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CLASE 5 BIOLOGIA (PARTE1)

Anteriormente se dijo que existian en la replicacion unas secuencias que se llamaban origenes de
replicacion, origen donde una hebra se separaba de la otra y participan todas las proteinas como
toposomerasa, ADN primasa, etc. En la transcripcion, es sintesis de ARN mensajero, la que trabaja
es la ARN polimerasa.

Si para replicar necesito ubicar el origen de la transcripcion, para transcribir necesito encontrar
una secuencia que me dice soy un gen y esa secuencia se denomina promotor, marca donde
esta el gen y le dice al arn polimerasa que en unos pasos mas alla (hacia la derecha)debe comenzar
a transcribir. La caja TATA es una secuencia que esta en el promotor (en bacterias y eucariontes).

Una vez que el mensajero esta sintetisado, es utilizado para hacer la sintesis de proteinas. Existen
3 tipos de ARN:

-ARN mensajero= Codifica proteinas

-ARN ribosomal= forman parte del ribosoma y de la sintesis de proteinas

- ARN transferencia=Son los que traducen las proteinas.

- ARN pequeos = son una nueva forma de plantear ARN que tienen que ver con procesos como el
esplaisis , que estan en relacionados con los intrones( que no se encuentran los los arn maduros).
Por lo tanto , estos ARN tienen que ver con la sacada de cada uno de los intrones desde un
precursor de mensajero eucarionte.

TRANSCRIPCION

La enzima que trabaja aqui y hace todo el trabajo es el ARN polimerasa, enrollo, desenrolla,
sintetisa el partidor, evita que las hebras se peguen,etc. Tiene dominio de topoisomerasa es decir
la capacidad de tomar el ADN, separar una hebra de la otra he ir desenrollando, y a medida que se
va moviendo detras de ella va a ir reenrollando el ADN. Por esa razon no hay helicasa, ni
toposomerasa ni primasa. La primasa no sirve aqui porque sintetisa arn usando como molde adn.
Por lo tanto un ADN polimerasa si requiere una primasa en cambio el ARN polimerasa no la
necesita porque ella hacn el trabajo completo.

Se va a reconocer una region del ARN que se llama promotor, la misma actividad helicasa que
tiene el arn polimera permite que el ADN se separe y la hebra que tiene la seal es la conocida
para usarla como molde por ejemplo si la hebra de arriba tiene puras AAA la hebra
complementaria tendria puras TTT, en cambio el ARN que se va a sintetisar tendra puras UUU
porque toma la primera hebra para transcribir.

Al oprimir, como en replicacion, se separan las hebras, la tomoisomerasa se mueve hacia la


derecha, la helicasa la sigue y la hebra lider se sintetisa en el mismo sentido, ARN polimerasa se
mueve de 5 a 3 prima polimerisando pero desplazandose al reves que la hebra molde y la
diferencia es que ire poniendo ribonucleotidos ( si hay una A pongo una U, si hay una G pongo una
C). Cuando el ARN polimerasa esta terminando de copiar en algun momento al separar las dos
hebras de ADN se genera una estructura secuendaria como una especie de laso y eso significa que
la ttranscripcion termino.

ESTRUCTURAS DE PROMOTORES DE PROCARIONTES

El 5 prima k , La cola poli A y el esplaisi, todo esto no lo tiene las bacterias porque las bacterias no
tienen membrana nuclear, encambio los eucariontes tienen una cariteca que diferencia lo que
vamos a traducir con lo que no se debe traducir. Si el ARN mensajero esta maduro se quedara en
el nucleo y no va hacer traducido, solo se van a transportar mensajeros que tengan 5 prima K, cola
poli A y que tengas unica y exclusivamente exones.

La ARN polimerasa necesita encontrar dos marcas para funcionar una de ellas es la caja TATA y la
secuencia menos 35. La caja tata se encuentra 10 nucleotidos antes de que la arn polimerasa se
ponga a transcribir, ese sitio que es donde empieza la polimerasa a transcribir, tecnicamente le
pusieron +1 o el inicio de la transcripcion. Por eso se debe conservar la ubicacion de la caja TATA.

