Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
UPIITA
Ingeniero en Binica
Asesores:
Dra. Yesenia Eleonor Gonzlez Navarro
UPIITA
Trabajo Terminal
Para obtener el Ttulo de
Ingeniero en Binica
Presentan los alumnos:
Benitez Murrieta Norma Josselyne
1
ndice General
2
6.4.1 PDMS (polydimethylsiloxane) ................................................................................... 33
6.4.2 PMMA (polymethylmethacrylate) ............................................................................. 33
6.4.3 Comparacin de PDMS y PMMA.............................................................................. 34
6.5 Deposito de Oro y Cromo sobre vidrio optico .................................................................. 35
6.5.1 Evaporacin trmica en vaco .................................................................................... 36
6.5.2 Evaporacin por calentamiento resistivo ................................................................... 37
6.5.3 Evaporacin por haz de electrones ............................................................................. 39
6.5.4 Pulverizacin Catdica o Sputtering .......................................................................... 39
6.5.5 Comparacin de tcnicas de depsito de metales para pelculas delgadas................. 41
6.6 Tcnicas de fabricacin de celda de flujo ......................................................................... 43
6.6.1 Fotolitografa .................................................................................................................. 43
6.6.1.1 Fotoresina positiva y negativa para fotolitografa ................................................... 44
6.6.1.2 Proceso de creacin de microcanales por fotolitografa .......................................... 45
6.6.2 Molde para estructura de celda de flujo ......................................................................... 46
6.7 Fabricacin de la celda microfludica de PDMS ............................................................... 46
Captulo 7. Desarrollo experimental........................................................................................ 48
7.1 Diseo del biosensor para ser compatible con el equipo de medicin de SPR. ................ 48
7.1.1 NanoSPR 6, Modelo 321 ............................................................................................ 48
7.1.2 Chip sensor comercial ................................................................................................ 49
7.2 Diseo de Celda de Flujo .................................................................................................. 49
7.3 Impresin 3D de molde para celda de flujo ...................................................................... 52
7.4 Creacin de microcanales mediante fotolitografa ............................................................ 53
7.5 Fabricacin de celda de flujo con PDMS .......................................................................... 61
7.6 Unin de celda de flujo de PDMS y superficie sensora .................................................... 64
7.7 Diagramas que resumen los procesos de fabricacin ........................................................ 67
7.7 Prueba y calibracin de chip sensor con diferentes concentraciones de sucrosa .............. 69
7.7.1 Ajuste de la celda microfludica en el equipo NanoSPR/321..................................... 69
7.7.2 Verificacin de conexin al equipo de computo ........................................................ 71
7.8 Calibracin de la celda microfludica................................................................................ 72
Captulo 8. Anlisis e interpretacin de resultados ................................................................ 74
Captulo 9. Conclusiones........................................................................................................... 88
Captulo 10. Recomendaciones y/o Sugerencias para investigaciones futuras. ................... 90
Bibliografa ................................................................................................................................ 91
Anexos A. Obtencin del vector de resonancia de plasmones superficiales ......................... 95
Anexos B. Software WinSpall 3.02 .......................................................................................... 97
3
ndice de Figuras
Figura 1. a) Campos elctricos generados en la interfase de metal-dielctrico ......................................... 22
Figura 2. Principio de deteccin de un sensor por SPR, el ngulo y la intensidad del lser reflejado cambia
si la molcula de inters se enlaza en el anticuerpo inmovilizado [16]. ..................................................... 22
Figura 3. Medicin del ngulo de SPR por barrido del ngulo de incidencia. ............................................. 23
Figura 4. Vector de onda de un fotn incidente desde un dielctrico junto con vector de propagacin de
un plasmn superficial entre la interfase del dielctrico y un metal [13]. .................................................. 24
Figura 5. Representacin esquemtica de la configuracin de Krestschemann, mostrando la excitacin de
la SPR por medio de un haz de electrones [14]. .......................................................................................... 25
Figura 6. Vector de onda de un fotn incidente desde un junto con vector de propagacin de un plasmn
superficial que se propagan entre el metal y el dielctrico de ndice de refraccin menor al del prisma
[13]. ............................................................................................................................................................ 25
Figura 7. Enzimas inmovilizadas en un soporte fsico. A) Por absorcin, la regin positiva de la protena
interacta con el soporte negativo [16]. ................................................................................................... 27
Figura 8. Esquema de una SAM sobre un sustrato, orientada 30, A) Grupo terminal funcional: Distintos
grupos qumicos que determina las propiedades superficiales para la inmovilizacin de los anticuerpos,
B)Cadena hidrocarbonada que regula el espesor, es una barrera fsica y altera la conductividad
electrnica, C) Ligando con alta afinidad por el sustrato y que estabiliza la superficie. D) Sustrato [11]. . 28
Figura 9. Unin de receptor biolgico con el analito por medio de enlaces no covalentes [21]................. 29
Figura 10. Angulo de SPR en relacin con la Reflectividad [13].................................................................. 31
Figura 11. Vidrio ptico con pelcula de Cr y Au. ........................................................................................ 36
Figura 12. . Deposicin a partir de evaporacin trmica [38]. ................................................................... 37
Figura 13. . Soportes de calentamiento resistivo: a) Filamento, b) Banda metlica y c) Crisol [38]. .......... 38
Figura 14. . Evaporacin por haz de electrones [39]. ................................................................................. 39
Figura 15 . Proceso de pulverizacin catdica [38]. ................................................................................... 40
Figura 16. . Patrn generado a partir de la fotolitografa en fotoresina positiva y negativa [43]. ............ 44
Figura 17. Molde donde se verter el PDMS para formar la celda de flujo ................................................ 46
Figura 18. A) Componentes PDMS, b), Mezcla de componentes, c) Vertido de PDMS en moldes, d)
Horneado de PDMS .................................................................................................................................... 47
Figura 19. Equipo de medicin de resonancia de plasmones superficiales NanoSPR 6/321. ..................... 48
Figura 20. . Componentes de Chip sensor comercial (Vidrio ptico, empaque de silicn, celda de flujo). . 49
Figura 21. Dimensiones fsicas de la celda comercial ................................................................................. 49
Figura 22. Volumen de muestra biolgica de chip sensor comercial. ........................................................ 50
Figura 23. Prototipo de Chip Sensor. .......................................................................................................... 50
Figura 24. Velocidad de flujo de agua dentro del Chip sensor comercial. .................................................. 51
Figura 25. Simulacin de velocidades agua dentro del prototipo de chip sensor. ...................................... 51
Figura 26. Dimensiones fsicas del molde de la celda prototipo ................................................................. 52
Figura 27. A) Preparacin de piezas del molde para impresin 3D. B) Impresin del molde de celda. .... 52
Figura 28. . Material (PLA) para impresin 3D. .......................................................................................... 53
Figura 29. Oblea de Silicio. ....................................................................................................................... 53
Figura 30. Limpieza de oblea ..................................................................................................................... 54
Figura 31. Lmpara de luz UV con ozono (UV Ozone Cleaner ProCleaner). ........................................ 54
Figura 32. a) Colocacin de la resina negativa SU-8, b) Configuracin de equipo Brewer Science 200x. .. 55
Figura 33. Colocacin de la oblea sobre la placa de temperatura regulable a 95C por 45 min. ............... 56
Figura 34. a) Imagen de microcanales en papel adhesivo, b) Dibujo acotado de los microcanales ........... 56
Figura 35. a) Superposicin de la mscara sobre a oblea con la resina, b) Exposicin de radiacin UV de la
resina negativa con la mscara para grabado de microcanales. ............................................................... 57
4
Figura 36. a) Revelador de resina negativa SU-8, b) Revelado de la resina. .............................................. 57
Figura 37. Limpieza con alcohol isoproplico. ............................................................................................. 58
Figura 38. Oblea con reveles de microcanales............................................................................................ 58
Figura 39. a) Equipo de Medicin Veeco Dektak 150, b) Medicin de la altura de los microcanales con el
perfilometro, c) Obtencin de datos de la altura de los microcanales en el equipo de cmputo. .............. 59
Figura 40. PDMS y elastmero de silicona.................................................................................................. 62
Figura 41. Mezcla de PDMS con agente de curacin. ................................................................................. 62
Figura 42. Cmara de vaco con mezcla de PDMS en su interior. ............................................................... 63
Figura 43. Vaciado de PDMS. ..................................................................................................................... 63
Figura 44. Tapa para moldear los 4 conductos de entrada y salida. .......................................................... 63
Figura 45. Secado de la celda de flujo. ....................................................................................................... 64
Figura 46. Celda de flujo de PDMS. ............................................................................................................ 64
Figura 47. Exposicin de radiacin de luz UV con ozono de la celda de flujo y vidrio. ............................... 65
Figura 48. Prototipo de celda Final. ............................................................................................................ 65
Figura 49. Vista lateral del prototipo final de la celda. .............................................................................. 66
Figura 50. Vista superior del prototipo final de la celda, en la imagen se alcanzan a percibir los
microcanales............................................................................................................................................... 66
Figura 51. Vista inferior de la celda microfludica, como la pelcula de Au y Cr son muy delgadas, la luz
alcanza a atravesar. ................................................................................................................................... 66
Figura 52. Equipo de medicin de SPR. ....................................................................................................... 69
Figura 53. Configuracin final de nuestro prototipo de chip sensor para el dispositivo Nano SPR/ 321 1)
Prisma de retroflexin trapezoidal con un ngulo de 65, 2) Fluido de inmersin ptico (n = 1.6100), 3)
Chip sensor de oro (vidrio/Cr/Au), 4) Celda microfludica de PDMS. .......................................................... 69
Figura 54. a) Prisma de retroflexin trapezoidal, b) Ajuste del prisma en el equipo de NanoSPR/321 ...... 70
Figura 55 a) Aceite de inmersin (n=1.61), b) Colocacin de aceite de inmersin sobre el prisma ............ 70
Figura 56. Ajuste de la celda microfludica sobre el aceite de inmersin. .................................................. 70
Figura 57. a) Equipo de pruebas de SPR constituido por una computadora y el equipo de medicin, b)
Colocacin de nuestra celda en el quipo NanoSPR/321. ............................................................................ 71
Figura 58. Vista superior de la celda microfludica en el equipo de SPR. .................................................... 71
Figura 59. Se observa la luz lser que incide en el prisma lo cual indica que est en funcionamiento. ..... 72
Figura 60. a) Mensaje de verificacin de conexin y bienvenida, b) Pantalla inicial donde se mostrara ms
adelante los datos de la prueba ................................................................................................................. 72
Figura 61. . Curva de SPR para el agua. ...................................................................................................... 72
Figura 62. Para la calibracin de la celda se obtiene la curva de SPR con agua. ....................................... 73
Figura 63. Se introducen diferentes concentraciones de sucrosa y se obtiene su respectiva curva de SPR.
