SUMARIO

EL MUNDO VIVO
Bacterias
Arqueas
Eucariotas
Virus

BIOMOLCULAS
Grupos funcionales
de las biomolculas orgnicas
Clases principales de biomolculas
pequeas

PROCESOS BIOQuMICOS
Reacciones bioqumicas
Energa
Metabolismo
Orden biolgico La clula viva. Los seres vivos estn formados por una o varias clulas. Las estructuras complejas
de las clulas vivas consiguen que stas realicen funciones como la generacin de energia,
VISiN GENERAL DEL PROCESAMI ENTO el crecimiento y la reproduccin.

DE LA INFORMACiN GEN TICA

MTOOOS BIOti;/uIMICOB 1.1 La vida ha demo~trado ser bastante ms compleja de lo que la imaginacin humana hubiera
INTRODUCCiN podido concebir. La estructura de la clula es el caso en cuestin. Las clulas no son las bolsas
de protoplasma que los cientfficos imaginaron hace alrededor de un siglo. sino que son estruc-
turolmente complejos y dinmicas. La historio de cmo se ha adquirido el conocimiento actual
sobre los procesos vivos, con sus miradas de grficos retorcidos, rivaliza con cualquier obro de
ficcin detectivesca. Los cientficos que trobajan paro entender la realidad fsica del mundo
natural con frecuencia quedan sorprendidos de lo sofisticados que son incluso los organismos
ms sencillos. Este capitulo y los siguientes se centran en los mecanismos bsicos que susten-
tan la vida descubiertos hasta el momento.
2 CAF'TU LO U N O Introduccin a la Bioqumica

Qu es la vida? La respuesta a esta pregunta sencilla y aparentemente engaosa ha

sido esquiva a pesar del trabajo de los cientficos durante varios siglos. Gran parte de
la dificultad para delinear la naturaleza precisa de los seres vivos descansa en la abllJ-
madora diversidad del mundo vivo y en el solapamiento aparente de diversas propie-
dades de la materia viva y la muerta. Como consecuencia, la vida se ha considerado
como una propiedad intangible que hace dificil una explicacin sencilla. Generalmen-
te se describe en trminos operativos, por ejemplo, como movimiento, reproduccin,
adaptacin y respuesta a los estmulos externos. Sin embargo, desde finales del siglo
XIX, la ciencia de la Bioqumica (la investigacin de las bases moleculares de la vida)
ha aportado nuevos conocimientos. Los bioqumicos han investigado los seres vivos
con un enfoque experimental nico que se basa en los conceptos de la biologa, la
qumica, la fsica y las matemticas, as como con una tecnologa cada vez ms sofisti-
cada. Su trabajo ha descubierto que a pesar de la rica diversidad de seres vivos, desde
la ballena azul al ms pequeo de los microorgarsmos, todos obedecen a las mismas
leyes fsicas y qumicas que rigen el universo. Todos estn formados por la misma
clase de molculas biolgicas y sus mtodos de mantenimiento de los procesos biol-
gicos son semejantes. Entre Jos conocimientos ms importantes que se han obtenido a
partir del trabajo de los bioqumicos se encuentran los siguientes:

L La vida es compleja y dinmica. Todos los organismos estn formados prin-

cipalmente por molculas orgnicas (con carbono) que tienen formas tridimen-
sionales complicadas. Los procesos vivos, como el crecimiento y el desarrollo,
utilizan miles de reacciones qumicas en las que variedades ingentes de molcu-
las vibran y giran, interaccionan, chocan y se reagrupan en molculas nuevas.
2. La vida est organizada y automantenida. Los seres vivos son sistemas
organizados jerrquicamente, es decir, cada nivel descansa sobre el inmedia-
to inferior (Fig. 1-1). Las molculas que constituyen los seres vi vos, denoll-
nadas biomolculas, estn formadas por tomos, que a su vez estn formados
por partculas subatmicas. Determinadas biomolculas se unen para formar
polmeros denominados macromolculas. Como ejemplos tenemos los ci-
dos nucleicos, las protenas y los polisacridos, que estn formados, respecti-
vamente, por nucletidos, aminocidos y azcares. Varias combinaciones de
biomolculas y macromolculas forman una mirada de estructuras supramo-
lecu lares ms grandes y ms complejas que juntas constituyen las clulas. En
los organismos multicelulares hay otros niveles de organizacin como los
tejidos, los rganos y los sistemas orgnicos. En cada nivel de organizacin el
conjunto es mayor que la suma de las partes. En otras palabras, en cada nivel
emergen propiedades nuevas que no se pueden predecir a partir del anlisis
de las partes que lo componen. Por ejemplo, la hemoglobina, la protena que
transporta el oxgeno molecular en la sangre de los vertebrados, est formada
por carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno e hierro. El componente hemo de
la hemoglobina, que es responsable del transporte de oxgeno, no se oxida por
el oxgeno como sucedera sin el componente proteico. Las propiedades del
sistema de anillo hemo y su proteccin de la oxidacin por la protena que lo
rodea son ejemplos de propiedades emergentes. La organizacin y el funcio-
namiento ordenado de los seres vivos requiere adquirir continuamente ener-
ga y materia, y eliminar las molculas de desecho. Estas tareas las realizan
cientos de reacciones bioqumicas que estn catalizadas por enzimas. Se de-
nomina metabolismo a la suma total de todas las reacciones en un ser vivo. La
capacidad de los seres vivos para regular los procesos metablicos, a pesar de
la variabilidad de sus ambientes interno y externo, se denomina homeostasis.
3. La vida es celular. Las clulas se diferencian mucho en estl1lctura y funcin,
pero todas estn rodeadas por una membrana que controla el transporte de
algunas sustancias qumicas dentro y fuera de la clula. La membrana tam-
bin participa en la respuesta de la clula al ambiente extracelular. Si se divi-
de una clula en sus partes componentes, se detiene el funcionaITento vital.
Las clulas se originan nicamente por la divisin de clulas que ya existen.
 1.0. Introduccin :3

FIGURA , - ,
Organizacin jerrquica de un organis-
mo multicelular: el ser humano
Sistema orgnico Los organismos multicelulares tienen varios
(digestivo) niveles de organizacin: sistemas orgnicos,
rganos, tejidos, clulas, orgnulos, mol-
culas y tomos. Se muestra el sistema
digestivo y uno de sus rganos componentes
(el hgado). El hgado es un rgano mulli-
rgano
(hgado) funcional que posee varias funciones di-
gestivas. Por ejemplo, produce bilis, que
facilita la digestin de las grasas y procesa y
distribuye las molculas de alimento absor-
bidas en el intestino delgado a otras partes
del cuerpo. El DNA, una molcula que
Organismo se encuentra en las clulas, contiene la
(humano) informacin gentica que controla la fun-
Tejido
(sinusoide cin celular.
heptico)

Clula
(hepatocito)

Orgnulo
(ncleo)

Molcula
(DNA)

tomo
(carbono)

4. La vida se fundamenta en la informacin. La organizacin requiere infor-

macin. Los seres vivos pueden considerarse como sistemas procesadores de
informacin, ya que el mantenimiento de su integridad estructural y de los
procesos metablicos requiere la gestin adecuada del conjunto enorme de
molculas interaccionantes dentro de las clulas, y entre las clulas y las
generaciones de futuras clulas. La informacin biolgica est en fonna de
mensajes codificados que son inherentes a la estructura tridimensional singu-
lar de las biomolculas. La informacin gentica, que se almacena en las
secuencias lineales de nucletidos en el cido nucleico cido desoxirribonu-
cleico (DNA), denominadas genes, especifica a su vez la secuencia lineal de
4 CAPTULO UNO
C O NC E P TO S CLAVE 1.1
Todos los organismos vivos obedecen a las
mismas leyes fsicas y qumicas. La vida
es compleja, dinmica, organiz.ada y auto-
mantenida. La vida es celular y basada
en la informacin. La vida se adapta y
evoluciona.
Introduccin a la Bioqumica
aminocidos de las protenas y de qu forma y cundo se sintetizan esas prote-
nas. Las protelas realizan su funcin interaccionando con otras molculas. La
estIl.lctllJa tridimensional singular de cada clase de protena permite su unin y
su interaccin con una clase especfica de molculas, con una forma comple-
mentaria precisa. Durante el proceso de unin se transfiere la informacin. Por
ejemplo, la unin de la insulina, una protena que libera el pncreas de los
vertebrados, a las molculas receptoras de insulina en la superficie de determi-
nadas clulas es una seal que inicia la captura de la molcula nutriente gluco-
sa. Asimismo, el transpolte de los aminocidos es sensible a la insulina.
S. La vida se adapta y evoluciona. Toda la vida sobre la Tierra tiene un origen
comn, y las formas nuevas surgen a partir de otras formas. Cuando un organis-
mo individual en una poblacin se autorreproduce, las modificaciones del DNA
inducidas por las agresiones y los errores que tienen lugar cuando se copian las
molculas de DNA pueden dar lugar a mutaciones o cambios de la secuencia.
La mayora de las mutaciones son silenciosas; es decir, o bien las repara la clula
o no tienen efecto sobre el funcionamiento del organismo. Sin embargo, algunas
son nocivas y sirven para limitar el xito reproductor de los descendientes. En
ocasiones poco frecuentes, las mutaciones pueden contribuir a aumentar la capa-
cidad del organismo para sobrevivir, para adaptarse a circunstancias nuevas y
para reproducirse. La plincipal fuerza impulsora de este proceso es la capaci-
dad de explotar las fuentes de energa. Los individuos que poseen caractersti-
cas que les permiten explotar mejor una fuente energtica especfica dentro de
su hbitat pueden tener una ventaja competiti va cuando los recursos son limita-
dos. A lo largo de muchas generaciones la interdependencia de los cambios
ambientales y de la variacin gentica puede dar lugar a la acumulacin de
caractersticas favorables y, finalmente, a formas de vida muy diferentes.
Las ciencias biolgicas estn experimentando en el momento actual una revolu-
cin creada por la aplicacin de las tcnicas bioqumicas y la gentica. Las tecnologas
generadas por esta ciencia relativamente nueva -la biologa molecular- han propor-
cionado un conocimiento inimaginable sobre el funcionamiento de los seres vivos. En
la actuaJjdad, es habitual la identificacin de genes especficos y el segu miento de sus
efectos en los seres vivos. Este enfoque nuevo ya ha proporcionado una avalancha de
informacin que ha transformado disciplinas tan diversas como la agricultura, la ar-
queologa, la botnica, la biologa del desarrollo, la ecologa, la ciencia forense, la
medici na, la farmacologa y la nutricin. La capacidad de los futuros cientficos para
utilizar el volumen completo de conocimientos nuevos y crecientes comienza con el
aprendizaje de los principios bsicos de la bioqumica. Este captulo presenta una
visin general de la bioqumica y una introduccin a los conceptos fundamentales de
esta disciplina cientfica. Tras una revisin breve de la diversidad de la vida, comenza-
mos nuestro anlisis de la bioqumica con una introduccin a la estI1lctura y funcin
de las principales biomolculas. A continuacin se consideran los procesos bioqumi-
cos ms impoltantes. El captulo concluye con una visin general del procesamiento
de la informacin gentica y una introduccin breve a los conceptos bsicos de la
bioqumica experimental moderna. A lo largo de este captulo y en el resto del libro,
expl icamos la relacin tan estrecha que existe entre los procesos bsicos de los seres
vivos, la estructura de los compuestos bioqumicos, las miles de reacciones bioqumi-
cas de los organismos, y la herencia gentica. El entendimiento de cualquiera de estos
temas est ligado de forma inseparable al entendimiento de los dems.
1.1. EL MUND O VIVO
Los clculos sobre el nmero de especies vivas actuales van desde varios millones a
decenas de millones. Todas estn formadas por clulas procariotas o eucariotas.
La mayora de los organismos son procariotas; es decir, sus clulas carecen de n-
cleo (pro = antes, karyon = ncleo o meollo). Los eucariotas (en = verdade-
 1.1. El mundo vivo 5

