Manual Toma Muestras (1) .Pdf1659166986

Secretara Distrital de Salud de Bogot, D. C.
Direccin
de Salud Pblica
Manual para la
toma de muestras
para anlisis
microbiolgico
Samuel Moreno Rojas

Alcalde Mayor de Bogot, D. C.
Hctor Zambrano Rodrguez
Secretario Distrital de Salud de Bogot, D. C.
Jos Fernando Martnez Lopera

Director de Salud Pblica
Mara Patricia Gonzlez Cullar

Profesional especializada, rea de Vigilancia en Salud Pblica
Daibeth Henrquez Iguarn

Profesional especializada, rea de Vigilancia en Salud Pblica

Direccin de Salud Pblica
Carrera 32 n 12-81, cuarto piso
Bogot, D. C.
www.saludcapital.gov.co
Coordinacin editorial
Ofi cina Asesora de Comunicaciones
ISBN 978-958 8313191
Primera edicin
Bogot, mayo de 2008
Diseo, diagramacin e impresin

Editorial Linotipia Bolvar y Ca. S. en C.
CONTENIDO
MANUAL PARA LA TOMA DE MUESTRAS PARA ANLISIS MICROBIOLGICO

Introduccin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1. ASPECTOS GENERALES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
1.1 Recomendaciones para la toma de muestras . .7
1.2 Solicitud de estudio . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
1.3 Precauciones de bioseguridad . . . . . . . . . . . 8
1.4 Preparacin de elementos . . . . . . . . . . . . . . 8
1.5 Equipo de asepsia y antisepsia . . . . . . . . . . . 9
1.6 Preparacin de la piel: limpieza y antisepsia . 10
1.7 Tcnica de extendido . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1.8 Identifi cacin de muestras . . . . . . . . . . . . . 10
1.9 Condiciones generales de almacenamiento
y transporte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
1.10 Criterios de aceptabilidad
o rechazo de muestras . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
1.11 Cadena de custodia y pruebas de laboratorio . 12
1.12 Objetivo general . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
1.13 Objetivos especfi cos. . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
2. MUESTRAS CLNICAS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
2.1 Muestras de orina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
2.2 Muestras de sangre . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
2.3 Muestras del tracto respiratorio . . . . . . . . . . 29
2.4 Muestras lquidos corporales . . . . . . . . . . . . 37
2.5 Muestras de piel y mucosas . . . . . . . . . . . . . 43

2.6 Muestras de biopsia y tejidos . . . . . . . . . . . . 45
2.7 Muestras de heces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
2.8 Muestras ticas, oculares y dentales . . . . . . . 49
2.9 Muestras para deteccin de hongos . . . . . . . . 53

2.10 Muestras tracto genitourinario . . . . . . . . . . . 61
2.11 Lista de chequeo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
3. MUESTRAS AMBIENTALES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
3.1 Superfi cies, soluciones y ambientes . . . . . . . . . 73
3.2 Muestras en personas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
Glosario . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Bibliografa. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86
Participantes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90
CONFERENCIA DE CONSENSO PARA LA TOMA DE MUESTRAS

PARA ANLISIS MICROBIOLGICO
Introduccin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
Acerca del desarrollo de esta conferencia
de consenso . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
Informacin para referenciar este documento . . . . . 94
Declaracin de confl ictos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
Resumen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95
Cul es el volumen, dilucin y nmero
de hemocultivos recomendados en pediatra? . . . . . 97
Cul es la recomendacin para la preparacin
del rea de la piel adyacente de heridas quirr-
gicas, traumticas, absceso o biopsias de tejido
para la toma de muestras en el anlisis micro-
biolgico? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Es til la utilizacin de antispticos

6
antes de la toma de cultivos en el
tracto respiratorio?. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
Cul es el volumen de sangre con mayor rendi

miento para la deteccin de bacteriemia en pa-
cientes adultos por medio de los mtodos automatizados de
cultivo? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
Conclusiones . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
Participantes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105
Introduccin
El estudio microbiolgico de muestras de tejidos y lquidos

corporales permite establecer el diagnstico etiolgico de
diferentes enfermedades infecciosas. Por tal motivo es
importante garantizar la calidad en la obtencin de la muestra y la
informacin que debe acompaarla durante el proceso que
comienza en la fase previa al anlisis, que incluye la preparacin,
la obtencin y el transporte, lo cual concluye en el anlisis de la
muestra.
Errores en cualquiera de las fases llevan a prdidas econmicas y
temporales, mala utilizacin de recursos y, lo ms grave, a errores
diagnsticos de gran impacto en el pronstico y la seguridad en la
atencin de los pacientes.
El objetivo general de este Manual para la toma de muestras para
anlisis microbiolgico es unifi car criterios en torno a la
preparacin de una muestra microbiolgica, describiendo el
equipamiento necesario para su obtencin, los cuidados y las
recomendaciones especiales que se deben seguir en una tcnica
adecuada de recoleccin y proceso de transporte, para garantizar
la viabilidad del espcimen.
Para la elaboracin de las recomendaciones iniciales se dispuso de
un documento base (1); las recomendaciones se actualizaron
mediante una bsqueda explcita de la literatura, con el fi n de
identifi car y evaluar la evidencia publicada despus de 2003, para
actualizar las recomendaciones del documento en referencia.
-5-
Con el fi n de recopilar la experiencia local y de identifi car aspectos

que requeran revisin y consenso, por medio del Comit distrital
de infecciones intrahospitalarias se solicit por escrito a todas las
instituciones prestadoras de servicios de salud (IPS) el envo de los
manuales, los protocolos o las guas disponibles sobre toma de
muestras para el anlisis microbiolgico en los laboratorios
institucionales.
Los documentos remitidos por las instituciones prestadoras de
servicios de salud se evaluaron con un instrumento diseado con
base en el instrumento de la colaboracin AGREE (Appraisal of
guidelines research and evaluation
http://www.agreecollaboration.org/).
Como reas ms importantes dentro del instrumento diseado
para clasifi cacin de los manuales, los protocolos o las guas, se
defi nieron el objetivo y el propsito, la participacin de los
implicados, la claridad y la presentacin de las recomendaciones y
la aplicabilidad de las mismas. Adems, se revisaron las referencias
bibliogrfi cas asociadas a cada documento.
A partir de la evidencia y la experiencia local, los participantes en
la elaboracin de este Manual identifi caron temticas en las que
la evidencia disponible o las recomendaciones postuladas fueran
motivo de controversia; se llevaron entonces a una reunin de
consenso formal, evento distrital del cual sus principales aspectos
se presentan en el anexo Consenso distrital.
1. Aspectos generales
1.1 Recomendaciones para la toma de muestras

Para el xito de la atencin del paciente es esencial la
comunicacin entre todo el equipo de salud. El mdico solicitar
un estudio microbiolgico con una orientacin clara de acuerdo
con la situacin clnica del paciente. El personal de enfermera y
laboratorio microbiolgico requiere conocimientos e informacin
8
precisa para realizar el procedimiento en condiciones ptimas; y

el personal encargado del transporte debe estar capacitado
adecuadamente para mantener la muestra en trminos de tiempo
y caractersticas hasta su entrega al rea de anlisis. Todo el
personal debe ser conciente de la importancia de sus actividades,
para contribuir a los objetivos de calidad.
1.2 Solicitud de estudio

Antes de colectar un espcimen se debe hacer una seleccin
cuidadosa para garantizar que el sitio fuente representa el lugar
de la enfermedad activa. Las muestras para cultivo de bacterias se
deben obtener con prontitud, despus del inicio de la enfermedad
activa y preferiblemente antes del inicio de antibiticos.
Los sitios anatmicos que ofrecen ms posibilidad de obtener
muestras contaminadas son: la vejiga desde la uretra y el perin;
la sangre, las heridas superfi ciales y el tejido celular subcutneo
desde la piel; el endometrio desde la vagina; el odo medio desde
el conducto auditivo externo; y el seno nasal desde la nasofaringe.
Recuerde:
Especifi car el estudio requerido; por ejemplo, examen directo,
cultivo y antibiograma de lquido intraabdominal, estudios de
aerobios y anaerobios.
Resumir el diagnstico clnico presuntivo del paciente. La
impresin diagnstica es especialmente til cuando se solicita
estudio de hongos y micobacterias.
-7-
Informar el uso de antibiticos u otros medicamentos (por

ejemplo, inmunosupresores) que pueden infl uir y que el
personal del laboratorio puede utilizar para orientar el anlisis.
1.3 Precauciones de bioseguridad

La manipulacin inapropiada puede convertirse en una fuente de
riesgo biolgico para las personas que estn en contacto o para el
medio ambiente. Utilizar los elementos de proteccin personal
necesarios para evitar exposicin con riesgo biolgico, de acuerdo
con la fuente de la muestra.
Proteccin ocular: gafas o mascarilla con visera.
Mascarilla.
Guantes.
Bata.
Contenedores para especmenes, a prueba de fugas y de fcil
sellamiento.
Cumplir con las recomendaciones de manejo de elementos

cortopunzantes:
No reenfundar agujas.
Disponer y utilizar adecuadamente el contenedor para cortopun-
zantes.
No transportar jeringas con agujas. Se recomienda transferir el
aspirado a un tubo estril.
En caso de accidente con riesgo biolgico, avisar inmediatamente

segn las recomendaciones del protocolo de accidente de trabajo
con riesgo biolgico institucional.
1.4 Preparacin de elementos

Una vez conocida la solicitud del tipo de examen, se debe preparar
el equipo necesario para la obtencin, la conservacin y el
transporte correctos de la muestra. Las propiedades biolgicas de
esta pueden ser alteradas por variables medioambientales como:
tiempo, contenedor, contaminacin externa.
1
0
1.4.1 Escobillones o hisopos
El anlisis de anaerobios requiere que la muestra se obtenga por
biopsia o aspirado con aguja; el uso de escobillones est
contraindicado.
Es importante tener en cuenta las caractersticas de los
escobillones para la recoleccin de ciertas muestras, lo que
asegurar la viabilidad del espcimen. Hay escobillones de
algodn, dacrn (polister) y alginato de calcio.
Los de mango de madera y algodn en la punta no se recomiendan
para estudio de virus herpes simplex, ya que pueden ser inactivado
por sus componentes txicos; los componentes de cidos grasos
interfi eren con la sobrevida de algunas especies de Chlamydia.
Estn indicados para la deteccin de Mycoplasma en uretra,
vagina y crvix, y para la deteccin de la mayora de bacterias no
exigentes nutricionalmente
Los escobillones de dacrn estn indicados para la deteccin de
virus y facilitan la sobrevida de Streptococcus pyogenes.
Los escobillones de alginato de calcio son tiles para la deteccin
de Chlamydia spp. Estn contraindicados para la coleccin de
especmenes con sospecha de virus de desarrollo lipdico y algunas
cepas de Neisseria gonorrhoeae.
El procedimiento de recoleccin de muestras debe ser
atraumtico y lo menos incmodo para el paciente; por tanto, se
recomienda el uso de escobillones fl exibles y con puntas
pequeas para obtener muestras de nasofaringe y uretra
masculina.
1.5 Equipo de asepsia y antisepsia

Las soluciones antispticas recomendadas para la preparacin de
la piel con el fi n de reducir el conteo de bacterias viables que
pueden contaminar los especmenes son: antispticos que
contienen yodo, incluyendo los yodforos, jabn y solucin,
alcohol yodado y gluconato de clorhexidina.
Guantes estriles.
1
1
Gasas estriles: no se recomienda el uso de torundas de
algodn ya que son fuente frecuente de contaminacin.
Batas y campos estriles.
1.6 Preparacin de la piel: limpieza y
antisepsia
Lavarse las manos, usar guantes estriles, aplicar jabn antisptico
en una gasa estril y con movimientos circulares desde el centro a
la periferia, hacer friccin mecnica del sitio que se va a puncionar
o penetrar. Repetir el mismo proceso con una gasa impregnada en
solucin antisptica. Finalizar con una aplicacin de alcohol al 70%
o alcohol yodado. Dejar secar espontneamente el antisptico
sobre la piel durante 2 minutos.
1.7 Tcnica de extendido

Con el escobilln estril obtenga la muestra del sitio especfi co.
Rote el escobilln sobre s mismo suavemente, a medida que va
cubriendo la superfi cie de la lmina de vidrio de un extremo a
otro. Evite devolverse sobre la lmina para evitar la ruptura
celular.
Asegrese que el grosor del extendido sea delgado y homogneo.
1.8 Identifi cacin de muestras

