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Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

Verificacin terica del papel que juega la


entropa en fenmenos de autoorganizacin y
autoreplicacin.

Realizado por:

Luis Ramiro Nez del Prado Miranda.

Asesor:

Prof. Mg. Rolando Moiss Perca Gonzales.

Arequipa

2014

I. INTRODUCCION

Los fenmenos tanto de auto-organizacin como de auto-replicacin son fenmenos


evidentemente vinculados a los sistemas biolgicos; por lo tanto la curiosidad por estos
temas y las primeras hiptesis acerca de ellos tuvieron reflexiones acerca de estos las
hicieron gente que buscaba el cmo y sobre todo el porqu del fenmeno biolgico.
El otro fenmeno en cuestin, a saber la entropa (nacida en el seno de la termodinmica y
mecnica estadstica), es un concepto proveniente netamente del mundo fsico, y que al
tener estrecha relacin a otro concepto tan ampliamente aceptado y tan fsicamente
confiable como es la energa, mediante la relacin entre entropa y calor, tiene un fuerte
asidero en nuestras percepciones acerca del mundo fsico. La descripcin estadstica de la

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entropa como relacionada a los cantidad de microestados en un sistema termodinmico, y


de esta manera llega tambin a ser la cantidad de desorden en un sistema; en contraposicin
a la idea de desorden se halla la idea de orden y por lo tanto de informacin [1].
As la idea de relacionar a la entropa con los organismos biolgicos y sus mecanismos los
cuales parecen conllevar aumento de orden en el espacio y tiempo (Para nuestro caso auto-
organizacin y auto-replicacin) tuvo que venir desde el mundo de la fsica.
El primer fsico en atreverse a plantear ciertos supuestos acerca del fenmeno biolgico y
de relacionar el aumento de orden de estos (auto-organizacin) con la disminucin de la
entropa fue ni ms ni menos que el gran maestro Erwin Schrdinger [14] adems de
plantear muchas ideas acerca de la complejidad necesaria para la existencia de organismos
biolgicos; en esta misma obra el propona la disminucin de la entropa como una cantidad
ideal como para describir fsicamente que un sistema pudiera tender al orden que
caracteriza un ser vivo. Acerca sus sentimientos al abordar este tema, textualmente dijo:
I can see no other escape from this dilemma (lest our true who aim be lost forever) than
that some of us should venture to embark on a synthesis of facts and theories, albeit with
second-hand and incomplete knowledge of some of them and at the risk of making fools of
ourselves.
Posteriormente no hubo inmediatos avances significativos en cuanto al tema sino hasta los
aos 60 y 70 en los que un grupo de investigacin de la Universidad Libre de Bruselas (P.
Glansdorff, I. Prigogine, G. Nicolis, entre otros) realizaron los primeros estudios serios de
la termodinmica fuera del equilibrio [9,8] los cuales dieron como resultado el principio de
auto-organizacin de los sistemas no lineales en desequilibrio termodinmico a travs del
descubrimiento de las Estructuras disipativas [13], con la cual se le otorgo en el ao de
1977 el premio Novel al cientfico ruso-belga Ilya Prigogine este tipo de estructuras nacen
del desequilibrio termodinmico y son las que rigen nuevos estados estacionarios y en los
que se basa el principio fsico de la auto-organizacin [12]; para esto se hace una
generalizacin del concepto de entropa el cual en el desequilibrio adquiere un significado
local y brinda un criterio general de evolucin de un sistema macroscpico [8].
Casi simultneamente a esta escuela en Alemania el seor Manfred Eigen (tambin ganador
del Novel) hizo investigaciones acerca de la auto-organizacin [4] pero esta vez haciendo
uso de los conceptos de seleccin natural. En sus trabajos tambin utiliza el concepto de

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entropa citando los trabajos de la escuela de Bruselas y a los trabajos de L. Brillouin [1]
donde se habla de la informacin de los sistemas biolgicos y de las competencias del tipo
darwinistas entre los contenido informativos y estructurales de las molculas biolgicas.
Por otro lado el estudio fsico de la auto-replicacin es recientemente por el seor Jeremy
England del Instituto Tecnolgico de Massachusetts en el ao 2013 lanzo una publicacin
titulada Fsica estadstica de la auto-replicacin [5] en la que a travs de las relaciones de
entropa de un sistema auto-replicador con un bao trmico en el cual se da una
ganeralizacin de la segunda ley de la termodinmica en la que aparece un nuevo termino
que nos ofrece una descripcin las relaciones macroscpicas de la auto-replicacin basado
en el teorema de fluctuaciones relaciones de Crooks [2].

II. OBJETIVOS DE INVESTIGACIN.

4.1 Objetivo General

Hacer un estudio de la entropa donde tericamente se reproduzcan las demostraciones de


manera extensa de los fenmenos autoorganizativos y autoreplicativos.

4.2 Objetivos Especficos

Comprobar la imposibilidad de un comportamiento ordenado en las proximidades


del equilibrio termodinmico.
Constatar por medio del estudio terico de la entropa como puede generarse
espontneamente excesos de entropa negativos (autoorganizacin).
Constatar la demostracin de que la segunda ley de la termodinmica puede ser
generalizada en una relacin que implica la autoreproduccin.
Al realizar las demostraciones termodinmicas y estadsticas de los fenmenos de
autoorganizacin y autoreplicacin respectivamente, y dada la ausencia de
demostraciones explicitas en la literatura internacional de los fenmenos
autoorganizativos y autoreplicativos, se espera que el presente estudio sirva como

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base y fundamento a otros trabajos de investigacin tanto del autor como de


cualquiera en el rea de fsica terica

III. DATOS DE LA INSTITUCIN


El presente proyecto de investigacin se realiz en el rea de Fsica Terica, de la
Escuela Profesional de Fsica, de la Universidad Nacional de San Agustn.
Avenida Independencia s/n, hexgonos de fsica primer piso.

