UNIVERSIDAD DE LAS FUERZAS ARMADAS - ESPE

DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA VIDA Y LA

AGRICULTURA
INGENIERÍA EN BIOTECNOLOGÍA

Integrantes: Carlos Aguirre

Jennifer Muñoz
Carolina Panchana
NRC: 2429
Fecha: 10-07-2017
Tema: VNTR

Objetivos

 Presentar las aplicaciones del VNTR por medio de un ejemplo.

Evolution of variable number tandem repeats and its relationship with genomic diversity
in Salmonella Typhimurium

Objetivo

Analizar las mutaciones ocurridas en cepas de Salmonella Typhimurium por medio de

MLVA y determinar si estas influyen o no en la presencia contínua de este microorganismo
en infecciones.

Resumen

Todos los genomas bacterianos tienen ADN repetitivo en múltiples loci (VNTR), los mismos
son usados en los estudios epidemiológicos. Multilocus VNTR análisis (MLVA) ha sido
establecido como un potencial epidiemologico en contra de microorganismo patógenos
como Salmonella entérica serovar Typhirium, Escherichia coli 0157 y han sido utilzados
para rastrear el origen de la infección. Salmonella Typhirium es la causante de la mayoría
de las infecciones en Australia de Salmonella.

El esquema múltiple loci VNTR análisis es: STTR9-STTR5-STTR6-STTR10-STTR3 es utilizada

de forma rutinaria para infecciones con Salmonella Typhirium. Pero los tipos endémicos de
MLVA presentan problemas en estos análisis presentan dificultades causadas por la
relación muy estrecha que existe entre una cepa causante de una infección y una que no lo
sea provocando la posible malinterpretación.

Los VNTR pueden mutar rápidamente. Los cambios pueden ocurrir en el mismo locus del
MLVA con no ancestros comunes. Los MLVA con una repetición diferente se consideran
como los más estrechamente relaciones aunque a menudo no reflejen la verdadera
filogenética relacionada a los aislamientos. Existe una necesidad por el mejor
entendimiento de las dinámicas de evolución en los cambios de repeticiones en VNTR.

Un total de 12112 muestras de Salmonella Typhirium fueron obtenidas de New South

Wales donde se realizo MLVA desde 2007 a 2014. S
Conclusiones

 Se encontró que la rangos medios de unidades repetidas de 8-14 en VNTR locus

STRR5, 6-13 en STRR6, y 9-12 en STRR10 son siempre predominantes en la
población.
 La prevalencia de infecciones causada por S. Typhimutium es influenciada por la
mutabilidad de VNTR
 El modelo de variación de MLVA y SNP estimo que el rango de mutacion de VNRP y
SNP con un radio de 1 cambio de VNTR por 6.9 cambios SNP. Estos cambios no
presentan ninguna relación.
 La existencia de S. Typhimurium con diferencia de repetición en un VNTR de tres
muy variables loci debería incrementar la vifilancia de los laboratorios públicos de
brotes de S. Typhimurium.