.................................................................................................................................................................... 73
Figura 64. Pantalla de inicio WinSpall 3.02 ................................................................................................ 74
Figura 65. Ubicacin para cargar datos. .................................................................................................... 75
Figura 66. Ingreso de parmetros para simulacin de la curva del efecto de SPR. .................................... 76
Figura 67. Parmetros de simulacin. a) Tipo de prisma, longitud de onda y luz polarizada, b) Lmites del
ngulo y c) Caractersticas de las capas del sistema. ................................................................................. 78
Figura 68. Men para ajuste de curvas. ..................................................................................................... 79
Figura 69. Ajuste iterativo de curvas. ......................................................................................................... 80
Figura 70. Ajuste manual de curvas. .......................................................................................................... 80
Figura 71. Evaluacin de datos cargados y simulacin de curva. ............................................................... 81
Figura 72. Evaluacin de valores de la curva de SPR con agua como dielctrico y la curva simulada. ...... 81
Figura 73. Evaluacin de valores del ngulo de SPR y reflectividad para la solucin de sucrosa a una
concentracin de 0.04g/ml. ........................................................................................................................ 83
5
ndice de Grficas
Grfica 1. . Relacin de espesor respecto a la velocidad de giro recomendada de acuerdo al tipo de resina
SU-08 3000 a una temperatura de 21C [48]. ............................................................................................ 55
Grfica 2. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro
(143.3103 m de espesor y 2.549 mm de ancho). ...................................................................................... 60
Grfica 3. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro (82.4824
m de espesor y 2.678 mm de ancho). ....................................................................................................... 60
Grfica 4. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro (99.0941
m de espesor y 1.905 mm de ancho). ....................................................................................................... 61
Grfica 5. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro
(106.1784 m de espesor y 1.891 mm de ancho). ...................................................................................... 61
Grfica 6. Curva de resonancia de plasmones superficiales con agua dentro del microcanal. ................. 75
Grfica 7. Simulacin de curva de SPR con agua como dielctrico dentro del microcanal. ....................... 78
Grfica 8. Curva de simulacin de SPR con agua destilada como dielctrico junto con curva de valores
medidos en el equipo de NanoSPR 6/321 con los valores mnimos de reflectividad. ................................. 81
Grfica 9. Curva de simulacin de SPR con agua destilada como dielctrico ajustada a los valores
medidos en el equipo de NanoSPR 6/321. .................................................................................................. 82
Grfica 10. Curva de SPR de la solucin de sucrosa a una concentracin de 0.04 g/ml. ............................ 83
Grfica 11. Ajuste de curva de SPR de la solucin de sucrosa a una concentracin de 0.04 g/ml con la
simulacin de la curva de SPR con agua destilada. .................................................................................... 84
Grfica 12. Curvas del efecto de SPR a diferentes concentraciones de sucrosa, a) C=0.08 g/ml, b) C=0.12
g/ml, c) C=0.16 g/ml, d) C=0.20 g/ml. ........................................................................................................ 85
Grfica 13. Curvas de SPR a diferentes concentraciones de sucrosa con sus valores mnimos de
reflectividad marcados. .............................................................................................................................. 86
Grfica 14. Relacin de la estimacin del ndice de refraccin y el ngulo de SPR. ................................... 87
Grfica 15. Relacin de la concentracin de sucrosa y la estimacin de los ndices de refraccin. ........... 87
ndice de Tablas
Tabla 1. Comparacin entre materiales, PDMS y PMMA. .......................................................................... 35
Tabla 2. Energa de exposicin de luz UV de acuerdo al espesor deseado de resina.................................. 57
Tabla 3. Valores de ndice de refraccin en base a espesores de las capas de los metales dados por el
fabricante. .................................................................................................................................................. 76
Tabla 4. Valores de ndice de refraccin en base a espesores de las capas de los metales dados por el
fabricante. .................................................................................................................................................. 82
Tabla 5. Datos de las curvas de SPR. .......................................................................................................... 86
6
Resumen.
7
Abstract
The development of the prototype includes an investigation of the SPR technique, as well
as materials for microfluidic cells manufacturing using the photolithography technique
for microchannels design and curing polymer for its structure, besides the sensor plate
that consists of depositing metals on the optical glass by thermal evaporation.
8
Glosario
9
Captulo 1. Objetivos
Realizar el diseo del biosensor para ser compatible con un equipo de medicin
de resonancia de plasmones superficiales.
10
Captulo 2. Introduccin.
Una gran variedad de mtodos pticos se han utilizado en biosensores, sin embargo, los
dispositivos basados en la espectroscopia de fluorescencia, resonancia de plasmn
superficial, interferometra y espectroscopia de modos guiados en estructuras de gua de
ondas pticas (rejilla de acoplador y el espejo resonante), son los ms comunes [4].
11
en el cual la frecuencia de radiacin del haz coincide con la frecuencia de resonancia de
los plasmones.
2.1 Antecedentes
El trmino biosensor aparece en la literatura cientfica a finales de los aos 70, aunque el
concepto bsico e incluso la comercializacin comenzaron antes. El primer biosensor fue
un analizador de glucosa desarrollado por Clark y Lyons en 1962 y fue comercializado a
partir de 1975 por Yellow Springs Instrument Company. Este biosensor se denomin
enzyme electrode y consista en una enzima glucosa oxidasa acoplada a un electrodo
para oxgeno. La enzima oxida la glucosa y como consecuencia produce un descenso
proporcional de la concentracin de oxgeno en la muestra, que es detectado por el
electrodo [7].
Otro nuevo tipo de biosensores, basados en principios pticos, fue desarrollado alrededor
de 1980 por Lowe y sus colaboradores, denominado sensor optoelectrnico. El
componente biolgico inmovilizado es una enzima ligada a un cromforo (entendindose
ste como un grupo funcional de la molcula responsable de la absorcin [8]), que a su
vez est ligado a una membrana [1].
12
El biosensor mediante la resonancia de plasmn superficial se demostr por primera vez
para los biosensores en 1983 [4]. Rufus Ritichie descubri estas ondas en los aos
cincuenta del pasado siglo. Cualquier superficie metlica (plana, esfrica, cilndrica o de
cualquier otra forma) posee plasmones superficiales [9].
El biosensor ptico basado en la tcnica SPR ha ganado atencin por su: alta sensibilidad
debido a que el ngulo de SPR vara proporcionalmente a pequeos cambios en el orden
de 10-4 [10] del ndice de refraccin; alta especificidad ya que el ndice de refraccin se
modifica en relacin a la cantidad de molculas detectadas en la interfase; y posibilidad
de anlisis en tiempo real por su velocidad de deteccin [1].
