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BIOQUIMICA2018-A
PROBLEMARIO: ENZIMAS
1. Un análisis inicial de las tasas de reacción para la reacción en solución, con E0 = 0.10 µM
y varias concentraciones de sustrato S0, produce los siguientes parámetros de la ecuación
de Michaelis-Menten:
Vmax = 0.60 µM/s; KM = 80 µM.
Solución:
De la definición de Vmax tenemos:
Vmax k 2 E 0
k
Vmax 0.6 µM/s
6 s-1
E
2 0
0.1 µM
k1 K M k1 k 2 80 µM 2 µM 1s1 6 s1 154 s1
2. En experimentos de laboratorio, se utilizaron dos decarboxilasas (A y B) obtenidas
de diferente microorganismo (ver tabla). Decida cual enzima demuestra un mayor
coeficiente de especificidad, (V max/ K m), recuerde que entre mayor sea el valor del
coeficiente de especificidad más específica es la enzima por el substrato.
Enzima A Enzima B
[S] Velocidad [S] Velocidad
(mM) (M/min) (mM) (M/min)
0.0002 0.3373 0.005 0.3962
0.0002 0.3364 0.005 0.3857
0.0005 0.6945 0.01 0.6163
0.0005 0.6957 0.01 0.6413
0.001 1.0764 0.05 1.5606
0.001 1.1407 0.05 1.5689
0.005 1.9636 0.1 1.9862
0.005 1.7706 0.1 1.7909
0.01 2.0641 0.25 2.2011
0.01 2.0751 0.25 2.2047
Solución:
3.5000
y = 0.5081x + 0.4224
3.0000 R² = 0.999 Vmax =
KM =
2.5000
2.0000
-1
1.5000 Vmax/KM = 1.968 min
1.0000
0.5000
0.0000
3.0000
y = 10.814x + 0.4323
2.5000 R² = 0.9967 Vmax =
KM =
2.0000
1.5000 -1
Vmax/KM = 0.092 min
1.0000
0.5000
0.0000
0.05 0.1 0.15 0.2 0.25
La Enzima A es más específica
Tiempo Sustrato
(min) (M)
0 20.00
2 18.32
4 16.64
6 14.97
8 13.30
10 11.63
12 9.96
14 8.31
16 6.66
18 5.02
20 3.40
Utilizando la ecuación
S 0 S K V t
S M max
S
ln 0
ln 0
S S
25
(So-S)/[ln(So/S)]
20
15
10
25
Solución:
Se observa que se utilizó la ecuación de Hanes-Woolf [S]/v
S 1 S K M
v Vmax Vmax
Los datos del problema son: KM/Vmax 1/Vmax
m = 0.3684 s M-1
-KM
[S]
b = 590.6 s 1
0.3684
Vmax 2.7144 M s 1
Solución:
Re-arreglando la ecuación de Michaelis-Menten
v S
Vmax K M S
despejando [S] tenemos
3 M
S KM
9 M
1 1
1
1
v /Vmax 0.75
6.Calcule vi y el grado de inhibición causado por un inhibidor competitivo
bajo las siguientes condiciones:
a). [S]=2x10-3 M y [I]=2x10-3 M
b). [S]=4x10-4 M y [I]=2x10-3 M
c). [S]=7.5x10-3 M y [I]=1x10-5 M
Asume que KM=2x10-3 M, KI=1.5x10-4 M y Vmax=270 nM/min.
Solución:
En cada inciso calculamos la velocidad sin (v0) y con (vi) efectos de inhibición
a).