Todo lo que se encuentra antes de la transcripcion tiene un valor negatico y todo lo que se
encuentra durante la transcripcion tiene un valor positivo por nomenclatura, eso significa que el -
35, el -1000 va a terminar de ser negativo cuando termine el gen.

Desenrolla donde va partiendo y enrolla donde va termiando, agarro el ADN de doble hebra, los
separo, copio el molde y una vez que lo copie lo vuelvo a enrollar detras. Por esto no necesita ni a
la helicasa ni a la topoisomerasa porque el ARN polimerasa hace todo, en bascterias y en
eucariontes.

Copia de 5 a 3 prima porque cuando se transcribe se debe seguir la regla que es copio al hongo
primeriso porque cuando se enloga lo que llega es un nucleotido trifosfato, el primer nucleotido
que llega tiene su 5 prima K libre y su 3 prima OH libre, el segundo nucleotido va a formar el
enlace fosfodiester entre el fosfato del segundo y el3 prima OH del primero, va a quedar dos
nucleotidos con un 5 prima K y un 3 prima OH; Y el tercer nucleotido va a quedar 3 nucleotidos
con un 5 prima k y un 3 prima OH y siempre se iran agregando nucleotidos al 3 prima. El molde
depende si estoy haciendo transcripcion o traduccion, la cosa es que la caja tata esta en una sola
hebra. El ARN polimerasa SIEMPRE reconoce a la marca(tata) y no a la complementaria de la
marca.

ARN POLIMERASAS DE EUCARIONTES

Las bacterias tienen 3 ADN polimerasas denominadas I, II Y III. Nosotros tenemos ADN
polimerasas alfa, beta, gama, delta y elthon. Los genes descubrieron los arn polimerasas pero les
pusieron los nombres alreves es decir, las bacterias tienen una sola ARN polimerasa formanda por
una subunidades que se parecen mucho a las ADN polimerasas eucariontes y nosotros tenemos 3
ARN polimerasas que se llaman I,II Y III al igual que las ADN polimerasas de las bacterias.

Cada polimerasa eucarionte va a reconocer promotores diferentes, la caja tata sirve para los
mensajeros, el arn polimerasa II sintetisa. La ARN polimerasa I usa unas seales distintas, la ARN
polimerasa III usa otras seales diferentes a las dos anteriores.

-La I sintetisa ARN grandes 28 y 18 veces que son los ribosomas.

-La II sintetisa ARN mensajeros

-La III sintetisa ARN mas pequeos , todos los ARN de transferencia y el 5s de los ribosomas.

Cada ARN ribosomal, transferencia y mensajeros sufren procesos distintos y por eso sus marcas y
su maduracion, y su sintesis es diferente; En cambio en la bacteria, todos se hacen y se procesan al
tiro porque no hay membrana nuclear que separe una estructura de otra.

COMPARACION DE ARNM DE PROCARIONTES Y EUCARIONTES

El concepto monocistronico tiene que ver que necesita sintetisar una proteina , debe sintetisar
(previamente) un ARN mensajero. 1 es a 1, de un mensajero se puede sintetisar miles de copias
para UNA SOLA proteina.

Las bacterias que se definen como organismos policistronicos, tienen la capacidad de generar
mensajeros grandes que pueden tener la informacion para generar muchas copias de una, dos,
tres hasta cinco proteinas diferentes porque nosotros tenemos un genoma mas grande por lo que
se debe organizar muchos aminoacidos, en comparacion al genoma de las bacterias. Como la
bacteria tiene el genoma mas pequeo junta todo y hace que el sistema sea mas eficiente.
Ademas nuestros genes se encuentran todos independientemente funcionando.

MADURACION DEL ARN EN EUCARIONTES

El 5prima cap es el sombrero que el mensajero debe usar, si no usa ese sombrero no puede salir
del nucleo hacia el citoplasma y no puede ser traducido en el porque sera conocido como un ARN
FORANIUM y sera degradado. La cola poli A en el extremo de la 3 prima , es otra seal que le dice
al sistema, soy un mensajero propio, por favor ponte a traducir y el SPLICING saca todas las
regiones que no codifican que no tienen codones ni los tripletes para formar aminoacidos. Debo
unir todos los exones para poder mandar afuera del nucleo.