Toda muestra debe ser etiquetada con los siguientes datos bsicos:
1. Nombre completo y edad del paciente.
2. Nmero de historia clnica: en algunas instituciones correspondeal
documento de identifi cacin.
3. Habitacin donde est ubicado el paciente o servicio
delocalizacin.
4. Tipo de muestra y sitio anatmico. Por ejemplo, secrecin de
herida quirrgica abdominal; biopsia tejido lcera pie diabtico;
orina obtenida a travs de sonda vesical permanente; sangre
obtenida a travs de catter venoso central, etc.
5. Fecha y hora de recoleccin.
6. Iniciales de la persona que obtiene la muestra.
1
2
1.9 Condiciones generales de almacenamiento
y transporte
El tiempo de transporte de todos los especmenes obtenidos para
estudio debe ser corto (preferiblemente antes de 2 horas) y de
acuerdo con la viabilidad del organismo sospechado y el recipiente
donde se colect.
Las muestras para cultivo de bacterias no deben ser
almacenadas por ms de 24 horas, independientemente del
medio y la temperatura de almacenamiento.
Segn el volumen obtenido: menos de 1 ml 1 cc deben ser
transportados en los primeros 15 a 30 minutos para evitar
evaporacin, desecacin y exposicin a condiciones
ambientales. Si los volmenes son mayores y se almacena en
el medio y a temperatura recomendada puede extenderse
hasta 24 horas, mximo.
Las bacterias que requieren procesamiento inmediato por su
susceptibilidad al medio ambiente son: Shigella spp, Neisseria
gonorrhoeae, N. meningitidis, Haemophilus infl uenzae,
Streptococcus pneumoniae y anaerobios.
Las muestras para estudio de anaerobios no deben ser
refrigeradas y deben ser colectadas en recipientes que
mantengan condiciones libres de oxgeno.
Muestras de lquido espinal, especmenes de vagina, odo
interno y ojos no deben ser refrigeradas.
Los frascos para recoleccin de lquidos deben tener tapa
rosca;no se recomienda el uso de tapones de gasa o algodn
que pueden absorber el lquido colectado y generar el riesgo
de derramamiento y exposicin biolgica.
1.10 Criterios de aceptabilidad o rechazo de

muestras
Cuando no se mantienen las condiciones de coleccin y transporte
recomendadas se debe obtener una nueva muestra, siempre que
sea posible. Cantidades insufi cientes, temperaturas inadecuadas,
1
3
recipientes rotos o con fugas o defi ciente calidad de la muestra
(por ejemplo, esputo contaminado con saliva; orina obtenida de
bolsa colectora), deben ser tenidos en cuenta para no procesar el
espcimen2.
Muestras sin identifi car: los especmenes obtenidos por

medios no invasivos se deben volver a obtener; los obtenidos
por medios invasivos se procesan previa autorizacin del
mdico.
Transporte demorado: defi nido como el tiempo superior al
recomendado para cada tipo de muestra; slo se procesan
previa autorizacin del mdico: de lo contrario se deben
repetir.
Muestras repetidas: en un mismo da y especmenes diferentes
a tejido o sangre, requieren confi rmacin de la orden por parte
del mdico
1.11 Cadena de custodia y pruebas de

laboratorio
Este es un procedimiento de cumplimiento obligatorio para la
toma y el transporte de muestras de anlisis microbiolgico, intra
o interinstitucionalmente, y es opcional para otros anlisis de
laboratorio.
Las consideraciones jurdicas se basan en normas internacionales
para el transporte de materiales peligrosos que incluye las
Recomendaciones del comit de expertos de las Naciones Unidas
para el transporte de artculos peligrosos. La Unin Postal
Universal (UPU) incluye estas recomendaciones en sus
regulaciones, particularmente las relacionadas con el embalaje. La
Organizacin Internacional de Aviacin Civil (OIAC) y la Asociacin
Internacional de Transporte Areo (Iata) tambin han incorporado,
como lo han hecho otras organizaciones de transporte, las
Recomendaciones de las Naciones Unidas en sus respectivas
regulaciones3. La Organizacin Mundial de la Salud acta como
asesora de estos cuerpos.
1
4
1.12 Objetivo general
Garantizar la identidad, la integridad, la seguridad, la continuidad y
el registro de las muestras para estudio microbiolgico:
Identidad: que se enve lo que se manifi esta.
Integridad: que la muestra se mantenga en condiciones
adecuadas.
Seguridad: cumplir las condiciones y los requisitos para
minimizar el riesgo que puede signifi car para todos los
manipuladores o el medio ambiente.
Continuidad: durante todo el proceso.
Registro: de cada paso con su respectivo responsable para
demostrar la trazabilidad del proceso y la confi dencialidad de
los datos.
1.13 Objetivos especfi cos

Asegurar las caractersticas originales de las muestras.
Optimizar los recursos disponibles.
Organizar la red de trabajo.
Estandarizar los mtodos de trabajo.
Mejorar la calidad del servicio.
Ofrecer una fuente de orientacin a los funcionarios
involucrados.
Mejorar el desempeo y la confi abilidad.
Mejorar la atencin al usuario.
2. Muestras clnicas
Un factor fundamental en la calidad del trabajo que se realiza en

el laboratorio de microbiologa es la coleccin y el transporte del
espcimen por analizar. La calidad del trabajo en el laboratorio de
microbiologa est determinada en gran parte por la naturaleza de
la muestra y su condicin de arribo al laboratorio. Si el laboratorio
no recibe una muestra apropiada no puede dar un informe de
utilidad clnica y en muchos casos puede confundir y alejar al
clnico del verdadero agente etiolgico de la enfermedad.
Este manual incluye las recomendaciones y los aspectos
relacionados con la tcnica de toma de muestras, los equipos
requeridos y el transporte adecuado de las mismas al laboratorio,
y se dirige al personal encargado de la toma y transporte de
muestras clnicas y ambientales en el mbito institucional.
- 15 -
1
9
2.1 Muestras de orina
FUENTE DE LA MUESTRA
A. Orina de miccin espontnea
CUIDADOS Y RECOMENDACIONES
Realizar higiene de genitales: en mujeres, es necesario lavar el
vestbulo vaginal y la entrada de la uretra con agua jabonosa,
enjuagar con abundante agua. Secar y separar los labios e iniciar
la miccin. En el hombre se debe hacer retraccin del prepucio y
lavar el meato urinario con agua jabonosa, enjuagar con
abundante agua y secar. Con el prepucio retrado iniciar la
recoleccin de la orina.
En pacientes ambulatorios es ideal recoger la muestra de la
primera miccin del da.
NO est indicada para identifi cacin de anaerobios. Es una
muestra importante para la deteccin de infecciones causadas por
citomegalovirus (CMV), enterovirus, adenovirus (4). Para
bsqueda de Mycobacterias se realiza la recoleccin de la misma
manera, se realiza cultivo pero no se realiza baciloscopia por la
baja especifi cidad (5).
TCNICA DE RECOLECCIN
Instruir al paciente para que inicie la miccin, desechar la primera
parte de la orina, introducir el frasco colector, recoger la parte
media de la orina sin detener el fl ujo urinario (5-10 cc) y terminar
de eliminar en el sanitario o pato. Tapar el frasco sin contaminar
la muestra.
EQUIPO
Frasco recolector estril de boca ancha de tapa rosca.
Equipo de higiene: jabn, gasas.
2
0
TRANSPORTE
Se recomienda en los primeros 15 minutos de la recoleccin, no
exceder de dos horas y a temperatura ambiente.
B. Orina obtenida a travs de cateterismo

transuretral
Realizar higiene de genitales con guantes no estriles. Retirar y
desechar los guantes; realizar lavado de manos clnico, usar
guantes estriles e insertar el catter urinario aspticamente.
La confi abilidad diagnstica es cercana a una sensibilidad de 95%
y especifi cidad del 99%, constituyendo una buena alternativa en
nios sin control de esfnteres. El riesgo de introducir la infeccin
durante el cateterismo o de otras complicaciones es bajo si el
personal entrenado emplea la tcnica correcta (2).
Eliminar la primera porcin de orina obtenida, colectar la siguiente
porcin de orina (5-10 cc) en el frasco estril, retirar la sonda de
nlaton y tapar el frasco.
EQUIPO
Sonda de Nelaton (No. 14 - 16 adultos, No. 6 -8 en nios).
Guantes estriles y no estriles.
TRANSPORTE
2
1
C. Orina obtenida a travs de sonda vesical
permanente
Pinzar la sonda durante 30 a 60 minutos antes de obtener la
muestra.
Realizar desinfeccin del puerto en Y de la sonda de foley con
alcohol al 70%.
Verifi car el retiro de la pinza de la sonda despus de obtener
la muestra.
No utilizar orina que ha estado depositada por varias horas en
bolsas o frascos colectores.
Los pacientes con catter vesical por largo tiempo, siempre
tienen microorganismos en la vejiga. No se recomienda
recolectar orina de estos pacientes, a menos que se sospeche
que el foco infeccioso es urinario.
Puncionar la sonda con jeringa estril con aguja de calibre
pequeo, aspirar 5 a 10 cc de orina, retirar jeringa.
Envasar en el frasco estril, manteniendo la tcnica asptica.
EQUIPO
Guantes no estriles, gasas estriles, alcohol al 70%.
Jeringa estril.
Guantes estriles.
TRANSPORTE
D. Orina obtenida en pacientes peditricos
2
2
Pacientes con control de esfnter: realizar higiene de genitales con
guantes no estriles. Secar adecuadamente el rea genital. El
paciente elimina en un recipiente limpio, de este recipiente se
reenvasa en un frasco limpio de tapa rosca.
Pacientes sin control de esfnter: realizar higiene de genitales con
guantes no estriles. Secar adecuadamente el rea genital. Si el
nio no tiene control de esfnteres y no se puede realizar puncin
suprapbica debe tomarse la muestra por sonda vesical. Otra
mtodo es colocar bolsa recolectora, si la miccin no se da en 20
minutos se deber repetir el aseo y colocar nueva bolsa (6). La
bolsa recolectora es el mtodo menos traumtico de obtener la
muestra de orina, ofrece ms alto riesgo de contaminacin
comparado con la puncin suprapbica y el cateterismo
transuretral, la interpretacin cambia a ms de 10.000 UFC
significativas para diagnstico de IVU y no cualquier recuento como
en puncin suprapbica o ms de 100.000 UFC como por miccin
espontnea. Un solo cultivo de orina obtenido con bolsa tiene una
probabilidad alta de ser falso positivo. Su sensibilidad es del 100%:
un resultado negativo descarta la infeccin urinaria, lo que la hace
til en el seguimiento del tratamiento (7, 8, 9).
Colocar bolsa plstica adherente, verifi cando ausencia de fugas.
Estar atento cuando el nio elimine, para retirar pronto la bolsa y
evitar derramamiento o contaminacin de la muestra. Son sufi
cientes 5 - 10 cc de orina.
EQUIPO
Bolsa plstica recolectora estril.
TRANSPORTE
2
3
E. Orina obtenida a travs de sonda
de urostoma y nefrostoma
Mantener tcnica asptica para la manipulacin de este tipo de
catteres. No se recomienda puncionar ni colapsar el trayecto del
catter.
Realizar limpieza del trayecto del sitio de unin entre el
catter, la llave de tres vas y el sistema colector.
Insertar jeringa a la llave de tres vas y extraer 5-10 cc de orina.
Envasar en el frasco colector estril. Volver a comunicar el
trayecto entre el catter y el sistema colector.
EQUIPO
Guantes estriles.
Gasas estriles.
Jeringa estril.
Frasco estril de boca ancha.
TRANSPORTE
F. Orina obtenida por puncin suprapbica
Este procedimiento debe realizarlo personal mdico
entrenado, previa preparacin de la piel con tcnica asptica.
En los pacientes peditricos es ideal para el cultivo, en especial
cuando se necesitan muestras confi ables y rpidas antes de
iniciar terapia inmediata en nios muy enfermos.
2
4
Las complicaciones si se sigue una tcnica adecuada son muy
raras.
En lactantes con micciones frecuentes la puncin suprapbica
puede fallar si al realizarla hay escasa orina en la vejiga; en
estos casos se recomienda tomar la muestra por cateterismo
vesical transuretral (2, 10).
Puncionar con jeringa estril sobre la lnea media en tercio
medio entre el ombligo y la snfi sis pbica.
Aspirar 5 a 10 cc de orina.
Envasar en frasco estril o llevar directamente en la jeringa.
EQUIPO
Equipo de preparacin de la piel.
Jeringa estril.
Guantes estriles.
TRANSPORTE
Nota:
La solicitud de urocultivo debe estar basada en el anlisis e
interpretacin de un parcial de orina previo patolgico y
correlacionado con la clnica.
Con el fi n de aumentar la probabilidad de recuperacin de
microrganismos en pacientes con infeccin urinaria
complicada o en tratamiento con antibiticos, se
recomienda inocular la muestra en una sola botella de
hemocultivo (relacin 1:10 c.c), obtenida a travs de
cateterismo transuretral.
No se recomienda cultivar puntas de catteres urinarios,
porque el crecimiento representa fl ora uretral distal.
2
5
No se recomienda solicitar baciloscopia en muestra de
orina, ya que su positividad es normal en el tracto urinario.
El cultivo para mycobacterias en orina se debe hacer en el
volumen total de la primera miccin de la maana.
2.2 Muestras de sangre
A. Sangre obtenida a travs

de puncin perifrica
Realizar lavado de manos quirrgico.
Mantener tcnica asptica durante todo el procedimiento.
Utilizar campo estril para evitar tener contacto con reas
circundantes que ofrezca el riesgo de contaminacin.
Colocar mascarilla al paciente.
Realizar antisepsia de la zona a puncionar; no palpe la vena sin
guantes estriles una vez preparada la piel.
Utilizar otros guantes estriles para cada puncin.
No cambiar la aguja para envasar la sangre en los frascos
colectores.
En pacientes que estn recibiendo tratamiento antibitico,
recolectar las muestras en botellas con resina.
Se debe mantener una dilucin en las botellas de hemocultivos
de 1:5 para pacientes peditricos y 1:10 para pacientes adultos
de acuerdo con la recomendacin del fabricante.
Para buscar micobacterias es necesario tomar la muestra y
colocarla en heparina; se recomienda tomar muestra durante
dos das.
Colocar la muestra en botella con rtulo especfi co para
cultivos de hongos. No se recomienda obtener muestras
2
6
mediante puncin arterial porque la tasa de recuperacin de
microorganismos es baja (2, 11).
Limpiar el tapn del frasco colector con alcohol al 70% antes
depuncionar para envasar la muestra.
Obtener 8 a 10 cc de sangre para cada frasco en pacientes
adultos.
Obtener cada muestra de sitios anatmicos diferentes y con
unintervalo de 10 a 15 minutos.
Para la deteccin de microorganismos en sangre en
sospechade bacteriemia se recomienda recolectar entre 20 y
40 ml de sangre (2 a 4 botellas de hemocultivos). En sospecha
de endocarditis pueden ser sufi cientes 20 ml de sangre (2
botellas de hemocultivos).
En sospecha de bacteriemia a mayor volumen
recolectado,mayor la probabilidad de recuperacin
microbiolgica (12).
En pacientes peditricos el volumen de los hemocultivos se ajusta
de acuerdo a la edad:
Prematuros extremos (menos de 1000 gr) 0,5 ml.
Neonatos hasta 1 ml.
Lactantes y nios hasta 6 aos 2-3 ml.
Mayores de 6 aos 5-10 ml.
El nmero de botellas a tomar depende de la situacin clnica en
pacientes peditricos:
En prematuros extremos (menos de 1.000 gr) 2 botellas.
Sospecha de bacteriemia: 2 botellas.
Sospecha de endocarditis 4-6 botellas (a tomar entre 6 y 24
horas) (12, 13).
EQUIPO
Bata y campos estriles.
Gorro y mascarilla con proteccin ocular.
Guantes estriles.
Equipo de asepsia (antisptico, gasas y guantes estriles).
2
7
Frascos para hemocultivos. Frascos para hemocultivos con
rtulo especfi co para hongos.
Jeringas estriles.
TRANSPORTE
Se recomienda en los primeros 15 minutos de la recoleccin a
temperatura ambiente. De 15 das a dos meses hongos
miceliales.
Para levaduras de acuerdo con el tiempo de positividad del mi-
croorganismo puede crecer en las primeras 24 horas.
B. Sangre obtenida a travs