V S 270nM / min 2x10 6 nM 135nM / min
v max
K M S 2x106 nM 2x106 nM
0
V S
v max
270nM / min 2x10 6 nM 17.61nM / min
I
i
K 1 S 2x10 nM 1 2x106 nM
6
2x106nM
1.5x105 nM
M
K i
vi 17.61nM / min
K M S 2x106 nM 4x105 nM
0
V S
v max
270nM / min 4x105 nM
3.72nM / min
i
K 1 I S 2x106 nM1 2x10 6
nM
4x105nM
M
K i 1.5x105 nM
vi 3.72nM / min
V S
v max
270nM / min 7.5x10 6 nM 210.21nM / min
I i
K 1 S 2x10 nM1 1x10 nM
4
7.5x106nM
6
1.5x10 nM
M 5
Ki
vi 210.21nM / min
Solución:
a). La fórmula del grado de inhibición para inhibición competitiva es:
100I
i% S
K i 1 I
K M
Despejando [I]
2.9x104 M
% I K
I M 3.7 x104 M
v0 vi
v0 = vi
Solución:
Para un inhibidor no-competitivo el grado de inhibición está dado por
100I
i%
K i I
despejando KI 100 100 5
4
KI I 1 2x10 M 1 6.67x10 M
i% 75
Solución:
-7
v0 Vmax S 5.15x10 M / min 6x10 M 1.93x10-7 M / min
4
KM S 1x10-3 M 6x104 M
2.5x104 M
1 K 1 3x105 M
v I
2.07x108 M / min
KM S 1x103 M 6x104 M
i
-8
i% 1 i v 100 1 2.07x10 M / min 100 89.29%
v
1.93x10 M / min
-7
0
Solución:
Para un inhibidor competitivo la actividad relativa está dada por:
K M S
a I ; despejando [S]
K M 1 S
K i
I
a KM 1 K M
Ki
S 4.28x103 M
1 a
Solución:
Se observa que se utilizó la ecuación de Lineweaver-Burk
1 KM 1 1
v Vmax S Vmax
1/v
1/Vmax KM /V max
E t
kcat max
20 s
10 nM
1
app
V max 153.846 nM s 1
0.0065
K Mapp 260 V max 260 153.846 40,000 nM
Se observa que: K K app , y V V app
M M max max
Vmax
I
app
Vmax
1
K i
Despejando Ki
I 30,000
Ki 100,000 nM
V max 200
1 1
app
V max 153.846
Solución:
Para un inhibidor competitivo la relación [S]0 a [S]i para observar una misma velocidad es:
I
S i S 0 1
K i
Despejando Ki
Ki I 2x105 M
4
3.7x10 M
3
S i 1.5x10 M
1 1
S 0 7.69x105 M
13. Utilice los siguientes datos experimentales para obtener la concentración de sustrato
[S] en la cual se obtiene un grado de inhibición del 60 % para una reacción enzimática
en presencia de un inhibidor [I].
Solución:
Primero se determina qué tipo de inhibición se tiene, por lo tanto
Vmax Vmax
app
100nM / min
M
K M 999,860 nM < K app 2,999,900 nM
Ki
I
6,000 nM
2,999.52 nM
app
K 2,999,900nM
M
1 1
KM 999,860nM
Despejando [S] de:
100I
i% S
K i 1 I
K M
se tiene:
I 100
S K M K i 1 1 333,500 nM
i %
Solución:
Se observa que se utilizó la ecuación de Hanes-Woolf
S 1 S K M
v Vmax Vmax [S]/v
Vmax
k 904.8 s 1
cat
Et
2.7144 M s 1
0.003 M
Solución: Paso 1. Corregir cada lectura sustrayendo el cambio aparente en la disolución testigo ( 0S) en el
tiempo correspondiente.
1 2 3 4 5
S S S S S
0.49 0.71 1.1 1.36 1.45
0.95 1.42 2.14 2.64 2.90
1.46 2.16 3.28 - -
1.93 2.88 - - -
2.41 3.6 - - -
2.9 - - - -
Paso 2. Representar moles de sustrato transformado para cada concentración frente al tiempo
(Figura). Trazar la mejor recta para cada serie de puntos.
4
S
Sustrato transformado (µmol)
5
S
3
S
2
S
1
S
Tiempo (minutos)
De esta figura determinar la velocidad de sustrato transformado por minuto para cada concentración
de sustrato en el tramo lineal de cada curva. Estos valores serán las pendientes de las porciones lineales
y serán también las velocidades iniciales.
SOLUCIÓN
Poniendo v0 = 0,1 Vmáx
9 [S] = Km
Es decir, [S] = Km / 9
entonces [S]90% = 9 Km = 81
[S]10% Km/9
Problema 17
Las velocidades iniciales a varias concentraciones de sustrato para una reacción catalizada por una enzima hipotétic
[S] (moles/l) V (µmoles/min)
5x10-2 0.25
-3
5x10 0.25
5x10-4 0.25
-5
5x10 0.20
5x10-6 0.071
5x10-7 0.0096
SOLUCIÓN
a) Vmax = 0.25 µmol/min, ya que por encima de [S] de 5x10-4 no aumenta.
b) Porque todos los enzimas está ocupados transformando un sustrato.
c) Cero, todos los enzimas ocupados, a esa [S] se da la Vmax.
d) Empleando la ecuación de Michaelis, utilizando la velocidad 0.20, 0.070 ó 0.0096 y sus correspondientes [S], como sab
1,25 x 10-5 moles/l.
e) Sabiendo la Km y Vmax, aplicamos Michaelis utilizando esas [S], y
obtenemos: V = 0,018 µmol/min y V = 0,25 µmol/min.
f) A [2x10-3] la V = Vmax = 0,25 µmol/min. En 5 min 0,25 x 5 = 1,25 µmol. Tenemos 10 ml de sustrato, luego 1,25 µmol / 1
Problema 18:
Se estudió la actividad de la enzima ureasa, que cataliza la reacción:
CO(NH2)2+H2O CO2+2NH2
en función de la concentración de urea, con los resultados siguientes:
SOLUCIÓN
Los datos se ordenan en la forma adecuada para una gráfica lineal (por ejemplo, 1/V inicial frente a 1/[S], aunque existen otras fo
de nuestro estudio). La gráfica de la doble inversa se indica en la Figura. De la gráfica se puede calcular que K m es 105 mm
urea consumidos mg -1 min-1. Observar la distribución de los puntos y tener presente cuando se eligen los valores adecuado
planificar un experimento.
