2016

espectrometria de
masas.docx

TRABAJO DE
ESPECTROSCOPIA
ESPECTROSCOPIA DE IR Y ESPECTOMETRIA DE MASAS
DOCENTE: GARCIA ARMAS, JUAN

Facultad de Ingeniera Industrial

UNIVERSIDAD PRIVADA ANTENOR ORREGO
10/10/2016
 Pgina |1

INTEGRANTES:

CISTERNA CUBA,
GERSON
GONZALES OLAVARRIA,
SERGIO
GRAU LMA, CLAUDIA
JULON IDROGO,
CARLOS
ROJAS ENCIOSUP,
ELIZABETH
(COORDIANDORA)
PRADO MINCHOLA ,
OSCAR
RUIZ SAAVEDRA,
MARCO ANTONIO
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1. PRINCIPIOS DE ESPECTROSCOPIA MOLECULAR: RADIACIN ELECTROMAGNTICA1

Las radiaciones electromagnticas pueden definirse como aquellos procesos en los que se
emite energa bajo la forma de ondas o partculas materiales y pueden propagarse tanto a
travs de un medio material como en el vaco.

La radiacin electromagntica, de la cual la luz visible es apenas un ejemplo, tiene las

propiedades tanto de las partculas como de las ondas. Las partculas se llaman fotones, y
cada uno posee una cantidad de energa llamada cuanto. En 1990, el fsico alemn Max
Planck propuso que la energa de un fotn (E) era directamente proporcional a su frecuencia
(v).
E=hv

Las unidades SI de frecuencia son el reciproco de segundos (s(: recibieron el nombre de

hertz y el smbolo de Hz en honor a Heinrich R. Hertz, fsico del siglo XIX. La constante de
proporcionalidad h se llama constante de Planck y tiene el valor H=6.63 x 10 J.s

La radiacin electromagntica viaja a la velocidad de la luz (c=3.0 x 10 m/s), que es igual al

producto de su frecuencia v y su longitud de onda :
C=v

1 Qumica Orgnica Vol1. L. G. Wade, pg. 510

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ESPECTRO ELECTROMAGNETICO

Figura 1

2. PRINCIPIOS DE ESPECTROSCOPIA MOLECULAR: ESTADOS DE ENERGA

CUANTIZADA

Qu es lo que determina que un fotn sea absorbido por una molcula? El requisito ms
importante es que la energa del fotn sea igual a la diferencia de energa entre dos estados,
como dos estados de spin nuclear, dos estados vibratorios o dos estados electrnicos.
 Pgina |4

En fsica el trmino para referirse a esto es resonancia: la transferencia de energa entre dos
objetos que ocurre cuando sus frecuencias son igualadas.

En espectroscopia molecular, lo que interesa es la transferencia de energa de un fotn a una

molcula designados como E1 y E2. La diferencia de energa entre ellos es E2-E1 o E. En la
energa cintica, la cual es continua, significa que todos los valores de la energa cintica
estn disponibles para una molcula, solo ciertas energas son posibles para los estados
electrnicos, vibratorios y de spin nuclear. Se dice que estos estados de energa estn
cuantizados. Las molculas se encuentran ms en el estado de energa menor E1 que en el
estado de energa mayor E2. La excitacin de una molcula de un estado menor a uno mayor
requiere de un incremento de energa igual a E. Por tanto, cuando la radiacin
electromagntica incide sobre una molcula, solo la frecuencia cuya energa correspondiente
es igual a E es absorbida, todas las otras frecuencias se transmiten.

3. Espectroscopia de infrarrojo2

La espectroscopia de infrarrojo (IR) era el mtodo instrumental aplicado con ms frecuencia

para la determinacin de las estructuras orgnicas.

3.1. Regin Infrarroja.

La radiacin infrarroja es la porcin del espectro electromagntico (vea la figura 2)

entre las microondas y la luz visible. La fraccin de la regin infrarroja de ms uso

para la determinacin de estructuras se encuentra entre 2.510^(-6) m y 16

10^(-6) m en longitud de onda.

2 Qumica Orgnica Vol1. L. G. Walde, pag. 517

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Figura 2

3.2. Vibraciones moleculares3

La absorcin de un fotn de radiacin infrarroja excita una molcula desde su estado

vibratorio ms bajo, o basal, a uno mayor. Estas vibraciones incluyen los modos de
alargamiento y de torsin del tipo ilustrado para un grupo metileno en la figura 3. Una
sola molcula puede tener un nmero grande de vibraciones distintas, y los espectros
de IR de molculas diferentes, como las huellas digitales, son diferentes. La
superposicin de sus espectros de IR se ofrece por lo comn como prueba de que
dos compuestos son iguales.

Figura 3 Vibraciones de alargamiento y de torsin de una unidad de metilo.

3.3. Vibraciones activas e inactivas en el IR

3 Qumica Orgnica Vol1. L. G. Wade, pag. 519

 Pgina |6

Uno de los componentes de una onda electromagntica es un campo elctrico que se

invierte con rapidez (E). Este campo estira y comprime de manera alternada un
enlace polar (ver figura 3.3) .Cuando el campo elctrico es en la misma direccin que
el momento dipolar, el enlace se comprime y su momento dipolar disminuye.

1. Vibraciones activas4

Cuando el campo es opuesto al momento dipolar, el enlace se estira y su

momento dipolar aumenta. Si este estiramiento y comprensin alternados del
enlace ocurre a la frecuencia de la velocidad de vibracin natural de la
molcula, puede absorberse energa. Las vibraciones de los enlaces con
momentos dipolares por lo general resultan en absorciones IR y se dice que
son activas en el IR.