de catter venoso central
Realizar lavado de manos quirrgico.
Mantener tcnica asptica durante todo el procedimiento.
Utilizar campo estril para evitar tener contacto con reas
circundantes que ofrezca el riesgo de contaminacin.
Colocar mascarilla al paciente.
En pacientes que estn recibiendo tratamiento antibitico,
recolectar las muestras en botellas con resina.
Realizar desinfeccin del trayecto y sitio de conexin de
equipos de infusin al catter.
Utilizar la va proximal para la obtencin de la muestra
encatteres multilmenes (14).
No se recomienda tomar muestras a travs de catteres
arteriales, porque aumenta la posibilidad de contaminacin
(2).
Limpiar el tapn del frasco colector con alcohol al 70% antes
depuncionar para envasar la muestra.
Extraer 10 c.c de sangre para limpiar la va y desecharlos.
Con otra jeringa obtenga 10 c.c ms de sangre y djelos a un
lado por un momento.
2
8
Utilice otra jeringa para extraer 10 c.c de sangre y envasar en
el frasco de hemocultivo.
Retornar los 10 cc de sangre que haba guardado
temporalmente, previa verifi cacin de ausencia de cogulos.
Obtener 8 a 10 cc de sangre para cada frasco en
pacientesadultos.
EQUIPO
Guantes estriles.
Frascos para hemocultivos.
Jeringas estriles.
TRANSPORTE
temperatura ambiente.
C. Pacientes con sospecha de infeccin

de torrente sanguneo relacionada con
catter venoso central
En bacteriemia asociada a catter en pacientes adultos y
peditricos se debe tomar una botella de hemocultivo de sangre
perifrica y uno de sangre obtenida a travs del catter (15, 16).
TCNICA DE RECOLECCIN Obtenga 10 cc de sangre

perifrica y 10 cc de sangre del catter.
EQUIPO
2
9
Guantes estriles.
Frascos para hemocultivos.
Jeringas estriles.
TRANSPORTE
A. Pacientes con sospecha de infeccin

de torrente sanguneo relacionada con
catter venoso central
Los cultivos de puntas de catter se recomiendan cuando se
tienen hemocultivos y existe una alta sospecha de infeccin del
torrente sanguneo relacionada con el catter.
Prepare la piel del rea circundante del sitio de insercin del
catter.
Cambie de guantes y coloque campo estril.
Retire el catter y corte de 4 a 5 c.m del trayecto distal del
catter con pinza estril, y colquelo inmediatamente en el
tubo estril.
EQUIPO
Gorro, mascarilla, bata.
Campos y guantes estriles.
3
0
Equipo de preparacin de piel.
Equipo de puntos o bistur.
Tubo estril.
TRANSPORTE
TIPO DE MUESTRA:
3. SECRECIN SITIO DE INSERCIN DEL

CATTER
A. Sitio de insercin del catter vascular
La presencia de signos locales en ausencia de manifestaciones
sistmicas pueder estar asociada con reaccin a cuerpo extrao.
Prepare la piel del rea circundante del sitio de insercin del
catter.
Con escobillones estriles tome una muestra de la secreciny
coloque en tubo estril con tapa; y con el otro escobilln
realice un extendido en lmina de vidrio.
EQUIPO
Guantes estriles.
Tubo estril con tapa rosca.
Lmina de vidrio.
Escobillones estriles.
TRANSPORTE
3
1
2.3 Muestras del tracto respiratorio
Secrecin de fosa nasal
Evitar las gotas y los baos nasales antes de tomar la muestra
(6, 17, 18, 19).
No se recomienda enviar cultivos para anaerobios.
El frotis y cultivo nasal no es el cultivo para diagnstico de
sinusitis, otitis media o infecciones del tracto respiratorio
inferior.
Slo se recomienda tomar cultivo de fosas nasales anteriores
para la deteccin de portadores de Staphylococcus aureus o en
lesiones nasales. Para bsqueda de hongos se recomienda la
misma tcnica.
Colocar al paciente bajo una buena fuente de luz.
Levantar la cabeza del paciente y con la otra mano introducir
el escobilln 1 cm en el interior de las fosas nasales, rotarlo y
luego retirarlo e identifi car de qu fosa nasal se tom la
muestra.
Tomar dos escobillones, hacer con uno extendido en lmina de
vidrio; colocar el otro en el medio de transporte.
EQUIPO
Guantes no estriles.
Lmina de vidrio y tubo con medio de transporte.
TRANSPORTE
3
2
Secrecin en rea nasofarngea
La persona que obtiene la muestra debe usar barreras de
proteccin (mascarilla, proteccin ocular).
No hacer grgaras ni limpieza con ninguna solucin
bucofarngea (6, 17, 18, 19).
Tomar la muestra preferiblemente en ayunas. No se
recomienda el cultivo rutinario de nasofaringe.
Introducir el escobilln fl exible hasta la nasofaringe posterior
evitando trauma.
Rotar el escobilln por 10 a 15 segundos para permitir
laimpregnacin del hisopo.
Retirar lentamente y tomar dos escobillones, hacer con uno
extendido en lmina de vidrio y colocar el otro en el medio de
transporte.
EQUIPO
Barreras de proteccin (mascarilla y proteccin ocular).
Escobillones estriles fl exibles con alginato de calcio.
Tubo estril con medio de cultivo y lmina de vidrio.
TRANSPORTE
3
3
3
4
3. ASPIRADO NASOFARINGE
Secrecin de rea nasofarngea
La persona que obtiene la muestra debe usar barreras de
proteccin (mascarilla, proteccin ocular).
bucofarngea (6, 17, 18, 19).
Tomar la muestra preferiblemente en ayunas. No se
recomienda el cultivo rutinario.
Si se sospecha de Bordetella pertussis esta muestra deber ser
sembrada inmediatamente sea obtenida, para lo cual se
dejarn caer aproximadamente 5 gotas del aspirado
nasofarngeo sobre la superfi cie del agar Regan lowe. As
mismo, se tomar aspirado nasofarngeo en un tubo estril
para inmunofl orescencia directa.
Es colectado mediante el paso de una sonda nelaton de un
calibre apropiado dentro de la nasofaringe.
Aspirar luego el material con una jeringa estril u otro
mecanismo de succin y colocarlo en tubo estril seco.
En caso de no poder recolectar la muestra en la jeringa, enve
el extremo distal de la sonda con el material aspirado en el
tubo estril seco.
En virologa los aspirados nasofarngeos son usualmente
colocados en medio de transporte para virus.
EQUIPO
Barreras de proteccin (mascarilla y proteccin ocular).
35
TIPO DE MUESTRA:
Tubo estril seco o medio de transporte para virus.

Sonda nelaton de tamao ideal.
Jeringa estril.
TRANSPORTE
Secrecin de la faringe
No contaminar el escobilln con secrecin de cavidad oral
odientes.
El hisopado de garganta est contraindicado en pacientes
condiagnstico de epiglotitis.
bucofarngea (6, 17, 18, 19).
Con un bajalenguas, presionar la lengua hacia abajo para
visualizar los pilares de la faringe y del rea tonsilar para
localizar el rea de infl amacin y exudado.
Rotar el hisopo de alginato de calcio sobre el rea.
vidrio y colocar el otro en el medio de transporte.
EQUIPO
3
6
Guantes.
Escobillones estriles con alginato de calcio.
TRANSPORTE
5. ESPUTO POR EXPECTORACIN ESPONTNEA
Expectoracin secrecin respiratoria
El esputo no es la muestra ideal para el diagnstico de
neumona;se recomienda preferiblemente el lavado
broncoalveolar.
Recolectar la muestra en la maana, en ayunas preferible-
mente.
Instruir al paciente para realizar cepillado de dientes y lavado
de la lengua slo con agua para remover el exceso de fl ora oral
y retirar prtesis dental en pacientes de edad.
Para pacientes pediatricos incapaces de producir un esputo,la
terapeuta respiratoria debe obtener la muestra a travs de
succin.
Para el estudio de mycobacterias se deben colectar tres
muestrasseriadas en das consecutivos para pacientes
hospitalizados.
En pacientes ambulatorios sintomticos respiratorios
consospecha de tuberculosis, la primera muestra se toma el
da de la consulta mdica y las otras dos al da siguiente,
cumpliendo las recomendaciones descritas para paciente
hospitalizado.
37
TIPO DE MUESTRA:
Instruir al paciente para que tosa con fuerza y profundamente, con

el fi n de obtener una muestra que provenga del tracto
respiratorio inferior, libre de saliva contenida en la cavidad oral, la
cual debe expectorar directamente en un recipiente estril de
boca ancha de tapa rosca.
EQUIPO
Frasco estril de boca ancha, de 5 cm de dimetro, de
taparosca, con capacidad de 30 a 50 ml, de material fcil de
rotular (5).
TRANSPORTE
exceder de dos horas y a temperatura ambiente. En caso de no ser
inmediatamente procesada la muestra, debe ser conservada a 4C
(5).
Expectoracin secrecin respiratoria
Instruir al paciente para realizar cepillado de dientes y lavado
de lengua solo con agua.
Realizar nebulizacin con solucin salina normal.
Para pacientes peditricos incapaces de producir un esputo, la
terapeuta respiratoria debe obtener la muestra a travs de
succin.
3
8
Instruir al paciente para que tosa con fuerza y profundamente, con
el fi n de obtener una muestra que provenga del tracto
respiratorio inferior, libre de saliva contenida en la cavidad oral, la
cual debe expectorar directamente en un recipiente estril de
boca ancha de tapa rosca.
EQUIPO
Frasco estril de boca ancha de tapa rosca de 5 cm de
dimetro,con una capacidad de 30 a 50 ml y material fcil de
rotular (5).
Nebulizador.
Solucin salina normal.
TRANSPORTE
7. SECRECIN TRAQUEAL
Secrecin obtenida por aspirado traqueal.
Realice el procedimiento con tcnica asptica.
De acuerdo con las caractersticas de las secreciones, irrigar
con solucin salina normal previo a realizar el procedimiento.
Introducir la sonda sin hacer succin a travs del tubo
endotraqueal o cnula de traquestoma, hasta ubicarla en el
espacio traqueal.
Ocluya el orifi cio distal de la sonda y comience a succionar,
retire la sonda lentamente mientras la va limpiando
externamente con una gasa estril.
39
TIPO DE MUESTRA:
Tenga precuacin de suspender la succin, retirando la

oclusin de la sonda para que se conserve la muestra obtenida
en el trayecto de la misma.
Coloque la muestra obtenida en frasco estril cortando el
segmento distal de la sonda, si no es posible el depsito de la
muestra sola, para lo cual retira la presin en el orifi cio de la
sonda lo que permitar la expulsin de la muestra en el
recipiente.
EQUIPO
Guantes estriles.
Mascarilla con proteccin ocular.
Sonda de nelaton.
Hoja de bistur.
Solucin salina normal.
Gasas estriles.
Frasco de boca ancha estril o trampa recolectora.
TRANSPORTE
TIPO DE MUESTRA:
8. LAVADO O CEPILLADO BRONCOALVEOLAR
Fibrobroncoscopia para lavado broncoalveolar

Fibrobroncoscopia para cepillado broncoalveolar
4
0
El paciente debe estar en ayunas para realizar el
procedimiento, ya que se requiere de sedacin.
Tener en cuenta que los anestsicos locales pueden inhibir el
crecimiento bacteriano.
Para el cultivo de hongos y mycobacterias se realiza la
mismatcnica.
A traves de tcnica de fi brobroncoscopia.
Conecte una trampa de Lukens al fi brobroncoscopio.
Irrigar con 10 cc de solucin salina no bacteriosttica
(Lactatode Ringer) a travs del canal abierto.
Succione para obtener la muestra en dos frascos estriles de
boca ancha; de uno de estos se realiza extendido en lmina de
vidrio.
EQUIPO
Equipos de fi brobroncoscopia.
Sistema de succin.
Recipiente de boca ancha estril de tapa rosca.
Lmina de vidrio.
TRANSPORTE
4
1
2.4 Muestras lquidos corporales
TIPO DE MUESTRA:
1. LQUIDO PLEURAL, PERICRDICO,

