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5 DropQuant
manual de usuario de
Contenido 2
declaración de garantía Trinean 5
Introducción 6
Advertencia 6
Información de seguridad 7
Seguridad ELECTRICA 8
seguridad biológica 8
Seguridad química 9
Mecánico 9
Especificaciones para DS96 10
Capítulo 2: Software 19
DropQuant 19
requisitos del ordenador 19
Instalación / Actualizaciones 19
Iniciar sesión 19
Pantalla de inicio 20
nueva medición 21
disposición de las placas 22
Importar 24
Medición 26
Capítulo 3: Aplicaciones 27
Ácidos nucleicos 27
mediciones oligo 28
proteínas 29
General de UV / Vis y curva estándar 31
Las curvas de calibración 31
2
exportación rápida 47
Anexo B: Mantenimiento 69
Limpieza del DropSense 96 69
Mantenimiento 69
Anexo X: Glosario 70
Pregunta o comentario sobre el contenido de este manual se pueden dirigir a la siguiente dirección o a su representante
TRINEAN.
TRINEAN NV / SA
3
Fax. 0032 9 2727539
info@trinean.com
www.trinean.com
Este documento es el copyright de TRINEAN y no debe ser copiada o reproducida en cualquier forma sin el consentimiento previo.
TRINEAN se reserva el derecho de realizar mejoras técnicas en este equipo y documentación sin previo aviso, como parte
de un programa continuo de desarrollo de productos.
4
declaración de garantía Trinean
productos TRINEAN Garantía limitada Garantía y disposiciones especiales están plenamente garantizados por un año contra
defectos en piezas, materiales y mano de obra. piezas y materiales defectuosos serán substituidos o, a discreción del TRINEAN,
reparado sin cargo por un período de un año, siempre que los productos se utilizan y mantenidos de acuerdo con las
instrucciones en el manejo y el servicio manual correspondiente, y además siempre que los productos no tienen, según lo
determinado únicamente por TRINEAN, sujetos al mal uso o abuso por parte del cliente u otras partes no relacionadas con
TRINEAN. TRINEAN ofrece ninguna garantía, expresa o implícita, en cuanto a la idoneidad de cualquier producto para fines
particulares distintos de los fines descritos en el manual de operación y mantenimiento aplicable, ni tampoco TRINEAN dar
ninguna otra garantía, ya sea expresa o implícita,
Donde TRINEAN garantiza cualquier producto, sea en virtud de esta garantía o como una cuestión de derecho, y hay un incumplimiento de dicha
garantía, remedio único y exclusivo del cliente será la sustitución de piezas y materiales defectuosos, como se describió anteriormente. Este será
el límite de responsabilidad TRINEANS'.
Trinean proporcionará serán hechos piezas de repuesto de instrumentos DS-serie y artículos relacionados disponibles por lo menos 7 años, directamente oa
Por otra parte, TRINEAN no será responsable de los daños accidentales o consecuentes. El fracaso del cliente para notificar
TRINEAN de un defecto reclamado por correo certificado dentro de los treinta días del descubrimiento de los mismos
constituirá una renuncia a cualquier reclamación por incumplimiento de garantía. Cuando un producto es requerido por
TRINEAN para ser instalado por un técnico certificado TRINEAN, el período de esta garantía comenzará en la fecha de dicha
instalación, condición, sin embargo, que cualquier uso del producto antes de dicha instalación deberá, a la sola elección de
TRINEAN , anulará esta garantía. Cuando no se requiere la instalación por personal TRINEAN, el período de esta garantía
comenzará en la fecha de envío desde TRINEAN. El período de esta garantía comenzará como se describe anteriormente si
el producto ha sido instalado en cumplimiento de una orden de compra,
Limitación de responsabilidad. No obstante cualquier disposición en contrario contenida en el presente documento, la librería (ya sea por causa de
incumplimiento de garantía, incumplimiento de contrato, agravio, o de otra manera), incluyendo, sin limitaciones, en virtud de cualquier disposición de
indemnización contenida en el presente documento, se limitará a la sustitución de los bienes volvió a TRINEAN cuales se muestran a satisfacción razonable
TRINEANS' haber sido conforme o reembolsar el precio de compra, o, si no se paga, a una cantidad de crédito del precio de compra, por lo tanto.
LAS GARANTÍAS ANTERIORES SON exclusivo y un RE de dar y aceptar EN LUGAR DE CUALQUIER OTRA GARANTÍA,
expresa o implícita, incluyendo sin limitación, el garantía implícita de MECHANTABILITY Y LA GARANTÍA IMPLICADA
PARA UN FIN PARTICULAR. Ninguna parte será RESPONSABLE AL OTRO DE CUALQUIER INCIDENTAL, O
CONSECUENTE INDIRECTOS, ESPECIALES.
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Introducción
Gracias por adquirir el DropSense96 usted. Este es un sistema único para la cuantificación de las muestras de microlitros,
que consiste en DropPlate-Desechables, un instrumento DropSense96 y software DropQuant.
