BIOQUIMICA GENERAL

Bioquímica es el estudio de las bases moleculares de la vida. Los principios químicos

de algunos de los procesos centrales en la biología son bien comprendidos y hay vías
moleculares comunes que caracterizan las diversas expresiones de la vida.

Niveles de Complejidad de los Seres vivos:

Los seres vivos están formados por diferentes elementos, entre los que son más
abundantes el C, H, O, N, etc. las causas o motivos que determinan la presencia de estos
elementos, y no la de otros son :

- Forman fácilmente enlaces sencillos y dobles.

- Son frecuentes los enlaces covalentes.
- Son elementos muy ligeros.
- Pueden formar esqueletos lineales o cíclicos.
- Se pueden introducir o ligar una gran cantidad de grupos funcionales.
- Los átomos más comunes o numerosos son los más idóneos o adecuados
evolutivamente (existe selección)

A partir del siglo XIX se acepta la “Teoría Celular” en la que se postula que las
células presentan semejanzas estructurales y funcionales.

Los seres vivos están integrados por moléculas inanimadas, estas moléculas se
ajustan a las leyes físicas y químicas + algunas características propias:

- Elevada complejidad.
- Alto grado de organización.
- Función específica.
 - Extraen o transforman energía.
- Producen una réplica exacta de sí mismos.
- Ejercen acciones mutuas de acuerdo con otro conjunto de principios
denominados “Lógica Molecular de la Vida”.
- Las biomoléculas se organizan para formar macromoléculas y están formadas
por moléculas más sencillas con una gran cantidad de funciones)
- En la organización molecular de la célula existe una simplicidad fundamental.
- La identidad de cada uno de las especies de organismos está preservada por su
posesión de un conjunto distintivo de ácidos nucléicos y proteínas.
- Hay un principio fundamental de economía molecular.

Los organismos vivos crean y mantienen su ordenación esencial a expensas de su

entorno, al que transforman haciéndolo cada vez más desordenado y caótico, por lo tal los
organismos vivos se consideran como sistemas abiertos (por el intercambio de materia y
energía). La célula viva es una máquina química isotérmica.

Las reacciones catalizadas enzimáticamente tienen un rendimiento mucho más

elevado y una gran especificidad : . “La especificidad de las interacciones moleculares
en las células es el resultado de la complementaridad estructural de las células
interactivas” .

Las reacciones catalizadas enzimaticamente no se realizan independientemente,

sino que se relacionan entre sí y constituyen secuencias de reacciones consecutivas : .
A------- B------- C ------- D ------- E ------- F ------- Hay rutas específicas,
transferencia de energía química (desde su liberación hasta los lugares en donde se
requieran).

Autorregulación: La secuenciación de reacciones permite la regulación metabolica

: . hay un autoajuste (inhibición Feed-Back) : . máxima eficiencia y economía.
 Autorreplica: “Los símbolos en los que se halla codificada la información genética
en el DNA, son de dimensiones submoleculares” (existe también complementaridad
estructural). “La información unidimensional del DNA es transferida a la información
tridimensional inherente a los componentes macromoleculares y supramoleculares de los
organismos, gracias a la traslación de la estructura del DNA a la estructura protéica.

: .

Una célula viva es un sistema abierto isotérmico de moléculas orgánicas, que se

ensambla, ajusta y perpetúa por sí mismo y opera según el principio de máxima
economía de partes y procesos; promueve muchas reacciones orgánicas ligadas
consecutivamente, destinadas a la transferencia de energía y a la síntesis de sus
propios componentes, por medio de catalizadores orgánicos que ella misma produce.

Moléculas de la vida:

A.- El Agua

El agua representa del 70-90% del peso de la mayor parte de las formas de vida.
Sus productos de ionización (iones de hidrógeno e hidroxilo) son importantes en la
determinación de la estructura y las propiedades biológicas de las proteínas, ácidos
nucléicos, membranas, ribosomas, etc.

