Protenas

Las protenas son las biomolculas ms comunes del planeta.

Son altamente diversas
Varan enormemente de tamao. De pptidos pequeos a polmeros enormes.
Todas estn conformadas por los 20 aminocidos, estos estn unidos en secuencias lneas
de forma covalente. Los aminocidos tienen propiedades nicas determinadas por sus
cadenas laterales. Conforman el alfabeto en el que est escrito el lenguaje proteico.
La clula es capaz de producir diversas sustancias apartir de los aminocidos como
hormonas, enzimas, anticuerpos, transportadores, toxinas, partes de animales, antibiticos
entre muchas otras cosas ms. Todo esto a partir de la unin de los 20 aminocidos que
forman gran variedad de protenas muy diferentes entre s.

Aminocidos

Generalidades

Las protenas son polmeros de aminocidos.

Los residuos aminocidos son bloques formadores de polmeros, llamados as por la
prdida de una molcula de agua cuando los aminocidos se unen a travs de un enlace
covalente especfico.
Las protenas son hidrolizables hasta sus aminocidos constituyentes.
Los 20 aminocidos son -aminocidos, estos tienen un grupo carboxilo y un grupo amino,
que estn unidos al mismo -carbono.
o La prolina al ser un aminocido cclico es una excepcin a esta regla.
Existen ms aminocidos fuera de este grupo de 20 pero son mucho menos abundantes.
Difieren en las cadenas laterales, tambin llamadas Grupos-R, que varan en estructura,
tamao y carga elctrica.
o Esto determina la solubilidad en agua de los aminocidos
Existen dos convenciones para identificar los carbonos en un aminocido.
o En una se utilizan los nmeros 1, 2,3 para numerar los tomos de carbono en una
cadena de aminocidos, se designa el carbono del grupo carboxilo como el nmero
1, l -carbono es el nmero 2 y de ah los carbonos de repollo.
o En la otra convencin, los carbonos son nombrados de acuerdo a letras griegas,
empezando apartir del -carbono.
El -carbono, est unido a un tomo de carbono, un grupo carboxilo, un grupo amino y un
grupo-R, por lo que se le denomina un centro quiral.
Poseen ordenamiento tetradrico en sus orbitales por lo que pueden apareces en forma de
dos esteroisomeros; especficamente enantiomeros.
Son pticamente activas.
Existe una nomenclatura especial, para designar la configuracin absoluta de los
aminocidos, este es el sistema L, D. En breve si el grupo amino se encuentra a la derecha
del -carbono, se denominar D-aminocido y si est a la izquierda ser L-aminocido.
 Los residuos estructurales de las protenas son exclusivamente L-esteroisomeros. Los D-
esteroisomeros slo han sido encontrados en unos pocos pptidos pequeos y antibiticos
peptdicos.
En sistemas vivos, la formacin de sistemas estables requiere que los aminocidos posean
la misma esteroisomera.

Clasificacin de los aminocidos de acuerdo a sus grupos-R

Se pueden agrupar en cinco categoras de acuerdo a las propiedades de los grupos-R

Grupos R apolares alifticos

Son apolares e hidrofbicos, se estabilizan entre s por medio de interacciones hidrofbicas.
o Glicina
o Alanina
o Prolina
o Valina
o Leucina
o Isoleucina
o Metionina
Grupos R aromticos

Relativamente apolares, todos participan en reacciones hidrofbicas

o Fenilalanina
o Tirosina
o Triptfano
Grupos R polares sin carga
Son ms solubles en agua ya que contienen grupos funcionales que forman puentes de
hidrogeno con el agua.
o Serina
o Treonina
o Cistena
o Asparagina
o Glutamina
Grupos R cargados positivamente

De los grupos ms hidrofilicos

o Lisina
o Histidina
o Arginina
Grupos R cargado negativos
o Aspartato
o Glutamato
Aminocidos no estndar con funciones importantes

4-hidroxiprolina
5-hidroxilisina
6-N-metil-lisina
y-carboxiglutamato
Desmosina
Selenocistena
Ornitina
Citrulina

Naturaleza de cido-base

Los aminocidos se comportan tanto como cidos como bases, a este tipo de sustancias se le
denominan anfteras (anfolitos)