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1.-Es una ciencia que estudia a las clulas vivas y como funcionan.
Bacterias
n Bacteriologa
Hongos y levaduras
n Micologa
Virus
n Virologa
Algas microscpicas
n Ficologa
Protozoarios
n Protozoologa
Definicin de microorganismo
Taxonoma microbiana
Nomenclatura
Identificacin
Caracterizacin por nmero limitado de pruebas
adecuadas al problema
Comparacin con especies conocidas
desnaturalizacin
Tm: punto medio del perfil de
Tm = 86C
desnaturalizacin trmica de
ADN doble hebra ADN-ADN o de ADN-ARN
80 90 100
temperatura (C)
Ensayo de reasociacin de DNA-DNA para
cepas a y b
Curvas de desnaturalizacin trmica de DNA
homoduplex y heteroduplex
Gnero y Cepa bacteriana
Clasificacin filogentica
Clasificacin Fentica
Tras la publicacin de El origen de
Agrupa a los organismos en las especies de Charles Darwin en
funcin de las semejanzas en 1859, los bilogos han desarrollado
sus caractersticas fenotpicas. clasificaciones que se basan en las
Los organismos que comparten relaciones evolutivas mas que en
muchas caractersticas o semejanzas generales. Esto ha
atributos constituyen un grupo resultado difcil en el caso de las
nico llamado taxn. bacterias por la falta de un buen
registro fsil. Se trabaja entonces con
material gentico, RNA y protenas.
Caractersticas utilizadas en la taxonoma
Para la identificacin y clasificacin de los microorganismos se
utilizan numerosas caractersticas que se han dividido en dos
grupos:
Caractersticas moleculares
Caractersticas clsicas La composicin, hibridacin y
Morfolgicas secuenciacin de los cidos nucleicos.
Fisiolgicas Comparacin de protenas: secuencias
de citocromos, protenas de transporte,
Metablicas protenas de choque trmico, diversas
Ecolgicas enzimas metablicas, as como la
movilidad electrofortica.
Genticas
Se estudian y comparan las propiedades
fsicas, cinticas y reguladoras de
diversas enzimas.
RANGOS TAXONMICOS EN
CLASIFICACION BACTERIANA
Taxones: Dominio
Phylum
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie
Sub-especie
importancia en estudios
clnicos y ecolgicos
Sistema binomial de nomenclatura
(Linneo)
Escherichia coli
Dominio
Phylum
Clase
Orden
Familia
Genero
Especie
Bacteria
Proteobacteria
Gamma Proteobacteria
Zymobacteria
Enterobacteriales
Enterobacteriaceae
Escherichia
Escherichia coli
Categoras de clasificacin a nivel de sub-
especie (tipificacin)
Variedades o tipos
patovariedad (patogenicidad)
CLSICA
caracteres fenotpicos (morfologa, nutricin, etc.)
algunos genotpicos: % G+C, hibridacin DNA-DNA
ponderacin de caracteres (llaves dicotmicas)
Caractersticas fenotpicas clsicas de valor
taxonmico
Contenido G+C
- determinacin por:
% hibridacin de DNA1 - DNA2
Tm del hbrido
Marcadores quimiotaxonmicos
Caractersticas
Estructura primaria:
v Dominios de conservacin universal
v Regiones altamente variables
v Dominios de nivel intermedio de conservacin, con
cambios de secuencia, pero conservacin de
estructura secundaria
Estructura secundaria:
v Similar en todos los organismos
v Acotada por su funcin en la sntesis de protenas:
funcin ancestral
Estructura secundaria
del rRNA 16S de E. coli
Lneas gruesas: dominios
de conservacin universal
Lneas normales: dominios
de conservacin
intermedia
Lneas punteadas: regiones
hipervariables11
Secuencias signaturas o firma en rRNA
Ejemplos:
Chloroflexus y Chlorobium
posibles explicaciones:
transferencia lateral
evolucin independiente
En general se cumple:
secuencia del gen del rRNA 16S difiere en ms del 3% con el resto
de las secuencias conocidas de bacterias entonces el % de
hibridacin DNA-DNA es menor al 70%
especies diferentes
Secuencia del gen ARNr 16S
COMPLETAR IDENTIFICACIN DE
CULTIVOS PUROS
> 3% < 3%
pruebas fenotpicas
Confirmacin con pruebas
fenotpicas y genotpicas diferentes similares
diferentes
Hibridacin ADN-ADN
son ancestrales
a) Las Mitocondrias,
b) Los Cloroplastos
c) Los Flagelos (Undulipodia)
Origen endosimbitico de los eucariotes
Origen endosimbitico de organelos
eucariticos: Mitocondrias y Cloroplastos
Reino Eukaryotae
En los aos 70 se descubre que los procariotes constan de
dos grupos muy distintos (C. Woese y G. E. Fox):
Eubacterias (hoy Bacteria)
Arqueobacterias (hoy Archaea)
Organismos microscpicos y macroscpicos
PROCARIOTES EUCARIOTES
Genforo Nucleoplasma
Varios cromosomas
Un slo cromosoma
ADN cadena doble lineal
ADN c.d., C.C.C (terminado en telmeros)
No presentan membrana nuclear Existe membrana nuclear (hay
(no hay ncleo autntico) ncleo autntico)
histonas
No existen histonas
Replicacin: mitosis
Replicacin: no mitosis
Organizacin del citoplasma
Organizacin del citoplasma Orgnulos (mitocondrias,
No poseen orgnulos de tipo cloroplastos, REL y RER,
aparato de Golgi, lisosomas.
eucaritico
Existe citoesqueleto,
No tienen citoesqueleto corrientes citoplmcias
Ribosomas de tipo 70S Ribosomas de tipo 80S
Procariote
Eucariote
Comparacin entre una clula procaritica y
una eucaritica
Caractersticas diferenciales entre Bacteria,
Archaea y Eukarya