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FECHA DE PRESENTACION:
Chiclayo 17 de mayo de 2015
PIMENTEL 2014
INTRODUCCIN
Sabemos que los cidos nucleicos constituyen el depsito de informacin de todas las
secuencias de aminocidos, de todas las protenas de la clula.
Existe una correlacin entre ambas secuencias, lo que se expresa diciendo que cidos
nucleicos y protenas son colineares; la descripcin de esta correlacin es lo que llamamos
Cdigo Gentico.
Los cidos nucleicos, as como las protenas e hidratos de carbono constituyen gran
parte de la materia viva (biomolculas). En particular, los cidos nucleicos son los componentes
ms fundamentales e importantes de la clula viva.
Estos procesos son la base de la vida a escala molecular, y permiten las diversas
actividades de las clulas: crecer, reproducirse, mantener sus estructuras, responder a
estmulos, etc.
Los cidos nucleicos son hidrolizados por enzimas nucleasas, liberndose los
nucletidos que los constituyen. Posteriormente, otras enzimas rompen los nucletidos en sus
componentes (pentosa, fosfato y base nitrogenada).
DEFINICION
Los cidos Nucleicos son compuestos formados por C, H, O, N y P, formados por cido fosfrico, una
pentosa (ribosa o desoxirribosa) y una base nitrogenada (adenina, guanina, citosina, timina y uracilo).
Los cidos nucleicos son polmeros de los nucletidos, que se unen entre s a travs del radical fosfato
situado en el C 5' de un nucletido y el radical hidroxilo (OH) del carbono 3' del otro nucletido. La unin
se realiza mediante enlaces fosfodister.
Existen dos tipos: ADN y ARN.
Una pentosa.
Un fosfato.
La unin de estas tres molculas en relacin 1:1:1 constituye un nucletido, unidad bsica o monmera de
los cidos nucleicos.
La pentosa puede ser: ribosa o desoxirribosa. La diferencia entre ambas reside en que el grupo hidroxilo (-
OH) del carbono 2' de la ribosa es sustituido por un hidrgeno en la desoxirribosa.
BASES NITROGENADAS
D EFINICIN
Las Bases Nitrogenadas, son una familia que contienen molculas cclicas derivadas de dos anillos
bsicos: purina y pirimidina estas contienen la informacin gentica.
En el caso del ADN las bases son dos Purinas y dos Pirimidinas. Las purinas son A (Adenina) y G
(Guanina). Las pirimidinas son T (Timina) y C (Citosina). En el caso del ARN tambin son cuatro bases,
dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A y G y las pirimidinas son C y U (Uracilo).
Nuclesido X=ribosa o
Formula de la base Base (X=H) Nucletido=ribosa fosfato
desoxirribosa
Adenosina monofosfato,
Adenina, A Adenosina, A
AMP
Guanosina monofosfato,
Guanina, G Guanosina, G
GMP
CLASIFICACIN
B ASES PRICAS
Estn basadas en el Anillo Purnico. Puede observarse que se trata de un sistema plano de nueve tomos,
cinco carbonos y cuatro nitrgenos.
B ASES PIRIMIDNICAS
Estn basadas en el Anillo Pirimidnico. Es un sistema plano de seis tomos, cuatro carbonos y dos
nitrgenos.
Las pirimidinas que encontramos en el ADN son Citosina y Timina. En el ARN encontramos Citosina y
Uracilo.
NUCLESIDOS
Se forman mediante la unin de una pentosa (beta - D - ribofuranosa o beta - D -desoxirribofuranosa), con
una base nitrogenada, establecindose un enlace N - glucosdico entre el carbono 1 de la pentosa y el
nitrgeno 1 de la base nitrogenada, si sta es pirimidnica, o el nitrgeno 9 si es prica.
Ribosa Desoxirribosa
Adenina Adenosina Desoxiadenosina
NUCLETIDOS
Se forman mediante la unin de una molcula de cido fosfrico y un nuclesido, a travs del grupo
hidroxilo del C 5' de la pentosa.