Propiedades:

1.- Cohesión interna elevada .- La atracción molecular o elevada cohesion interna es

explotada por las plantas superiores para el transporte de los elementos nutritivos en
disolución (los iones modifican la estructura del agua líquida). Esta característica la
 –1
proporciona al agua un elevado calor de vaporización ( H= 540 cal ) por lo que les
sirve a los organismos como un muy eficaz tampón térmico. El agua tiene un elevado
calor latente de fusión : . se requiere más calor para efectuar un cambio de estado.

2.- Estructura.

Su disposición electrónica le comunica una simetría dieléctrica cuyo ángulo de

enlace H – O -- H = 104.5º y la distancia interatómica H – O = 0.0965 nm. Hay
atracción electrostática mediada por puentes de hidrógeno, entre los oxígenos de diferentes
moléculas (4). La longitud del enlace de hidrógeno es 0.177 nm (4.5 kcal/mol -1 ) y
existen además enlaces covalentes (110 kcal/mol –1)

En el hielo se forma una red tetraédrica que es un enrejado abierto : . < densidad
del estado sólido que el líquido a diferencia de una gran cantidad de otros compuestos.
Debido a esta característica el agua sólida sirve como un aislante térmico en mares, lagos
y ríos.
 En la estructura del agua líquida la distancia media O – O es ligeramente menor
que la del hielo ( L = 0.29 y S = 0.276 ) ; a 100º C el agua aún mantiene su ligamiento
por enlaces de hidrógeno, aunque estos enlaces se forman y escinden a elevada velocidad.
Al modificar la temperatura obviamente la longitud del enlace O – O varía, a 15ºC = 0.29 ,
mientras que a 85º C = 0.305 .

3.- Propiedades del Agua.

El enlace de hidrógeno puede formarse entre las diferentes moléculas de agua o con
otras moléculas de importancia, como grupos hidroxilo, carbonilo, cadenas polipeptídicas,
bases nitrogenadas, etc. Hay competencia entre estos compuestos con el agua para formar
el enlace de hidrógeno, aunque existe cooperatividad.

El agua es un buen solvente debido a su constante dieléctrica (a las fuerzas de

atracción electrostática) que es F= 80 : . solubiliza compuestos iónicos o no iónicos
(polares) como azucares, alcoholes, aldehídos y cetonas (debido a que se establecen
enlaces de hidrógeno con sus grupos funcionales).

El agua solubiliza, formando micelas a compuestos o moléculas anfipáticas o que

contienen grupos fuertemente polares + no polares (ácido oléico, oleato sódico, algunas
proteínas y ácidos nucléicos).

Grupo carboxilo polar (hidrofilico)

Cadena hidrocarbonada no polar (hidrofóbica)

Fuerzas de Van der Waals : .

atracción hidrofóbica.

Las sales disueltas tienden a cambiar la estructura normal del agua líquida (cambio
de enlaces, distancia intermolecular, propiedades, etc) por ejemplo: bajan el punto de
ebullición, baja la presión de vapor, diferente presión osmótica, etc. : . hay un gran efecto
de los solutos sobre las propiedades del agua.
Ionización del Agua.

El agua tiene una tendencia a disociarse debido a la masa del hidrogeno unido
covalentemente al Oxígeno : .

H H H
O ------ H---- O O ----- H + OH –
H H
Ion Hidronio Hidroxilo

Producto Iónico del Agua.

El producto de disociación ionica del agua es un proceso de equilibrio:

( H ) ( OH )
H2O ---------------- H + + OH - : . K eq = ------------------------ y
( H2O )

Kw = 1 x 10 – 14 . A 15 º C en medio La ( H2 O ) en mayor en el agua

ácido hay > ( H ) y en medio alcalino pura y la ( H ) ( OH ) es menor
( H ) y esto constituye la base para : . la concentración molar del agua
la escala de pH no cambia por la ligera ionización
Kw (H ) (OH )

SPL Sorensen : 0.0000001 o 1 x 10 –7

1
pH = log 10 ------- = - log 10 ( H )
( H ) 1
En una disolución neutra a 25 ºC ( H ) (OH ) = 1.0 x 10 –7 M. : . pH = log ------ = 7.0
1x 10-7
Medida del pH.

