Bacteria anaerobia: Historia y papel en flora normal humana

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Revisin de la literatura a travs de: Nov 2012 | Este tema se actualiz por ltima vez: abr 5, 2012.
INTRODUCCIN - Las bacterias anaerbicas son las formas predominantes de vida en el cuerpo humano. Si bien el papel
de estos microbios como patgenos estaba bien establecido a principios del siglo XX, a menudo se descuidan en parte debido
al hecho de que pocos laboratorios clnicos alguna vez los detectaron. Las caractersticas importantes que pueden limitar la
deteccin de algunos de estos organismos son:
La falta de mtodos de diagnstico ampliamente disponibles distintos de la coloracin y cultivo de Gram
Requisitos de crecimiento fastidioso que a menudo limitan la recuperacin
La ubicuidad en las superficies mucocutneas que dificulta la obtencin de culturas significativas
La presencia de flora mixta que incluye otros patgenos conocidos
Durante las ltimas dcadas, se ha renovado el inters en las infecciones anaerobias, basadas en la verificacin de su papel
como patgenos por la recuperacin de los sitios infectados, la eficacia del tratamiento con antibiticos y la dilucidacin de
los factores de virulencia. Ahora parece que estamos en una era en la que la terapia se dirige con frecuencia a anaerobios
basados en una suposicin de que los organismos estn all y que los antibiticos especficos son eficaces.
La historia de la apreciacin de los anaerobios como patgenos y la composicin de la flora normal en seres humanos ser
revisada aqu. La fisiopatologa, las claves clnicas, la recuperacin y el rango de infecciones causadas por estos organismos
se discuten por separado. (Ver "Fisiopatologa, pistas clnicas y recuperacin de organismos en infecciones anaerobias" y
"Infecciones bacterianas anaerobias").
DEFINICIN DE ANAEROBES - Las bacterias anaerbicas se definen como bacterias que crecen en ausencia de oxgeno y
no muestran crecimiento superficial en 10 por ciento de dixido de carbono en el aire. Pueden clasificarse adems por
aerotolerancia relativa: los anaerobios estrictos no pueden tolerar 0,5 por ciento de oxgeno; Los anaerobios ms importantes
desde el punto de vista clnico (Bacteroides fragilis, Prevotella melaninogenica y Bacteroides melaninogenicus) y
Fusobacterium nucleatum son anaerobios moderados que toleran entre un 2 y un 8 por ciento de oxgeno. La mayora de
estos organismos pueden sobrevivir en el aire durante perodos sostenidos, pero no pueden replicarse en el oxgeno
atmosfrico.

PERSPECTIVA HISTRICA - Louis Pasteur se acredita con el descubrimiento de anaerobios con el cultivo exitoso de
Clostridium butyricum en ausencia de oxgeno atmosfrico en 1862 [1]. Veillon y Zuber de la Facultad de Medicina de Pars
publicaron una serie de importantes contribuciones en la dcada de 1890 sobre el papel de las bacterias anaerobias como
causa de secrecin ptrida de infecciones en mltiples sitios anatmicos, incluyendo infecciones plvicas, abscesos
cerebrales, gangrena pulmonar y apendicitis [2].
Informes tempranos - Los sndromes clostridiales clsicos mediados por toxinas, botulismo y ttanos, tambin fueron bien
reconocidos a finales del siglo XIX. De hecho, Clostridium tetani se recuper en cultivo puro en 1890, y los estudios de
inmunizacin del ttanos haban comenzado [1].
A principios del siglo XX, numerosos artculos de la literatura francesa y alemana revisaron el papel de las bacterias
anaerobias en diversos tipos de infecciones. Muchos fueron descritos como "infecciones fusospirochetales", caracterizadas
por la aparicin de varillas gram-negativas fusiformes (presumiblemente F. nucleatum) y espiroquetas anaerbicas. En
retrospectiva, parece que estas infecciones fueron probablemente anlogas a las encontradas en la prctica actual, pero los
organismos identificados generaron considerable inters debido a su carcter morfolgico nico.
Estudios de patognesis - Entre las principales contribuciones fue la observacin por Schottmueller que los estreptococos
anaerbicos, en lugar de estreptococos beta-hemolticos del grupo A, eran en realidad los patgenos predominantes en la
sepsis puerperal [3]. Postul que la infeccin fue adquirida endgenamente de la flora genital normal. Esta era una tesis
novedosa en ese momento porque casi todas las enfermedades infecciosas se pensaban que eran exgenas y contagiosas.