Se nombran anteponiendo la palabra cido al nombre de la base y aadiendo la terminacin -lico (ej.:
cido adenlico). Con frecuencia se emplea solamente las siglas del nombre completo (AMP, CMP, dTMP =
desoxitimidn monofosfato).
Los nucletidos pueden contener uno, dos o tres fosfatos, denominndose respectivamente nucletido
mono, di o tri-fosfato.
TIPOS DE ACIDOS NUCLEICOS
DEFINICION:
El ADN, est formado por nucletidos de A, C, G y T, unidos entre s por medio de enlaces
fosfodister en el sentido 5' -- 3' (entre el C 3' de uno y el C 5' del siguiente). Tiene un peso molecular
muy elevado
DEFINICION DE METABOLISMO
El metabolismo es el conjunto de reacciones bioqumicas y procesos fsico qumicos que ocurren en una
clula y en el organismo.
Estos procesos son la base de la vida a escala molecular, y permiten las diversas actividades de las
clulas: crecer, reproducirse, mantener sus estructuras, responder a estmulos, etc.
Los cidos nucleicos son degradados en el intestino, sobre ellos actan enzimas denominadas nucleasas
(ribo y desoxiribonucleasa) pancreticas e intestinales, dichas enzimas separan a estas macromolculas
en nucletidos los cuales estn formados por una pentosa (ribosa o desoxirribosa), una base nitrogenada
(purinas o pirimidinas), y un grupo fosfato.
Estos a la vez sufren entonces la accin de fosfatasas intestinales que liberan el resto fosfato de los
nucletidos convirtindolos en nuclesidos, los cuales pueden ser absorbidos como tales, o ser
degradados por nucleosidasas intestinales, que separan las bases nitrogenadas pricas o pirimdicas de la
pentosa ribosa o desoxirribosa.
Las pentosas (ribosa o desoxirribosa) siguen en su degradacin la va de los glcidos. El cido fosfrico se
excreta en parte como in fosfato, a travs de la orina y en parte se utiliza para la sntesis de ATP.
Por otro lado, las bases nitrogenadas se degradan para dar productos que son excretados. Las bases
pricas (A y G) originan cido rico, que se elimina por la orina. Las bases pirimidnicas (C, T y U) se
degradan liberando amoniaco o urea.
An cuando los humanos consuman una dieta rica en nucleoprotenas, las bases pricas y pirimdicas de
estas no se incorporan de manera directa a los cidos nucleicos de las clulas tisulares, sino que se
biosintetizan de novo a partir de intermediarios anfiblicos.
Sin embargo, los anlogos de purinas y pirimidinas inyectados (incluyendo medicamentos potenciales
contra el cncer) pueden incorporarse al DNA, lo cual se utiliza como terapia curativa.
El fosfato y los azucares que se producen en la digestin de los cidos nucleicos pueden ser reutilizados,
al igual que la adenina, pero la mayor parte de las bases pricas o pirimdicas se catabolizan y excretan.
El ser humano no depende de las bases nitrogenadas de la dieta para atender a las necesidades de la
sntesis de cidos nucleicos y nucletidos libres. Las bases son producidas en casi todas las clulas con
tal eficacia, que el organismo puede prescindir totalmente del aporte exgeno.
e. Componentes de coenzimas. Coenzimas tales como el NAD+, NADP+, FAD, sus formas reducidas y
la coenzima A contienen como parte de sus estructuras una porcin 5-AMP.
g. Efectores alostricos. Muchos de los pasos regulados en las vas metablicas estn controlados por
las concentraciones intracelulares de nucletidos. Tal es el caso, como veremos, de la sntesis de los
nucletidos, donde son ellos mismos quienes regulan su biosntesis.
El metabolismo de los nucletidos est centrado en el anfibolismo de las bases nitrogenadas que los
forman.
Como sucede con los aminocidos, en el organismo puede hacerse una separacin virtual entre exgeno
y endgeno formndose dos pools metablicamente independientes.
Las bases procedentes de los alimentos son degradadas y sus productos finales excretados, mientras que
la sntesis de nuevos nucletido y polinucletidos se realiza con purinas y pirimidinas formadas en las
clulas.
