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ADN ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO

La molcula de la vida
Friedrich
Miescher,
1869
Nucleina

Phoebus Levene, 1919 Oswald Avery, 1944

Linus Pauling, 1948


Francis Crick
y
James Watson
ADN
(Acido desoxirribonucleico)

Es un tipo de cido
nucleico, una
macromolcula que forma
parte de todas las clulas.
Contiene la informacin
gentica usada en el
desarrollo y el
funcionamiento de los
organismos vivos
conocidos y de algunos
virus, siendo el responsable
de su transmisin
hereditaria.
ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN
GRUPO DESOXIRRIBOSA
FOSFATO
Su formula qumica es PO4-3
Estructuralmente esta
formado como sigue:
ADENINA

BASE NITROGENADA

GUANINA
Las bases son compuestos
heterocclicos y aromticos con
dos o ms tomos de
nitrgeno. Pueden ser:

BASES PURICAS: CITOSINA

A y G

BASES PIRIMIDICAS:
C, U y T TIMINA
NUCLEOTIDO

NUCLEOSIDO
ESTRUCTURA
SECUNDARIA DEL
ADN
La formacin de enlaces
asimtricos implica que cada
hebra de ADN tiene una
direccin.
En una doble hlice, la direccin de
los nucletidos en una hebra (3
5) es opuesta a la direccin
en la otra hebra (5 3).
Esta organizacin de las hebras de
ADN se denomina antiparalela;
son cadenas paralelas, pero con
direcciones opuestas.
EXTREMO 5 P NH2 EXTREMO 5 P
C
O O O H-C N
H-C C
HO P O P O P O - CH2 O N O

OH OH OH

OH H NH2
C
O
P OH N
O O O O C N
C
C C
HO P O P O P O CH2 O N N
OH OH OH

OH H
O O
P OH C
O O O O H3C C N-H
H-C C
HO P O P O P
O
CH2 O N O

OH OH OH

OH H NH2
O
P OH N C
O O O O C N
C
C C
HO P O P O P O CH2 O N N
Pirofosfato OH OH OH

OH H
O O
P OH
C
O O O O H3C C N-H
H-C C
O
O
HO P O P O P CH2 N O
OH OH OH

EXTREMO 3 OH OH H

EXTREMO 3 OH
EXTREMO 5 P H OH
EXTREMO 3 OH
O O O CH2

A :::
T O

HO P O P O P O - CH2 O
O
OH OH OH P OH
O
H O
O H
O
P OH

C :::
O
G O CH2
CH2 O ::: O
P OH
O
H O
O H
O
P OH

CACGT
O

G :::
C O CH2

CH2 O ::: O
P OH
O
H O
O H
O
P OH
O
ACGTG T :::
A O CH2
CH2 O O
P OH
O
H O
O H
O
P OH OH OH OH
O

G :::
C O P O P O - CH2 HO P O

CH2 O ::: O O O

OH H

Las Cadenas son Antiparalelas EXTREMO 5 P


EXTREMO 3 OH
ESTRUCTURA TERCIARIA DEL ADN: ADN LINEAL

Los 24 cromosomas nucleares del genoma


humano son molculas lineales de DNA
ESTRUCTURA TERCIARIA
DEL ADN
ADN CIRCULAR

ADN GENOMICO
BACTERIANO
PLASMIDOS
ADN CIRCULAR
FUNCIONES BIOLOGICAS
DEL ADN

Autoduplicacin (replicacin
del ADN)
Almacenamiento de
informacin (genes y genoma).
Codificacin de protenas
(transcripcin y traduccin).

DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGIA MOLECULAR


DUPLICACION
DEL ADN

La divisin celular
requiere de la
duplicacin del
material gentico.

Cada hebra sirve como


molde para replicar la
complementaria.

Stabilization of stalled DNA replication forks. In wild-type


cells, the S phase checkpoint ensures that DNA replication
proteins remain associated with the replication fork in the
presence of the replication inhibitor hydroxyurea.
Bidireccional: Se da hacia ambos lados del
SEMICONSERVATIVA sitio de inicio denominado origen de
replicacin
A cada lado de la burbuja de replicacin se
forma una horquilla de replicacin

Experimentos de
Meselson y Stahl (1957)
La duplicacin de la nueva cadena es de 5 3
Semidiscontinua
REPLICACIN EN
PROCARIOTAS
Inicio
Reconocimiento de orgenes de

replicacin.
Separacin de hebras.

Posicionamiento de maquinaria

transcripcional.

Elongacin
Crecimiento bidireccional de las

horquillas de replicacin.
Replicacin semiconservativa,

semidiscontinua, coordinada.