Los biosensores tipo SPR se pueden utilizar para una caracterizacin diversa de los
anticuerpos modificados. Se han utilizado para la produccin y caracterizacin del
anticuerpo del hygromycin B y se concluy que fue ms rpido y exacto que los ensayos
inmunoqumicos adems este permiti el rpido desarrollo de los mtodos de anlisis del
hygromycin B en muestras biolgicas. Se detect la enterotoxina staphylococcal B en
leche y en general en varios patgenos y agentes en la prueba y anlisis de alimentos
como salmonelas y Listeria. Tambin se han utilizado con xito para la deteccin de
drogas, micotoxinas, pesticidas y monitoreo del proceso de destilacin [1].
Existen compaas que desarrollan biosensores como es: Pharmacia BIACore, la cual
ofrece biosensores pticos, especialmente mediante la tcnica de resonancia de
plasmones superficiales; Quantech Biosensors, Quantech Ltd. enfoca su trabajo en el
13
diagnstico mdico mientras que su subsidiaria HTS Biosystems, Inc. persigue el
desarrollo de sistemas de deteccin para el mercado de las investigaciones cientficas y
los bioprocesos; Biosensor Applications desarrolla biosensores en sentido general,
incluyendo sensores para bioprocesos y XanTec se basa al igual que Pharmacia BIACore
en la resonancia de plasmones superficiales para la deteccin de las interacciones
biomoleculares [1].
14
Captulo 3. Planteamiento del Problema.
Un nuevo diseo del chip sensor integrando la tecnologa microfludica aportara una
alternativa para mejorar el aprovechamiento de la muestra, ya que la cantidad necesaria
en un microcanal sea mucho menor en comparacin a la utilizada en la celda
comercializada, adems permitira agilizar las pruebas de deteccin al unificar los
componentes para un ajuste ms sencillo del chip en el equipo.
15
Captulo 4. Justificacin.
Una membrana celular tiene un sistema especfico de reconocimiento por el cual puede
realizar sus funciones biolgicas, en particular son de gran inters los procesos y sistemas
asociados con las membranas celulares tales como la capacidad de barrera, transporte
activo y pasivo, canales, receptores, motores moleculares, cadena transportadora de
electrones y procesos de adhesin y fusin [11].
16
4.1 Solucin Propuesta.
Disear y fabricar un prototipo de chip sensor (celda de flujo) compatible con el sistema
de medicin de transduccin ptica NanoSPR 6/321 que el CIDETEQ utiliza en
investigaciones de biosensores para deteccin de enfermedades.
Este chip sensor ser construido en colaboracin con el Centro de Nanociencias y Micro
y Nanotecnologas (CNMN), ya que el centro cuenta con la infraestructura necesaria para
el desarrollo del mismo, con el fin de proporcionar una alternativa que pueda mejorar el
desarrollo de las investigaciones.
17
Captulo 5. Marco terico
5.1 Biosensores
Anticuerpos
cidos nucleicos
Microorganismos
Tejidos orgnicos
Enzimas
Los biosensores son normalmente para un solo uso. Por lo general son adecuados
para aplicaciones de punto de cuidado, pero en la actualidad no son adecuados
para el seguimiento a largo plazo cuando se requieren mediciones continuas, tales
como el seguimiento de las bacterias en el agua.
18
Los biosensores a menudo tienen una gama operativa limitada, en trminos de
factores tales como la temperatura, pH, o la humedad, en el que operarn de forma
fiable.
19
Trmicos. Dispositivos capaces de medir cambio de calor sobre la superficie del
electrodo
Cuidado de la salud
Manejo de enfermedades crnicas, como la monitorizacin de la glucosa en la
diabetes
El diagnstico y la deteccin de las pruebas de embarazo en el hogar; estmago
lceras Helicobacter pylori:
Bioqumica, por ejemplo, pruebas de colesterol
Pruebas de infeccin bacteriana
Evaluacin de la enfermedad aguda, como para cnceres, como el de prstata
Biotecnologa
Fermentacin del vino
cido ctrico
Fabricacin de cerveza
Produccin de enzimas
Produccin biofarmacutica
Calidad de la comida
Deteccin de contaminantes qumicos
Deteccin de toxinas
Deteccin de patgenos
Deteccin hormonas
Monitoreo ambiental
Contaminacin, como las pruebas de coliformes fecales en el agua
Agricultura
20
Pesticidas en el agua, tales como los organofosfatos
Metales pesados
Hormonas
Seguridad
Deteccin de agentes de guerra y qumicos
La idea de plasmn se debe a que en los metales hay electrones que no estn ligados al
ncleo atmico y pueden moverse libremente dentro del material formando en conjunto
un plasma [12]. Los plasmones son las oscilaciones en conjunto de los electrones libres o
de conduccin de un metal que son excitados al hacer incidir radiacin electromagntica
[13].
Al hacer incidir una frecuencia de radiacin que coincide con la frecuencia de resonancia
de los plasmones se produce un fenmeno de absorcin que en pelculas delgadas de
metales depende del espesor y en partculas nanomtricas de metal del tamao y forma
del material [12]. Este fenmeno se conoce como resonancia de plasmones.
21
Figura 1. a) Campos elctricos generados en la interfase de metal-dielctrico
Figura 2. Principio de deteccin de un sensor por SPR, el ngulo y la intensidad del lser reflejado cambia si la
molcula de inters se enlaza en el anticuerpo inmovilizado [16].
22
El mtodo para obtener el ngulo de SPR se puede realizar haciendo un barrido del ngulo
de incidencia midiendo la reflectividad para obtener la posicin del mnimo de
reflectividad (Figura 3).
Figura 3. Medicin del ngulo de SPR por barrido del ngulo de incidencia.
23
Teniendo en cuenta que el haz de electrones viene de un medio dielctrico y adems se
ignoran materiales magnticos considerando =1, el vector de onda de un fotn libre
se puede representar como
= (1)
Por otra parte el vector de onda de un plasmn superficial que representa la dispersin
de los plasmones superficiales en una interfase metal-dielctrico, viene dado por:
=
+ (2)
El vector de onda del fotn va a ser menor que el vector de onda de un plasmn superficial
que se propaga en la interfase entre el mismo medio y el metal.
En la Figura 4 se puede observar un esquema que representa el vector en x del haz del
fotn junto con el vector de propagacin del plasmn superficial .
Figura 4. Vector de onda de un fotn incidente desde un dielctrico junto con vector de propagacin de un
plasmn superficial entre la interfase del dielctrico y un metal [13].
Debido a que el vector de onda del fotn es siempre menor que el de los plasmones
superficiales, ser imposible que los fotones lleguen a excitar a los plasmones, por lo que
se ocupa la configuracin de Kretschmann (Figura 5) para su acoplamiento en el sistema
[13]. El acoplamiento consiste en hacer incidir en primera instancia el haz de fotones
24
sobre un prisma dielctrico con un ndice de refraccin mayor que el dielctrico de la
interfase.
La componente en x del vector de onda del haz del fotn que pasa por el prisma se puede
representar con la siguiente ecuacin:
= sin (3)
debe ser mayor que el ndice de refraccin del dielctrico > , y es el ngulo
al que incide el haz de electrones, que permite con el ngulo adecuado excitar a los
plasmones superficiales, denominado ngulo de SPR ( ) (Figura 6).
Figura 6. Vector de onda de un fotn incidente desde un junto con vector de propagacin de un plasmn
superficial que se propagan entre el metal y el dielctrico de ndice de refraccin menor al del prisma [13].
Por lo tanto tenemos que la condicin para que se d el fenmeno de SPR es cuando:
25
=
+ =
sin = (4)
= sin1 ( (5)
+ )
26
inicas o fuerzas dbiles (puentes de hidrogeno, fuerzas de Van der Waals, interacciones
hidrofbicas), la adsorcin mantiene intacta la actividad de la molcula al no afectar su
conformacin, es un mtodo rpido y simple [17]. Sin embargo las molculas podran
liberarse fcilmente al sufrir cambios en su medio como PH y temperatura [16], por lo
que se produce con facilidad la prdida del anticuerpo inmovilizado y la orientacin al
azar del mismo, estos factores afectan finalmente la sensibilidad del sensor [17].
Figura 7. Enzimas inmovilizadas en un soporte fsico. A) Por absorcin, la regin positiva de la protena interacta
con el soporte negativo [16].
Las SAMs de alcanotioles sobre oro son las ms estudiadas debido a la simplicidad de
preparacin, los alcanotioles son adsorbidos por la superficie por fisiorcin y
Quimiosorcin. Los alcanotioles se ordenan con un angulo de inclinacin de 30 y
contienen un grupo reactivo en un extremo que permite la inmovilizacin del anticuerpo
al unirse covalentemente a la SAM (Figura 8). La SAM protege a las biomolculas
27
inmovilizadas de la desnaturalizacin. La densidad de puntos de unin del anticuerpo a
la SAM es controlada por el uso de SAMs mixtas que contienen alcanotioles con grupos
funcionales reactivos e inertes [17].