2. Vibraciones inactivas

Si un enlace es simtrico y tiene momento dipolar de cero, el campo elctrico

no interacta con el enlace. Debido a que la vibracin no produce algn
cambio en el momento dipolar, no hay absorcin de energa.
Se dice que esta vibracin es inactiva en el IR y que no produce absorcin en
el espectro IR. La clave para una vibracin activa en el IR es que la vibracin
debe cambiar el momento dipolar de la molcula.

4 Qumica Orgnica Vol1. L. G. Walde, pag. 519

 Pgina |7

Figura 3.3

3.4. Medicin del espectro IR5

Los espectros de infrarrojo pueden medirse usando muestras lquidas, slidas o

gaseosas que se colocan en el haz de luz infrarroja.

Un espectrofotmetro infrarrojo mide las frecuencias de la luz infrarroja absorbida por un

compuesto. En un espectrofotmetro infrarrojo sencillo (figura 4), se usan dos haces de
luz. El haz de la muestra pasa a travs de la celda de la muestra, mientras el haz de
referencia pasa a travs de una celda de referencia que slo contiene el disolvente. Un
espejo rotatorio permite de manera alternada que la luz de cada uno de los dos haces
entre al monocromador.

Figura 4

3.5. Espectroscopia IR de hidrocarburos6

Alcanos: Los espectros de IR de un alcano no son muy informativo debido a que no hay
grupos funcionales presentes y todas las absorciones se deben a enlaces C-H y C-C. Los
enlaces C-H del alcano muestran una absorcin fuerte de 2850 a 2960cm -1 , y los enlaces
saturados C-C muestran un nmero de bandas en el intervalo de 800 a 1300cm -1. Dado
que la mayor parte de los compuestos orgnicos contienen porciones parecidas a las de
los alcanos saturados, la mayor parte de los compuestos orgnicos tienen estas

5 Qumica Orgnica Vol1. L. G. Wade, pag. 519

6 John E. McMurry. Qumica Orgnica. 7a Edicin. Pg. 408-440
 Pgina |8

absorciones IR caractersticas. Los enlaces C-H y C-C son claramente visibles en los
tres espectros.

Alcanos C H 2850 - 2960cm-1

C C 800 - 1300cm-1

Alquenos7: Los alquenos monosustituidos y disustituidos tienen absorciones de

doblamiento fuera del plano caractersticas =C-H en el intervalo de 700 a 1000cm -1,
razn por la que permite determinar el patrn de sustitucin en el enlace doble. Los
alquenos monosustituidos como el 1-hexeno muestran bandas caractersticas fuertes
en 910 y 990cm -1, y los alquenos 2,2-disustituidos (R2C=CH2) tienen una banda intensa
en 890cm-1

Alquenos C H 3020-3100cm-1

C C 1640 1680cm-1

RCH CH2 910 y 990cm -1

R2 C CH2 890cm-1

Alquinos8: Los alquinos muestran una absorcin de estiramiento C-C de 2100 a 2260cm -
1 , una absorcin es mucho ms intensa para alquinos terminales que para alquinos
internos. De hecho, los enlaces triples sustituidos simtricamente como en el 3-hexino no
muestran ninguna absorcin, por razones que no se discutirn aqu. Los alquinos
terminales como el 1-hexino tambin tienen un estiramiento caracterstico =C-H en
3300cm-1. Esta banda es diagnostica para los alquinos terminales debido a que es muy
intensa y bastante definida

7 Francis A. Carey Qumica orgnica, 6ta Edicin. Pg. 590-632, 990

8 Francis A. Carey Qumica orgnica, 6ta Edicin. Pg. 590-632, 990
 Pgina |9

3.6. Absorciones caractersticas de alcoholes y aminas.9

Alcoholes: El grupo funcional O-H de los alcoholes es fcil de localizar. Los alcoholes
tienen una banda caracterstica en el intervalo de 3400 a 3650cm -1 que por lo reglar es
amplia e intensa. Si est presente, es difcil no encontrar est banda o confundirla con
otra cosa

Alcoholes C H 3400 - 3650cm-1 (amplia, intensa)

Aminas: El grupo funcional N-H de las aminas tambin es fcil de localizar en el IR, con una
absorcin caracterstica en el intervalo de 3300 a 3500cm -1. Aunque los alcoholes absorben
en el mismo intervalo, una absorcin N-H est mucho ms definida y es menos intensa que
una banda O-H.

10Aminas N H 3300 - 3500cm-1(fuerte, intensa, media)

9 Francis A. Carey Qumica orgnica, 6ta Edicin. Pg. 590-632, 990

Wade Qumica orgnica, 5ta Edicin. Pg. 510-561

10 Organic Chemistry as a Second Language: Second Semester Topics, Volume 2, 9-22 pg. By David
R. Klein
https://books.google.com.pe/books?id=tbfB1up3jQEC&printsec=frontcover#v=onepage&q&f=false
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Figura 5

3.7. Absorciones caractersticas de los compuestos carbonlicos11

Debido a que tiene un momento dipolar grande, el enlace doble 0 = 0 produce

absorciones infrarrojas intensas de estiramiento. Los grupos carbonilo absorben a
frecuencias de 1700 cm- *, pero la frecuencia exacta depende del grupo funcional
especfico y del resto de la molcula. Por estas razones, la espectroscopia infrarroja con
frecuencia es el mejor mtodo para detectar e identificar el tipo de grupo carbonilo en un
compuesto desconocido.