IV. DESCRIPCIN Y DESARROLLO DEL TEMA.

4.1 DESCRIPCIN.

En el presente estudio se ha realizado una serie de demostraciones las cuales podrn servir
de punto de partida papar muchas otras investigaciones en el futuro cercano. Las
demostraciones en cuestin estarn dadas en los mbitos de la termodinmica [3,12] del no
equilibrio y la estadstica fsica [5].
En primer lugar se demostr mediante mtodos termodinmicos el fenmeno de
autoorganizacin y sus rangos de existencia o en los lmites donde esta se presenta, para
esto recurrimos al clculo de variaciones [12] as como tambin se usa el mtodo de
Lyapunov [9,15] para determinar las regiones de estabilidad de los estados que no implican
orden as como los parmetro donde el sistema pasa de un rgimen desordenado a uno
donde espontneamente genera configuraciones ms ordenadas.
En segundo lugar tambin se demostr mediante mtodos estadsticos y estocsticos [5,6]
aunados al teorema de fluctuacin [2] dado en la forma denominada como relaciones de
Crooks [5] que se puede formular una generalizacin de la segunda ley de la termodinmica
la cual es agregado un trmino donde se describe la autoreplicacin en trminos de su
rapidez de replicacin.

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4.2 DESARROLLO DEL TEMA.

4.2.1 Deduccin de la ecuacin de difusin-reaccin (balance de masa).


Empezamos por considerar la conservacin de masa donde se puede observar lo siguiente:


= el flujo que penetra

Donde es la superficie que rodea cierto recinto de volumen dentro de la cual se desea medir el
cambio de masa en cuestin; formalizando la anterior sentencia se define un vector flujo de
masa que atraviesa la superficie , cuya normal en cada punto sea .

Dado que la materia no se produce ni desaparece al interior de (caso no relativista).

Lo interesante surge cuando observamos que la masa est conformada de gran variedad de
sustancias = capaces de interactuar entre s de manera qumica, de tal forma que la j-sima
sustancia puede ser descrita como:


= +

El primer trmino del segundo miembro de la anterior ecuacin corresponde al aporte externo de la
j-sima sustancia y el segundo corresponde a la produccin o aniquilacin qumica (en el interior
del recinto ) de la misma.

Como hicimos antes describiremos el cambio externo como:

Fig.1: Sistema abierto donde existe un aporte exterior difusivo de la -sima sustancia

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Sin embargo el segundo trmino tiene que estar dado en funcin a la rapidez de reaccin en la
que aparecen o desaparecen una o varias de las molculas que conforman la j-sima componente en
cuestin y esto se da de la siguiente manera:


= ,

El coeficiente estequiomtrico , es el que da la proporcin de molculas que aparecen o


desaparecen en cada reaccin; en el caso de ser parte de los reactantes de la j-sima sustancia ,
ser positivo y en el caso de ser parte de los productos ser negativo; el valor numrico de , viene
dado por las proporciones en las que aparecen o desaparecen las molculas antes mencionadas.

La rapidez de flujo tiene forma polinmica ya que viene expresado como el producto de las
concentraciones tanto de reactantes como de productos elevados a exponentes en general mayores a
uno, lo que le otorga al termino de reacciones qumicas carcter no lineal. De este modo nuestro
modelo adquiere la forma:


= + ,

Por el teorema de gauss = , y haciendo = donde es la


rapidez de reaccin por unidad de volumen en general la componente en cuestin puede participar
de varias reacciones qumicas de donde el sub ndice es el nuemero de tal reaccin = {1, , }
en general puede participar de reacciones. Aplicando a nuestro modelo estas ltimas
observaciones podemos reescribir nuestro modelo como:


=


= = + ,

De donde se ve


= + ,

Denominada ecuacin de difusin-reaccin (o de balance de masa).

As que como podemos ver una completa descripcin dinmica del panorama qumico est dado por
un sistema de ecuaciones diferenciales, parciales, de segundo orden, no lineales y acopladas [3,12].

4.2.2 Deduccin de las relaciones de produccin de entropa

En lo que sigue deduciremos la produccin de entropa tomando en cuatro restricciones:

i) Supondremos la temperatura constante.

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ii) El sistema se halla en equilibrio mecnico y suponemos no hay fuerzas externas.


iii) A escalas del desplazamiento libre medio de las molculas conformantes del sistema el
gradiente de concentraciones es prcticamente nulo.
iv) Las condiciones de contorno no dependen del tiempo.

Considerando modelar la entropa fuera del equilibrio podemos proponer un funcional que tiene que
estar relacionado con las concentraciones { } de las componentes y esta puede ser tan complejo
como queramos:


= ({ }; {j }; {2 }; ; { } ; ; , )

De la condicin iii) vemos que los gradientes de concentracin no pueden ser arbitrariamente
grandes, en el orden) por lo tanto podemos despreciar de nuestra relacin los gradientes {j }~0;

dada la condicin ii) podemos excluir de nuestra representacin la variable { } ~0 considerando

adems que en las cercanas del equilibrio las colisiones reactivas son lo suficientemente escasas
frente a las colisiones de ruido trmico podemos considerar {2 }~0. De lo anterior se desprende
que podemos asumir un equilibrio local por lo cual la relacin de entropa puede ser modelada con
una forma.

