GUÍA DE ESTUDIO No.

1: Fundamentos de bioquímica
Resuelva la siguiente guía de estudio; apóyese del capítulo 1 del libro “Fundamentos de
Bioquímica de Lehninger” 6ta. edición. Esta guía se evaluará con un examen corto, el
martes 30 de enero.
FUNDAMENTOS CELULARES
1. Liste y describa las seis características de los organismos vivos.
● Un elevado grado de complejidad química y de organización microscópica: Las
estructuras internas celulares están formadas por miles de moléculas diferentes
como polímeros muy largos, su estructura tridimensional única y su capacidad para
interaccionar con otras moléculas celulares además de ser específica y selectiva.
● La existencia de sistemas para extraer, transformar y usar la energía del entorno:
permite construir y mantener complejas estructuras y llevar a cabo el trabajo
mecánico, químico, osmótico y eléctrico a los organismos.
● La existencia de funciones definidas para cada uno de los componentes de un
organismo y la regulación de sus interacciones mutuas: la relación entre los
componentes químicos de un organismo vivo es dinámica, los cambios en uno de
los componentes producen cambios compensatorios en otro, de modo que el
conjunto posee un carácter propio, más allá del de cada parte individual, el conjunto
de moléculas lleva a cabo un programa que da la reproducción y la perpetuación,
que al final es la vida.
● Mecanismos para detectar y responder a las alteraciones en su entorno: Gracias a la
adaptación de sus procesos químicos internos o de su localización en el ambiente
que los rodea.
● La capacidad de autorreplicarse y autoensamblarse: cada célula contiene miles de
moléculas diferentes, algunas de ellas de una gran complejidad, a pesar de ella cada
bacteria es una copia fiel del original y toda la información para su construcción está
contenida en el material genético de la célula original. HERENCIA DE LOS GENES
PARENTALES.
● capacidad de cambiar a lo largo del tiempo mediante evolución gradual: Los
organismos varían sus estrategias vitales heredades en pasos muy pequeños para
sobrevivir. Se refleja a nivel molecular en la similitud de secuencias génicas y de
estructuras de proteínas.
2. ¿A qué hace referencia la lógica molecular de la vida?
La bioquimica describe en términos moleculares las estructuras, mecanismos
y proceso químicos compartidos por todos los organismos y define los
principios de organismos que subyacen en todas las diversas formas de vida,
principios a los que se refiere colectivamente como lógica molecular de la
vida

3. Mencione algunas aplicaciones de la bioquímica en otras ciencias.

proporciona conocimiento en
medicina
agricultura
nutrición
industria

4. ¿Cuáles son las funciones de la membrana plasmática?

Define la periferia d e la célula y separa su contenido del medio exterior. actúa como una
barrera a la libre circulación de iones inorgánicos y de la mayor parte de compuestos
cargados o polares. Está compuesta por lípidos y proteínas.
5. ¿Cuál es la diferencia entre citosol y citoplasma?
el citoplasma contiene la solución acuosa, el citosol y múltiples partículas mientras que el
citosol es la parte del citoplasma que permanece en el sobrenadante.
6. Realice un cuadro sinóptico en cual se observe la clasificación de los organismos vivos
según su fuente de energía y su fuente de carbono.
7. Mencione la función en la célula de los siguientes organelos: ribosoma, proteosoma,
mitocondria, retículo endoplásmico liso, retículo endoplásmico rugoso, aparato de Golgi,
peroxisoma, lisosoma, citoesqueleto (mencione sus tres tipos).
-*Ribosomas: tiene lugar la sintetización proteica a partir del ARN mensajero y degradacion
de proteinas
-*Proteosoma: tiene lugar la sintetización y degradacion de proteinas
-*mitocondria: donde tienen lugar la mayoría de las reacciones extractoras de energía de la
célula.
-*reticulo endoplasmatico liso: Modifica lípidos, colocando carbohidratos para que sean
coordinados.
-*reticulo endoplasmatico rugoso: Coloca carbohidratos, dando una post-traducción
-*Aparato de golgi: Empaquetamiento y transporte de proteínas fuera de la membrana de la
célula.
-*peroxisoma: Donde se oxidan los ácidos grasos de cadena muy larga
-*lisosoma: Degradan los desechos celulares innecesarios, están llenos de enzimas
digestiva.
-*citoesqueleto. Soporte estructural de las células facilitan el movimiento de orgánulos.
Filamentos de actina, microtúbulos y filamentos intermedios.

