CAP:03

EL CAOS ORDENADO DE LAS PROTEÍNAS.

¿Qué sabemos realmente de las proteínas? ¿Qué se conoce de los aspectos básicos de su morfología
y funcionamiento? Las proteínas son la materia de la vida. Representan los ojos, los brazos y las
piernas de las células vivas. En este trabajo le daremos a conocer el orden en que están configuradas
las proteínas, como el titulo lo dice el caos ordenado de las proteínas; de igual forma los distintos
postulados que se dieron a conocer para tener una idea de su morfología.
En el principio se creía que las proteínas estaban compuestas por aminoácidos unidos entre sí como
la cuenca de un collar y que para ejercer su función primero debía plegarse (es el proceso por el que
una proteína alcanza su estructura ternaria) y adoptar una forma rígida. En 1894 Emil Fisher planteo
el modelo llave cerradura, este postula que las proteínas se unen específicamente a una molécula
mediante su contorno especifico (forma rígida), en cambio sino es así, no pueden unirse y no
cumplen su función.

Las proteínas son la materia de la vida. Representan los ojos, los brazos y las piernas de las células
vivas. Incluso el ADN, el icono supremo de todas las moléculas biológicas, resulta importante sobre
todo porque contiene los genes que especifican la síntesis de proteínas. Y las células de nuestro
organismo —como las neuronas, los leucocitos o las células olfatorias— se diferencian unas de otras
en gran medida porque activan distintos conjuntos de genes y, en consecuencia, producen diferentes
grupos de proteínas.

Dada la importancia de esas moléculas, muchos podrían pensar que los aspectos básicos de su
morfología y funcionamiento se conocen desde hace tiempo. Sin embargo, durante decenios los
científicos aceptaron una idea que resultó incompleta. Dedujeron, acertadamente, que las proteínas
se hallaban compuestas por aminoácidos unidos entre sí como las cuentas de un collar. Además, para
que una proteína ejerciera su función, su cadena de aminoácidos debía primero plegarse y adoptar
una configuración precisa y rígida. No obstante, hoy se hace cada vez más evidente que ciertas
proteínas desempeñan sus funciones biológicas sin haber llegado nunca a plegarse por completo,
mientras que otras se pliegan solo cuando se las necesita. De hecho, quizás una tercera parte de las
proteínas humanas son «intrínsicamente desordenadas» y poseen al menos algunas regiones
desplegadas o desordenadas.

ENLACES PERFECTOS.

El primer experimento que desarrollaremos apoya el modelo llave cerradura.

-En 1931 el bioquímico Hsien Wu demostró que la desnaturalización de las proteínas (la eliminación
de su estructuraternaria) daba lugar a una pérdida total de su función. Tras determinar la estructura
tridimensional de la mioglobina de cachalote. Para tal fin, primero se provoca la transformación de
las estructuras rígidas en cristales; posteriormente, estos se irradian con rayos x y se estudia su
difracción.
Pero más adelanto se dieron cuenta que las proteínas no debían necesariamente plegarse para llevar
acabo su función.
-En 1996 Richard W.Kriwacki examinaba la proteína p21 (implicada en el control de la división
celular) con un espectrómetro de resonancia magnética nuclear (RMN), una de las técnicas más
utilizadas para estudiar proteínas. Según los datos de RMN la proteína presentaba una
desorganización casi total (no estaba plegada) sin embargo esta seguía ejerciendo su indispensable
funciónreguladora. Constituía la primera prueba convincente de que la falta de estructura en una
proteína no inutiliza su función.
Las proteínas se dividen en estructuradas, desestructuradas y todas las que se ubican en un punto
intermedio, teniendo zonas de ambas en mayor o menor proporción.