Terminacin
Reconocimiento de seales de

terminacin.
Research in bacterial model systems has shown that developmental
Desensamble de replisomas. events are synchronized both during transcription, via DNA-binding
proteins with multiple genetic modules, and at the posttranslational
level through bifunctional proteins that can molecularly couple
developmental events.
REPLICACIN EN
PROCARIOTAS

ADN polimerasas: Sntesis de ADN


Primasas: Generacin 3OH libres
Ligasas: Unin los fragmentos de
Okazaki
Helicasas: Separacin de hebras
Topoisomerasas: Mantenimiento del
grado de superenrollamiento
SSBs: Mantenimiento de simples
hebras
Inicio: Formacin de la
horquilla de replicacin
Formacin de horquilla de replicacin en E. coli
REPLICACION EN
EUCARIOTAS

Los mecanismos son


similares
Ms de un origen de
replicacin por
cromosoma
Es ms complejo
Utiliza mayor cantidad de
enzimas

In this Special Focus Genomic Regulation issue, Trends in Cell


Biology delves into the nucleus to examine recent findings on
myriad forms of genomic regulation, from co-transcriptional
splicing to Xist, and the role of such regulation in cell biology.
Diferencias de replicacin entre eucariotas y
procariotas

Eucariotas
Procariotas Se origina en varias
Se da solo en un lugar horquillas de replicacin a
de origen la vez.
2 horquillas de El genoma humano es
replicacin. 700 veces mas larga que
el genoma de E. coli.
Velocidad de
Velocidad de replicacin
replicacin: 60Kb/min
lenta: 2-3 Kb/min
Una replicacin del Una replicacin del ADN
ADN puede durar hasta puede durar hasta 20 das
30 minutos.
Funcin de protenas de horquilla del
ADN
Qu ocurre antes de la replicacin en eucariotas ?

RECONOCIMIENTO
DEL ORIGEN

ENSAMBLE DEL COMPLEJO


DE PREREPLICACION

ACTIVACION DEL COMPLEJO


DE PREREPLICACION

ORC: Complejo de reconocimiento del origen.


CDC6:Factor de divisin del ciclo celular 6.
CDT1: Factor de transcripcin de tipo 1 dependiente
de cdc10.
Geminina: protena asociada a CDT1.
MCM9: Protena de mantenimiento del
minicromosoma.
MCM2-7: Complejo asociado a MCM9, dependiente
de ATPasa ycon actividad helicasa

www.nature.com/reviews/molcellbio OCTOBER 2010 VOLUME 11


Orgenes de replicacin
Caractersticas de los orgenes de
replicacin del ADN

MAR: Regin de unin a la matriz

Ocurre durante la fase S


Una nica vez por ciclo celular
Horquilla eucariota
Catlisis y
Estructura del ADN
polimerasa
Francis
Genoma humano Craig Bill Collins
Clinton
y el proyecto del Genoma Venter

humano
El genoma humano es la secuencia de
ADN contenida en 23 pares de
cromosomas en el ncleo de cada
clula humana diploide.
El Proyecto Genoma Humano (PGH) fue
un proyecto de investigacin cientfica
con el objetivo fundamental de
determinar la secuencia de pares de
bases qumicas que componen el ADN
e identificar y cartografiar los
aproximadamente 20.000-25.000 genes
del genoma humano desde un punto de
vista fsico y funcional. Fundada en el
1990 por Francis Collins y presentada
en su totalidad el 2003.
EPIGENETICA
La epigentica hace referencia a los mecanismos de regulacin gentica que no
implican cambios en la secuencias de ADN.
El trmino fue acuado por Conrad Hal Waddington en 1942 para referirse al
estudio de las interacciones entre genes y ambiente que se producen en los
organismos.

MECANISMOS DE REGULACION
EPIGENETICA
1.- Metilacion del ADN. H2A.Z
2.- Modificacin de histonas. H3.3
H2B H2A
Linker histone

Acetilacin H3 H4 H1
Metilacin
Ac
Fosforilacin Ac

Otras Me
Histone tail modifications
3.- ARN no codificantes.
1.- Metilacion del ADN.
A la base citosina se le aade un grupo metilo el cual
permite la conformacin cerrada de la cromatina.
Un alto grado de metilacin se asocia con el
silenciamiento de genes.
Se ha observado que la metionina, la colina, el cido
flico y las piridoxinas (que son sustancias provenientes
de la dieta) tienen como funcin la adicin de grupos
metilos.
La metilacin se da en mayor grado en las islas CpG
(regiones con alta concentracin de citosina y guanina)
las cuales forman parte de la regin promotora de los
genes, mediante la enzima ADN metiltransferasa y
protenas de unin metil-CpG.
Si existen anomalas en el silenciamiento de ciertas
copias se pueden dar cambios en el fenotipo que pueden
ser resultado de enfermedades como el caso del
sndrome de Beckwith Wiedemann. Este sndrome se da
cuando las dos copias del gen IGF2 estn activas.
Se ha determinado que un alto ndice de metilacin de
genes reguladores del ciclo celular y reparadores de ADN
lleva a una mayor frecuencia de la formacin de tumores
cancergenos.
Metilacin del DNA
MetilacindeCpGenlaposicin5delaC