FUNDAMENTOS QUÍMICOS
8. Mencione las observaciones realizadas por Antoine-Laurent Lavoisier y Jacques Monod
respecto a la composición química de la vida.
Antoine-Lauren observó la relatividad simplicidad quimica del mundo mineral en contraste
con la complejidad de los mundos animales y vegetal: se sabia que estos ultimos estan
formados por compuestos ricos en carbono,oxigeno,nitrógeno,fosforo.
Jacques Monod: los organismos comparten un origen evolutivo común, basado en la
universalidad de intermediarios y transformaciones químicas denominado unidad
bioquimica.

9. ¿Qué elementos químicos conforman más del 99% de la masa celular? Describa las
caracteristicas de cada uno de ellos ¿Por qué se considera lógico que formen parte
importante en la composición de las biomoleculas?
Carbono, Nitrogeno, Oxigeno, Hidrogeno.
Son los elementos más ligeros capaces de formar uno, dos, tres y cuatro enlaces
covalentes.
10. Una molécula orgánica es una molécula compuesta por carbonos, el carbono
representa más del 50% de los componentes sólidos celulares. Describa las
características del carbono que explican su elevada participación en biomoléculas.
puede formar enlaces covalentes simples,dobles y triples y su capacidad de formar enlaces
simples muy estables con los cuatro elementos más comunes. Los carbonos enlazados
covalentemente en las biomoleculas, pueden formar cadenas lineales, ramificadas y
circulares, ningún otro elemento químico puede formar moléculas de tamaños, formas y
composición tan diferentes.
11. ¿Qué es un oligoelemento (o elemento traza)? ¿Por qué son necesarios en los
organismos vivos? representan una fracción minúscula del peso del cuerpo humano pero
todos ellos son esenciales para la vida, generalmente a causa de que resultan
imprescindibles para la función de proteínas específicas, incluidas muchas enzimas
12. ¿Qué átomos de los elementos mayoritarios son electrolitos?
R. Sodio, potasio, calcio y cloro
13. ¿Qué diferencia existe entre el consumo dietético diario de elementos mayoritarios y
oligoelemento?
R. Los elementos mayoritarios son componentes estructurales de células y tejidos y deben
estar
presentes en la dieta en cantidades diarias del orden de gramos, mientras las necesidades
de
oligoelementos son mucho menores, en el caso del hombre son suficientes unos pocos
miligramos
al día de Fe, Cu y Zn y todavía menos del resto de este conjunto de elementos.
14. ¿Qué grupos funcionales se encuentran frecuentemente en biomoléculas? Describa sus
características químicas.
características químicas.

Grupos Elementos que Presencia de Capacidad de Capacidad de Carácter

funcionales los conforman dobles ceder/donar formar acido,
enlaces protones puentes de básico y
hidrogeno neutro
Alcoholes ausente Grupo donador Capacidad de Acido o
de electrones formar base
puentes de debido al
hidrogeno afecto
inductivo
Aminas ausente Grupo donador Aminas Básico
de electrones primarias y
secundarias
presentan la
capacidad de
formar
puentes de
hidrogeno.
Aldehídos Presente, Grupo atractor No pueden Acido
doble enlace de electrones formar
carbono, puentes de
 oxigeno hidrogeno
entre si
Cetonas Presente, Grupo atractor No pueden Acido
doble enlace de electrones formar
carbono, puentes de
oxigeno hidrogeno
entre si
Ácido Presente, Grupo atractor Capacidad de Acido
carboxílico doble enlace de electrones formar
carbono, puentes de
oxigeno hidrogeno
entre la
molécula en
cuestión y el
agua.
15. Definir

Macromolecula: Polimeros de masa molecular aproxiamadamente de 5.000 construidos a

partir de precursores relativamente simples.