Cetonas, aldehidos y cidos sencillos

Las vibraciones de estiramiento del 0 = 0 de las cetonas y los cidos carboxlicos

sencillos ocurren a frecuencias de alrededor de 1710 cm- '.L a s de los aldehidos son un
poco ms altas, de alrededor de 1725 cm- 1 .Estas frecuencias son ms altas que las de
los enlaces dobles C = C debido a que el enlace doble C = 0 es ms fuerte y ms rgido.

11 Quimica Orgnica By John McMurry,pginas 510-532

file:///H:/Nueva%20carpeta/espectro/Quimica%20Org%C3%A1nica%20-%20John%20McMurry%20-
%20Google%20Books.html
 P g i n a | 11

Las absorciones del grupo carbonilo pueden ser tan intensas que producen bandas de
armnicos pequeas a alrededor de 3400 cm-1 , duplicando su frecuencia fundamental.

Adems de la absorcin intensa de estiramiento del 0 = 0 , un aldehido muestra un

conjunto caracterstico de dos frecuencias bajas del estiramiento del CH de 2700 y
2800 cm "1. Ni una cetona ni un cido producen absorciones en estas posiciones
Un cido carboxlico produce una absorcin caracterstica y ancha del OH adems de
la absorcin intensa del estiramiento del grupo carbonilo .Debido al enlace por puente de
hidrgeno inusualmente intenso en los cidos carboxlicos.

Disminucin de las frecuencias de los grupos carbonilo debido a la resonancia

carbonilo debido a la resonancia12

La deslocalizacin de los electrones pi reduce la densidad electrnica del enlace doble

del grupo carbonilo, debilitndolo y disminuyendo la frecuencia de estiramiento de
aproximadamente 1710 cm" 1 a 1685 cm 1 para las cetonas, aldehdos y cidos
conjugados.

La absorcin del C = C de un compuesto carbonlico conjugado puede no ser

aparente en el espectro IR debido a que es mucho ms dbil que la absorcin del
C=O. La presencia del enlace doble C = C puede seguir siendo inferida a partir de su
efecto sobre la frecuencia del 0 = 0 y la presencia de las absorciones del = H
insaturado arriba de 3000 cm-1.

12 Quimica Orgnica By John McMurry,pginas 510-532

file:///H:/Nueva%20carpeta/espectro/Quimica%20Org%C3%A1nica%20-%20John%20McMurry%20-
%20Google%20Books.html
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Los grupos carbonilo de las amidas absorben a frecuencias IR particularmente bajas:

de aproximadamente 1640 a 1680 cm- 1 (figura 12-13). La estructura de resonancia
dipolar (mostrada a continuacin) coloca parte del enlace pi entre el carbono y el
nitrgeno, dejando menos de un enlace doble C = 0 completo.

La frecuencia muy baja del grupo carbonilo de la amida podra confundirse con el
estiramiento del C = C de un alqueno.

Absorciones del grupo carbonilo mayores a 1725 cm

Algunos grupos carbonilo absorben a frecuencias mayores a 1725 cm-1 . Por

ejemplo, los steres carboxlicos sencillos absorben alrededor de 1735 cm-1. Estas
absorciones de frecuencia ms alta tambin se observan en las cetonas cclicas
tensadas (en un anillo de cinco miembros o menor). En un anillo pequeo, la tensin
angular sobre el grupo carbonilo incrementa la densidad electrnica en el enlace
doble C =O, lo que resulta en un enlace ms fuerte y ms rgido.

3.8. Absorciones caractersticas de los enlaces C-N13

13
Quimica Orgnica By John McMurry, Cengage Learning Editores, 2012pginas 510-532
 P g i n a | 13

Las absorciones infrarrojas de los enlaces carbono-nitrgeno son similares a las de los
enlaces carbono-carbono, excepto que los enlaces carbono-nitrgeno son ms polares y
dan absorciones ms intensas. Los enlaces sencillos carbono-nitrgeno absorben
aproximadamente en 1200 cm"1, en una regin cercana a varias absorciones de los C
C y CO. Por tanto, el estiramiento del enlace sencillo CN rara vez es til para la
determinacin de la estructura.
Los enlaces dobles carbono-nitrgeno absorben en la misma regin que los enlaces
dobles C=C, alrededor de 1660 cm"*; sin embargo, el enlace C=N da origen a
absorciones ms intensas debido a su momento dipolar mayor. El estiramiento del C=N
con frecuencia se parece en intensidad a la absorcin de un grupo carbonilo.

El enlace carbono-nitrgeno ms fcil de reconocer es el enlace triple de un nitrilo. La

frecuencia de estiramiento del enlace C=N del nitrilo es cercana a la de un enlace triple
C=C acetilnico, alrededor de 2200 cm - 1; sin embargo, los nitrilos por lo general
absorben por arriba de 2200 cm 1 (2200 a 2300 cm"1), mientas que los alquinos
absorben debajo de 2200 cm-1. Tambin, los enlaces triples de los nitrilos son ms
polares que los enlaces triples C^=C, por lo que los nitrilos producen absorciones ms
intensas que los alquinos.

