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Disposicin subcelular de principales protenas vegetales

y transformacin transitoria de plantas de tabaco mediante


Agrobacterium tumefaciens
Diego Valderrama. Curso de Fisiologa vegetal. Departamento de Biologa. Facultad de Ciencias.
Universidad de Chile.

Resumen: Las plantas poseen protenas importantes para la realizacin de la fotosntesis, como
tambin para la sntesis de azcares. Estas protenas se encuentran distribuidas en diversos
compartimentos subcelulares tales como cloroplastos y mitocondrias y la localizacin de estas
protenas se ha podido vislumbrar a travs de experimentos de fraccionamiento de estos
compartimentos subcelulares y su consecuente anlisis de las protenas presentes en dichos
compartimentos. En este prctico se realiz fraccionamiento subcelular de cloroplastos para la
determinacin de la localizacin de las protenas clorofila I y clorofila II (encargadas de cosechar la luz
incidente) y de las subunidades y de Coupling Factor 1 (CF 1) que forman parte del complejo
encargado de la sntesis de ATP. Por otro lado, mediante la transformacin transitoria de plantas de
tabaco con Agrobacterium tumefaciens fue posible insertar material gentico al ncleo celular de
clulas vegetales que contena las protenas a estudiar fusionadas a protenas fluorescentes tales como
GFP, YFP y RFP que pudieron ser vistas bajo microscopio de fluorescencia identificando la localizacin
subcelular de estas protenas. Por tanto, el uso de estas dos metodologas ya sea de forma separadas
o complementndose sirven para la determinacin correcta de la localizacin subcelular de protenas
de inters.

Introduccin: La principal diferencia entre necesit localizar y analizar las protenas


clulas vegetales y clulas animales, es la esenciales para su funcionamiento. Para este
presencia de un organelo capaz de utilizar la fin es que se desarroll el mtodo de
energa lumnica proveniente del sol y fraccionamiento subcelular de cloroplastos, que
transformarla en energa qumica, la cual es permite extraer protenas desde una
almacenada en NADPH y ATP, quienes, a suspensin cruda de cloroplastos, adems de
travs de la fijacin de CO2, son necesarios saber si esas protenas provienen desde el
para la sntesis de hidratos de carbono estroma o desde las vesculas tilacoidales
elementales para el desarrollo de las plantas. (Tobin, 1996).
De hecho, aproximadamente el 40% del peso
Otro mtodo usado es la fusin de protenas de
seco de una planta proviene del carbono fijado
inters con protenas fluorescentes (Spokes &
en la fotosntesis (Lambers & Cols.,1998).
Cols.,2006) tales como GFP (Green
Como se mencion anteriormente, la Fluorescent Protein), YFP (Yellow Fluorescent
fotosntesis es llevada a cabo dentro de los Protein) y RFP (Red Fluorescent Protein) con lo
cloroplastos, encontrndose estos en las hojas cual se logra determinar mediante microscopa
de las plantas. El cloroplasto posee una doble de fluorescencia la localizacin de estas
membrana plasmtica que lo delimita y en su protenas de fusin. El cDNA de la protena
interior se encuentran las vesculas tilacoidales, junto con el cDNA de la protena fluorescente se
las cuales se apilan en granas y es all donde encuentran insertos dentro del plasmidio Ti
ocurre la actividad fotosinttica. Comprender modificado (vector binario) de Agrobacterium
como se realiza esta actividad ha sido de gran tumefaciens, bacteria con la cual se transform
inters para la ciencia y es por ello que se (Horsch & Cols. 1985) de forma transitoria hojas
de tabaco, en donde el lugar de infeccin no se 2,8 mg de clorofila/mL y que para realizar los
regenera y las clulas infectadas no pueden siguientes experimentos se debi ajustar la
heredar los transgenes insertados de modo concentracin de 0,5 mL de la suspensin cruda
que, estos transgenes sern expresados solo obtenida a 0,5 mg/mL por lo cual fue necesario
por un tiempo determinado (Bhaskar &Cols., agregar 4,6 mL de buffer de sacarosa a la
2009). muestra.

Por ltimo, los objetivos de este prctico fueron: Una vez obtenida la nueva concentracin se
obtener una suspensin cruda de cloroplastos procedi a determinar la distribucin de la
para realizar el fraccionamiento subcelular Protena Clorofila I (PCI), Protena Clorofila II
permitindonos localizar la ubicacin de las (PCII) y de las subunidades y de Coupling
protenas de inters; lograr transformacin Factor 1 (CF1). Para eso se debi seguir el
transitoria de hojas de tabaco mediante protocolo, detallado en Materiales y mtodos,
agrobacterium tumefaciens para determinar con lo cual se obtuvieron 4 muestras (NS, NP,
mediante microscopa de fluorescencia la TS y TP) las cuales fueron cargadas en un gel
localizacin de las protenas de fusin en condiciones denaturantes obtenindose lo
insertadas. mostrado en Figura 1. En la Figura 1A (gel sin
teir) las bandas de color verde indican la
Resultados
presencia pigmentos de distintos pesos
Fraccionamiento subcelular de cloroplastos moleculares, aunque al no haber bandas en el
carril 1 (leader) se dificulta conocer sus pesos
Tras la preparacin de la suspensin cruda de moleculares. Al teir el gel (Figura 1B) es
cloroplastos, se procedi a la estimacin de posible apreciar el Leader y por tanto conocer el

Figura 1. Gel de poliacrilamida en condiciones denaturantes sin teir (A) y con tincin de Coomassie (B). 1:Leader; 2-5:
Muestras NS, NP, TS, TP del Grupo de trabajo; 7-10: Muestras Grupo de Exequiel; 11: Control de Grupo de Mara
Jess G.; 12: Control de Grupo de Camila A.; 13: Control de Grupo de Valeria D.; 14: Control de Grupo de Pablo; 15:
Control de Grupo de trabajo.

clorofila, es decir, conocer la cantidad de peso aproximado de las protenas en cuestin,


clorofila existente en la muestra usando acetona pues en el carril 4 se aprecian tres bandas con
para desunir la clorofila de la protena. La pesos moleculares aproximados de 120 kDa, 60
estimacin se midi mediante absorbancia a kDa y 40 kDa. En el carril 5 no se aprecia banda
652 nm. El valor obtenido fue de 0,965 con el alguna, mientras que en carril 3 solo se aprecia
cual se pudo obtener la concentracin de una banda de 60 kDA, caso similar al carril 2, el
clorofila en la muestra mediante la ecuacin de cual posee una sola banda de 40 kDa. El carril
la Ley Lambert-Beer, concentracin que fue de 15 que contena al control, posea las 3 bandas
con los pesos moleculares anteriormente para alguna de las protenas fluorescentes a
mencionados. usar: GFP, YFP y RFP. Para infiltrar las hojas
de tabaco, se realiz una pequea herida en el
Uso de protenas fluorescentes
envs de la hoja con una jeringa, la misma que
La suspensin de agrobacterium para infiltrar contena la suspensin de agrobacterium a
requera de 10 mL de un cultivo muestra infiltrar. Se infiltr cada panel de una hoja por

Figura 2: Imgenes de microscopia de fluorescencia de muestras epidermal peel de hojas de tabaco infiltradas con
suspensin de agrobacterium con vector binario de protenas de fusin fluorescentes. A-D: Muestra Control (suspensin
de agrobacterium sin transformar); E-H: Muestra A; I-L: Muestra B; M-O: Muestra C; P-S: Muestra D. Imgenes A, E, I,
M y P corresponden a imagen de microscopia de campo; imgenes B, F, J, N y Q corresponden a imagen de microscopa
de fluorescencia superponiendo los filtros verde y azul; imgenes C, G, K, y R corresponden a imagen de microscopa
de fluorescencia usando filtro verde; imgenes D, H, L, O y S corresponden a imagen de microscopa de fluorescencia
usando filtro azul.

problema (Muestra A) que contena a separado con la muestra problema y en una


agrobacterium con el vector binario que codifica
hoja distinta se infiltr solo con agua como importantes de la fotosntesis y la sntesis de
control negativo. ATP mediante el fraccionamiento subcelular de
cloroplastos y la microscopa de fluorescencia
Transcurridos 3 das desde la infiltracin se
para protenas de fusin fluorescentes.
procedi a preparar las hojas infiltradas para ser
expuestas en microscopio fluorescente Distribucin de protenas en la membrana
permitiendo localizar subcelularmente las tilacoide: mediante el mtodo de
protenas de fusin, lo que se ve en la Figura 2 fraccionamiento subcelular de cloroplastos se
que muestra la fluorescencia de la muestra consigui localizar las protenas de inters:
problema trabajada (A) ms las dems Clorofila I, Clorofila II y subunidades y de
muestras trabajadas por los otros grupos de Coupling Factor 1. Estas protenas tienen un
trabajo. peso molecular aproximado de 110 kDa, 32
kDa, 55 kDa y 53 kDa respectivamente (Smith,
La imagen 2G muestra la localizacin de las
1977; Howe & Cols., 1985).
protenas de fusin de la muestra A en
pequeos cuerpos circulares a lo largo de todas Con el uso del detergente Tritn X-100 en una
las clulas perteneciendo al aparato de Golgi; de las soluciones anlisis, se logr desnaturar
imgenes 2J y 2K corresponden a la muestra B la membrana tilaciodal, solubilizando protenas
y corresponden a protenas que se localizan en que se encontrasen en esta membrana, de
cloroplastos; imagen 2O muestra protenas de modo que, en esta solucin, las protenas se
la muestra C que se ubican en el ncleo de cada encontraran en el sobrenadante. La otra
clulas; por ltimo, la imagen 2R de la muestra solucin anlisis contena NaBr, sal que genera
D presenta la localizacin de las protenas en el efecto salting out, es decir, a altas
pequeos cuerpos redondos que se encuentran concentraciones de NaBr, esta sal competir
en gran cantidad en cada clula por lo que se con las protenas por el solvente, disminuyendo
podra tratar de cloroplastos. Estos pequeos la solubilidad de las protenas hacindolas
cuerpos aparecen en gran parte de las precipitar (Desnoyers & Ichhapor, 1969)
imgenes de microscopa fluorescente que usa encontrndose en el precipitado de la solucin.
filtro verde (2C, 2G, 2K, 2 y 2R) lo que es
En la Figura 1 se aprecia que en el gel sin
debido a que con este filtro se produce la
tincin no hubo bandas de pigmentos cuando
autoflorescencia de los cloroplastos (Dalton &
debi ocurrir lo contrario, tal como se puede
Cols., 2011).
apreciar en las muestras del grupo de Exequiel.
Discusin En cuanto al gel con tincin, este si present
bandas, las cuales tenan un tamao
Las plantas poseen complejas rutas
aproximado de 120 kDa, 60 kDa y 40 kDa. En
metablicas, en donde pasos de una ruta
los carriles 3 y 4 (NP y TS) se encuentra la
metablica pueden ocurrir en distintos
misma banda de 60 kDa, lo que indicara que
organelos, lo que destaca la gran
las subunidades y se encuentran tanto en
compartimentalizacin que poseen las clulas
las membranas tilacoidales como en el estroma
vegetales (Heining, 2013) como tambin el alto
y que segn literatura (www.atpsynthase.info)
trfico de molculas a nivel subcelular. Es por
estas subunidades se encuentran en el
eso que fue necesario desarrollar metodologas
estroma, pero interaccionan con las
que permitiesen localizar aquellas molculas de
subunidades que se ubican intrnsecamente en
inters para estudiar cierta ruta o proceso
la membrana tilacoidal. La banda de 40 kDa se
subcelular. En el caso particular de este
encuentra tanto en el carril 2 como en el carril 4
prctico, se aplicaron mtodos que permiten
(NS y TS respectivamente) y que debiese
localizar a algunas de las protenas ms
corresponder a CPII; la banda de 120 kDa se
encuetra en el carril 4 y se tratara de CPI. Con que el uso complementario de estas dos
ambos resultados se puede concluir que tanto metodologas sera mucho ms eficiente en la
CPI como CPII estn intrnsecamente unidas a localizacin subcelular de protenas.
la membrana tilacoidal.
Materiales y mtodos
Visualizacin de las protenas fusionadas:
1. Fraccionamiento subcelular de cloroplastos:
observando la Figura 2 y segn lo observado en tener en cuenta de que la clorofila es bastante
el da en que se us microscopia de susceptible a la degradacin, de modo que se debe
fluorescencia se pudo concluir que se realiz proceder en todo momento en condiciones de fro y
una agroinfiltracin con xito que permiti oscuridad.
posteriormente localizar distintas protenas
1.1 Extraccin de cloroplastos: se colectaron 7 g
fusionadas en diferentes organlos presentes en
de tejido de hojas de espinaca, los cuales se
las clulas vegetales. Es as, por ejemplo, que pusieron en mortero (ubicado en recipiente con hielo
en la Figura 2K se aprecia claramente como las y cubierto de papel aluminio) junto con 15 mL de
protenas fusionadas se localizan en los buffer de sacarosa (0,38M sacarosa, 0,07M
cloroplastos de las clulas vegetales. Para la K2HPO4, 0,01M KCl, pH 7,5). Luego de ser bien
visualizacin de las muestras se usaron los homogenizado, se filtr mediante gasa en vaso
filtros verde y azul lo que permite que excitar a precipitado de 100 mL, para posteriormente dividir
las protenas fluorescentes roja y verde suspensin equitativamente en dos tubos Falcon de
15 mL y centrifugar a 3000 rpm por 5 minutos para
respectivamente, hacindolas emitir
la sedimentacin de cloroplastos. Se desech
fluorescencia a un menor nivel de energa,
sobrenadante para luego agregar 200L de buffer a
emitiendo a la longitud de onda del rojo para
cada tubo y proceder a resuspender el pellet
RFP y a la longitud de onda del verde para GFP mediante agitacin y con mucha precaucin (no se
(Cardemil, 2017). Este fenmeno explicara la debe usar micropipeta para esta accin). Ya
autoflorescencia de los cloroplastos en filtros resuspendidos, se procedi a juntar contenido de
verdes, pues al ser excitados con luz verde y ambos tubos en un solo tubo y completar hasta un
emitirn luz roja. volumen de 1 mL con bffer de sacarosa dejando la
suspensin en oscuridad. Esa fue la preparacin
Como se pudo apreciar, los mtodos usados en original de cloroplastos para los ensayos
este prctico permitieron localizar las protenas posteriores.
de inters de cada experimento, aunque cada
1.2 Estimacin de clorofila: se solubiliz clorofila
tcnica presenta alguna desventaja que en el
agregando 5 mL de acetona al 80% en tubo Falcon
caso del fraccionamiento subcelular de
de 15 mL junto con 50 L de la preparacin original.
cloroplastos, esta es que para obtener mayor Luego se mezcl y centrifug a 3000 rpm por 2
eficiencia se debiese aislar cada protena de minutos precipitando las protenas. Tras esto, se
forma independiente lo que se traduce en un midi absorbancia a 652 nm, teniendo 1 mL de
tiempo de trabajo mayor adems de que en acetona al 80% (como blanco para calibracin) y 1
geles es difcil discernir entre protenas con mL del sobrenadante en acetona. En caso de que la
pesos moleculares similares. En cuanto a la absorbancia hubiese sido mayor a 1,0 se deba
microscopia de fluorescencia, para lograr agregar 5 mL al tubo Falcon y volver a repetir los
fusionar las protenas fluorescentes es pasos descritos anteriormente hasta obtener un
valor menor a 1,0. La determinacin de la
necesario conocer la secuencia nucleotdica de
concentracin de clorofila se hizo a partir de la
la protena de inters por lo que el querer
ecuacin de Lambert-Beer:
estudiar una protena con secuencia
desconocida ser complicado. A pesar de estas = 2,9 652
desventajadas citadas se logr cumplir cada Una vez determinada la concentracin, se debe
objetivo propuesto, comprendiendo adems ajustar la concentracin de 0,5 mL de preparacin
original hasta obtener concentracin final de 0,5 transient gene expression and silencing: A rapid
mg/mL. Para ello, se debe agregar buffer de tool for functional gene assay in potato. PLoS
sacarosa hasta alcanzar concentracin final.
ONE 4: e5812.
1.3 Distribucin de protenas en la membrana
tilacoide: se coloc 50 L de cloroplastos (0,5 mg Cardemil, L. Fotosntesis. Fotosistema I y II.
clorofila/mL) en 2 tubos eppendorf, agregando a uno
de los tubos 50 L de 5% Triton X-100 (muestra T) y
10 de Agosto de 2017.
al otro 50 L de NaBr 4M (muestra N) para dejar Dalton D., Ma C., Shrestha S., Kitin P., Strauss
ambos tubos en hielo y oscuridad por 15 minutos
mezclando cada 2 minutos. Transcurrido el tiempo, S. (2011). Trade-offs between biomass growth
los tubos se centrifugaron a 14000 rpm por 5 minutos and inducible biosynthesis of
para posteriormente traspasar los sobrenadantes polyhydroxybutyrate in transgenic poplar. Plant
(100 L) a tubos nuevos (muestras TS y NS), Biotechnol J 9:759-767.
mientras que los sedimentos fueron resuspendidos
en 100 L de buffer de sacarosa (muestras TP y NP). Desnoyers, J., Ichhapor, F. (1969). Salting-in
A estas 4 muestras se les agreg 50 L de buffer de and salting-out of polar nonelectrolytes.
carga para hacerlos correr en gel. Se prepar Canadian Journal of Chemistry. Vol. 47, 1969
tambin un quinto tubo que contuvo 50 L de
extraccin original y 50 L de buffer de sacarosa. Heinig U., Gutensohn M., Dudareva N., Aharoni
Todas las muestras se dejaron en hielo por 20
A. (2013). The challenges of cellular
minutos, agitndolos ocasionalmente hasta el
momento de cargar 15 L de cada muestra en los compartmentalization in plant metabolic
posillos correspondientes en el gel. Tanto la engineering. Curr Opin Biotechnol 24:239-246.
electroforesis de los geles como el tratamiento
posterior de los geles fue llevado a cabo por los Horsch R., Fry J., Hoffman N., Eicholtz D.,
ayudantes. Rogers S., Fraley R. (1985). A simple and
2. Uso de protenas fluorescentes general method for transferring genes into
2.1 Infiltracin de hojas de tabaco: se virti10 mL plants. Science, 227: 12291232.
del cultivo muestra problema (previamente inoculado
por ayudantes) en tubo Falcon de 15 mL, Howe C., Fearnley I., Walker J., Dyer T., Gray
sedimentando clulas a travs de centrifugacin a J. (1985). Nucleotide sequences of the genes
3000 rpm por 10 minutos. Se desech el
sobrenadante y se resuspendieron las clulas con 1 for the alpha, beta and epsilon subunits of wheat
mL de Medio de Infiltracin (MI: 1 x sales MS, 20% chloroplast ATP synthase. Plant Mol Biol 4:333-
sacarosa, acetosiringona 300M, MES 10mM pH 345.
5,7). Se midi OD a 600 nm de la suspensin
tomando 20 L de esta, diluyndola en 980 L de MI Lambers H., Chapin F.S., Pons T.L. (1998).
en cubeta de 1 mL (para blanco se us 1 mL de MI). Photosynthesis, Respiration, and Long-
Por ltimo, se agreg 5 mL de la suspensin para Distance Transport. Plant Physiological
infiltrar en una jeringa con la cual se procedi a Ecology. Springer, New York, NY.
infiltrar paneles de una hoja de tabaco, marcando
el rea infiltrada e infiltrando una hoja aparte con Smith, H. (1977). The Molecular Biology of Plant
agua (control negativo).
Cells. Ed 14., University of California Press,
2.2 Visualizacin de protenas fusionadas: se
cort el rea infiltrada para hacer un epidermal peel Berkeley y Los Angeles, California.
de la muestra problema y del control, montando
estas muestras en portaobjeto con agua y
Sparkes, I., Runions, J., Kearns, A., Hawes,
tapndolas con cubreobjetos. Se visualizaron las C. (2006). Rapid, transient expression of
muestras en micrscopio fluorescente (Olympus fluorescent fusion proteins in tobacco plants and
IX70) en campo claro y posteriormente con filtros generation of stably transformed plants. Nature
para visualizar protenas fluorescentes. Las Protocols 20: 19-25.
imgenes fueron grabadas por los ayudantes.
Tobin, A. (1996). Subcellular fractionation of
plant tissues. Isolation of chloroplasts and
Referencias
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Bhaskar PB, Venkateshwaran M, Wu L, An J- 59:57-68.
M, Jiang J (2009). Agrobacterium-mediated

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