Este manual está dirigido a todos los usuarios de DropSense, y describe los procedimientos de instalación, operación y medición.
Una copia electrónica de este manual se puede abrir desde el programa DropQuant haciendo clic en el botón Ayuda.
Precaución: Las situaciones que potencialmente pueden afectar los resultados de sus mediciones.
Advertencia
El sistema DropSense está diseñado para UV / Vis cuantificación de muestras pequeñas. Utilizando el sistema para otras
aplicaciones no garantiza la seguridad del usuario y el correcto funcionamiento del instrumento.
Este instrumento está destinado a ser utilizado por personas que tienen un conocimiento básico de la espectroscopia de UV / Vis
Antes de iniciar la instalación o el uso del sistema, lea atentamente este manual y asegúrese de entender las instrucciones para
evitar problemas de seguridad.
Mantenga el manual cerca del instrumento de referencia. El contenido de este manual está sujeta a cambios sin previo
aviso.
6
Información de seguridad
Antes de utilizar el sistema DropSense 96, es esencial que lea este manual de usuario y prestar particular atención a la información
de seguridad. Las instrucciones y seguridad de la información en el manual de usuario debe seguirse para garantizar un
funcionamiento seguro de la DropSense 96 y para mantener la DropSense 96 en una condición segura.
Los siguientes tipos de información de seguridad aparecen en este manual de usuario. Los detalles sobre
estas circunstancias se dan en una caja debajo de la una.
Los consejos dados en este manual está destinada a complementar, no reemplazar a, los requisitos normales de seguridad
vigentes en el país del usuario.
Manipulación y posicionamiento
Siempre asegúrese de que el instrumento se coloca sobre una superficie firme, que permite un fácil acceso a su
espalda. Es extremadamente importante que tanto el botón de encendido y el cable de alimentación en la parte
posterior son siempre fácilmente accesible.
Antes de mover / reposicionar el instrumento, siempre asegurarse de que hay suficiente espacio para eso. No
proporcionar espacio de trabajo adecuado puede causar daños materiales o lesiones al controlador.
El mantenimiento de la DropSense 96 sólo debe ser realizada por personal de servicio cualificado Trinean o
técnicos de servicio de un agente autorizado.
Usando el aparato de una manera que no se especifica en este manual del usuario puede afectar a la
protección proporcionada por el equipo.
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Daños en el instrumento [C2]
Evitar el derrame de agua o productos químicos sobre el daño DropSense 96. causados por el agua o derrames
químicos se anulará la garantía.
En caso de emergencia, apague el DropSense 96 con el interruptor principal y desconecte la fuente de alimentación
de la toma de corriente.
Seguridad ELECTRICA
Cuando el instrumento está conectado a la red eléctrica, terminales pueden ser vivo. Abrir las cubiertas o eliminación
de partes puede exponer partes vivas.
Para asegurar un funcionamiento satisfactorio y seguro de la DropSense 96 seguir las siguientes pautas:
• El cable de alimentación de línea debe estar conectado a una toma de corriente de línea que tiene un conductor de protección
(tierra / tierra).
• Si el instrumento se convierte eléctricamente insegura, prevenir otro personal de operar el equipo, póngase en contacto con su
distribuidor local o servicio de soporte Trinean. El instrumento puede ser inseguro eléctricamente cuando:
• Se ha almacenado durante un período prolongado de tiempo en condiciones que están fuera de las condiciones normales
de almacenamiento.
seguridad biológica
Las muestras
Las muestras pueden contener agentes infecciosos. Usted debe ser consciente del peligro para la salud presentado por dichos agentes, y debe
utilizar, almacenar y disponer de dichas muestras de acuerdo con las normas de seguridad requeridas.
8
Las muestras que contienen agentes infecciosos [W5]
Algunas muestras utilizadas con este instrumento pueden contener agentes infecciosos. DropSense96 no está destinado
a ser utilizado para las muestras biológicas o agentes infecciosos dentro de la clase de riesgo OMS 3 y 4. Manejar este
tipo de muestras con el mayor cuidado y de acuerdo con las normas de seguridad requeridas. Siempre use gafas de
seguridad, 2 pares de guantes y una bata de laboratorio.
El organismo responsable (por ejemplo, director del laboratorio) debe tomar las precauciones necesarias para garantizar
que el lugar de trabajo que rodea es seguro y que los operadores de los instrumentos no están expuestos a niveles
peligrosos de agentes infecciosos como se define en las hojas de seguridad aplicables (SDSS) o la OSHA, * La ACGIH, †
‡ o documentos COSHH.
La ventilación de humos y eliminación de desechos debe estar de acuerdo con todos, estatales y locales de
salud y seguridad nacionales y las leyes.
* OSHA: Administración de Seguridad y Salud (Estados Unidos de América). † ACGIH: Conferencia Americana de
Higienistas Industriales Gubernamentales (Estados Unidos de América). ‡ COSHH: Control de Sustancias Peligrosas para la
Salud (Reino Unido).