1.- Por electrodos de hidrógeno ya que hay una diferencia de potencial, Se usa otro
electrodo de referencia.
2.- Por electrodos de vidrio en donde se usan diversas sustancias de referencia.
3.- Por indicadores ácido - base en donde se emplean colorantes que son ácidos débiles y
el grado de color depende de el ( H ) : .
Indicador - ( H ) --------------------- Indicador + ( H )
Incoloro Coloreado.

Ácidos y Bases.

Las reacciones bioquímicas se realizan en diversos medios ácidos – básicos , los

cuales son aveces extremos, por lo que es necesario su análisis.

Lewis : Ácido = Potencial aceptor de pares de electrones.

Base = Sustancia que puede actuar como dadora de pares electrónicos.

Brönsted- Lowry : Ácido = Dador de protones.

Base = Aceptor de protones.

Existe afinidad entre los conjugados ácido – base, por lo que depende de esto tanto
la presencia de ácidos y bases fuertes, como débiles.

La tendencia de disociación de un ácido o base se denomina constante de

disociación (K), la que se determina con curvas de valoración con NaOH en el caso de un
ácido y viceversa con una base. Esta curva de valoración puede expresarse por la Ecuación
de Henderson – Hasselbach :
Funciones de la Ecuación de Henderson – Hasselbach :

1.- Permite el cálculo de pK de diferentes ácidos conociendo la ( M ) de aceptores y

dadores a un pH determinado.
2.- Sirve para el cálculo de pH de un conjugado a un determinado pK.
3.- Determinación de la relación molar del ácido y su base conjugada, si se conocen el pH
y el pK.

Tampón.

Sistema donde los conjugados tienden a impedir los cambios de pH cuando se

añaden iones. Los fluidos inter y extracelulares se comportan como tales, por ejemplo los
fosfatos orgánicos como la glucosa 6 fosfato y el ATP; los carbonatos de mucha
importancia en la respiración; etc. : . son muy importantes en la actividad enzimática y
por lo mismo en el metabolismo.

pH de algunos fluidos y componentes celulares.

Zumo de limón 2 – 2.3

Vinagre 2 – 2.3
Zumo de tomate 4
Leche 6.5
Fluidos musculares 6.8
Sangre 7.3
Detergentes 10
Saliva humana 6.5 - 7.5
Orina 5–8
Estómago 0.8 – 7
Interior celular 6.9 - 7.1
Agua de mar 8
 Hidratos de Carbono, Sacáridos o Glúcidos.
( CH2O ) n o Cn (H2O)n

Son la principal fuente energética inmediata para la mayoría de los seres vivos
(heterotrofos y quimiotrofos), además de ser una rica fuente de carbono. Se clasifican en
diversos grupos dependiendo de la cantidad de monómeros que los formen:
Monosacáridos
Oligosacáridos
Disacáridos
Trisacáridos
Polisacáridos

MONOSACÁRIDOS.- Sólidos, blancos, cristalinos, muy solubles en agua, insolubles en

disolventes no polares y y la mayor parte de ellos con sabor dulce.

Son azucares sencillos, poseen una unidad de polihidroxialdehido o

polihidroxicetona (CH2O)n n = > 3 - 9. Un carbono con un oxígeno carbonílico
formando un enlace acetal o cetal. Acetal cuando el carbono está al final de la cadena por
lo que se forma una aldosa, y cetal en un carbono intemedio, por lo que se forma un
derivado cetonico o cetosa. Los monosacáridos aveces presentan isómeros.

Actividad óptica.- Se debe a los centros quirales (carbonos asimétricos) d (+) y l (-) , que
son diferentes a las formas D y L.

Mutorrotación.- Se da en casi todos los azucares que se ciclan, por ejemplo:

Ciclación.- se presenta en el grupo funcional con el OH más accesible. La ciclación
depende de la presencia de H + o no.