Figura 8. Esquema de una SAM sobre un sustrato, orientada 30, A) Grupo terminal funcional: Distintos grupos
qumicos que determina las propiedades superficiales para la inmovilizacin de los anticuerpos, B)Cadena
hidrocarbonada que regula el espesor, es una barrera fsica y altera la conductividad electrnica, C) Ligando con
alta afinidad por el sustrato y que estabiliza la superficie. D) Sustrato [11].
Los receptores son componentes de clulas que tienen la capacidad de identificar una
molcula en especial [18].Para el caso que se va a estudiar, se usar un receptor biolgico
especfico que detectar el antgeno desarrollado a causa de la aparicin de tumores
malignos. Dichos receptores biolgicos puede ser una molcula, una sustancia o un
proceso que se altera cualitativa o cuantitativamente como resultado de la presencia de
otra molcula [19].
28
Figura 9. Unin de receptor biolgico con el analito por medio de enlaces no covalentes [21].
El trmino avidez se usa para describir la fuerza general de las interacciones de unin
colectivas que ocurren durante una unin multivalente [4]. Esta fuerza depende de las
afinidades individuales de cada uno de los determinantes del analito, teniendo como
entendido que la afinidad describe la unin del receptor biolgico a un solo componente
del analito. La avidez es quiz una medida ms informativa de toda la estabilidad o fuerza
de la unin entre el receptor biolgico y el analito [21].
29
Captulo 6. Metodologa
Para comenzar la transduccin mediante SPR del biosensor un haz de luz atraviesa el
prisma y despus el vidrio ptico, estos acoplados mediante un aceite con el mismo ndice
de refraccin del prisma. Es importante tener en cuenta las caractersticas del vidrio ptico
ya que sobre este se depositan los metales que contendrn al receptor biolgico y es
crucial para la caracterizacin del biosensor.
Al hablar de vidrio ptico nos referimos a un grupo de vidrios con mejores calidades
pticas que los vidrios estndar como el vidrio de sosa y cal o el vidrio borosilicato. El
vidrio ptico es particularmente adecuado para ser utilizado en la fabricacin de
componentes pticos como lentes de precisin ya que su ndice de refraccin es fijo y no
vara como en el vidrio estndar [23].
EL ndice de refraccin del vidrio ptico puede ser desde 1.523 hasta 1.804 [24], para el
presente proyecto se utilizaran portaobjetos de vidrio de 20mm x 20mm x 1mm de espesor
y un ndice de refraccin de n = 1.6160. Con ayuda de una solucin ptica se iguala el
ndice de refraccin del prisma con el del vidrio ptico para evitar que la luz se desvi.
De igual manera el prisma de reflexin trapezoidal tiene un n=1.6160 para el
acoplamiento ptico.
30
superficiales, por lo que son muy sensibles a la presencia de molculas absorbidas en la
superficie [9].
La curva de plata tiene un mnimo de reflectividad ms agudo que el del oro, adems con
superficies de Ag se obtiene gran amplificacin del campo superficial, por otra parte la
superficie de oro brinda mayor resolucin y sensibilidad. Ambas superficies de oro y plata
pueden reaccionar fcilmente con los grupos tiol para uniones estables, por lo que son
sustratos adecuados para la colocacin de monocapas auto-ensambladas (SAM). El oro
es ms estable ante solventes y soluciones utilizadas frecuentemente [17].
Para el oro el espesor ptimo es de 45nm a una longitud de onda de 790nm [17], aunque
se han realizado experimentos con diferentes longitudes de onda como 670nm con 50nm
de oro obteniendo buenos resultados [5].
31
El oro se deposita sobre una capa de cromo an ms delgada regularmente de 2nm a 5nm
[15] [5] que asegura la sujecin del oro en el sistema [25] . En este trabajo se propone
depositar una capa de 45nm de oro sobre una capa de cromo de 5nm, las capas son
compatibles con las longitudes de onda de 650nm y 850nm del equipo NanoSPR-06.
32
6.4 Material de la celda microfludica
33
Fuerte dependencia de la viscosidad con la temperatura, lo que permite solucionar
problemas de huecos en el moldeo al aumentar ligeramente la temperatura [31].
Es un plstico amorfo con una transparencia que no difiere mucho a la del vidrio
[29].
Se pueden fabricar dispositivos con dimensiones por debajo de los 30nm [32].
Es un material muy hidrfobo, por tanto difcil de mojar [33].
Genera EOF (fluido electroosmotico) estable al aplicar un campo elctrico en
microcanales.
El PDMS se deforma ms fcilmente que el PMMA al sufrir una presin, razn por la
cual puede ser utilizado en dispositivos mircrofluidicos como membranas activas pero no
puede circular sobre sus canales la mayora de solventes orgnicos [31].
Las propiedades que debe cumplir el material para la creacin de la celda microfluidica
son:
Bajo costo
Fcil acceso
Resolucin de al menos 100nm para canales microfluidicos (estas dimensiones
nos permiten comprobar a escala micromtrica el fenmeno de SPR)
Fabricacin o preparacin sencilla
34
Tabla 1. Comparacin entre materiales, PDMS y PMMA.
Bajo costo $0.036 pesos por gramo $0.0276 pesos por gramo
[34] [35]
De la Tabla 1 se puede decir que ambos materiales cumplen con la resolucin necesaria
para la fabricacin de los microcanales, el PMMA es ms econmico que el PDMS pero
el PMMA requiere un proceso ms complejo de preparacin.
La fabricacin del chip sensor se llevar a cabo mediante el depsito de pelculas delgadas
sobre vidrio ptico con una superficie plana de 20x20 mm. Se deposita una pelcula de
cromo (Cr) con un espesor de 5 nm y una de oro (Au) de 45 nm como se puede observar
en la Figura 11.
35
Figura 11. Vidrio ptico con pelcula de Cr y Au.
Entre las tcnicas para la deposicin de metales tenemos la evaporacin trmica, la cual
puede efectuarse por calentamiento resistivo o mediante bombardeo de electrones, as
como la pulverizacin catdica o sputtering por su designacin en ingls.
Este tipo de mtodos requiere de un vaco alto o ultra alto (con presiones menores a 10-12
Pa), esto con la finalidad de que el material evaporado llegue a la superficie del sustrato
sin sufrir colisiones en el camino, adems de evitar que la pelcula formada reaccione con
el gas circulante y evitar problemas asociados a la oxidacin a altas temperaturas [38].
Una de las ventajas que presenta la evaporacin como tcnica de deposicin es que puede
llevarse a cabo mediante un montaje sencillo con la posibilidad de evaporar materiales en
forma simple como polvo, hilo o pastillas, y cuando se trata de metales con bajo punto de
fusin, la evaporacin se puede efectuar con equipos de diseo relativamente sencillos y
de bajo coste.
36
El proceso de evaporacin se efecta con la presin residual de la cmara de vaco (Figura
12) del sistema, lo que hace que el recorrido libre de las partculas del material sea tal,
que es del orden de las dimensiones de la cmara y esto hace que las partculas evaporadas
describan una trayectoria casi rectilnea, sin colisiones con el gas, hasta alcanzar la
superficie donde se va a formar la pelcula, considerndose sta tcnica como un proceso
direccional donde solo la superficie que est a la vista desde la fuente de evaporacin
queda recubierta [37].
Para la formacin de las pelculas delgadas se deben considerar algunos factores para que
el producto final sea el mejor deseado como es el tipo de material, la presencia de
dopantes como impurezas o no, la temperatura del sustrato ya que ste es el responsable
de la desorcin y disociacin, as como la orientacin superficial [36]. De igual manera,
la temperatura a la cual es sometido el material a la hora de su evaporacin, ya que el
tamao de grano del material va a variar dependiendo las diferentes temperaturas a las
que se someta, esto sin modificar el espesor de la pelcula delgada [38].
La velocidad a la cual va ir creciendo la pelcula es del orden de entre 0.1 a 1 nm/s, lo que
ayuda a obtener recubrimientos en el orden de micrmetros e incluso nanometros [37],
lo cual para este trabajo es de suma importancia por los requerimientos de los espesores
de las pelculas de Cr y Au a utilizar.
37
conveniente que el material a evaporar, cuando alcance el punto de fusin, moje el metal
para evitar el desprendimiento. b) Una banda metlica generalmente usada para evaporar
material en forma de polvo, estando en el exterior de la campana de vaco la fuente de
alimentacin elctrica de bajo voltaje y alta corriente, evitndose las descargas elctricas
entre los hilos de contacto. c) Un crisol cermico calentado a travs de un arrollamiento
metlico por corriente elctrica o induccin de radio frecuencia, empleando materiales
como grafito, xidos y nitruros refractarios (almina, nitruro de boro, etc.), que son muy
inertes a las temperaturas de fusin de un gran nmero de materiales [39].