Seguridad química
Vapores tóxicos
Si se trabaja con disolventes volátiles o sustancias tóxicas, debe proporcionar un sistema de ventilación de laboratorio eficiente para
eliminar los vapores que se pueden producir.
Deposito de basura
En el caso de recipientes de plástico contener productos químicos peligrosos, o materiales contagiosas / biopeligrosos. Estos desechos
deben ser recogidos y eliminados de acuerdo con las normativas de seguridad locales.
Mecánico
Para asegurar un funcionamiento satisfactorio y seguro de la DropSense 96, siga estas pautas:
• Utilice consumibles / diapositivas recomendados.
• Al apagar el instrumento, o cuando ponerlo en marcha, por favor no se pare o apoyar su peso sobre
el instrumento. Girar el instrumento o tratar de acceder a él desde atrás girando el instrumento.
seguridad de mantenimiento
Realizar el mantenimiento tal como se describe en el Anexo B. Su distribuidor local y / o cargos Trinean para las reparaciones que se
requieren debido a un mantenimiento incorrecto.
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Daños en el instrumento [C3]
No utilice disolventes o reactivos que contienen ácidos, álcalis, o abrasivos para limpiar el DropSense 96.
Datos técnicos
Trinean se reserva el derecho de cambiar las especificaciones en cualquier momento.
Condiciones ambientales
alimentación de 24 V externa de alimentación diseñada para una amplia gama de voltajes de entrada; consumo máximo
de energía de aproximadamente 15 W
Fusible T1A
Categoría de sobrevoltaje OVC II
Salida de datos USB
Temperatura del aire 15ºC a 35ºC (59ºF a 95ºF)
Humedad relativa Max. 75% (sin condensación)
Altitud Hasta 2000 m (6500 ft.) Sobre el nivel medio del mar (MSL)
Lugar de operación Sólo para uso en interiores
condiciones de transporte
Temperatura del aire - 25ºC a 60ºC (-13ºF a 140ºF) en el paquete del fabricante
Humedad relativa Max. 75% (sin condensación)
Condiciones de almacenaje
Temperatura del aire 5ºC a 40ºC (41ºF a 104ºF) en el paquete del fabricante
Humedad relativa Max. 85% (sin condensación)
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Capítulo 1: DropSense96 de un vistazo
DropSense96 de un vistazo 1
DropSense96 general
La plataforma DropSense96 está diseñado para medir el espectro UV / Vis de absorción de las muestras de microlitros de tamaño,
adecuados para ambos flujos de trabajo manuales y automatizados. A partir del espectro de absorción medido, se calcula la cantidad y
calidad de las pequeñas biomoléculas tales como ADN, ARN y proteínas. Esta plataforma es la respuesta para muchas aplicaciones en
laboratorios de ciencias de la vida.
diseño de experimento
• La bomba y unidad de colector para que permite a la muestra para funcionar dentro de la cubeta desechable
• Platina mecánica para mover los materiales desechables dentro del instrumento
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cDrop se basa más en esta selección.
2 Modo / vis UV general: El resultado de la medición es el espectro de absorción completa como una
función de longitud de onda (rango: 230 nm-750 nm).
3 Las curvas de calibración: un método de la curva estándar básico está disponible desde DropQuant 1.2. los
usuario define las muestras de referencia y sus valores de referencia correspondientes, y las muestras
desconocidas. DropQuant construye entonces la curva estándar, y calcula la concentración de las muestras
desconocidas en base a esa información.
4 cDrop: una extensión de software que realiza el análisis matemático en el UV / Vis
para extraer información sobre el contenido de las muestras (en contraste con el método de cuantificación directa de que
utiliza la información de absorción a una sola longitud de onda para calcular la concentración de la muestra). cDrop es un
software complemento. Se vende como un producto independiente, sino que se integra perfectamente en el software
DropQuant.
El pequeño requisito muestra usando los DropPlates hace que el DropSense96 la solución perfecta para muchas aplicaciones:
• Medición de la concentración (A260 nm) y la pureza de muestras de ácidos nucleicos (ADN / ARN / oligos)
Trinean ofrece un sistema completo para el cliente, que incluye una serie de complementos. Póngase en contacto con su
distribuidor local para obtener más información sobre estas extensiones al sistema de DropSense.
Con el fin de asegurar un funcionamiento óptimo, el DropSense96 utiliza nuestros DropPlates propietarias, se describen a continuación.
Consumibles
El DropSense es la única plataforma que puede leer DropPlates: una placa de 96 pocillos completa se puede leer en menos de 5 minutos.
Los consumibles Trinean DropPlate están hechas de plásticos técnicos avanzados que permiten la transmisión óptica de alta sobre
el espectro UV-VIS completo con una alta precisión. Las partes básicas del desechable son:
• Los pozos de entrada de forma cónica se colocan con un 9 mm (estándar SBS) ajuste de tono para pipetas multicanal
o carga de la muestra robótico.