Contribuciones de los investigadores estadounidenses a principios de 1900 incluyeron los estudios de sello de la bacteriologa
y fisiopatologa del absceso pulmonar por David Smith a finales de 1920 [4, 5]. Este investigador observ que los organismos
en las paredes del absceso obtenidos en la autopsia se parecan a los observados en la grieta gingival, lo que lleva al
postulado de que la aspiracin de las bacterias gingivales de la grieta era el mecanismo de la infeccin. Esta hiptesis fue
apoyada posteriormente por la inoculacin intratraqueal de pus de piorrea en animales de experimentacin para demostrar la
progresin secuencial de la neumonitis ("neumona por aspiracin") al absceso pulmonar. (Ver "Absceso de pulmn".)
En una sorprendente serie de experimentos, se aislaron 17 organismos diferentes del inculo y luego se usaron solos y en
combinacin con desafos intratraqueales a varios animales. Eventualmente, demostr que se requeran cuatro especies
microbianas para reproducir el absceso pulmonar: estreptococos anaerbicos, un espiroqueta anaerbico, un vibrio
anaerbico y un bacilo anaerbico fusiforme. Este fue uno de los primeros estudios de la sinergia microbiana, la demostracin
de que dos o ms organismos podran producir una lesin patolgica que no poda ser reproducida con un inculo ms simple.
Dos cirujanos americanos, Meleney y Altemeier, hicieron contribuciones importantes adicionales. Meleney seal el papel de
las bacterias anaerbicas en las infecciones de los tejidos blandos y describi la condicin conocida posteriormente como
"gangrena sinrgica Meleney", una lcera erosiva rara pero caracterstica en el sitio de las suturas de retencin. Esta lesin
alberga Staphylococcus aureus y un estreptococo anaerbico y se puede reproducir en animales slo con un inculo de
ambos.
Altemeier examin la bacteriologa de la apendicitis a finales de la dcada de 1930 y fue capaz de aislar las bacterias
anaerobias de 96 de 100 pacientes [6]. Tambin seal que la secrecin ptrida se encontr exclusivamente en la presencia
de infecciones que implican bacterias anaerbicas y que estos tambin fueron los nicos organismos para producir el olor
caracterstico tanto in vivo como in vitro [7].
Dos dcadas de desinters - El inters por las infecciones anaerobias desapareci en gran medida en el perodo de 1940 a
1960. Hubo relativamente pocos informes clnicos y los laboratorios clnicos no intentaron recuperar anaerobios. Los
organismos parecan estar fuera de la vista y fuera de la mente.
Atencin renovada - El inters renovado por las infecciones anaerbicas a mediados y finales de los sesenta sigui tres
desarrollos simultneos.
El frasco GasPak, que hizo relativamente fcil el aislamiento de anaerobios para la mayora de los laboratorios de
microbiologa, se puso a disposicin.
La clasificacin taxonmica de las bacterias anaerbicas fue finalmente puesta en orden, principalmente por los tediosos
estudios de los trabajadores del Instituto Politcnico de Virginia.
Se realizaron estudios de la actividad de antibiticos contra anaerobios in vitro y en ensayos clnicos por Sydney Finegold
y otros; Este trabajo inicialmente puso de relieve el papel potencial de la lincomicina, y los informes posteriores se ocupan de
la clindamicina, metronidazol, cefoxitina, y una serie de otros antibiticos [8].
Los estudios de 1970 a 1980 mostraron que las bacterias anaerobias representaban un nmero relativamente grande de
infecciones, aunque la frecuencia fue profundamente influenciada por el sitio anatmico y el mecanismo de adquisicin de la
enfermedad (exgena versus endgena). La deteccin de anaerobios en el laboratorio tambin fue altamente variable
dependiendo de los mtodos usados para recolectar, transportar y procesar especmenes. Una revisin de la experiencia en
la Clnica Mayo en la dcada de 1970 encontr que B. fragilis fue el segundo despus de Escherichia coli como una causa
de gram negativos bacteremia bacilar [9]. Hubo varios estudios adicionales de los aos setenta (resumidos a continuacin)
que mostraron altos rendimientos de anaerobios cuando se estudiaron adecuadamente. Estos resultados han sido traducidos
a la prctica mediante el uso generalizado de frmacos dirigidos especficamente a bacterias anaerobias; Dos de los ms
frecuentes son: clindamicina y metronidazol.