3.9. Lectura e interpretacin de los espectros IR14

Para analizar un espectro infrarrojo utilizaremos la siguiente tabla resumen para

identificar los grupos funcionales de una manera ms adecuada.

file:///H:/Nueva%20carpeta/espectro/Quimica%20Org%C3%A1nica%20-%20John%20McMurry%20-
%20Google%20Books.html
14
qumica orgnica, wade Leroy, Whitman College editorial Pearson, volumen x sptima edicin,
Mxico 201
 P g i n a | 14

TABLA 1 RESUMEN
 P g i n a | 15

Pasos para analizar un espectro Ir15:

- Primero dibujaremos una lnea en 1500 cm

- Segundo debemos enfocarnos en cualquier seal a la izquierda de esta lnea (regin de
diagnstico), pues al hacerlo esto nos ayudara a identificar las siguientes regiones:
o Doble banda (doble enlace): 1600-1850 cm
o Triple banda (triple enlace): 2100-2300 cm
o Banda X-H (enlace de hidrgeno): 2700-4000 cm

- Cada seal que aparezca en la regin de diagnstico deber tener tres caractersticas:

o Numero de onda16
Para cualquier onda, la asociacin entre la onda de absorcin y la onda de
estiramiento depende de dos factores:
Fuerza del enlace
Masa atmica

o Intensidad de onda17

15 Organic Chemistry as a Second Language: Second Semester Topics, Volume 2, 9-22 pg. By David
R. Klein
https://books.google.com.pe/books?id=tbfB1up3jQEC&printsec=frontcover#v=onepage&q&f=false

16 (misma referencia)
 P g i n a | 16

o Forma de onda18

Ejemplo IR del Tolueno19 compuesto1:

17
Organic Chemistry as a Second Language: Second Semester Topics, Volume 2, 9-22 pg. By David
R. Klein
https://books.google.com.pe/books?id=tbfB1up3jQEC&printsec=frontcover#v=onepage&q&f=false

18
Organic Chemistry as a Second Language: Second Semester Topics, Volume 2, 9-22 pg. By David
R. Klein
https://books.google.com.pe/books?id=tbfB1up3jQEC&printsec=frontcover#v=onepage&q&f=false
19qumica orgnica, wade Leroy, Whitman College editorial Pearson, volumen x sptima edicin,
Mxico 201, pginas 510-532 qumica orgnica, wade Leroy, Whitman College editorial Pearson,
volumen x sptima edicin, Mxico 201, pginas 527
 P g i n a | 17

Se aprecia una banda dbil de 3420cm, una banda intensa de 1725 cm, y una banda en
la regin inusual del estiramiento del C-H. En la regin de C-H tiene dos bandas adicionales
de 2720 y 2820 cm, la banda intensa en 1725 cm debe ser de un grupo C=O, y las
bandas en 2720 y 2820 cm sugieren un aldehdo. La banda dbil de 3420 cm podra
confundirse con un O-H de alcohol. A partir de la experiencia, sabemos que los alcoholes dan
absorciones mucho ms fuerte y ms anchas del O-H. Esta banda pequea probablemente
es un armnico de la absorcin intensa del C=O. Muchos espectros IR muestran absorciones
pequeas en la regin del O-H a partir de armnicos, del agua o de otras impurezas.

Compuesto 2:

La absorcin en 1650 cm es tan intensa que probablemente indica un grupo carbonilo. Un

grupo carbonilo a esta frecuencia baja sugiere una amida. Las bandas dobles (un par de
bandas) de la absorcin del N-H en aproximadamente 3300 cm tambin sugiere una amida
primaria, R-CONH. Dado que no hay absorcin del C-H por arriba de 3000 cm, es probable
que sea una amida saturada.
 P g i n a | 18

Compuesto 3:

Espectro de infrarrojo del cido hexanoico. Los cidos carboxlicos muestran una absorcin
ancha del O-H de 2500 a 3500 cm. Esta absorcin le da a toda la regin del estiramiento
del C-H una apariencia bastante ancha, puntualizada por absorciones ms pronunciadas del
estiramiento del C-H.

4. ESPECTROMETRA DE MASAS

4.1. Concepto

Es una tcnica para medir la masa y por tanto, la masa molecular (MM)de una molecula20
y en la mayora de los casos brinda informacin valiosa acerca de la formula molecular 21
muy diferente a la espectroscopia IR puesto que EM va a utilizar una muestra con
cantidades muy pequeas que son resultado del rompimiento de molculas que han sido
irradiadas por electrones de energa alta, mientras que en la espectroscopia IR la
molcula absorbe luz infrarroja produciendo cambios en las vibraciones de una molcula

La espectrometra de masas de alta resolucin (EMAR) puede dar una frmula molecular
exacta, incluso para una muestra impura.

Los espectros de masas pueden utilizarse de dos modos generales:

20
Quimica orgnica, sexta edicin, francis Care, editorial Mc Gramhill, mexico 2006 pagina 424.
21
qumica orgnica, wade Leroy, Whitman College editorial Pearson, volumen x sptima edicin,
Mxico 201, pagina 539
 P g i n a | 19

a. Para comprobar la identidad de dos compuestos: cuanto mayor es el nmero de

propiedades fsicas (pto. de fusin, pto. ebullicin, densidad, etc) encontradas en
ambos compuestos, mayor es la evidencia de tener compuestos idnticos.

b. Para ayudar a establecer la estructura de una sustancia nueva

La espectrometra de masas de mezclas: CG-EM22

Se combina con cromatografa de gases para el anlisis rutinario de mezclas de

compuestos, como mezclas de reaccin o muestras ambientales.

4.2. Determinacin de la frmula molecular por medio de la espectrometra de masas.23

El peso molecular de un compuesto es un dato que puede obtenerse de ordinario por

una inspeccin visual del espectro de masas. Aunque los cationes radicales producidos
por la ionizacin electrnica inicial suelen experimentar una fragmentacin considerable
para dar cationes de m/z menor, la partcula de m/z mayor corresponde por lo general a
la molcula ionizada y la m/z = M de esta partcula proporciona el peso molecular del
compuesto.