DNMT
+SAM

Pol
FT
DNAnometilado P Exon 3
Exon 1 Exon 2 Expresingnica
Transcripcin

Ac
Me
Histona HDAC HMT Histona
MeCP2

DNAmetilado P Exon 1 Exon 2 Exon 3 Expresingnica


Transcripcin
MetilacindelDNA

GluckmanPD.NatureReviewsEndocrinol.2009,5:401408
NafeeTM:BJOG2008,115:158168.
Evidenciadelainfluenciadefactoresdietariosinvolucradosenlaregulacin
epigenticadelmetabolismoendistintasetapasdelavidaenmamferos
Nacimiento Ablactacin Adulto
Lactancia

Crecimientofetal CrecimientoNeonatal

Dietabajaenprotenas Exceso dealimentacinneonatal Dietaaltaengrasa


MetilacindelDNA MetilacindelDNA
MetilacindelDNA
Receptor deangiotensina(glndulaadrenal; POMC(hipotlamo; rata)
ratn) Sistemadeneurotransmisores (cerebro;
Receptordeinsulina(cerebro;rata)
Npy,Cart,Pomc (cerebro;rata) rata)
TACSTD2(humano)
MltiplesgenesenF2(clulasb;rata)
Leptina (tejidoadiposo;ratn)
PPARa,LXRa (hgado;ratn)*Reviertecon
cidoflico Restriccincalrica
Dietaaltaengrasas
MetilacindelDNA
MetilacindelDNA
Consumoinadecuado deenerga Hras(rata)
Genesasociados adopaminayopioides RUNX(humano)
(cerebro;ratn) MetilacindelDNA P16(humano)
Cdkn1a(hgado;rata) ATP10A,WT1,TNFa (tejidoadiposo;
IL10,LEP,ABCA1,GNASAS, MEG3,
humano)
IGF2(humano)
Consumodecido flico
HNF4A(humano) Modificacionesdehistonas
MetilacindelDNA BOLA3,FLJ20433,PAX8,SLITRK1,
ZFYVE28(humano) p16INK4 (humano)
IGF2(humano) hTERT (humano)
RXRa,eNOS (humano)
CambiosmediadosporSIRT1(FOXO,
Modificacionesdehistonas PGC1A,HDAC1,etc;ratn,rata).
Pdx1(clulabeta;rata)
Glut4(msculoesqueltico;rata)
Dusp5,IGF1(hgado,hipocampo;
rata)
11bDH(rin;rata)
PPAR ( l t )
2.- MODIFICACION DE HISTONAS
3. ARNs no
codificantes
ncRNAs pequeos ncRNAslargos
(18200nt) (200nt1000kb)

lncRNAs
Tamao:>200nt
miRNAs siRNAs piRNAs TranscritosporRNAPolIIyIII
Tamao:1824nt Tamao:2024nt Tamao:2430nt
TranscritosporRNAPolIIyIII TranscritosporRNAPolII TranscritosporRNAPolII PosiblesorgenesdeloslncRNAs
TranscripcinBidireccional Mutacinenungencodificantedeprotenaquemodifiqueel
Transcripcin Intrnicos TranscripcinBidireccional marcodelectura
encluster

Rearregloscromosmicos
NCLEO

PrimiRNA Duplicaciones
ncRNApequeo ncRNAlargo

Insercindetransposonquecontieneunsitiodeiniciodelatranscripciin

Drosha PontingCP.2009

procesamiento MecanismosdeaccindescritosparaloslncRNAs
PremiRNA Regulacinencis Regulacinentrans

DRC1
Dicer procesamiento
Dicer
CITOPLASMA

?
ModificacinAlostrica
piRNAs
miRNA siRNA
PIWI

RISC Anzuelo

5 RITS
5
Represin PTGS: TGS:
Regulacin Controlde
traduccionalo Degradacin Modificaciones epigentica
encromatina transposones
activacindemRNA demRNA
CollinsL,2011 CollinsL,2011 GuttmanM,RinnJ.2012
CollinsL,2011
http://www.dnai.org/a/index.html
(cual es la estructura del ADN?)
http://www.pbs.org/wnet/dna/episode
1/index.html (Quienes son los
investigadores detrs del ADN?)
www.nature.com (Cual es el paper
que presentaron watson y crick)
http://www.web.virginia.edu/Heidi/cha
pter12/chp12.htm (Cual es la
estructura del ADN?)
http://nanobiologynotes.blogspot.com
/ (Cmo se lleva a cabo el proceso
de duplicacion del ADN?)
www.pubmed.com (Cul es la
secuencia del genoma humano?)
www.science.com (El primer
borrador del genoma humano)
www.orln.gov (Conocer todo sobre el
proyecto del genoma humano y sus
aplicaciones)

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