ro) estn formados por un nmero de clulas relativamente grande y de gran com-
plejidad que poseen un ncleo, que es un compartimiento rodeado por una membra-
na que contiene el material gentico.
Los procariotas no slo son las formas ms antiguas de vida sobre la Tierra, sino
que desde hace unos 3800 millones hasta alrededor de 1800 millones de aos, fueron
las nicas formas de vida. Hasta los aos 1980 se pensaba que los procariotas cons-
taban slo de las bacterias. El anlisis de las secuencias de nucletidos del cido
ribonucleico (RNA), una clase de cido nucleico que participa en la sntesis de pro-
tenas, ha demostrado que existen dos grupos de procariotas bastante distintos: bac-
terias y arqueas. Su apariencia externa es semejante, pero las diferencias de las
propiedades moleculares de las bacterias y las arqueas son ms pronunciadas que las
diferencias con las de los eucariotas. Los procariotas unicelulares son los seres vivos
ms pequeos. No obstante, su biomasa combinada es 10 veces mayor que la de los
organismos eucariotas ms grandes (animales, vegetales, hongos y protistas unicelu-
lares). Los procariotas virtualmente ocupan cada nicho de la Tierra. Adems de en el
aire, el suelo y el agua, varias especies procariotas viven sobre la piel y en el tubo
digestivo de los animales, dentro de los manantiales calientes y a varios kilmetros
de profundidad dentro de la corteza de la Tierra.
Las pruebas moleculares sobre las relaciones evolutivas de las especies vivas
son lo suficientemente convincentes para que muchos cientficos clasifiquen actual-
mente a todos los seres vivos en tres dominios: bacterias, arqueas y eucariotas
(Fig. 1-2). Cada dominio se considera brevemente. Posteriormente, se presenta una
introduccin a los virus, entidades genticas que se encuentran en la frontera entre lo
vivo y lo inanimado.
F"II3URA 1-2
Los dominios de la vida sobre la Tierra
Vegetales
Las pruebas moleculares indican que todas
las formas de vida investigadas hasta ahora
pueden clasificarse en tres dominios.
Animales

Hongos

Halfilos Flagelados

EUC IOTA

Termfilos

Cianobacterias Bacterias
hetertrofas
6 CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

Bacterias
Las bacterias son tan diversas en sus hbitat yen sus capacidades nutritivas que slo
pueden realizarse sobre ellas afirmaciones generales. Como grupo, las bacterias son
especialmente conocidas por su diversidad bioqumica. Varias especies poseen ca-
ractersticas que las permiten explotar virtualmente cada fuente de energa, nutriente
y entorno concebible. Por ejemplo, algunas especies bacterianas pueden utilizar la
energa luminosa para convertir el CO 2 en molculas orgnicas. Otras utilizan la
energa que extraen de las molculas inorgnicas u orgnicas.
Algunas especies bacterianas poseen una reputacin bien merecida como pro-
ductoras de enfermedades (p. ej., clera, tuberculosis, sfilis y ttanos). Sin embargo,
la gran mayora desempea funciones vitales en el mantenimiento de la vida sobre la
tierra. Se requiere la actividad de muchas clases de bacterias para reciclar nutrientes
como el carbono, el nitrgeno y el azufre. Por ejemplo, la bacteria Rhizobium trans-
forma el nitrgeno molecular inerte (N 2 ) en amonaco (NH J ), que luego puede ser
asimilado por otros organismos como las plantas leguminosas. Una de las funciones
ms importantes de las bacterias es la descomposicin, un proceso que libera nu-
trientes de los organismos muertos, para que puedan utilizarlos los vivos.
Muchas especies bacterianas son de gran inters prctico para el ser humano. Los
alimentos como el yogur, el queso, el pan cido y el sauerkraut se fabrican con la
colaboracin de determinadas bactelias. Otras clases de bacterias, como los actinomi-
cetos, producen antibiticos que se utilizan para curar las infecciones bacterianas. Las
bacterias han sido especialmente valiosas en la investigacin bioqumica. Debido a su
rpido crecimiento ya su cultivo relativamente fcil, determinadas especies (especial-
mente Escherichia coli) han sido fundamentales en la investigacin de la mayora de
los procesos bioqumicos bsicos. La informacin adquirida en los estudios sobre los
microorganismos patgenos se ha utilizado en medicina para aliviar y prevenir el
sufrimiento humano. Ms recientemente, los biotecnlogos han utilizado el rpido
crecimiento bacteriano y su flexibi lidad metablica para insertar en las clulas bacte-
rianas genes que codifican hormonas, vacunas y otros productos de uso humano.

Arqueas
Las arqueas slo se reconocieron como grupo diferenciado de organismos en 1977,
ao en que Cad Woese analiz molculas especficas de cido nucleico. La compa-
racin de las propiedades moleculares de las arqueas con las de las bacterias y los
eucariotas ha demostrado que las arqueas estn en muchos aspectos ms cerca de los
eucariotas que de las bacterias de apariencia simi lar. Por ejemplo, el sistema de
sntesis de protenas de las arqueas es ms parecido al de los eucariotas.
Una caracteIstica destacada de la mayora de las arqueas es su capacidad para
ocupar y hasta mejorar en todos los hbitat. Denominadas frecuentemente extremfi-
las, algunas especies de arqueas pueden vivir en circunstancias que fcilmente destrui-
ran a la mayora de las formas vivas. Aunque otras clases de organismos (p. ej.,
determinadas bacterias, algas y hongos) pueden vivir en condiciones extremas, las
arqueas se encuentran entre las especies ms extremfiJas. Los extremfilos se clasi-
fican de acuerdo con las condiciones especiales en las que viven: temperaturas muy
altas o muy bajas, concentraciones salinas elevadas, presin elevada. Las investiga-
ciones de las arqueas extremfilas tambin han permitido conocimientos singulares
sobre las adaptaciones de la estructura biomolecular a las condiciones extremas,
adems de proporcionar un conocimiento considerable de la historia de la vida sobre
la Tierra (vase el recuadro de inters especial 2-1). Los esfuerzos investigadores de
los bioqumicos y los biotecnlogos se han centrado en las extremozimas, que son
enzimas (catalizadores proteicos) que operan en condiciones nocivas. Entre los ejem-
plos de las aplicaciones industriales de este trabajo estn las enzimas que se utilizan en
el procesamiento de los alimentos y los detergentes de lavandeIa. Junto con muchas
especies bacterianas, las arqueas han demostrado su utilidad en la biorreparacin,
proceso en el que se utilizan los organismos para degradar o eliminar los contami-
nantes de los lugares de desechos txicos y los vertidos de petrleo.
 1.1. El mundo vivo 7

Eucariotas
El tercer dominio de los seres vi vos, los eucariotas, est constituido por el resto de
las especies de la Tierra (Fig. 1-3). Aunque la presencia o ausencia de un ncleo es
la diferencia ms notable entre los procariotas y los eucariotas, existen otras distin-
ciones significativas:

1. Tamao. Las clulas eucariotas son sustancialmente ms grandes que las

clulas procariotas. Por ejemplo, el dimetro de las clulas animales vara
entre 10 y 30 ,um. Estos valores son aproximadamente 10 veces superiores
que los de los procariotas. Sin embargo, es ms clara la disparidad de tamao
entre los dos tipos de clulas cuando se considera el volumen. Por ejemplo, el
volumen de una clula eucariota tpica, como una clula heptica (hepatoci-
to), se encuentra entre 6000 y 10 000 1m 3 El volumen de E. coli es varios
centenares de veces menor.
2. Complejidad. La complejidad estructural de los eucariotas es notable. Ade-
ms de un ncleo bien formado, se encuentran presentes varias estructuras
subcelulares denominadas orgnulos. Cada orgnu10 est especializado en la
realizacin de tareas especficas. La compartimentalizacin que proporcio-
nan los orgnulos permite la concentracin de las molculas de reactante y
producto en lugares donde pueden utilizarse con eficacia. Esto, junto con
otros factores, hacen posible la existencia de mecanismos reguladores com-
plicados. Como consecuencia, las clulas de Jos eucariotas multicelulares son
capaces de responder con rapidez y eficacia a las comunicaciones intercelula-
res que se requieren para la proliferacin y el desarrollo.
3. Multicelularidad. Slo en los eucariotas se encuentra una multicelularidad
verdadera. Aunque los protistas unicelulares muy complejos constituyen la
mayor biomasa de los eucariotas, todas las categoras restantes son multicelu-
lares. Algunas bacterias tienen un hbito de vida colonial, especialmente so-
bre los medios slidos, pero en pocas ocasiones se consigue la cooperatividad
y especializacin de la multicelularidad. Los organismos multicelulares no
slo son un conjunto de clulas: son sistemas vivos muy ordenados que juntos
forman una entidad coherente. La complejidad estructural de las clulas
eucariotas proporciona la capacidad que requieren los mecanismos complica-
dos de comunicacin intercelular en estos organismos.
F"IGURA 1 - 3
Biodiversidad
La Tierra est poblada por muchos millones
de especies que habitan todos los nichos
del planeta. Sin embargo, la mayora de
las especies son demasiado pequeas para
poder ser vistas por el ojo humano. En esta
figura, slo se indican los representantes
de Jos grandes eucariotas multiceJulares,
los ms conocidos por el ser humano.
B CAPTULO UNO
CONCEPTO S C L AVE 1. 2
Los seres vivos se han clasificado en tres
dominios: bacterias, arqueas y eucariotas.
Los vi!us son parsitos intracelulares que
slo pueden autorreproducirse insertando su
informacin gentica en una clula viva.
Introduccin a la Bioqumica
Virus
Los virus no son seres vivos, aunque pueden desorganizar los procesos dentro de los
seres vivos por medio de reacciones bioqumicas. Formados por DNA o RNA en-
vuelto en una protena o una membrana, los virus son agentes infecciosos que se
autorreproducen insertando su informacin gentica en clulas hospedadoras sus-
ceptibles. Los genes vricos pueden permanecer durmientes en el DNA de la clula
durante perodos de tiempo largos o pueden empezar inmediatamente a dirigir la
produccin de cantidades masivas de cido nucleico y componentes proteicos que se
ensamblan en nuevas partculas del virus. Una vez ha empezado una infeccin vrica
manifiesta, la clula est, en efecto, secuestrada. Los genes del virus emplean la
maquinaria de la clula para su propio uso. Como consecuencia de la infeccin
vrica, las clulas pueden daarse o destruirse.
Los virus son parsitos intracelulares que infectan a casi todas las clases de
organismos. Sio embargo, cada tipo de virus normalmente slo infecta a una especie
o a unas pocas especies semejantes. Con frecuencia las infecciones vricas producen
enfermedades. Entre las enfermedades infecciosas bumanas producidas por virus se
encuentran el sndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA), la polio, la rabia,
varios tipos de hepatitis y el resfriado comn. Las enfermedades animales y vegeta-
les producidas por virus causan un dao inmenso a la agricultura. Sin embargo, los
virus hacen algo ms que producir enfermedades. Pueden ser tambin agentes de
modificaciones genticas. En ocasiones, cuando se producen viroides (partculas
vricas) nuevos, stos incorporan de forma inadvertida parte del material gentico de
la clula hospedadora. A continuacin, esta informacin se transmite a una clula
hospedadora nueva. En circunstancias poco habituales se transfiere a una especie
diferente. Este proceso, que se denomina transduccin, es una fuente de variacin
gentica que impulsa los cambios evolutivos.
Los bioqumicos han utilizado a los virus como herramientas en sus investiga-
ciones de numerosos procesos vivos. Por ejemplo, las investigaciones de los bacte-
rifagos (virus que infectan a las bacterias) han aportado un conocimiento inestima-
ble sobre los mecanismos genticos bsicos. En las investigaciones sobre los
detalles de la expresin del procesamiento de la informacin gentica y otros aspec-
tos del metabolismo celular se han utilizado virus animales. Actualmente, se est
utilizando la capacidad de los virus para infectar a determinadas cl ulas humanas
como mecanismo en los protocolos de la genoterapia.
1.2. BIOMO L C U L A S
Los seres vivos estn formados por miles de clases diferentes de molculas inorgn.i-
cas y orgnicas. El agua, una molcula inorgnica, puede constituir entre el 50 y el
95 % del contenido en peso de una clula, y los iones como el sodio (Na+), el potasio
(K+), el magnesio (Mg 2+) y el calcio (Ca 2+) pueden representar otro 1 %. Casi todas
las dems clases de molculas orgnicas estn formadas principalmente por seis
elementos: carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre, y contienen
cantidades mnimas de determinados elementos metlicos y otros no metlicos. Es
notable el hecho de que los tomos de cada uno de los elementos ms comunes que
se encuentran en los seres vivos puedan formar fcilmente enlaces covalentes esta-
bles. En los enlaces covalentes, los tomos estn unidos al compartir los electrones
que completan los orbitales ms externos de cada tomo.
La capacidad de los tomos de carbono para formar cuatro enlaces covalentes
sencillos fuertes, bien con otros tomos de carbono o con tomos de otros elementos,
posibilita la notable complejidad estructural y la diversidad de las molculas orgni-
cas. Las molculas orgnicas con muchos tomos de carbono pueden dar lugar a
formas complicadas, como largas estructuras lineales o cadenas ramificadas y ani-
llos.
 1.2. Biomolcu las 9

