Mestrados 2016/2017
# Responsável email
1 Adelaide Almeida
2 Adelaide Almeida
3 Adelaide Almeida
4 Adelaide Almeida
5 Adelaide Almeida
6 Adelaide Almeida
Adília Pires & Etelvina
7 adilia@ua.pt
Figueira
8 Adília Pires & Rosa Freitas
Alberto Correia/Bruno
9 P
Nunes
10 Ana Lillebø
Ana Lillebø (UAveiro)
11
Marta Otero (ULeon)
12 Ana Lillebø; Ana I Sousa
13 Ana Luís e Artur Alves
14 Ana Luís e Salomé Almeida anatluis@ua.pt; salmeida@ua.pt
Ana Marta Gonçalves,
15 Helena Oliveira, Fernando
Gonçalves
Ana Marta Gonçalves,
16
Fernando Gonçalves
Ana Marta Gonçalves,
17
Fernando Gonçalves
Ana Marta Gonçalves,
18
Fernando Gonçalves
DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4
T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
Terapia fagica na inativação de Staphylococcus aureus: efeitos nos fatores O projeto tem como objetivo avaliar o efeito da terapia fágica nos fatores de virulência de
aalmeida@ua.pt P Todos 1
de virulência. Staphylococcus aureus não inativados após contacto com os fagos.
O projeto tem como objetivo desenvolver um procedimento eficaz para descontaminar bivalves
aalmeida@ua.pt P Todos Terapia fagica na depuração de bivalves. 1
contaminados, empregando uma combinação de duas técnicas, terapia fágica e depuração.
O projeto tem como objetivo desenvolver um procedimento eficaz para inativar bactérias
aalmeida@ua.pt P Todos Terapia fagica na inativação de bactérias patogénicas de peixe. 1
patogénicas em aquacultura, empregando terapia fágica
O projeto tem como objetivo desenvolver um procedimento eficaz para desinfetar águas
aalmeida@ua.pt P Todos Terapia fotodinâmica na desinfeção de águas residuais. 1
residuais, empregando a terapia fotodinâmica.
O projeto tem como objetivo desenvolver um procedimento eficaz para descontaminar bivalves
aalmeida@ua.pt P Todos Terapia fotodinâmica na depuração de bivalves. contaminados, empregando uma combinação de duas técnicas, terapia fotodinâmica e 1
depuração.
O projeto tem como objetivo desenvolver um protocolo de terapia fotodinâmica para controlar a
aalmeida@ua.pt P Todos Terapia fágica no controle da PSA do kivi. 1
"PSA do kiwi". A "PSA" é uma doença provocada pela bactéria Pseudomonas syringae.
Este trabalho tem como objetivo avaliar as respostas, a nível individual (ex: capacidade
Alterações fisiológicas e bioquímicas em poliquetas expostos a regenerativa de tecidos) e ao nível sub-celular (por meio de marcadores bioquímicos) de
P vários TE, EA, BM, BA 1
contaminantes e alterações ambientais poliquetas de elevado interesse comercial, quando expostas a contaminantes (ex. metais) e
alterações ambientais (ex. salinidade, temperatura e pH).
Este trabalho tem como objetivo avaliar as respostas, a nível individual e ao nível sub-celular (por
adilia@ua.pt P vários TE, EA, BM, BA Os efeitos de contaminantes e alterações ambientais em poliquetas meio de marcadores bioquímicos) de poliquetas expostos a contaminantes (ex. metais) e 1
alterações ambientais (ex. salinidade, temperatura e pH).
The selected candidate will work on the ecology of a Portuguese commercial fish species, with
direct application on fisheries. The research plan will include fish acquisition, biological sampling,
laboratorial work (otolith fingerprinting, biomarkers and biometry) and statistical analyses (uni-
atcorreia.ciimar@gmail.com;
Vários BA, TE, BMC, BM, EA Ecologia de peixes com interesse comercial em Portugal and multivariate tests). NOTA IMPORTANTE: mestrado parcialmente
nunes.b@ua.pt
financiado com bolsa, no quadro NORTE-01-0145-FEDER-000031, com a referência MarInfo -
Integrated Platform for Marine Data Acquisition and Analysis; ver mais detalhes em
http://www.eracareers.pt/
O projeto tem como objetico a avaliação do efeito da contaminação por Hg nos serviços de
lillebo@ua.pt P BA, BM, EA Dinâmica do fósforo (P) num sapal historicamente contaminado por Hg
regulação do ciclo do P prestados pelos ecossistemas de sapal.
O projeto tem como objetico a avaliação do efeito da intrusão salina superficial na capacidade de
Cinética de adsopção de fósforo (P) em solos salinizados: caso de estudo do
lillebo@ua.pt P BA, BM, EA adsopção de fósforo (P) nos solos do Baixo Vouga Lagunar: implicações nos serviços prestados
Baixo Vouga Lagunar
pelo ecossistema
O projeto tem como objetico contribuir para a recuperação das pradarias marinhas da Ria de
lillebo@ua.pt P BA, BM, EA Ensaio para a recuperação do moliço na Ria de Aveiro
Aveiro através do ensaio de transplantes da espécie Zostera noltei .
anatluis@ua.pt; A new approach for biorremediation of acid mining environments: Mesocosm experiments simulating strong metal and acid gradients (Aljustrel pyritic mines).
P Vários M;BMC;TE;BA 1
artur.alves@ua.pt interactions of bacteria and microalgae using metagenomic tools Colonization with field biofilms. Determination of interactions through metagenomic approach
Ambientes ácidos extremos: efeitos em biofilmes e mecanismos de Mesocosm experiments simulating strong metal and acid gradients (Aljustrel pyritic mines).
P vários BA; EA; TE sobrevivência/Extreme acid environments: effects on biofilms and survival Colonization with field biofilms. Determination of total biomass, primary productivity, and 1
mechanisms microalgae diversity
Estudo do efeito de pesticidas, avaliando danos no DNA e no metabolismo de linhas celulares
holiveira@ua.pt P Vários TE, BMC Efeito genotóxico e bioquímico de pesticidas em linhas celulares humanas
humanas.
Caracterização da dieta alimentar e da composição bioquímica (quantificação proteica,
fjmg@ua.pt P Vários BA, EA, BMC Caracterização bioquímica de peixes dulçaquicolas com valor comercial
composições lipidica e de carbohidratos) de peixes dulçaquicolas com valor comercial.
Este trabalho pretende fazer uma caracterização da composição bioquímica de peixes marinhos
fjmg@ua.pt P Vários BA, EA, BMC Caracterização bioquímica de peixes marinhos com valor comercial Ricardo Jorge Almeida Vieira 50307
com valor comercial
Efeito do sulfato de cobre no perfil em ácidos gordos e na atividade Este estudo tem como objetivo caracterizar o efeito do sulfato de cobre na composição
fjmg@ua.pt P Vários BA, TE, BMC Andreia Filipa da Costa Mesquita 65731
enzimática de bivalves marinhos bioquímica de bivalves marinhos com valor comercial
 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
Ana Marta Gonçalves, Lipidomica e carbohidratos como ferramentas de avaliação e aplicação Caracterização e identificação de moléculas chave nos perfis lipidico e de carbohidratos de
19 fjmg@ua.pt P Vários BA, EA, BMC, BM
Fernando Gonçalves sócio-económica de produtos espécies aquáticas, com interesse económico.

Ana Marta Gonçalves,

Impacto dos incêndios florestais em perfis de ácidos gordos de animais Avaliação da toxicidade das cinzas de incêndios florestais nos perfis de ácidos gordos do
20 Fernando Gonçalves, fjmg@ua.pt P Vários BA, BMC, BA, TE, EA
aquáticos gastrópode aquático Physa acuta.
Nelson Abrantes
Ana Marta Gonçalves,
O efeito de fitofarmacêuticos nos perfis de ácidos gordos de espécies não Avaliação de efeitos de produtos fitofarmacêuticos em espécies de água doce de diferentes níveis
21 Fernando Gonçalves, fjmg@ua.pt P Vários BA, EA, TE
alvo tróficos. Determinação da qualidade alimentar em cadeias tróficas.
Nelson Abrantes

Ana Marta Gonçalves, Dinâmica espacio-temporal das comunidades de plâncton no estuário do Avaliação da dinâmica das comunidades de fito e zooplâncton do estuário do Mondego (com
22 fjmg@ua.pt P Biologia Marinha Leonardo Santos 37133
Fernando Gonçalves Mondego saídas de campo mensais).

Ana Marta Gonçalves, Este trabalho pretende avaliar os impactos de microplásticos em espécies aquáticas chave, dada a
23 Nelson Abrantes, Fernando fjmg@ua.pt P Vários TE, BA, EA Impacto de microplásticos em sistemas de água doce lacuna de conhecimento existente. O trabalho envolverá uma forte componente de campo e Mariana Oliveira Rodrigues 64886
Gonçalves laboratorial.