Figura 13. . Soportes de calentamiento resistivo: a) Filamento, b) Banda metlica y c) Crisol [38].
Cuando se van a evaporar metales voltiles y que subliman antes de fundir, es decir, que
la temperatura de evaporacin es inferior a la temperatura de fusin se opta por un sistema
ms simple de calentamiento, que consiste, ya sea en pasar corriente elctrica
directamente al material en caso de que se un metal, o bien, usar un horno auxiliar.
Considerando que se busca tener una pelcula delgada uniforme a lo largo de toda la
superficie, durante todo el proceso de evaporacin se rota el sustrato y as favorecer un
crecimiento y espesores uniforme [40].
Dentro de otras desventajas que se pueden mencionar al usar este proceso, tenemos que
no se puede controlar directamente la temperatura del material a evaporar, sino que se
controla la potencia aplicada al contenedor por lo que la cantidad de material evaporado
no es controlado durante el procedimiento, hacindolo an ms difcil cuando es por
largos periodos de tiempo [40].
38
6.5.3 Evaporacin por haz de electrones
39
la energa de los iones incidentes es suficientemente elevada, la interaccin con la
superficie del material hace que los tomos de la superficie sean arrancados, para pasar a
la fase de vapor.
El gas de la descarga suele ser argn, un gas inerte de masa elevada, mientras que para el
nodo se ocupa un material conductor, usualmente acero inoxidable, que est conectado
al potencial de tierra junto a la campana de vaco por razones de seguridad. Por lo ltimo,
40
los sustratos a recubrir estn colocados sobre el nodo, o bien, frente al ctodo sobre un
soporte auxiliar [37].
La velocidad del proceso depende de factores como: energa y masa de los iones
incidentes, nmero atmico y temperatura del blanco, ngulo de incidencia de los iones,
tipo de blanco (aleacin, compuesto, cristalino) [41].
De las tcnicas antes citadas, la pulverizacin catdica se presenta como una de las
tcnicas ms avanzadas y con mejores caractersticas para efectuar el depsito de un gran
nmero de materiales, siendo este un proceso ms controlado en comparacin con la
evaporacin por calentamiento resistivo y por haz de electrones. Sin embargo, el
complejo sistema y componentes requeridos para efectuarlo lo hacen ms costoso. Entre
las ventajas ms destacadas de esta tcnica podemos mencionar que [37]:
41
La pelcula depositada tiene buena adherencia debido a la alta energa de llegada
de los tomos pulverizados a la superficie del substrato.
La velocidad de deposicin es fcilmente controlada debido al control de
velocidad de erosin del blanco a travs de la potencia aplicada en la descarga.
Por otra parte tenemos la evaporacin trmica en vaco, donde se deriva la evaporacin
por calentamiento resistivo y la evaporacin por haz de electrones, que tienen como
ventaja la sencillez de su montaje para su realizacin, lo que las hace de menor coste en
comparacin con la pulverizacin catdica.
Para este trabajo se ocupa la tcnica de evaporacin por haz de electrones para el depsito
de pelculas delgadas.
La razn por la cual se descarta la pulverizacin catdica, siendo que sta presenta ms
ventajas respecto al acabado de pelculas delgadas y control del procedimiento, es el costo
de los materiales y la complejidad del sistema.
42
para su evaporacin y deposicin en orden y espesores sin afectar el montaje durante todo
el procedimiento.
La celda de flujo est constituida por PDMS, un tipo de polmero prctico de manejar
sobre moldes por su fcil desprendimiento y replica de mscaras o relieves a pequeas
escalas.
Con el PDMS se busca generar la estructura de la celda de tal forma que sta sea
compatible con el equipo de medicin de SPR, adems de replicar los microcanales por
medio de un molde a una resolucin de 100 micras, fabricado por el mtodo de
fotolitografa.
6.6.1 Fotolitografa
43
En el caso de la fotoresina negativa el comportamiento es de manera opuesta. Cuando se
expone a la luz UV, la resina negativa permanece sobre la superficie del sustrato donde
est expuesta y la solucin reveladora elimina solamente las reas no expuestas. Por lo
tanto, las mscaras utilizadas para fotoresinas negativas contienen el negativo inverso del
patrn. La figura 16 muestra las diferencias de patrones generados por el uso de una
fotoresina positiva y negativa [42].
Figura 16. . Patrn generado a partir de la fotolitografa en fotoresina positiva y negativa [43].
44
6.6.1.2 Proceso de creacin de microcanales por fotolitografa
45
El desarrollo de microcanales usando SU-8 es bsicamente sencillo, solo requiere
experimentos de prueba y error, despus de esto se tendr un molde terminado para su
uso en la colada para verter el PDMS.
Para la creacin del cuerpo de la celda de flujo se disea un molde para generar la
estructura fsica que se ajuste al equipo de medicin. Este molde se realiza mediante
impresin 3D. En la figura 17 se muestra una propuesta de molde, que consta de 2 piezas.
Figura 17. Molde donde se verter el PDMS para formar la celda de flujo
El molde se disea tomando en cuenta la ranura de la celda que debe embonar en equipo
de medicin NanoSPR6/321.
46
a) b)
c) d)
Figura 18. A) Componentes PDMS, b), Mezcla de componentes, c) Vertido de PDMS en moldes, d) Horneado de
PDMS
47
Captulo 7. Desarrollo experimental
7.1 Diseo del biosensor para ser compatible con el equipo de medicin de SPR.
48
7.1.2 Chip sensor comercial
El chip sensor comercial est conformado por tres componentes, un vidrio ptico con
dimensiones de 20x20x1 mm, recubierto en una de las superficies de 20x20 por una capa
de Cr con un espesor de 5nm y sobre el Cromo una pelicula de Au de 45nm, sumando
as aproximadamente 50 nm, un empaque de silicn que cuenta con dos cpsulas y una
celda de flujo de acrlico que tiene canales de entrada y salida dirigidos a las cpsulas del
empaque de silicn (Figura 20).
Figura 20. . Componentes de Chip sensor comercial (Vidrio ptico, empaque de silicn, celda de flujo).
49
Figura 22. Volumen de muestra biolgica de chip sensor comercial.
50
Figura 24. Velocidad de flujo de agua dentro del Chip sensor comercial.
Figura 25. Simulacin de velocidades agua dentro del prototipo de chip sensor.
La velocidad mxima alcanzada para el caso de chip sensor comercial es de 0.008 m/s
mientras que para el prototipo es de 0.021 m/s. Se puede observar que en el prototipo se
alcanza una mayor velocidad de flujo dentro del canal, esto se debe a la cantidad de
volumen necesario para llenar cada celda, finalmente concluimos que no nos afecta el
aumento de la velocidad de flujo puesto que en el ensayo la solucin primero se introduce
dentro de la celda y se encuentra esttica para la prueba.
51
7.3 Impresin 3D de molde para celda de flujo
Se dise un molde compuesto de dos piezas para dar forma a la celda de flujo, en base
a las dimensiones especficas para ser ajustada en el equipo de medicin de resonancia de
plasmones superficiales NanoSPR/321.
El molde se fabric en la impresora 3D Proyectil FDM/20 (Figura 27a) que se apoya del
software Repetier Host para la preparacin de las piezas a imprimir. La impresin del
molde que se constituye de dos piezas (Figura 27b) se efectu en aproximadamente 2
horas.
a) b)
Figura 27. A) Preparacin de piezas del molde para impresin 3D. B) Impresin del molde de celda.
EL material utilizado para la impresin del molde es PLA (Figura 28) el cual se imprimi
a una temperatura de 210C con una velocidad de 60 mm/s.
52
Figura 28. . Material (PLA) para impresin 3D.
Se realiza limpieza para preparar la oblea (Figura 30), que consiste en colocar la oblea en
una caja de petri y agregar acetona hasta que quede cubierta completamente, se coloca la
caja dentro de un equipo de limpieza ultrasonica y hacerlo vibrar durante 5 min. Este
proceso se repite con alcohol isoproplico y agua, al termino de la limpieza se sopletea
con aire comprimido para el secado de la oblea.
53
Figura 30. Limpieza de oblea
Despues de la limpieza se coloca la oblea de silicio dentro de una lmpara de luz UV con
ozono (Figura 31), por un periodo de 5 min. para dejar un acabado hidroflico en la
superficie que ayuda a que la resina se distribuya uniformemente.
Figura 31. Lmpara de luz UV con ozono (UV Ozone Cleaner ProCleaner).
54
a) b)
Figura 32. a) Colocacin de la resina negativa SU-8, b) Configuracin de equipo Brewer Science 200x.
Grfica 1. . Relacin de espesor respecto a la velocidad de giro recomendada de acuerdo al tipo de resina SU-08
3000 a una temperatura de 21C [48].