0.30
)
-1
0.24
1/V inicial (mg min mmoles
0.18
0.12
0.06
0.00
0.00 0.01 0.02 0.03 0.04
Problema 19
Se investigó el efecto de un inhibidor I sobre la velocidad de una reacción catalizada enzimáticamente sobre un solo
resultados
A) ¿De que manera actúa el inhibidor? B) Obténgase los valores para Vmáx, y Km.
SOLUCIÓN
A) La manera más sencilla de deducir cómo actúa un inhibidor es graficar 1/ en función de 1/[S]0 para cada concentración
7 1
1/ 0 (mol L -1 min-1 )
5 0.5
[I ] 0 (mmol L-1)
0
-15 -10 -5 0 5 10 15 20 25
A partir de la gráfica se puede observar que la pendiente de las curvas se modifica con los cambios en la concentración del i
eje 1/Vmax). Por ello los datos anteriores indican que el inhibidor I está actuando como un inhibidor competitivo.
B) De la intersección en el eje 1/ se puede estimar Vmax= 1(mol L -1 min-1) y de la intersección con el eje 1/[S]0 los valores d
Km=0,2(mmol L -1) con 0.5(mmol L -1) de inhibidor y Km=0,3 (mmol L -1) con 1(mmol L-1)
Problema 20:
A partir de los siguientes datos de una reacción enzimática, determinar de que manera está actuando el inhibidor. De
máxima.
[S] mM µg producto/h µg producto/h
(sin inhibidor) (6 mM inhibidor)
2 139 88
3 179 121
4 213 149
10 313 257
15 370 313
SOLUCIÓN
Se calculan los inversos de [S] y de v, producto sin inhibidor y producto con inhibidor y se representa. Sin inhibidor: Vmax
inhibidor: Vmax es la misma y Km=9 mM.
Problema 21:
Calcular qué velocidad se obtendrá en una reacción enzimática si la velocidad de la concentración de sustrato es a) 10 Km b) Km/3.
Sol.: a) 91 %; b) 25%
Problema 22:
Una enzima cuya Km es 2,4 · 10-4 M se ensaya con una concentración de sustrato de 2·10-7 M. Si la velocidad media para esta reac
de 5·10-2 M fue 0.128 mmoles/min, calcular la velocidad inicial en el caso anterior.
Sol.: 0.107 µmol/min
Problema 23:
Se detectó actividad de una determinada enzima en extractos de hígado y cerebro. Para dilucidar si la actividad detectada era at
en ambos órganos, o a especies distintas de la enzima propias de cada órgano, se llevaron a cabo estudios cinéticos con distintos s
ensayado siempre bajo idénticas condiciones en 1 ml de volumen total incluyendo 0,1 ml de extractos de cada órgano, resultó ser
velocidades iniciales:
Concentración de sustrato Velocidad (moles/min)
(moles/ml) Hígado Cerebro
1 0,14 0,085
2 0,23 0,14
5 0,39 0,23
10 0,50 0,30
Den las características de la enzima que puedan ser determinadas a partir de estos datos, y muéstrese cuáles de ellas son de interés en rel
las dos enzimas.
Sol.: los valores de Km son los mismos
Problema 24:
La fructosa difosfatasa (que cataliza la hidrólisis de la fructosa difosfato a fructosa-6-fosfato y fosfato) es inhibida por AMP. Los
partir de un estudio de la enzima del hígado de rata:
FDP (moles ml-1)
4 6 10 20 40
AMP (moles ml-1) Velocidad inicial (moles ml-1 min-1)
Problema 25:
Una determinada enzima cataliza la reacción A ↔ B. Se ha observado previamente que la Vmáx de esta reacción no
varía dentro de un rango de pH entre 5 y 9: Vmáx= 100 moles/min/g de enzima. Por otra parte, la Km varía según se
muestra en esta figura:
0,010
0,008
Km (M)
0,006
0,004
0,002
0,000
5 6 7 8 9
pH
El ensayo fue realizado en presencia de 0,01 M sustrato, y 1 g de enzima, en cada uno de los bufferes. ¿Qué velocidad inicial
se esperaría para pH 5.5 y 8? Explique.
Sol.: Para pH 5.5: 50 moles/min/g de enzima
Para pH 8: 100 moles/min/g de enzima
Problema 26:
Salmonella typhimurium una enzima (E) que cataliza la reacción A→P, se decidió hacer un estudio estructura cinético
Problema 27
La cinética de una enzima viene determinada como función de la concentración de sustrato en presencia y ausencia de