= ({ (, )})

Y para hacer la descripcin del equilibrio local tenemos que dar una descripcin local de la entropa

definiendo una densidad local de entropa

= ({ (, )})

Con el objetivo de ver cmo cambia la entropa en funcin del tiempo efectuamos la derivada de
esta respecto al tiempo la cual por la regla de la cadena se convierte en:


= ( )

Usando la frmula de Gibbs

= +

Donde es la energa interna es la presin y es el potencial qumico de la j-sima sustancia.


Consideramos ahora la energa interna constante as como tambin el volumen para una sola
componente expresada en densidades la relacin [10,12].

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Reemplazando esta relacin en la derivada de la densidad de entropa obtenemos

Por ltimo podemos introducir a la relacin la ecuacin de difusin-reaccin


= [ + , ]


= [ ] ,

Ahora aplicando la identidad vectorial () = + al primer trmino del segundo


miembro de la ecuacin se obtiene:


= ( ) + [ , ]

Y si recordamos que la afinidad qumica de la r-sima reaccin, se define de la forma:

= ,

La variacin de la densidad de entropa queda de la siguiente manera:


= ( ) +

De lo anterior podemos definir:



=


= ( ) +

de manera que


= +

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Para poder obtener una interpretacin fsica de lo que sucede tenemos que volver a la visin global
del modelo, eso implica tener que integrar la anterior ecuacin para obtener el cambio de la entropa


= = +

= +

De donde se puede ver claramente que el cambio en la entropa tiene componentes internas y
externas


= +

donde

Lo que nos interesa de aqu en adelante ser la relacin que describe la produccin interna de
entropa ya que lo que no interesa es el fenmeno de auto-organizacin, es decir la ecuacin


= ( ) +

Que indica la densidad de produccin local de entropa que es una descripccion de la produccin de
entropia en el interior de un sistema sujeto a difucion trmica y a reacciones qumicas [3,12].

4.2.3 Estudio del proceso irreversible (produccin de entropa) en el rango lineal.

Como vemos la relacin de produccin interna de entropa existen cantidades tales como y ,
que pueden ser pensadas como flujos generalizados asociados con los procesos irreversibles de

difusin y reaccin qumica adems de cantidades como ( ) y
a las que llamaremos fuerzas
generalizadas dado que son las que dan origen a los flujos.

De esta manera podemos escribir la relacin de produccin local interna de entropa como

Con


= ; = ( )


= ;
=

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Como vemos estas fuerzas y flujos tienen carcter vectorial y carcter escalar dependiendo si son de
origen difusivo o si son de origen reactivo respectivamente.

En el equilibrio se da que no hay fuerzas 0 = 0 por lo que tendramos flujos tambin 0 = 0.

As que para observar que es lo que sucede en la vecindad prxima del estado de equilibrio
efectuamos una expansin en una serie de potencias de .

1 2
({ }) = 0 + ( ) + ( ) +
0 2 0
,

Sabiendo que 0 = 0 se elimina el primer trmino y como 0 en la vecindad del equilibrio


podemos despreciar tambin los trminos de orden mayor a uno entonces:


({ }) = ( )
0

o de manera ms compacta

({ }) =

donde


= ( )
0

es un coeficiente fenomenolgico. Estos coeficientes fenomenolgicos cumplen con ciertas


propiedades:

Relaciones de reciprocidad de Onsager [3] que nos indica que = ; adems un medio alejado
del equilibrio en la regin lineal el medio tiene que ser istropo lo que no indica que no existen
acoplamiento entre fenmenos escalares (reaccin qumicas) y fenmenos vectoriales (difusin
trmica) por lo que respectivamente se los puede denotar con y .de esta manera podemos
expresar las densidades de produccin interna de entropa como:
i j
= ( ) ( )
T


= ( ) ( ).

Dado que el sistema que estamos investigando es un sistema abierto con intercambio de materia y
energa con sus alrededores, y como ya dijimos se cumple que:


= +

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De donde lo ms prximo al equilibrio se da en el rgimen estacionario esto es cuando
= 0; y
para esto se tiene que cumplir que:

= 0

Esto quiere decir que entra un material rico en energa y es degradado en el interior del recinto que
es objeto de estudio y esto adems se produce a un mismo ritmo.

Por lo tanto nos interesa saber qu es lo que sucede en la vecindad al rgimen estacionario, en otras
palabras cuando el rgimen estacionario sufre una perturbacin. Con este fin volvemos a ver la
ecuacin de balance de masa


= + ,

Y recordando que = ; podemos reescribir nuestros flujos en funcin de los coeficientes


fenomenolgicos haciendo


~ ( )

As nuestra relacin de balance de masa tendr la forma


= ( ) +

Tambin produccin interna de entropa puede expresarse de la siguiente manera:

i j
= = = [ ( ) ( ) + ( ) ( )]
T

Para investigar la cmo cambia la produccin de entropa en la regin cercana al rgimen


estacionario efectuamos la derivada temporal de la produccin de entropa


= { [ ( ) ( ) + ( ) ( ) + ( ) ( )] +


+ [ ( ) ( ) + ( ) ( ) + ( ) ( )]}

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Evaluando que tanto puede influir el cambio temporal de los coeficientes fenomenolgicos

Y utilizando la relacin de balance de masa en el rango lineal obtenemos


= ( ( ) + )


expresin que al ser reemplazada en la produccin de entropa nos da

i j i j i j
( )( ) = ( ( ) ( ) ( ) + ( ) ( )) ~0
T T
T

Al ofrecernos trminos cbicos de las fuerzas generalizadas, y dado que estas se las est suponiendo
muy pequeas su expresin cubica viene a ser despreciable, anlogamente y de la misma manera

puede ser tratada
obteniendo lo mismo. De esta manera y observando que los ndices , hablan
acerca de las mismas componentes y que tambin , se refieren a las mismas reacciones la
produccin de entropa puede expresarse como:

2
= 2 { + }

Pero dada la definicin de afinidad = obtenemos:

Reemplazando en el cambio temporal de produccin de entropa

2
= 2 { }

pero

=

As
2
= 2 { }


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2
= 2


2
2
{ ( ) }

El ltimo paso fue desarrollado efectuando una integracin parcial. Tomando en cuenta que las
condiciones de frontera son consideradas constantes el primer miembro de la ecuacin resulta:

2
( ) = 2 = 0

As el cambio temporal de la produccin de entropa queda de la siguiente forma:

2
= 2 { ( ) }


2
= [ ( ) + ] dV



2
=


Y dado que la ltima expresin es una forma cuadrtica, entonces 0, por lo

tanto.


0

Lo que nos ofrece la visin de que la produccin de entropa acta como un potencial
termodinmico; ya que es lo que espontneamente conduce al sistema al estado estacionario, dado
que cuando hay una perturbacin de la concentracin respecto a la concentracin en el estado
estacionario 0 as en el sistema cuya concentracin viene descrita por {0 + } el cambio

temporal la densidad de produccin de entropa es negativa
< 0 lo que quiere decir que el
sistema ir produciendo su entropa a menor ritmo hasta alcanzar el estado estacionario donde

= . o sea
= 0 esto es lo que se conoce como teorema de mnima produccin de entropa
esto nos da a entender que cualquier intento de obtener un exceso de entropa en la regin lineal de
la vecindad del estado estacionario ser espontneamente eliminado, o en otras palabras las
soluciones estacionarias de las ecuaciones que gobiernan la produccin total de entropa son
asintticamente estables. Lo que nos da una idea que en la regin lineal no puede surgir ningn
estado ordenado, y que cualquier estado ordenado, desaparecer como lo hara en un sistema
cerrado [3, 12].

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Fig.2: Cuenco de atraccin del estado estacionario asintticamente estable, esquema que muestra
cualitativamente el teorema de mnima produccin de entropa.

4.2.4 Estudio del proceso irreversible en el rango no lineal

Para poder discernir entre la regin lineal de la regin no lineal, tenemos que tener un criterio
mediante el cual poder cuantificar donde se halla la regin que separa la regin lineal de la regin
no lineal.

Para esto el flujo sabemos que es del flujo el que puede generar las no linealidades tanto en las
ecuaciones de balance de masa, as como en la ecuacin de la produccin de entropa.

= (, ) + ( )

Que es el potencial qumico perteneciente a la -sima componente qumica de una solucin, de esta
manera bajo la definicin antes dada de afinidad = obtenemos

= ( (, ) + ( ))

= ln


= ln

Definimos como constante de equilibrio al producto de todas las densidades en el equilibrio


elevadas a sus respectivos coeficientes estequiomtrico para el equilibrio como:



= ,

As como sabemos en el equilibrio la afinidad es cero por lo tanto

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= ln

= ln = 0

de donde podemos expresar


= exp

Por ltimo para definir la afinidad en trminos de para lo cual acomodamos la ltima ecuacin
de la siguiente manera

ln =


ln ln = ln =

Entonces


= ln

Para observar cmo es que podemos ver el lmite de la regin lineal de la no lineal recurriremos a
un ejemplo sencillo para esto consideramos la reaccin
1



2

As la densidad de rapidez de reaccin puede expresarse como:

= 1 2

Y la afinidad para esta reaccin se puede expresar como



= ln

As podemos expresar la velocidad de reaccin en trminos de la afinidad

= 1 2
2
= 1 (1 )
1
k2
= 1 (1 exp [ ])
k1

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Lo cual nos dice que podemos hacer una aproximacin lineal solo si es que y esta es la
condicin fsica en la que se hablar de una aproximacin lineal al estado estacionario; y esto quiere
decir que el rango lineal se presenta en el supuesto que la energa trmica sea mucho mayor que la
energa de afinidad qumica [12].

En la vida real y para casi todos los asuntos prcticos es muy difcil ver la condicin de linealidad
cumplida en la naturaleza, por lo tanto ahora tendremos que tratar con el caso no lineal es decir
esto quiere decir que las reacciones qumicas toman un aporte ms importante que la
difusin trmica. Con este fin utilizaremos la ecuacin de balance de masa de la forma completa


= j +

Y la ecuacin de produccin de entropa interna


= = [ j ( ) + ( )] =

Con el fin de irnos alejando del rgimen lineal y obtener relaciones vlidas para todo rango
podemos hacer lo siguiente:

Sabiendo que:


= =

tambin


= [ + ] = +

De esta manera uno puede conocer las relaciones diferenciales de la densidad de produccin
interna de entropa


= + = +

Por lo tanto tenemos que

Para ver cmo estas dos expresiones se relacionan entre si vemos que en el rango lineal

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= =

Mientras que


= = ( )



=

Esto debido a que los coeficientes fenomenolgicos no varan en el tiempo y aplicando las
relaciones de reciprocidad de Onsager = tenemos por lo tanto que en el rango lineal
tenemos que


=

Por lo tanto y como


= +


=2


Como segn principio de mnima produccin de entropa se da que
= 0;
de este modo se cumple que:

1 1
= = 0
2 2

As en particular
0 si vemos que esto se podra cumplir para el caso general fuera del rango
lineal podramos obtener un criterio general de evolucin del sistema [7,8], con este objetivo en
mente exploramos como va en el rango general donde es excedido el rango lineal y las relaciones de
reciprocidad no tienen ya validez, para esto integramos las relaciones diferenciales antes obtenidas
pero esta vez de manera general


= = [ ( ) + ( ) ]

1
= [ j + ]

Haciendo = obtenemos

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1
= [ j + ]


Adems = , entonces

1
= [ j + ]

1 1
= + [ j ]

El primer trmino del ltimo miembro es cero ya que las condiciones de contorno son constantes

1
= [ j ]

1
= ( j )


1
= ( )


1
= 0

Lo cual nos indica que hemos hallado el criterio general de evolucin macroscpica que estbamos
buscando ya que la desigualdad tambin se cumple para las relaciones de produccin de entropa en
general [8,12].