PERITONEAL, SINOVIAL O ARTICULAR,
CULDOCENTESIS, AMNITICO
Lquidos o fl uidos de espacios estriles
La recoleccin de muestras de este origen est reservada
estrictamente al mdico especialista.
No se recomienda usar escobillones, la muestra debe ser obtenida
por aspirado o drenaje quirrgico.
Los lquidos susceptibles de formar cogulo deben ser colectados
en tubos con anticoagulante SPS (polisulfonato de sodio) para
pruebas especiales, excepto si se est hacindo busqueda de
Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae,
Peptostreptococcus y Gardnerella vaginalis. En este caso se puede
usar anticoagulante tipo heparina, citrato de sodio y EDTA (cido
etilendiaminotetrac tico).
Con el fi n de aumentar la probabilidad de recuperacin de
microorganismos, se recomienda inocular la muestra en una sola
botella de hemocultivo (relacin 1:10 cc).
Lquido amnitico y fl uido de culdocentesis deben ser
transportados en medio anaerobio. En el liquido amnitico los
virus que causan infeccin en el tero son CMV, Parvovirus B-19 y
VIH, menos frecuentemente observados virus herpes simplex (HSV)
y virus Zoster (VZV). Para bsqueda de hongos se utiliza la misma
tcnica.
Realice preparacin de la piel con tcnica asptica.
4
2
Puncionar con jeringa y aguja estril, y recoger mnimo 50 ml de
lquido repartido en los tubos necesarios:
Recoleccin en frasco aparte para citologa, bloque celular.
Recolectar en frasco con anticoagulante para citoqumico.
Recolectar en frasco con citrato de sodio para ADA, si se considera
necesario.
Recolectar en frasco estril con 25 ml para cultivo de bacterias,
hongos y mycobacterias.
Si se requiere cultivo para anaerobios se recolectar en lajeringa
manteniendo las condiciones ideales para el crecimiento de estos
grmenes, evitando la exposicin de la muestra al medio
ambiente. No olvide solicitar coloraciones Gram y ZN con cultivos
o, en caso necesario, coloraciones y cultivos para hongos. Si se
requiere PCR (reaccin en cadena de polimerasa), conservar a la
menor temperatura posible mientras se envan al sitio de
referencia, por debajo de -10C.
EQUIPO
Equipo de preparacin de piel y anestesia local.
Jeringa y aguja estril.
Tubo estril seco para cultivos.
Tubo estril con citrato de sodio para ADA.
Tubo estril con anticoagulante para citoqumico y
pruebasespeciales.
Frascos estriles para citologa y cultivo.
Frasco de hemocultivo.
Frasco de hemocultivo para hongos.
TRANSPORTE
Inmediatamente despus de la recoleccin a temperatura ambiente.
Para cultivo de mycobacterias el tubo debe ser protegido de la luz
directa. Si se requiere PCR (reaccin en cadena de polimerasa) se
debe transportar en recipiente con hielo seco.
TIPO DE MUESTRA:
4
3
2. LQUIDO CEFALORRAQUDEO
Puncin lumbar. A travs de catter de

ventriculostoma intraoperatoriamente o a travs de
cmara de vlvula de derivacin ventriculoperitoneal
Procedimiento realizado por personal mdico.
Utilice tcnica asptica.
En el caso de recolectar la muestra por puncin lumbar,
recomendar al paciente luego del procedimiento permanecer
acostado en posicin horizontal de 4 a 6 horas.
Los virus ms comnmente aislados son los enterovirus.
Realice preparacin de piel.
Obtenga de 1 a 2 ml de muestra en mnimo 3 tubos estriles secos
con tapa rosca o tapn de caucho para estudio citolgico,
citoqumico y microbiolgico. Esta muestra sirve para la bsqueda
de micobacteriosis extrapulmonar.
Si se requiere PCR (reaccin en cadena de polimerasa) para
enterovirus, herpes simple o tuberculosis, recolectar un tubo
adicional de 1ml y conservar a la menor temperatura posible
(debajo de - 10C).
EQUIPO
Equipo de puncin lumbar desechable.
Tubos estriles secos con tapa rosca o tapn de caucho.
Apsito para cubrir el sitio de puncin.
TRANSPORTE
4
4
Inmediatamente luego de la recoleccin a temperatura ambiente. Si
se requiere PCR (reaccin en cadena de polimerasa) se debe enviar el
tubo en recipiente con hielo seco.
Jugo gstrico
La sonda se debe fi jar y marcar al nivel que se introdujo, con el fi
n de evaluar si se moviliz durante la noche.
Dejar cerrada durante la noche.
Recolectar la muestra de la maana, luego de 6 horas de ayuno.
Tomar la muestra con el paciente en reposo.
Informar al laboratorio clnico el volumen probable que se va a
obtener, ya que la proporcin recomendada de fosfato trisdico
es 2 cc por cada 10 cc de jugo gstrico obtenido.
Proteger de la luz el frasco donde se recolecta la muestra durante
su transporte.
En una muestra utilizada para la bsqueda de mycobacterias en
nios y adultos que al no expectorar degluten sus esputos, para
aumentar la sensibilidad de diagnstico la muestra debe ser
recolectada de manera seriada durante tres das consecutivos.
Pasar una sonda nasogstrica la noche anterior y explicar la fi
nalidad de la misma.
En la maana y con el paciente en reposo, aspirar de 5 a 10 cc de
contenido gstrico con una jeringa estril.
Depositar la muestra en recipiente estril con fosfato trisdico al
10%.
Posteriormente instilar de 25 a 50 cc de agua destilada y aspirar
20 cc de contenido gastrico.
Agregar al recipiente estril con la muestra inicial y tapar
hermticamente.
4
5
EQUIPO
Jeringa de 10 cc.
Recipiente de boca ancha estril de tapa rosca con fosfato
trisdico al 10%, con capacidad para 50 ml.
Sonda nasogstrica.
Agua destilada.
TRANSPORTE
Inmediatamente luego de la recoleccin a temperatura ambiente,
debe protegerse de la luz.
4
7
2.5 Muestras de piel y mucosas
A. Heridas abiertas
Limpiar la herida del borde hacia afuera con gasa impregnada
con solucin salina normal y alcohol isoproplico al 70%, con el
fi n de evitar la contaminacin de la muestra con fl ora
colonizante que no est realmente implicada en el proceso
infeccioso.
Lavar la parte interna de la herida con solucin salina
abundante, sin presin. No usar antispticos.
Aspire si es posible o pase un escobilln dentro de la herida.
Tome la muestra con dos escobillones.
Si emplea medio de transporte coloque uno en dicho medio y
con el otro haga un extendido en lmina de vidrio.
Si no tiene medio de transporte coloque los escobillones en un
tubo estril con tapa.
EQUIPO
Guantes estriles.
Solucin salina normal o alcohol al 70%.
Gasa estril.
Medio transporte o frasco estril con tapa rosca o tapn de
caucho.
Lmina de vidrio.
TRANSPORTE
4
8
B. Heridas cerradas
Herida cerrada con rgano adyacente estril: lavar con jabn y
soluciones antispticas a base de yodopovidona o
clorhexidina. Posteriormente aplicar alcohol isoproplico al
70%.
Herida cerrada con rgano adyacente no estril: limpiar con
solucin salina normal y luego alcohol isoproplico al 70%.
Cuando se toman muestras para anaerobios por aspiracin no
se recomienda colocar tapn de caucho en la aguja, por riesgo
de accidente biolgico. Utilice el capuchn de la aguja.
Puncionar el absceso con aguja y jeringa estriles.
Colocar el material obtenido en tubo estril con tapa o dejar el
material en la jeringa, mantener las condiciones ideales para el
crecimiento de grmenes anaerobios evitando la exposicin de
la muestra al medio ambiente.
Cuando no se realiza puncin-aspiracin, tomar la muestra con
los escobillones del medio de cultivo para anaerobios.
EQUIPO
Guantes estriles.
Solucin salina normal o alcohol al 70%.
Gasa estril.
Jeriga con agujas estriles.
Medio de cultivo para anaerobios.
TRANSPORTE
En caso de enviar la muestra en jeringa con aguja protegida por el
capuchn, el transporte debe ser inmediato para garantizar el
crecimiento de grmenes anaerobios. Si se enva la muestra en
4
9
tubo estril con tapa, se recomienda hacerlo en los primeros 15
minutos de la recoleccin a temperatura ambiente.
Nota:
En este tipo de muestras es posible realizar aislamientos para
hongos; se debe tener en cuenta el tiempo de incubacin
para los hongos miceliales.
2.6 Muestras de biopsia y tejidos
A. Segmento de tejido de cualquier

sitio anatmico
Realizar preparacin antisptica del rea de donde se va a
tomar la biopsia.
Conservar la esterilidad de la muestra hasta su recepcin en el
laboratorio clnico o de patologa.
Colocar la muestra de tejido en solucin salina no
bacteriosttica(lactato de Ringer).
No agregar formol a la muestra que se va a enviar al
laboratorio clnico.
Se recomienda tomar cultivo de biopsia tejido para lesiones
relacionadas con lceras de presin, lceras varicosas,
quemaduras y pie diabtico, realizar limpieza previa con
solucin salina estril.
Si el cultivo de biopsia tejido no es posible de realizar,
aspirematerial infl amatorio de la base de la lesin.
No se recomienda hacer bsqueda de anaerobios en este tipo
de lesiones.
5
0
Este procedimiento debe ser realizado por el mdico.
Seccionar la muestra en fresco para enviar a patologa y al
laboratorio clnico.
EQUIPO
Equipo para preparacin de piel.
Frasco estril para la muestra microbiolgica.
Frasco limpio para la muestra patolgica.
Solucin salina no bacteriosttica (lactato de Ringer).
TRANSPORTE
Inmediatamente despus de la recoleccin a temperatura
ambiente.
B. Aspirado de mdula sea
Preparacion de la piel con tcnica asptica.
Procedimiento realizado por mdico bajo anestesia local.
Para bsqueda de hongos se sigue la misma tcnica.
TCNICA DE RECOLECCIN Aspirar y colectar de

la cresta iliaca posterior superior.
EQUIPO
Equipo para preparacin de piel.
2 botellas para hemocultivo (mycobacterias, aerobios y
hongos).
TRANSPORTE
5
1
2.7 Muestras de heces
Materia fecal
No cultive muestras de consistencia dura.
Para estudio de rotavirus y Clostridium diffi cile, enviar muestra
diarreica y no utilizar escobilln.
En el caso de pacientes peditricos, si no es posible recoger
muestra de materia fecal se puede tomar la muestra a travs
de frotis rectal.
No se recomienda realizar coprocultivo de rutina para
pacientescon estancia hospitalaria mayor de 3 das, a no ser
que el diagnstico de ingreso haya sido gastroenteritis.
Recolectar en lo posible ms de 2 cc o gramos de materia fecal.
EQUIPO
Guantes.
Frasco plstico limpio, de boca ancha.
TRANSPORTE
Se recomienda durante la primera hora luego de la recoleccin a
temperatura ambiente. Para estudio de mycobacterias debe
enviarse inmediatamente al laboratorio, protegida de la luz
directa.
5
2
Hisopado rectal
Recomendado en pacientes peditricos y adultos incapaces de
recolectar muestra de materia fecal.
Recomendado para deteccin de Neisseria gonorrhoeae,
Shigella, Campylobacter, Herpes simplex y portadores de
Streptococcus del grupo B y otros Streptococcus Beta-
hemolytico.
La muestra fecal debe ser visible en el escobilln para la
deteccin de los patgenos.
En virologa la muestra es til para la deteccin de virus
entricos como: adenovirus, calicivirus, astrovirus y rotavirus.
Para bsqueda de enterovirus polioviurs o no poliovirus en
pacientes con sndrome Guillain Barr.
Cuidadosamente introducir el escobilln una pulgada en el
esfnter anal.
Rotar suavemente el escobilln para obtener la muestra.
EQUIPO
Escobillones.
Tubo estril con tapa rosca o tapn de caucho.
TRANSPORTE
temperatura ambiente. Estudios virales deben enviarse al
Instituto Nacional de Salud en medio de transporte viral.
2.8 Muestras ticas, oculares y dentales
5
3
Secrecin conjuntival Raspado corneal Aspirado de

fluido vtreo
No usar gotas oftlmicas 18 a 24 horas antes de la muestra.
Ausencia de cualquier cosmtico.
No tomar antibiticos 24 a 48 horas antes.
No usar anestsicos que posean actividad antimicrobiana.
En el caso de obtencin de la muestra intraoperatoriamente,el
mdico especifi car el sitio de donde se tom la muestra:
corneal, del humor acuoso, etc.
Si sospecha endoftalmitis enve muestra de aspirado
intraocular.
Si sospecha queratitis tome dos muestras con escobillones
impregnados con alginato de calcio.
Los virus ms comnmente aislados son HSV, adenovirus, CMV y
VZV.
Secrecin conjuntival: tome una muestra por cada ojo con
escobillones separados, previamente humedecidos con
solucin salina. Rote el escobilln en cada conjuntiva, coloque
un escobilln en el medio de transporte o en tubo estril seco
con tapa rosca o tapn de caucho y con el otro realice
extendido en lmina de vidrio.
Raspado corneal: esta muestra es recolectada por el
especialista.
Use esptula estril y raspe las lesiones o lceras e inocule la
muestra en el medio de transporte o en tubo estril seco con
tapa rosca o tapn de caucho; realice extendido en lmina de
vidrio.
Aspirado de fl uido vtreo: utilice tcnica asptica para realizar
puncin por aspiracin.
5
4
EQUIPO
Guantes estriles
Escobillones estriles, jeringa y aguja estriles
Medio de transporte (agar sangre o chocolate) y lmina de
vidrio.
TRANSPORTE
Inmediatamente luego de la recoleccin a temperatura ambiente.
Paciente con secrecin proveniente del odo
No usar gotas ticas de 18 a 24 horas antes de la toma de
lamuestra.
No tomar o aplicar antibiticos de 24 a 48 horas antes.
Otitis supurativa requiere confi rmacin con cultivo de la
secrecin.
Pacientes con otitis supurativa con probable ruptura de
tmpano no practicar lavado.
Si la sospecha de infeccin es de otitis media la muestra deber
ser tomada por un especialista a travs de timpanocentesis. No
se recomienda hacer de rutina, sino en aquellos casos crnicos
que no responden a la terapia instaurada.
55
Este procedimiento lo debe realizar un mdico especialista.
No se recomienda toma de muestras con escobilln rotado
enotitis media o externas supurativas.
De ser posible la muestra debe ser tomada con ayuda de
microscopio por otorrinolaringlogo.
Si la membrana timpnica est intacta se har con puncin
timpnica en casos de otalgia intensa, paciente inmunosuprimido,
neonato.
La toma por escobilln cuando hay otorrea est sujeta amayor
contaminacin externa, no ayuda mucho y por el contrario,
confunde a quien no sabe cmo interpretar los resultados.
EQUIPO
Solucin antisptica.
Medio de transporte y lmina de vidrio.
TRANSPORTE
exceder de dos horas y a tempertatura ambiente.
Gingival, periodontal, periapical, estomatitis

de Vicent
Limpie cuidadosamente el margen gingival y la superfi cie dental
supragingival, para remover la saliva, los detritos y la placa.
Usando una esptula periodontal remueva cuidadosamente
material de la lesin subgingival y transfi ralo al medio de
transporte anaerobio.
Realice extendido en lmina de vidrio para coloracin de Gram.
EQUIPO
Mascarilla, proteccin ocular.
Esptula periodontal.
Medio de transporte anaerobio y lmina de vidrio.
TRANSPORTE
57
2.9 Muestras para deteccin de hongos