Oligomero: Polimeros caracterizados por ser más cortos.

Supramolecula: Macromoleculas que se unen entre si para la obtención de subunidades

funcionales como los ribosomas

16. Existen varias ciencias conocidas como “ciencias ómicas”, entre las que se

encuentran:
la metabolomica, genomica, proteomica, glicómica y lipidomica ¿Qué estudia cada una
de ellas?
*-Metabolómica: es la caracterización sistematica del metaboloma( es el conjunto de
moléculas pequeñas de una célula determinada en unas condiciones específicas se
denomina en condiciones muy específicas
*- Genómica: estudia la caracterización de las estructuras comparativa, la función, la
evolución y el mapeo de los genomas.
*-Proteómica: es la caracterización sistemática de este complemento de proteínas en
condiciones determinadas.
*-Glicómica: el glucómica de una célula es el conjunto de sus moléculas que contienen
glucósidos.

17. ¿Qué es la configuración de una molécula?

es la distribución tridimensional de los átomos que constituyen la molécula, los cuales

cambian debido a rupturas de enlace.

18 ¿Qué es la conformación de una molécula?

es la distribución tridimensional de los átomos que constituyen la molécula, los cuales

cambian

debido a la libertad de rotación

19. Qué es un isómero geométrico? ¿Quién los puede formar? ¿Qué tipos existen?

moléculas que tienen la misma cadena, pero que difieren en la posición de sus
sustituyentes.

Pueden ser cis o trans.

20. ¿Qué es un carbono quiral? ¿Cuántos estereoisómeros puede formar? ¿Qué es una

mezcla racémica?

es un carbono que posee 4 sustituyentes diferentes. Para saber el número de

estereoisomeros que pueden formarse se usa 2 n donde n es el número de centros quirales.

Una

mezcla racemica es la que contiene 2 enantiomeros en una cantidad equimolar

21.¿Qué tipos de estereoisómeros existen? ¿Cuál es la característica de cada uno?

se clasifican en enantiomeros y diastereomeros. Los enantiomeros son imágenes

especulares entre si y los diastereomeros no lo son.

22. ¿Por qué son importantes los isómeros en bioquímica? ¿En qué consiste la

estereoespecificidad?
la esteoesoecificidad es una propiedad de las enzimas y otras proteínas, la cual consiste en

distinguir entre estereoisomeros, para encajar o complementar con el adecuado.

FUNDAMENTOS FÍSICOS

23. ¿Qué es homeostasis?

cómo los sistemas de señalización específicos regulan las actividades de las biomoléculas,

dentro de una célula, dentro de un órgano y entre órganos

24. Explique en qué consiste en un estado estacionario dinámico.

consiste en mantener una constancia en la concentracion interna, diferente al equilibrio que

posee los alrededores, por medio de un aporte de energía contante.

25. En términos biológicos ¿Qué es un sistema? ¿Qué es el universo? ¿Qué tipos

de sistemas existen? ¿Qué tipo de sistema es un organismo vivo?

Para las reacciones químicas que tienen lugar en solución, se puede definir un sistema

como el conjunto de los reactivos y productos presentes, el disolvente que los contiene y

la atmosfera circundante o, dicho de otro modo, todo aquello incluido en una región

definida del espacio.

El universo es el conjunto del sistema y su entorno.

Los tipos de sistemas son: asilado, cerrado y abierto

Un organismo vivo es un sistema abierto, en el cual hay intercambio de energía y masa.

26. ¿Qué es una ruta metabólica? ¿Qué es metabolismo? ¿Qué tipos de

metabolismo existen en relación a la complejidad de las moléculas y energía?

¿Qué tipos de metabolismo existen en relación a los organismos que lo

desarrollan?

Una ruta metabólica o vía metabólica es una sucesión de reacciones químicas que

conducen de un sustrato inicial a uno o varios productos finales, a través de una serie

de metabolitos intermediarios. Las diferentes reacciones de todas las rutas metabólicas

están catalizadas por enzimas y ocurren en el interior de las células.

El metabolismo es la compleja red de rutas catalizadas por enzimas, tanto catabólicas

como anabólicas.