Ahora estamos en posicin como para seguir nuestro estudio ms all de la regin lineal para esto
tendremos que tomar el estado estacionario como el estado de referencia en el cual se podrn
denotar tanto fuerzas como flujos como {0 }, {0 }, {0 }, {0 } los cuales corresponden a el conjunto
de las concentraciones en el estado estacionario {0 } y tendremos que expandir nuestro criterio
general de evolucin macroscpica alrededor de nuestro estado de referencia en el cual la ecuacin
de balance detallado de masa tiene la forma

0 ({0 }) + 0 ({0 }) = 0

1
De esta manera la ecuacin
= [ j
+
] puede ser expandida
alrededor del estado de referencia haciendo:

= 0 +

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= 0 +
= 0 +
= 0 +

As

1
= [ j + ]

1
= [ (0 + ) (0 + ) + (0 + ) (0 + )]

1 0
0 0
0
= [ (j + j + j + j )

0 0
+ (0 + 0 + + )]

Dado que el estado de referencia no cambia en el tiempo los trminos que contienen las derivadas
temporales de 0 y se anulan, de manera que nos queda:

1
= [ (0j + j ) + (0 + )]

1 1
= [ 0j + 0 ] + [ j + ]

Trabajando sobre la primera integral

1
[ 0j + 0 ] =

1 1
= 0j + [ 0j + 0 ]

El primer miembro es cero dadas las condiciones de contorno constantes y el segundo miembro lo
podemos trabajar como ya es de costumbre

1
[ 0j 0 ] =

1
= [ 0 + 0 ] = 0

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Esto ltimo dada la ecuacin de balance de masa para el estado de referencia; de este modo nos
quedamos con la igualdad

1
= [ j + ]


= [ j ( ) + ( )]
T

De esta manera hemos obtenido que

= = 0

De donde podemos ver que el cambio en la produccin de entropa es el cambio en el exceso de


produccin de entropa y este cumple con el criterio general de evolucin macroscpica [12].

Para poder seguir ahondando en el anlisis de la produccin de entropa podemos conjeturar que el
exceso en el flujo generalizado de la -sima componente puede representarse como una
combinacin lineal del exceso de las fuerzas generalizadas de la forma

De este modo la expresin que describe el cambio en la produccin de entropa puede expresarse
como:

Dado que estamos en una situacin fuera del equilibrio los elementos de la matriz no tiene por
qu cumplir con las relaciones de reciprocidad esto es:

Pero es posible descomponer la matriz de los coeficientes en una parte simtrica y anti simtrica

+
= + = +
2 2
De donde podemos expresar el cambio en la produccin de entropa como


= +


1
= +
2

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Trabajando con el interior del diferencial en el trmino simtrico tenemos que:

1 1 1
=
2
2 2

Revisando la diferencial del termino antisimtrico tenemos que

1 1
= { + }
2
2


Pero como = la anterior ecuacin se puede expresar:

1 1
= { } = 0
2
2

En consecuencia

1 1
=
2
2

De este modo podemos expresar la parte interna del diferencial como:


= =

Y para ver la interpretacin del ltimo miembro de la anterior ecuacin podemos considerar que el
exceso de entropa generado por el exceso de produccin de entropa asociado al exceso de flujo
puede definirse como

En el cual efectuamos una expansin del tipo = 0 + alrededor del flujo estacionario 0 de
donde obtenemos las expresiones siguientes

= = 0 +

Viendo entonces el primer trmino de la relacin


0 = [ 0 0 ]



= 0 + [ 0 0 ]

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Donde 0
= 0 dado que las condiciones de frontera son constantes; por lo tanto


0 = [ 0 0 ]



= [ 0 + 0 ] = 0

Por la relacin de balance detallado de masa en el estado estacionario de este modo podemos ver
que

= exceso de produccion de entropa


Y por fin el criterio de evolucin del sistema podr expresarse como

1
= + 0
2

En consecuencia podemos observar que si la contribucin antisimtrica se anula estaramos en el


rango lineal y el cambio de la produccin de entropa solo sera el cambio en el exceso de la
produccin de entropa dictado por el teorema de mnima produccin de entropa y el exceso de
produccin de entropa seria necesariamente 0 y el sistema conservara su estabilidad
asinttica al estado estacionario. Pero se observa que en el rango no lineal se produce una ruptura
espontanea de la simetra de la contribucin de las fuerzas generalizadas respecto del cambio en la
produccin de entropa; esta contribucin antisimtrica sugiere la posibilidad de la perdida de
estabilidad del estado estacionario lejos del equilibrio [12].