MUESTRAS MICTICAS
Capas superficiales de la piel Cabello Cuero cabelludo
No aplicar ningn tratamiento fngico oral o tpico por lo menos
3 das antes.
No aplicar cremas, ungentos o polvos en el sitio de la toma de la
muestra.
La toma de la muestra debe ser realizada por personal experto.
Limpiar la zona afectada con alcohol al 70%; dejar secar.
En lesiones secas raspar los bordes de la lesin y de varios sitios
con el bistur estril; depostelos directamente en la caja de petri.
En lesiones hmedas obtenga la muestra con un escobilln de
dacrn y colquelo en un tubo estril.
Si son pelos, tome con pinzas estriles por lo menos 15 de ellos;
depostelos en caja de petri.
Las muestras recolectadas servirn para cultivo y realizar la prueba
de KOH.
EQUIPO
Guantes estriles, mascarilla.
Gasas estriles.
Alcohol al 70%.
Escobillones de dacrn.
Bistur estril.
5
8
Pinzas estriles.
Tubo estril.
Cajas de petri.
TRANSPORTE
Inmediato a temperatura ambiente
TIPO DE MUESTRA:
2. LQUIDOS Y FLUIDOS CORPORALES
Capas profundas de la piel lesionada Abscesos

Lesiones nodulares
En micosis subcutnea se puede obtener diferente
materialentre los que se encuentra pus o exudados de lesiones
que drenen.
Si hay sospecha de esporotricosis se debe dejar una gasa
durante 24 horas para recoger el material a examinar o toma
de biopsia por dermatlogo (13, 20).
Si la coleccin se presenta como un absceso se debe aspirar
con jeringa y aguja estriles;
Si la secrecin est en una lesin abierta se toma la
muestracon escobilln estril preferiblemente de dacrn.
EQUIPO
Guantes estriles.
Mascarilla.
Gasas estriles.
Jeringas estriles.
59
Tubos estriles.
Escobilln de dacrn.
TRANSPORTE
Inmediato a temperatura ambiente.
Material purulento, material necrtico

y material de lceras.
Procedimiento mdico bajo tcnica asptica.
Realizar raspado de la crnea con una esptula de platino y
depositar la muestra sobre medio de cultivo y realizar lmina
para coloracin.
El fl uido vtreo necesita aspiracin y puede colocarse
directamente en el medio o en un tubo estril (13, 20).
EQUIPO
Equipo de asepsia: mascarilla, guantes y campo estriles.
Esptula de platino.
Botellas de hemocultivo.
TRANSPORTE
Inmediato a temperatura ambiente
6
0
Espacio medular
Enviar, adems de LCR, un tubo con suero sanguneo 2 cc
refrigerado.
Enviar con resumen de historia clnica.
Procedimiento realizado por personal mdico.
Preparacion aseptica de la piel: el paciente debe estar
recostado sobre un costado con el torso doblado hacia
delante.
Bajo anestesia local se introduce una aguja larga en el
conducto espinal; no necesita ser aspirado, fl uye por presin
en individuos sanos.
Obtener mnimo 3 cc de LCR en tubo estril tapa rosca (20).
EQUIPO
Equipo de asepsia: mascarilla, guantes y campo estriles.
Equipo de puncin lumbar.
TRANSPORTE
Inmediato a temperatura ambiente.
Cabellos quebrados, lesiones de cuero cabelludo
No aplicar ningn tratamiento fngico oral o tpico por lo
menos 3 das antes.
No aplicar cremas, ungentos o polvos en el sitio de la toma de
la muestra.
61
Raspar los bordes activos de la lesin.
Obtenga escamas, costras o partes del cabello afectado y
recoja material de los bordes de las lesiones.
En afecciones del cuero cabelludo, retire con pinzas los
cabellos sin brillo, quebradizos.
La muestra se coloca en una caja de petri limpia (13, 20).
EQUIPO
Equipo estril con pinzas, tijeras, cajas de petri, guantes,
tapabocas.
TRANSPORTE
Menos de dos horas a temperatura ambiente.
Material raspado, costras o escamas
menos 8 das antes.
la muestra.
Lave bien el sitio de la lesin, con agua y con jabn, y luegocon
alcohol al 70%, utilizando gasa; no use algodn y deje secar.
Con bistur estril raspe el borde de la lesin y recoja el
material que se desprende.
Recoja las costras o escamas con pinzas estriles.
6
2
Coloque el material raspado, las costras o escamas en una caja
de petri estril y asegure la tapa con cinta adhesiva para que
no se abra (13, 20).
EQUIPO
Equipo estril con pinzas, tijeras, cajas de petri, guantes,
tapabocas.
TRANSPORTE
Menos de dos horas a temperatura ambiente.
Raspado, corte y fragmentos de ua
menos 3 das antes.
la muestra.
No debe tener esmalte aplicado en las uas.
Lavar bien el sitio de la lesin, con agua y con jabn y luego con
alcohol al 70%,utilizando gasa. No usar algodn.
Deje secar.
Con bisturi estril raspe la zona afectada y recoja el detritus,
debajo de la ua.
Coloque el material en una caja de petri estril y asegure la
tapa con cinta adhesiva para que no se abra.
63
EQUIPO
Equipo estril de pinzas, tijeras, bistur, cajas de petri estriles,
guantes, tapabocas.
TRANSPORTE
Menor a 72 horas a temperatura ambiente.
Material del canal auditivo externo
No usar ningn medicamento 18 a 24 horas previo a la toma
de la muestra.
Rotar el escobilln fi rmemente en el canal externo del odo,
previamente humedecido con agua destilada estril o solucin
salina estril.
Realizar lmina para coloracin de Gram.
EQUIPO
Escobilln, tubo tapa rosca o tapn de caucho. Enviar el
escobilln en un tubo estril con tapa de rosca con 1 cc de
solucin salina.
TRANSPORTE
Inmediatamente a temperatura ambiente.
6
4
Secrecin uretral
Verifi car que se haya realizado una limpieza previa y adecua-
da de los genitales externos para eliminar secreciones
contaminantes.
La muestra se debe tomar al menos una hora despus de que
el paciente haya orinado.
Realice masaje prosttico para tomar la muestra; si se observa
la salida de material por la uretra recolctelo en un tubo seco
estril.
En caso de no obtener drenaje con el masaje uretral, lave en el
rea periuretral con antisptico y enjuague con agua.
Inserte un escobilln estril pequeo 2 a 4 cm dentro de
lauretra, rtelo y djelo introducido al menos por 2 segundos
para facilitar la absorcin (18,19).
EQUIPO
Equipo para higiene externa (Jabn antisptico, gasas).
Tubo estril.
TRANSPORTE
6
5
2.10 Muestras tracto genitourinario
GENITALES FEMENINOS
A. Secreciones de la glndula de Bartholin
Se recomienda realizar slo estudio de anaerobios.
La recoleccin de esta muestra la realiza personal mdico.
Realice tcnica de preparacin de piel.
Realice puncin para aspirar lquido de la glndula.
Coloque la muestra en el medio de transporte para anaerobios.
EQUIPO
Guantes estriles.
Medio de transporte para anaerobios.
TRANSPORTE
B. Secreciones cervicales
La paciente debe haber suspendido el tratamiento
antibitico,aplicacin de ovulos o duchas vaginales 3 das antes de
la toma de la muestra.
Evitar tener relaciones sexuales 3 das antes de la toma de la
muestra y no realizar la toma durante el sangrado menstrual.
6
6
Este procedimiento est contraindicado en pacientes
embarazadas.
Utilizar espculo estril o desechable. No usar lubricantes durante
el procedimiento.
En caso de sospechar presencia de Chlamydia trachomatis tomar
la muestra con el escobilln de transporte correspondiente
suministrado por el laboratorio; en este caso no se realiza
extendido en lmina de vidrio.
Con un primer escobilln estril remover moco y secreciones del
orifi cio de entrada del cuello cervical, y desecharlo.
Con un nuevo escobilln estril tome cuidadosamente la muestra
del canal endocervical y colquelo en tubo estril con tapa rosca
o tapn de caucho.
Con otro escobilln realice extendido en lmina de vidrio.
EQUIPO
Escobilln estril.
Tubo estril con tapa rosca o tapn de caucho.
TRANSPORTE
Se recomienda inmediatamente sin exceder ms de 15 minutos y a
C. Productos de la concepcin
No se recomienda hacer cultivo de loquios, por alta probabilidad de
resultados rroneos.
Este procedimiento lo realiza personal mdico.
6
7
Enviar una porcin de tejido en recipiente estril.
Verifi car el envo de muestra para cultivo anaerobio.
EQUIPO
Recipiente estril.
TRANSPORTE
D. Secreciones vaginales
La paciente no debe aplicar ovulos o duchas vaginales 24
horasantes de la toma de la muestra.
Verifi car que se haya realizado una limpieza adecuada de los
genitales externos previamente, para eliminar secreciones
contaminantes.
Obtener secrecin de la membrana mucosa de la pared vaginal
con un escobilln estril.
Con el escobilln estril realice extendido en lmina de vidrio y
con otro escobilln colquelo en tubo estril con un mililitro de
solucin salina estril para bsqueda de Trichomonas, Gardnerella
vaginalis y hongos.
EQUIPO
Lmina de vidrio.
Tubo estril.
Solucin salina.
TRANSPORTE
6
8
Hacer la lectura lo ms pronto posible; de lo contrario, mantener el
tubo con el escobilln a 37C con el fi n de evitar la prdida de
movilidad de las Trichomonas.
A. Secreciones uretrales
Verifi car que se haya realizado una limpieza adecuada de los
genitales externos previamente, para eliminar secreciones
contaminantes.
La muestra se debe tomar al menos una hora despus de que el
paciente haya orinado.
Realice masaje prosttico para tomar la muestra; si se observa la
salida de material por la uretra, recolctelo en un tubo seco
estril.
En caso de no obtener drenaje con el masaje uretral, realice lavado
en el rea periuretral con antisptico y enjuague con agua.
Inserte un escobilln estril pequeo 2 a 4 cm dentro de lauretra,
rtelo y djelo introducido al menos por 2 segundos para facilitar
la absorcin (18, 19).
EQUIPO
Equipo para higiene externa (jabn antisptico, gasas, jarra
conagua).
Tubo estril.
TRANSPORTE
6
9
B. Secrecin prosttica
Verifi car que el paciente haya evacuado la vejiga.
Realice la limpieza del meato uretral con agua y jabn.
Realice masaje prosttico a travs del recto y recolecte el fl uido
expulsado a travs de la uretra en un tubo estril o recolecte ms
de un mililitro.
EQUIPO
Escobilln de transporte o tubo estril.
TRANSPORTE
Lesiones genitales
Realice limpieza de las lesiones con solucin salina estril antes de
tomar la muestra.
Los virus aislados con mayor frecuencia de lesiones genitales son
HSV-1 y HSV-2, CMV y virus de papiloma humano.
Con una hoja de bsturi remueva la superfi cie de la lesin.
Mientras presiona fi rmemente la base de la lesin, permita que el
trasudado se acumule y con el escobilln estril recolecte la
muestra y colquelo en tubo estril.
66
EQUIPO
Escobilln de transporte.
Tubo estril.
TRANSPORTE
7
1
2.11 Lista de chequeo
MANUAL PARA LA TOMA DE MUESTRAS
PARA ANLISIS MICROBIOLGICO
Objetivo: verifi car el cumplimiento de las recomendaciones para la toma de los diferentes
tipos de muestras microbiolgicas, segn manual establecido con el fi n de garantizar la
calidad del resultado.
Fecha:_____________ Servicio:_____________
NO
SOLICITUD DEL ESTUDIO S NO OBSERVACIONES
APLICA
1. En la orden de solicitud de la toma
de muestras para anlisis
microbiolgico se especifi ca de forma
completa el estudio requerido.
microbiolgico aparece el diagnstico
presuntivo del paciente.
microbiolgico se informa el uso de
antibiticos u otros medicamentos que
puedan infl uir en el resultado.
PRECAUCIONES DE BIOSEGURIDAD
4. Utiliza los elementos de proteccin

personal (gafas o mascarilla con visera,
mascarilla, guantes, bata, contenedor
de cortopunzantes).
PREPARACIN DE ELEMENTOS
5. De acuerdo con la solicitud de toma