Los cidos nucleicos del organismo, al igual que las protenas, estn en continuo recambio. Una parte de
las bases liberada durante los procesos de degradacin puede ser reutilizada para la sntesis de
nucletidos y cidos nucleicos, a travs de la va llamada de reciclaje. El resto termina siendo
catabolizado y los productos finales son excretados.
El folato es una vitamina para los seres humanos y tiene q ser aportado en la dieta diaria; el folato tiene
diversas funciones en la sntesis de los precursores de los cidos nucleicos. El acido nucleico contenido en
la dieta es transformado en tetrahidrofolato (THF) por la enzima dihidrofolato reductasa la cual utiliza al
NADPH como agente reductor.
El THF es derivado de la vitamina que acta como coenzima aceptora de unidades de un tomo de
carbono; estas se unen al THF dando lugar a 4 coenzimas importantes:
- 5- metil -THF: importante en el estado de oxidacin del metanol.
- 5,10 metilen THF: en el estado de oxidacin del formaldehido.
- 5,10 metel THF: importante en el estado de oxidacin del cido frmico.
- 10 formil THF: importante en el estado de oxidacin del cido frmico.
El ensamblaje de los segmentos se realiza en una secuencia de reacciones llevadas a cabo por
enzimas que se hallan en el citosol de la mayora de las clulas (Siguiente figura). Desde el
comienzo participa ribosa-5-fosfato, sobre la cual se van realizando todas las adiciones, por
consecuente el producto final de la va no es una base libre, sino un nucletido (IMP).
La ribosa-5-fosfato se genera en la va de las hexosas monofosfato, sta debe ser activada para
ingresar a la sntesis usando una ATP, el cual le transfiere pirofosfato en el carbono 1. Esta
reaccin es catalizada por la fosforribosilpirofosfato sintetasa, dando como producto 5-fosforribosil-
1-pirofosfato (PRPP), compuesto que participa tanto de la sntesis de novo de purinas y pirimidinas
como en la va de reciclaje.
La siguiente reaccin, catalizada por la glutamina PRPP amidotransferasa, transfiere el grupo amida de
una glutamina en el carbono donde se encuentra el pirofosfato de la PRPP, al cual desplaza formado un
enlace CN que ser el enlace N-glucosdico entre el C1 de la pentosa y el N9 de la purina en el
nuclesido que se ha de formar. El producto es 5-foforribosil-1-amina, la cual reacciona con glicina y ATP
para dar 5-fosforribosilglicinamida, reaccin llevada a cabo por la fosforribosilglicinamida sintetasa.
Los dems tomos del heterociclo purina se agregaran en 8 etapas sucesivas. La actividad enzimtica de
varios pasos de sta va, residen en dominios separados de protenas enzimticas multifuncionales. De
toda estas etapas el primer nucletido que se obtiene es inosina monofosfato (IMP), cuya base
nitrogenada es la hipoxantina.
A partir del IMP se produce una bifurcacin de la va de sntesis, debido a que el IMP se convertir en AMP
o GMP. Posteriormente estos nucletidos formarn ATP y GTP respectivamente, utilizando las enzimas 5-
monofosfato quinasa y nuclesido-5-disfosfato quinasa.
La conversin hacia uno u otro nucletido no es al azar; la formacin de GMP requiere energa de ATP,
mientras que la formacin de AMP requiere GTP. Esto se interpreta como una reaccin recproca, es decir,
un aumento de ATP provoca un aumento de GMP y viceversa, mucho GTP aumenta la produccin de AMP.
Esto es una forma de regulacin que equilibra las cantidades de GTP y ATP sintetizadas dentro de la
clula.
El anillo de purina esta ensamblado con una molecula de ribosa 5- fosfato, por lo que las purinas se
sintetizan como mononucleotidos en contraposicin a las bases libres. La localizacin de esta via es
en las clulas hepticas (hepatocitos), en el citosol celular y hay dos estadios:
4) La adicin del grupo formilo del formil THF produce C8 del anillo de cinco carbonos. Una
5) La adicin del segundo grupo amido de la glutamina requiere ATP, forma el formilglicinamidina
ribosil-5- fosfato (VI). Catalizada por la fomilglicinamida ribosil-5-fosfato cintetasa, esta reaccin
agrega el tomo que ser el nitrgeno 3 del IMP.
