MICROBIOLOGIA AMBIENTAL

Introducción

PhD. Adriana Janneth Espinosa Ramírez

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 Contacto
Cubículo de Biología
Segundo piso central cerca secretaría de
Biología

Horario LUNES 10-12 am

adriana.espinosa@uptc.edu.co

Aula virtual microbiología ambiental

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 Microbiología
Es el estudio de los microorganismos, (< 1 mm)
Encargados de muchas diversas reacciones

Industria del queso, yogurt, pan

Producción de alcohol y otros biocombustibles

Ubiquidad están en todas partes de la naturaleza:

- suelo, aire, agua, biota

•
Microorganismos responsables de impactos directos en
matricez ambientales:

- Transmisión de enfermedades
- Malos olores y sabores (H2S Sulfuro de hidrógeno)
- Biocorrosión de superficies
- Romper materia orgánica (DBO)
- Degradación polutantes
- Bioadsorbentes
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 Bacterias
• Procariotas
• Pared celular de
peptidoglicano
• Fisión binaria
• Obtienen energía
de compuestos
orgánicos e
inorgáncos y por
fotosintesis
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 Archaea:

• Procariotas
• Sin peptidoglicano
• Viven en ambientes
extremos
• Grupos
– Metanógenos
– Halófilos Extremos
– Termófilos Extremos
Halobacteria

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• Eucariotes Fungi
• Pared celular de
quitina
• Usan compuestos
orgánicos para
obtener energía
• Los mohos y
hongos y levaduras

• Forman micelio y
otros son
unicelulares MICROBIOLOGIA AMBIENTAL
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 Protozoos
• Eucariotes
• Absorben o ingieren
materia orgánica
• Móviles por
pseudopodos, cilios,
or flagelos
• Son de vida libre y
algunos parásitos

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 Algas
• Eucariotas
• Pared celular de
celulosa
• Obtienen energía por la
fotosíntesis
• Producen oxígeno
moleculas y sintetizan
compuestos orgánicos
• Metabolicamente
diversas
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UPTC AJER Figure 1.1d
 Virus
• Acelulares
• Material genético de
ADN o ARN
• Cubierta protéica
• Envoltura lipídica
• Virus se replícan
unicamente en una
célula viva
• Todos parásitos
• Virus de bacterias son
bacteriofagos
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Por qué estudiar microbiología?

– Presentes en todos los ambientes

– Aspectos benéficos, procesos biológicos
– Asociados a procesos de biosfera(cadenas
alimenticias, ciclaje de nutrientes
– Pocos son patógenos
– Aplicaciones biotecnológicas para producir
compuestos de interés: antibióticos,
combustibles, pigmentos, etc

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Cambios paleobiogeográficos debidos cambios geográficos

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http://cns.utexas.edu/news/you-are-your-microbiome 16
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 La microbiología ambiental

Es el estudio de los
microorganismos que existen en ambientes
naturales o artificiales.

El ambiente en que vivimos se ha determinado en

gran medida por la actividad de los
microorganismos que interactúan entre sí y con su
entorno inmediato.

Las células microbianas aisladas son capaces de

llevar a cabo sus funciones vitales de crecimiento,
generación de energía y reproducción
independiente de otras células.
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HITOS MICROBIOLOGIA

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Los primeros seres vivos del planeta
fueron microorganismos, muy
posiblemente anaeróbicos, y puede
pensarse que durante más de mil
millones de años a partir de su
aparición en los mares, los únicos
habitantes de nuestro planeta fueron
estos seres microscópicos.

Se conocen fósiles microbianos cuya

edad ha sido fijada en 1600 millones
de años.

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LOS SERES VIVOS EUCARIOTAS SOMOS BACTERIAS COMPLEJAS

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 AMBIENTES EXTREMOS
Parque Yellowstone, Estados Unidos

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AJER
CIANOBACTERIAS
Son los microorganismos aeróbicos
fotoautotróficos, mas antiguos sobre el planeta.

Estas organismos son conocidas

como las “originadoras de la vida”.

 Según registros fósiles

(estromatolitos), habitan la superficie
terrestre desde el Eon Arquense
(3300-3500 millones de años).