Ana Sofia Reboleira, Estudo das comunidades bentónicas em nascentes cársicas e aplicação de índices bióticos para a
24 fjmg@ua.pt P Vários EA, BA Ecologia e biodiversidade de nascentes cársicas
Fernando Gonçalves sua caracterização ecológica.

Ana Sofia Reboleira, Avaliação da sensibilidade de crustáceos estigóbios a determinados contaminantes e estudo das
25 fjmg@ua.pt P Vários EA, BA, ET Ecotoxicologia de crustáceos de águas subterrâneas
Fernando Gonçalves consequências desta contaminação em ecossistemas subterrâneos

Ana Sofia Reboleira, Comportamento e desenvolvimento pós-embrionário de artrópodes Manutenção de culturas de animais cavernícolas em laboratório, observação e acompanhamento
26 fjmg@ua.pt P Vários EA, BA, ET
Fernando Gonçalves cavernícolas de fases do seu desenvolvimento.

Ana Sofia Reboleira, Sérgio

Estudo da composição faunística e diversidade de anfíbios e répteis em grutas nos maciços
27 Marques, Fernando fjmg@ua.pt P Vários EA, BA Distribuição de anfíbios e répteis em grutas do maciço Estremenho. Ana Patrícia dos Reis Marques 78835
calcários do centro de Portugal, identificando e mapeando a sua distribuição nestes habitats.
Gonçalves

Bactérias produtoras de biossurfactantes como potenciais promotoras do Avaliação da expressão de fatores de promoção do crescimento de plantas (sideróforos, enzimas,
28 Angela Cunha acunha@ua.pt P BA 1 Sofia Cruzeiro 69912
crescimento de plantas fitohormomas) em bactérias produtoras de biossurfactantes

Biofilms are associations of microorganisms involved in a self-produced extracellular matrix that

are more resistant to antimicrobial agents than the corresponding planktonic forms and
therefore, represent a challenge in terms of disinfection. The photodynamic effect (generation of
Angela Cunha e Amparo Surfactants and quorum-quenchers as coadjutants in the photodynamic reactive oxygen species by interaction of light with a photosensitizing molecule, in presence of
29 acunha@ua.pt P Vários BA, M
Faustino (DQ) inactivation of microbial biofilms. molecular oxygen) is regarded as a promising alternative for the control of environmental
biofilms, particularly when combined with matrix-destabilizing agents. The objective of the work
is to evaluate the effect of surfactants and quorum-sensing inhibitors on the susceptibility of
microbial biofilms to photodynamic inactivation.

Plant-growth-promoting bacteria (PGPB) are known to establish mutually beneficial relations with
the host plant and contribute to enhanced tolerance to stress and increased productivity of crop
Angela Cunha e Helena Isolation of plant-growth-promoting bacteria (PGPB) from the rhizosphere
30 acunha@ua.pt P Vários BA, M cultures. The objective of the work is to isolate and characterize PGPB associated with Salicornia
Silva of Salicornia ramosissima
in the perspective their application for microbe-assisted crop cultivation of halophytes in saline
agriculture practices.

Glasswort (Salicornia ramossisima) is an halophyte widely represented in Portuguese estuaries

that is gaining interest as a gourmet food. Shoots can be consumed fresh, as a salad greens, or
Angela Cunha e Helena Characterization of the microbiological quality of glasswort (Salicornia
31 acunha@ua.pt P Vários BA, M dehydrated, as a spice. The objective of the work is to assess the relation between microbiological
Silva ramosissima) shoots as salad greens
quality of sediments of cultivation areas and irrigation water and microbial load of edible parts of
the plant.

No âmbito do projecto ALIEN (PTDC/AGR-PRO/2183/2014 ), pretende-se avaliar o potencial de

Angela Cunha/Amparo
fotosensibilizadores para a inativação de fungos patogénicos da videira. O impacto económico das
32 Faustino/Ana Cristina acesteves@ua.pt P Vários M; BA; BCM Métodos eco-compatíveis para o combate a doenças fúngicas
doenças fúngicas nas vinhas portuguesas e europeias é extremo e são necessárias medidas de
Esteves
combate eficazes e eco-compatíveis.

Estudo da halotolerância e diversidade genética num dinoflagelado O género Durinskia pertence a um grupo de dinoflagelados com plastos derivados de uma
António José Calado;
33 acalado@ua.pt; scraveiro@ua.pt P Todos binucleado / Salinity tolerance and genetic diversity in a dinoflagellate with diatomácea endossimbionte, da qual retêm o núcleo. Presentes em água doce e marinha: 1
Sandra C. Craveiro
a supplementary eukaryotic nucleus mesmas espécies?

António Luís; Eduarda

34 aluis@ua.pt; eduper@ua.pt P Distribuição de contaminantes nos orgãos internos de aves predadoras JULIANA ALMEIDA D'AMIL 60092
Pereira

António Luís; Paulo G.

aluis@ua.pt; pgmota@uc.pt; Vocalization repertoires variation and the genetic dispersal patterns of Red-
35 Mota; João Alexandre P Vanessa Filipa Santos Rodrigues 64654
jcabral@utad.pt billed Chough (Pyrrhocorax pyrrhocorax ) populations in Iberian Peninsula.
Cabral

aluis@ua.pt;
António Luís; Inês Estudo do comportamento em cativeiro e perspectivas de enriquecimento
36 carla.monteiro@zoosantoinacio. P Henrique Jorge Sousa Almeida Santos 81451
Canavarro; Carla Monteiro ambiental em grandes carnívoros
com

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
Using existing literature data to perform a global meta-analysis on causal links between
António Nogueira, Michiel Causalities between biodiversity, ecosystem functions and services in
37 antonio.nogueira@ua.pt T EA, TE biodiversity, ecosystem functions and services in the Vouga river through multi-variate modeling
Daam, Ana Lillebø Natura 2000 sites of the Vouga river
approaches

O presente trabalho visa estudar os efeitos ecotoxicológicos que derivam da exposição de

organismos aquáticos a efluentes provenientes de estações de tratamento de águas residuais
Ecotoxicidade de fármacos de efluentes domésticos após tratamento em
38 Bruno Nunes nunes.b@ua.pt P Vários BA, TE, BM, EA urbanas, e de exposições laboratoriais sob condições controladas a fármacos de ampla utilização.
ETARS
Serão utilizadas ferramentas bioquímicas que demonstrem os efeitos toxicológicos possíveis,
nomeadamente em peixes e crustáceos.

O presente projecto visa determinar os efeitos ecotoxicológicos que resultam da combinação de

fármacos e outros contaminantes emergentes, utilizados como desinfectantes e conservantes,
Efeitos da combinação de fármacos com anti-incrustantes, desinfectantes e
39 Bruno Nunes nunes.b@ua.pt P Vários BA, TE, BM, EA tanto na indústria farmacêutica como dermocosmética e química, utilizando biomarcadores. Os
conservantes, sujeitos a condições abióticas realistas
organismos teste serão expostos a diversas condições de luz e salinidade, simulando variações
normais do ciclo de vida dos animais.

O presente projeto visa estudar os efeitos toxicológicos e farmacológicos de venenos obtidos a

40 Bruno Nunes/Félix Carvalho nunes.b@ua.pt; felixdc@ff.up.pt P Vários BA, TE, BMC, BM Estudo dos efeitos tóxicos de venenos de peixes partir de peixes marinhos da costa portuguesa. Este trabalho será desenvolvido no Departamento
de Biologia da Universidade de Aveiro e na Faculdade de Farmácia da Universidade do Porto.

O presente trabalho tem como objectivo a monitorização de efeitos tóxicos com repercussões
Estudo dos efeitos de drogas terapêuticas em parâmetros bioquímicos e bioquímicas e modificações epigenéticas em plantas do género Lemna, expostas a concentrações
41 Bruno Nunes/Glória Pinto nunes.b@ua.pt; gpinto@ua.pt P Vários BA, TE, BMC, BM, EA
epigenéticos de plantas aquáticas ecologicamente relevantes das drogas com utilização terapêutica paracetamol, diclofenac e
ciprofloxacina.

Este projecto pretende avaliar os efeitos comparativos decorrentes da exposição a doses

ecologicamente relevantes de dois compostos antifúngicos, o ciproconazol (uso agrícola) e
piritionato de zinco (uso dermocosmético), no anfíbio Xenopus laevis e no fungo Saprolegnia
Estudo dos efeitos de antifúngicos de uso agrícola e dermocosmético em
42 Bruno Nunes/Isabel Lopes nunes.b@ua.pt; ilopes@ua.pt P Vários BA, TE, BM, EA australis, de modo a avaliar o risco que o seu uso e ulterior libertação para o meio ambiente
anfíbios e fungos infecciosos
poderá ter nas duas espécies preconizadas. Serão utilizadas ferramentas bioquímicas para
avaliação dos efeitos toxicológicos e para possível identificação dos mecanismos tóxico
envolvidos.