microbiolgico, prepar el equipo
completo y necesario para la correcta
toma, conservacin y transporte de la
muestra.
6. Prepara el equipo de asepsia y
antisepsia:
- Guantes estriles.
- Gasas estriles.
- Jabn y solucin antisptica.
- Alcohol al 70 % y alcohol yodado.
- Batas y campos estriles.
PREPARACIN DE LA PIEL, LIMPIEZA Y ANTISEPSIA (En la toma de muestras que
se requiera)
7. Realiza lavado de manos clnicos y se
coloca guantes estriles.
Contina
68
NO
SOLICITUD DEL ESTUDIO S NO OBSERVACIONES
APLICA
8. Aplica jabn antisptico en una gasa

estril y con movimientos circulares
del centro a la periferia realiza friccin
mecnica del sitio a friccionar o
penetrar.
9. Repite el proceso anterior con una
gasa estril impregnada en solucin
antisptica.
10. Finaliza con la aplicacin en el sitio
a puncionar o penetrar, alcohol al 70 %
o alcohol yodado con una gasa estril.
11. Deja secar espontneamente el
alcohol antisptico sobre la piel
durante 2 minutos.
IDENTIFICACIN DE LA MUESTRA
12. La muestra para anlisis

microbiolgico es etiquetada con los
siguientes datos bsicos:
- Nombre completo de paciente y
edad.- Nmero de historia clnica.
- Habitacin donde se encuentra
ubicado el paciente o servicio de
localizacin.
- Tipo de muestra y sitio anatmico.
- Fecha y hora de recoleccin.
- Iniciales de la persona que obtiene
la muestra.
13. Coloca en el frasco recolector
adecuado, el material obtenido en la
toma de muestra para anlisis
microbiolgico.
14. Cumple con el tiempo mximo
estipulado para el transporte de
acuerdo con la muestra para anlisis
microbiolgico.
Evaluado: ________________________________________________
7
3
Evaluador: ________________________________________________
RECOMENDACIONES: _________________________________________
Puntaje aprobado: la persona conoce y est capacitada para realizar este procedimiento cuando
cumpla con ms del 80 % de las recomendaciones del manual.
Puntaje no aprobado: la persona requiere una nueva capacitacin y evaluacin para asegurar el
procedimiento de toma muestras cuando cumpla con menos del 60 % de las recomendaciones del
manual.
Informar y retroalimentar al evaluado para que identifi que las debilidades encontradas y hacer un
plan de mejoramiento.
Indicadores de cumplimiento
1. Porcentaje de personas por servicio con evaluaciones aprobadas = Nmero de evaluaciones
aprobadas/total de evaluaciones realizadas.
2. Porcentaje de contaminacin = Nmero de aislamientos considerados contaminados/total de
muestras procesadas en un perodo.
3. Porcentaje de muestreos rechazados = Nmero de muestras mal recolectas/total muestras
tomadas.
Proceso de divulgacin
Manual para la toma de muestras para
anlisis microbiolgico
Objetivo:
Verifi car que el personal de la institucin encargado de la toma de muestras

conozca el Manual para la toma de muestras para anlisis microbiolgico.
Servicio: ________________________ Fecha: ______________________
Total personas del servicio: __________ Total de asistentes a la divulgacin:

__________________
Indicador:
1. Porcentaje de asistencia = Nmero de asistentes / total de esperados del

servicio *100
2. Porcentaje de servicios cubiertos = Nmero de servicios capacitados / total

de servicios a capacitar*100
Contenido de la sesin:
1. Presentacin del objetivo del Manual.
2. Clasifi cacin segn tipo de muestras.
3. Explicacin de los cuadros de consulta: cada tipo de muestra contiene una

tabla con el listado de elementos necesarios, el mtodo para la recoleccin,
los cuidados y las recomendaciones especiales, y el tiempo de transporte.
4. Firma de asistencia a la sesin de divulgacin.
5. Entrega del Manual a la jefe de servicio.

3. Muestras ambientales
En dcadas pasadas y en medio del desinters general en el

personal de salud, los departamentos de epidemiologa
hospitalaria se dedicaban principalmente a la toma de cultivos
ambientales y a la obtencin de inferencias de cmo el medio infl
ua en la aparicin de infecciones en los pacientes, aceptndolas
con frecuencia como complicaciones naturales e inevitables. Las
tasas de infeccin se consideraban poco, por lo cual no sorprende
que las tasas ofi ciales fueran siempre cercanas a cero.
Actualmente se sabe que los cultivos ambientales son de muy
poca utilidad a pesar de su alto costo, y que todos los esfuerzos
deben iniciar con la formacin de un grupo de personas que
coordinen las acciones de control, en lo que se conoce como el
Comit de infecciones intrahospitalarias. Este Comit y el
laboratorio de microbiologa, como miembro del mismo, deben
actuar en conjunto para evitar la sobrecarga de estudios que
brinden poca informacin y garantizar la toma de muestras que
sean indispensables para la accin.
Como parte de la investigacin de brotes se ha contemplado la
utilidad de tomar muestras de reas hospitalarias y del personal,
que deben tomarse tan pronto como sea posible, teniendo en
cuenta que los resultados son soporte esencial al momento de
evaluar las hiptesis dentro del proceso de investigacin del
evento.
El manual contiene aspectos relacionados con la tcnica de toma
de muestras, los equipos requeridos y el transporte adecuado al
laboratorio.
- 71 -
79
3.1 Superfi cies, soluciones y ambientes
MUESTRAS AMBIENTALES
Pisos, paredes, mesas, mesones, camillas, etc.
Utilizar escobillones estriles, verifi car la vigencia y esterilidad del
equipo para la toma de las muestras (caldo y medios de cultivo).
Las muestras deben ser recolectadas con elementos de proteccin
como guantes, tapabocas, gorro y bata.
En caso de ser recolectadas por evento de brote por infecciones
intrahospitalarias, se recomienda recolectarlas antes de la
limpieza y desinfeccin.
En el caso de requerirse evaluar el proceso de limpieza y
desinfeccin, se debe tomar despus del mismo.
TCNICA RECOLECCIN
Existen dos formas de anlisis:
La cualitativa: con un escobilln estril, humedecido en caldo de
cultivo estril, se toma la muestra rotndolo sobre s mismo y
recorridendo la superfi cie a tomar y se pasa a un medio de cultivo
directamente o se puede pasar a un caldo de cultivo para
incubarlo y luego pasarlo al medio de cultivo.
La cuantitativa: se toma con un escobilln estril con ayuda de una
plantilla de, por ejemplo: 5,10,20 cm2 para luego realizar siembra
en placa profunda que permite realizar un recuento y reportarlo
por UFC/ml. La forma cuantitativa se realiza por mtodos de
contacto y existen las siguientes opciones: 1) por medio de la
ayuda de una plantilla (5,10,20 cm2) adquirida comercialmente o
fabricada por el usuario en un material que se pueda esterilizar, y
depositar el escobilln en un tubo que contenga 10 ml de de caldo
de cultivo o agua peptonada; esto con el fi n de poder realizar
74
diluciones y sembrar en profundidad; 2) el mtodo rodac; y 3) el

mtodo de petrifi lm (30,31,32).
EQUIPO
Tubos con caldo de cultivo o agua peptonada.
Guantes.
Tapabocas, segn tcnica a utilizar: cajas para el mtodorodac,
lminas de petrifi lm, plantilla estril, medios de cultivo especfi
cos para microorganismos mesfi los, coliformes, hongos y
levaduras.
TRANSPORTE
A. Soluciones - Jabones desinfectantes
Existen dos alternativas: 1) que las muestras sean tomadas y
analizadas por laboratorios con experiencia industrial; 2) que sean
procesadas en el laboratorio clnico (rea de microbiologa),
teniendo en cuenta que se debe contar con los caldos y los medios
de cultivo necesarios para su procesamiento.
1. En caso de ser procesadas por el laboratorio clnico de la
institucin, se recomienda tomar una alicuota del jabn, solucin
o desinfectante, preferiblemente del frasco del tiempo
81
del evento. Se puede realizar utilizando: a) la tcnica de dilucin

en tubo; b) la tcnica de la placa en agar; c) tcnica del coefi ciente
fenlico (utilizada especfi camente para comparar el poder
desinfectante de un agente qumico frente al fenol).
2. En caso de contratar un laboratorio con experiencia industrial,
ellos mismos se encargarn de recolectar las muestras (32,33).
EQUIPO
Caldos y medios de cultivo para identifi car microorganismos mesfi
los, coliformes, hongos y levaduras.
TRANSPORTE
B. Aguas - Leches
como guantes, tapabocas, gorro y bata. Existen dos alternativas:
1) que las muestras sean tomadas y analizadas por laboratorios
con experiencia industrial; 2) que sean procesadas en el
laboratorio clnico (rea de microbiologa), teniendo en cuenta
que se debe contar con los caldos y los medios de cultivo
necesarios para su procesamiento.
En caso de ser procesadas por el laboratorio clnico de la institucin,
se recomienda tomar una alicuotas de aguas o leches,
preferiblemente en el tiempo del evento.
EQUIPO
Para leches: caldo verde brillante, Buffer fosfato sdico o agua
peptonada 1%.
76
Para aguas: Sustrato defi nido o fi ltracin de membrana.

TRANSPORTE
A. Sedimentacin
Utilizar cajas con medios que hayan pasado la prueba de
esterilidad.
Nota: no se encontr evidencia bibliogrfi ca que sustente su utilidad
y la calidad de sus resultados.
Dejar un nmero de cajas, de medio de cultivo (agar nutritivo, agar
BHI o agar sangre) abiertas, de acuerdo con el tamao del espacio
a estudiar por un perodo entre 15 a 30 minutos; cerrar luego las
cajas y enviarlas a incubar (35,36).
EQUIPO
Cajas de agar nutritivo, agar sangre o agar BHI.
TRANSPORTE
B. Muestreador de aire
83

Garantizar que el equipo este funcionando correctamente.
No se encontr evidencia bibliogrfi ca que sustente su utilidad y
la calidad de sus resultados.
Este mtodo es costoso.
El aire muestreado se hace incidir sobre un medio de cultivo
determinado, segn se pretenda valorar bacterias u hongos
(30,31,32,33,34,35,36).
EQUIPO
Equipo muestreador de aire.
Cajas con medios de cultivo.
TRANSPORTE
85
3.2 Muestras en personas
MUESTRAS AMBIENTALES
A. Manos
Utilizar escobillones estriles, verifi car la vigencia y esterilidad
del equipo para la toma de las muestras (caldo y medios de
cultivo).
Las muestras deben ser recolectadas con elementos de
proteccin como guantes, tapabocas, gorro y bata.
En caso de ser recolectadas por evento de brote por
infecciones intrahospitalarias, se recomienda recolectarlas sin
avisar al personal con el fi n de evaluar el proceso de lavado
de manos.
Procesar mano derecha y mano izquierda por separado.
Existen dos formas de anlisis:
La cualitativa: con un escobilln estril, humedecido en caldo
de cultivo estril, se toma la muestra rotndolo sobre s mismo
y recorridendo la superfi cie de la mano (palma, dorso, lecho
ungueal, espacio intergidital), se pasa a un medio de cultivo
directamente o se puede pasar a un caldo de cultivo para
incubarlo y luego pasarlo al medio de cultivo.
La cuantitativa: 1) se toma con un escobilln estril y se
recolecta en un tubo que contenga 10 ml de caldo o agua
peptonada para realizar siembre en profundidad y reportarlo
por UFC/ml; 2) el mtodo rodac; 3) el mtodo de petrifi lm
(37,38,39,40,41,42).
EQUIPO
Tubos con caldo de cultivo o agua peptonada.
80
Guantes.
Tapabocas.
Cajas para el mtodo rodac.
Lminas de petrifi lm.
Medios de cultivo especfi cos para microorganismo mesfi los,
coliformes, hongos y levaduras.
TRANSPORTE
B. Nasal
Evitar las gotas y los baos nasales antes de tomar la muestra
(6, 17, 18, 19).
No se recomienda enviar cultivos para anaerobios.
Slo se recomienda tomar cultivo de fosas nasales anteriores
para la deteccin de portadores de Staphylococcus aureus o en
lesiones nasales.
Para bsqueda de hongos se recomienda la misma tcnica.
Levantar la cabeza del paciente y con la otra mano introducir
el escobilln 1 cm en el interior de las fosas nasales, rotarlo y
luego retirarlo e identifi car de qu fosa nasal se tom la
muestra.
vidrio y colocar el otro en el medio de transporte
(37,38,39,40,41,42).
8
7
EQUIPO
TRANSPORTE
C. Faringe
No contaminar el escobilln con secrecin de cavidad oral o
dientes.
El hisopado de garganta est contraindicado en pacientes con
diagnstico de epiglotitis.
bucofarngea (6, 17, 18, 19).
TCNICA RECOLECCIN
Con un bajalenguas presione la lengua hacia abajo para
visualizar los pilares de la faringe y del rea tonsilar para
localizar el rea de infl amacin y exudado.
Rote el hisopo sobre el rea.
vidrio y colocar el otro en el medio de transporte
(37,38,39,40,41).
EQUIPO
Guantes.
TRANSPORTE
82