Otros modelos de proteínas serían las promiscuas (son parte de las desestructuradas) de estas
hablaremos másadelante en el punto d) y las intrínsecamente desordenadas (punto f). Las proteínas
intrínsecamente desordenadas son específicamente de los veinte aminoácidos esenciales para
nuestro cuerpo, realizan importantes funciones biologías, al ser diversas funciones los veinte
aminoácidos no tienen una sola estructura ternaria.
-En 1997 A. Keith Decker al comparar las secuencias de aminoácidos entreproteínas que se supone
eran intrínsecamente desordenadas y las rígidas. Descubrió que las proteínas intrínsecamente
desordenadas presentaban más aminoácidos hidrófilicos que las proteínas rígidas. Por lo tanto el
balance entre aminoácidos hidrófilicos e hidrófobicos permitiría pronosticar el grado de plegamiento
o desorganización de una proteína.

MARAÑA PROTÉICA:

La proteína p27, presente en la mayoría de vertebrados. Al igual que la p 21, p27 es una de las
proteínas fundamentales que regulan la división celular para que las células no se multipliquen de
manera descontrolada. La RMN muestra que p27 es muy flexible, con regiones que se pliegan y
despliegan rápidamente para dar lugar a estructuras lábiles con forma de sacacorchos o de lámina.
En la gran mayoría de las células cancerosas humanas a la cantidad de p27 se reduce, y cuanto menor
sea el valor, peor resulta el pronóstico para el paciente.

PROTEÍNAS ESCURRIDIZAS:
Existen solo veinte aminoácidos naturales para la biosíntesis de proteínas de acuerdo con las
instrucciones codificadas en el genoma. Siendo tan simples en su composición química, ¿cómo es
posible que estas macromoléculas puedan ejecutar funciones de suma diversidad y complejidad? Ello
se debe a que la actividad biológica de cada proteína no depende tanto de la naturaleza de los
aminoácidos que la componen como del modo en que se combinan y, por tanto, de la estructura
tridimensional que esta adopta al plegarse —para una proteína mediana, de unos 200aminoácidos, el
número de combinaciones posibles para los veinte aminoácidos disponibles asciende a 20200.

La estrecha relación entre la estructura y la función en las proteínas ha originado programas de

investigación que tienen por objeto la determinación sistemática de la estructura de todas las
proteínas del genoma. Estos estudios han revelado, sorprendentemente, que existe un número
elevado de proteínas que, aunque no adoptan estructuras tridimensionales definidas, llevan a cabo
importantes funciones biológicas. Esta nueva clase de proteínas, que desafían en parte el dogma
central de la biología molecular formulado por Francis Crick en 1958 (a cada secuencia aminoacídica
le corresponde una estructura tridimensional)

EL SECRETO DE LA EVOLUCIÓN:

La escasez de IPD en las bacterias indicaría que este tipo de moléculas habría surgido tarde en la
evolución. Sin embargo, diversas líneas de investigación sugieren lo contrario. Por un lado,
numerosos sistemas de señalización importantes en bacterias utilizan proteínas de desestructuradas,
y no proteínas estructuradas. Además, en las máquinas moleculares evolutivamente antiguas
formadas por asociaciones de ARN y proteínas, casi todas las proteínas se hallan total o parcialmente
desestructuradas cuando no están unidas a su ARN correspondiente. Entre estos complejos híbridos
cabe citar los somites cirujanos y el ribosma.

UN ARMA DE DOBLE FILO:

A la vista de la importancia

Iológica de las proteínas, no debería sorprendernos que muchas de ellas sean responsables
de enfermedades. El nuevo paradigma del desorden intrínseco en las proteínas cambiará por
completo la forma en que entendemos y tratamos las dolencias humanas.

En algunos casos, la ausencia de estructura en una proteína resultara perjudicial. Si una

célula las sintetiza en exceso ciertas proteínas desorganizadas tenderán a agregarse y a
formar placas en el cerebro se piensa que estas placas ocasionan una serie de patologías
neurodegenerativas devastadoras, ente ellas las enfermedades de Alzheimer, Parkinson y
Huntington. Parece que las proteínas desestructuradas deben mantenerse bajo un control
escrupuloso para evitar que se vuelvan dañinas.

El amanecer de una nueva estructura era en la estructura y función de las proteínas tiene el
potencial necesario para transformar nuestros conocimientos sobre la vida, y quizá salvarla.