• Estos pozos de entrada están conectados con un canal de almacenamiento capilar. Cuando la distribución de una gota de muestra en
la entrada bien, se transfiere inmediatamente en el canal de almacenamiento a través de fuerzas capilares con el fin de suprimir la
evaporación de la muestra. Esto permite al usuario realizar la medición en el DropSense96 dentro de un lapso de tiempo de 2 h
después de la dispensación.
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• El canal de almacenamiento capilar es más aguas abajo conectado con cubetas de uno o twomeasurement para la lectura óptica,
como se muestra a continuación. Esas mismas cubetas tienen una longitud de recorrido fijo.
• El canal microfluídico continúa a través de un pequeño canal hacia el orificio de ventilación, a la que el instrumento
DropSense96 conecta su sistema de presión de vacío.
Todos DropPlates tienen una fecha de caducidad. No utilice el DropPlate después de esa fecha, ya que el sistema de auto llenado ya no está
garantizada.
Durante la medición, el instrumento mide simultáneamente el UV / Vis absorción a través de las cubetas de medición durante el
transporte impulsado por presión de las muestras desde el canal de almacenamiento capilar para las cubetas de medición. Esto
permite que el instrumento para monitorear el comportamiento de llenado de las cubetas de medición y analizar la absorbancia
espectral de la muestra. El chip microfluídico permite mediciones exactas y reproducibles debido a longitudes de trayectoria fijos y
la eliminación de la evaporación de la muestra en la entrada así. Hay 2 enfoques diferentes para nuestros productos desechables
organizados en 2 diferentes tipos de fichas.
• DropPlate16: esta versión pequeña del consumible DropPlate tiene 16 pozos de entrada. El DropPlate16 debe montarse
sobre un soporte de aluminio: la DropFrame. Hasta 6 DropPlates pueden ser montados en un DropFrame, lo que permite la
medición de 1 a 96 muestras simultáneamente. El DropFrame tiene las mismas dimensiones exteriores que una placa de 96
pocillos estándar, asegurando la compatibilidad con los robots de manejo de líquidos.
• DropPlate96: esta placa de microtitulación de 96 pocillos está diseñado para el uso de alto rendimiento. Este consumible es ideal para
flujos de trabajo automatizados ya que es fácil apilable y que incluye un código de barras para el seguimiento de la muestra. El
DropPlate96 es compatible con los robots de manejo de líquidos (normas SBS) y permite un fácil carga de la muestra, la conservación
No es necesario llenar todos los 16 pozos de entrada para realizar una medición. A medida de la muestra solo se
puede hacer y las posiciones no utilizadas en las DropPlates se puede llenar en otra medición hasta que todos los
depósitos de entrada se han llenado.
DropPlates son desechables de un solo uso. No trate de volver a usar una placa. del meandro
comportamiento auto llenado desaparece y pipeteado dará lugar a burbujas de aire.
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los marcos
Hasta 6 DropPlates16 puede ser colocado en una DropFrame, creando un 96 pocillos completa placa con dimensiones de las placas de 96
pocillos estándar (estándar SBS). los DropFrame incluye características mecánicas que definen una posición única de los DropPlates. Esta placa
única se puede colocar de una manera en la DropFrame debido a los pasadores de alineación y los triángulos de orientación sobre el marco.
Se recomienda poner el DropPlates16 en el bastidor antes de cargar las muestras líquidas. El DropFrame es de color para ayudar a la
inspección visual de los pozos de entrada cargado o vacío, depósitos de muestras asociadas negro. Este diseño específico de la
DropFrame minimiza los errores humanos durante la carga de la muestra.
Actualmente Trinean tiene disponibles 2 tipos de placas: los DropPlates S con una cubeta de medición y el tiempo más rápido de
lectura, y el DropPlate-D + con mayor rango de medición. Todos los tipos de DropPlate tienen dimensiones exteriores idénticas y pozos
de entrada cónica con forma. La entrada también está conectado a un depósito de almacenamiento en forma de meandro que utiliza
fuerza capilar para tomar la muestra de la entrada también. Esta técnica protege las muestras de la evaporación.
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con la versión de firmware 1.51
El DropPlate-D +
El DropPlate-D + (Dual Nueva Generación) tiene dos depósitos de medición para el análisis óptico. La cámara de almacenamiento capilar
puede almacenar hasta 2 muestra l. Al llenar secuencialmente las dos cámaras ópticas, una medición de doble longitud de la trayectoria se
realiza. La combinación de ambas longitudes de trayecto resultados en un gran rango de medición OD y de este modo evita la necesidad de
dilución de la muestra.