La adecion del 5 prima cap es un proceso cotranscripcional es decir mientras la ARN polimerasa II
esta sintetisando el mensajero inmediatamente se le pone la marca del 5 cap. Sigue sintetisando
y en algun momento pasara por una seal de polimerizacion una poli A polimerasa, va a decir lo
que va a ser esa proteina, va a tomar una secuencia y va a pegarle al extremo 3 20, 30 hasta 100
(o mas) AAA y marcara la cabeza con el 5cap y la cola con la cola poli A de ese precursor del
mensajero porque aun no esta maduro, para que este maduro debe tener SPLICING.
Todos los mensajeros eucariontes deben tener 5cap para salir a traves del complejo polo nuclear
al citoplasma, si no lo tiene no puede salir.

ADICION DE LA COLA DE POLI A

Normalmente son unas centenas de amiocinas que se estan pegando en el extremo 3, termina de
marcar el fin de ese precursos de mensajero en eucarionte, las bacterias no tien ni 5cap ni cola
poli A.

EXTRUCTURA DE GENES PROCARIONTES Y EUCARIONTES

Un gen eucarionte con axones e intrones y un gen bacteriano que solo tien un gen codificante. Los
intrones normalmente son mayor en tamao que los exones, guardamos intrones porque cumplen
una funcion biologica que es proteger de las mutaciones que no afectan a las proteinas, pero si cae
en los exones si afecta a la proteina. Mientras mas evolucionado este un individuo como
organismo , mas intrones tiene , mas secuencia intergenicas tiene. Diferencia entre nosotrso con
el chimapanse.

SPLICING DE TRANSCRITOS PRIMARIOS

Cada 3 nucleiotidos tengo un aminoacido por eso cundo sancan intrones y quedan los exones, del
tamao que queda no es igual al tamao que se expresa en la proteina ( se va achicando el
tamao).

El Splicing lo hace un cuerpo que se llama spliceosoma significa que en ese splicing habra proteinas
y arn cataliticos que van hacer capaces de reconocer secuencias en los intrones y van hacer que
cada intron por si solo haga una especie de laso y salga, cuando sale se hace un enlace covalente
entre el intron I y el intron II y asi consecutivamente hasta formar un ARN mensajero maduro que
solamente tiene exones. No tengo separacion fisica en los procesos de maduracion de las
bacterias como si lo tengo en el caso de u eucarionte porque todo lo que pasa adentro del nucleo
esta pensado en separar el formato de ua proteina dentro del nucleo del formato de una molecula
madura fuera del citoplasma. Si paso el poro nuclear el sistema piensa que es maduro y puede ser
traducido y transcribido.

TRADUCCION

Para la sintesis de proteinas debe estar el mensajero, transferencia y las unidades mayor y menor
de los ribosomas. ARN de transferencia para armarlo y necesitan la proteina que le entregue la
mochila (la informacion) a cada ARN de transferencia, aminoacil ARNT que le mira el codigo a la
ARN de transferencia y dice tienes AGC , te debo poner una mochila de prolimero, tienes ATC te
debo poner una mochila de alanina.

ARN de transferencia solo reconoce algo en el mensajero y si lo reconoce se saca la carga y la pone
para que se genere la sintesis de proteinas , lo que reconoce la unidad de transferencia se llama
codon, el codon esta en el mensajero y el anticodon esta en el ARN de transferencia.
CODIGO GENETICO

No es universal , los cloroplastos y las mitocondrias tiene su propio codigo genetico por lo tanto el
codigo genetico que se define como universal esta pensado en lo que nuestros genes nucleares
tienen y se codifican a un aminoacido. El codigo genetico no es ambiguo es decir un triplete (tres
letras) solo codifican para un solo y unico aminoacido pero el codigo genetico es degenerado
porque por ejemplo la prolina, la leucina puede ser codificada por 5 o 6 combinaciones de letras
diferentes.

Cada codon o cada triplete estara asociado por un unico y exclusivo aminoacido. Las dos primeras
letras son las que definen el nombre del aminoacido.