55
Figura 33. Colocacin de la oblea sobre la placa de temperatura regulable a 95C por 45 min.
En esta siguiente etapa se utiliz una mscara la cual est constituida por un vidrio de
10x10x1 mm y la imagen de los microcanales que se muestra en la Figura 34a. En la
Figura 34b se muestran las medidas especficas de los microcanales. La mscara se realiz
con un plotter cortador para serigrafa en un papel adhesivo, esta se adhiere al vidrio que
previamente se limpia con el mismo procedimiento que la oblea de silicio.
a) b)
Figura 34. a) Imagen de microcanales en papel adhesivo, b) Dibujo acotado de los microcanales
56
a) b)
Figura 35. a) Superposicin de la mscara sobre a oblea con la resina, b) Exposicin de radiacin UV de la resina
negativa con la mscara para grabado de microcanales.
a) b)
Se retira la oblea del revelador y se roca alcohol isoproplico por 10 s (Figura 37). Si al
aplicar el alcohol se observa alguna sustancia blanca sobre la superficie de la oblea,
57
significa que el revelador no ha removido por completo la resina, por lo que se debe
sumergir nuevamente al revelador hasta que al rosear alcohol isoproplico no ocurra esto.
Para corroborar el espesor de los microcanales se utiliza el equipo Veeco Dektak 150
(Figura 39), que mide relieves a nivel micro. El espesor de los relieves de los microcanales
que obtuvimos es de aproximadamente 100 micras.
58
a) b)
c)
Figura 39. a) Equipo de Medicin Veeco Dektak 150, b) Medicin de la altura de los microcanales con el
perfilometro, c) Obtencin de datos de la altura de los microcanales en el equipo de cmputo.
59
Grfica 2. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro (143.3103 m de
espesor y 2.549 mm de ancho).
Grfica 3. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro (82.4824 m de
espesor y 2.678 mm de ancho).
60
Grfica 4. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro (99.0941 m de
espesor y 1.905 mm de ancho).
Grfica 5. Representacin de los datos obtenidos del espesor del microcanal por el perfilmetro (106.1784 m de
espesor y 1.891 mm de ancho).
El molde final para crear la celda de flujo est compuesto por la oblea con los relieves de
los microcanales y el molde del cuerpo, los cuales son fijados mediante cinta adhesiva
cuidando que selle correctamente para evitar fugas del PDMS, y poniendo atencin en
centrar el molde del cuerpo sobre la oblea.
61
Para la solidificacin del PDMS el cual se encuentra en estado lquido viscoso, se le
agrega el elastmero de silicona Sylgard 184 en una proporcin 10 a 1, es decir, para 10
ml de PDMS agregamos 1 ml del elastmero de silicona (Figura 40).
Ahora con la mezcla lista, se coloca dentro de una cmara de vaco para retirar las
burbujas generadas como se muestra en la Figura 42, hasta que ya no quede aire dentro
del polmero.
62
Figura 42. Cmara de vaco con mezcla de PDMS en su interior.
A continuacin se realiza el vaciado del polmero dentro del molde final cuidando de no
generar ms burbujas (Figura 43).
Para crear los conductos de entrada y salida de la muestra biolgica hacia los
microcanales se construy una tapa que tiene un tubin de 1mm de diametro para moldear
cada uno de los 4 conductos de entrada/salida (Figura 44).
63
Se lleva con precaucin el molde al horno de secado por aproximadamente 12 horas a una
temperatura de 60C o bien, para un secado ms rpido a 95C por 2 horas (Figura 45).
Se saca del horno el molde pasando el tiempo estimado y se retira la celda de flujo de
PDMS del molde. Se pueden observar los microcanales en el PDMS en la Figura 46.
Una vez fabricada la celda de flujo, sta se adhiere a un vidrio previamente limpio usando
el procedimiento realizado para la oblea de silicio. El vidrio y la celda de flujo se colocan
dentro de la cmara de radiacin de luz UV con ozono (UV Ozone Cleaner ProCleaner
(Figura 47)) por un tiempo de 5 minutos.
64
Figura 47. Exposicin de radiacin de luz UV con ozono de la celda de flujo y vidrio.
65
Figura 49. Vista lateral del prototipo final de la celda.
Figura 50. Vista superior del prototipo final de la celda, en la imagen se alcanzan a percibir los microcanales.
Figura 51. Vista inferior de la celda microfludica, como la pelcula de Au y Cr son muy delgadas, la luz alcanza a
atravesar.
66
7.7 Diagramas que resumen los procesos de fabricacin
INICIO
Introduccin de la oblea de Si
dentro de la cmara de luz
UV/Ozono durante 5 minutos.
FIN
67
FABRICACIN DE LA CELDA
MICROFLUDICA
INICIO
FIN
68
7.7 Prueba y calibracin de chip sensor con diferentes concentraciones de sucrosa
El primer paso fue ajustar la celda microfludica al equipo de medicin. Se logr ajustar
correctamente debido a que la celda de flujo fue diseada con las dimensiones fsicas del
equipo.
Figura 53. Configuracin final de nuestro prototipo de chip sensor para el dispositivo Nano SPR/ 321 1) Prisma de
retroflexin trapezoidal con un ngulo de 65, 2) Fluido de inmersin ptico (n = 1.6100), 3) Chip sensor de oro
(vidrio/Cr/Au), 4) Celda microfludica de PDMS.
69
1. Primero se coloco en el equipo NanoSPR6/321 el prisma de retroflexion
trapezoidal (n=1.61)(Figura 54):
a) b)
Figura 54. a) Prisma de retroflexin trapezoidal, b) Ajuste del prisma en el equipo de NanoSPR/321
a) b)
70
Finalmente el equipo de pruebas queda conformado por la computadora y el equipo de
resonancia que contiene nuestra celda microfludica (Figura 6 y 7).
a) b)
Figura 57. a) Equipo de pruebas de SPR constituido por una computadora y el equipo de medicin, b) Colocacin
de nuestra celda en el quipo NanoSPR/321.
71
Figura 59. Se observa la luz lser que incide en el prisma lo cual indica que est en funcionamiento.
a) b)
Figura 60. a) Mensaje de verificacin de conexin y bienvenida, b) Pantalla inicial donde se mostrara ms
adelante los datos de la prueba
El siguiente paso es llenar la celda con agua (Figura 61) y ejecutar la prueba de SPR por
la computadora. En la grfica que se muestra en la computadora (Figura 62) se observa
el ngulo crtico y el ngulo de SPR para el agua en la celda que fueron de 55.67 y
62.6834 respectivamente.
72
Figura 62. Para la calibracin de la celda se obtiene la curva de SPR con agua.
Figura 63. Se introducen diferentes concentraciones de sucrosa y se obtiene su respectiva curva de SPR.
73
Captulo 8. Anlisis e interpretacin de resultados
Al realizar la simulacin de las curvas donde se aprecian los ngulos de SPR de las
diferentes concentraciones de sucrosa, se pretende obtener la relacin del ngulo respecto
al ndice de refraccin.
El software WinSpall lee documentos en formato de texto plano, por lo que para ingresar
los datos de la curva obtenidos con el equipo NanoSPR 6/321 se recomienda guardarlos
en un archivo .txt, ya que ste los genera con extensin .sp1. El archivo debe contener
solo los puntos medidos acomodados en dos columnas, la primera con los datos del ngulo
de incidencia y la segunda con el valor de reflectividad ha dicho ngulo. Cabe mencionar
que los valores de los ngulos generados por el equipo deben estar expresados en grados,
mientras que los datos de reflectividad se tiene que normalizar respecto al valor de
reflectividad en el ngulo crtico o ms cercano a l.
74
Para cargar los datos se va a la seccin Scan y se selecciona Load. Aparecer un
recuadro como se puede observar en la Figura 65, que al dar clic en Load nos permitir
buscar el documento con los datos. Al seleccionar el archivo se podr observar en el
mismo recuadro el o los datos cargados que tenga el archivo con el que se estar
trabajando.
Una vez cargados los datos, se puede observar la curva del efecto SPR que se form con
el agua dentro del microcanal.
Grfica 6. Curva de resonancia de plasmones superficiales con agua dentro del microcanal.
75
Ahora, se prosigue a generar una curva que simule el fenmeno de SPR obtenido. Para
ello necesitamos conocer las caractersticas del prisma para el acoplamiento del chip
sensor y del rayo lser del equipo NanoSPR 6/321, las unidades para graficar la curva de
SPR y los espesores de cada uno de los materiales de nuestro sistema multicapa as como
su ndice de refraccin. Los valores de acuerdo a los espesores dados por el fabricante se
muestran en la siguiente tabla.
Tabla 3. Valores de ndice de refraccin en base a espesores de las capas de los metales dados por el fabricante.
Una vez con los datos para la simulacin, se procede a ingresarlos al software. Para ello,
en la parte de Simulation, seleccionamos Parameter (Figura 66) y se abrir un
recuadro.