La placa de D + tiene 2 reservorios de medición que permiten efectuar medidas en longitud de 0,1 mm y 0,7 mm camino, que ofrece un rango de
requisitos de tamaño de la muestra: Para las mediciones correctas y más precisos, es esencial que una cantidad mínima de muestra se
dispensa para el correcto llenado de las cámaras de medición que permiten efectuar medidas precisas. Aunque este rango de volumen
tiene un error de pipeteo en cuenta, lo mejor es utilizar una pipeta de precisión (por ejemplo 0,5-5 l) con puntas de precisión para asegurar
que la cantidad de muestra recomendado es dispensado.
El DropPlate-S
El DropPlate-S parece muy similar a la DropPlate-D +, sin embargo el depósito meandro es más corta y debido a tener sólo una
cámara de medición, su alcance máximo es menor que en el D +. La longitud de la trayectoria de la cubeta es de 0,5 mm, y con un
rango de 0,1-40 OD (para una trayectoria equivalente 10mm) los DropPlate-S es ideal para la cuantificación de muestras de
biomoléculas derivadas de procedimientos de extracción automatizadas con un rendimiento estable. Por ejemplo, el ADN genómico
humano extraído tiende a estar dentro de un intervalo de concentración 50-1000 ng / l y se puede cuantificar usando el DropPlate-S.
Dado que el DropPlate-S contiene sólo un micro-cubeta en vez
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de dos como la DropPlate-D +, el tiempo de medición durante 96 pocillos completos DropPlate-S se reduce por medio de unos 4 minutos.
Por favor, consulte el glosario para obtener detalles sobre sobredosis , requisitos de tamaño de la muestra y
dieciséis
Características externas
El panel frontal del instrumento contiene el cajón placa de micropocillos en posición central para cargar y descargar el
DropFrame o el DropPlates, y tres luces indicadoras: verde, naranja y rojo.
cajón de
microplacas
indicadores LED
Frente
segundo. Verde y rojo : DropSense96 está listo pero no hay comunicación con un DropQuant
que se ejecuta en que se ha logrado el PC (compruebe si DropQuant se está ejecutando y si la conexión USB está
bien)
distribuidor local
2 cajón de microplacas
El cajón de microplacas se mueve dentro y fuera del instrumento, para cargar y descargar el DropPlates. Una tapa en
el panel frontal se cierra el instrumento automáticamente cuando el cajón está en el interior del instrumento. El cajón
permanece en el instrumento durante el ciclo de medición.
El cajón puede aceptar diferentes tipos de portadores, siempre que sus dimensiones externas son compatibles
con el estándar SBS.
El portador de placa se puede abrir en cualquier momento dado mediante el botón 'bandeja abierta' en el software
DropQuant. No obstruya el movimiento de la bandeja. Cuando la lectura es completa, el cajón de la DropSense96
abre, permitiendo a los clientes para eliminar el DropPlate. El cajón se cierra automáticamente después de 30
segundos (esta característica no es activo cuando se integra la DropSense96).
17
4
2 3
Espalda
1 Interruptor de alimentación
3 Puerto USB
Es necesario utilizar el cable USB Trinean, incluyendo los filtros de ferrita. Sin un funcionamiento estable del
instrumento puede garantizarse si se utiliza un cable USB diferente, por ejemplo, si un cable más largo o si se
utiliza un cable sin los elementos filtrantes.
La fuente de poder
El instrumento DropSense utiliza una fuente de alimentación externa AC / DC (similar a una fuente de alimentación portátil), que se incluye en el
envío. La entrada de alimentación es compatible con los estándares de Estados Unidos (110VAC) y las normas europeas (230 VCA).
Dependiendo de la ubicación del cliente, un cable de alimentación de tipo estadounidense o un cable de alimentación de la UE se incluye con el
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Capítulo 2: Software
Software 2
DropQuant
Software DropQuant de Trinean, se divide en 2 paquetes importantes.
• DropQuant - para definir y llevar a cabo los experimentos.
actualmente.
• Un puerto USB libre (el instrumento sólo se puede conectar a través del puerto USB)
• Microsoft Excel y el lector de PDF de Adobe para manipular los datos archivados (opcional, pero esencial para eso)
Instalación / Actualizaciones
instalación y actualización de software de DropQuant Trinean, funciona como muchos otros programas de software de Windows, y tanto
su instalación y actualización deben trabajar siguiendo el mismo procedimiento.
Iniciar sesión
Después de introducir el nombre de usuario y la contraseña, se producirá una serie de auto-pruebas. Para más detalles sobre los nombres de
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Pantalla de inicio
En esta pantalla de inicio, es posible acceder a la base de datos de medición, estableció un experimento de Nueva / medición
y para acceder a la Información y configuración,
Ayuda
Cierre la sesión e
inicie sesión
Conectarse a la
instrumento
Definir y empezar
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nueva medición
La creación de una nueva medición con DropQuant, requiere unos pocos pasos. En la ventana nueva
medición, es posible definir los siguientes ajustes:
definición experimento: Incluyendo 2 campos editables, el usuario puede definir el experimento por su nombre e incluir
información adicional en el cuadro de descripción. Un nombre predeterminado se genera para cada experimento, e incluye la
fecha y la hora para almacenar fácil cronológica. Toda la información experimento se incluirá en el informe final experimento.
definición de ejemplo: Varias aplicaciones preconfiguradas se han incluido para la definición experimento rápido y fácil.
