De ADN a

protenas
Reglas de Chargaff (1950)
En general establecen que el ADN de cualquier
clula debe tener una proporcin 1:1 de bases
pricas y pirimdicas
A+G = C + T
Regla de paridad 1 (complementarias)
%A = %T y %G = %C
Regla de paridad 2
%A ~ %T y %G ~ %C es vlido para ambas
cadenas
Segunda regla La composicin del ADN vara
entre las especies
 Descubrimiento del ADN (1953)
J Watson y F. Crick publican su
artculo que sugiere la
estructura del ADN
Dos cadenas
polinucleotidicas
enroscadas en una hlice
derecha
Se basaron en:
ADN compuesto de bases,
azcares y grupos fosfato
Chargaff: A=T y C=G
Rosalind Franklin con
rayos X calcul una
estructura helical
 6 7
1 5 N
N
8
Purinas
2
4
N N
9
3
O NH2

C N C N
H N C N C
C H C H
C C C C
H2N N N H N N
H H

Guanina Adenina
3 N 4 5

Pirimidinas
2 6
N
1

Citosina Timina Uracilo

NH2 O O

C C C
H H CH3 H H
N C N C N C

C C C C C C
O O O
N H N H N H
H H H
Pentosas
5 CH OH OH
2
O

4 C C 1

5 CH OH OH
H 2
O
3 C C 2
4 C C 1
OH H

2-desoxiribosa H
3 C C 2

OH OH

ribosa
Las cadenas del ADN son
antiparalelas
Dogma central
El proceso de transferencia de informacin
secuencial es irreversible
3 normales
Replicacin, transcripcin, traduccin
3 especiales
Replicacin RNA, transcripcin inversa, traduccin ADN-
Proteina
3 no conocidas
Todas inician en protena
Replicacin
Replicacin
Replicacin
Modelos 3D del ADN

Modelos en JMOL del ADN

http://www.umass.edu/molvis/tutorials/d
na/dnapairs.htm
Enzimas de replicacin
Reparacin
De ADN a ARN: Transcripcin
Transcripcin
Objetivo
Crear una cadena de ARN complementaria a una secuencia
de ADN
1er paso en la expresin de genes
Unidad de transcripcin = al menos 1 gen
Diferencias con replicacin
No necesita primasa
ARN polimerasa
U en lugar de T
Fragmentos de
Okazaki
 Transcripcin
Se resume a 5 pasos
ARN polimerasa mueve la burbuja
de transcripcin
ARN polimerasa agrega nucletidos
complementarios al ADN
Cadena ribosa-fosfato se forma con
ayuda de ARNp
Puentes de hidrgeno ARN-ADN se
rompen
Se procesa el ARN (tapa y cola)
para salir al citoplasma
Es un proceso continuo en cada
cadena de ARN
 Entonces...
El proceso de transcripcin es:
Pre-iniciacin >> ARN polimerasa + factores de transcripcin +
promotores (-30,-75 y -90 pb) pero slo a nivel basal
(activadores, represores, coactivadores y corepresores)
Iniciacin >> Factores de transcripcin adheridos al promotor
median la adhesin de la ARNp formando un complejo
Paso del promotor >> iniciacin abortiva hasta que el factor
se alinia y se sobrepasan los 23 nucletidos
Elongacin >> se van uniendo nucletidos incluyendo sistema
de verificacin
Terminacin >> generalmente cola de a que corta el proceso
de elongacin
 Fbricas de transcripcin
Son unidades activas de
transcipcin de genes en un sitio
discreto dentro del ncleo
10,000 fbricas en clulas HeLa
8mil ARNp II y 2mil ARNp III
Cada ARNp II tiene 8 enzimas

Se estima que por ejemplo genes

de clulas eritroides comparten la
misma fbrica de transcripcin
Retrotranscripcin
Algunos virus pueden transcribir ARN a ADN
Utilizan retrotranscriptasa para generar ADNc al ARN viral y se
genera la doble cadena.
Ribonucleasa H elimina el ARN
El ADNc se inserta en el genoma hospedero (integrasa)
Se ensamblan los nuevos virus