7) La adicin de CO2 a (VII) agrega el tomo que sera el carbono 6 del IMP. La reaccin, catalizada
por la aminoimidazol ribosil -5-fosfato carboxilasa. No requiere ATP ni biotina y forma el
aminoimidazol carboxilato ribosil-5-fosfato (VIII).
8) La condensacin de aspartato con (VlII). La molcula completa se une en posicin 6, requiriendo
ATP. Catalizada por la succinilcarboxamida ribosil-5-fosfato sintetasa, forma el aminoimidazol
succinil carboxamida ribosil-5-fosfato (IX)
9) Eliminacin del esqueleto carbono del aspartato como fumarato, dejando que el grupo amino
forme el N1 del anillo de 6 carbonos. Catalizada por la adenosilsuccinasa, forma el
aminoimidazol carboxamida ribosil-5-fosfato (X).
10) Adicin de un segundo grupo formilo del fornil THF. El carbono 2 del IMP se agrega en
una reaccin que implica un segundo derivado del tetrahidrofolato y una segunda
forrniltransferasa.
11) EI cierre de! aniIlo de seis carbonos (XI) que se cataliza por Ia IMP ciclohidrolasa. forma el
primer nucletido de la purina, esto es, el monofosfato de inosina o IMP (XII).
La formacin de IMP requiere en total de seis molculas de ATP
2. Vas de recuperacin
El recambio de acidos nucleicos da lugar a la liberacin de purinas libres. Estas bases libres
son recicladas por la via de recuperacin que vuelve a unir un azcar y un grupo fosfato para
reformar el nucletido
Cuando se descomponen los acidos nucleicos y los nucletidos se liberan las bases libres. La
via de recuperacin recicla estas bases libres volvindolas a unir con la ribosa -5-fosfato
Se trata de una via de un paso y la ribosa 5- fosfato es transferida del PRPP a las bases libres.
La liberacin de pirofosfato convierte a las reacciones en irreversibles. Solamente se necesitan
dos enzimas: adenina fosforribosil transferasa (APRT) e hipoxantina guanina fosforribosil
transferasa (HGPRT). La via es simple y requiere mucho menos ATP que la sintesis de novo
porque las bases no tienen que fabricarse previamente.
La enzima es un monmero enzimtico activo, pero en presencia de IMP, AMP y GMP forma un dmero
menos activo. La PRPP favorece la forma monomrica. La enzima posee dos centros alostricos, en
uno se fijan IMP y GMP, nucletidos oxopurnicos; y en el otro AMP, nucletido aminopurnicos. La
fijacin simultanea de IMP y AMP o GMP produce un efecto aditivo o sinrgico en la inhibicin del
enzima.
Ambas enzimas se regulan por feed-back, inhibicin competitiva de los productos. Estas vas
alternativas de sntesis de nucletidos interrumpen eficazmente la sntesis de novo de estos
compuestos.
En primer lugar, por el uso de PRPP, activador de la Gln PRPPamido transferasa, lo que provoca una
gran disminucin de su velocidad de catlisis; y en segundo lugar, la formacin de AMP, GMP y IMP
provocan efecto negativo sobre la misma enzima. Esto evita el uso de energa innecesario, pero ms
importante an, desciende marcadamente la sntesis de AMP y GMP as como el metabolito de su
degradacin, el cido rico. Esto se ve reflejado en el sndrome de Lesch-Nyhan, enfermedad
neurolgica hereditaria ligada al cromosoma X, donde la actividad de la HGPRTasa esta disminuida de
forma importante, dando hiperuricemia, retraso mental y trastornos sensoriales que pueden llevar a la
automutilacin.
d. Catabolismo de purinas.