• Ácidos nucleicos
• UV-VIS general
• Curva estándar
Cada una de estas aplicaciones tiene múltiples sub-opciones que se explican en el capítulo Aplicaciones de este manual.
Solvente: A pesar de no tener ninguna influencia en el espectro medido, esta opción podría influir en los tiempos de las muestras de
bombeo.
Alta viscosidad - En algunos casos en los que las muestras son bastante viscosa, puede que sea necesario para activar este modo. El
modo de alta viscosidad, permite que las bombas funcionen para algunos segundos más de lo normal, permitir que la muestra viscoso
para llegar a las cámaras de medición.
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selección del fondo: Elección entre la corrección de fondo por defecto usando el rango espectral de 400-600 nm o una
sola longitud de onda de elección.
Tipo DropPlate: Dependiendo del rango de concentración de aplicación o de la muestra, una selección de DropPlate-S o DropPlate-D + se
puede hacer. Ambos DropPlates se explican en el capítulo 1. Por otra parte, una placa de 96 pocillos de microtitulación estándar se puede leer.
Esta selección requiere información adicional, tal como longitud de la trayectoria, volumen de la muestra y la marca de placa.
Ruta de selección de longitud: Al seleccionar el DropPlate-D +, el usuario puede elegir entre un único o doble mediciones de longitud de
trayectoria. Cuando se utiliza un DropPlate-S, sólo una única medición de longitud de la trayectoria es posible. Esta selección requiere un
volumen de muestra de 2 l y genera un rango de medición de 0,1-40 OD (para una trayectoria de 10 mm).
Guardar como Formato: Cuando se han realizado todas las selecciones anteriores, el usuario puede guardar estos en un nuevo formato para su
uso futuro. Estos formatos son nombre de usuario de dependiente. Sólo el administrador usuario tiene la posibilidad de hacer un formato que está
disponible para todos los usuarios. Los formatos también se pueden borrar y renombrar.
Después de definir el experimento, es hora de configurar los ajustes de la placa. En esta pantalla, es
posible, entre otras opciones, configurar varias placas.
A pesar de la selección placa múltiple es posible, sólo una placa de 96 pocillos puede ser cargado y se
mide a la vez en los DropSense 96. Cargando múltiples placas dañará el instrumento.
Placa definición
del layout
nombre de la muestra
tabla de definición
DropPlate Nombre / código de barras y descripción - Es posible configurar diferentes nombres de placa para cada plato. En caso de un
DropPlate 96 con un código de barras, es posible utilizar un interno o un lector de código de barras externo. En caso de un lector de código de
Escaneado de un código de barras también tiene la ventaja de tener el sistema de ahorro de todos los pocillos disponibles en una placa en una
base de datos.
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Seleccione el modo de clic - Estos dos botones permiten al usuario cambiar entre el modo de inserción,
donde es posible añadir nuevos pozos o reemplazar los ya existentes, para ver / actualizar Modo, donde es posible navegar a
través de pozos predefinidos, y redefinir información como el nombre del pozo y de tipo bien.
Placa definición del layout - aquí se puede definir el diseño de la placa, siendo posible seleccionar varias opciones.
• Escribe bien - Muestra, En blanco, de referencia (por curvas de referencia). Tenga en cuenta que
• Fuente Coloque la placa - En caso de pipeteado de las muestras de una placa estándar de 96 pocillos a nuestros platos, es posible
añadir un identificador común que permite realizar un seguimiento de la posición de esta muestra sobre la placa de origen.
Abrir los resultados en - para clientes con cDrop, es posible abrir los resultados después de la medición inmediatamente con cDrop para
análisis de contenido. Para todos los demás clientes, la configuración predeterminada será DataViewer. Esta opción debe seleccionarse
antes de definir las ubicaciones de muestra (s) en la placa. También es posible seleccionar entre múltiples protocolos mediante la
selección de la muestra primero y que define en la disposición de la placa, y luego el protocolo.
nombre de la muestra tabla de definición - A pesar de ser posible definir un diseño de placa y el nombre de la muestra en los menús
anteriores, también es posible definir aquí el uso de un formato de tabla. Simplemente introducir el nombre (s) deseada en la mesa después
También es posible copiar valores de un gráfico en Excel a éste simplemente arrastrando la mesa o copiar / pegar él. Esto es
muy útil cuando se trabaja con diseños complejos.
Ajustes adicionales - Al hacer clic derecho en el campo de definición disposición de las placas, es posible acceder a un conjunto de opciones
23
Exportación disposición de las placas / importación - Con el fin de acelerar el proceso de iniciar una medición, es posible predefinir una
disposición de la placa. se aceptan varios formatos, tales como TXT, CSV y XLS.