Figura 66. Ingreso de parmetros para simulacin de la curva del efecto de SPR.
Dentro de los parmetros necesarios para la simulacin est el tipo de prisma que se usa
para las pruebas, para este caso usaremos el prisma de medio cilindro que es considerado
un prisma universal ya que el prisma de retroflexin trapezoidal no se encuentra dentro
de las opciones que tiene el programa. Otros datos a especificar son la longitud de onda
76
y el tipo de luz polarizada, que son 670 nm y luz P-polarizada respectivamente, de
acuerdo a las caractersticas del lser que nos da el equipo de medicin (Figura 67a).
Por ltimo, se especifican las caractersticas de los materiales que conforman el sistema
multicapa, donde se tiene que indicar que tipo de variable que se va a introducir, en este
caso, el ndice de refraccin (n) y el coeficiente de absorcin (k) para cada uno de los
materiales as como su espesor (Figura 67c). Los valores los podemos encontrar en la
Tabla 3.
a)
b)
77
c)
Figura 67. Parmetros de simulacin. a) Tipo de prisma, longitud de onda y luz polarizada, b) Lmites del ngulo y
c) Caractersticas de las capas del sistema.
Grfica 7. Simulacin de curva de SPR con agua como dielctrico dentro del microcanal.
Como se puede observar, la grfica simulada queda muy por debajo de los datos obtenidos
y se necesita que sta quede lo ms sobrepuesta a los valores del barrido realizado. Esto
se debe principalmente a que los espesores de las pelculas delgadas de los metales pueden
variar al momento de que se hizo el depsito y esto afecta al ndice de refraccin. Otros
78
factores que influyen en la medicin son las condiciones en las que se realiza el barrido
como pueden ser la temperatura, presin y humedad, adems de que el agua puede
presentar variaciones en la presin por la forma en que se introdujo y temperatura por el
tiempo en que se expone al rayo lser ya que ste la modifica.
El sobreponer las dos curvas nos ayudar a obtener los ndices de refraccin de las
soluciones a diferentes concentraciones de sucrosa que se introdujeron en el microcanal.
Principalmente se busca ajustar la posicin de los ngulos mnimos de reflectividad
(ngulo de SPR) de cada una de las curvas.
El ajuste de las curvas se puede realizar de dos maneras, de forma iterativa y forma
manual. En la parte de Simulation del software, en la seccin de Simulation se
encuentran las opciones manual e iterative que nos ayudarn a ajustar las curvas
(Figura 68).
Para el ajuste iterativo de las curvas se despliega un recuadro que nos permite seleccionar
los parmetros a modificar para que la simulacin se sobreponga a los datos medidos
(Figura 69). Dentro de los valores que se pueden modificar solo se deberan seleccionar
los parmetros de las pelculas de cromo u oro, ya que la capa 1, que representa al prisma
y al vidrio, y la capa 4 que viene siendo el agua destilada, mantienen su ndice de
refraccin, mientras que el Cr y Au pueden variar respecto al espesor de la pelcula. Una
vez seleccionados los parmetros se hace la iteracin dando clic sobre Start.
79
Figura 69. Ajuste iterativo de curvas.
Para el ajuste manual aparece un recuadro con los valores a modificar y de igual manera
solo se modifican los parmetros que son parte de las pelculas delgadas de cromo y oro
(Figura 70), donde se pueden aumentar o disminuir el valor desde 0.1, 0.01 o 0.001, o
bien editarlo.
El ajuste iterativo es rpido, pero no es efectivo ya que nos puede dar valores irreales
(como se puede observar en el recuadro naranja de la Figura 71, donde el ndice de
refraccin del Cr nos da un valor negativo) y/o lejos de los parmetros que se tienen (el
espesor del Au al que acopla la curva es de 37.32nm, cuando idealmente es de 45nm), por
tales motivos, se recomienda obtener la simulacin de la curva mediante un ajuste manual.
Winspall permite ver los ngulos de SPR de las curvas, ya que muestra el valor exacto
del ngulo donde se encuentra el valor mnimo de reflectividad. Para ello en la pantalla
80
de inicio, se encuentra un cono que hace una evaluacin para obtener dicho valores
(Figura 10).
En la Grfica 8 se observan las curvas ajustadas, donde se muestra la ubicacin del valor
mnimo de reflectividad.
Grfica 8. Curva de simulacin de SPR con agua destilada como dielctrico junto con curva de valores medidos en
el equipo de NanoSPR 6/321 con los valores mnimos de reflectividad.
Para poder obtener el valor exacto del ngulo, en la misma ventana de evaluacin de las
curvas, la opcin Min-Data (Figura 72), nos muestra los datos y con ello se puede
observar que los valores son muy cercanos entre la simulacin y los obtenidos en la
medicin, teniendo as para el agua destilada un ngulo de SPR de 62.6834 que
corresponde a un ndice de refraccin de n=1.3339.
Figura 72. Evaluacin de valores de la curva de SPR con agua como dielctrico y la curva simulada.
81
Despus de verificar el ngulo de SPR, ambas curvas se pueden observar en la pantalla
de inicio del programa una vez saliendo de la evaluacin (Grfica 9). En la Tabla 4
tenemos los parmetros finales de la curva de simulacin con valores reales y cercanos a
los especificados, que nos ayudar a obtener los ndices de refraccin de las prximas
soluciones.
Grfica 9. Curva de simulacin de SPR con agua destilada como dielctrico ajustada a los valores medidos en el
equipo de NanoSPR 6/321.
Tabla 4. Valores de ndice de refraccin en base a espesores de las capas de los metales dados por el fabricante.
Una vez con las curvas ajustadas, se procede a agregar los datos de la prxima curva que
se obtuvo, que es la generada teniendo como lquido la solucin de agua y sucrosa a una
concentracin de 0.04 g/ml. Ahora, en la Grfica 10 se pueden observar tres curvas que
82
representan el efecto SPR, los recuadros negros son los datos obtenidos con agua como
dielctrico y la lnea roja continua la simulacin, mientras que los crculos rojos son las
mediciones de la solucin de sucrosa a la concentracin de 0.04 g/ml.
Grfica 10. Curva de SPR de la solucin de sucrosa a una concentracin de 0.04 g/ml.
Ahora, basta con variar el valor del ndice de refraccin de la capa 4, que es la que
representa el dielctrico, ya que en el sistema multicapa sta fue la nica que se modific
al sustituir el agua con la solucin de sucrosa, manteniendo las pelculas delgadas tal y
como se plantearon para el ajuste de la simulacin.
El ndice de refraccin se modificar hasta acercar la posicin del ngulo con el valor
mnimo de reflectividad de la curva simulada junto con el valor mnimo de reflectividad
de la curva generada con las nuevas mediciones adjuntadas. Como se observa en la Figura
73, en la seccin de evaluacin de las curvas, al igual que en caso cuando solo tenamos
la curva que representa el fenmeno con agua, se pueden obtener el valor especfico del
ngulo, el cual es de 63.1497.
Figura 73. Evaluacin de valores del ngulo de SPR y reflectividad para la solucin de sucrosa a una concentracin
de 0.04g/ml.
83
Una vez ajustadas las curvas (Grfica 11), obtenemos el ndice de refraccin para la
solucin, que en este caso da de n=1.3391.
Grfica 11. Ajuste de curva de SPR de la solucin de sucrosa a una concentracin de 0.04 g/ml con la simulacin
de la curva de SPR con agua destilada.
El prximo paso es adjuntar los valores obtenidos de las curvas que restan a las diferentes
concentraciones, que fueron de 0.08, 0.12, 0.16 y 0.20 g/ml, y de la misma manera, con
ayuda de la simulacin, se va a ir variando solamente el ndice de refraccin para recorrer
la curva y que queden alineados una a una el ngulo de SPR de la curva de datos medidos
con la simulada para obtener los ndices de refraccin de las diferentes soluciones. En la
Grfica 12, se aprecia como las curvas de las soluciones (curvas punteadas rojas), se van
recorriendo a la derecha gradualmente conforme la concentracin de sucrosa aumenta, lo
que hace que el ndice de refraccin se incremente de la misma manera. Las curvas de los
valores medidos con agua destilada representadas por los recuadros negros nos sirven
para observar como el ngulo de SPR se va alejando conforme aumenta la concentracin
de sucrosa.
84
a) b)
c) d)
Grfica 12. Curvas del efecto de SPR a diferentes concentraciones de sucrosa, a) C=0.08 g/ml, b) C=0.12 g/ml, c)
C=0.16 g/ml, d) C=0.20 g/ml.
De igual forma, dentro del software Winspall 3.02, se pueden visualizar todas curvas
obtenidas a las diferentes concentraciones de sucrosa como se puede observar en la
Grfica 13, donde adems, en la evaluacin de las curvas, marca los mnimos de
reflectividad para poder obtener el valor exacto del ngulo de SPR como se realiz
anteriormente.