La degradacin de DNA y RNA por nucleasas produce nucletidos (ribo y desoxiribonucletidos) y
estos a su vez son sometidos a hidrlisis de nucleotidasas con accin fosfatasa dando nuclesidos
libres, en el caso de las purinas, adenosina y guanosina; esta ltima es degradada a guanina y ribosa-
1-fosfato por la nuclesido purnico fosforilasa.
El nuclesido adenosina, por accin de la adenosina desaminasa, se convierte en inosina, luego una
nuclesido fosforilasa divide a la inosina en hipoxantina y pentosa-1-fosfato. La hipoxantina se oxida a
xantina por la xantina oxidasa, flavoprotena que contiene Fe y Mo (molibdeno).
Por otro lado la guanina, por accin de la guanasa, se convierte tambin en xantina. Tanto adenina
como guanina convergen en xantina. Este metabolito es sustrato de la xantina oxidasa, nuevamente en
escena, que lo convierte en cido rico, producto terminal de la degradacin de purinas, el cual es
escretado principalmente por orina. La figura 15 muestra la va de degradacin de las purinas.
Esta reaccin es similar al primer paso del ciclo de la urea, donde participa la carbamoil fosfata
sintetasa I, la cual es mitocondrial y requiere N-acetilglutamato para funcionar, en cambio la CPSII
no lo necesita y es citoslica.
Formado el carbamoil fosfato se combina con aspartato para dar carbamoilaspartato, reaccin
catalizada por la aspartato transcarbamilasa (o aspartato carbamoil-transferasa), enzima
alostericamente regulada, siendo el principal punto de regulacin de la va. El carbamoilaspartato
se cicla y forma cido orotico, el cual reacciona con fosforibosil pirofosfato (PRPP) para formar el
primer nucletido: uridina monofosfato (UMP).
La fosforilacin del UMP, por accin de la nucletido difosfoquinasa, produce UDP y UTP. Es
entonces cuando el C4 de la uridina-5-trifosfato se transamina con un grupo amida de una
glutamina, formando citidina-5-trifosfato (CTP), siendo la CTP sintetasa quien participa en esta
reaccin.
2. Asapartato carbamoil transferasa: por su parte, esta enzima es inhibida por UMP y CTP, tambin
productos finales; y es activada por sus sustratos carbamoil fosfato y Aspartato.
Adems, se da un feed-back negativo en la formacin de CTP a partir de UTP, lo que asegura
niveles equilibrados de CTP y UTP, este ltimo factible de convertirse en TTP.
d. Catabolismo de pirimidinas.
El recambio de los cidos nucleicos da lugar a la liberacin de nucletidos de pirimidina y purina. La
degradacin de los nucletidos pirmidnicos siguen la ruta que los convierte en nuclesidos por accin
de fosfatasas inespecficas.
La citidina y desoxicitidina son desaminadas a uridina y desoxiuridina, por la nuclesido pirimidina
desaminasa. La uridina fosforilasa cataliza la fosforlisis de la uridina, desoxiuridina y timidita, para
formar las bases pirimdinicas uracilo y timina como producto final.
Las bases pirmdicas son degradadas hasta productos muy solubles y fcilmente eliminados o
utilizados por las clulas.
El uracilo recibe dos hidrgenos donados por NADPH para convertirse en dihidrouracilo.
Posteriormente se produce, por hidrlisis, apertura y ruptura del anillo pirimidnico para formar -
alanina, CO2 y NH3 como producto final. Ninguno de estos productos es exclusivo de la degradacin
del uracilo, por lo que no puede estimarse el recambio de los nucletidos de citosina y de uracilo a
partir de los productos finales de esta va.
La timina es hidrogenada a dihidrotimina en una reaccin en la cual participa NADPH. Luego el ciclo se
abre y se produce -aminoisobutirato, CO2 y NH3. Eventualmente, el -aminoisobutirato puede
convertirse en succinil-CoA, que puede ingresar al ciclo del cido ctrico. Por otro lado, el cido -
aminoisobutrico es excretado por la orina en el hombre, y se origina exclusivamente a partir de la
degradacin de timina. Se puede, por tanto, estimar el recambio de DNA o de los nucletidos de
timidina midiendo la excrecin de -amino-isobutirato.