La extensa publicidad concedida a las bacterias anaerobias y las infecciones anaerobias en los aos setenta result en la
aceptacin general de estos organismos como patgenos principales en tipos seleccionados de infecciones. Este
reconocimiento fue acompaado de grandes ensayos clnicos multicntricos, estudios de sensibilidad a los antibiticos [10 -
12], y el uso generalizado de antimicrobianos con cobertura contra anaerobios.
La incidencia de infecciones anaerobias se redujo por una de las campaas educativas ms exitosas en la historia de la
medicina moderna. El resultado fue una virtual desaparicin de la bacteriemia bacteriana anaerobia en la medida en que
algunas autoridades propusieron una interrupcin de la rutina anaerbica hemocultivos [13 - 15]. Sin embargo, se ha
producido un aumento subsiguiente en las infecciones anaerobias y en los anaerobios con resistencia a los antibiticos de
uso comn.

Estado actual - El "anaerobic bandwagon" de la dcada de 1970 pareca ser muy eficaz para lograr el reconocimiento de las
bacterias anaerobias y su papel en determinadas infecciones. Esto dio lugar a una mayor disponibilidad de microbiologa
anaerbica y el uso apropiado de antibiticos.
Sin embargo, existe la preocupacin de que algunas infecciones anaerobias no se detectan debido en parte a una disminucin
en la calidad de los laboratorios de microbiologa, que refleja las realidades econmicas, la subcontratacin y la dependencia
de los antibiticos empricos. Adems, la incidencia de infecciones anaerobias parece estar aumentando, lo que es
probablemente el resultado de un aumento en el nmero de pacientes con enfermedades subyacentes complejas [16]. A
modo de ejemplo, un informe de la Clnica Mayo encontr una disminucin en la incidencia de bacteriemia anaerbica de
1974 a 1988, seguida por un aumento a un promedio de 53 casos por ao de 1993 a 1996 ya 94 casos por ao de 2001 a
2004 [diecisis]. Esta cuestin es cada vez ms relevante en el contexto del reconocimiento y la seleccin de antibiticos
debido a la resistencia creciente de anaerobios a los antibiticos, incluyendo moxifloxacin, cefoxitin, carbapenems, y
clindamycin. (Ver "Infecciones bacterianas anaerbicas", seccin sobre 'Resistencia a los antibiticos'.)
FLORA NORMAL - La mayora de las superficies mucocutneas de los seres humanos albergan una rica flora indgena
compuesta por bacterias aerbicas y anaerobias, cuyas especies microbianas y concentraciones varan en diferentes sitios
anatmicos (tabla 1). Las bacterias anaerobias son las formas dominantes, a menudo representan 99 a 99,9 por ciento de la
flora cultivable [14, 17]. El nmero total de especies bacterianas en un solo individuo es probablemente superior a 500.
Sin embargo, la mayor parte de la flora normal no puede ser cultivada o caracterizada por los mtodos de laboratorio actuales.
Esto se ilustra en un anlisis de 13.555 prokaryotic ribosomal ARN secuencias de genes del colon en el que la mayora de
las bacterias se consideraron inculto y nuevos microorganismos [18].
Vas areas superiores - Las vas respiratorias superiores, incluyendo la cavidad oral, los conductos nasales, la orofaringe y
la nasofaringe, albergan una flora compleja que difiere en varios sitios a pesar de la continuidad anatmica; Estos son
conocidos como nichos ecolgicos [17]. Las concentraciones de bacterias en la saliva son aproximadamente 10 (8) / mL con
90 por ciento de bacterias anaerbicas; El organismo predominante es Veillonella parvula. La placa dental incluye una
complicada matriz de bacterias, incluyendo Streptococcus mutans, el principal organismo implicado en la caries dental, pero
las bacterias anaerobias tambin han sido implicados. (Ver "Epidemiologa, patognesis y manifestaciones clnicas de las
infecciones odontognicas").

El ambiente en la grieta gingival es similar al del colon en que el potencial de oxidacin-reduccin es de -300 mV, las
concentraciones de bacterias alcanzan los 10 (12) / mL (los lmites geomtricos con los que las bacterias pueden ocupar
espacio) y las bacterias anaerobias Representan el 99 por ciento de la flora cultivable. En personas sanas, los senos
paranasales, las trompas de Eustaquio y los conductos respiratorios por debajo del nivel de la laringe son generalmente
estriles.