Importar
Importación de diseño de la placa - Una función de importación ( 'disposición de la placa de importación') está prevista en la parte inferior de
la pantalla 'Placa de distribución' de entrada rápida y fácil de la información disposición de la placa. Existen varios tipos de archivos (Excel, txt y
csv) pueden ser importados y los datos pueden ser reformateado en una mesa de software dedicado para DropQuant configuración de diseño
de la placa rápida.
24
Selección del
plantilla de .xls
tipo de archivo
abierto
Seleccionada
plantilla de
previsualización de archivos
configuración
de formato
de importación
Importada vista
previa de datos
Tipo de archivo de selección - Seleccionar entre los tipos de archivos disponibles. También es posible seleccionar entre las hojas de cálculo
en un archivo en particular.
configuración de formato de importación - Después de pulsar la flecha al lado de “defecto” es posible que el usuario defina el formato que se
desea importar. Tenga en cuenta que si se demuestra que los errores en la información que se muestra en la muestras convertidas / Información
muestras seleccionadas, que tienen más probabilidades de estar relacionado con algo no está correctamente definida aquí.
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Medición
Durante la medición de la placa, DropQuant tiene una sucesión de ventanas con las instrucciones de carga de placas y
la información que permiten al usuario ver la progresión de medición.
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Capítulo 3: Aplicaciones
aplicaciones 3
Hay algunas diferencias importantes y opciones adicionales en la elección del 4 disponibles “Tipos de ejemplo”. Para obtener
información adicional acerca del ADN ARN, la concentración / proteínas y determinación de la pureza, así como el general de
UV / Vis, consulte Anexo 1: Teoría .
Ácidos nucleicos
Etiquetado - La medición de la eficacia de marcado de sondas fluorescentes con etiquetas antes de micro-matriz de hibridación elimina
muestras potencialmente defectuosas y mejora la eficacia experimento. El análisis de espectro completo con el DropSense96, permite
la medición de la absorción de ácido nucleico a 260 nm mientras que la detección del colorante fluorescente en su pico de absorción.
En una sola medición, el software DropQuant calcula la concentración de ácido nucleico se expresa en g /? L y las concentraciones de
colorante en pmol / l.
Etiquetas - Aquí se puede elegir entre varios tipos de etiquetas predefinidas. Al seleccionar esta opción, se activa la pantalla de la
base de datos de etiquetas, donde es posible añadir o eliminar etiquetas.
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mediciones oligo
Un oligo se define por su secuencia. Sus características tales como el peso molecular y coeficiente de extinción molar se
pueden calcular a partir de la secuencia, y pueden ser utilizados en el cálculo de la concentración. Estas ecuaciones están
bien descritos en la literatura. DropQuant permite definir la secuencia de cada muestra, y para usar esta información en el
post-procesamiento.
La concentración se expresa como ng / uL o pmol / uL. La conversión entre ambas depende del peso molecular (que
puede ser calculado a partir de la secuencia)
Los ácidos nucleicos como el ADN se caracterizan por un factor de concentración, que es la concentración como función de
la absorción [ng / uL / OD]. El coeficiente de extinción es la absorción como función de la mol [pmol / uL / OD], la
concentración y la mol están relacionados por el peso molecular [g / mol].
Definición de la secuencia
Materiales> Oligo.
2 Seleccione la unidad de concentración: g /? L o pmol / l. El valor seleccionado se utiliza en el
ventana de post-procesamiento. El valor predeterminado es g /? l.
Otras opciones de como disolventes, etiquetas y corrección de fondo se pueden seleccionar como para otras muestras de ácido nucleico.
La secuencia se puede introducir en la pantalla de definición de ejemplo, usando el botón “Enter / check secuencias”.
1 En primer lugar definir las muestras, incluyendo el, definición placa de fuente en blanco y otra
información. Después se definen las muestras, la información de la secuencia puede ser definido.
2 Haga clic en el botón “Enter / check secuencias y una mesa con los pozos definidos en la placa
aparecerá.
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Disponible, tenemos 2 métodos de entrada diferentes.
Secuencia - Tipo de la secuencia de oligonucleótidos, o copiar / pegar desde una tabla de Excel. El software calculará
las propiedades tales como el coeficiente de extinción, el peso molecular y el factor de concentración.
Toda la información se puede guardar en Excel pulsando la 'exportación a Excel' botón en la parte inferior de la pantalla. La fosforilación
tanto en el extremo 5' y 3' también puede ser incluido mediante la adición de la cantidad adecuada o la letra 'p' de la secuencia. Presione
'Guardar' para volver a la pantalla 'diseño de la placa'.
E & MW - Aquí es posible introducir coeficientes de extinción individuales o replicados e información de peso molecular.
Cuando se utiliza el “réplicas” función de entrar en la secuencia de una muestra se lleva automáticamente a la de relleno en de la
secuencia y los datos para todos sus repeticiones.