Por haber sido los primeros

productores primarios, liberando
oxígeno, fueron las originadoras de
laAJER
atmósfera
MICROBIOLOGIA AMBIENTAL UPTCprimitiva.
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 ESTROMATOLITOS

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AJER
 Presencia de fósiles
ARCHEAS y
CIANOBACTERIAS

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MICROBIOLOGIA AMBIENTAL UPTC
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 El progreso y el desarrollo de la microbiología tuvieron que esperar la
disponibilidad de herramientas, técnicas y procedimientos que
pudieran aplicar al estudio de estas pequeñas formas de vida.

Aunque se sospechaba la
existencia de organismos minúsculos su
descubrimiento estuvo relacionado con la invención
del microscopio.

1. Los hermanos Jansen inventaron

en 1590 el llamado microscopio compuesto.

2. En 1676 Antony van Leeuwenhoek, un

vendedor de paños holandés sin formación
científica, y gran pulidor de lentes, consigue
hacer el microscopio simple dotado de lente
esférica una herramienta útil, describe las
bacterias, a los que llama "animáculos" o
pequeños animales.

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 MICROSCOPISTAS

• Uno de los grandes

microscopistas del siglo XVII
fue Anton van
Leeuwenhoek (1632-1723)

Describió los espermatozoides, glóbulos rojos, bacterias y, de forma

destacada, de protozoos de aguas estancadas. 37
El desarrollo de la Biología Celular

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 Jhon Snow 1854

Médico inglés
Relación de calidad
del agua con el
cólera

radicó en romper con la teoría miasmática

de la enfermedad,

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fue necesario idear otras técnicas para el estudio de
los microorganismos, su desarrollo como ciencia
independiente se debe a que respondió
interrogantes como

¿Existe la generación espontánea?

¿Cuál es la causa de las enfermedades

infecciosas?

A dicho desarrollo contribuyo Pasteur cuando

demostró que la vida no se originaba
espontáneamente y que las bacterias que
aparecían en los alimentos putrefactos se
deben a la presencia en el aire de estas.

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• Louis Pasteur demostró que el
aire es una fuente común de
microorganismos y que éstos
aparecían en caldos nutritivos
debido al aire contaminado y
no espontáneamente.
• Pasteur resumió sus
conclusiones en su libro “Sobre
las partículas organizadas que
existen en el aire” que
prácticamente cerró la
discusión sobre la generación
espontánea a favor de la
biogénesis. MICROBIOLOGIA AMBIENTAL 43
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 Fermentación y Pasteurización
• Mostró que los microorganismos son
responsables de la fermentación (la
conversión del azúcar en alcohol) por
crecimiento microbiano
• Bacteria usan los azúcares y pueden
transformarlo a alcohol o producir ácido
acetico, transforman el vino en vinagre.
• Con calor alto se pueden eliminar las
bacterias sin afectar el alcohol y se desarrollo
la pasteurización
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1860s:
Joseph Lister usó un desinfectante químico para prevenir
infecciones en las cirugías, después de observar el trabajo de
Pasteur que demostró que los microbios están en el aire, que
causan contaminación de alimentos y causan enfermedades en
animales.
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 TEORIA MICROBIANA DE LA ENFERMEDAD
POSTULADOS DE KOCH (1834)
El agente patógeno debe estar
presente en los individuos
enfermos

El microorganismo debe poder

aislarse del huésped enfermo
en cultivo puro

El microorganismo crecido en
cultivo puro, al inocularse en
animales sanos, induce en
ellos la enfermedad

De estos animales
experimentales inoculados y
ya enfermos, se puede volver a
aislar el microorganismo

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Cambio de escala de observación!!!

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CELULA
PROCARIOTE

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Bacteria Archea Yeast - Fungi

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Microorganismos

Facilitan muchas reacciones naturales en la biosfera

Rompen la materia orgánica

Utiles en biorremediación

Algunos son patógenos para otros seres vivos

BIOMASA total aproximadamente 5×1030 bacterias

Se reproducen rápidamente por FISION BINARIA

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 Uso de las Eubacterias
en tecnología e industria

• BIOMASA, proteínas

•En la producción de QUESOS, YOGURT, VINAGRE

•Fabricación de MEDICAMENTOS, antibióticos de bacilos

•PRODUCTOS QUÍMICOS: ÁCIDOS ORGÁNICOS, SOLVENTES

•Procesos como TRATAMIENTO DE AGUAS RESIDUALES

•ENZIMAS: amilasas, catalasa lactasa, etc.