Si es espectro se mide con un espectrmetro de alta resolucin, se puede establecer

una formula molecular nica para cualquier pico de un espectro de masas, comprendido
del ion molecular.

Utilizando esta relacin, se calcula con facilidad la intensidad del pico del espectro de
masas

+1

22
Quimica organica, Morrison y Boyd quinta edicion, editorial Addison-wesley iberoamericana, mxico
1990, pgina 560,651
23
Quimica orgnica, sexta edicin, francis Care, editorial Mc Gramhill, mexico 2006 pagina
522
 P g i n a | 20

4.3. Patrones de fragmentacin en la espectrometra de masas 24

1. ALCANOS: Ruptura para dar los carbocationes ms estables.

2. ALCOHOLES: Perdida de agua

Ruptura en

24
Quimica orgnica,tercera edicin, A. Streitwieser Chheathcock, editorial Mc Gramhill,
mexico 1996 pagina 1343
 P g i n a | 21

3. ALQUENOS Y AROMATICOS: Ruptura para dar carbocationes alilicos y benclicos.

CARBOCATION ALILICO

CATION BENCILICO ION TROPILO

m/z = 91 m/z = 91

4. AMINAS: Ruptura para dar cationes estabilizados

ION IMINIO

5. ETERES: Perdida de un grupo alquilo

 P g i n a | 22

RUTURA EN

ION ESTABILIZADO

6. CETONAS Y ALDEHIDOS: Perdida de grupos alquilo para dar acilio

ION ACILIO

El re arreglo e MCLAFFERY rompe y produce ofelinas

 P g i n a | 23

4.4. Aplicaciones en los diferentes grupos funcionales

ALCANOS

El espectro de masas del n-hexano muestra varias caractersticas tpicas de los

alcanos de cadena recta. El pico base (m/z = 57) corresponde a la prdida de un
grupo etilo, originando un radical etilo y un catin butilo. El radical etilo neutro no se
detecta porque no est cargado y no se desva en el campo magntico.

Una fragmentacin semejante da un catin etilo y un radical butilo. En este caso, el

fragmento de etilo (m/z = 29) es el que se detecta

La ruptura simtrica del hexano da un catin propilo y un radical propilo

La ruptura para dar un catin pentilo (m/z =71) y un radical metilo es muy dbil porque
el radical metilo es menos estable que un radical sustituido. La ruptura para dar un
catin metilo (m/z = 15) y un radical pentilo no es visible porque el catin metilo es
menos estable que un catin sustituido. Parece que la estabilidad del catin es ms
importante que la estabilidad del radical porque aparece un pico dbil
correspondiendo a la prdida de un radical metilo pero no se observa ruptura para dar
el catin metilo.
 P g i n a | 24

Las estabilidades de cationes y radicales se pueden emplear tambin para explicar

los espectros de masas de los alcanos ramificados. La figura 11-17 muestra el
espectro de masas 2-metilpentano.La fragmentacin de un alcano ramificado sucede
generalmente en el tomo de carbono de la ramificacin para dar el catin ms
sustituido y un radical. La fragmentacin del 2-metilpentano es el tomo de carbono
ramificado puede dar un carbocation secundario de las maneras siguientes:

Ambas fragmentaciones dan cationes secundarios pero la segunda da un radical

primario en lugar de un radical metilo. Por lo tanto, la segunda fragmentacin explica
el pico base (el mayor) mientras que la primera explica el otro pico grande en m/z =
71 .Otras fragmentaciones que resultan en cationes primarios explican los picos ms
dbiles

ALQUENOS

La fragmentacin en el espectrmetro de masas se presenta dando cationes

estabilizados por resonancia siempre que sea posible. La fragmentacin ms comn
en los alquenos es la ruptura de un enlace alilico para dar un catin alilico
estabilizado por resonancia. Por ejemplo la figura 11-19 muestra como el radical
catin del 2-hexeno sufre ruptura alilica para dar el catin estabilizado por resonancia
que causa el pico base en m/z = 55 . Se encuentran en otros tipos de cationes
estabilizados por resonancia en los espectros de masas de los teres, aminas y
 P g i n a | 25

compuestos carbonilicos en captulos posteriores que describen la qumica de estos

grupos funcionales.

El radical catin del 2 hexeno sufre una ruptura de un enlace alilico para dar un catin
metalilo de m/z = 55. El otro fragmento de esta ruptura es un radical etilo que no se
detecta porque no est cargado.

ALCOHOLES

Por lo general se observan picos en el espectro de masas que corresponden a la

perdida de molculas estables pequeas. La prdida de una molcula pequea se
nota por el pico de un ion que ha perdido un fragmento con nmero de masa par.

Un radical catin puede perder agua (18), CO (28), CO2 (44) y aun eteno (28) u otros
alquenos. El ejemplo ms comn de la perdida de una molcula pequea es la
perdida de agua de los alcoholes, que sucede tan fcilmente que el ion molecular es
dbil o est ausente. Sin embargo el pico que corresponde a la perdida de agua (el
pico M-18) por lo general es grande.

El espectro de masas del 3 metil 1 butanol (figura 11-18) es tpico de los alcoholes. El
pico en m/z que parece ser el ion molecular, en realidad es el pico M-18. El ion
molecular (m/z = 88) no se observa porque pierde agua muy fcilmente. El pico base
en m/z = 55 corresponde a la perdida de agua y a un grupo metilo.
 P g i n a | 26

El pico intenso en m/z = 70 en el espectro de masas del 3 metil 1 butanol en realidad

es el pico M-18, que corresponde a la perdida de agua. El ion molecular no es visible
porque pierde agua con mucha facilidad

Adems de perder agua los alcoholes tienden a fragmentarse junto al tomo de

carbono del carbinol para dar un carbocation estabilizado por resonancia.