D. Uas
Utilizar escobillones estriles.
Verifi car la vigencia y la esterilidad del equipo para la toma de
las muestras (caldo y medios de cultivo).
Cultivar las uas de cada mano por separado.
Para el estudio de microorganismos comunes se debe abrir
una caja de medio slido y las uas de la persona por cultivar
deben introducirse en el medio y permanecer de 5 a 10
segundos en esta posicin; luego se debe cerrar la caja y
llevarla a cultivar.
Otra forma es humedecer el escobilln en un caldo o solucin
salina estril y realizar un movimiento similar al de limpieza por
debajo de la ua, en las cinco uas de cada mano, y depositar
el escobilln en un tubo que contenga caldo de cultivo para
luego sembrarlas en el medio de cultivo (37,38,39,40,41).
EQUIPO
Tubos con caldo de cultivo.
Escobillones.
Guantes.
Tapabocas.
TRANSPORTE
temperatura ambiente
8
9
E. Coprocultivo
No cultive muestras de consistencia dura.
Para estudio de rotavirus y Clostridium diffi cile, enviar muestra
diarreica y no utilizar escobilln.
Es recomendable para el personal asistencial del lactario,
cocina y del personal asistencial de los servicios cuando se
sospecha Enterococcus faecalis y Enterobacterias lactosa
negativa.
Recolectar en lo posible ms de 2 cc o gramos de materia fecal
(37,43,44).
EQUIPO
Guantes.
Frasco plstico limpio, de boca ancha.
TRANSPORTE
temperatura ambiente. Para estudio de mycobacterias debe
enviarse inmediatamente al laboratorio, protegida de la luz
directa.
Glosario
Sustancias infecciosas. Sustancia que contiene un

microorganismo viable, como una bacteria, un virus, una
rickettsia, un parsito, un hongo o un prin que se sabe o se cree
en forma razonable que causa enfermedad en humanos o
animales.
Con respecto al embalaje y el transporte, las sustancias infecciosas
incluyen:
Todos los cultivos que contienen o se sospecha que contienen
un agente que puede causar infeccin.
Especmenes humanos o animales que contengan tal agente
en cantidades sufi cientes para causar infecciones.
Muestra(s) de un paciente con una enfermedad seria de causa
desconocida.
Otros especmenes que no se incluyen en las categoras
anterio-res, pero identifi cados como infecciosos por una
persona califi cada, por ejemplo, mdicos, cientfi cos, personal
de enfermera, etc.
Los especmenes diagnsticos recolectados durante la
investigacin de un brote epidmico de una enfermedad seria de
causa desconocida deben ser manejados como sustancias
infecciosas.
Especmenes diagnsticos. Cualquier material humano o animal,
incluyendo, pero no limitado a, excretas, sangre o sus
componentes, tejidos y fl uidos tisulares, recolectados con el
propsito de hacer un diagnstico o estudio. Se excluyen los
animales vivos infectados.
- 84 -
Especmenes teraputicos. Cualquier rgano humano o

sustancias biolgicas recolectados con el propsito de ser
transplantado en un organismo, considerado como receptor o de
ser aplicado como mtodo de inmunizacin.
Asepsia. Ausencia de microorganismos que pueden causar
enfermedad infecciosa.
Antisepsia. Mecanismo o proceso para inhibir o reducir el nmero
de microorganismos de la piel o tejidos vivos. La tcnica asptica
incluye el uso de principios de asepsia, elementos de barrera y
equipo estril.
Antisptico. Sustancia qumica utilizada para realizar antisepsia:
Clorhexidina 2 4%.
Yodados: jabn al 7%; solucin 10%.
Alcohol al 70%.
9
1
Bibliografa
1. Thomson BR (JR.), and Miller M. Specimen collection, transport,

andprocessing: Bacteriology. En Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH,
Pfaller MA, Yolken RH, editors. Manual of clinical microbiology. 8th ed.
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MA, Yolken RH, editors. Manual of clinical microbiology. 8th ed.
3. Organizacin Mundial de la Salud. Gua para transporte seguro
desustancias infecciosas y especmenes. Ginebra (Suiza):
WHO/EMC/97.3; 1997.
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Participantes

rea de vigilancia en Salud Pblica
Mara del Socorro Chal Palacios

Laboratorio de Salud Pblica
Stella Vanegas Morales

Hospital Universitario Fundacin Santa Fe de Bogot
Diana Bermdez Olarte

Instituto Nacional de Cancerologa
Laline Osorio
Hospital Simn Bolvar
95
Luz Mila Lpez

Hospital Santa Clara
Agradecimientos:
A las instituciones prestadoras de servicios de salud, por el

envo de protocolos y manuales institucionales de toma de
muestras; al Grupo para el Control de la Resistencia Bacteriana
en Bogot (Grebo), por su apoyo durante el proceso.
- 90 -
Conferencia de
consenso para la
toma de muestras
para anlisis
microbiolgico
- 91 -
Introduccin
La calidad y la confi abilidad en el diagnstico microbiolgico

depende en gran medida de la toma de los especmenes; este
aspecto, complementario al procesamiento, es esencial para
garantizar la calidad de todo el proceso. Existen diversos puntos
controversiales relacionados con la toma de hemocultivos,
muestras de origen hemtico, tegumentario y respiratorio. Estos
aspectos fueron identifi cados durante la revisin ampliada que
llev a la construccin del Manual para la toma de muestras para
anlisis microbiolgico adelantado por el rea de vigilancia en
salud pblica de la Secretara Distrital de Salud de Bogot, D. C.
Este documento contiene la sntesis de una reunin distrital de
consenso que deliber sobre cuatro aspectos esenciales, en los
que la evidencia disponible no era sufi ciente para la adopcin de
una recomendacin precisa.
Este cuerpo de recomendaciones complementa los elementos
incluidos en el Manual, y pretende generar recomendaciones
estandarizadas para la red de prestadores pblicos y privados de
servicios de salud de la ciudad, especialmente dirigidas a los
profesionales de la salud que participan en la toma y el transporte
de muestras microbiolgicas.
Con este documento se pretende lograr la remisin al laboratorio
clnico de microbiologa de muestras con alta calidad para el
procesamiento y remisin de reportes que redunden en la mejor
atencin para nuestros pacientes.
- 93 -
Acerca del desarrollo de esta

9
9
conferencia de consenso
Como parte de la elaboracin del Manual para la toma de
muestras para anlisis microbiolgico, la Secretara Distrital de
Salud de Bogot, D. C., por medio del rea de vigilancia en Salud
Pblica, desarroll una conferencia de consenso en noviembre de
2006. En esta participaron profesionales de la salud,
representantes de las instituciones y agremiaciones de usuarios.
El objetivo era evaluar la evidencia disponible en algunos aspectos
controversiales del documento inicial. En este reporte se
presentan las recomendaciones de esa reunin.
La informacin discutida en el presente consenso es importante
hasta la fecha de realizacin del mismo, sin desconocer el avance
y la produccin continuas de nueva informacin.
Informacin para referenciar este documento

Para hacer una referencia bibliogrfi ca de este documento 1 favor
usar el siguiente formato:
Secretara Distrital de Salud. Consenso en toma de muestras
microbiolgicas. SDDS 2007.
Declaracin de confl ictos

Ninguno de los participantes en esta conferencia de consenso
declaro algn confl icto de inters o impedimento para participar
en la presentacin, la votacin o la generacin de las
recomendaciones.
Para ver una lista de los participantes del proceso con sus
respectivas afi liaciones institucionales remtase al fi nal de este
documento.
1
Este documento usa la estructura de presentacin de los consensos del Instituto
Nacional de Salud de los Estados Unidos (NIH) disponible en Http://consensus.nih.
gov/ABOUTCDP.htm
1
0
Resumen
Objetivos
Discutir la evidencia que sustenta las recomendaciones en cuatro
escenarios controversiales relacionados con la toma de muestras
para anlisis microbiolgico en una reunin distrital de consenso
e incorporar las recomendaciones al Manual para la toma de
muestras para anlisis microbiolgico desarrollado por la
Secretara Distrital de Salud.
Participantes
Profesionales de ciencias de la salud (mdicos, profesionales de
enfermera, bacterilogas y profesional tcnico auxiliar),
representantes de sociedades cientfi cas, universidades,
entidades gubernamentales y privadas con injerencia en el
asunto, delegados de las reas involucradas de la Secretara
Distrital de Salud y representantes de agremiaciones de usuarios.
Evidencia
Un panel de cuatro expertos con sufi ciencia en los aspectos
seleccionados prepar previamente una revisin de la evidencia
en cada una de las reas controversiales, que se present en
plenaria durante la reunin de consenso realizada en noviembre
de 2006. La metodologa de presentacin inclua el
establecimiento de la pregunta, la bsqueda de informacin
importante y la sntesis de la evidencia.
Conferencia de consenso
Previa convocatoria de miembros del Comit de infecciones
intrahospitalarias distrital, autoridades nacionales y distritales en
salud, Instituto Nacional de Salud, sociedades cientfi cas y
asociaciones de usuarios, se hizo una reunin de consenso en la
que, previa presentacin de la evidencia por el panel de expertos
y discusin de los participantes en la plenaria, se someti a
votacin cada uno de los asuntos de controversia. Todos los
1
0
asistentes participaron en la discusin de la evidencia presentada
por el panel de expertos. El anlisis de las posiciones y
presentaciones estuvo a cargo del jurado, que present las
recomendaciones fi nales.
Conclusiones
Existe evidencia controversial en algunos aspectos de la toma de
muestras para anlisis microbiolgico, tales como el volumen y el
nmero de botellas en hemocultivos en nios; el volumen que
ofrece el mejor rendimiento en adultos; las recomendaciones de
preparacin con antispticos para la toma de cultivos
respiratorios; y la preparacin de reas contaminados para el
cultivo. En este documento estn las recomendaciones
extractadas de la reunin distrital de consenso que discuti la
evidencia disponible en relacin con estos aspectos.
1
0
Cul es el volumen, dilucin y nmero de
hemocultivos recomendados en pediatra?
Experta: Martha lvarez
Volumen y dilucin
La concentracin bacteriana en pacientes con bacteriemia parece
ser comparativamente mayor en nios; sin embargo, hay
limitaciones para la toma de muestras sanguneas en esta edad,
especialmente en neonatos y con mayor frecuencia con
prematuros de menos de 1.000 g. Los volmenes recomendados
por botella de hemocultivo se encuentran en los siguientes
rangos:
Prematuro extremo
(hasta 1.000 g de peso): Tomar hasta 0,5 ml
Neonatos: Tomar hasta 1 ml
Lactantes y nios < 6 aos: 2-3 ml
Nios > de 6 aos: 5-10 ml
El volumen de sangre por tomar debe ser diluido con una relacin
1:5 a 1:10. El volumen puede variar de acuerdo con la tcnica de
hemocultivo disponible en el laboratorio de cada institucin. En
opinin del consenso, los mtodos automatizados son
recomendados sobre los mtodos manuales, por su facilidad y
mejor sensibilidad.
En el comercio se dispone de botellas que contienen diferentes
tipos de volmenes y diluciones, pero para neonatos y menores
de 6 aos se prefi eren las denominadas peditricas. Existen datos
en la literatura que han avalado la posibilidad de utilizar
volmenes menores (0,6 en un estudio ingls y 0,2 con dilucin
1:10 en un estudio mexicano, con adecuada sensibilidad para la
deteccin de bacilos Gram negativos).
Nmero de botellas
El nmero de botellas por tomar depende de la situacin clnica:
Sospecha de bacteriemia: 2 botellas
Sospecha de endocarditis: 4-6 botellas /a tomar entre 6 y 24 horas
1
0
Sospecha de bacteriemia
asociada con el catter: 1 botella por va central y
1 botella por va perifrica
Se debe establecer el tiempo de crecimiento del (los)
microorganismo(s) para hacer el diagnstico de bacteriemia
asociada con el catter, en los casos en los que el tiempo de
crecimiento es inferior en al menos dos horas en el cultivo tomado
por el catter frente al tiempo de aquel tomado por va perifrica.
Un mayor volumen aumenta la sensibilidad de la tcnica de
hemocultivo, as como hacerlo en presencia de fi ebre. Sin
embargo, en pacientes prematuros el clnico podr determinar el
volumen por tomar, as como el momento ideal, sin olvidar que no
se debe retardar el inicio del antibitico en las situaciones en las
que el mdico lo considere.
Tcnica
La muestra de sangre se puede hacer a travs de la arteria radial
por una persona experta (mdico o enfermera). En prematuros se
puede utilizar la va umbilical para la toma de muestras, aun
cuando la posibilidad de contaminacin puede ser mayor. Se
considera que una verdadera bacteriemia por Staphylococcus
epidermidis con 2 hemocultivos positivos y clnica positiva.
En todos los casos, la toma de hemocultivos se debe hacer con
tcnica de asepsia y antisepsia apropiada por personal de salud
con lavado de manos, guantes estriles, bata y tapabocas.
Se pueden tomar hemocultivos de control 48 a 72 horas despus
de la toma inicial. En pacientes con uso previo de antibiticos
(incluyendo neonatos cuyas madres hayan recibido antibiticos
durante el trabajo de parto) se puede considerar el uso de resinas
en los hemocultivos para mejorar la sensibilidad.
Recomendaciones del consenso

Volumen de los hemocultivos debe ser ajustado con la edad:
Prematuros extremos (menor a 1. 000 g): 0,5 ml
Neonatos: hasta 1 ml
Lactantes y nios hasta 6 aos: 2-3ml
1
0
Mayores de 6 aos: 5-10 ml
Dilucin: mantener una dilu-
cin en 1:5 a 1:10
Nmero de hemocultivos: el nmero de botellas por tomar
depende de la situacin clnica:
En prematuros extremos: 2 botellas
Sospecha de bacteriemia: 2 botellas
Sospecha de endocarditis: 4-6 botellas (tomar entre 6 y
24 horas)
Sospecha de bacteriemia asociada con el catter: 1 botella
por va central, una
por va perifrica
105
100
Cul es la recomendacin para la preparacin del rea de

la piel adyacente de heridas quirrgicas, traumticas,
absceso o biopsias de tejido para la toma de muestras en
el anlisis microbiolgico?
Experta: Sandra del Pilar Torres
El objetivo en la toma de muestras es identifi car el microorganismo
causante de la infeccin del absceso herida traumtica. El antisptico
reduce carga bacteriana en el momento de la muestra, este puede ser
yodado o clorhexidina. Antes de tomar el cultivo se debe hacer una
curacin de la herida, incluso cuando se han usado preparaciones con
plata o diferentes tipos de apsitos previamente.
No se recomienda aplicar antisptico sobre la herida o usar presin
para hacer el barrido de la fl ora contaminante.
No hay evidencia sobre el uso de alcohol como un segundo
antisptico, y no es clara la ventaja de uno sobre otro antisptico en
esta situacin (yodado frente a alcohol). De igual forma, no se dispone
de informacin en lo relacionado con hongos.