Los patgenos potenciales anaerbicos ms importantes que se encuentran en las vas respiratorias superiores son
Fusobacterium nucleatum, Prevotella melaninogenica, Prevotella oralis, Bacteroides ureolyticus y Peptostreptococcus spp,
que representan los organismos predominantes en infecciones anaerobias orales y pleuropulmonares [19-21].
Trato gastrointestinal - El tracto gastrointestinal (GI) muestra marcadas variaciones en patrones bacteriolgicos en
concentraciones en diferentes niveles [22 - 25].
Estmago - El estmago est protegido por la barrera del cido gstrico y, en consecuencia, alberga un nmero relativamente
pequeo de bacterias derivadas de las bacterias salivales tragadas que son predominantemente gram positivas. El nmero y
tipos de bacterias aumentan con la prdida de acidez gstrica.
Intestino delgado - El intestino delgado es el sitio de la motilidad rpida por lo que los organismos comnmente encontrados
simplemente estn pasando. La interrupcin de este flujo, como con un segmento estancado (estenosis, obstruccin,
divertculo, lazo ciego), resulta en concentraciones de colon de bacterias con un predominio de anaerobios [22, 26]. Este
patrn de sobrecrecimiento bacteriano puede ser responsable de la malabsorcin y se trata mejor con antibiticos dirigidos
contra anaerobios. Se especula que el crecimiento excesivo puede desempear un papel en el sndrome del intestino irritable
[27]. (Ver "Fisiopatologa del sndrome del intestino irritable", seccin sobre "Alteracin en la microflora fecal").
Colon - Las concentraciones ms grandes de bacterias anaerobias se encuentran en el tem terminal relativamente estancado
y el colon, donde las concentraciones alcanzan 10 (11) por gramo, y las bacterias anaerbicas representan aproximadamente
el 99,9 por ciento de la flora cultivable [23, 24]. Las bacterias anaerobias ms importantes y frecuentes son Bacteroides spp
(principalmente miembros del grupo B. fragilis), Prevotella spp, Clostridium spp y Peptostreptococcus spp. Cabe sealar que
la mayora de las bacterias en el colon humano no pueden ser cultivadas. Esto se ha estudiado mediante el anlisis de 16S
rRNA secuencias de genes, que muestran sustanciales individuales variacin que parece fuertemente influenciado por el
husped filogenia y la dieta [18, 28, 29]. La totalidad se conoce como "el microbioma del intestino". Estudios en animales
sugieren un posible papel para este microbioma en condiciones importantes, como la obesidad y el sndrome metablico [30].
La flora del colon se establece despus del destete y se cree que permanece relativamente estable durante toda la vida a
menos que sea interrumpido por el tratamiento antibitico. Se cree que su papel en el mantenimiento de la salud consiste en
establecer el equilibrio ecolgico al prevenir la colonizacin con organismos exgenos.
Esta proteccin, conocida como "resistencia a la colonizacin", se ve comprometida con el tratamiento con antibiticos, lo que
aumenta el potencial de infeccin por patgenos entricos y la colonizacin por bacterias resistentes, tales como enterococos
resistentes a la vancomicina (VRE) y bacilos gramnegativos resistentes. Estas bacterias causan muchas infecciones
nosocomiales, incluyendo infecciones graves en pacientes con neutropenia o enfermedad crtica. (Ver "Sndromes de fiebre
neutropnica" y "Infecciones y resistencia a los antimicrobianos en la unidad de cuidados intensivos").
Una extensin lgica de esta tesis es "modulacin selectiva de la flora fecal" mediante el uso de antibiticos dirigidos contra
bacilos gram-negativos aerbicos pero conservando el componente anaerobio de la flora en un esfuerzo por prevenir la
colonizacin por cepas resistentes [31]. El objetivo es prevenir la neumona nosocomial, la bacteriemia y otras infecciones
graves en pacientes que estn gravemente enfermos. La mayora de los datos provienen de estudios de descontaminacin
selectiva de la flora del colon para prevenir la neumona nosocomial o asociada a ventilador. Estos estudios generalmente
muestran una reduccin muy significativa en las tasas de neumona nosocomial, pero no hay reduccin en las tasas de
mortalidad. (Ver "Factores de riesgo y prevencin de la neumona adquirida en el hospital, asociada al ventilador y asociada
con la asistencia sanitaria en adultos", seccin sobre "Descontaminacin selectiva del tracto digestivo").
