El ciclo de Krebs es un ciclo metabólico cuyo alimentador es acetil-
CoA que es uno de los productos finales de la degradación de glúcidos, aminoácidos y lípidos. Este sustrato inicial se degrada paso a paso en el ciclo quedando transformado en 2 CO2 con liberación de energía que queda contenida en los cofactores reducidos (un FADH2 y 3 NADH) y también en un GTP. Además, es una vía que se relaciona con muchos otros procesos anabólicos del metabolismo de glúcidos, proteínas, ácidos nucleicos, porfirinas y lípidos. Por eso se considera al igual que la glucólisis (degradación de la glucosa), una vía central del metabolismo.
Podemos plantear como reacción global esquematizada del ciclo de
Krebs:
En esta reacción general podemos ver cuál es el sustrato inicial,
cuáles son sus productos finales y los cofactores que participan.
Tipo de proceso del ciclo de Krebs
Es un proceso catabólico pues su alimentador, acetil-CoA (grupo
acetilo -compuesto de 2 carbonos- unido a la CoA) se degradará y se formará 2 CO2, compuestos más pequeños, y sus hidrógenos quedarán formando parte de los cofactores reducidos. Además se forma el GTP, que contiene la misma cantidad de energía que el ATP. Todo lo anterior podemos verlo en la reacción global anterior.
Localización del ciclo de Krebs
Este proceso se lleva a cabo en la matriz mitocondrial. Allí es donde
se encuentran la mayoría de las enzimas que participan en él. Además en la propia mitocondria es donde se encuentran localizados los otros 2 procesos de la respiración celular que forman la cadena respiratoria. En la cadena respiratoria se van a utilizar los cofactores reducidos formados por el ciclo de Krebs. La localización mitocondrial de ambos procesos facilita con una máxima eficiencia la función de ambos procesos, que es otro de los principios de la Bioquímica: el principio de la máxima eficiencia. En cuanto a su localización hística, se produce en todos los tejidos cuyas células tengan mitocondrias. Por ello, el ciclo no se produce en los hematíes, que carecen de mitocondrias.
Visión general de las reacciones del ciclo de Krebs
Se compone de 8 reacciones y cada una de ellas está catalizada por
enzimas. Escojamos como primera reacción la entrada del acetil CoA (a) que se condensa con el ácido oxalacético (b). Las reacciones de óxido-reducción son la 3; 4; 6 y 8 (Fig. 7.11). Otra reacción de importancia es la 5 donde se forma GTP por una fosforilación a nivel de sustrato. Es una vía cíclica porque el ácido oxalacético (b) que es el producto final de la última reacción, la 8, vuelve a ser sustrato de la primera reacción. Este ciclo es globalmente irreversible, aunque algunas de sus reacciones son reversibles (reacciones 2, 5, 6, 7 y 8). El grupo acetilo, bicarbonatado, se oxida por pasos graduales en el ciclo de Krebs y como en cada vuelta del ciclo se forman 2 CO2, se pudiera decir que el acetilo que está unido a la CoA se degrada en cada vuelta del ciclo. Los otros productos de la vía son los cofactores reducidos (3NADH.H+ y 1FADH2) y un GTP.
Fig.7.11.Las reacciones del ciclo de los ácidos tricarboxílicos o ciclo
de Krebs, a) acetil-coA, b) ácido oxalacético,(c) ácido cítrico, d) cis aconítico, e) ácido isocítrico, f) ácido á ceto glutámico, g) succinil coA, h) ácido succínico, i) ácido fumárico, j) ácido L-málico.
Origen del acetil-CoA
El acetil-CoA proviene del catabolismo de lípidos, aminoácidos y
glúcidos; estos últimos constituyen su fuente principal en el cerebro, pero en otros tejidos como el hígado y músculo, son los ácidos grasos su fuente principal. Reacciones del ciclo de Krebs
Primera reacción: enzima ácido cítrico sintasa.
Esta enzima cataliza la condensación entre el grupo acetilo del acetil-
CoA y el ácido oxaloacético. Este ácido debe unirse a la enzima antes que el acetilCoA, debido a esto tienen que encontrarse a concentraciones adecuadas para que se lleve a cabo la primera reacción; De esta forma se mantienen los niveles adecuados de los metabolitos del ciclo y se garantiza la actividad del mismo. Además es una de las enzimas reguladoras del ciclo y su regulación se trata más adelante en este capítulo.
Segunda reacción: enzima aconitasa
La aconitasa cataliza una isomerización del ácido cítrico en ácido
isocítrico, pues como vemos en la figura 7.11 el grupo hidroxilo cambia de posición.