O presente projecto visa estudar os efeitos tóxicos de fármacos anticolinesterásicos em

organismos de solo, com particular incidência nas questões de locomoção e evitamento,
Bruno Nunes/Mónica nunes.b@ua.pt; Estudo dos efeitos de compostos anticolinesterásicos em organismos de
43 P Vários BA, TE, BM, EA utilizando também ferramentas moleculares. Os organismos serão expostos a estes compostos,
Amorim mjamorim@ua.pt solo
mas também a antídotos específicos, no sentido de compreender os mecanismos de toxicidade
que estão subjacentes ás intoxicações por este tipo de composto.

O presente projeto visa determinar os efeitos tóxicos de duas drogas de utilização humana (ácido
Avaliação dos efeitos de dois fármacos anti-inflamatórios não esteroides acetilsalícilico e diclofenac) numa espécie de poliqueta marinha, Hediste diversicolor, sob diversas
nunes.b@ua.pt;
44 Bruno Nunes/Rosa Freitas P Vários BA, TE, BMC, BM, EA numa espécie de poliqueta marinha, exposta a condições variáveis de condições realistas de salinidade que simulam alterações prováveis associadas a alterações
rosafreitas@ua.pt
salinidade globais. Os efeitos tóxicos serão essencialmente monitorizadas ao nível do seu desempenho
metabólico, defesa antioxidante e de respiração.

Avaliação de efeitos sub-letais de hormonas esteróides sintéticas em embriões de peixe-zebra a

Carla Quintaneiro e
45 cquintaneiro@ua.pt P Vários BA; TE Efeitos de hormonas esteróides sintéticas em embriões de peixe-zebra diferentes níveis de organização biológica estabelecendo correlações entre efeitos teratogénicos
Amadeu Soares
e de comportamento com alterações bioquímicas e moleculares.

A reprodução é um dos parâmetros mais importantes numa população. Os ovários de fêmeas de

Caracterização do estado reprodutor de fêmeas de pequenos cetáceos cetáceos foram recolhidos ao longo de vários anos. O seu estudo permitirá inferir sobre o estado
46 Catarina Eira catarina.eira@ua.pt T/P Vários BA;BM;EA 1 Bárbara Camarão 78865
através da morfologia do ovário reprodutor e sazonalidade da reprodução em pequenos cetáceos e estimar o número mínimo de
vezes que cada indivíduo se reproduziu.

Na costa continental Portuguesa, a comunidade de pequenos cetáceos é bastante diversificada. A

Contribuição para o estudo da dieta de pequenos cetáceos em Portugal
47 Catarina Eira catarina.eira@ua.pt T/P Vários BA;BM;EA contribuição para o estudo da dieta de golfinho-comum, boto, e golfinho riscado produzirá 1 Glennda Jorge Pinheiro 82114
continental
informação sobre a sobreposição dos recursos alimentares mais importantes.

48 Catarina Marques crmarques@ua.pt T/P M The microbiota associated with human cancer This work will explore shifts in the human microbiome under healthy and pathological conditions. 1 Ana Cristina Marques da Silva 64799

This theme aims to explore the potential of marine microorganisms to synthesize bioactive
Catarina Marques e
49 crmarques@ua.pt T/P Vários BA, M, BMC, BM Digging into the bioactive legacy of marine microbes compounds for different applications. Microbiological and molecular biology techniques will be 1
Amadeu Soares
used.

NANOBINDERS: biogenic nanoparticles synthesized by bacteria for metal This work intends to characterize nanoparticle-producing bacteria towards metals bioremediation
50 Catarina Marques crmarques@ua.pt T/P Vários BA, M, BMC 2
removal (project PTDC/AAG-REC/3004/2014). Techniques: microbiology, molecular biology and imaging.

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.

Catarina Marques e This work will focus on the study of genetic markers that could help understand microalgae
51 crmarques@ua.pt T/P Vários BA, TE Microalgae from an uranium mine: the "story" behind their resistance 1
António Calado resistance to extreme conditions of contamination commonly occurring in mines.

Neste tema pretende-se integrar diferentes respostas biológicas (fotobiologia e fisiologia) de

Catarina Marques e João Impacto de compostos emergentes e pesticidas em respostas múltiplas de
52 crmarques@ua.pt T/P Vários BA, TE Lemna spp. para avaliar o efeito de compostos emergentes e pesticidas sob diferentes condições 1
Serôdio macrófitas sob cenários de alteração climática
representativas de alterações globais.

Developed in DBio & ECOMAR.Study of stress factors impact on the microbial community living in
Catarina Marques e Rui Shifts in the microbial symbiotic community of corals subjected to different
53 crmarques@ua.pt T/P Vários BA, M, BMC, BM association with soft corals.Corals zootechny, microbiological and molecular biology procedures 1
Rocha e Amadeu Soares stress factors
will be used.

Catarina Marques, Rui Developed in DBio & ECOMAR. Study of the bioactive nature of different coral species for
54 crmarques@ua.pt T/P Vários BA, TE, BM Corals-driven bioterrorism against toxic cyanobacterial blooms 1 José Luís Nunes 61942
Rocha e Amadeu Soares controlling blooms of toxin-producing cyanobacteria in freshwater reservoirs.

Catarina Marques e Paula Bioprospection of microalgae and cyanobacteria activity against human This work will focus on the in vitro toxicity testing of microbial extracts against normal and
55 crmarques@ua.pt T/P Vários BA, TE, BMC 1
Gonçalves cells diseased human cells. Microbiological and cellular biology techniques will be herein used.

Microbiological, molecular biology and genetic techniques will be applied to get a deeper
Catarina Marques e Sónia
56 crmarques@ua.pt T/P Vários BA, TE, BMC The hidden microbial biosynthetic value in extreme environments understanding of the biosynthesis of secondary metabolites by bacteria from different 1
Mendo
unexplored and extreme environments.

Prever os efeitos do aquecimento global a partir de zonas termais é o objetivo do trabalho. Para
Cristina Delgado e Salomé cristina.delgado@ua.pt; A ilha de São Miguel nos Açores como laboratório natural para estudo do
57 P vários BA; EA isso, será feita uma análise das comunidades de diatomáceas, ao longo de um gradiente de 1
Almeida salmeida@ua.pt impacto do aquecimento global ao nível das comunidades de diatomáceas
temperatura e sua interação com a química da água.

The study of ecosystem services constitute a growing field of research. The Millennium Ecosystem
Assessment (2005) proposes four categories of ecosystem services: provisioning, regulating,
cultural and supporting. Coastal cultural ecosystem services (CES), include nonconsumptive direct
Serviços culturais de ecosistema marinho na Ria de Aveiro: Turismo, use values, and are a relatively young research field that suffers from poor quantification. The
58 Cristina Pita, Ana Lillebo c.pita@ua.pt P Vários BM, BA,EA
recreação e lazer current project focus on quantifying coastal recreation and tourism services in Aveiro. It will: (1)
carry out a descriptive reviews to identify these services, consisting of a desktop study; (2) use
questionnaires to collect information about the public views, preferences and uses of the marine
and coastal environment.

The study of ecosystem and the services it provides constitute a growing field of research. The
Ocean Health Index (OHI) is an assessment framework that comprehensively evaluates marine
environments in a way that is standardized yet tailorable to different contexts and spatial scales.
Cristina Pita, Henrique Using the Ocean Health Index (OHI) framework to evaluate the ecological
59 c.pita@ua.pt P Vários BM, BA,EA OHI framework assesses a suite of key social, economic, and ecological benefits a healthy oceans
Queiroga health of marine ecosystems in Portugal
provides. The current project focus on the ecological evaluation of marine ecosystems in
Portugal.

Culturing conditions, including medium and food preparation. Advanced molecular biology
Etelvina Figueira & Bruno Minimization and automatization of the OECD 211 Daphnia magna techniques, enzimatic biomarkers, acute and chronic toxicity and reproductive effects assessment
60 efigueira@ua.pt P vários BA, BMC, EA,TE
Campos reproduction test are also methodologies that students can perform. NOTA: O trabalho decorrerá integralmente no
IDAEA-CSIC , - Barcelona

Mercury effects in salt marsh plants: alterations in the metabolome of

61 Etelvina Figueira efigueira@ua.pt P MBMC Spartina maritma and Halimione portulacoides from a highly contaminated 1 Célia Carolina Moreira Fernandes 65720
system

Eduardo Ferreira, Carlos The Cantabrian brown bear is a small and fragmented population that is still under threat because
elferreira@ua.pt; Genetic structure and gene flow on the threatened population of the
62 Manuel Martins dos Santos T/P EA
Cantabrian brown bear (Ursus arctos)
of the conflict with human populations. With this study we aim to characterize and evaluate the 1 INÊS DE SOUSA GREGÓRIO 49690
cfonseca@ua.pt
Fonseca, Tânia Barros status of this charismatic but endangered mammal.