Aldohexosas = 1 y 5
Aldopentosas = 1 y 4
Cetohexosas = 2 y 5
Cetopentosas = No cíclicas.
La formación de un hemiacetal o hemicetal
Ciclohexosas aldehídicas = Hemiacetales (acetal)
cíclico determina un centro asimétrico : .
Ciclohexosas cetónicas = Hemicetales (cetal)
carbón anomérico ( presentan = = orientaciones

espaciales : . = = mutorrotación (+) o (-) )

Formas D y L.- Son formas de configuración absoluta.

D (dextro) = orientaciones relativas de los otros grupos hidroxilo

L (levo) = imagen de espejo de D.

D = El OH del carbón anomérico hacia abajo en los alfa ( ) y hacia arriba en los
beta ( ).
L = El OH del carbón anomérico hacia arriba en los alfa ( ) y hacia abajo en los
beta ( ).

: . se presenta la epimerización.

Alfa ( ) o beta ( ) es la orientación de grupos hidroxilo del carbón 1

anomérico. Las formas alfa y beta son anoméricas.
Alfa ( ) = OH a la derecha o hacia abajo
Beta ( ) = OH a la izquierda o hacia arriba.
Poder Endulcorante ( en relación con la sacarosa)

Lactosa = 0.2
D- galactosa = 0.3
Maltosa = 0.3
D- xilosa = 0.4
Glicerol = 0.5
D- glucosa = 0.7
Sacarosa =1
D- fructosa = 1.7
Sacarina sódica = 5.00

Azúcar invertido.- La inversión del azúcar ( ) 20 = + 66.5º sacarosa se ocasiona al

romperse la unión entre glucosa y fructosa por la enzima invertasa, cuya mezcla
equimolecular tiene una ( )20 = - 39.7º. La D- glucosa = + 52.7º y la D- fructosa = - 92.4º

Azucares reductores y no reductores .- Su poder reductor depende de si están libres los

grupos funcionales, ya que estos pueden ocuparse para formar enlaces glucosidicos, en
cuyo caso se tornan no reductores.

Principales monosacáridos:
Triosas

Posee un carbon asmétrico o quiral No posee un carbón asimétrico.

Gliceraldehido Dihidroxicetona
Aldotriosa Cetotriosa

Ambos son metabolitos que intervienen en la glucolisis y en las reacciones oscuras

de la fotosíntesis, entre otras.
 Tetrosas

D-Eritrosa
Aldotetrosa

Pentosas
Fórmulas de proyección lineal de Fisher

D-Ribosa D- Desoxirribosa
Aldopentosa Aldopentosa

Forman parte de los nucleosidos y de los ácidos nucléicos, tanto del DNA, como
del DNA.

Fórmulas de proyección cíclica de Haworth

Ribosa Desoxirribosa

D-Ribulosa
Cetopentosa.
Importante metabolito intermediario
Xilosa Xilulosa
Aldopentosa Cetopentosa

Hexosas
Son los monocacáridos más abundantes.

D-Glucosa D- Galactosa D- Manosa

Combustible de los seres vivos y Epímero C-4 Epímero C-2
unidad estructural de los polisacá- Constituyente
ridos, como el almidón y la celulosa. de la lactosa en
la leche.

D- Fructosa D Fructofuranosa
Importante en el metabolismo de Se relaciona con el furano
carbohidratos, azúcar de la fruta, etc.
OLIGOSACÁRIDOS. Compuestos por 2 a 10 residuos de monosacáridos unidos por
enlaces glucosidicos (Enlaces covalentes entre el carbón anomérico de uno y otro carbón
de otro) : . disacáridos, trisacáridos, etc.

DISACÁRIDOS.- Son moléculas que por hidrólisis dan dos monosacáridos. Están unidos
por enlaces glucosídicos ( 1–4, 1–6, 1- 4 , 1- 6 ).