En esta reacción, el ácido isocítrico se oxida y descarboxila. La
enzima es dependiente del NAD+ que debe estar unido a la enzima para que ella pueda realizar su acción. Los productos son el CO2 y el ácido alfa-ceto-glutárico. En esta reacción ocurre la formación del 1er cofactor reducido, el NADH, como se observa a continuación. Esta es otra de las enzimas reguladoras importante del ciclo de Krebs. Cuarta reacción: enzima alfa-ceto-glutárico deshidrogenasa
La reacción está catalizada por un complejo multienzimático. Además
de las 3 enzimas que lo forman, requiere de 5 cofactores; el pirofosfato de tiamina (PPT), el ácido lipoico, la coenzima A, el FAD y el NAD+. El ácido alfa-ceto-glutárico se descarboxila y se oxida transformándose en succinil-CoA. En esta reacción ocurre la formación del 2do cofactor reducido, el NADH. La reacción es irreversible.
Quinta reacción: enzima succinil-tioquinasa o succinil CoA sintetasa
Esta reacción es totalmente reversible y transfiere la energía
contenida en el enlace tíoester de la succinil-CoA al último enlace anhídrido fosfórico del GTP. El tercer fosfato del GTP puede ser transferido al ADP y formar ATP. Esta es la única reacción del ciclo donde se forma un compuesto con energía semejante al ATP, es una fosforilación a nivel de sustrato. El otro producto de la reacción es el ácido succínico.
Sexta reacción: enzima succínico deshidrogenasa
La succínico deshidrogenasa no es una proteína simple, es una
proteína compleja (la proteína se encuentra unida a un grupo prostético), es una flavo proteína, cuyo grupo prostético es el FAD. Es una proteína integral de la membrana interna de la mitocondria. Participa en 2 procesos, en el ciclo de Krebs y lo relaciona con la cadena respiratoria. Cataliza la oxidación del ácido succínico en ácido fumárico, mientras que se forma el 3er cofactor reducido, el FADH2. La reacción es reversible. Séptima reacción: enzima fumarasa
Una molécula de agua se introduce en el doble enlace y se forma el
ácido málico. Esta reacción es libremente reversible.
Octava reacción: enzima málico deshidrogenasa
Con esta reacción se completa el ciclo y su producto es el ácido
oxalacético, iniciador del ciclo. También es la última reacción de oxido-reducción que se produce; se forma el 3er NADH. Constituye una reacción reversible, pero el equilibrio está desplazado hacia la formación de del ácido málico. Sin embargo, la propia marcha del ciclo, o lo que es lo mismo, el consumo del ácido oxalacético hace que esta reacción se desplace en el sentido de la formación del ácido oxalacético.
Regulación del ciclo de Krebs
Varios tipos de mecanismos reguladores intervienen en el control de
la velocidad del ciclo de los ácidos tricarboxílicos. Estos son la disponibilidad de sustrato, la inhibición por producto o inhibición feedback por intermediarios del propio ciclo. También, de gran importancia, está presente la regulación por efectores alostéricos. Aun cuando todas las reacciones poseen alguna regulación, las que fundamentalmente determinan la velocidad de ciclo de Krebs son las reacciones catalizadas por las enzimas cítrico sintasa e isocítrico deshidrogenasa.
Regulación de la cítrico sintasa
Esta regulación ocurre por el mecanismo de disponibilidad se
sustrato. Un metabolito importante que regula la actividad de la cítrico sintasa es uno de sus sustratos, el ácido oxalacético. Esta enzima normalmente trabaja a concentraciones no saturantes de sus sustratos, por lo que su actividad varía en dependencia de los cambios de concentración de estos. Es indispensable la unión del ácido oxalacético en el centro activo de la enzima para que pueda unirse el acetil CoA y llevarse a cabo la reacción. Si las concentraciones del ácido oxalacético son pobres esta primera reacción del ciclo ocurre deficientemente.
Regulación de la isocítrico deshidrogenasa
Está regulada por la disponibilidad de NAD+ e inhibida por su
producto final, el NADH.
También tiene regulación alostérica por el ADP (su efector alostérico
positivo) y el ATP (su efector alostérico negativo). Las concentraciones de ATP y de ADP son reguladoras importantes de varios procesos celulares. La relación entre las concentraciones de ATP/ADP nos dan un índice del estado energético de la célula, el llamado potencial energético celular (PEC). Si la concentración de ATP se eleva, el PEC es alto e indica que en la célula no se requieren en esos momentos mucho ATP y es el propio ATP el que inhibe los procesos que lo forman. Esto sucede, por ejemplo, en el reposo. Si las concentraciones de ATP disminuyen y se elevan las de ADP, esto es indicador de un bajo PEC, indica que se requiere del ATP, y el ADP es el activador alostérico de los procesos formadores de ATP. Esto sucede, por ejemplo, en el ejercicio. Así sucede con la enzima isocítrico deshidrogenasa, enzima reguladora del ciclo de Krebs. Al aumentar la concentración de ADP, la enzima se activa y lo mismo ocurre con el ciclo. Si aumentan las concentraciones de ATP, la enzima se inhibe y también el ciclo. Se considera a esta enzima como la marcapaso del ciclo.
El resumen de la regulación del ciclo lo podemos observar en la figura
7.12.