Endergónica y exergónica

Catabolismo y anabolismo.

FUNDAMENTOS GENÉTICOS Y EVOLUTIVOS

27. ¿Cuántos caracteres (pares de bases, pb) aproximadamente tiene el ADN de E.

coli? ¿Cuál es la longitud aproximada de una célula?

Tiene 4.64 millones de pares de nucleótidos)

El diámetro típico de las cellas animales y vegetales es de unos 5 a 100 micrómetros, y

muchos organismos unicelulares tienen un longitud de 1 a 2 micrometros

28. Considerando el dogma central de la biología molecular ¿Cómo una mutación

genética podría afectar la función de una proteína?

Pueden ser dañinas o incluso letales para el nuevo organismo o célula. Por ejemplo
puede provocar la síntesis de una enzima (proteína) defectuosa incapaz de catalizar una

reacción metabólica esencial. En algunos casos es favorecida.

29. ¿Qué es un tipo celular “salvaje”?

Se refiera cuando ocurre alguna mutación y que es favorecida sobre las no mutantes, las

células mutante sobrevivirian y prosperaran en el nuevo entorno miestras las células del

tipo salvaje (no mutantes) no dispondrían de nutrientes y perecerían

30. ¿En qué consiste la hipótesis del escenario de un mundo de ARN sobre el

origen de la vida (revise la figura 1-36 para responder)?

Surgió la idea de que el ARN precedió al ADN y a las proteínas, debido a que el ARN

puede actuar como catalizador de su propio proceso de formación.

Consiste en que el ARN surgió con moléculas cortas de secuencias al azar,

posteriormente se auto replicaba selectivamente que producían péptidos específicos.

Luego hubo coevolución de ARN y proteínas. Al final el ARN genómico empieza a

copiarse en forma de ADN.

31. Explique en qué consiste la teoría del endosimbionte para la evolución de los

organismos eucariotas. Por tratarse de una teoría basada en simbiosis ¿Cuál es la

ventaja para la célula y cuál para la bacteria?

Consiste en que las células primitivas eucarioticas eran incapaces de llevar a cabo la

fotosíntesis o de usar metabolismo aeróbico, envolvieron bacterias aerobias o

fotosintéticas para forma asociaciones endosmóticas, que finalmente se convirtieron en

permanentes. El proceso incluye la fagocitosis de una celula a otra que dio origen a la

mitocondria, que posteriormente fue fagocitada por otra celula y se formo el cloroplasto.

La ventaja para la celula es que se posee un organelo especifico para generar ATP que

es la moneda energética y realizar actividades celulares necesarias, las cuelas pueden

evolucionar y formar sistemas más complejos.

La bacteria se beneficiaba del medio al no tener tanta competencia debido a que las
otras ya no generaban su energía de la misma manera, por ser endosimioticos ahora.

32. ¿Qué es un gen homologo, paralogo, y ortologo? ¿Qué relación tiene cada uno

de ellos con las proteínas que expresan?

La homología es una interpretación de que una alta similitud entre dos secuencias se debe

a que las mismas poseen un origen común. Se dice que sus secuencias son

HOMOLOGAS y que las proteínas que codifican son homólogos.

Las secuencias o genes ortólogos son aquellas secuencias homólogas que se han
separado

por un evento de especiación. En otras palabras, las secuencias ortólogas son las

secuencias que se encuentran en diferentes especies y que son altamente similares debido

a que se han originado en un antepasado común

Si una misma especie contiene dos genes homólogos, estos dos genes y sus productos

proteicos se denominan PARÁLOGOS. En otras palabras, si un gen de un organismo se

duplica para ocupar dos posiciones diferentes en el mismo genoma, entonces las dos
copias

son parálogas

SE usa el concepto de homología de secuencias para predecir la función de un gen: si la

secuencia de gen A, cuya función es conocida, es homóloga a la secuencia de gen B,

cuya función es desconocida, puede inferirse que B podría compartir la función de A. En

la rama estructural de la bioinformática, la homología se usa para determinar qué partes

de una proteína son importantes en la formación de la estructura y en la interacción con

otras proteínas.