En el caso del VIH la clula

no sobrevive

La telomerasa funciona de la
misma manera
Tipos de ARN generados
Codificante
ARN mensajero (ARNm) >> protenas

No codificante
ARN nuclear pequeo (ARNsno)
ARN Ribosomal
ARN transferencia
ARN de regulacin
ARN de reconocimiento
Riboenzimas
Procesamiento de ARN
La transcripcin de un Gen de ADN
Produce un ARN transcrito primario
Necesita madurar para poder usarse

Procesamiento = Maduracin
Modificacin de bases
Metilacin principalmente
Tapa y cola (capping)
Corte y empalme
Modificacin de
bases
Tapa (5 cap)
Objetivo >> producir ARN
maduro para traduccin
Sirve para asegurar la
estabilidad del ARN

Nucletido alterado en la
punta 5
Proceso nuclear
ARN mitcondrial y
cloroplasto no tienen tapa
Tapa (5 cap)
Elementos
Guanina va 5 a 5
triofosfato
Metilacin en la posicin 7
por metil-transferasa
Metilacin del OH del 2C
de las primeras 2 ribosas

La modificacin asemeja la
punta 3 (C5 unido y C3 sin
unir)
Resistencia a
exonucleasas
 Tapa (5 cap)
Proceso
Primer PO4 es removido (ARN fosfatasa terminal)
Se agrega GTP (guanilil trasnferasa) perdiendo 2
PO4
Metilacin del N 7 (metil transferasa)
Si la 2 base es
adenina se metila y la
3 base se metila 10-
15% de veces
Tapa (5 cap)
Funciones
Regulacin de la exportacin nuclear
Complejo de adhesin de la tapa (CBC) complejo de
poros nuclear
Prevencin de degradacin por exonucleasas
Similitud con la punta 3 y complejo CBC bloquea enzimas
que quitan la tapa
Promocin de la traduccin
Remocin de la tapa detiene la traduccin por lo que su
permanencia incrementa la vida del ARNm
Promocin del corte del intrn
Horquilla con el spliceosoma para promover el corte del
intrn
 Cola (poli-A)
Objetivo >> generacin de ARN maduro
Inicia en el momento en que termina la transcripcin
En algunas ocasiones el complejo de poliadenilacin
inicia en sitios distintos de un mismo transcrito primario
Cola (poli-A)
Funciones:
Proteccin contra degradacin enzimtica en el
citoplasma
Ayuda en la terminacin de la transcripcin
Permite la exportacin del ARNm del ncleo
Promueve la traduccin
Casi todos los ARNm tienen cola poli-A excepto
ARNm de histonas que tienen un complejo en bucle
seguido por una secuencia rica en purinas
micro-ARN tiene cola en formas intermedias pero en
maduro se elimina por procesamiento
 Cola (poli-A) Proceso
Elementos
Corte (10-50b de CPSF)
CPSF factor de
especificidad de CPSF + sitio reconocimiento
corte/poliadenilacin CstF pega a sitio rico en GU
y viene asociado a
CstF factor de estimulacin ARNpolimerasa
del corte
CFI pega en UGUAA
PAP polimerasa inclusive anexa CPSF si
poliadenilato AAUAAA no esta

PABP protena de unin de Cola

poliadenilato PAP agrega As
CF1 y 2 Factor de corte 1 y PABP se une a la cola y
2 cataliza PAP
A 250b se suelta de CPSF
Sitio de reconocimiento terminado el proceso
AAUAAA aunque hay otros
con menor especificidad El complejo est asociado con
el complejo de corte
Cola (poli-A)
Corte
Objetivo >> eliminacin
de intrones y ligado de
exones
Es parte del sistema de
poliadenilacin
Elementos
5 ARN nuclear pequeos
(snRNA) U1, U2, U4, U5 y
U6
Secuencia GU en 5 y AG
en el 3 + tracto
polipirimidina con A
conservada
Corte
Proceso
U1 se une a la punta 5
U2AF se pega a 3 y recluta a U2
Se integra complejo U4/U5/U6
Se forma la horquilla U1 a complejo
U2/U4/U5/U6/U2AF
Cambio de U1 por U6 y liberacin de U1 y U4
Formacin de la horquilla secundaria de
corte
Corte