Culturing conditions, including medium and food preparation. Advanced molecular biology
Etelvina Figueira & Bruno Development of a behavioural test in Daphnia magna to detect effects of techniques, enzimatic biomarkers, acute and chronic toxicity and reproductive effects assessment
63 efigueira@ua.pt P vários BA, BMC, EA,TE
Campos psychiatric drugs are also methodologies that students can perform. NOTA: O trabalho decorrerá integralmente no
IDAEA-CSIC , - Barcelona

Debaromyces hansenii is a highly osmo, halo and xerotolerant yeast with remarkable
Etelvina Figueira & Isabel biotechnological potential. The project intends to uncover the molecular mechanisms involved in
64 efigueira@ua.pt P vários BMC, M Unveiling molecular mechanisms of Debaromyces hansenii stress tolerance
Miranda its stress tolerance. NOTA: O trabalho decorrerá integralmente na Faculdade de Medicina do
Porto

C. parapsilosis is the second most common yeast species isolated from blood cultures. It is our
Etelvina Figueira & Isabel
65 efigueira@ua.pt P vários BMC, M Surveillance of Candida parapsilosis antifungal resistance goal to characterize its susceptibility profile and the molecular mechanisms involved in resistance.
Miranda
NOTA: O trabalho decorrerá integralmente na Faculdade de Medicina do Porto

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
Echinocandins represent a first line therapeutic for invasive fungal infections. This study will
Etelvina Figueira & Isabel Echinocandin resistance and promoted virulence: unveiling its blockade in
66 efigueira@ua.pt P vários BMC, M assess novel therapeutic strategies, by improving echinocandin clinical usefulness. NOTA: O
Miranda invasive fungal infections
trabalho decorrerá integralmente na Faculdade de Medicina do Porto

Neste trabalho serão abordados aspetos relacionados com a caraterização fenotípica, diversidade,
Etelvina Figueira & Isabel Diversidade das bactérias que nodulam as raízes das leguminosas em filogenia e eficácia simbiótica das bactérias fixadoras de azoto, bem como a pesquisa de outras
67 efigueira@ua.pt P vários BA, M, BMC, EA
Videira e Castro sistemas agrosilvopastoris atividades "in vitro" que ajudem a promover o crescimento das plantas. NOTA: O trabalho
decorrerá integralmente no INRB , ao lado do ITQB em Oeiras - Lisboa

Estudo da toxicidade de misturas de solventes alternativos com potencial Trabalho a desenvolver no âmbito do projeto ToxMix. Ensaios ecotoxicológicos com diferentes
68 Fernando Gonçalves fjmg@ua.pt P Vários TE, BA
industrial espécies e com diferentes substâncias (2 vagas).

Francisco Coelho e Newton The student will use molecular biology techniques to study the ecology of mobile genetic
69 franciscorcoelho@ua.pt P Vários M,BMC,BM Ecology of mobile genetic elements in marine invetebrates
Gomes elements in marine invetebrates. Good English writing skills required.

The aim of this project is to test new elicitors capable to enhance plant defences for further
application by forest managers. Skills in plant physiology and plant signalling pathways, gene
The use of emergent plant elicitors to manage forest diseases:
70 Glória Pinto & Artur Alves gpinto@ua.pt; artur.alves@ua.pt T/P Vários BA; BMC; EA expression (including epigenetics) will be acquired do decipher the role of elicitors in plant-
physiological and molecular networks
pathogen interactions. The students will be enrolled in the ongoing FCT projects: ALIEN and
URGENTpine.

The aim of this project is to explore plant defences mechanisms. Skills in plant physiology and
plant signalling pathways (redox and hormonal status), gene expression (including epigenetics)
71 Glória Pinto & Artur Alves gpinto@ua.pt; artur.alves@ua.pt T/P Vários BA; BMC; EA Plant Alert: Signalling during plant-pathogen early interactions
will be acquired do decipher plant-pathogen interactions. The students will be enrolled in the
ongoing FCT projects: ALIEN and URGENTpine.

Helena Oliveira, Fernando Avaliação do potencial toxicológico de nanopartículas de grafeno na saude 2 vagas. Pretende-se avaliar a genotoxicidade de nanopartículas de grafeno em células humanas Carolina Sofia Pereira Roxo 81213
72 holiveira@ua.pt P Vários BA, BMC, TE
Gonçalves humana in vitro. O objetivo final será elaborar um ranking de toxicidade para os vários nanomateriais. Bruna Sofia Carvalho Teixeira 60750

2 vagas. As nanopartículas luminescentes apresentam enorme potencial de aplicação no

Helena Oliveira, Fernando Avaliação in vitro da biocompatibilidade de nanomateriais com potential
73 holiveira@ua.pt P Vários BA, BMC diagnostico e terapia. A biocompatibilidade destes nanomateriais será avaliada em vários
Gonçalves aplicação biomédica
modelos celulares in vitro.

The objective is to assess the crop productivity of SR when cultivated in presence of plant-growth-
Helena Silva e Ângela
74 hsilva@ua.pt; acunha@ua.pt P Vários BA; M; BM Assessment of Salicornia ramosissima (SR) crop productivity promoting bacteria (PGPB), in terms of seed germination and plant biomass/parenchyma
Cunha
production (field and mesocosms experiments ).

Elaboração de chaves dicotómicas ilustradas e interativas, ou outros conteúdos de divulgação de

75 Helena Silva e Lísia Lopes hsilva@ua.pt; lisia@ua.pt P Vários BA; EA Ferramentas interativas na divulgação da diversidade botânica
ciência (percursos pedrestres, brochuras), para o estudo e divulgação da biodiversidade vegetal

Desenvolver Guia de Campo e Chaves Ilustradas da Flora e Vegetação dos ecossistemas

Helena Silva, Lísia Lopes, Projeto Cabeço Santo (Quercus)- Guia e Chaves Ilustradas para a
76 hsilva@ua.pt, paula.maia@ua.pt P Ecologia Aplicada que têm sido alvo de restauro ecológico, como ferramentas essenciais para a
Paula Maia flora e vegetação dos habitats em processo de Restauro Ecológico
conservação e divulgação.

Criação de uma página para divulgação da Flora de TL, com base na biodiversidade, conservação,
Helena Silva e Paulo
77 hsilva@ua.pt; psilveira@ua.pt P Vários BA; EA A Flora de Timor-Leste (TL) e a sua divulgação online etnobotânica, entre outros. Pré-requisitos: conhecimentos sobre elaboração de páginas na
Silveira
internet, tratamento de imagem.

O comportamento locomotor é um endpoint muito sensível e de grande importância ecológica.

78 Inês Domingues inesd@ua.pt Vários BA, TE Efeitos de pesticidas na actividade locomotora de larvas de peixe zebra Neste trabalho vamos conhecer os efeitos de doses muito baixas de pesticidas na locomoção de 1
larvas de peixe zebra.

Há evidências de que os efeitos de uma exposição a um stress químico em fases embrionárias do

Efeitos a longo termo de exposição embrionária a contaminantes em peixe
79 Inês Domingues inesd@ua.pt Vários BA, TE ciclo de vida se podem manifestar mais tardiamente na fase adulta. Neste trabalho esta hipótese 1 Daniela Correia 81164
zebra
irá ser testada.

O comportamento antipredatório é essencial para a sobrevivência das espécies. Neste trabalho

Inês Domingues e João Efeitos de fármacos psiquiátricos na resposta a predadores em larvas de
80 inesd@ua.pt Vários BA, TE pretende-se saber de que modo é que este comportamento é afetado pela exposição a fármacos 1
Pestana peixe zebra.
psiquiátricos.

Inês Domingues e Miguel A fototaxia é a reação dos seres a estímulos luminosos. Neste trabalho iremos perceber como é
81 inesd@ua.pt Vários BA, TE Efeitos de stress químico na fototaxia de organismos aquáticos 1
Oliveira que esta reação pode ser influenciada por ação de um contaminante.

Inês Domingues e Miguel This work aims at determining the DNA damage potentialof human pharmaceuticals to non-target
82 migueloliveira@ua.pt Vários BA, TE Genotoxicity of pharmaceuticals to aquatic organisms 1 Niedja Santos
Oliveira aquatic organisms

Personal care products residues (including microbeads) are continuously released in the
Inês Domingues e Miguel Effects of Personel care products in zebrafish (Danio rerio ) at biochemical
83 migueloliveira@ua.pt Vários BA, TE environment. The aim of this work is to assess the effects of some of these compounds to 1
Oliveira and behavioural levels
zebrafish at serveral levels of biological organization.

Análise da comunidade microbiana associada ao pó em casas de pacientes com doença obstrutiva

Isabel Henriques/ Ana Microbial community in houses from patients with chronic respiratory crónica. Serão utilizadas tecnologias dependentes e independentes do cultivo. Os dados obtidos
84 ihenriques@ua.pt P BMC 1 Tatiana Deolinda Santos Teixeira Silva 81225
Catarina Sousa (UBI) diseases in Estarreja serão relacionados com o estádio e progressão da doença bem como com outros dados da
qualidade do ar no interior das casas.

