otimizacao da
producao de combustveis e alimentos.
A palestra se mostrou interessante, porem difcil de acompanhar e muito extensa em tecnicidades.

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Palestra 10
Data: 06/06/2017 Palestra: Estrategias de Virtual Screening aplicadas a descoberta de
compostos bioativos
Palestrante: Profa. Antonia T. do Amaral Instituto: QFL-IQ-USP

Comentario
A Profa. Antonia T. do Amaral mostrou um pouco sobre o Virtual Screening e estrategias para se
chegar num composto bioativo.
O aumento do desenvolvimento de compostos bioativos a partir de 1998 deu-se principalmente
por conta de que o Virtual Screening so comecou a ser usado a partir dessa epoca. Essa tecnica com-
putacional e utilizada na descoberta de farmacos para pesquisar bibliotecas de pequenas moleculas,
a fim de identificar as estruturas que sao mais susceptveis de se ligar a um marcador biologico,
tipicamente um receptor ou enzima.
A palestra focou no Virtual Screening, indo de aplicacoes a conceitos tecnicos.

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Palestra 11
Data: 13/06/2017 Palestra: Funcoes mitocondriais associadas com mecanismos de controle
de vida e morte das celulas
Palestrante: Prof. Anibal Vercesi Instituto: UNICAMP

Comentario
O Prof. Anibal Vercesi concluiu a graduacao em 1972, com 95% da tese de doutorado pronta.
O palestrante estudou mitocondrias por mais 50 anos, desde a graducao a atualidade. Seu estudo
permitiu a percepcao entre o dose fisiologica de calcio e o funcionamento da mitocondria e, com isso,
um melhor estudo da estrutura energetica tanto de celulas animais quanto vegetais.

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Palestra 12
Data: 20/06/2017 Palestra: Biologia Estrutural - o que e e porque importa
Palestrante: Prof. Richard C. Garrat Instituto: IFUSP-Sao Carlos

Comentario
O Professor Richards nasceu em Londres e conta como resolveu estudar medicina por influencia do
pai. Fez os primeiros 2 anos de medicina no Guys Hospital Medical School, desistindo do curso
para se tornar cientista, estudando, entao no Birkbeck College, no departamento de cristalografia.
O palestrante conta como veio para o Brasil para continuar seus estudos em biologia estrutural.
Utilizando difracao de raios-X, auxiliado pelo uso de nano cristais, a pesquisa procura enten-
der as estruturas moleculares de compostos organicos, pois o entendimento da estrutura leva ao
entendimento de sua funcao.
O palestrante conta que o processo de descoberta de novas estruturas se torna cada vez mais
rapido, permitida a descoberta de novas estruturas em minutos, processo o qual poderia levar ate
mesmo meses antigamente.
Alem disso, foi citada a possibilidade de inventar novos enovelamentos. Um novo enovelamento
foi inclusive apresentado, porem sem funcao. Apesar disso, o domnio da tecnica e importante para
que futuramente sejam criados compostos uteis ao uso humano.

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