Grupos funcionales de las biomolculas orgnicas

La mayora de las biomolculas pueden considerarse derivadas del tipo ms simple

de molculas orgnicas, que son los hidrocarburos. Los h.idrocarburos (Fig. 1-4) son
molculas que contienen carbono e hidrgeno y que son hidrfobas, lo cual significa
que son insolubles en agua. Todas las dems molculas orgnicas se forman uniendo
otros tomos o grupos de tomos al esqueleto carbonado de un hidrocarburo. Las
propiedades qumicas de estas molculas derivadas estn determinadas por la dispo-
sicin especfica de los tomos denominados grupos funcionales (Cuadro 1-1). Por
ejemplo, los alcoholes se producen cuando los tomos de hidrgeno se sustituyen
por grupos hidroxilo (-OH). As, el metano (CH 4 ), un componente del gas natural,
puede convertirse en metanol (CH 30H), un lquido txico que se utiliza como disol-
vente en muchos procesos industriales.
La mayora de las biomolculas contienen ms de un grupo funcional. Por ejem-
plo, muchas molculas sencillas de azcar tienen varios grupos hidroxilo y un grupo
aldehdo. Los aminocidos, que son los bloques de construccin de las protenas,
tienen un grupo amino y un grupo carboxilo. Las propiedades qumicas de cada
grupo funcional contribuyen al comportamiento de las molculas que lo contienen.
CH 2 FIE3U RA 1 ~ 4
H H H H H H H H H
1 1 1 1 1 1 1 1 1
H C/ ~CH Frmulas estructurales de varios hi-
2 1 2
H-C-H H-C-C-H H-C-C-C-C-C-C-H 1
drocarburos.
1 1 1 1 1 I I I I H2 C"-.... /CH 2
H H H H H H H H H CH 2
Metano Etano Hexano Ciclohexano

CUADRO 1 - 1
Grupos funcionales importantes de las biomolculas

Nombre de la familia Estructura del grupo Nombre del grupo Significado

Alcohol R-OH Hid roxilo Polar (y por lo tanto hidrosolublel. forma enlaces
de hidrgeno
o
II
Aldehdo R-C-H Carbonilo Polar. se encuentra en algunos azcares

O
II
Cetona R-C-R' Carbonilo Polar. se encuentra en algunos azcares
O
II
cidos R-C-OH Carboxilo Dbilmente cido. lleva una carga negativa cuando
dona un proln
Aminlls Amino Dbilmell!e bsico, lleva una carga positiva cuando
ace pta un protn
O
1
II
Amidas R-C-NH 2 Amido Polar, pero no lleva carga
Tioles R-SH Tiol Fcilmente oxidable: puede formar f<cilmente
enlaces -S-S- (disulfuro)

O
II
steres R-C--O-R ster Sc encuentran en determinadas molculas lipdicas
Doble enlacc RCH=CHR Alqueno Componente estructural importante dc l11uchas
hiomolculas: p. ej .. se encuentra en molculas lipdicas
10 CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

Principales clases de biomolcuJas

Muchos de los compuestos orgnicos que se encuentran en las clulas son relativa-
mente pequeos, con pesos moleculares inferiores a 10 000 dalton (D). (Un dalton,
1 unidad de masa atmica es igual a 1/12 de la masa de un tomo de 12C). Las clulas
contienen cuatro familias de molculas pequeas: aminocidos, azcares, cidos
grasos y nucletidos (Cuadro 1-2). Los miembros de cada grupo desempean varias
funciones. En primer lugar, se utilizan en la sntesis de molculas mayores, muchas
de las cuales son polmeros. Por ejemplo, las protenas, determinados hidratos de
carbono y los cidos nucleicos son polmeros formados, respectivamente, por ami-
nocidos, azcares y nucletidos. Los cidos grasos son componentes de varias cla-
ses de molculas de lpidos (insolubles en agua).
En segundo lugar, algunas molcu las tienen funciones biolgicas especiales. Por
ejemplo, el nucletido adenosina trifosfato (ATP) opera como reserva celular de
energa qumica. Finalmente, muchas molculas orgnicas pequeas participan en
las rutas de reacciones. En las cuatro secciones siguientes se describen ejemplos de
cada clase.

AMINOCIDOS Y PROTENAS Existen cientos de aminocidos naturales,

cada uno de los cuales contiene un grupo amino y un grupo carboxilo. Los aminoci-
dos se clasifican como a, fJ o y, de acuerdo con la posicin del grupo amino con
referencia al grupo carboxilo. En los aminocidos a, la clase ms frecuente, el grupo
amino est unido al tomo de carbono (carbono a) inmediatamente adyacente al
grupo carboxilo (Fig. 1-5). En los aminocidos fJ y y, el grupo amino est unido a los
carbonos segundo y tercero, respectivamente, a partir del grupo carboxilo. Unido
tambin al carbono a est otro grupo, que se denomina cadena lateral o gnlpo R. Las
propiedades qumicas de cada aminocido estn determinadas en gran medida por
las propiedades de su cadena lateral. Por ejemplo, algunas cadenas laterales son
hidrfobas, mientras que otras son hidrfilas (es decir, se disuelven fcilmente en
agua). La frmula general de los aminocidos a es

o
a 11
H N-CH-C-OH
2 1

Existen 20 aminocidos a estndar en las protenas. Algunos aminocidos estn-

dar tienen funciones singulares en los seres vivos. Por ejemplo, la glicina y el cido
glutmico actan como neurotransmisores en los animales. (Los neurotransmiso-
res son molculas sealizadoras liberadas por las clulas nerviosas). Las protenas
contienen tambin aminocidos no estndar que son versiones modificadas de los
aminocidos estndar. La estructura y funcin de las molculas proteicas con fre-
cuencia se altera por la conversin de determinados residuos de aminocidos en

CUADRO 1-2
Clases principales de biomolculas

Molcula pequea Polmero Funciones generales

Aminocidos Protenas Catlisis y elementos estructurales

Azcares Hidratos de carbono Fuentes energticas y elementos
estructurales
cidos grasos N.A. Fuentes energlicas y elementos
estructurales de las molculas
lipdicas complejas
Nucle6lidos ONA Informaci6n gentica
RNA Sntesis de protenas
 1.2. Biomolcu las 1 1

F"leURA 1-5
Frmulas estructurales de varios
o aminocidos (J.
11
H N-CH-C-OH Se resaltan los grupos R. El grupo R en las
2 1 estructuras de los aminocidos puede ser
CH - C - H un tomo de hidrgeno (p. ej., en la glicina),
3 1 un grupo hidrocarbooado (p. ej., el grupo
CH 3 isopropilo en la valina) o un derivado
hidrocarbonado (p. ej., el grupo hidroxime-
Glutamina Valina Lisina tilo en la serina).

o
11
H N-CH-C-OH o
2 1
11
o H N-CH-C-OH

H N-CH-C-OH
2 1

Glicina
11

O
Fenilalanina
2 1

CH 2
1
OH
Serina

derivados fosforilados, hidroxilados o de otro tipo. (El trmino residuo indica una
biomolcula pequea que se ha incorporado a una macromolcula, p. ej., los residuos
de aminocido de una protena.) Por ejemplo, en el colgeno, la protena del tejido
conjuntivo, un gran nmero de los residuos de prolina estn hidroxilados. Muchos de
~-Alanina
los aminocidos naturales no son aminocidos a. Entre los ejemplos ms notables se
encuentra la fl-alanina, precursor de la vitamina cido pantotnico, y el cido y-ami no-
butrico (GABA), un neurotransmisor que se encuentra en el cerebro (Fig. 1-6). O
Las molculas de aminocido se utilizan principalmente para la sntesis de lar- 11
H2 N-CH 2 -CH 2 - CH 2 -C-OH
gos polmeros complejos denominados polipptidos. Los polipptidos cortos, con
una longitud inferior a SO aminocidos, se denominan pptidos. A los polipptidos GASA
ms largos se les suele denominar protenas. Los polipptidos desempean una gran
variedad de funciones en los seres vivos. Entre los ejemplos de molculas formadas F"leURA 1-6
por polipptidos se encuentran las protenas de transpOlte, las protenas estructurales Ejemplos seleccionados de aminocidos
y las enzimas. naturales que no son aminocidos a:
Los aminocidos individuales estn unidos en pptidos (Fig. 1-7) Y poJipptidos fj-alanina y cido r-aminobutrico
mediante el enlace peptdico, un enlace amida que se forma en una clase de reac- (GABA)
cin de sustitucin nuclefila (pg. 17) con participacin de un grupo carbonilo, que
se produce entre el grupo amino de un aminocido y el grupo carboxilo de otro. El
carcter parcial de doble enlace del enlace peptdico da lugar a una disposicin en el
plano de los tomos HN-CO que da a las molculas polipeptdicas una estabilidad

F"leURA 1-7
Estructura de la met-encefalina, un pen-
tapptido
La met-encefalina pertenece a una clase
H O H O H O HC O H O
de molculas que poseen acti "idad opioi-

9
1 11 1 11 1 11 21 11 1 11
HN-C-C-N-C-C-N-C-C-N-C-C-N-C-C-OH de. La met-encefa1ina se encuentra en el
2 1 1 1 1 1 1 1 1 1
cerebro e inhibe la percepcin del dolor. (Los
enlaces peptdicos estn coloreados. Los
HH HH HH H I:: gn.lpos R estn subrayados.)

00 c~
12 CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

F"II3URA 1 - B
Estructura polipeptdica
Al plegarse el polipptido en su estructura
tridimensional singular, los grupos R ms
hidrfobos (esferas amarillas) quedan en-
terrados en el intelior lejos del agua. Los
grupos hidrfilos normalmente se encuentran
en la superficie.