Otro papel importante de las bacterias del colon es la defensa contra dos formas de diarrea asociada a antibiticos: La forma
ms conocida es la diarrea o colitis asociada a C. difficile que es una enfermedad mediada por la toxina, potencialmente
mortal que probablemente se produce cuando las esporas de C. difficile En el colon transformar a las formas vegetativas con
la produccin de toxinas debido a la eliminacin de antibiticos de los componentes crticos de la competencia de la flora
colnica [32]. La segunda forma de diarrea asociada a antibiticos parece ser debida a la eliminacin de anaerobios del colon
que son crticos para metabolizar los carbohidratos para producir cidos grasos de cadena corta que se absorben en el colon;
Con la eliminacin de anaerobios crticos (especialmente las especies de Clostridia, Bacteroides y Bifidobacteria) el colon no
puede manejar los carbohidratos y el resultado es una diarrea osmtica que se resuelve rpidamente cuando los antibiticos
se detienen [33].
Tracto genital - La flora del tracto genital femenino es menos estable que la del tracto gastrointestinal. Las concentraciones
de bacterias en la vagina o el cuello uterino promedio aproximadamente 10 (8) por ml durante los aos reproductivos [34-36],
pero hay una variacin considerable [10 (5) a 10 (11) por ml] en los estudios que pueden estar relacionados con Tcnica oa
las diferencias reales. Cultivos simultneos de material del cuello uterino y la vagina muestran patrones bacteriolgicos nicos,
y los cultivos secuenciales muestran cambios considerables en diversas etapas del ciclo menstrual que puede ser
hormonalmente influenciado [34 - 37]. Aproximadamente, el 50 por ciento son bacterias anaerobias, pero esto puede variar.
De hecho, aproximadamente el 20 por ciento de las mujeres no tienen anaerobios detectables o al menos concentraciones
bajas.
Los organismos dominantes son lactobacilos aerobios, microaerobios y anaerobios; Los anaerobios ms comunes son
Lactobacillus, Peptostreptococcus y Bacteroides spp, incluyendo Prevotella bivia (anteriormente Bacteroides bivius). B. fragilis
se encuentra en slo 2 a 10 por ciento [38]. Los factores que parecen influir en los hallazgos bacteriolgicos en el tracto genital
incluyen [38-42]:
Menarche
Menopausia
Embarazo
Tratamiento con antibiticos
Ciruga ginecolgica
El papel de la flora del tracto genital en el mantenimiento de la homeostasis no est bien estudiado, aunque el tratamiento
antibitico claramente predispone a la candidiasis vaginal. La vaginosis bacteriana (BV) parece reflejar la disbiosis de la flora
del tracto genital [35, 43]:
Concentraciones de lactobacilos, que presumiblemente mantener la homeostasis, se reducen notablemente.
Los organismos dominantes son bacterias anaerobias como se indica por la tincin de Gram y el cultivo.
El efluente vaginal contiene un predominio de los cidos grasos voltiles de cadena corta producidos por los anaerobios.
Las recomendaciones teraputicas actuales para BV se limitan a frmacos dirigidos contra anaerobios (metronidazol y
clindamicina). (Ver "Vaginosis bacteriana".)
Piel - La flora de la piel contiene un gran nmero de bacterias anaerobias. Los organismos predominantes son
Propionibacterium acnes y, en menor medida, otras especies de Propionibacterium y Peptostreptococcus [43].

RESUMEN
Las bacterias anaerbicas son las formas predominantes de vida en el cuerpo humano. Si bien el papel de estos microbios
como patgenos estaba bien establecido a principios del siglo XX, a menudo se descuidan en parte debido al hecho de que
pocos laboratorios clnicos los detectan con fiabilidad. (Ver "Introduccin" arriba).
Durante las ltimas dcadas se ha renovado el inters por las infecciones anaerbicas, basadas en la verificacin de su
papel como patgenos por la recuperacin de sitios infectados, la eficacia del tratamiento antibitico y la dilucidacin de los
factores de virulencia. Ahora parece que estamos en una era en la que la terapia se dirige con frecuencia a anaerobios
basados en una suposicin de que los organismos estn all y que los antibiticos especficos son eficaces. (Ver
"Introduccin" ms arriba).