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
Caracterização de isolados hospitalares, resistantes a múltiplas classes de antibióticos e
Isabel Henriques/ Cláudia produtores de beta-lactamases de espectro alargado ou beta-lactamases do tipo AmpC
85 ihenriques@ua.pt P BMC Molecular characterization of multi-drug resistant clinical isolates 1 Diana Salvador Sá Dias 67976
Oliveira plasmídicas. As tecnologias a aplicar incluem amplificação por PCR, sequenciação, clonagem,
conjugação etc.

Pretende-se que o aluno realize um percurso investigativo completo. As activides prátcas

envolverão a recolha de amostras da comunidade microbiana da pele de populações naturais de
86 Isabel Lopes ilopes@ua.pt P Vários TE, BA, EA Caracterização da comunidade bacteriana da pele de salamandras.
Salamandra salamandra e seu processamento em labotratório de modo a caracterizar a
composição e diversidade.

Este projecto pretende detereminar a influência das vias de exposição na toxicidade de

87 Isabel Lopes ilopes@ua.pt P Vários TE, BA, EA Avaliação da ecotoxicidade de nanopartículas em hidras. nanopartículas em duas espécies de hidras. Serão realizados bioensaios para determinar efeitos
tóxicos a nível individual e sub-individual.

Pretende-se que o aluno realize um percurso investigativo completo. Em laboratório serão

Isabel Lopes/António
88 ilopes@ua.pt P Vários TE, BA, EA Influência da temperatura no desenvolvimento embrionário de anfíbios. realizados ensaios de exposição de embriões da espécie de anfíbio Xenopus laevis a várias
Nogueira
temperaturas de modo a quantificar o seu efeito no tempo de desenvolvimento embrionário.

Challenge of nanotechnology in biotechnology industry: addressing Study of biochemical and ecotoxicological effects of nanoparticles from food packaging industry
Isabel Lopes & Victor
89 ilopes@ua.pt; vgalhano@ua.pt T/P Vários BA/TE biochemical and ecotoxicological effects of nanoparticles used in food on aquatic organisms through bioassays (chronic-exposure growth inhibition and Ames
Galhano
packaging mutagenicity tests).

Joana Pereira, Fernando 1 vaga. É objetivo deste trabalho avaliar os efeitos ecológicos e ecotoxicológicos da contaminação
90 jpereira@ua.pt P Vários BA, TE, EA, BM Análise dos efeitos da contaminação por metais em regiões polares
Gonçalves natural e antropogénica por elementos-traço em amostras recolhidas na Antártida e no Ártico.

Joana Pereira, Sérgio 1 vaga. Abordagens de análise bioquímica, transcriptómica e epigenética serão utilizadas para
91 Marques, Fernando jpereira@ua.pt P Vários BA, EA, BMC Análise de padrões conducentes a fenómenos microevolutivos em Daphnia investigar os mecanismos que justificam a tolerância diferencial de Daphnia a estímulos de stress Guilherme Jeremias 67456
Gonçalves químico.

1 vaga. Pretende explorar-se várias possibilidades no âmbito da gestão da espécie invasora, que é
Joana Pereira, Sofia Melhoramento de estratégias de controlo do lagostim vermelho do
92 jpereira@ua.pt P Vários BA, TE, EA uma praga economicamente muito relevante, em particular através da tentativa de
Guilherme Louisiana
melhoramento das metodologias de controlo químico

1 vaga. Serão analisadas as variações na distribuição de massa entre compartimentos fisiológicos

Body mass dynamics in Daphnia challenged by relevant environmental
93 Joana Pereira, Tânia Vidal jpereira@ua.pt P Vários BA, TE, EA de Daphnia, bem como as suas implicações na alternância de estratégias ecológicas e processos
stressors
microevolutivos

O objetivo principal deste trabalho é determinar os efeitos de stressores ambientais

João Pestana; Carlos
94 jpestana@ua.pt P Vários BA, TE, EA, BMC Homeostasia energética como bioindicador de stress ambiental (metais/pesticidas e stressores abióticos) em diferentes parâmetros energéticos de invertebrados
Gravato
aquáticos (2 vagas) .

Estudo do efeito da qualidade da luz (coloração) nos mecanismos de fotoinativação e reparação

95 João Serôdio jserodio@ua.pt P Todos Espetro de ação da fotoinibição em algas
de organismos fotossintéticos marinhos

Estudo do efeito de fators ambientais na fotoinibição (fotoinativação e reparação) em diferentes

96 João Serôdio jserodio@ua.pt P Todos Efeito de stressores ambientais na fotoinibição de microalgas estuarinas
grupos de microalgas estuarinas e marinhas

Estudo de como a presença das espécies de carnívoros pode ser condicionada por factores
Luis Miguel Rosalino, lmrosalino@ua.pt; Condicionantes ambientais à presença de mesocarnivoros em ambientes ambientais e ecológicos muito distintos em áreas predominantemente agrícolas e naturais. A
97 T/P Ecologia Aplicada 1 Marta Martins Alexandre 81238
Eduardo Ferreira elferreira@ua.pt Mediterrânicos: importância do contexto paisagístico repercursão desta variação de padrões entre populações da mesma espécie na conservação
destes predadores é discutida

98 Luis Souto lsouto@ua.pt P BMC Avaliação Biomolecular dos Efeitos pos-mortem - epigenetics of the death Avaliação Biomolecular dos Efeitos pos-mortem 1 Rita Sabino Abrantes de Pina 81152

99 Luis Souto lsouto@ua.pt P Molecular Genetic Tools in Food Forensics I 1 Luzia Georgeth Pereira de Sousa 75171

Aplicação de técnicas de biologia molecular tendo em vista a certificação de produtos

100 Luis Souto lsouto@ua.pt P Molecular Genetic Tools in Food Forensics II
alimentares.

EURO4SCIENCE 2.0 is an Erasmus + European Union funded Spin Off of a previous Forensic
Euro4Science 2.0 - Development of scientific based forensic "case files" as
101 Luis Souto lsouto@ua.pt P BA;BMC Science Educational Strategy (Euro4Science http://euro4science.eu) Promoting Scientific Literacy 3
a strategy to improve science education
and European Students Citizenship
Vestígios vegetais podem constituir importantes fontes de evidências, macro e microscópicas-
sementes, frutos, folhas, grãos de pólen e esporos. Na sequência de trabalhos anteriores
102 Luis Souto lsouto@ua.pt P Ciências Forenses - Botânica Forense pretende-se desenvolver novas ferramentas de aplicação em botânica forense como o catálogo 1
referenciado e ilustrado de grãos de pólen e um raionale biomolecular. Colaboração com Mestre
Rosa Pinho (Herbário).

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
A Entomologia Forense estuda sobretudo insectos para fins de apoio à investigação criminal,
especialmente na estimativa do intervalo post-mortem. Na sequência de trabalhos anteriores
pretende-se desenvolver um modelo animal para entomologia forense com caracterização em
103 Luis Souto lsouto@ua.pt P Ciências Forenses - Entomologia Forense 1
ambiente costeiro e tendo presentes as variações sazonais nos padrões de sucessão. Pretende-se
a conclusão de novas ferramentas de apoio à entomologia forense, como sejam um caálogo
ilustrado e um rationale de abordagem biomolecular.

A determinação de idade é uma questão relevante em múltiplas áreas, desde a identificação

CiênciasForenses - Biologia Forense :determinação genetico-molecular da
104 Luis Souto lsouto@ua.pt P individual forense à ecologia. Atualmente com recurso a técnicas de epigenética é possível 1
idade em vestígios forenses
considerar uma estimativa biomolecular da idade.
A perícia documental é uma área com considerável procura e que, exigindo elevada
experiência,recorre a instrumentação tipicamente utilizada pelos biólogos, razão porque é
105 Luis Souto lsouto@ua.pt P Ciências Forenses - perícia de documentos 1
realizada em centros de biologia. Pretende-se iniciar um percurso nesta área forense em parceria
com o NCForenses.
As novas tecnologias de sequenciação de genomas terão impacto em múltiplas áreas da
biomedicina e biotecnologia, à ecologia molecular. Na Genética Forense as atuais bases de dados
Ciências Forenses - Forensic Genetics under NGS Sequencing and genomic
106 Luis Souto lsouto@ua.pt T e os rigorosos critérios de validação colocam importantes questões na sua aplicação. Esta área 1
era
fortemenet promissora justifica uma revisão do estado da arte para possível desenvolvimento
experimental subsequente

Certas profissões como os músicos estão sujeitos a picos de stress na performance. O cortisol é
107 Luis Souto lsouto@ua.pt P Neurobiologia - Stress em Performance uma das variáveis em jogo. Na sequência de trabalhos prévios de avaliação dos níveis de cortisol 1
pretende-se enquadrar este tema numa investigação integrada e neurobiológica.