4.2.5 Autoorganizacin, estabilidad, auto catlisis y estructuras disipativas.

Podemos ver el papel importante que juega el exceso de produccin de entropa en el criterio de
evolucin, esto nos sugiere que un estudio sobre la estabilidad de los estados estacionarios en el
desequilibrio puede basarse en el estudio de la ecuacin de produccin de entropa con este fin
someteremos a la ecuacin de produccin de entropa al anlisis variaciones [9,12]. De manera que
la segunda variacin nos pueda indicar si la primera variacin es estable (un mnimo), si esta es
inestable (un mximo), o si su equilibrio es indiferente. As la segunda variacin del cambio en la
cantidad de produccin de entropa = 0 0 nos puede dar el criterio
necesario para poder discriminar este hecho, as:

1
= + 2 +
2

= 0 0 = (0 + )(0 + ) 0 0

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 22


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

= 0 0 + 0 + 0 + 0 0

1
= 0 + = + 2
2

En consecuencia

= 0

Y lo que nos interesa es

1 2
= =
2

Como ya habamos visto antes para el rgimen lineal 0.

Con el propsito de ampliar el anlisis en la vecindad del estado estacionario a continuacin


procederemos a analizar las diferencia entre el nivel de entropa de un sistema en desequilibrio
alejado del estado estacionario con respecto de uno en estado estacionario,

= ({ }) ({0 })

Como la entropa es una funcin del conjunto de las densidades de concentracin podemos expandir
la diferencia en potencias de los excesos de densidad de concentracin, para esto recurrimos al
anlisis variacional , de esta manera queremos buscar cmo podemos ligar estas ecuaciones con el
exceso en la produccin de entropa, de esta manera tambin poder asociarle una interpretacin
fsica concreta.

1
= + 2 +
2
Calculando la primera variacin


= ( )

0

Por la relacin de Gibbs antes mencionada

0
( ) =
0

El exceso de primer orden de la entropa tiene la forma

1
= 0

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 23


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

De esta manera podemos expresar la segunda variacin de la diferencia toma la forma de

1
2 = ( ) 0
0

Pero para obtener una interpretacin fsica de lo que significa esto obtengamos primero la variacin
temporal del ltimo resultado, esto es:

1 2 1
( ) = ( )
2 2 0

1
= { ( ) + ( ) }
2
0 0

2
Pero ambos trminos tienes simetra desde el punto de vista que ( ) = ( ) de este

0 0
modo uno obtiene:

1 2 1
( ) = ( )
2 0


De este modo perturbando la ecuacin perturbada de balance de masa obtenemos
=
+ ; y esto usado en la anterior igualdad nos ofrece

1 2 1
( ) = ( ) [ + ]
2
0

1
= [ ( ) + ( ) ]
0 0

1
= ( )
0

1
[ ( ) + ( ) ]
0 0

Como anteriormente vimos las condiciones de frontera constantes hacen que se anule el trmino de
variacin superficial quedando as:

1 2 1
( ) = [ ( ) + ( ) ]
2 0 0

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 24


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.


A esta expresin la podemos acomodar tomando en cuenta que = ( ) y que por lo
0

tanto = ( ) podemos hacer que la anterior expresin se vea como
0

1 2 1
( ) = [ ]
2


= [ ( ) ( ) ]

= =

De esta manera uno puede ver que nuestra conjetura respecto a la estabilidad del rgimen
estacionario dada como:

1 2
=
2
A sido correcta y esto se confirma con

1 2
( ) =
2

Ya que tiene la forma del segundo criterio de estabilidad de Lyapunov o teorema de Lyapunov, as
la segunda variacin de la entropa puede ser interpretada como la funcin de Lyapunov cuyo
cambio temporal nos indica estabilidad o inestabilidad del sistema [9].

En la teora de la estabilidad de Lyapunov se sugiere una ecuacin del tipo = mediante la


cual podemos ver si un flujo es estable o inestable segn sea < 0 > 0 respectivamente, esto
con la nica salvedad de que la funcin de Lyapunov es definida como positiva en las vecindades
del estado estacionario, sin embargo nuestra funcin de Lyapunov en especfico es definida
1
negativa 2 0; de esta manera se dara el caso contrario es decir > 0 correspondera al caso
2
estable y < 0 correspondera al caso inestable. Terminando con la identificacin de la relacin
del exceso en la produccin de entropa con el criterio de Lyapunov haramos como el exceso en
las fuerzas generalizadas y como los excesos en los flujos generalizados [15].

Ya que el criterio de Lyapunov aplicado a nuestro problema tiene la forma de

1 2
( ) = =
2

Procederemos entonces a determinar la signatura de para poder determinar la estabilidad del


rgimen estacionario, en otras palabras la estabilidad del rgimen lineal (llamada rama
termodinmica) as como sus fronteras. Con este prepsito estudiaremos dos casos particulares ya

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 25


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

que cada caso dependiendo de su linealidad, no linealidad y la estructura de la no linealidad sern


casos particulares.

Para comenzar veremos la ms simple de las reacciones qumicas


1



2

El flujo asociado a esta reaccin es:

= 1 2

La afinidad qumica viene dada por



= ln

Efectuando las respectivas perturbaciones en las concentraciones, uno puede obtener:

= 0 + = 1 (0 + ) 2 = 1 0 2 + 1

Entonces

= 1

Para la afinidad expandimos en serie de Taylor, de este modo:


= (ln )
0
1
= ( 0 ) ( )


= 0

De esta manera podemos componer la funcin de exceso de produccin de entropa para esta
reaccin



0 ( )2
= = 1 = 1 >0
0

Lo que nos indica que esta reaccin se comporta como en la vecindad del rgimen estacionario en
dodo el rango de sus soluciones y el estado estacionario es asintticamente estable.