4.5. Lectura e interpretacin de los espectros de masas

11-8)
 P g i n a | 27

a) Bromo (C6H5Br)
b) Yodo (C2H5I)
c) Cloro (C4H7)
d) Nitrgeno (C7H17N)

11-11) En el 87: ah perdida de agua

En el 111: ruptura de alilo

En el 126: ruptura junto al alcohol

 P g i n a | 28

11-16)

Espectro de masas del n-hexano. Hay grupos de iones que corresponden a la perdida de
fragmentos con uno, dos, tres y cuatro tomos de carbono.

11-17)

El espectro de masas del 2 metil pentano. El pico base corresponde a la prdida de un radical
propilo para dar un catin isopropilo.

a) CH2=C(CH3)COOH
b) (CH3)2CHCOCH3
c) PhCH2=N
d) PhNHCH2CH3
 P g i n a | 29

APLICACIONES DE LA ESPECTOMETRIA DE MASAS 25

La espectrometra de masas es una poderosa tcnica micro analtica que permite determinar
con gran precisin la masa de las molculas.

Un espectrmetro de masa mide la relacin masa sobre carga (m/z) de molculas,

fragmentos y tomos.

El proceso implica:

- La conversin de la muestra de iones de fase gaseosa

- Separacin de los iones basados en su m/z
- Deteccin de los iones de cada m/z

Aplicacin de los espectros de masas en la biomolecular

- Permite analizar una variedad de especies moleculares (amplio rango de masa,

desde pequeos metabolismos a grandes molculas tales como las protenas).
- Permite evaluar mezclas moleculares complejas en clulas, tejidos u otros tipos de
muestra con una alta especificidad
- Localizacin simultanea de molculas
- Deteccin de modificaciones post tradicionales
- Las imgenes de IMS son nicas y se derivan de medidas moleculares directas sin
depender de reactivos especficos de un banco
- Permite mapear la distribucin espacial con la exactitud de la masa y la especificidad
qumica ( MALDI TOF TOF)

Aplicaciones de los espectros de masas en la microbiologa

Microorganismos

- Mtodos basados en espectrometra de masas para monitorear nuevos aislados

- Identificaciones de bacterias de rutina. La velocidad de adquisicin de datos de
anlisis (5 minutos por organismo) permite un alto rendimiento. Los patrones de
masas son comparados a perfiles de miles de bacterias lo que permite la
identificacin de organismos a nivel gnero, especies y algunas veces al nivel de
subespecies

Vertebrados

- Estrs relacionado con las condiciones de cultivo

25
http://es.slideshare.net/helpyouec/la-espectrometra-de-masas-y-sus-aplicaciones-a-la-
biotecnologa-acucola-agrcola-y-ambiental
 P g i n a | 30

- Calidad de peces: comprensin de los mecanismos involucrados en el desarrollo de

malformaciones esquelticas de la columna vertebral
- Efectos de la administracin de pro biticos en las dietas, con los resultados
interesantes al nivel de la inmuno estimulacin
- Estudios in vitro e in vivo sobre infecciones en peces cultivados
- Desarrollo de vacunas
- Estudios toxicolgicos para evaluar las expresiones de protenas inducidas por los
qumicos (contaminantes ambientales que afectan el crecimiento, reproduccin y
salud de los animales)
- Descubrimiento de biomarcadores potenciales para el monitoreo y evaluacin de
riesgos

Invertebrados

- Herramienta para comprender mejor los mecanismos de respuesta inmune

- Estudiarlos efectos de antibiticos sobre los patrones de expresin de protenas en la
hemolinfa
- Identificacin de organismos centinelas como los bivalvos que sor reservorios de
muchos contaminantes ( proteomica toxicolgica)

Algas

- Estudio de la biologa de las micro algas y su respuesta a seales ambientales para

comprender los mecanismos que desencadenan el desarrollo de blooms algales
peligrosos
- Comprensin del metabolismo para tener aplicaciones biotecnolgicas como es la
produccin de compuestos bioactivos y biocombustible as como su uso en
bioremediacion

Industrial o Acadmica (para procesos de rutina o de investigacin)

Campos de aplicacin:

Bioqumica-Biotecnologa: anlisis de protenas, pptidos, oligonucletidos

Qumica farmacutica: descubrimiento de drogas, qumica combinatoria,

Farmacocintica, metabolismo de drogas

Espectrometra de Masa - Aplicaciones

Farmacocintica, metabolismo de drogas

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Bioqumica clnica: test de drogas

Anlisis Ambientales: calidad de agua, contaminacin de alimentos

Geologa: composicin de hidrocarburos

Aplicacin de la espectrometra de masas biolgicas

Desde 1930, MS tcnica analtica importante para Biologa Estructural

Produccin de iones de alto peso molecular en fase gaseosa (macromolculas

Biolgicas)

Desarrollo de tcnicas de ionizacin como FAB, MALDI, ESI

Desarrollo de mtodos ultrasensibles para caracterizacin de protenas basados en

Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry (FTIR-MS), lmite de

Deteccin de 30 zmol (30x10-21mol) para protenas de masa molecular 8 20 kDa.

Utilizacin de MS:

Determinacin precisa de masa molecular de protenas y ac. Nucleicos, amplio rango de

masas

Secuenciacin de pptidos y oligonucletidos

Identificacin de modificaciones post-traduccionales

Cambios estructurales en protenas, plegamiento y dinmica

Identificacin de protenas (cantidades subpicomolares) de 2D-electroforesis

Identificacin de marcado isotpico

Aplicaciones cualitativas

Determinacin del peso molecular de todas las sustancias que pueden volatilizarse por la
posicin del pico correspondiente a la masa patrn.