Desplegada

Plegada

suficiente en condiciones fisiolgicas. El carbono Ci. aporta flexibilidad a la cadena

poJipeptdica debido a la rotacin libre de los enlaces en este carbono.
La estructura tridimensional final y, como consecuencia, la funcin biolgica, de los
polipptidos se debe, en gran medida, a las interacciones entre los grupos R (Fig. 1-8).

AZCARES E HICRATOS CE CARBONO Los azcares contienen gru-

pos funcionales alcohol y carbonilo. Se describen en funcin del nmero de carbo-
nos y de la clase de grupo carbonilo que contienen. Los azcares que poseen un
grupo aldehdo se denominan aldosas, y aquellos que poseen un grupo cetona se
denominan cetosas. Por ejemplo, el azcar glucosa de seis carbonos (una fuente de
energa importante en la mayora de los seres vi vos) es una aldohexosa (Fig. 1-9). La
fructosa (azcar de la fruta) es una cetohexosa.
Los azcares son las unidades bsicas de los hidratos de carbono, las molculas
orgnicas ms abundantes de la naturaleza. Los hidratos de carbono van desde los
azcares sencillos, o monosacridos, como la glucosa y la fructosa, a los polisac-
ridos, polmeros que contienen miles de unidades azcar. Entre estos ltimos se
encuentran el almidn y la celulosa de las plantas y el glucgeno de los animales.
Los hidratos de carbono desempean varias funciones en los seres vivos. Determina-
dos azcares son fuentes de energa importantes. La glucosa es la fuente de energa
hidrocarbonada en los animales y las plantas. La sacarosa es utilizada por muchas
plantas como un medio eficaz de transporte de energa por sus tejidos. Algunos
hidratos de carbono actan como materiales estructurales. La celulosa es el principal
componente estmctural de la madera y de determinadas fibras de las plantas. La
quitina, otro tipo de polisacrido, se encuentra en las cubiertas protectoras exteriores
de los insectos y los crustceos.
 1.2. Biomolculas 13

H H FIGURA 1-9
1 1
Ejemplos de varios monosacridos de
c=o H-C-OH H H
importancia biolgica
1 1 1 1
H-C-OH c=o c=o c=o La glucosa y la fructosa son fuentes impor-
1 1 1 1
tantes de energa en los animales y los
HO-C-H HO-C-H H-C-OH CH 2 vegetales. La ribosa y la desoxinibosa son
1 1 1 1
componentes de los cidos nucleicos. Estos
H-C-OH H-C-OH H-C-OH H-C-OH monosacridos se encuentran en la natura-
1 1 1 1 leza en forma de estructuras de anillo.
H-C-OH H-C-OH H-C-OH H-C-OH
1 1 1 1
H-C-OH H-C-OH H-C-OH H-C-OH
1 1 1 1

H H H H
Glucosa Fructosa Ribosa 2-Desoxirribosa
(una aldohexosa) (una cetohexosa) (una aldopentosa) (una aldopentosa)

Algunas biomolculas contienen componentes hidrocarbonados. Los nucleti-

dos, los bloques de construccin de los cidos nucleicos, contienen los azcares
ribosa o desoxinibosa. Determinadas protenas contienen tambin hidratos de car-
bono. Las glucoprotenas y los glucolpidos se encuentran en la superficie externa de
las membranas celulares de los organismos multicelulares, donde desempean fun-
ciones decisivas en las interacciones entre las clulas.

CICOS BRASOS Los cidos grasos son cidos monocarboxlicos que gene-
ralmente contienen un nmero par de tomos de carbono. En algunos organismos
actan como fuentes de energa. Los cidos grasos estn representados por la frmu-
la qurrilca R -COOH, en la que R es un grupo alquilo que contiene tomos de
carbono e hidrgeno. Existen dos tipos de cidos grasos: cidos grasos saturados,
que no contienen dobles enlaces carbono-carbono, y cidos grasos insaturados, que
poseen uno o varios dobles enlaces (Fig. 1-10). En condiciones fisiolgicas el grupo
carboxilo de los cidos grasos se encuentra en el estado ionizado, R -COO-. Por
ejemplo, el cido graso saturado de 16 carbonos, denominado cido palmtico, se
encuentra como palrriltato, CH3(CH2)14COO-. Aunque el grupo carboxilo cargado
tiene afinidad por el agua, las largas cadenas hidrocarbonadas apolares hacen a la
mayora de los cidos grasos insolubles en agua.
Los cidos grasos slo se encuentran como molculas independientes (libres) en
los seres vivos en cantidades mnimas. La mayora se encuentra como componente
de varias clases de molculas lipdicas (Fig. 1-11). Los lpidos son un grupo diverso
de sustancias solubles en disolventes orgnicos, como el cloroformo o la acetona, e
insolubles en agua. Por ejemplo, los triacilgliceroles (grasas y aceites) son steres
que contienen glicerol (un alcohol de tres carbonos con tres grupos hidroxilo) y tres
cidos grasos. Deterrrilnadas molculas de lpidos anlogos a los triacilgliceroles,
que se denominan fosfoglicridos. contienen dos cidos grasos. En estas molculas

o FIBURA 1 - 10
11
Estructura de los cidos grasos
CH3CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2C - OH
(a) cido graso saturado; (b) cido graso
cido palmtico (saturado) insaturado.
(a)

cido oleico (insaturado)

(b)
14 CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

F"IGU RA 1 - 1 1 o O
Molculas Jipdicas que contienen cidos 11 11
O CH -O-C-R O CH,-O-C-R
grasos 11 1 2 1 11 1 2 1
(a) Triacilglicerol; (b) fosfatidiJcolina, una C-O-CH O C-O-CH O CH
clase de fosfoglicrido. R(
R/
2
1
CH 2 -
11
O-C- R3
I
CH 2 - O -1- 1I
O - CH 2 CH 2 -1-
) 3
CH 3

0- CH
3
(a) Triacilglicerol (b) Fosfatidilcolina

el tercer grupo hidroxilo del glicerol est acoplado con fosfato, el cual a su vez est
urudo a pequeos compuestos polares como la colina. Los fosfoglicridos son com-
ponentes estructurales importantes de las membranas celulares.

NUCLETIDOB y CIDOS NUCLEICCS Los nucletidos contienen

tres componentes: un azcar de cinco carbonos (bien ribosa o desoxirribosa), una
base nitrogenada, y uno o varios grupos fosfato (Fig, 1-12), Las bases de los nucle-
tidos son anillos aromticos heterocclicos con varios sustituyen tes. Hay dos clases
de bases: las purinas biciclicas y las pirimidinas monocclicas (Fig. 1-13).

F"IGU RA 1 - 12
Estructura de los nucJetidos Adenina
Cada nucle6tido contiene una base nitroge-
nada (en este caso, adenina), un azcar
pentosa (ribosa), y uno o varios fosfatos.
Este nucle6tido es la adenosina nifosfato. O O O
1I 11 11
- O-P- O- P- O- P-O-CH
I I 1 I 2
-O -O -O

Ribosa

OH OH

F""I G U RA 1-1 3 H"-.,. /H

Bases nitrogenadas N
O

H-{r~
(a) Purinas y (b) pirimidinas.

H 'y 'v/ H

N
1
N H \J-"AN
1
N N
1
/H

H H H
Adenina (A) Guanina (G)
(a)

H
: ti H O

H N O
1

H
Timina (T) Uracilo (U)
(b)
 1.2. Biomolculas 15

Los nucletidos participan en una gran variedad de reacciones de biosntesis y

de generacin de energa. Por ejemplo, una proporcin sustancial de la energa que
se obtiene de las molculas del alimento se utiliza para formar los enlaces fosfato de
energa elevada de la adenosina trifosfato (ATP). Sin embargo, la funcin ms im-
pOL1ante de los nucletidos es actuar como bloques de construccin de los cidos
nucleicos. En una molcula de cido nucleico, un gran nmero de nucletidos (des-
de centenares a millones) estn ligados por enlaces fosfodister para formar cadenas
largas de polinucletidos. Hay dos clases de cido nucleico:

1. DNA. El DNA es el depositario de la informacin gentica. Su estructura

consta de dos cadenas de polinucletidos enrolladas una alrededor de la otra
para formar una doble hlice a derechas (Fig. 1-14). Adems de la desoxirri-
bosa y el fosfato, el DNA contiene cuatro clases de bases: las purinas adeni-
na y guanina y las pirimidinas timina y citosina. La doble hlice se forma por
el apareamiento complementario entre las bases mediante la formacin de
enlaces de hidrgeno. (Un enlace de hidrgeno es una fuerza de atraccin
entre el hidrgeno y tomos electronegativos como el oxgeno o el nitrge-
no.) La adenina se aparea con la timina, y la guanina con la citosina. Cada gen
est formado por una secuencia lineal de bases especfica y singular. Aunque
la mayora de los genes codifican la secuencia lineal de aminocidos de las
protenas, el DNA no est implicado directamente en la sntesis de protenas.
En su lugar, se utiliza otro tipo de cido nucleico para conveL1ir las instruc-
ciones codificadas en el DN A en productos polipeptdicos.

3'

\
\

\
\

(b)
F"I [3 U RA 1 - 1 4
DNA
(a) Vista esquemtica del DNA. Los esqueletos azcar-fosfato de la doble hlice estn rerresentados por cintas coloreadas. Las bases unidas
al azcar desoxirribosa estn en el interior de la hlice. (b) Vista ampliada de dos pares de bases. Obsrvese que las dos cadenas de DNA
van en direcciones opuestas definidas por los grupos 5' y 3' de la desoxirribosa. Las bases en las cadenas opuestas forman pares debido
a los enlaces de hidrgeno. La citosina siempre se aparea con la guanina y la timina siempre se aparea con la adenina.
16 CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

2. RNA. El RNA es un polinucletido que se diferencia del DNA en que contie-

CONCEPTOS CLAVE 1.3
La mayora de las molculas de los seres
vivos son orgnicas. Las propiedades qumi-
cas de las molculas orgnicas estn deter-
minadas por las disposiciones especfi-
cas de los tomos. que se denominan grupos
funcionales. Las clulas contienen cuatro
familias de molculas pequeas: amino-
cidos, azcares, cidos grasos y nuc1etidos.
ne el azcar ribosa en lugar de desoxirribosa, y la base uracilo en lugar de
timina. En el RNA, como en el DNA, los nucletidos estn unidos por enla-
ces fosfodister. A diferencia de la doble hlice del DNA. el RNA es de
cadena sencilla. Las molculas de RNA se doblan en estructuras tridimensio-
nales creadas por las regiones locales de apareamiento complementaJio de
bases. Durante un proceso complejo, la doble hlice del DNA se desenrolla
parcialmente y se sintetizan las molculas de RNA utilizando una cadena de
DNA como molde. Existen tres clases principales de RNA: RNA mensajero
(mRNA), RNA ribosmico (rRNA) y RNA de transferencia (tRNA). Cada
secuencia singular o molcula de mRNA posee la informacin que codifica
directamente la secuencia de aminocidos de un polipptido especifico. Los
ribosomas, que son estructuras supramoleculares grandes y complejas forma-
das por rRNA y molculas proteicas, convierten la secuencia de bases del
mRNA en la secuencia de aminocidos de un polipptido. Las molculas de
RNA de transferencia actan como adaptadoras durante la sntesis de prote-
nas. Cada clase de molcula de tRNA se une a un aminocido especifico.
Cada polipptido se constmye al traducirse en cada ribosoma la informacin
de la secuencia de bases del mRNA por el apareamiento de bases entre las
molculas de mRNA y tRNA. Al aproximarse los aminocidos se forman los
enlaces peptidicos.