Otro es el caso cuando estudiamos una reaccin no lineal en este caso ser una reaccin de auto
catlisis descrita como:

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 26


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

1

+ 2

2

Para la cual la ecuacin del flujo ser:

= 1 2 2

La cual tras ser perturbada ser

= 0 + = 1 (0 + ) 2 (0 + )2
= 1 0 + 1 2 (0 )2 22 0 2 ( )2
= [ 1 0 2 (0 )2 ] + [1 22 0 ] 2 ( )2

De aqu vemos que

= [1 22 0 ]

Para la afinidad tenemos que:



= ln 2
= ln
( )

Expandiendo en serie de Taylor obtenemos


= (ln )
0
0
= ( ) ( 0 2 )
( )

= 0

De este modo podemos construir el exceso en la produccin de entropa de la manera ya


acostumbrada

1
= ( ) [1 22 0 ] ( 0 )


= 0 [1 22 0 ]( )2

Esta ltima expresin no tiene signatura definida y su signo de pende del factor [1 22 0 ]
solo depende de parmetros, el parmetro que puede ser variado en este ejemplo es la concentracin
del sustrato para hacer un anlisis hacemos para el estado estable > 0

1 22 0 < 0

O sea

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 27


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

1
<1
22 0

Es decir que esta reaccin es estable cunado la cantidad de sustrato es relativamente pobre con
relacin a la concentracin de catalizador en el equilibrio como se podra esperar. Ms cuando la
concentracin llega a un nivel critico

22 0
, =
1

El exceso de produccin de entropa se hace nulo = 0 de esta manera el sistema se halla en


estado de estabilidad marginal y se halla en su posicin ms sensible a las perturbaciones. Por
ultimo cuando el valor critico es sobrepasado el estado estacionario se vuelve completamente
inestable y la evolucin del sistema ya no es direccionada hacia el estado estacionario sino que el
sistema se dirige hacia otros estados donde < 0.

El hecho de que cuando se rompe la estabilidad del estado estacionario el exceso en la produccin
de entropa sea negativo nos da a entender que el sistema genera su propio orden y de esta manera
llegamos a demostrar el fenmeno de auto organizacin mediante la formacin de nuevos estados a
los que se les ha llamado estructuras discipativas [9,12].

4.2.6 Estudio de la produccin de entropa en la autoreplicacin

Para comenzar el objetivo del estudio de la produccin de entropa en el proceso de autoreplicacin


nos ofrece una idea de las relaciones entre la autoreplicacin y las condiciones termodinmicas del
medio en el cual se producen los eventos autoreplicativos. Esto tiene mucha importancia desde el
punto de vista del estudio de la materia viviente. Dado que es un rasgo fundamental de esta [5,4].

Comenzaremos describiendo una transicin entre estados termodinmicos. Para esto suponemos un
sistema con un nmero fijo de partculas en el interior de un recinto de volumen en contacto
1 1
con un bao trmico de temperatura inversa = (o = en unidades S.I.). A cada micro

estado del sistema podemos rotularlo como , , y cada uni de ellos tendr asociada una energa
, , para cada micro estado entonces las posibles transiciones de estado a nivel
microscpico pueden venir descritas por los flujos de probabilidad

()( ; ) = ()( ; )

Esta ltima relacin [6,5] expresa la simetra de inversin temporal de la dinmica Hamiltoniana

que debe cumplirse al nivel de transicin de estados microscpicos. En esta relacin () = ()
es la distribucin de Boltzmann y ( ; ) es la probabilidad condicional de transicin entre el
estado -simo al -simo en un tiempo = > 0. De esta manera comparando las probabilidades
podemos obtener lo siguiente

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 28


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.


( ; ) () ()
= = = ()
( ; ) ()

()

Donde el cambio en la energa se da por intercambio calorfico con el medio ambiente =


por lo tanto la entropa intercambiada con el exterior ser as la relacin anterior
puede expresarse como:

( ; )
= = exp[]
( ; )

Esta relacin puede usarse sin ningn inconveniente fuera del equilibrio ya que tiene la forma del
teorema de fluctuacin disipacin el cual funciona arbitrariamente fuera del equilibrio
termodinmico. Con el motivo de hacer predicciones estadsticas que nos permitan hacer un anlisis
tambin a nivel macroscpico tenemos que promediar todas las corrientes probabilsticas que llevan
de un sistema de autoreplicadores inicial a otro sistema de autoreplicadores ya replicados [2,5].
Comenzaremos por considerar que el sistema puede pasar por tal cantidad de micro estados que
estos pueden considerarse ms bien un continuo de estados () a partir del auto replicador padre
hasta alcanzar convertirse en dos auto replicadores, as la entropa puede expresarse como

[()]
= = ln { }
[( )]

De esta manera podemos expresar el intercambio energtico con los alrededores adems de la
irreversibilidad del proceso ya que el orden de la razn entre probabilidades de ir cambiando de
estados () desde un extado inicial (0) hasta un estado final (), y la el transito inverso es el
nivel de entropa producido en el proceso ().

Para poder describir el transito autoreplicativo tenemos que fijar primeramente los puntos extremos
de las trayectorias () que fijaremos como (0) y () . Primeramente suponemos que el
sistema se halla en una condicin observable de grano grueso . Este a su vez contiene precisamente
una fase de bacterias en crecimiento exponencial saludable comenzando un periodo de divisin
celular. Lo que equivale al estado con una distribucin de probabilidad asociada (|) de que el
sistema se halle en algn microestado que es parte del macroestado .