Determinacin de la formula molecular.

Si el instrumento es de gran resolucin bastar la determinacin precisa de su masa

molecular para poder atribuirle una frmula emprica. Otras veces puede determinarse por la
relacin entre las alturas del pico correspondiente a la masa patrn y la de los picos de los
istopos. Existe una tercera forma que sera con la regla del nitrgeno, segn la cual todas
las sustancias orgnicas con peso molecular par deben de contener un nmero par o ningn
 P g i n a | 32

tomo de N y los de nmero impar deben de contener un nmero impar. Por el contrario los
fragmentos moleculares por rotura de enlace, tienen una masa impar si contienen cero o
nmero par de tomos de N y masa par si el nmero de tomos de N es impar.

Identificacin de compuestos por su fragmentacin patrn

La fragmentacin de la mayor parte de las molculas produce un gran nmero de picos que
permiten la identificacin de numerosos compuestos y el reconocimiento de ciertos grupos
funcionales de ellos. Se han descrito una serie de reglas generales que rigen los procesos de
fragmentacin, los cuales son de gran utilidad para la determinacin de los espectros.

Identificacin de productos de reaccin o de productos metablicos

Se usa en cintica qumica y en farmacologa pudindose llegar a identificar impurezas y

metabolitos a concentraciones de pocas partes por milln. Muchos estudios de
farmacocintica se realizan haciendo uso de la espectrometra de masas dada la naturaleza
compleja de las matrices (con frecuencia sangre u orina) y la alta sensibilidad requerida para
determinar concentraciones extremadamente bajas de analitos. Se utiliza comnmente un
sistema de cromatografa lquida- espectrometra de masas (LC-MS) con sistema de
cuadrupolos triple. Un tndem de masas se pude adicionarse para elevar la especificidad. El
uso de patrones y estndares internos permite determinar cuantitativamente el frmaco
deseado. Puede seguirse entonces la metabolizacin del frmaco a partir de su suministro al
paciente.

Caracterizacin y anlisis de polmeros

El polmero se piroliza en condiciones controladas y los productos voltiles se hacen pasar a

un espectrmetro para su anlisis.

Anlisis de sangre

Gracias a la rapidez del mtodo, se puede emplear incluso como control durante un proceso
quirrgico. As se puede determinar a gran velocidad las concentraciones hemticas de
monxido y dixido de carbono, oxgeno, nitrgeno, gases anestsicos (como el NO).

Anlisis protemico

Con el desarrollo de las tcnicas de ionizacin ESI y MALDI, la espectrometra de masas se

ha impuesto desde los aos noventa como un mtodo esencial en la caracterizacin de
protenas, especialmente en la secuenciacin o determinacin de estructuras primarias.

Esta tcnica ha sustituido en buena medida a las tcnicas de secuenciacin de protenas por
va qumica. Las tcnicas tradicionales tienen una baja eficiencia y no son adecuadas para la
secuenciacin rpida del creciente nmero de protenas obtenidas en los diferentes proyectos
de genmica. El procedimiento estndar parte de la hidrlisis enzimtica (tripsina, pepsina) de
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la protena a secuenciar y una separacin cromatografa inicial para llegar a mezcla de un

pequeo nmero de pptidos. Los espectrmetros de masa en tndem permiten la
separacin final y la caracterizacin de los pptidos, en ellos la mezcla inicial de pptidos
puede ionizarse con la tcnica ESI. El primer EM separa los iones moleculares de los
diferentes pptidos, estos iones se activan vibracionalmente por colisiones y fragmentan.

El espectro de masas que se obtiene de cada pptido en el segundo EM permite su

identificacin. Debido a la simplicidad de la fragmentacin es posible utilizar las masas de los
fragmentos para la bsqueda en una base de datos de masas para secuencias peptdicas.
Finalmente la superposicin de los diferentes pptidos, con su abundante informacin
redundante que resulta de los diferentes caminos de la protelisis, permite obtener la
secuencia de aminocidos o estructura primaria de la protena.

Estudiar la abundancia de istopos26

Esta fue la finalidad con la que fue creada la tcnica y en la actualidad se usa para anlisis
por dilucin de istopos, estudios con trazadores isotrpicos, estudiar la edad de las muestra
por su proporcin de istopos con la ventaja frente a los radiactivos que se pueden medir los
istopos no radiactivos. La espectrometra de masas permite determinar la composicin
isotpica de los elementos en una muestra, la que tiene numerosas aplicaciones prcticas.
Las diferencias en masa entre los istopos de un elemento son muy pequeas y los istopos
menos abundantes son comnmente muy raros por lo que se requieren instrumentos
especialmente sensibles. Estos instrumentos son denominados espectrmetros de masas
para la composicin isotpica (isotope ratio mass spectrometer IR-MS por sus siglas en
ingls). Para especies con masas pequeas se manifiestan diferencias en las propiedades
fsicas, qumicas y biolgicas entre las diferentes composiciones isotpicas como la velocidad
de vaporizacin entre HB2BO y HOD, fijacin de CP16POB2B y CP16POP18PO como
carbonato de calcio en un foraminfero, etc. La fijacin selectiva de COB2B con diferente
composicin isotpica por parte de organismos vivos depende de la temperatura ambiente. El
estudio por EM de materiales fsiles permite el estudio de las condiciones climticas en
tiempos remotos (Paleoclimatologa).