1 .3. PReCEses Blel:\luMICeS

Todas las caractersticas de los seres vivos -su organizacin compleja y su capaci-
dad para crecer y reproducirse- son el resultado de procesos bioqumicos coordina-
dos y finalistas. El metabolismo, la suma total de estos procesos, es posible por el
flujo de energa y nutrientes y por los miles de reacciones bioqumicas, cada una de
ellas catalizada por una enzima especifica. Las funciones primarias del metabolismo
son: (1) la adquisicin y utilizacin de energa, (2) la sntesis de molculas necesa-
rias para la estructura y el funcionamiento de las clulas (es decir, protenas, hidratos
de carbono, lpidos y cidos nucleicos), (3) el crecimiento y desarrollo, y (4) la
eliminacin de los productos de desecho. Los procesos metablicos requieren canti-
dades significativas de energa til. Esta seccin comienza con una revisin de las
principales clases de reacciones qumicas y las caractersticas esenciales de ICls es-
trategias que generan energa que se observCln en los seres vivos, y posteriormente se
delinean brevemente los procesos metablicos y los medios por los cuales los seres
vivos mClntienen sistemCls ordenados.

Reacciones bioqumicas
A primera vista las miles de reacciones que tienen lugar en las clulas parecen ser
extremadamente complejas. Sin embargo, varias caractersticas del metabolismo
nos permiten simplificar en gran medida este cuadro:

l. Aunque el nmero de reacciones es muy grande, el nmero de clases de reac-

ciones es relativamente pequeo.
2. Las reacciones bioqumicas tienen mecanismos sencillos propios de las reClC-
ciones orgnicas (es decir, L1nCl enzima normalmente slo hClce una cosa).
3. Son relativamente pocas las reacciones de importancia central en Bioqumica
(es decir, aquellas que se utilizan en la produccin de energa y ICl sntesis y
degradacin de los principales componentes celuIClres).

Entre las clases de reaccin ms comunes que se encuentran en los procesos

bioqumicos se encuentran las siguientes: O) sustitucin nuclefila, (2) eliminacin,
(3) adicin, (4) isomerizacin, (5) oxidacin-reduccin. Cada una se describir de
forma breve.
 1.3. Procesos bioqumicos 17

REACCIONES CE SUSTITUCiN NUCLErlLA En las reacciones

de sustitucin nuclefila, como sugiere el nombre, se sustituye un tomo o gfL1pO
por otro:

A: + B-0x .. A-B + X:

En la reaccin general que se muestra ms arriba, la especie atacante (A) se

denomina nuclefilo (<<amante del ncleo). Los nuclefilos son aniones (tomos o
gfL1pOS con carga negativa) o especies neutras que poseen pares electrnicos no
enlazantes. Los electrfilos (<<amantes de los electrones) son deficitarios en densi-
dad electrnica y, por lo tanto, fcilmente atacables por un nuclefilo. Al formarse
un enlace nuevo entre A y B, se rompe el viejo entre B y X. El nuclefilo que sale
(en este caso, X) se denomina grupo de salida.
Un ejemplo importante de sustitucin nuclefila es la reaccin de la glucosa con
el ATP (Fig. 1-15). En esta reaccin, que es el primer paso en la utilizacin de la
glucosa como fuente de energa, el oxgeno del hidroxilo del carbono 6 de la mol-
cula de azcar es el nuclefilo, y el fsforo el electrfito. El gfL1pO de salida es la
adenosina di fosfato.
Las reacciones de hidrlisis son una c Jase de reaccin de sustitucin nuclefila
en la que el oxgeno de una molcula de agua es el nuclefilo. El grupo carbonito de
un ster, una amida o un anhdrido es normalmente el electrfilo.

R-C-O-R' + H. O - - . . A-e - OH + R'OH

1I 11
o o
La digestin de muchas molculas del alimento implica una hidrlisis. Por ejemplo,
las protenas se degradan en el estmago en una reaccin catalizada por cido. Otro
ejemplo importante es la fragmentacin del enlace fosfato del ATP (Fig. 1-16). La
energa que se obtiene durante esta reaccin se utiliza para impulsar muchos proce-
sos celulares.

CH,ii~
FIGURA 1 - 15

Lo\ O O O
iJy\
H~ Jl r
H
Ejemplo de sustitucin nuclefila
En la reaccin de la glucosa con el ATP,
el oxgeno del hidroxilo de la glucosa es el
nuc]efilo. El tomo de fsforo (el electr-

~
\! -O-~---.C'O-~-O-~-O-CH
! \ filo) est.' polarizado por el oxgeno enlazado,
+ N N de forma que lkva una carga positiva
OH 2
parcial. Al producirse la reaccin, el par
HO OH 1 1 1 O
-O -O -O de electrones sin compartir sobre el CH 2 0H
del azcar ataca al fsforo, dando lugar a
OH
la expulsin del ADP, el grupo de salida.
Glucosa Adenosina trifosfato

OH OH

~:,op~) +
O
11
-O-P-O-P-O-CH
1
O
11

1 2 O
+
HO OH
-O -O
OH
Glucosa-6-fosfato Adenosina difosfato

OH OH
lB CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

FIGURA 1 - 16
Reaccin de hidrlisis
La hidrlisis del ATP se utiliza para impulsar
una sorprendente diversidad de reacciones
bioqumicas que requieren energa. o o
o
11 11 11
- O - P - O - P - O - P - O - CH
1 1 1 2 O
-O -O -O

Adenosina trifosfato

OH OH

1
o o O
11 11 11
- O - P - O - P - O - CH + -O-P-O-H + Energa +
1 1 2 O 1

-O -O -O
Adenosina difosfato Fosfato inorgnico

OH OH

REACCIONES CE ELIMINACiN En las reacciones de eliminacin,

cuando se eliminan los tomos de una molcula se forma un doble enlace.

H H H H
1 1 1 1
H-C-C-H --+ H-C=C-H +
1 1
A B

La eliminacin de H2 0 de las biomolculas que contienen grupos funcionales

alcohol es una reaccin que se encuentra comnmente. Un ejemplo sealado de esta
reaccin es la deshidratacin del 2-fosfoglicerato, un paso importante en el metabo-
lismo de los hidratos de carbono (Fig. 1-17). Otros productos de las reacciones de
eliminacin son el amonaco (NH 1 ), las aminas (RNH 2 ) y los alcoholes (ROH).

FIGURA 1 - 1 7 COO- O COO- O

Reaccin de eliminacin 1 11 H?O 1 11
H-C-O-P-O- C-O-P-O-
Cuando se deshidrata el 2-fosfoglicerato
se forma un doble enlace. H-C-OH 0-
1 1 -----.~ H-C
11 1
0-
1 1

H H
2-Fosfoglicerato Fosfoenolpiruvato
 1.3. Procesos bioqumicos 19

REACCIONES DE ADICiN En las reacciones de adicin se combinan

dos molculas para formar un solo producto.

H H H H
1 1 1 1
H-C=C-H + A-S H-C-C-H
1 1
A S

La hidratacin es una de las reacciones de adicin ms comunes. Cuando se aade

agua a un alqueno se produce un alcohol. Un ejemplo caracterstico es la hidratacin
del intermediario metablico fumarato para formar malato (Fig. 1-18).

REACCIONES DE ISOMERIZACIN Las reacciones de isomerizacin

suponen el desplazamiento de tomos o grupos. Una de las isomerizaciones bio-
qumicas ms comunes es la interconversin entre los azcares aldosas y cetosas
(Fig. 1-19).

REACCIONES DE OXIDACiN-REDUCCiN Las reacciones de oxi-

dacin-reduccin (tambin denominadas reacciones redox) se producen
cuando hay una transferencia de electrones desde un donador (denominado agen-
te reductor) a un aceptor (denominado agente oxidante). Cuando los agentes re-
ductores donan sus electrones, quedan oxidados. Al aceptar electrones, los agentes
oxidantes quedan reducidos. Los dos procesos se producen siempre de forma simul-
tnea.
No siempre es fcil determinar si las biomolculas han ganado o perdido electro-
nes. Sin embargo, pueden utilizarse dos reglas senci Ilas para averiguar si una mol-
cula ha sido oxidada o reducida:

1. Se produce una oxidacin cuando una molcula gana oxgeno o pierde hidr-
geno:

CH 3 C -OH
11
O
Alcohol etlico cido actico

2. Se produce una reduccin cuando una molcula pierde oxgeno o gana hidr-
geno:

CH 3 C -OH
11
O
cido actico Alcohol etlico

O FI [3 U RA 1 - 1 S
O
11 Reaccin de adicin
11 C-O-
H C-O- Cuando se aade agua a una molcula que
"/ C
+
-----II~~ HO -
1

C -H contiene un doble enlace, como el fumarato,

se produce un alcohol.
11 1

C H-C-H
/ ........ H
1

C C-O-
~\
O 0- 11
O
Fumarato Malato
20
F"I a u RA 1- 1 9
Reaccin de isomerizacin
Una clase de reaccin bioqumica que se
observa con frecuencia es la interconversin
reversible de los ismeros de aldosa y celosa.
CONCEPTOS CLAVE,.4
Las clases de reacciones ms comunes que
se encuentran en los procesos bioqumicos
son la sustitucin nuclefila, la elimina-
cin, la adicin, la isomerizacin y la
oxidacin-reduccin.
CAPTULO UNO Introduccin a la Bioquimica
H H
1 1
R-C-C-H R-C-C-H
1 11 11 1
O O O O
1 1
H H
Aldosa Celosa
En las reacciones biolgicas redox, los electrones se transfieren a acepto res elec-
trnicos como el nucletido NAD+/NADH (dinucletido de nicotinamida y adenina
en su forma oxidada/reducida).
Energa
Se define la energa como la capacidad paTa realizar trabajo, es decir, mover la
materia. A diferencia de las mguinas fablicadas por el hombre, que generan y utili-
zan la energa en condiciones duras con temperaturas, presiones y corrientes elctri-
cas elevadas, las mquinas moleculares relativamente frgiles de los seres vivos
deben utilizar mecanismos ms sutiles. Las clulas generan la mayoa de su energa
utilizando reacciones redox en las que se transfieren electrones desde una molcula
oxidable a una molcula con deficiencia de electrones. En estas reacciones, los elec-
trones con frecuencia se eliminan o aaden en forma de tomos de hidrgeno (Ho) o
iones hidruro (H-). Cuanto ms reducida est una molcula, es decir, cuantos ms
tomos de hidrgeno posee, ms energa contiene. Por ejemplo, los cidos grasos
contienen proporcionalmente ms tomos de hidrgeno que los azcares y por lo
tanto rinden con la oxidacin ms energa que las mo.Iculas de azcar. Cuando se
oxidan los cidos grasos y los azcares, sus tomos de hidrgeno se eliminan por las
coenzimas redox FAD (dinucletido de flavina y adenina) o NAD+, respectivamen-
te. (Las coenzimas son molculas pequeas que operan asociadas con las enzimas y
sirven como transportadoras de grupos moleculares pequeos o, en este caso, elec-
tTones.) Los productos reducidos de este proceso (FADH o NADH, respectivamen-
te) pueden luego transferir los electrones a otro aceptor electrnico.
Siempre gue se transfiere un electrn se pierde energa. Las clulas poseen meca-
nismos complejos para explotar este fenmeno, de forma que parte de la energa libe-
rada puede capturarse para el trabajo celular. La caractestica ms destacada de la
generacin de energa en la mayora de las clulas es la ruta de transpone electrnico,
una serie de molculas transportadoras de electrones ligadas y embebidas en la mem-
brana. Durante un proceso regulado, se libera la energa al transferirse los electrones
desde una molcula transportadora de electrones a otra. Durante varias de estas reaccio-
nes redox, la energa que se libera es suficiente para impulsar la sntesis de ATP, la
molcula transportadora de energa que suministra directamente la energa que se utiliza
para mantener la gran organizacin de las estructuras celulares y las funciones celulares.
A pesar de sus muchas semejanzas, los distintos seres vivos difieren en las estra-
tegias precisas que emplean para adquirir la energa de su entorno. Los auttrofos
son organismos que transforman la energa del sol (fotoauttrofos) o diversas sus-
tancias qumicas (quimioauttrofos) en energa de enlace qumico. Los hetertro-
fos obtienen energa degradando molculas de alimento ya formadas como nica
fuente de energa. Algunos procariotas y un pequeo nmero de plantas (p. ej., la
planta carnvora que digiere los insectos capturados) son fotohetertrofos, es decir,
utilizan como fuentes de energa tanto la luz como las biomolculas orgnicas.
La fuente ltima de la energa que utilizan la mayora de las fOlIDas de vida sobre
la TielTa es el Sol. Los organismos fotosintetizadores como los vegetales, determina-
dos procariotas y las algas, captan la energa luminosa y la utilizan para transformar el
dixido de carbono (C0 2) en azcares y otras biomoJculas. Entre los procariotas hay
especies quimitrofas que no obtienen energa del sol. Situadas en lugares exticos,
como los manantiales calientes o enterradas en los estratos rocosos, obtienen la ener-
 1.3. Procesos bioquimicos 2 1