Las bacterias anaerbicas se definen como bacterias que crecen en ausencia de oxgeno y no muestran crecimiento
superficial en un 10 por ciento de dixido de carbono en el aire. Pueden clasificarse adems por aerotolerancia relativa: los
anaerobios estrictos no pueden tolerar 0,5 por ciento de oxgeno; Los anaerobios ms importantes desde el punto de vista
clnico (Bacteroides fragilis, Prevotella melaninogenica y Bacteroides melaninogenicus) y Fusobacterium nucleatum son
anaerobios moderados que toleran entre un 2 y un 8 por ciento de oxgeno. (Ver "Definicin de anaerobios" arriba).
Existe la preocupacin de que algunas infecciones anaerbicas no se detectan debido en parte a una disminucin de las
pruebas apropiadas en los laboratorios de microbiologa, que refleja las realidades econmicas, la subcontratacin y la
dependencia de los antibiticos empricos. Adems, la incidencia de infecciones anaerobias parece estar aumentando, lo
que es probablemente el resultado de un aumento en el nmero de pacientes con enfermedades subyacentes complejas.
(Ver "Estado actual" ms arriba.)
La mayora de las superficies mucocutneas de los humanos albergan una rica flora indgena compuesta de bacterias
aerbicas y anaerobias, cuyas especies microbianas y concentraciones varan en diferentes sitios anatmicos (tabla 1). Las
bacterias anaerobias son las formas dominantes, a menudo representan el 99 al 99.9 por ciento de la flora cultivable. (Ver
"Flora normal" arriba).
Las vas areas superiores, incluyendo la cavidad oral, los conductos nasales, la orofaringe y la nasofaringe, albergan una
flora compleja que difiere en varios sitios a pesar de la continuidad anatmica. Los patgenos anaerbicos potenciales ms
importantes encontrados en las vas areas superiores son Fusobacterium nucleatum, Prevotella melaninogenica, Prevotella
oralis, Bacteroides ureolyticus y Peptostreptococcus spp, que representan los organismos predominantes en las infecciones
anaerobias orales y pleuropulmonares. (Vase "Vas areas superiores" arriba).
El tracto gastrointestinal (GI) muestra variaciones marcadas en patrones bacteriolgicos en concentraciones a diferentes
niveles. El estmago est protegido por la barrera del cido gstrico y, en consecuencia, alberga un nmero relativamente
pequeo de bacterias derivadas de las bacterias salivales tragadas que son predominantemente gram positivas. (Ver "Flora
normal" arriba y "Estmago" arriba).
El intestino delgado es el lugar de la motilidad rpida por lo que los organismos comnmente encontrados simplemente
estn pasando. La interrupcin de este flujo, como con un segmento estancado (estenosis, obstruccin, divertculo, lazo
ciego), da como resultado concentraciones de colon de bacterias con predominio de anaerobios. (Ver 'intestino delgado'
arriba.)
Las concentraciones ms grandes de bacterias anaerobias se encuentran en el leon terminal relativamente estancado y
en el colon, donde las concentraciones alcanzan 10 (11) por gramo, y las bacterias anaerobias representan aproximadamente
el 99.9 por ciento de la flora cultivable. Las bacterias anaerobias ms importantes y frecuentes son Bacteroides spp
(principalmente miembros del grupo B. fragilis), Prevotella spp, Clostridium spp y Peptostreptococcus spp. (Ver "Coln"
arriba).
Los organismos dominantes en el tracto genital femenino son lactobacilos aerobios, microaerobios y anaerobios; Los
anaerobios ms comunes son Lactobacillus, Peptostreptococcus y Bacteroides spp, incluyendo Prevotella bivia
(anteriormente Bacteroides bivius). (Vase "Trato genital" ms arriba.)
La flora de la piel contiene un gran nmero de bacterias anaerobias. Los organismos predominantes son Propionibacterium
acnes y, en menor medida, otras especies de Propionibacterium y Peptostreptococcus. (Ver "Piel" arriba).

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REFERENCES
 Coleccin y transporte de muestras microbiologicas

INTRODUCCIN - El objetivo de la evaluacin microbiolgica es proporcionar resultados precisos y clnicamente pertinentes

de manera oportuna. La calidad de los especmenes presentados al laboratorio de microbiologa es crtica para la evaluacin
ptima de las muestras.