•Biocombustibles, y biopesticidas

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INDUSTRIA
ALIMENTARIA
• DETERIORO DE ALIMENTOS
• FERMENTACIONES DESEABLES
(YOGUR, QUESO, EMBUTIDOS,
BEBIDAS ALCOHÓLICAS, etc.)
• OTRAS APLICACIONES: PRODUCCIÓN
DE FRUCTOSA, ASPARTAME, ÁCIDO
CÍTRICO
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 Enfermedades de Transmisión
alimentaria y microorganismos
responsables

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 Alimentos y bebidas

Saccharomyces cerevisiae LEVADURA PAN VINO

Cándida milleri LEVADURA CERVEZA
Lactobacillus sanfrancisco BACTERIA PAN
Gluconobacter suboxidans BACTERIA VINAGRE

Productos químicos industriales

Saccharomyces cerevisiae ETANOL

LEVADURA ETANOL
Kluyveromyces fragilis LEVADURA ACETONA -
Clostridium acetobutylicum BACTERIA BUTANOL
Xanthomonas campestris BACTERIA POLISACARIDOS
Aspergillus niger HONGO ACIDO CITRICO

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Enzimas

Aspergillus oryzae HONGO AMILASAS

Aspergillus niger HONGO GLUCAMILASA
Saccharomyces cerevisiae LEVADURA INVERTASA
Bacillus BACTERIA PROTEASAS

Polisacáridos
Leuconostoc BACTERIA DEXTRANO
mesenteroides

Vitaminas

Eremothecium ashbyi LEVADURA RIBOFLAVINA

Pseudomonas denitrificans BACTERIA VIT. B12
Propionibacterium BACTERIA
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 BIOTECNOLOGÍA

• USO DE MICROORGANISMOS EN
PROCESOS INDUSTRIALES A GRAN
ESCALA
• APLICACIÓN DE PROCEDIMIENTOS
GENÉTICOS PARA PRODUCIR NUEVOS
ORGANISMOS CAPACES DE
SINTETIZAR PRODUCTOS ESPECÍFICOS
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BIOPLASTICOS
Polihidroxialcanoatos
Polihidroxibutiratos

fototrofa Rhodovibrio
sodomensis con
gránulos de PHB

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 Proteínas recombinantes que hoy se comercializan y emplean como fármacos en
humanos.

PRODUCTO INDICACIÓN TERAPÉUTICA

Factores de coagulación Hemofilia

Insulina Diabetes mellitus

Hormona de crecimiento Deficiencia de la hormona en niños

Eritropoyetina (EPO) Anemia

Interferón alfa Hepatitis B y C, cáncer

Vacuna anti-hepatitis B Inmunización contra hepatitis B

Anticuerpos monoclonales recombinantes Asma, artritis reumatoidea

Proteína C Sepsis severa

Beta-glucocerebrosidasa Enfermedad de Gaucher

DNAsa Fibrosis quística

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Enzimas producidas en bacterias y en hongos genéticamente modificados, y que
actualmente se usan en la industria alimenticia:

ENZIMAS APLICACIÓN
Alfa-amilasa Pan, bebidas, almidón

Aminopepetidasa Queso, lácteos, sabores

Fosfolipasa Pan, grasas

Glucosa isomerasa Almidón

Hemicelulosa Pan, almidón

Lactasa Lácteos

Lipasa Grasas, quesos, sabores, pan

Pectinasa Bebidas, derivados de frutas

Proteasa Queso, pan, bebidas, derivados de carne

y pescado
Quimosina Queso
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Xilanasa Bebidas,
UPTCalmidón,
AJER pan
 ENERGÍA

• PRODUCCIÓN DE METANO
• ACCIÓN SOBRE PETRÓLEO CRUDO
• FUENTES ALTERNATIVAS DE ENERGÍA:
ORGANISMOS FOTOSINTÉTICOS,
BIOCOMBUSTIBLES

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 Biotecnología en procesos minero-
metalúrgicos:
► extracción de cobre, uranio, cobalto, oro y plata.
► Se están haciendo esfuerzos importantes para
conseguir su implantación a escala industrial en el
tratamiento de otros minerales.
► Biodecontaminación
► Biogénesis
► Biocorrosión
► Generación de drenajes ácidos de minas
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TRATAMIENTO RESIDUOS LIQUIDOS

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TRATAMIENTO
BIOLÓGICO

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