ga requerida para incorporar el CO 2 a las biomolculas orgnicas oxidando sustancias

inorgnicas como el cido sulfhdrico (SH 2 ), el nitrito (NO;:) o el gas hidrgeno (H 2 ).
La biomasa producida en ambos tipos de procesos es, a su vez, consumida por orga-
nismos hetertrofos que la utilizan como fuente de energa y de materiales estructura-
les. En cada paso, al reagruparse los enlaces moleculares, parte de la energa se pierde
en forma de calor. Antes de que suceda esto, las clulas utilizan la energa capturada
para mantener sus estructuras y actividades complejas. Las rutas metablicas por las CONCEPTOS CLAVE 1.5
que los seres vivos generan y utilizan la energa se bosquejan brevemente en la sec- En Jos seres vivos la energa, la capacidad
cin sobre Metabolismo. Las descripciones de los mecanismos bsicos mediante los para mover la materia, normalmente se
cuales se mantiene el orden celular constituyen la seccin Orden Biolgico. genera mediante reacciones redox..

Metabolismo
El metabolismo, la suma de todas las reacciones catalizadas por enzimas de un ser
vivo, es una actividad coordinada y dinmica. Muchas de estas reacciones estn
organizadas en rutas. Cada ruta bioqumica est formada por varias reacciones que
se producen secuencialmente, es decir, el producto de una reaccin es el reactante de
la reaccin siguiente. Existen dos clases principales de rutas bioqumicas: anabli-
cas y catablicas. En las rutas anablicas o de biosntesis, se sintetizan grandes
molculas complejas a pm1ir de precursores ms pequeos. Los bloques de construc-
cin (aminocidos, azcares y cidos grasos) producidos o adquiridos del alimento
se incorporan en molculas grandes ms complejas. Dado que la biosntesis aumenta
el orden y la complejidad, las rutas anablicas requieren un aporte de energa. Entre
los ejemplos de procesos anablicos se encuentran la sntesis de poi isacridos y
protenas a partir de azcares y aminocidos, respectivamente. Durante las rutas
catablicas se degradan molculas grandes complejas a productos ms pequeos y
sencillos. Algunas rutas catablicas liberan energa. Una fraccin de esta energa se
captura y se utiliza para impu Isar las reacciones anablicas. CONCEPTOS CLAVE 1 . 6
En la Figura 1-20 se explica la relacin entre los procesos anablicos y catabli- El metabolismo es la suma de todas las
cos. Al degradarse las molculas nutrientes, la energa y el poder reductor se conser- reacciones en un ser vivo. La mayora de
van en las molculas de ATP y NADH, respectivamente. Los procesos de biosntesis las reacciones bioqumicas pueden clasificar-
utilizan metabolitos del catabolismo, ATP sintetizado y NADPH (dinucletido de se como anablicas (de biosntesis) o cata-
nicotinamida y adenina fosfato reducido, una fuente de poder reductor, es decir, blicas (de degradacin).
electrones de energa elevada), para crear estructuras y funciones complejas.

Orden biolgico
La unidad coherente que se observa en todos los seres vivos comporta la integracin
funcional de millones de molculas. En otras palabras, la vida es una complejidad muy
organizada. A pesar de la abundante diversidad de procesos vivos que contribuyen a
generar y mantener el orden biolgico, la mayola puede clasificarse en las siguientes
categoras: (1) sntesis de biomolcuJas, (2) transporte de iones y molculas a travs de
las membranas celulares, (3) produccin de fuerza y movimiento, y (4) eliminacin de
desechos metablicos y otras sustancias txicas. Cada una ser considerada brevemente.

Nutrientes FIGURA 1-20

Anabolismo y catabolismo
En los organismos que utilizan oxgeno
para generar energa, las rutas catabl icas
tr'ansforman los nutrientes en molculas
pequeas que son materiales de partida. La
energa (ATP) y el poder reductor (NADPH)
que impulsan las reacciones de biosntesis
se generan durante los procesos catablicos
Sustratos de biosntesis al convertirse determinadas molculas nu-
trientes en productos de desecho como
Mantenimiento
el dix.ido de cal'bono y el agua.
y crecimiento
22 CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

SNTESIS DE SIOMOLCULAS Los componentes celulares se sintetizan

en un enorme conjunto de reacciones qumicas. Muchas de estas reacciones estn
integradas en rutas reguladas cuidadosamente en numerosos pasos. Por ejemplo, el
nucletido monofosfafo de adenosina se sintetiza en una ruta de 12 pasos. Debe
sealarse que un gran nmero de reacciones de biosntesis requieren energa, que se
suministra de forma directa o indirecta por la fragmentacin simultnea de los enla-
ces fosfoanhdrido de las molculas de ATP.
Las molculas que se forman en las reacciones de biosntesis realizan varias fun-
ciones. Pueden ensamblarse en estructuras supramoleculares (p. ej., las protenas y los
lipidos que constituyen las membranas), utilizarse como molculas de informacin (p.
ej .. el DNA y el RNA), o catalizar reacciones qumicas (es decir, las enzimas).

TRANSPORTE A TRAVS DE LAS MEMBRANAS Las membranas

celulares regulan el paso de iones y molculas de un compartimiento a otro. Por
ejemplo, la membrana plasmtica (la membrana externa de la clula) es una barrera
selectiva. Es responsable del transporte de determinadas sustancias, como los nu-
trientes, desde un entorno relativamente desorganizado al interior celular, ms orde-
nado. De manera semejante se transportan los iones y las molculas dentro y fuera
de los orgnulos durante los procesos bioqumicos. Por ejemplo, los cidos grasos se
transportan dentro de un orgnulo denominado mitocondria de forma que puedan
degradarse para generar energa.
La mayor parte del trabajo del transporte en una clula se realiza por protenas
unidas a la membrana. Cuando se transportan las sustancias en contra de un gradien-
te (es decir, desde un lugar de concentracin baja a un lugar de concentracin eleva-
da) se requiere energa. Este proceso se denomina transporte activo. Por ejemplo,
la bomba Na+-K+, un complejo proteico de la membrana plasmtica, es responsable
del mantenimiento de un gradiente inico a travs de la membrana celular. Este
gradiente inico proporciona la energa necesaria para muchos procesos de transpor-
te activo y el potencial de reposo de membrana de las clulas excitables (clulas
nerviosas y musculares). La bomba Na+-K+ utiliza al menos un tercio de la energa
disponible para bombear Na+ fuera de la clula y K+ dentro de la clula. Por cada
molcula de ATP hidrolizada, se bombean tres iones Na+ fuera de la clula y se
bombean dos iones K+ al interior de la clula.

MOVIMIENTO CELULAR Una de las caractersticas ms obvias de los seres

vivos es el movimiento organizado. Las actividades complejas y coordinadas que se
requieren para mantener la vida necesitan el movimiento de los componentes celula-
res. Entre los ejemplos se encuentran la divisin celular y el movimiento de los
orgnulos. Ambos procesos dependen en gran medida de la estructura y funcin de
una red compleja de filamentos proteicos conocida como citoesqueleto.
Las formas de movimiento celular influyen profundamente sobre la capacidad
de todos los organismos para crecer, reproducirse y competir por unos recursos limi-
tados. Entre los ejemplos, considrese el movimiento de los protistas en su bsqueda
de alimento en una charca, o la migracin de los leucocitos humanos en su persecu-
cin de clulas extraas durante una infeccin. Otros ejemplos ms sutiles son el
movimiento de las enzimas especficas a lo largo de la molcula de DNA durante la
replicacin del cromosoma que precede a la divisin celular y la secrecin de insuli-
na por determinadas clulas pancreticas.

ELIMINACiN DE RESIDUOS Todas las clulas vivas producenproduc-

tos de desecho. Por ejemplo, las clulas animales convierten, en ltima instancia, las
molculas del alimento, como los azcares y los aminocidos, en CO 2 , H2 0 y NH J .
Estas molculas, si no se eliminan adecuadamente, pueden ser txicas . Algunas sus-
tancias se eliminan con facilidad. Por ejemplo, en los animales, el CO 2 difunde fuera
de las clulas y (tras una conversin breve y reversible a bicarbonato por los eritroci-
tos) es rpidamente exhalada a travs del sistema respiratorio. El exceso de H 2 0 se
excreta a travs de los riones. Sin embargo, otras molculas son txicas, por lo que se
han diseado mecanismos complejos para llevar a cabo su elim.inacin. El ciclo de la
 1.4. Visin general del procesaminto de la informacin gentica 23

urea (que se describe en el Captulo 15), que utilizan muchos animales para eliminar el
CONCEPTOS CLAVE 1 . 7
NH 3 , transforma esta sustancia muy daina en urea, una molcula menos txica.
Las clulas contienen tambin una gran variedad de molculas orgnicas com- Los procesos vivos tienen lugar en una
plejas que deben eliminarse. Las clulas vegetales resuelven este problema transpor- complejidad muy ordenada que se manene
por un aporte constante de energa.
tando estas molculas a una vacuola, donde se degradan o se almacenan. Sin embar-
go, los animales deben utilizar mecanismos de eliminacin que dependen de la
hidrosolubilidad (p. ej., la formacin de orina por el rin). Las sustancias hidrfo-
bas como las hormonas esteroideas, que no pueden degradarse a molculas ms
sencillas, se convierten durante una serie de reacciones en derivados hidrosolubles.
Este mecanismo tambin se utiliza para solubilizar algunas molculas orgnicas
como los frmacos y los contaminantes ambientales.