A investigação recente tem vindo a demosntrar a importância do sistema digestivo como parte da
108 Luis Souto lsouto@ua.pt T Neurobiologia - The enteric nervous system: our body's second brain homeostasia psico-neuro-imune. Esta área fortemenet promissora justifica uma revisão do estado 1
da arte para possível desenvolvimento experimental subsequente.

A edição de genes com desenvolvimento de metodologias de alteração precisa de alvos

Biologia do Genoma - New tools for genome editing, potential and genómicos em células vivas (ensaios CRISPR) é atualmente das técnicas com maiores expectativas
109 Luis Souto lsouto@ua.pt T 1
challenges no âmbito da biomedicina. Esta área fortemenet promissora justifica uma revisão do estado da
arte para possível desenvolvimento experimental subsequente.

O trabalho tem como objetivo aumentar o conhecimento sobre possíveis efeitos perniciosos de
Metodologias in vitro no estudo da toxicidade de nanopartículas e
110 Marcelino Miguel Oliveira migueloliveira@ua.pt P Vários BA; TE; BM nanopartículas de ouro e fármacos para organismos aquáticos e estudar mecanismos de ação
fármacos em organismos aquáticos
tóxica.

Em colaboração com Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental onde será

Marcelino Miguel
111 migueloliveira@ua.pt P Vários BA; TE; BM Alterações no proteoma de peixes induzido por contaminantes emergentes realizada a maior parte do trabalho laboratorial. Estudo da expressão de diferentes proteinas
Oliveira/Alexandre Campos
após exposição a nanopartículas e fármacos.

The main objectives of this study are: to determine if environmentally relevant concentrations of
Marcelino Miguel
Fish personality, memory and learning – The influence of pharmaceuticals human pharmaceuticals alter fish personality and learning ability; if there is particular personality
112 Oliveira/Inês migueloliveira@ua.pt P Vários BA; TE; BMC Tiago Santos; Mariana Sampaio 68949; 81233
and abiotic factors characteristic more sensitive to pharmaceuticals; how potential effects are modulated by abiotic
Domingues/Miguel Barbosa
factors.

Marcelino Miguel Alterações histológicas induzidas contaminantes emergentes em peixes Este trabalho pretende avaliar as principais alterações histológicas, induzidas em tecidos alvo,
113 migueloliveira@ua.pt P Vários BA; TE; BMC
Oliveira/Lourdes Pereira marinhos após exposição de organismos aquáticos a nanopartículas.

Marcelino Miguel Este trabalho visa o desenvolvimento e validação de biossensores que permitam detetar
114 migueloliveira@ua.pt P Vários BA; TE; BM Biossensores para deteção de respostas de stresse em peixes
Oliveira/Manuel Silva alterações na homeostasia dos peixes.

Marcelino Miguel Efeito biológico de micropartículas de materiais plásticos em organismos Este trabalho visa avaliar os efeitos bioquímicos de pequenas partículas resultantes da
115 migueloliveira@ua.pt P Vários BA; TE; BM
Oliveira/Manuel Silva aquáticos degradação física/química de materiais plásticos disponíveis comercialmente.

Margarida Fardilha; Maria mfardilha@ua.pt;mlourdespereir biologia molecular e Molecular mechanisms underlying the modulation of sperm motility by disruption of protein-
116 Modulation of sperm motility by Cell Penetrating Peptides Joana Santiago
de Lourdes Pereira a@ua.pt celular protein interactions using cell penetrating peptides

Methods:
Margarida Fardilha; Maria mfardilha@ua.pt;mlourdespereir biologia molecular e Yeast two hybrid screen
117 Sperm motility modulation using high throughput drug screening 1
de Lourdes Pereira a@ua.pt celular Cell biology
Molecular biology techniques
O objetivo principal deste trabalho é determinar os efeitos de inseticidas microbianos em
Maria Bordalo e Sá; João Impacto da exposição a inseticidas microbianos em invertebrados
118 maria.bordalo@ua.pt Vários BA, TE, EA diferentes parâmetros de história de vida de organismos aquáticos não-alvo, bem como 2
Pestana; Isabel Lopes aquáticos não-alvo
determinar alterações bioquímicas induzidas por esta exposição

The key for the success of the invasive Ruditapes philippinarum: a review Contribute for forecasting the invasiveness and distribution potential of R. philippinarum in
Marina Dolbeth; Ana Isabel
119 mdolbeth@ua.pt T Vários BA, BM, EA on the population dynamics in relation to its distribution patterns natural coastal areas, based on the literature review of the species traits relative its distribution
Lillebo
worldwide worldwide.

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.

Devido às propriedades da seda (biocompatibilidade, biodegradabilidade e condições suaves de

processamento), as nanopartículas deste material têm emergido como potenciais novos
nanotransportadores de fármacos anticancro. Pretende-se avaliar as alterações histológicas induzidas em
Maria de Lourdes Pereira e
120 mlourdespereira@ua.pt P Vários BA; TE Efeito de NPs de seda em órgãos de murganho diferentes órgãos de murganhos. aos quais foram administradas NPs de seda bem caracterizadas (ensaios já
Iola Duarte
realizados em instalações autorizadas da Fac. Farm da UL). O estudante estará envolvido na preparação de
cortes histológicos e na sua observação microscópica, com vista à caracterização das modificações
estruturais dos diferentes tecidos e da sua relação com as alterações metabólicas já identificadas.

Quantify how hypoxia-induced changes in biodiversity affect bioturbation levels in assembled

Marina Dolbeth; Ana Isabel How does hypoxia induced changes in biodiversity affect ecosystem
121 mdolbeth@ua.pt P Vários BA, BM, EA mesocosms. Bioturbation will be measured with luminophore tracers and quantified with
Lillebo functioning in coastal areas: 1. Bioturbation
modelling techniques.

Marina Dolbeth; Ana Isabel How does hypoxia induced changes in biodiversity affect ecosystem Quantify how hypoxia induced changes in biodiversity affect nutrient balance in water and
122 mdolbeth@ua.pt P Vários BA, BM, EA
Lillebo functioning in coastal areas: 2. Nutrient balance sediment samples from assembled mesocosms, with manipulated diversity.

Este trabalho tem como objectivo avaliar o impacto de eventos climáticos extremos, como o
Impacto de stresses multiplos (eventos extremos e eutrofização) em
123 Marta Lopes / Ana Lillebø martalopes@ua.pt P Vários BA, TE, BM, EA efeito da precipitação na variação da salinidade, combinado com outras pressões antrópicas,
bivalves
como a eutrofização, nas populações de bivalves.

Impacto da espécie invasora Arenicola marina na população de Diopatra A D. neapolitada possui um elevado interesse comercial e, como tal, o objectivo deste trabalho é
124 Marta Lopes / Ana Lillebø martalopes@ua.pt P Vários BA, TE, BM, EA
neapolitana na Ria de Aveiro avaliar o impacto da espécie invadora A.marina na população de D. neapolitana na Ria de Aveiro.

Utilização de Nereis como um controlador biológico de uma espécie O objetivo deste trabalho é testar uma espécie autoctone como um controlador biológico da
125 Marta Lopes / Ana Lillebø martalopes@ua.pt P Vários BA, TE, BM, EA
invasora espécie invasora Arenicola marina .

Marta Monteiro e Amadeu Uso de embriões de linguado na avaliação de susbtâncias desreguladoras Uso de embriões de linguado senegalês como modelo alternativo na avaliação ecotoxicológica de
126 mmonteiro@ua.pt P Vários BA; TE
Soares da tiróide químicos com ação de disrupção endócrina da tiroide, reguladora da metamorfose na fase larvar.

The project aims to test the hipothesis that mothers increase the variability in offspring
127 Miguel Barbosa miguel.barbosa@ua.pt P EA Maternal response of increased variability in temperature phenotypic traits in response to increase unpredictability in temperature. This project has a
strong practical component.

The aim of this project is to examine the variation in phenotypic fitness related traits across
geographical distribution. Theory expects that phenotypic variability to correlate with distance to
limit of geographical distribution of the species. In other orther, species are expected to display
128 Miguel Barbosa miguel.barbosa@ua.pt T/P EA Phenotypic variation across geographical distribution
greater variability in phenotypes near the bounderies of their geographical distribution than in
the middle. This projects will use dataset to investigate the range of distribution in the
phenotypes of several fish species of the North-atlantic.