Un equipo muy especializado se dedica a la determinacin del contenido de deuterio en

muestras de agua y otros compuestos. La razn isotpica D/H promedio en el agua de los
ocanos es de 156 ppm pero oscila varias decenas de ppm en las aguas fluviales de acuerdo
a su procedencia. Las razones isotpicas en una muestra son una fuente de informacin
valiosa para determinar adulteracin o falsificacin de vinos u otros productos de alta calidad,
establecer la procedencia geogrfica de una droga (cocana, marihuana) y en la deteccin de
alteraciones metablicas.

26
http://ocw.usal.es/eduCommons/ciencias-biosanitarias/quimica-organica-
ii/contenido/QO_II_Tema01_ocw.pdf
 P g i n a | 34

La tcnica IR-MS se aplica tambin a la determinacin de la edad de materiales mediante el

llamado fechaje del carbono. La determinacin de los tiempos de permanencia a la intemperie
o de tiempo de enterramiento de diferentes materiales se basa sobre el hecho de que un
objeto enterrado unos pocos metros bajo el suelo, sedimentos, rocas o hielo est protegido de
los rayos csmicos y al ser desplazado a la superficie se expone a dicha radiacin. Al ser
expuesto se generan los llamados ncleos cosmognicos como P10PBe, P14PC, P26PAl y
P36PCl. Estos nclidos son radiactivos con tiempos de vida medios desde miles hasta
millones de aos. Las mediciones en espectrmetros de masa especializados, con elevada
exactitud, permite encontrar las razones entre los istopos estables y los radiactivos. La
determinacin del tiempo de exposicin de un material se realiza partiendo de las razones
entre los istopos estables y los radioistopos. De aqu se deduce la cantidad absoluta de
radio-istopos presentes, la que es proporcional al tiempo de permanencia en la superficie. Si
la velocidad de produccin de un radio-istopo es conocida puede determinase entonces el
tiempo de exposicin del material. La determinacin de los tiempos de enterramiento utiliza
tambin a los nclidos cosmognicos. Si el objeto permaneci un tiempo determinado en la
superficie puede estimarse la cantidad inicial de radioistopos presentes en el material al
momento del enterramiento. Posteriormente se produce una disminucin de la concentracin
de los radioistopos, que slo depende de los tiempos de vida medios conocidos. Si se
dispone de dos concentraciones en tiempos diferentes puede entonces estimarse el tiempo
de enterramiento.

Aplicaciones cuantitativas27

Para la determinacin cuantitativa de los componentes de una mezcla es conveniente que

cada uno de ellos presente por lo menos un pico que difiera claramente de los dems. La
calibracin se realiza por comparacin de los picos con patrones adecuados. Las alturas de
los picos son directamente proporcionales a las presiones parciales de los componentes
volatilizados en la muestra.

Las aplicaciones cuantitativas de la espectrometra de masas para anlisis cuantitativo

son de dos tipos:

Determinacin cuantitativa de especies moleculares o tipos de especies moleculares

en muestras orgnicas, biolgicas y ocasionalmente inorgnicas

Normalmente tales anlisis se llevan a cabo haciendo pasar la muestra a travs de una
columna cromatogrfica o de electroforesis capilar y posteriormente por el espectrmetro.

27http://datateca.unad.edu.co/contenidos/401539/exe-

2%20de%20agosto/leccin_33_aplicaciones_de_la_espectrometra_de_masas.html
 P g i n a | 35

Determinacin de la concentracin de elementos en muestras inorgnicas y, en menor

medida, de muestras orgnicas y biolgicas:

Las concentraciones de analito en este caso se obtienen directamente a partir de las alturas
de los picos de los espectros de masas. Se crean curvas de calibrado que nos permiten el
anlisis cuantitativo gracias a la existencia de picos nicos para cada componente y cada
valor de m/z.
 P g i n a | 36

BIBLIOGRAFA

John E. McMurry. Qumica Orgnica. 7a Edicin. Pg. 408-440

Francis A. Carey Qumica orgnica, 6ta Edicin. Pg. 590-632, 990
Wade Qumica orgnica, 5ta Edicin. Pg. 510-561

Quimica orgnica, sexta edicin, francis Care, editorial Mc Gramhill, mexico 2006 pagina
424.
qumica orgnica, wade Leroy, Whitman College editorial Pearson, volumen x sptima
edicin, Mxico 201, pginas 510-532
Quimica organica, Morrison y Boyd quinta edicion, editorial Addison-wesley iberoamericana,
mxico 1990, pgina 560,651
Organic Chemistry as a Second Language: Second Semester Topics, Volume 2, 9-22 pg. By David R. Klein
Quimica Orgnica By John McMurry, Cengage Learning Editores, 2012 pginas 510-532

LINKS:

http://espectroscopico.weebly.com/uploads/1/7/6/6/17662713/ms_instrumentacion_1ra_clase.
pdf
http://es.slideshare.net/helpyouec/la-espectrometra-de-masas-y-sus-aplicaciones-a-la-
biotecnologa-acucola-agrcola-y-ambiental
http://datateca.unad.edu.co/contenidos/401539/exe-
2%20de%20agosto/leccin_33_aplicaciones_de_la_espectrometra_de_masas.html
http://ocw.usal.es/eduCommons/ciencias-biosanitarias/quimica-organica-
ii/contenido/QO_II_Tema01_ocw.pdf
https://books.google.com.pe/books?id=tbfB1up3jQEC&printsec=frontcover#v=onepage&q&f=f
alse
file:///H:/Nueva%20carpeta/espectro/Quimica%20Org%C3%A1nica%20-
%20John%20McMurry%20-%20Google%20Books.html