1.4. VISi N GE NE RA L DE L PR OC ESA M IE N TD

DE L A I N F O R MAC i N GENTICA

La codificacin y la replicacin de la informacin gentica son algunos de los temas

ms importantes de la bioqumica, y su estudio comporta muchos de los conceptos
presentados en este captulo: vida, biomoJculas, reacciones qumicas, energticas.
En esta seccin final del primer captulo presentamos una breve visin general de
los aspectos genticos de la bioqumica (que tambin se conocen como biologa
molecular). El material de esta visin general ayudar a situar en perspectiva el
material de los Captulos 2 a 16. El flujo de la informacin gentica es el tema de los
tres ltimos captulos del libro.
Los medios de reproducir la informacin gentica se resumen en el dogma
central de la biologa molecular (Fig. 1-21). De acuerdo con este principio, la infor-
macin codificada en las secuencias qumicas de los genes se utiliza para dirigir el
montaje de los aminocidos en los polipptidos. U na caracterstica esencial que
permite el flujo de informacin gentica es la capacidad de las bases de los nucleti-
dos para producir apareamientos especficos. Como se indica en el diagrama esque-
mtico de la Figura 1.22, existen dos fases en la transferencia de la informacin
gentica: transcripcin y traduccin. Durante la transcripcin, las enzimas denomi-
nadas RNA polimerasas, junto con otras protenas, copian o transcriben las instruc-
ciones coctificadas en los genes en las secuencias de bases de las molculas de RNA.
stas se sintetizan mediante la formacin de enlaces fosfodister entre ribonucleti-

FIGURA 1-21
El dogma central
En la mayor parte de las circunstancias la
informacin gentica fluye desde el DNA (a)
al RNA (b) y a la protena (c). El DNA
almacena la informacin que dirige su propia
sntesis y la de las molculas de RNA que
pa11icipan en la sntesis de protenas. Una
excepcin importante del dogma central
es la capacidad de un grupo pequeo de
virus, denominados retro virus, que sintetizan
DNA utilizando un RNA molde.

(e) Protena

(a) DNA (b) RNA

24 CAPTULO UNO Introduccin a la Bioqumica

FIGURA 1-22
Paso 1: Transcripcin
Visin general del nujo de la informacin
gentica Citoplasma
La informacin gentica en el DNA se RNA polimerasa
convierte en la secuencia lineal de amino- I
cidos de los polipptidos en un proceso en
dos fases. Durante la transcripcin, se I
sintetizan las molculas de RNA a partir
de una cadena de DNA mediante aparea-
miento complementario de bases en el DNA
y en las molculas de ribonucletidos
tri fosfato libres. Durante la segunda fase,
que se denomina traduccin, las molculas
de RNA se unen a los ribosomas que estn
formados por rRNA y protenas ribos- I
I
micas. Los complejos RNA de transferencia Doble hlice de DNA
aminoacilo sitan su carga de aminocido
en el lugar cataltico dentro del ribosoma RNA mensajero
en un proceso con apareamiento de bases en formacin
complementarias entre los codones del
rnRNA y los anticodones de los tRNA. Una
vez que se ha situado correctamente el Paso 2: Traduccin
aminocido dentro del lugar cataltico, se
RNA de transferencia
forma un enlace peptdico. Tras moverse la con un aminocido
molcula de rnRNA con relacin al riboso- Citoplasma
ma, entra un codn nuevo en el lugar
cataltico del ribosoma y se aparean las Cadena
polipepldica
bases con el anticodn adecuado en otro
complejo aminoacil-tRNA. Tras la entrada
de un codn de parada del mRNA en el
lugar cataltico, el polipptido recin sinte-
tizado se libera del ribosoma.

J Anticodn

RNA mensajero

Codones

dos adyacentes con apareamiento de bases. La incorporacin de los ribonucletidos

en el RNA puede resumirse de la forma siguiente:
Ribonuc!etido trifosfato + RNA" ---7 RNA" + I + pp
en donde RNA,,+ I es el RNA que ha crecido de una unidad de ribonuc!etido a partir
del RNA", y PP; es pirofosfato (HP20~-). Esta reaccin est catalizada por la enzima
RNA polimerasa. La energa que impulsa esta reaccin se genera en la rotura de los
enlaces fosfoanrudrido de los nuc!etidos y la consecuente hidrlisis del pirofosfato.
Con pocas excepciones, el nico fin de las molculas de RNA es la sntesis de protenas.
Durante la traduccin, el RNA mensajero (mRNA) se une a los ribosomas,
donde su cdigo de bases de nuc!etidos se descodifica en la secuencia de aminoci-
dos de los polipptidos. Los ribosomas, que se encuentran libres en el citoplasma o
en el retculo endoplsmico rugoso (un orgnulo del interior de las clulas), estn
formados por RNA ribosmico (rRt'J'A) y varias protenas.
MTODOS BIOQuMICOS 1.1. Introduccin

Vivimos tiempos apasionantes para los bioqumicos! El conocimiento
del que se dispone en la actualidad con relacin al funcionamiento in-
terno de los seres vivos est proporcionando a los cientficos oportuni-
dades sin precedente para resolver los problemas que durante mucho
tiempo han atl igido al ser humano. Nuestro mayor conoc imiento sobre
los procesos vivos se basa en lo~ conceptos modernos que han sido
posibles por los esfuerzos investigadores de los bioqumicos a lo largo
del siglo veinte. Esta empresa notablemente eticaz es en gran medida el
resultado de las brechas intelectual y tecnolgica que descansan sobre
una premisa tilosfica denominada reducciollismo. De acuerdo con los
reduccionistas, un fenmeno complejo, como la vida, puede, en ltima
instancia. entenderse analizando sus componentes ms simples. Ponien-
do a punto y utilizando tcnicas que explotan las propiedades fsicas y
qumicas de las biomolculas componentes, lo~ bioqumicos han dado
una visin coherente de los principios organizativos de los procesos
vitales. Entre los ejemplos de las propiedades de las biomolculas que
han demostrado ser tiles estn el tamao. la carga elctrica neta, la
solubilidad. la capacidad para moverse en un campo elctrico y la capa-
cidad de absorber o retlejar la radiacin electromagntica.
Al avanzar la investigacin en las ciencias biolgicas. se ha hecho
cada vez ms evidente que la bioqumica es una ciencia multidiscipli-
naria. Por ejemplo. muchas de las tcnicas que utilizan los bioqumi-
cos. como la difraccin de rayos X, la microscopa electrnica y el
marcaje con istopos radiactivos. empleadas en la investigacin de la
estructura de las macromolculas, la estructura celular y las rutas me-
tablicas. respectivamente. fueron puestas a punto por fsicos. Ade-
ms. el conocimiento alcanzado en otras discip linas afines, como la
biologa celular y la gentica, se ha entrelazado tanto con la bioqumi-
ca que gradualmente se han erosionado las barreras intelectuales den-
tro de las propias ciencias biolgicas. La explosin reciente de la in-
formacin biolgica creada por las tcnicas de DNA recombinante,
puestas a punto por los bilogos moleculares. tambin han generado
problemas nuevos no previstos. La Biologa molecular. la ciencia que
utiliza las tcnicas bioqumicas para investigar los aspectos moleculares
de la gentica, ha proporcionado cantidades masivas de informacin
sobre las eSllucturas de los genes y las protenas. El reto con el que se
enfrentan en la actualidad los cientficos es disear los medios para
utilizar esta informacin e identificar y definir problemas resolubles
con los qlle se enfrenta el ser humano. como mejorar la nUlricin de una
poblacin. siempre en aumento, y desarrollar tratamientos 1mb eficaces
frente a las enfermedades. Pam ayudarlos en este trabajo, muchos cien-
tficos estn utilizando actualmente los servicios de otros cientficos
especializados en ordenadores y matemticos. Como respuesta tambin
a estos temas, muchas universidades y agencias federales han formado
equipos multidisciplinarios de cientmcos. En este planteamiento relati-
vamente nuevo, los grupos de investigacin que abordan problemas
previamente intratables cuentan con especialistas tan diversos como
bioqumicos, biofsicos y otros cientficos. junto con ingenieros yespe-
cialistas en ordenadores. El objetivo de estos esfuerzos es analizar las
enormes cantidades de informacin de la estructura de genes y prote-
nas para profundizar en nuestro conocimiento sobre los seres vivos.
Los principios bsicos de la investigacin bioqumica son una par-
te importante de la educacin bioqumica, ya que proporcionan un
conocimiento ms profundo de la generacin del conocimiento cient-
fico. A lo largo de este libro se da una introduccin a las caractersti-
cas bsicas de las tcnicas bioqumicas ms va liosas en los recuadros
denominados Mtodos Bioql/micos. Algunas de estas tcnicas poseen
un inters histrico importante, mientras que otras se encuentran entre
los mtodos ms actuales utilizados por los cientficos. El enfoque de
cada presentacin se centra en la forma de adquirir los conocimientos
tiles en los procesos vivos explotando las propiedades fsicas y qu-
micas de las biomolculas.