Herida abierta:
Limpiar bordes (del borde hacia afuera) con solucin salina normal y
alcohol isoproplico al 70%. Lavar la herida interna con solucin
salina abundante, sin presin. No usar antispticos.
Herida cerrada con rgano adyacente estril:

Usar como antisptico: jabn yodado, solucin yodada ms alcohol
isoproplico al 70%.
Herida cerrada con rgano adyacente no estril:

Usar solucin salina y alcohol isoproplico al 70%.
Es til la utilizacin de antispticos antes de la toma de
cultivos en el tracto respiratorio?
Experto: Elkin Lemos
Parte de la fl ora del tracto respiratorio puede incluir bacterias y hongos
como Stretptococcus spp, Veillonella spp, Neisseria spp,
Peptostreptococcus spp,Haemophilus spp, Actynomyces
spp,Corynebacterium spp,mycoplasma spp, Staphylococcus spp,
Bacteroides spp, Micrococcus, Fusobacterium y Candida.
El enjuague bucal busca disminuir la probabilidad de alimentos en la
muestra. Se ha documentado que el lavado de la boca disminuye un
logaritmo el aislamiento de contaminantes2; sin embargo, los productos
bucofarngeos disponibles en el mercado que tienen una diversidad de
componentes no han demostrado su impacto sobre la fl ora. Existen
diferentes recomendaciones no basadas en la evidencia sobre el uso de
cepillado de dientes.
Una vez tomada la muestra debe transportarse inmediatamente al
laboratorio y su siembra debe ser realizada de la manera ms rpida
posible.

1. Muestras de faringe y orofaringe: no hacer grgaras ni utilizar
enjuagues bucales ni soluciones bucofarngeas.
2. Muestras de esputo espontneo o inducido: cepillado de dientes y
lavado de la lengua slo con agua estril.
102
Cul es el volumen de sangre con mayor rendimiento

para la deteccin de bacteriemia en pacientes adultos por
medio de los mtodos automatizados de cultivo?
2
Respiration 1989; 56(3-4):137-46.
107
Experto: Carlos lvarez

El volumen de sangre cultivado permite discriminar entre las
verdaderas bacteriemias y las contaminaciones. A mayor volumen de
sangre existe una mayor posibilidad de descartar contaminantes.
Cockerill y colaboradores 3 responden a la pregunta cul es la efi
ciencia de los distintos volmenes de sangre hemocultivos
automatizados?, que en los pacientes con endocarditis a partir de los
20 ml no hay cambio en la sensibilidad de los hemocultivos. En
pacientes sin endocarditis se observ un aumento en la sensibilidad
de los hemocultivos, con un volumen de 40 ml se incrementa la
positividad de hemocultivos en 57% con respecto a 10 ml y en 21%
con respecto a una alcuota de 20 ml y en 7% con respecto a 30 ml.
Los hemocultivos tomados en das posteriores pueden contribuir a
detectar hasta 10% de los pacientes.
Mermel y colaboradores 4 , en una revisin de hemocultivos no
automatizados, demuestran que la sensibilidad aumenta cerca de 3%
por cada mililitro extra de muestra de sangre.
La sensibilidad puede ser similar para las muestras arteriales o
venosas y las resinas pueden mejorar la sensibilidad del hemocultivo,
por razones no claramente establecidas. No hay datos que permitan
decidir cul es el mejor momento para tomar de la muestra en
relacin con la fi ebre. Otros aspectos
La muestra puede ser tomada a partir de una o dos venopunciones;
sin embargo, se corre mayor riesgo de contaminacin cuando se toma
en un solo sitio. Las tomas se pueden hacer con intervalos de 20
minutos. Al tomar la muestra se puede limpiar la tapa de la botella
con alcohol y la piel con alcohol o yodado. Tambin hay
mayor riesgo de contaminacin con lneas centrales (arteriales o

perifricas). En bacteriemia asociada a catter debe tomarse una muestra
por la lnea central y otra por vena perifrica.
3
Clin Infect Dis 2004; 38:1724-30.
4
Ann Intern Med 1993; 119:270-72.
El cultivo de anaerobios se solicitar en las situaciones clnicas en las que
estos microorganismos se consideren apropiados y el procesamiento
debe ser el adecuado para este tipo de microorganismos. Debe
contemplarse la bacteriemia por mltiples microorganismos,
considerando que el tiempo de incubacin puede ser de 5 das en
grmenes comunes y de ms das (usualmente 7) para grmenes no
comunes, dependiendo del microorganismo sospechado.

1. Para la deteccin de microorganismos en sangre se recomienda enviar
entre 20 y 40 ml (2 a 4 botellas de hemocultivos).
2. En sospecha de endocarditis pueden ser sufi cientes 20 ml desangre
(2 botellas), y en ausencia de esta 40 ml (4 botellas) son apropiados.
Conclusiones
En este documento se resumen las recomendaciones para la toma de

muestras en cultivos como producto de la reunin distrital de
consenso. Se lograron algunos acuerdos generales sustentados en
evidencia y discusin de un pblico experto sobre el volumen y el
nmero de tomas para el diagnstico microbiolgico adecuado en
muestras de origen sanguneo; por otra parte, se recomend el uso
de un proceso de lavado para la toma de muestras de esputo
espontneo o inducido y la toma de muestras de faringe u orofaringe
sin el uso previo de soluciones de limpieza previa. Finalmente, se
logr un acuerdo general sobre la preparacin de las reas
correspondientes a heridas abiertas, cerradas con rgano adyacente
estril y con rgano adyacente no estril.
Esperamos que la adherencia de la red de prestadores distritales de
salud a las recomendaciones de este consenso y del Manual para la
toma de muestras microbiolgicas garantice la consecucin de los
objetivos esperados, ambientes y procesos ms seguros y de calidad
para usuarios y trabajadores del sistema sanitario de nuestra ciudad.
De igual forma, la efectividad y el impacto en costos sanitarios de la
adecuada implementacin de estas medidas deber tener un impacto
positivo en su funcionamiento y efi ciencia.
- 104 -
Participantes
Integrantes del jurado

Jorge Alberto Corts Luna
Mdico internista, especialista en infectologa
Asociacin Colombiana de Infectologa Presidente
Captulo Central
Margarita Gonzlez Caldern

Enfermera. Especialista perinatologa. Magster en biotica
Comit de tica, Hospital Universitario Fundacin Santa Fe de Bogot
Sandra Mnica Rodrguez Colmenares

Enfermera especialista en cardiorrespiratorio
Representante Facultad de enfermera, Pontifi cia Universidad Javeriana
Mary Luz Gmez Mayorga

Bacteriloga
Profesional Laboratorio de Salud Pblica Secretara
Distrital de Salud de Bogot, D. C.
Carmen Rosa Gallego Velasco

Bacteriloga
Profesional Laboratorio de Salud Pblica Secretara
Distrital de Salud de Bogot, D. C.
Beatriz Eugenia Mojica Carreo

Enfermera
Comit de infecciones intrahospitalarias, Clnica Nueva
Jaime Alberto Morales Barrios

Mdico pediatra neonatlogo
Unidad recin nacidos, Hospital Simn Bolvar
Dioselina Pelez Carvajal

Bacteriloga. Magster en microbiologa
Profesional rea de enterovirus, Instituto Nacional de Salud
Mara Eugenia Rodrguez Caldern

Enfermera epidemiloga
Comit de infecciones intrahospitalarias, Hospital La Victoria
- 105 -
106
Panel de expertos
Martha lvarez Pia

Mdico pediatra, especialista infectologa
Fundacin Cardio Infantil, Bogot
Evalu: Cul es el volumen, dilucin y nmero de hemocultivos
recomendados en pediatra?
Sandra Mara del Pilar Torres

Enfermera terapeuta enterostomal
Jefe clnica de heridas, Hospital Universitario Fundacin Santa Fe de Bogot
Evalu: Cul es la recomendacin para la preparacin del rea de la piel
adyacente de heridas quirrgicas, traumticas, absceso o biopsias de tejido
para la toma de muestras en el anlisis microbiolgico?
Elkin Vladimir Lemos

Mdico, especialista en infectologa, candidato a doctor en Salud Pblica
Jefe unidad de infectologa, hospitales El Tunal y de Kennedy
Evalu: Es til la utilizacin de antispticos antes de la toma de cultivos en el
tracto respiratorio?
Carlos Arturo lvarez Moreno

Mdico, especialista en infectologa
Presidente, Asociacin Colombiana de Infectologa
Jefe unidad de infectologa Hospital San Ignacio
Evalu: Cul es el volumen de sangre con mayor rendimiento para la
deteccin de bacteriemia en pacientes adultos por medio de los mtodos
automatizados de cultivo?
Comit organizador
Mdico especialista en epidemiologa
Profesional especializado, coordinadora del Comit de infecciones
intrahospitalarias distrital
rea de vigilancia en salud pblica, Secretara Distrital de Salud de Bogot, D.
C.
Enrique Ardila
Medic internista, especialista en endocrinologa y epidemiologa clnica
Asesor metodolgico conferencias de consenso y guas de prctica clnica
Profesor Especial Universidad Nacional de Colombia
107
Grupo para la Resistencia Bacteriana (Grebo)

Aura Luca Leal
Mdico, especialista en microbiologa clnica, magister en control de
infecciones
Profesora asociada, Universidad Nacional de Colombia
Juan Sebastin Castillo

Mdico, magister en epidemiologa clnica (candidato)
Giancarlo Buitrago
Mdico, magister en epidemiologa clnica (candidato)
Diana Bermdez Olarte

Enfermera Comit de infecciones y vigilancia epidemiolgica, Instituto
Nacional de Cancerologa
Stella Vanegas Morales

Enfermera. Especialista en cuidado intensivo
Coordinadora comit prevencin de infecciones
Hospital Universitario Fundacin Santa Fe de Bogot
Mara del Socorro Chal Palacios

Bacteriloga. Magster en microbiologa. Especialista en epidemiologa
Profesional especializado Laboratorio de Salud Pblica Secretara Distrital
de Salud de Bogot, D. C.
Luz Mila Lpez

Comit de infecciones Hospital Santa Clara
Laline Osorio
Enfermera. Especialista en salud ocupacional
Comit de infecciones, Hospital Simn Bolvar
La planeacin y el desarrollo de esta conferencia de consenso

estuvo respaldada econmica e institucionalmente por la

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Secretara Distrital de Salud de Bogot, D. C.

Samuel Moreno Rojas

Jos Fernando Martnez Lopera

Mara Patricia Gonzlez Cullar

Daibeth Henrquez Iguarn

Secretara Distrital de Salud de Bogot, D. C.

ISBN 978-958 8313191

Diseo, diagramacin e impresin

MANUAL PARA LA TOMA DE MUESTRAS PARA ANLISIS MICROBIOLGICO

1.1 Recomendaciones para la toma de muestras . .7

1.2 Solicitud de estudio . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7

1.3 Precauciones de bioseguridad . . . . . . . . . . . 8

1.4 Preparacin de elementos . . . . . . . . . . . . . . 8

1.5 Equipo de asepsia y antisepsia . . . . . . . . . . . 9

1.6 Preparacin de la piel: limpieza y antisepsia . 10

1.7 Tcnica de extendido . . . . . . . . . . . . . . . . . 10

1.8 Identifi cacin de muestras . . . . . . . . . . . . . 10

1.9 Condiciones generales de almacenamiento

1.10 Criterios de aceptabilidad

1.11 Cadena de custodia y pruebas de laboratorio . 12

1.12 Objetivo general . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12

1.13 Objetivos especfi cos. . . . . . . . . . . . . . . . . . 13

2.1 Muestras de orina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17

2.2 Muestras de sangre . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23

2.3 Muestras del tracto respiratorio . . . . . . . . . . 29

2.4 Muestras lquidos corporales . . . . . . . . . . . . 37

2.5 Muestras de piel y mucosas . . . . . . . . . . . . . 43

2.7 Muestras de heces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47

2.8 Muestras ticas, oculares y dentales . . . . . . . 49

2.9 Muestras para deteccin de hongos . . . . . . . . 53

2.11 Lista de chequeo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67

3.1 Superfi cies, soluciones y ambientes . . . . . . . . . 73

3.2 Muestras en personas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79

CONFERENCIA DE CONSENSO PARA LA TOMA DE MUESTRAS

Acerca del desarrollo de esta conferencia

Informacin para referenciar este documento . . . . . 94

Declaracin de confl ictos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94

Cul es el volumen, dilucin y nmero

de hemocultivos recomendados en pediatra? . . . . . 97

Cul es la recomendacin para la preparacin

del rea de la piel adyacente de heridas quirr-

gicas, traumticas, absceso o biopsias de tejido

para la toma de muestras en el anlisis micro-

Es til la utilizacin de antispticos

antes de la toma de cultivos en el

tracto respiratorio?. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101

Cul es el volumen de sangre con mayor rendi

El estudio microbiolgico de muestras de tejidos y lquidos

Con el fi n de recopilar la experiencia local y de identifi car aspectos

1.1 Recomendaciones para la toma de muestras

precisa para realizar el procedimiento en condiciones ptimas; y

1.2 Solicitud de estudio

Informar el uso de antibiticos u otros medicamentos (por

1.3 Precauciones de bioseguridad

Cumplir con las recomendaciones de manejo de elementos

En caso de accidente con riesgo biolgico, avisar inmediatamente

1.4 Preparacin de elementos

1.5 Equipo de asepsia y antisepsia

1.7 Tcnica de extendido

1.8 Identifi cacin de muestras

1.10 Criterios de aceptabilidad o rechazo de

Muestras sin identifi car: los especmenes obtenidos por

1.11 Cadena de custodia y pruebas de

Servicio: __ Fecha: