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Oscar Millet
Unidad de Biología Estructural
CICbioGUNE
Ausencia de coherencias.
Observables
de relajación
Bo Bo Bo
Z Z Z
R1 = 1/T1
RF Relajación
En moléculas pequeñas T1 ≈ T2
Tiempo largo de reestablecimiento del equilibrio.
nOe de baja intensidad.
R1 = 1/T2
RF
Relajación
Ausencia de
relajación
Presencia de Anchura de
relajación Línea espectral !!
Tiempo Frecuencia
Tiempo de relajación transversal (T2)
2. Mecanismos de relajación del espín nuclear
Mecanismos de relajación en RMN
Relajación dipolo-dipolo.
Anisotropía del desplazamiento químico.
Relajación cuadrupolar (I > ½).
Relajación paramagnética.
Anisotropía de desplazamiento químico
Interacción dipolo-dipolo
Mecanismos de relajación y dinámica molecular
El movimiento Aparición de un
de la molécula campo
es responsable magnético
último del fluctuante
mecanismo
Movilidad y
flexibilidad molecular
Relajación
Relajación longitudinal (T1)
Relajación transversal (T2)
Observables
de relajación
Movilidad y
flexibilidad molecular
Reorientaciones de la molécula
Flexibilidad segmental
…
Caracterización de los movimientos moleculares
La función de correlación
G (t ) = B (t ) ⋅ B (t + τ )
∞
J (ω ) = 2 ⋅ Re ∫ G (τ ) ⋅e −iωτ dτ
0
Caracterización de los movimientos moleculares
X(t) J(ω)
F = -kx
X ωo=(k/m)1/2
- Movilidad + Movilidad
J(ω)
1
H
J(ω)
1H
θ
15 N
15
N
ω (freq)
ω (freq)
Relajación longitudinal (T1)
Relajación transversal (T2)
Observables
de relajación
Movilidad y
flexibilidad molecular
Reorientaciones de la molécula
Flexibilidad segmental
…
La teoría de Bloch, Wagness y Redfield permite
obtener expresiones para los observables de relajación
Ejemplo: relajación del nitrógeno amida de una proteína
J(ω)
ω (frequency)
R1 = 1/T1
R2 = 1/T2
R2Z = 1/T2Z
RZZ = 1/TZZ
R1H = 1/T1H
NOENH
Chemical shift J
Dipolar couplings
Movimientos locales en proteínas y su relación con la RMN
Nature of Motion
Chemical shift J
Dipolar couplings
Movimientos globales
Difusión
translacional
Difusión rotacional
Movimientos internos
Bo
Reorientación global
Dper
S2 oscila entre 0 y 1:
1
H
Ω = θ, φ
15
N
Chemical shift J
Dipolar couplings
Efecto del intercambio en el espectro de RMN
1.5ppm 1.0ppm
H H
1.5ppm 1.0ppm
Intercambio lento: Kex << Δω
1.5ppm 1.0ppm
H H
1.5ppm 1.0ppm
H
H
FT
Promedio de ambas conformaciones
1.25ppm
1.5ppm 1.0ppm
H
H
FT
Promedio de ambas conformaciones
1.25ppm
Intercambio intermedio: Kex ≈ Δω
Intercambio intermedio
A B