Las tcnicas generales de recoleccin y manipulacin de muestras que se han establecido tanto para maximizar el
rendimiento de organismos como para aislar patgenos relevantes de especmenes obtenidos de diferentes sitios corporales
sern revisadas aqu (tabla 1A-D). Las tcnicas de recoleccin de especmenes especficos tales como sangre, esputo y orina
se discuten con ms detalle por separado. (Vase "Cultivos de sangre para la deteccin de bacteriemia" y "Cultivos de esputo
para la evaluacin de la neumona bacteriana" y "Muestreo de orina y cultivo en el diagnstico de infeccin urinaria en
adultos").
RECOGIDA DE MUESTRAS - La interpretacin vlida de los resultados del cultivo slo se puede lograr si el espcimen
obtenido es apropiado para el procesamiento. Como resultado, se debe tener cuidado de recolectar slo aquellos
especmenes que pueden producir patgenos, en lugar de colonizar la flora o contaminantes. Las reglas especficas para la
recoleccin de material varan, dependiendo de la fuente del espcimen, pero se aplican varios principios generales [1-3]:
Hacer todo lo posible para obtener los especmenes antes del inicio de la terapia antimicrobiana.
Use guantes, batas, mscaras y / o gafas protectoras, cuando sea apropiado, al recolectar muestras de sitios estriles.
Utilice una tcnica asptica estricta.
Cuando obtenga muestras de sitios normalmente estriles como espacios pleurales o articulares, LCR o peritoneo, tenga
cuidado de minimizar la contaminacin por la flora colonizadora normal de la piel o las membranas mucosas.
Recoger un volumen adecuado de muestra; Enve el tejido o el lquido siempre que sea posible en lugar de someter una
muestra recogida en un hisopo.
Si la muestra se recoge en una jeringa, retire la aguja y cmbiela con una tapa antes de transportarla.
Etiquetar todos los contenedores de muestras con informacin de identificacin del paciente (nombre y nmero del hospital
o fecha de nacimiento) y la fuente de la muestra y la fecha y hora de la recoleccin.
Completar completa y precisamente todas las solicitudes de papel o electrnicas, incluidos los detalles solicitados sobre el
historial del paciente, la terapia antimicrobiana y la fuente de la muestra, de modo que el laboratorio pueda determinar mejor
el mtodo apropiado para procesar la muestra.
Notificar al laboratorio de antemano si se solicitan pruebas especiales o si se sospecha de agentes patgenos inusuales,
incluidos agentes potenciales de bioterrorismo.
Coloque etiquetas de advertencia en los especmenes de pacientes sospechosos de tener enfermedades altamente
contagiosas y notifique al supervisor del laboratorio.
Coordinar el procesamiento de los especmenes que se someten para las evaluaciones microbiolgicas y patolgicas. A
menudo es mejor enviar un solo espcimen al laboratorio y hacerlo dividirlo por un patlogo experimentado, en lugar de
someter muestras separadas. Si se somete una sola muestra, no debe colocarse en los conservantes utilizados habitualmente
para muestras de patologa (por ejemplo, formalina) hasta que una porcin se separe para el cultivo.
Si hay alguna pregunta acerca de la muestra ptima para recolectar, llame al laboratorio de microbiologa antes de obtener
los especmenes.
TRANSPORTE DE MUESTRAS - En general, los especmenes pueden ser enviados al laboratorio de microbiologa en
recipientes estriles, a prueba de fugas, encerrados en bolsas de plstico estancas y selladas. En el caso de los fluidos
obtenidos en jeringuillas (por ejemplo, paracentesis, aspiracin articular, drenaje de absceso), la mayora de los organismos
permanecen viables durante perodos de tiempo significativos en la jeringa utilizada para la recoleccin. Durante mucho
tiempo se ha defendido que estos especmenes sean enviados en la jeringa original. Sin embargo, en la era de las
precauciones universales, algunos laboratorios fomentan la transferencia del material a otro recipiente antes del transporte,
mientras que otros recomiendan el transporte en la jeringa original despus de que la aguja se retire y se sustituya por una
tapa. En nuestra institucin, el laboratorio de microbiologa prefiere recibir ejemplares en la jeringa original, siempre y cuando
la aguja haya sido sustituida por una tapa. El laboratorio tambin aceptar especmenes en otros recipientes, pero rechazar
cualquier jeringa que llegue con la aguja todava en su lugar.