Posteriormente tras un lapso de tiempo en contacto con el bao trmico de temperatura inversa ,
el sistema se hallar en un segundo estado de grano grueso donde el sistema contiene precisamente
dos fases de bacterias en crecimiento exponencial saludable comenzando una divisin celular, a la
cual llamaremos la cual tiene asosiada a ella una probabilidod (|) que el sistema se halle en
el microestado dado el sistema inicialmente preparado en y que despus de un lapso de tiempo
se halla en el macroestado .

Con el objeto de aclarar un poco el significado de una fase bacteriana en crecimiento exponencial
saludable comenzando un periodo de divisin celular acudiremos a la ecuacin logstica

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 29


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= (1 )

Donde es el nmero de habitantes en una poblacin bacteriana, es la tasa reproductiva neta, y


es la cantidad de suministro disponible. As al decir una fase bacteriana en crecimiento
exponencial saludable comenzando un periodo de divisin celular lo que queremos decir es que el
suministro es abundante de esta manera / 0 por lo tanto la ecuacin logstica tendr
la forma:

Cuya solucin es:

() = 0

De aqu el nombre de fase bacteriana en crecimiento exponencial saludable [11].

Habiendo definido y lo anterior podemos ahora hacer una estadstica de las probabilidades
condicionales de transicin pero en esta vez del estado macroscpico para esto definimos el
promedio de la probabilidad condicional de transicin del estado al estado como:

( ) = (|)( )

Y el promedio de la probabilidad condicional de transicin inverso es:

( ) = (|)( )

( ) (|)( )
=
( ) (|)( )
(|)
( ) (|)( )
(|)
=
(|)( )

(|) ()
Pero como (|)
= ()

Entonces

( )
( ) (( )) (|)( )
=
( ) (|)( )
(|)( )
=
(|)( )

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 30


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(|)
(|) ln[ ]
Adems como (|)
= exp = (|) entonces:

exp
(|)( ) (|)
( ) ln[ ]
= (|)
( ) (|)( )
exp ( )
= =
ln[
(|)
] ( )
(|)

En consecuencia podemos arreglar la expresin de forma que quede expresado en forma compacta

() (|)
( ) ln
() (|) =1
(|)
Recordando que ln (|)
=

()
( )
() = 1

Por lo tanto con el propsito de acotar esta relacin 1 + as

() ( )
( )
() 1 + [ ( ) ]
( )

( )
( ) + + 0
( )

Que es una generalizacin de la segunda ley de la termodinmica que implica auto replicacin [5].

V. CONTRIBUCION AL LUGAR DE PRCTICAS.

La contribucin del presente estudio al centro de prcticas, es decir al grupo de fsica terica de
la Escuela Profesional de Fsica de la Universidad Nacional de San Agustn, viene por ser este
un estudio detallado de las demostraciones tanto termodinmicas as como estadstica de los
fenmenos tanto de autoorganizacin as como de autoreplicacin respectivamente; esto usando
como parmetro fundamental la entropa.

Estas demostraciones no se hallan en la literatura internacional de manera tan detallada como


en el presente estudio, por lo tanto son de extrema utilidad a los investigadores que deseen
comenzar a trabajar en estos relativamente nuevos campos de la ciencia y de manera particular
a los investigadores locales que puedan acometer estos tpicos de manera sistemtica como un
nuevo campo de investigacin

Por otro lado este material puede ser utilizado con fines didcticos en la implementacin de
nuevos cursos electivos donde se desarrollen las ideas y el estilo del presente estudio.

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 31


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

VI. CONCLUSIONES.
Del precedente trabajo, y en especfico del teorema de mnima produccin de entropa,
se comprob lo demostrado por la escuela de Bruselas [12] que en las vecindades del
rgimen estacionario de un sistema abierto este no puede tornarse espontneamente
ordenado.
Tambin verifica que lo demostrado por la escuela de Bruselas [9, 12,13] el proceso de
auto catlisis es el sistema ms simple en el cual la entropa puede disminuir de manera
espontnea siempre y cuando los parmetros de concentraciones de los reactantes haya
sobrepasado sus niveles estacionarios en una proporcin definida.
Tambin verificarse los resultados estadsticos del seor England [5] en los que se
consigue una generalizacin de la segunda ley de la termodinmica que incluye un
trmino asociado al fenmeno de autoreplicacin.

VII. RECOMENDACIONES.
Para posteriores estudios del tema se recomienda complementar los mtodos
termodinmicos de autoreplicacin con los mtodos de la dinmica no lineal, esto con
el propsito de una cuantificacin ms rigurosa de los dominios de equilibrio, vecindad
del equilibrio y perdida del equilibrio del sistema.
Podra tambin hacerse un estudio a posterior de la relacin entre los mtodos de
clasificacin del equilibrio para sistemas autoreplicativos en los cuales tendra que
hacerse un puente entre el formalismo termodinmico de la autoorganizacin y el
formalismo estadstico de la autoreplicacin.

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 32


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

VIII. BIBLIOGRAFA.

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[11] Murray, J. D. (2002). Mathematical Biology I: An Introduction, vol. 17 of
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[13] Prigogine, I. (1975). Dissipative structures, dynamics and
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[14] Schrodinger, E. (1945). What is life? The physical aspect of the living cell.
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[15] Wiggins, S.(2000) Introduction to applied nonlinear dynamical systems and
chaos. Vol. 2. New York: Springer-Verlag.

Informe final: prcticas pre profesionales. Pgina 33


Verificacin terica del papel que juega la entropa en fenmenos de autoorganizacin y autoreplicacin.

Arequipa, Diciembre del 2014.

..
Est. Luis Ramiro Nez del Prado Miranda.

..
Asesor: Mg. Rolando Moises Perca Gonzales.

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