1.- Maltosa.- e forma como un producto intermediario de la acción de las amilasas sobre el
almidón. Contiene o está formado por dos restos de D Glucosa.

El carbón anomérico no reductor está

en posición alfa ( ).

2.- Celobiosa .- Unidad disacárida que se repite en la celulosa. Esta formada por dos restos
de glucosa unidos por enlaces 1 – 4 glucosídicos.

3.- Lactosa.- Disacárido de la leche, formado por D galactosa + D glucosa, unidos por
enlaces 1 – 4 glucosídicos.
4.- Sacarosa .- Azúcar de la caña; disacárido de la glucosa y de la fructosa, unidos por
enlaces 1 - 2 glucosídicos. Se conoce como azúcar de mesa, es el más abundante
disacárido en la naturaleza. Es no reductor pues los carbones anoméricos (adehídico y
cetónico) de los 2 azúcares participan en el enlace glucosídico. La hidrólisis de la
sacarosa se denomina frecuentemente inversión, ya que va acompañada de un cambio neto
de rotación óptica, de dextro a levo, en cuanto se ha producido la mezcla equimolecular de
glucosa y fructosa; esta mezcla se denomina azúcar invertido.

TRISACÁRIDOS.

1.- Rafinosa.- Es el azúcar de la remolacha y esta formada por las siguientes moléculas :
D galactosa 1 – 6 D- glucosa 1 – 2 fructosa.

POLISACÁRIDOS. (Monosacáridos )n n = igual o mayor a 10 . También se les llama

glucanos y difieren entre sí por:

 Tipo de monosacárido.
 Longitud de la cadena.
 Grado de ramificaciónes.
 Tipo (s ) de enlace (s)
 Se dividen en dos grupos dependiendo de sus monomeros y sus enlaces:

Homopolisacáridos .- Formados por solo un tipo de unidad monomérica.

Heteropolisacáridos .- Formados por dos o más unidades monoméricas diferentes.

HOMPOLISACÁRIDOS.

1.- Almidón .- Carbohidrato de reserva de energía, se encuentra en las plantas como

gránulos de reserva dispersos en el citoplasma. Compuesto solo por residuos de D-
glucosa, la cual se organiza para formar dos componentes: La amilosa y la amilopectina.

a).- Amilosa.- Molécula lineal formada por glucosas unidad por enlaces 1–4,
tiende a formar un ovillo helicoidal . No soluble en agua, pero forma
micelas hidratadas que dan un color azul con el yodo.

b).- Amilopectina .- molécula ramificada de glucosa, unida por enlaces 1–6y

>>> 1 – 4, Cada ramificación se presenta cada 24 – 30 residuos de glucosa,
produce disoluciones coloidales o micelas de coloración rojo – violaceo con el
yodo.

En el extremo reductor
Se encuentra un grupo
Aldo o ceto libre

Almidón + amilasa (en jugo panceático o saliva) : . Glucosa y maltosa

Actúa sobre enlaces 1 – 4.

Almidón + amilasa (enzima de la malta que no hidroliza enlaces ) : . maltosa

Actúa sobre el extremo no reductor y escinde cada 2º enlace.

Glucosa ------------- 1 – 6 desramificador + dextrina límite -----------------------------

2.- Glucógeno .- Principal reserva de las células animales (células hepaticas y musculares)
y bacterianas (en gránulos o inclusiones) ; Es un a poliglucosa ramificada, muy
semejante a la amilopectina, pero el glucógeno se ramifica cada 8 – 10 residuos. Los
enlaces no reductores 1–4 y 1 – 6 son estables al tratamiento con alcalis.

Glucógeno + KOH + calor ------------- Digestión

Glucógeno + y amilasa --------------- glucosa + maltosa.
Glucógeno + yodo ------------- coloración rojo violacea.