Pacientes con cncer sometidos a quimioterapia o radioterapia, procesos en los que se matan grandes
cantidades de clulas y se degrada DNA, excretan niveles aumentados de cido -aminoisobutirico.
Se han sintetizado o aislado (como productos naturales de plantas, hongos o bacterias) muchos
compuestos que son anlogos estructurales de las bases o los nuclesidos utilizados en la reacciones
metablicas. Estos compuestos son inhibidores relativamente especficos de enzimas implicadas en la
sntesis o interconversin de nucletidos. Estos frmacos, tiles en terapia de cuadros clnicos, se han
clasificados en antimetabolitos, antifolatos, antagonistas de la glutamina y otros compuestos.
Antimetabolitos: son, generalmente, anlogos estructurales de las bases o nuclesidos purnicos y
pirimidnicos que obstaculizan centros metablicos muy especficos. Mucho de los actuales
quimioterapicos pertenecen a este grupo.
Antifolatos: compuestos que obstaculizan la formacin de tetrahidrofolato (THF) a partir de
dihidrofolato (H2folato) por inhibicin de la dihidrofolato reductasa.
Antagonistas de la glutamina: en las clulas tienen lugar muchas reacciones en las que la
glutamina acta como dador de grupos amino. Estas reacciones de amidacin son muy crticas
para la sntesis de novo del anillo purnico (N3 y N9), en la conversin de IMP en GMP, en la
formacin del carbamoil fosfato citoslico, en la conversin de UTP a CTP y en la sntesis de
NAD+. Los compuestos que inhiben estas reacciones se conocen como antagonistas de la
glutamina.
El cuadro que a continuacin se presenta describe algunos agentes quimioterpicos, muchos de los cuales
son de muy frecuente uso en la clnica mdica.
Los seres humanos sintetizan los cidos nucleicos, ATP, NAD+, coenzima A, etc., a partir de intermediarios
anfiblicos. Sin embargo, los anlogos de purina o pirimidina inyectados, entre ellos frmacos anticncer
potenciales, pueden incorporarse hacia el DNA.
La biosntesis de purina y pirimidina oxirribonucletidos y desoxiribonucletidos (NTP y dNTP) es un
evento regulado con exactitud, coordinado por medio de mecanismos de retroaccin que aseguran su
produccin en cantidades apropiadas, y en momentos que se ajustan a una demanda fisiolgica variable
(p. ej., divisin celular).
Las enfermedades de seres humanos que incluyen anormalidades del metabolismo de la purina son gota,
sndrome de Lesch Nyhan, deficiencia de adenosina desaminasa, y deficiencia de nuclesido purina
fosforilasa. Las enfermedades de la biosntesis de la pirimidina son ms raras, pero incluyen acidurias
orticas.
Al contrario de los uratos, los productos del catabolismo de pirimidina (dixido de carbono, amoniaco,
alanina y aminoisobutirato) son muy solubles.
Este trastorno del catabolismo de pirimidina, tambin conocido como uraciluriatiminuria combinada,
tambin es un trastorno de la biosntesis de aminoacidos, dado que la formacin de alanina y
aminoisobutirato est alterada. Una forma no gentica puede desencadenarse por la administracin del
medicamento anticncer 5fluorouracilo a pacientes que tienen concentraciones bajas de dihidropirimidina
deshidrogenasa.
1. Los cidos Nucleicos son compuestos formados por C, H, O, N y P, formados por cido
fosfrico, una pentosa (ribosa o desoxirribosa) y una base nitrogenada (adenina,
guanina, citosina, timina y uracilo).
2. Las Bases Nitrogenadas, son una familia que contienen molculas cclicas derivadas
de dos anillos bsicos: purina y pirimidina estas contienen la informacin gentica.
En el caso del ADN las bases son dos Purinas y dos Pirimidinas. Las purinas son A
(Adenina) y G (Guanina). Las pirimidinas son T (Timina) y C (Citosina). En el caso del
ARN tambin son cuatro bases, dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A y G y
las pirimidinas son C y U (Uracilo).