En la Tabla 5 se pueden observar los marcadores que tienen cada una de las curvas de la
figura, adems del ngulo de SPR, el valor de reflectividad en el que se da dicho ngulo
y el ndice de refraccin que le corresponde en base a esos valores.
85
Grfica 13. Curvas de SPR a diferentes concentraciones de sucrosa con sus valores mnimos de reflectividad
marcados.
Concentracin ndice de
Reflectividad
Representacin de sucrosa ngulo de Refraccin
[u.a.]
[g/ml] SPR [] [u.a.]
0 62.6834 0.3639 1.3341
0.04 63.1497 0.3771 1.3391
0.08 63.5326 0.3910 1.34315
0.12 63.9699 0.3654 1.3478
0.16 64.4011 0.3838 1.3524
0.2 64.9263 0.4439 1.3574
86
Relacin de Angulo de SPR e ndice de Refreccin
65.5
65
64.5
64
[]
SPR
Theta
63.5
63
62.5
62
1.33 1.335 1.34 1.345 1.35 1.355 1.36 1.365
Indice de Refraccin, n[u.a.]
En la Grfica 15 se tiene una grfica que muestra los valores estimados del ndice de
refraccin en funcin de la concentracin de sucrosa. Se tiene que en promedio el ndice
de refraccin tiene un incremento de 0.0046 por cada aumento de 0.04 g/ml en la
concentracin de sucrosa. La recta que permite representar una aproximacin de los
puntos viene dada por y=0.115x+1.3342 con un coeficiente de correlacin r= 0.9996331,
que de igual manera, nos representa una alta relacin entre las variables, por lo que
podemos decir, que el comportamiento del sensor es lineal.
1.36
1.355
Indice de Refraccin, n[u.a.]
1.35
1.345
1.34
1.335
1.33
0 0.02 0.04 0.06 0.08 0.1 0.12 0.14 0.16 0.18 0.2
Concentracin de sucroca [g/ml]
87
Captulo 9. Conclusiones
El acabado del molde impreso en 3D para la fabricacin de la celda present relieves que
dificultaron el desmolde y afectaron la esttica, por lo que el molde se recubri con una
pelcula de esmalte que ayud al desprendimiento del PDMS y a la generacin de una
menor cantidad de burbujas en la celda, siendo que estas burbujas pudieran afectar los
microcanales y/o los conductos de entrada de fluido.
Por otra parte, el curado del PDMS se recomienda sea por un periodo de al menos 12
horas en el horno a una temperatura de 60 C, ya que el colocarlo a una temperatura de
95C por 2 horas puede generar afecciones antiestticas como burbujas.
88
El unir la placa sensora con la celda microfludica mediante UV/Ozono resulto efectivo,
esto se comprob al no presentar derrames en la calibracin y prueba de funcionamiento,
lo que aseguro que el prototipo se pueda presentar en una sola pieza.
Una vez obtenidos el molde para la estructura de la celda, la oblea con los relieves para
los microcanales y el vidrio ptico con las pelculas de Cr y Au depositadas, el tiempo de
fabricacin de la celda microfludica depende principalmente del curado del PDMS, ya
que la unin de la celda demora aproximadamente 10 min. Adems, este tipo de
procedimientos se pueden adaptar a cualquier laboratorio con los equipos adecuados,
logrndose realizar a bajo costo.
Para las pruebas del dispositivo se trat de replicar en cada experimento para las
diferentes concentraciones de sucrosa a 0, 0.04, 0.08, 0.12, 0.16 y 0.20 g/ml la forma de
introducir la muestra a los microcanales, controlando la fuerza y la velocidad con la que
se coloc as como el tiempo de exposicin del fluido al rayo lser, ya que esto puede
modificar las condiciones de las soluciones y propiciar resultados errneos.
El ndice de refraccin estimado de cada solucin fue obtenido con el software WinSpall
3.02 simulando las curvas de SPR obtenidas en el equipo NanoSPR 6/321. Cada curva
experimental se ajusta manualmente a una simulada variado el ndice de refraccin con
el fin de que el ngulo de SPR coincidan, lo que ocasiona cierto error en el ndice de
refraccin. A pesar de este error, la relacin obtenida del ngulo de SPR con el ndice de
refraccin presenta un comportamiento lineal con un coeficiente de correlacin de
0.9996331.
89
Captulo 10. Recomendaciones y/o Sugerencias para investigaciones futuras.
90
Bibliografa
[5] C. Choi S, Surface plasmon resonance biosensor based on competitive protein adsorption
for the prognosis of thyroid cancer, 2012.
[10] Navina Mehan, Vinay Gupta, K. Sreenivas y Abhai Mansingh, Surface plasmon
resonance based refractive index sensor for liquids, vol. 43, 2005.
91
[13] S. F. D., Tcnicas basadas en la resonancia de plasmones superficiales. Deteccin y
estudio de reacciones de hibridizacin de ADN en superficies., Repblica Argentina,
2001.
[19] G. Campuzano Maya , Utilidad clnica de los marcadores tumorales, vol. 16, n 9-10,
2010.
[23] GoodFellow, GoodFellow Divisin ceramica y vidrio, 2016-2017. [En lnea]. Available:
http://www.goodfellow-ceramics.com/sp/productos/vidrio/vidrio-optico. [ltimo
acceso: Enero 2016].
92
[27] S.-K. F. Da-Shin Wang, Nacional Center for Biotechnology Information, 27 Julio 2016.
[En lnea]. Available: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5017341/. [ltimo
acceso: 10 Mayo 2017].
[28] J. A. Soto Olmos, Induccin de rejillas de periodo largo en fibras pticas mediante la
aplicacin de dispositivos MEMS de polmero, Mxico: Programa de Maestra y
Doctorado, Universidad Autnoma de la Ciudad de Mxco, 2011.
[38] N. A. Alarcn Reyes, Resistividad Elctrica de pelculas delgadas de cobre recubiertas con
TiO, Santiago de Chile, Chile.
93
[40] V. Arribas Pardo, Formacin de nanoestructuras de silicio por evaporacin trmica y
pulverizacin catdica: Intento de crecimiento de nanohilos de silicio, Barcelona, Espaa:
Universidad Autnoma de Barcelona, 2012.
[43] MicroChem Corp., SU-8 2000 Permanent Epoxy Negative Photoresist, [En lnea].
Available: http://www.microchem.com/pdf/SU-
82000DataSheet2000_5thru2015Ver4.pdf. [ltimo acceso: 21 11 2016].
[44] MicroChem Corp., Microposit 1800 Series Photo Resists, [En lnea]. Available:
http://www.microchem.com/PDFs_Dow/S1800.pdf. [ltimo acceso: 21 11 2016].
[46] NanoSPR Devices, [En lnea]. Available: http://nanospr.com. [ltimo acceso: 11 10 2016].
[48] MicroChem Corp., SU-8 3000 Permanent Epoxy Negative Photoresist, [En lnea].
Available: http://microchem.com/pdf/SU-8%203000%20Data%20Sheet.pdf. [ltimo
acceso: 20 4 2017].
94
Anexos A. Obtencin del vector de resonancia de plasmones superficiales
Las funciones de las ondas electromagnticas para cada uno de los medios en una
interfase metal-dielctrico para el fenmeno de resonancia de plasmones superficiales,
considerando que la onda incidente se da por medio de luz P-polarizada, pueden
representarse de la forma:
De las funciones de onda (1) que representan el campo elctrico y el campo magntico
en los diferentes medios, tenemos que y son las componentes del vector en x,
y las componentes en la direccin z y es la frecuencia angular, adems de
que se ignorarn materiales magnticos, es decir, se considerar =1 durante el
desarrollo, donde dichas funciones deben de cumplir las ecuaciones de Maxwell, en este
caso en presencia de una densidad de corriente ,
= 0 (2a)
=0 (2b)
1
+ =0 (2c)
1 4
= (2d)
= (3)
= (4)
95
Aplicando la ecuacin de Maxwell (2d) con = 0 por ausencia de flujo de cargas a los
campos y de las funciones en (1), se obtiene:
= (5)
= (6)
= (7)
= (8)
que muestra que los plasmones superficiales slo se excitan en una interfase entre medios
con constantes dielctricas de signos opuestos, en este caso < 0 y > 0 [13].
Por otro lado, aplicando la ecuacin de Maxwell (2c) a los campos y se obtiene:
+ = (10)
= (11)
A partir de la ecuacin (11), junto con las ecuaciones (7) y (8), obtenemos:
2
2 + 2 = ( ) (12a)
2
2 + 2 = ( ) (12b)
2
= ( ) 2 (13a)
2
= ( ) 2 (13b)
96
=
+ (14)
97