Milene Matos E Eduardo milenamatos@ua.pt: Adaptar ou perecer? Que oportunidades para a biodiversidade no Análise da distribuição, abundância e co-existência de morcegos e carnívoros em ambientes
129 EA Rita Vale 64289
Ferreira elferreira@ua.pt Antropoceno muito humanizados.

milenamatos@ua.pt;
130 Milene Matos e Rosa Pinho EA Estudo da Arabis sadina no Parque Natural da Serra de Aire e Candeeiros Análise da distribuição e requisitos ecológicos de Arabis sadina numa área protegida portuguesa. Sandra Lourenço dos Santos 14986
rpinho@ua.pt

Milene Matos e Carlos milenamatos@ua.pt; Estão as Áreas Importantes para as Aves de Portugal Continental em bom Avaliar o estado de conservação das IBBA terrestres do território continental de Portugal,
131 EA Inês Vaz 50617
Fonseca cfonseca@ua.pt estado de conservação? inventariadas em 2002.

Mónica Amorim/ Vera Ecotoxicidade em invertebrados terrestres: efeitos bioquimicos de curto Avaliação de efeitos de compostos quimicos ambientais ao nível do stress oxidativo e
132 mjamorim@ua.pt/vmaria@ua.pt P Vários TE, BA, BMC
Maria prazo genotoxicidade em invertebrados terrestres.

Mónica Amorim/ Vera Ecotoxicidade em invertebrados terrestres; efeitos biológicos adversos a Avaliação de efeitos de agentes stressores ao nível do organismo, célular e molecular, ao longo
133 mjamorim@ua.pt/vmaria@ua.pt P Vários TE, BA, BMC
Maria longo prazo de várias gerações do ciclo de vida.

Olga Ameixa; Amadeu Neste trabalho pretende-se compreender a ecologia das comunidades de insetos do Baixo Vouga
134 olga.ameixa@ua.pt P EA; BA Ecologia e diversidade de Insetos no Baixo Vouga Lagunar
Soares Lagunar.

Efeito da salinização dos solos na abundância e diversidade de insetos: caso Neste trabalho pretende-se avaliar o impacto da salinização dos solos na abundância e
135 Olga Ameixa; Ana Lillebø olga.ameixa@ua.pt P EA; BA
de estudo do Baixo Vouga Lagunar diversidade de insetos do Baixo Vouga Lagunar.

Fish (Diplodus sargus ) were exposed to mercury and different brain areas were isolated. The
Patrícia Pereira e Mário
136 mpacheco@ua.pt P Vários BA; TE; BMC; BM; EA Searching for the vulnerability of specific brain areas of fish to mercury vulnerability of these specific brain areas to mercury exposure will be evaluated through a set of
Pacheco
oxidative stress endpoints.

Integrado na informatização do herbário da UA pretende-se, neste tema, estudar as coleções do

Contribuição para o estudo das coleções botânicas do Prof. Doutor
137 Paulo Silveira/Rosa Pinho psilveira@ua.pt T/P Vários BA, EA Prof. Doutor A. Reis Moura, recolhidas em diversos pontos do país, alguns de relevância 1
Armando Reis Moura
conservacionista e que serão alvo de novo estudo.

Roberto Martins e Susana Toxicity of anti-corrosion and anti-fouling modified coatings for maritime coatings in organisms
138 roberto@ua.pt; sloureiro@ua.pt T/P Vários TE, BM, BA, EA Effects of novel maritime coatings in marine organisms
Loureiro from different levels of the marine trophic chain

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
Roberto Martins e Susana
139 roberto@ua.pt; sloureiro@ua.pt TE, BM, BA, EA Effects of zinc derivatives in marine organisms Toxicity of zinc related compounds in organisms from different levels of the marine trophic chain
Loureiro T/P Vários
Toxicity and efficacy of novel anti-fouling nanomaterials as well as the free biocides and
Roberto Martins e Susana
140 roberto@ua.pt; sloureiro@ua.pt TE, BM, BA, EA Toxicity of novel anti-fouling nanomaterials in marine organisms unloaded nanomaterials will be assessed in several marine species towards a future 1 Joana Figueiredo 69776
Loureiro
T/P Vários implementation of REACH risk assessment

Rosa Freitas & Etelvina Avaliar a performance bioquimica de uma espécie de bivalves, provenientes de locais distintos,
141 rosafreitas@ua.pt Vários TE, EA, BM, BA A história de vida interessa?
Figueira quando exposta a diferentes stresses

Estudo da resposta de uma espécie de ostra num cenário de aumento de temperatura da água do
Rosa Freitas & Etelvina O impacto do aquecimento global e poluição em espécies de ostra: mar e em combinação com a exposição dos organismos a Arsénio. Durante o ensaio de
142 rosafreitas@ua.pt Vários TE, EA, BM, BA
Figueira respostas fisiológicas exposição serão medidos parametros fisiológicos dos organismos e no final do ensaio serão
determinados parametros de resposta bioquimica às diferentes condições de exposição

Rosa Freitas & Etelvina Alterações fisiológicas e bioquímicas em bivalves expostos a diferentes O objectivo deste trabalho é através de diferentes técnicas avaliar as respostas fisiológicas de
143 rosafreitas@ua.pt Vários TE, EA, BM, BA
Figueira condiçoes ambientais bivalves quando sujeitos a diferentes condições ambientais

Rosa Freitas & Etelvina Este trabalho tem como objetivo avaliar as respostas ao nível sub-celular (por meio de
144 rosafreitas@ua.pt Vários TE, EA, BM, BA Estudos dos efeitos de alterações ambientais em poliquetas
Figueira marcadores bioquímicos) de poliquetas quando sujeitas a alterações ambientais.

Rosa Freitas & Vânia Calisto Testar o efeito que differentes condições ambientais produzem na sensibilidade de bivalves e
145 rosafreitas@ua.pt Vários TE, EA, BM, BA Toxicidade de fármacos num ambiente em alteração
(Dep. Química) poliquetas a fármacos

Rosa Freitas & Victor Neto Testar os efeitos tóxicos de nanoparticulas de carbono: avaliação da performance bioquímica de
146 rosafreitas@ua.pt Vários TE, EA, BM, BA Toxicidade de contaminantes emergentes em bivalves e poliquetas
(Dep Mecânica) bivalves e poliquetas
Avaliar o estado ecológico de habitats alvo de restauro ecológico em termos de i) controlo de
Diversidade florística e funcional em comunidades florestais em processo
147 Rosa Pinho, Paula Maia rpinho@ua.pt, paula.maia@ua.pt P Ecologia Aplicada espécies e invasoras, ii) introdução de espécies nativas, iii) diversidade e resiliência das
de restauro ecológico – o caso de estudo do Cabeço Santo (Quercus)
comunidades.
Introdução do eucalipto em Portugal e suas consequências para a floresta
148 Rosa Pinho , Paulo Silveira rpinho@ua.pt, psilveira@ua.pt
autóctone

Rui Rocha & Amadeu Effect of microplastics on the ontogeny, physiology and metabolism of Developed in DBio & ECOMARE. Effect of microplastics on the ontogeny, physiology and
149 ruimirandarocha@ua.pt T/P Vários BA, BM, EA, TE
Soares marine fish larvae, under a 100 year climate change scenario metabolism of Solea senegalensis larvae reared under a 100 year climate change scenario.

Rui Rocha & Catarina The role of the Symbiodinium clade/type in the resistance of corals to Developed in DBio & ECOMARE. Study of the relevance of different Symbiodinium clades or types
150 ruimirandarocha@ua.pt T/P Vários BA, BM, EA
Marques environmental stressors on the resistance of corals from Atlantic and Indian oceans reefs to environmental stressors.

Salomé Almeida, Etelvina efigueira@ua.pt; Zinc and copper effects in freshwater diatoms: metabolomic and
151 P MBMC 1 Sara Isabel Bastos Gonçalves 63933
Figueira & Maria Kahlert salmeida@ua.pt biochemical status of Tabellaria flocculosa

Salomé Almeida & Maria
152
João Feio (MARE/UC)
salmeida@ua.pt; mjf@ci.uc.pt
P Vários
Use the Hydra tool (in AQUAWEB platform; http://aquaweb.uc.pt), based in machine learning
approaches, to develop model diatom communities of central Portuguese rivers. In a second
Predicting changes in algae (diatoms) communities from rivers under
BA; EA phase scenarios of climate change and mitigation measures will be simulated to predict changes 1
scenarios of global changes.
in algae distribution. Finally, based on models and simulations, the student will propose a plan of
measures for the disturbed rivers that account for future climate changes.

Salomé Almeida & Maria
153
João Feio (MARE/UC)
salmeida@ua.pt; mjf@ci.uc.pt
P Vários
The aim of this project is to propose a plan of action that promotes the enhancement of an urban
stream ecological quality and contribute to the city naturalization (Coimbra): assess the quality of
BA; EA Assessment and restoration planning of urban rivers an urban stream, by analysing diatom and invertebrate communities in selected stretches; assess 1
existing pressures and ecosystem services provided by the stream. Finally, a multi-criteria analysis
will be followed to propose adequate and cost-effective restoration measures.