Fig.7.12. Esquema de la regulación del ciclo de Krebs. La activación
fundamental de la enzima cítrico sintasa se debe a los aportes de ácido oxalacético y del acetil-CoA a partir de la pirúvico deshidrogenasa. La isocítrico deshidrogenasa es activada alostéricamente por el ADP e inhibida por el ATP. Relación del ciclo de Krebs con otros procesos metabólicos
Algunos metabolitos del ciclo de Krebs participan en procesos de
biosíntesis. Se observa en la figura 7.13, que a partir de los intermediarios se forman aminoácidos, grupos hemo y otros compuestos.
Fig.7.13. Participación de los intermediarios del ciclo de Krebs en los
procesos biosintéticos.
El ácido oxalacético y el ácido alfa-ceto-glutárico se pueden
transformar en sus aminoácidos correspondientes que son el ácido aspártico y el ácido glutámico respectivamente. Estas reacciones, de transaminación, se estudiarán en el capítulo del metabolismo de los compuestos nitrogenados de bajo peso molecular (capítulo 10). Los aminoácidos pueden utilizarse en la síntesis de proteínas, pero además ellos intervienen en la síntesis de las bases nitrogenadas tan necesarias en la síntesis de los ácidos nucleicos, y en la de algunos cofactores.
El succinil~CoA es un precursor de la síntesis del grupo hemo,
importante grupo prostético que forma parte de la mioglobina, hemoglobina y otras hemo-proteínas como los citocromos. Estos últimos compuestos los veremos cuando se trate la cadena transportadora de electrones.
El ácido málico, en determinadas condiciones fisiológicas, se
incorpora al proceso de gluconeogénesis.
El ácido cítrico, al acumularse en momentos de alto potencial
energético celular, sale de la mitocondria y en el citoplasma constituye la fuente de acetil-CoA citoplasmático, precursor para los procesos de la síntesis de los ácidos grasos y colesterol.
Por supuesto, los cofactores reducidos relacionan al ciclo con el resto
de los procesos de la respiración celular, pues son los sustratos de la cadena transportadora de electrones donde se reoxidan y así podrán ser utilizados de nuevo por el ciclo de Krebs. En la figura 7.13 podemos ver las relaciones que tiene el ciclo de Krebs con otros procesos metabólicos a través de sus intermediarios.
Funciones del ciclo de Krebs
De todo lo planteado anteriormente el ciclo de Krebs tiene 2 funciones importantes. Una de ellas es la formación de los cofactores reducidos que serán sustratos de la cadena respiratoria y se emplean en la formación de ATP. La segunda función importante es que a partir de sus metabolitos intermediarios se sintetizan compuestos como son los aminoácidos, grupos hemo y ácidos grasos, Esto hace que este ciclo tenga relaciones con el metabolismo de proteínas, con el de las hemoproteínas, los ácidos nucleicos, los glúcidos y los lípidos. Además es sumamente importante la relación que tiene con otros procesos de la cadena respiratoria.
Anaplerosis
En las reacciones del ciclo de Krebs, al producirse el catabolismo de la
acetil-CoA se regeneran todos los intermediarios, pero como estos además se escapan del ciclo al participa en otros procesos de síntesis, entonces al ciclo de Krebs le faltarían las cantidades necesarias de sus metabolitos intermediarios para realizar sus funciones. Las cantidades de ácido oxalacético disminuidas no se corresponden con las requeridas para su condensación con las de acetil-CoA lo que implicaría un deficiente funcionamiento de este proceso.
Esto no sucede realmente porque existen ciertas reacciones que
reponen los metabolitos del ciclo; son las reacciones de anaplerosis, palabra que proviene del griego y que quiere decir rellenar. Las propias transformaciones de los metabolitos del ciclo en aminoácidos son reversibles y pueden aportar intermediarios a este ciclo. Pero la reacción de relleno fundamental es la catalizada por la enzima ácido pirúvico carboxilasa, enzima localizada en la mitocondria.
En esta reacción el ácido pirúvico se carboxila y se transforma en
ácido oxalacético y el ATP aporta la energía necesaria para que ocurra la reacción. Esta enzima tiene un activador alostérico, el propio acetil- CoA. Se comprende la importancia de esta regulación que activa la formación del ácido oxalacético, sustrato imprescindible para que ocurra la primera reacción del ciclo. El aporte del ácido oxalacético es suficiente para rellenar de metabolitos el ciclo, pues este ácido se transforma en los otros metabolitos en las subsiguientes reacciones (Fig. 7.14).
Fig.7.14. Se representa un ciclo metabólico de 3 componentes (B, C
y D). El rojo más fuerte representa una concentración más alta del componente que el del color más pálido. En a) A se ha transformado en B y así se aumentó su concentración, B y C se encuentran a concentraciones muy bajas. Al funcionar el ciclo (b), B se transformó en C y este componente también aumentó su concentración a partir de B. Finalmente en c) vemos como ya los 3 componentes del ciclo se encuentran a concentraciones aumentadas. Y todo esto ocurrió sólo por la formación de B a partir de A.