La traduccin comienza al unirse cada ribosoma a una molcula de mRNA y

pasar a convertir su secuencia de bases en un polmero de aminocidos ligados por
enlaces peptdicos. Cada aminocido est especificado por una palabra codificada,
denominada codn, que consta de tres bases secuenciales. La transferencia real de
informacin se produce cuando el codn del mRNA interacciona y forma aparea-
mientos de bases complementarias con una secuencia de tres bases en una molcula
de RNA de transferencia (tRNA) denominada anticodn.
Cuando se produce un apareamiento de bases codn-anticodn, el aminocido
unido al tRNA se coloca correctamente dentro del ribosoma para la formacin del
enlace peptdico. Al formarse cada enlace peptfdico, se libera de su tRNA el ami-
nocido recin incorporado y el mRNA se mueve con relacin al ribosoma de forma
que en el lugar cataltico entra un nuevo codn. El ltimo proceso se denomina
translocacin. La traduccin contina de codn en codn hasta que se alcanza una
secuencia de bases especial denominada codn de terminacin o de parada. Enton-
ces se libera el polipptido del ribosoma y se plega en su conformacin biolgica-
mente activa. Dependiendo del tipo de polipptido, puede entonces unirse a otros
polipptidos plegados para formar complejos ms grandes. CONCEPTOS e VE 1.B
Expresin gnica es un trmino que se utiliza para describir los mecanismos por
La informacin gentica codificada en la
medio de los cuales los seres vivos regulan el flujo de informacin gentica. Los
estructura de los cidos nucJeicos se util iza
genes se activan o desactivan de forma que las clulas pueden conservar recursos y
para dirigir el montaje de los aminocidos
responder adecuadamente a las variaciones ambientales o del desarrollo. Por ejem- en los polipptidos. En un proceso de-
plo, muchas bacterias producen slo las enzimas que degradan un nmero escaso de nominado expresin gnica, los genes se
molculas cuando se dispone realmente del nutriente. En los organismos multicelu- activan o desactivan de forma que las clulas
lares, los patrones complejos programados de la expresin gnica son responsables pueden conservar los recursos y responder
de las diversas caractersticas de las clulas diferenciadas. a los cambios ambientales y del desarrollo.
26 CAPTULO UNO
RESUMEN
l. La Bioqumica se puede definir como el estudio de las bases mo-
leculares de la vida. Los bioqumicos han contribuido a los si-
guientes conocimientos sobre la vida: (l) la vida es compleja y
dinmica, (2) la vida est organizada y automantenida, (3) la vida
es celular, (4) la vida se basa en la informacin, y (5) la vida se
adapta y evoluciona.
2. Las pruebas moleculares con respecto a las relaciones evolutivas
de las especies vivas son lo suficientemente convincentes, por lo
que muchos cientficos clasifican en la actualidad a los seres vi-
vos en tres dominios: bacterias, arqueas y eucariotas.
3. Todo lo vivo est formado por clulas procariotas o clulas euca-
riotas. Las procariotas, que comprenden las bacterias y las ar-
queas, carecen de un orgnulo rodeado por una membrana deno-
minado ncleo. Las eucariotas comprenden todas las especies
restantes. Estas clulas contienen un ncleo y estructuras comple-
jas que no se observan en las procariotas.
4. Muchos organismos eucariotas son multicelulares. Los organis-
mos multicelulares poseen varias ventajas sobre los unicelulares.
Entre ellas se encuentran (1) la provisin de un ambiente relativa-
mente estable para la mayora de las clulas del organismo, (2) la
capacidad de mayor complejidad en la forma del organismo y su
funcin, y (3) la capacidad para explotar los recursos ambientales
ms eficazmente de lo que pueden hacerlo los organismos unice-
lulares individuales.
5. Las clulas animales y vegetales contienen miles de molculas.
El agua constituye entre el 50 y el 90 % del contenido en peso de
una clula, y los iones como el Na+, K+ y Ca 2+ pueden representar
otro 1 %. Casi todas las otras clases de biomolculas son orgni-
cas. Las propiedades del elemento carbono son responsables de la
enorme variedad de molculas orgnicas. Las propiedades quimi-
cas de las molculas orgnicas estn determinadas por las dispo-
siciones especficas de tomos, que se denominan grupos funcio-
nales. Se producen diferentes familias de molculas orgnicas
cuando los tomos de hidrgeno en las molculas hidrocarbona-
das se sustituyen por grupos funcionales. La mayora de las bio-
molculas contiene ms de un grupo funcional.
6. Muchas de las biomolculas que se encuentran en las clulas son re-
lativamente pequeas, con pesos moleculares inferiores a 1000 D.
LECTURAS RECOMENDADAS
Goodsell, D.S., The Machinery oi Lije, Springer-Verlag, New York,
1993.
Lewis, R., Lije, 3." ed., WCBlMcGraw-Hill, Dubuque, Iowa, 1998.
Mader, S., Biology, 6." ed., WCBlMcGraw-Hill, Dubuque, Iowa,
1998.
PALABRAS CLAVE
cido graso, 13 azcar, 12
cido nucleico, 14 bacterias, 5
agente oxidante, 19 biomolcula,2
agente reductor, 19 biorreparacin, 6
aminocido, 11 clula eucariota, 4
anticodn, 25 clula procariota, 4
arqueas, 5 codn, 25
auttrofo, 20 electrfilo, 17
Introduccin a la Bioqumica
Las clulas contienen cuatro familias de molculas pequeas:
aminocidos, azcares, cidos grasos y nucletidos. Los miem-
bros de cada grupo desempean varias fW1ciones: (l) se utilizan
en la sntesis de molculas ms grandes, (2) algunas molculas
pequeas poseen funciones biolgicas especiales, y (3) muchas
molculas pequeas son componentes de rutas complejas de reac-
ciones.
7. Todos los procesos vitales constan de reacciones qumicas catali-
zadas por enzimas. Las reacciones de una clula, que en su con-
junto se conocen como metabolismo, dan lugar a una actividad
muy coordinada y finalista. Entre las clases de reacciones ms
habituales en los procesos bioqumicos estn: (l) sustitucin nu-
clefila, (2) eliminacin, (3) adicin, (4) isomerizacin, y (5) oxi-
dacin-reduccin.
8. Las clulas son en s mismas inestables. Slo un flujo constante
de energa impide que se desorganicen. Uno de los medios por los
cuales las clu las obtienen energa es la oxidacin de las biomol-
culas o de determinados minerales.
9. El metabolismo es la suma de todas las reacciones catalizadas por
enzimas de un ser vivo. Muchas de estas reacciones estn organi-
zadas en rutas. Existen dos tipos principales de rutas bioqumicas:
anablicas y catablicas.
10. La estructura compleja de las clulas requiere un grado elevado
de orden interno, que se consigue mediante cuatro medios prima-
rios: (1) sntesis de biomolculas, (2) transporte de iones y mol-
culas a travs de las membranas, (3) produccin de movimiento,
y (4) eliminacin de los productos de desecho metablicos y otras
sustancias txicas.
11. En el flujo de informacin gentica la forma y las propiedades
qumicas de las bases en los residuos de nucletidos del DNA
dirigen el montaje de los polipptidos a partir de los aminocidos.
Existen dos fase de la expresin gnica: transcripcin y traduc-
cin. En la transcripcin, las RNA polimerasas utilizan la capaci-
dad de las bases de los nucletidos para formar apareamientos y
copiar la secuencia de bases de los genes para sintetizar molcu-
las de RNA. Durante la traduccin, los ribosomas utilizan la in-
formacin de la secuencia de bases del rnRNA para construir los
polipptidos.
Raven, P.H. and Johnson, G.B., Biology, 5.' ed., McGraw-Hill, Dubu-
que, Iowa, 1999.
Tudge, c., The Variety oi Lije: A Survey and a Celebra/ion oi ALL /he
Creatures /ha/ Have Ever Lived, Oxford University Press, New
York, 2000.
eliminacin, 18 fotoauttrofo, 20
energa, 20 fotohetertrofo, 20
enlace peptdico, 11 gen, 3
enzima, 2 grupo de salida, 17
eucariota, 5 grupo funcional, 9
expresin gnica, 25 hetertrofo, 20
extremfilo, 6 hidratacin, 19
extremozima, 6 hidrocarburo, 9
 Preguntas de revisin 27

hidrfilo, 11 mutacin, 4 polipptido, 11 ruta anablica, 21

hidrfobo, 9 neurotransmisor, 11 polisacrido, 12 ruta catablica, 21
hidrlisis, 17 nuclefilo, 17 protena, 11 saturado, 13
homeostasis, 2 nucletido, 14 purioa, 15 sustitucin nuclefila, 17
insaturado, 13 orgoulo, 7 quimioauttrofo, 20 traduccin, 24
isomerizacin, 19 oxidacin-reduccin (redox), 19 quimiohetertrofo, 20 transcripcin, 23
lpido, 13 oxidar, 19 reaccin de adicin, 19 transduccin, 8
macromolcula, 2 pptido, 11 reducciooismo, 25 translocacin, 25
metabolismo, 2 pirimidina, 15 reducir, 19 transporte activo, 22
monosacrido, 12

PREE3UNTAB DE REVISiN
l. Describa los conocimientos que la investigacin bioqumica ha d. transporte activo
proporcionado sobre la vida y los procesos vivos. e. grupo de salida
2. Existen tres dominios en los seres vivos. Cules son~ Qu f.eliminacin
caractersticas singulares poseen los organismos de cada domi- g. isomerizacin
nio~ h. sustitucin nuclefila
1. agente reductor
3. Describa las principales difereocias entre las clulas procariotas y
las eucariotas. J. agente oxidante
4. Identifique los grupos funcionales de las molculas siguien- 7. D dos funciones para cada una de las molculas siguientes:
tes: a. cidos grasos
b. azcares
o O c. nucletidos
11 11
HO-C-CH 2CH 2CH-C-OH 8. Cules son las funciones del DNA y del RNA ~
9. Cmo obtienen las clulas energa de los enlaces qumicos?
1

NH 2 10. Cmo eliminan las plantas los productos de desecho?

a. b. 11. Cul es la diferencia entre un hidrocarburo insaturado y uno sa-
turado~

12. Qu ventajas tienen los organismos multicelulares sobre los or-

ganismos unicelulares?
13. Asigne cada uno de los compuestos siguientes a una de las clases
principales de biomolculas:
c. d.

e. f.
a.

g. h.

S. Nombre las cuatro clases de biomolculas pequeas. En qu bio- b.

molculas ms grandes se encuentran~

6. Defina los trminos siguientes: O

a. bioqumica 11
CH 3 - (CH 2 )g - CH 2 - C - OH
b. oxidacin
c. reduccin c.
28 CAPTU LO U N O Introduccin a la Bioqumica

17. D un ejemplo de cada uno de los procesos de reaccin sigu ien tes:
a. sustitucin nuclefila
b. eliminacin
c. oxidacin-reduccin
d . adicin
18. D una lista de varios iones importantes que se encuentran en los
o seres vivos.
11
-O-P-O-CH O 19. Cules son las principales clases de reacciones qumicas que se
1 2 producen en los seres vivos?
-O 20. Describa varias funciones de los polipptidos.
21. Los hidratos de carbono se consideran como fuentes de energa
metablica. Cules son otras dos funciones fundamentales que
OH OH desempean los hidratos de carbono en los seres vivos?
d.
22. Cules son las biomolculas ms grandes? Qu funciones de-
14 . Defina los trminos siguientes: sempean en los seres vivos?
a. metabolismo 23. Los nucletidos desempean varias funciones adems de ser los
b. nuclefilo componentes del DNA y del RNA. D un ejemplo.
c. reduccionismo 24. Cmo se mantiene el orden dentro de las clulas vivas?
d. electrfilo
25. Nombre varios productos de desecho que producen las clulas
e. energa
animales.
15. Qu son los orgnulos? En general qu ventajas les proporcio- 26. Qu son las propiedades emergentes? D varios ejemplos.
nan a los eucariotas?
27. Compare las funciones del mRNA, rRNA y tRNA en la sntesis
16. Cules son las funciones primarias del metabolismo? de protenas.

PREGUNTAS DE RAZONAR
l. Se ha considerado a las reacciones bioqumicas como versiones 7. Las bases de dos cadenas complementarias de DNA se aparean
exticas de las reacciones orgnicas. Puede sugerir algunos pro- una con la otra debido a los enlaces de hidrgeno; es decir,
blemas con esta suposicin?
2 Con frecuencia se supone que los procesos bioqumicos en los N~H
procariotas y los eucariotas son bsicamente semejantes. Es una o . . H - N 0 ;~
n
CH H
suposicin adecuada?
3. La mayor paI1e de lo que se conoce sobre los procesos bioqumi-
H{ l-H'" J N"
cos es el resultado directo de la investigacin con organismos
procariotas. Sin embargo, la mayora de los organismos son euca-
/
N--{ O
'yN
H
riotas. Puede sugerir algunas razones por las que se han realiza-
do tantos esfuerzos utilizando procariotas? Por qu no se utilizan Par de bases timina-adenina
directamente los eucariotas?
4. Los enlaces sencillos carbono-nitrgeno so n de rotacin libre; sin Se ha aislado un nuevo nucletido que contiene la purina siguiente:
embargo, los enlaces amida carbono-nitrgeno son mucho ms
rgidos. Por qu? Qu efecto tiene esta propiedad de los enla-
ces amida sobre las formas que pueden asumir las protenas?
5. Por qu son los cidos grasos la principal reserva a largo plazo
del organismo?
6. Cuando se disuelve en agua una sus tancia como el cloruro sdi-
co, los iones que forma quedan totalmente rodeados por molcu-
las de agua que forman estructuras denominadas esferas de hi-
dratacin. Cuando se mezcla la sal sdica de un cido graso con 2-am ino-6-metoxipurina
agua, el grupo carboxilato de la molcula se hidrata pero la por-
cin hidrocarbonada hidrfoba de la molcula est poco hidrata- C ul de las purinas o pirimidinas normales (adenina, guanina,
da, si es que lo est algo. Las cadenas hidrocarbonadas de nume- citosina o ti mina) esperara que se apareara con ella?
rosos cidos grasos tienden a agruparse juntas en estructuras 8. En la mayora de los seres humanos sanos, una alimentacin con
esfricas denominadas micelas o, s i se encuentran presentes abundante colesterol da lugar a la inhibicin de la sntesis de co-
cantidades grandes, en lminas bicapa. Utilizando un crculo lesterol en las clulas del organismo. Qu propiedad de los seres
para representar al grupo carboxilato y una Ifnea ondulada unida vivos explica este fenmeno?
para representar la cadena hidrocarbon ada de un c ido graso, 9. Describa los posibles beneficios de la produccin de biomolcu-
dibuje una micela y una bicapa. las como la insulina mediante biotecnologa.