TRADUCCION

El ARN de transferencia porta el aminoacido y porta el anticodon, va a entregar cada aminoacido a


cada codon que reconoce en el mensajero, cuando comienza a sintetisarce la proteina , proceso
conocido como traduccion, lo que debe pasar es que le ribosoma, la subunidad menor del
ribosoma reconozca algo en esa molecula si es un mensajero eucarionte lo que reconocera es el
sombrero del mensajero, es decir el 5CAP, despues de que reconozca eso , la subunidad del 5cap
debe comenzar a caminar desde el 5cap hasta encontrar el codon de idinio (AUG). Si en ese codon
de inicio esta ubicado el ARN de transferencia que reconoce el AUG y que viene con la metionina,
se arma el cadete y comienza la traduccion. Si cuando pasa la subunidad del ribosoma pasa por el
AUG no existe coexistencia con metionina, el sistema ni siquiera se arma, hace un escaneo y
suelta el mensajero. Comienza a formar hasta que encuentra el codon de termino y el sistema
termina.

La subunidad menor se encarga de reclutar ella sola al ARN de transferencia que reconoce el AUG
y ella lo lleva reconociendo el 5cap ,caminando hasta encontrar el AUG y cuando comienza a
formar le manda una seal a la subunidad mayor y se ponen hacer la traduccion. Cuando el
ribosoma esta formado quedan disponibles unos sitios que se llaman A, P Y E. El A donde llega el
aminoacido con el ARN de transferencia, el P donde se forma el enlace peptidico y el E sale el ARN
de transferencia que ya entrego su aminoacido.

Cuando aparece el segundo ARN de transferencia, llega al citio A, la subunidad mayor se mueve y
hace que en el sitio P se forme el primer enlace peptidico y el ARN de transferencia que tenia
quedo en el cito E por lo tanto se va a descanzar y una vez que esto paso la subunidad menor se
pone a la par y de nuevo el sito A queda completo.

INICIACION DE LA TRADUCCION EN PROCARIONTES

Las bacterias no tienen 5cap y deben conocer a sus mensajeros como propios. El remplazo del
5cap en la abcteria se llama SHINE-DALGARNO , es una secuencia propia de todo mensajero
bacteriano que tiene complementariedad de bases que termianan UAAGGAGG y se unen por
puente de hidrogenos con AUUCCUCC.
La subunidad menor del ribosoma bacteriano tiene internamente una secuencia que se forman
puente de hidrogeno con SHINE-DALGARNO y de esa manera la subunidad menor reconoce si ese
mensajero es de el. Lo que ocurre es que se debe ir moviendo hasta AUG , esperar a que llegue el
codon de inicio, el ARN de transferencia con metionina y al igaul que en eucarionte comienza la
traduccion. Se debe cambiar la funcion del 5CAP para que comience.

En ingles los codones de terminos no se llamaban codones de terminos sino que conodes sin
sentidos , lo que ocurre que cuando el sistema reconoce los codone, los codones de termino no
existe en ningun arn de transferencia por lo que debe llegar una proteina llamada factor de
liberacion disfrazada de arn de transferencia se pone justo en el sito A para formar enlace
peptidico y como en el arn de transferencia del termino no tiene nada, el aminoacido se suelta y
por eso se genera el termino.

POLIRRIBOSOMA

Los mensajeros bacterianos tienen una vida super reducida y se debe trabajar mucho con el antes
de perderlo y el ribosoma es el que lo traduce. Cada mensajero debe ser utilizado por el tiempo en
que se encuentra en el citoplasmas haciendo muchas proteinas identicas en el menor tiempo
posible.

LA TRANSCRICION Y LA TRADUCCION ESTAN ACOPLADAS EN PROCARIONTES

En lasbacterias, se transcribe el mensajero e inmediatamente yo estoy traduciendo por eso no


hay 5cap, ni cola polia A ni SPLICING, a penas el arn polimerasa esta sintetisando el 5 de ese
mensajero inmediatamente hay ribosomas que dicen le encontramos el shine-dalgarno tiene AUG
me pongo a traducir.

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