3.- Celulosa .- Constituyente estructural mas abundante en las plantas (pared celular); es
una poliglucosa no ramificada ordenada en hileras paralelas; las glucosas se unen por
enlaces 1 – 4 ; La celobiosa es su disacárido repetitivo; insoluble en agua; se
relaciona estructuralmente con la hemicelulosa (pentosas por hexosas), lignina (cadenas de
3 carbonos + anillos aromáticos como el guayacol, fenol, pirocatequina, etc), pectina
( galacturónico + galactosa + arabinosa ) que se encuentra en las cáscaras de frutas y
fruta verde; En los animales no rumiantes no hay celulasas, solo algunos microorganismos
celuloliticos las producen.

4.- Quitina .- Homopolisacárido lineal de residuos de N-acetil glucosamina unidos por

enlaces 1 – 4 ; forma el principal componente de los exoesqueletos de los invertebrados,
pared celular de hongos, algas, levaduras, etc.
5.- Inulina .- Polímero de la fructosa que se emplea en la diferenciación bioquímica de las
bacterias.

HETEROPOLISACÁRIDOS

1.- Ácido Hialurónico .- Es el más importante heteropolisacárido en animales superiores;

se encuentra en el tejido conjuntivo, sustancia fundamental, fluido sinovial, humor vitreo y
cordón umbilical. Actúa como un amortiguador y lubricante de golpes en articulaciones.
Por su consistencia gelatinosa y su composición química algunos lo consideran como
mucopolisacárido; es un polímero lineal de D- glucuronico 1 – 3 N acetil glucosamina
1–4.

2.- Sulfato de condroitina .- material estructural de cartílago, hueso y tendones (forma

parte de los mucopolisacáridos de tejido conjuntivo); está formado por ácido glucurónico
unido por enlaces 1 – 3 a N acetil galactosamina ( la que se encuentra sulfatada o
disulfatada en el carbón 4 o 6) 1–4.
3.- Heparina .- Mucopolisacárido presente en tejidos de mamíferos y células cebadas ( de
hígado, pulmones y arterias) ; se libera en la anafilaxia y evita la activación de los
factores VIII y IX , por lo que no hay acción de la trombina (Se usa como anticoagulante),
además produce liberación de lipasas lipoproteínicas que actúan sobre los triglicéridos,
causando la disipación del plasma lipémico. Es una molécula lineal formada por ácido
glucurónico 1–4 glucosamina disulfatada 1–4.

4.- Queratosulfato .- Polisacárido de cornea y tejido conectivo; formado por D glactosa

1 – 4 (2 N. acetil 3 desoxi D glucosa 6 sulfato) 1 – 3 D- galactosa.

5.- Agar agar .- Es una galactona.

6.- Mucina .-

7.- Mucílagos .-

MUCOPOLISACÁRIDOS .- Polisacáridos que contienen nitrógeno, algunos autores los

ubican como heteropolisacáridos, por ejemplo la heparina, sulfato de condroitina, ácido
hialurónico, quitina, etc.

COMPUESTOS DIVERSOS .- Derivados de carbohidratos como el ácido sialico, la

vitamina C, estreptomicina, inositol, ácido glucuronico, sorbitol, galactitol, xilitol, etc.
1.- Ácido siálico .- Se encuentra en mucinas (mucoproteínas de la saliva) y substancias de
grupos sanguíneos. Son N- acetil derivados del ácido neuramínico ( 3 desoxi 5 amino
azucar de 9 carbones).

REACCIONES DE CARBOHIDRATOS

1.- Tratamiento ácido.

Carbohidratos + 100ºC + HCl 1 N o H2SO4 1 N --------- Hidrólisis toral en 15 minutos

Furfural Ac. levulínico.

2.- Tratamiento alcalino.

Carbohidratos + Temp. Amb. + NaOH 0.035 N + Ca (OH)2 sat. ------ intemediario enolico

Isomerización (fructosa o manosa)

3.- Oxidación .-
C. H. + Agente oxidante (Cu, Bi, Ag, Fe y CN ) ------------------------ isomerización
Hay un grupo
Reductor aldehido
o cetona (hemicetal
o hemiacetal) : .
tiene un grupo que se
oxida facilmente.