Sérgio Marques, Ana Marta

Avaliação das alterações bioquímicas de diferentes fases do desenvolvimento de anfíbios
154 Gonçalves, Fernando sergio.marques@ua.pt P Vários BA, EA, TE Alterações bioquímicas em Anfíbios por acção de xenobióticos
expostos a xenobióticos.
Gonçalves
Sérgio Marques, Ana Sofia
Estudo da composição faunística e diversidade de anfíbios e répteis em grutas nos maciços
155 Reboleira, Fernando fjmg@ua.pt P Vários EA, BA Distribuição de anfíbios e répteis em grutas de Sicó. Joana Ferreira de Paiva Morais Soares 59906
calcários do centro de Portugal, identificando e mapeando a sua distribuição nestes habitats.
Gonçalves
Study of the seasonal variation of the skin microbiota of Lepomis gibbosus and also of its
Sérgio Marques, Fernando Seasonal variation of Lepomis gibbosus skin microbiota and its
156 sergio.marques@ua.pt P Vários EA, BA, M antimicrobial potential, in a lake under anthropogenic stress. Identification of the main Fausto Joaquim Ribeiro Sá 68431
Gonçalves antimicrobial potential, in a lake under anthropogenic stress.
agrochemical stressors and assessment of their effect on the skin microbiota.

Sérgio Marques, Fernando Avaliação do efeito de um produto fitofarmacêutico na capacidade Avaliar qual o efeito de um produto fitofarmacêutico na capacidade antimicrobiana da microbiota
157 sergio.marques@ua.pt P Vários BA, EA, TE, M Liane Isabel de Jesus Carvalho 50161
Gonçalves antimicrobiana da microbiota da pele de anfíbios da pele de P. perezi quais as potenciais consequencias.

Algumas lesmas do mar fotossintéticas são capazes de reter cloroplastos funcionais por longos
Sónia Cruz, Ricardo Calado,
158 sonia.cruz@ua.pt P BM Effect of light on the reproductive traits of photosynthetic sea slugs periodos de tempo. O efeito de diferentes níveis de luz na reprodução de lesmas fotossintéticas 1 Mariana Isabel Teixeira Ribeiro 81156
Paulo Cartaxana
será estudado para inferir sobre a importância da fotossíntese para estes organismos.

159 Ana Teresa Viana 63888

Sónia Mendo smendo@ua.pt P Microbiologia MM Desenvolvimento de metodologias de transformação de Pedobacter sp.

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4

 # Responsável email T/P Mestrado vários Mestrados Tema Descrição # Vagas nome aluno(a) nº mec.
Determinação dos efeitos genotóxicos (expressão de genes chave, mutações e danos no DNA)
Sónia Mendo/Joana Baixos níveis de radiação: consequências genéticas e riscos para animais e
160 smendo@ua.pt P Vários BMC/BA resultantes da exposição a resíduos provenientes de uma mina de urânio desativada em Ana Vaz 81224
Lourenço humanos
organismos indicadores.
Prediction the function of the genes present in the lanthipeptide’s biosynthetic clusters of
Sónia Mendo/Tânia Haloferax mediterranei genome and clone the genes of the biosynthetic clusters; Evaluate the
161 smendo@ua.pt P BMC Investigate the presence of lantipeptide´s genes clusters in Archaea Hugo Costa 81416
Caetano production of Archaea’s lanthipeptides in E. coli.

Purify by HPLC the antibacterials produced by Pedobacter sp. NL19 and evaluate the
Sónia Mendo/Tânia
162 smendo@ua.pt P Vários BMC/M Investigate antibacterial activity of Pedobacter sp. NL19 antibacterial activity againts Gram negative and Gram positive bacteria; If possible proceed to the Beatriz Almeida 81217
Caetano/ Cristina Esteves
identification of the produced compounds.

Susana Gomes /Mónica susana.gomes@ua.pt/mjamorim The aim is to investigate the effects of nanomaterials (e.g. nanopesticides) in the environment
163 P Vários BA; TE; BMC Molecular tools in nano-ecotoxicology
Amorim @ua.pt using molecular biology tools (from gene to organism) in ecotoxicology.

Susana Loureiro/Marta Análise de hidrocarbonetos policiclicos aromaticos em tecidos não

164 sloureiro@ua.pt T/P TE Marta Pena Gil Fraga 82045
Monteiro/Carlos Gravato invasivos de gestantes humanas.

Tânia Vidal, Fernando

165 taniavidal@ua.pt P Vários BA; TE Avaliação de toxicidade de sedimentos de rios 1 vaga. Avaliar a toxicidade de sedimentos de habitats lóticos no âmbito do projeto SHIFT
Gonçalves

Tânia Vidal, Helena

1 vaga. Comunidade microbiológica como ferramenta complementar da DQA usando novas
166 Oliveira, Fernando taniavidal@ua.pt P Vários BA; TE Desenvolvimento de novas ferramentas ecotoxicológicos Martha Raquel Pereira Santos 81308
metodologias (e.g. citometria de fluxo) no âmbito do projeto SHIFT
Gonçalves
Caracterização sociográfica e sócio-ambiental das comunidades de pescadores da Arte Xávega,
Ulisses Azeiteiro e Fátima
167 ulisses@ua.pt P BM Alterações Climáticas, Arte Xávega e Comunidades Piscatórias. tipologia das embarcações envolvidas e levantamento das perceções das comunidades em 1
Alves
relação ao seu entorno (pesca, conservação e alterações climáticas.

Composição e distribuição/ Abundância e Estrutura do plâncton gelatinoso na Costa

Ulisses Azeiteiro e
168 ulisses@ua.pt; fmorgado@ua.pt P Vários BA, BM, EA Plâncton Gelatinoso e Alterações Climáticas. Portuguesa e relações com circulação oceânica, padrões de variabilidade climática, 1
Fernando Morgado
padrões climatéricos regionais (atmosféricos-oceânicos) e upwelling.

Composição e distribuição/ Abundância e Estrutura do ictioplâncton na Costa

Ulisses Azeiteiro e Portuguesa, ecologia trófica e relações com circulação oceânica, padrões de
169 ulisses@ua.pt; fmorgado@ua.pt P Vários BA, BM, EA Ictioplâncton e Alterações Climáticas 1
Fernando Morgado variabilidade climática, padrões climatéricos regionais (atmosféricos-oceânicos) e
upwelling .

Levantamento da incidência de novas doenças, emergentes ou reemergentes, no Sul

Ulisses Azeiteiro e Mário Alterações Climáticas e Doenças Infeciosas: Risco Presentes e
170 ulisses@ua.pt P EA de Portugal e Madeira: relações com a variabilidade climática e análise da resposta 1
Pereira Futuros.
da infraestrutura de saúde ambiental e pública.

Estudo da resposta celular a nanomateriais com a finalidade de serem utilizados em terapias anti-
Virgília Sofia Silva &
171 vsilva@ua.pt T/P Vários BA; TE; BMC Desafios e estratégias em nanomedicina: Resposta celular a nanomateriais. tumorais. Serão estudados os processos celulares implicados na internalização celular, assim Joana Filipa Pereira Santos 81435
Mónica Cicuendez
como, as vias de sinalização intracelular afectadas.

Estudo da resposta celular a biomateriais com a finalidade de serem utilizados em regeneração

Virgília Sofia Silva & Novas abordagens em terapêuticas regenerativas: aplicações em
172 vsilva@ua.pt T/P Vários BA; TE; BMC de tecidos. Serão estudados processos celulares como a adesão, proliferação, diferenciação, Andreia Pereira Coimbra 82043
Mónica Cicuendez biomateriais.
morfologia e actividades enzimáticas.
Implementação de um modelo animal in vitro em toxicologia do meio aquático e sua
Desenvolvimento de um modelo alternativo para estudo de
173 Virgília Sofia Silva vsilva@ua.pt T/P Vários BA; TE; BMC; BM; EA caracterização através do estudo de biomarcadores para monitorização ambiental de
neurotoxicidade ambiental.
neurotoxicidade.
Implementação de novas metodologias de avaliação de neurotoxicidade em organismos
174 Virgília Sofia Silva vsilva@ua.pt T/P Vários BA; TE; BMC; BM; EA Avaliação de neurotoxicidade: desenvolvimento de novos biomarcadores. aquáticos. Serão testados diversos parâmetros bioquímicos ao nível sub-celular como
ferramentas para identificar efeitos neurotóxicos.

T/P- dependendo
Vários Mestrados:seseo atema parado
escolha mestrado inclui
Mestrado apenas uma
for "vários", componente
na coluna teórica
seguinte (T) ou quais,
especificar se engloba prática
usando (P) BA- Biologia Aplicada, TE-Toxicologia e Ecotoxicologia, M-Microbiologia, BMC-Biologia
as siglas:
Molecular e Celular, BM- Biologia Marinha, EA-Ecologia Aplicada
Descrição: sumário ou objetivos com máx. de 200 caracteres com espaços

DBIO Temas Mestrado 2016-2017-outubro -V4