Empalme alternativo la mayor fuente de

diversidad gentica en eucariotas
Dscam drosophila 38,000 diferentes ARN
Empalme
Empalme alternativo
El ARN tiene que salir

Nucleo rodeado de mltiples poros rodeados

de protenas
mARN con tapa y cola es permitido salir
RNA que tiene spliceosoma no puede salir

Requiere de la hidrlisis de GTP e importinas

(o exportinas)
De ARN a Proteina - traduccin
El ensamblado de un nuevo polipptido a partir de
sus aminocidos es dirigido por el cdigo gentico

Establece la correspondencia entre la secuencia

de tres nucleotidos (codn) y la secuencia de los
20aa de las protenas

Elementos:
ARN transferencia (cargado)
ARN mensajero
Ribosoma
Correspondencia ARN-poliptido
ARNm: codn
ARNt: anticodon

Marco de lectura
Dependiendo de en qu letra se inicie la lectura es
la secuencia que resulta
Cmo saber dnde iniciar?

Codones especiales
Inicio >> AUG metionina
Terminacin
UAG
UAA
UGA
Marcos de lectura
 ARNt
Molecula adaptador de ARN con 73-
94 nucletidos
liga la cadena de acidos
nucleicos con la secuencia de aa
Se identifica la secuencia de ARNm
mediante el anticodn
Unin por puentes de H
El aa se carga mediante aminoacyl
en la punta aceptora
Se espera que haya 62 tipos distintos
de ARNt Cola CCA en amarillo,
Terminacin aceptora en
Hay menos debido al morado, Horquilla variable en
emparejamiento flexible naranja, Brazo D en rojo, Brazo
anticodon en azul con el
Inosina y pseudouridina permiten Anticodon en negro, Brazo T en
puentes de H a ms de un tipo verde
de base 3era posicin
Carga de
ARNt
 ARN Ribosomal
Es el component principal del
ribosoma +/- 60% por peso, 2 tipos
principales
Procariotas subunidad 30s
(chica) tiene al 16s; subunidad 50s
(mayor) tiene al 5s y 23s
Eucariotas subunidad 40s (chica) Subunidad pequea en azul con
tiene al 18s; 60S (mayor) tiene al el RNA en azul obscuro;
5s, 5.5s y 28s subunidad mayor en rojo con
RNA en rojo fuerte
40% es protena, al menos 50
distintas
La estructura terciaria consta de 4
dominios: Dominio 5
5, central, 3menor, 3 mayor
Iniciacin (procariotas)
Iniciacin (procariotas)
Iniciacin (eucariotas)
Elongacin
Terminacin
Traduccin - animacin

Leccin sobre traduccin y sntesis de protenas

(ingles y necesita contrasea)

http://media.pearsoncmg.com/bc/bc_martini_ap_
slim/assets/animations/ch14_translation.html
Transporte y procesamiento
Chaperonas tipo GroEL/ES
Tambin conocidas
como chaperoninas

Grupo I >> GroEL/ES

procariotes, cloroplasto y
mitocondria
Grupo II >> TriC citosol
eucariote
Transporte y procesamiento
Chaperonas tipo Hsp70
Alta afinidad a protenas sin
doblar cuando asociada a
ADP
Asociadas con la apoptosis
Incrementan en golpe de
calor e intoxicacin por
metales pesados
Participan en transporte
transmembranal de protenas
al estabilizarlas en formas
parcialmente dobladas
Alta expresin en melanoma
y baja en cncer renal
Seal de salida
Importacin proteica
Mitocondria/cloroplastos
Cadena lder regin n-terminal
20 aa +
-hlice con lado + y lado
hidrofbico
TOM >> translocasa, outer
mitocondrial
TIM >> translocasa, inner
mitocondrial

Nature Reviews Molecular Cell Biology 5, 519-

530 (July 2004)