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Representación esquemática de los átomos (bolas negras) y los enlaces moleculares (barras blancas-grises)
de una molécula de C 60, es decir, un compuesto formado por sesenta átomos de carbono.
En química, una molécula (del nuevo latín molecula, que es un diminutivo de la palabra moles,
'masa') es un grupo eléctricamente neutro y suficientemente estable de al menos dos átomos en
una configuración definida, unidos por enlaces químicos fuertes (covalentes o enlace iónico).123456
En este estricto sentido, las moléculas se diferencian de los iones poliatómicos. En la química
orgánica y la bioquímica, el término "molécula" se utiliza de manera menos estricta y se aplica
también a los compuestos orgánicos (moléculas orgánicas) y en las biomoléculas.
Antes, se definía la molécula de forma menos general y precisa, como la más pequeña parte de
una sustancia que podía tener existencia independiente y estable conservando aún sus
propiedades fisicoquímicas. De acuerdo con esta definición, podían existir moléculas
monoatómicas. En la teoría cinética de los gases, el término molécula se aplica a cualquier partícula
gaseosa con independencia de su composición. De acuerdo con esta definición, los átomos de
un gas noble se considerarían moléculas aunque se componen de átomos no enlazados.7
Una molécula puede consistir en varios átomos de un único elemento químico, como en el caso
del oxígeno diatómico (O2),8 o de diferentes elementos, como en el caso del agua (H2O). 9Los
átomos y complejos unidos por enlaces no covalentes como los enlaces de hidrógeno o los enlaces
iónicos no se suelen considerar como moléculas individuales.
Las moléculas como componentes de la materia son comunes en las sustancias orgánicas (y por
tanto en la bioquímica). También conforman la mayor parte de los océanos y de la atmósfera. Sin
embargo, un gran número de sustancias sólidas familiares, que incluyen la mayor parte de
los mineralesque componen la corteza, el manto y el núcleo de la Tierra, contienen muchos enlaces
químicos, pero no están formados por moléculas. Además, ninguna molécula típica puede ser
definida en los cristales iónicos (sales) o en cristales covalentes, aunque estén compuestos
por celdas unitarias que se repiten, ya sea en un plano (como en el grafito) o en tres dimensiones
(como en el diamante o el cloruro de sodio). Este sistema de repetir una estructura unitaria varias
veces también es válida para la mayoría de las fases condensadas de la materia con enlaces
metálicos, lo que significa que los metales sólidos tampoco están compuestos por moléculas. En
el vidrio (sólidos que presentan un estado vítreo desordenado), los átomos también pueden estar
unidos por enlaces químicos sin que se pueda identificar ningún tipo de molécula, pero tampoco
existe la regularidad de la repetición de unidades que caracteriza a los cristales.
Casi toda la química orgánica y buena parte de la química inorgánica se ocupan de
la síntesis y reactividad de moléculas y compuestos moleculares. La química física y,
especialmente, la química cuántica también estudian, cuantitativamente, en su caso, las
propiedades y reactividad de las moléculas. La bioquímica está íntimamente relacionada con
la biología molecular, ya que ambas estudian a los seres vivos a nivel molecular. El estudio de las
interacciones específicas entre moléculas, incluyendo el reconocimiento molecular es el campo de
estudio de la química supramolecular. Estas fuerzas explican las propiedades físicas como
la solubilidad o el punto de ebullición de un compuesto molecular.
Las moléculas rara vez se encuentran sin interacción entre ellas, salvo en gases enrarecidos y en
los gases nobles. Así, pueden encontrarse en redes cristalinas, como el caso de las moléculas de
H2O en el hielo o con interacciones intensas pero que cambian rápidamente de direccionalidad,
como en el agua líquida. En orden creciente de intensidad, las fuerzas intermoleculares más
relevantes son: las fuerzas de Van der Waals y los puentes de hidrógeno. La dinámica molecular es
un método de simulación por computadora que utiliza estas fuerzas para tratar de explicar las
propiedades de las moléculas.
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Tipos de moléculas[editar]
Las moléculas se pueden clasificar en:
Moléculas discretas: constituidas por un número bien definido de átomos, sean estos del
mismo elemento (moléculas homonucleares, como el dinitrógeno o el fullereno) o de elementos
distintos (moléculas heteronucleares, como el agua).
Molécula de fullereno, tercera forma estable del carbono tras el diamantey el grafito
Primera generación de un dendrímero, un tipo especial de polímero que crece de forma fractal
Descripción[editar]
La estructura molecular puede ser descrita de diferentes formas. La fórmula molecular es útil para
moléculas sencillas, como H2O para el agua o NH3 para el amoníaco. Contiene los símbolos de los
elementos presentes en la molécula, así como su proporción indicada por los subíndices.
Para moléculas más complejas, como las que se encuentran comúnmente en química orgánica, la
fórmula química no es suficiente, y vale la pena usar una fórmula estructural o una fórmula
esqueletal, las que indican gráficamente la disposición espacial de los distintos grupos funcionales.
Cuando se quieren mostrar variadas propiedades moleculares, o se trata de sistemas muy
complejos como proteínas, ADN o polímeros, se utilizan representaciones especiales, como los
modelos tridimensionales (físicos o representados por ordenador). En proteínas, por ejemplo, cabe
distinguir entre estructura primaria (orden de los aminoácidos), secundaria (primer plegamiento en
hélices, hojas, giros…), terciaria (plegamiento de las estructuras tipo hélice/hoja/giro para dar
glóbulos) y cuaternaria (organización espacial entre los diferentes glóbulos).
Figura 1. Representaciones de la terpenoide, atisano, 3D (centro izquierda) y 2D (derecha). En el modelo 3D
de la izquierda, los átomos de carbono están representados por esferas azules; las blancas representan a los
átomos de hidrógeno y los cilindros representan los enlaces. El modelo es una representación de la superficies
molecular, coloreada por áreas de carga eléctrica positiva (rojo) o negativa (azul). En el modelo 3D del centro,
las esferas azul claro representan átomos de carbono, las blancas de hidrógeno y los cilindros entre los
átomos son los enlaces simples.
electrón, mientras que la de cada núcleo, con protones, será . Para estudiar este sistema
es necesario analizar el siguiente hamiltoniano cuántico:
(1)
coordenadas asociadas a las posiciones de los electrones vienen dadas por y la de los
núcleos atómicos vienen dadas por . Y las interacciones electrostáticas entre electrones y
(3)
definido sobre el espacio de funciones y donde es la posición de los núcleos que para el
análisis se considera fija. El resultado básico de este análisis viene dado por el siguiente resultado
matemático:
Teorema de Kato
Tosio Kato
La propiedad de ser autoadjunto implicará que las energías son cantidades reales, y el que sean
acotados inferiormente implicará que existe un estado fundamental de mínima energía por debajo
del cual los electrones no pueden decaer, y por tanto, las moléculas serán estables ya que los
electrones no pueden perder y perder energía como parecían predecir las ecuaciones del
electromagnetismo clásico. Dos resultados matemáticos adicionales nos dicen como son las
energías permitidas de los electrones dentro de una molécula:10
Además dentro de la mecánica cuántica puede demostrarse que pueden existir iones positivos
(cationes, con carga positiva comparable al núcleo atómico), mientras que no es igual de fácil tener
iones negativos (aniones), el siguiente resultado matemático implica tiene que ver con la posibilidad
de cationes y aniones:10
Teorema
debajo del umbral de ionización , además los estados ligados , con energías
satisfacen la cota exponencial