El transporte rpido de especmenes al laboratorio de microbiologa es esencial para optimizar el rendimiento de las culturas
y la interpretacin de los resultados. Los retrasos en el procesamiento pueden provocar el crecimiento excesivo de algunos
microorganismos o la muerte de otros ms exigentes. Tambin debe evitarse la desecacin de la muestra.
Las muestras para el cultivo de bacterias deberan llegar al laboratorio de microbiologa dentro de una o dos horas de la
recoleccin. Si un retraso es inevitable, la mayora de los especmenes (con la excepcin de sangre, lquido cefalorraqudeo,
lquido articular y cultivos de Neisseria gonorrhoeae) deben ser refrigerados hasta su transporte. Es importante agregar que
la refrigeracin debe ocurrir en un refrigerador aprobado para la coleccin de la muestra.

Rechazo de muestras por el laboratorio - Las razones comunes para el rechazo de los especmenes por los laboratorios de
microbiologa incluyen:
Ejemplos no marcados
Informacin incoherente sobre la requisicin y la etiqueta del espcimen (por ejemplo, nombres de pacientes diferentes)
Especie recibida en un recipiente con fugas o roto
Especie obviamente contaminada
Solicitud de prueba inadecuada basada en la fuente de la muestra (tabla 1A-D) o situacin clnica (por ejemplo, solicitud de
un cultivo de heces para patgenos entricos en un paciente hospitalizado durante ms de tres das)
Medios de transporte inapropiados para la prueba solicitada (por ejemplo, cultivos anaerbicos solicitados para ejemplares
sometidos a medios de transporte aerbicos)
Cantidad insuficiente de muestra
Especie transportada a una temperatura inadecuada
Tiempo de transporte de muestra prolongado
Es importante que el laboratorio de microbiologa notifique prontamente al mdico responsable cuando se rechaza un
espcimen, de modo que se puedan tomar medidas apropiadas para obtener ms material. Si hay un problema de etiquetado,
la persona responsable de recoger la muestra puede ser capaz de corregir el error de papeleo. En situaciones en las que no
sea factible obtener otro espcimen (por ejemplo, procedimiento quirrgico u otro procedimiento invasivo requerido para
obtener el espcimen original), el laboratorio puede tener que proceder al procesamiento de muestras, aunque la validez de
los resultados puede verse comprometida. Tales decisiones se toman tpicamente en colaboracin con el mdico del paciente,
y los informes del laboratorio se acompaan generalmente de una renuncia.
Ejemplos de especmenes que no son adecuados para el cultivo incluyen [2]:
Hisopos de lcera de decbito, absceso perirectal, lesin periodontal, herida por quemadura, lcera gangrenosa - enve
aspirado o tejido en su lugar
Vomito
Descarga de colostoma
Punta de catter Foley

RESUMEN
El objetivo de la evaluacin microbiolgica es proporcionar resultados precisos y clnicamente pertinentes de manera
oportuna. La calidad de los especmenes presentados al laboratorio de microbiologa es crtica para la evaluacin ptima de
las muestras. (Ver "Introduccin" arriba).
La interpretacin vlida de los resultados del cultivo slo puede lograrse si el espcimen obtenido es apropiado para el
procesamiento. Como resultado, se debe tener cuidado de recolectar slo aquellos especmenes que pueden producir
patgenos, en lugar de colonizar la flora o contaminantes. (Ver "Recoleccin de muestras" arriba).
El clnico solicitante puede ayudar a asegurar que los especmenes se procesan apropiadamente completando las
solicitudes con precisin y proporcionando al laboratorio la mayor cantidad de informacin relevante posible. (Ver "Recoleccin
de muestras" arriba).
En general, los especmenes pueden enviarse al laboratorio de microbiologa en recipientes estriles, a prueba de fugas,
encerrados dentro de bolsas de plstico estancas y selladas. El transporte rpido de especmenes al laboratorio de
microbiologa es esencial para optimizar el rendimiento de las culturas y la interpretacin de los resultados. Los retrasos en
el procesamiento pueden provocar el crecimiento excesivo de algunos microorganismos o la muerte de otros ms exigentes.
Tambin debe evitarse la desecacin de la muestra. (Ver 'Transporte de muestras' arriba.)