Por favor, no confundir con la replica Botón disponibles en la misma pantalla. los
último está destinado a ser utilizado en la aplicación de las curvas de calibración.
proteínas
Medición de múltiples proteínas con diferentes coeficientes de extinción - cuando se mide varias proteínas, es posible
establecer que la información antes de la medición.
29
30
General de UV / Vis y curva estándar
Además de las otras opciones de tipo de muestra, también es posible realizar una medición UV general / Vis, o una
curva estándar.
Para obtener más información sobre las curvas de calibración, por favor lea la información adicional en el Anexo 1: Teoría.
curva estándar a partir de un experimento anterior. Ambos métodos se explican en este párrafo.
31
campos de entrada siguientes están disponibles para definir los parámetros de la curva estándar método:
Esto no puede ser cambiado por el cliente después de la medición se realiza. Sin embargo, tenga en cuenta
que la Método puede ser cambiado más adelante.
32
Las curvas estándar disponibles para la selección, están directamente disponibles al hacer clic en la “medida nueva curva de botón
estándar”.
El usuario también puede navegar las curvas estándar disponibles haciendo clic en el botón “Ver curvas STD”. Esto abre una ventana con
Una vez que el usuario ha seleccionado una curva estándar predefinido, no es posible añadir nuevas muestras de
referencia estándar en el experimento.
33
Las muestras definición
• Hay un conjunto de muestras de referencia para definir una curva estándar que se utiliza para todas las
muestras desconocidas en el experimento. No es posible definir múltiples curvas de calibración en un solo
experimento.
• Un experimento puede contener múltiples placas, las muestras de referencia pueden estar en cualquier lugar
en una o varias placas.
• Las muestras de referencia se pueden definir en cualquier placa dentro del experimento. Sin embargo, si se
detiene la medición (por interacción con el cliente, fallo del instrumento, avería de potencia, etc) antes de
que se midieron las muestras de referencia, se calcularán las concentraciones de NO.
No es posible definir muestras de la curva estándar adicionales si se selecciona una curva predefinida. Se recomienda definir
las réplicas de las muestras de referencias, para mejorar la precisión global del método. Esto es muy recomendable si los
valores de DO de las referencias están en los límites de la zona de detección ( 0,1 OD).
34
definición de ejemplo
La sección de importación se extiende, lo que permite la definición de las mediciones de la curva estándar. Hay una columna adicional para
la definición del valor de referencia. Si esta columna contiene un número, entonces la muestra es por defecto una referencia. Si está vacío,
Los ajustes de la curva estándar son parte del formato, y por lo tanto no son parte del archivo de importación.
La ventana de resultados
experimentos de curva estándar se pueden seleccionar de la base de datos de medición y se abrieron en la ventana de
post-procesamiento igual que cualquier otra medición DropQuant. La ventana de resultados muestra los espectros medidos de todas las
muestras (referencias y muestras desconocidas). La concentración de las muestras desconocidas se calcula y se muestra en las tablas.
35
Hay una pestaña adicional que muestra la curva estándar.
36
Almacenamiento de una curva estándar para un uso futuro
En la ficha curva estándar, el usuario puede hacer clic en el botón “Guardar curva estándar” para guardar la curva estándar para un uso
Es importante tener en cuenta que para algunos tipos de experimentos, una nueva curva estándar debe ser utilizado
siempre, en lugar de una guardada previamente uno.
La función de exportación de datos incluye un par de columnas adicionales en caso de un experimento de curva estándar:
• “A540 (10mm)” (si 540 es la longitud de onda elegida para la construcción de la curva estándar): la OD medida
utilizado para crear la curva estándar.
• “Concentración”: la concentración calculada. La sintaxis depende de la unidad definida en la fase de definición
experimento. Por ejemplo: si la unidad es ng / uL, entonces el nombre de la columna debe ser “Concentración (ng / uL)”
Aplicaciones Típicas
Las solicitudes de la curva estándar incluyen la medición de la concentración de proteínas con coeficiente de extinción
desconocido, lectura de ensayos colorimétricos, etc.
37
Capítulo 4: La interpretación de los datos
Salvado
experimentos
configuración de la
administración experimento
La portada DataViewer muestra todas las mediciones corrieron en su DropSense 96. Es importante señalar que algunos
experimentos podrían no ser visibles para ciertos usuarios debido a los derechos de acceso. Para obtener más información, lea la
sección Usuarios de este manual.
filtro de búsqueda campo - Para ayudar al usuario en busca de mediciones previas basadas en un campo específico, es posible filtrar las
Los experimentos guardados - Todos los experimentos medidos accesibles para el usuario actual, se mostrará aquí. Es importante durante la
configuración de un experimento, a la entrada de la mayor cantidad de información posible para que pueda ser buscado mientras que los
resultados de filtrado.
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configuración de la administración experimento - Este conjunto de botones permite al usuario experimentos o bases de datos de
exportación e importación.
• Postal experimento seleccionado - Útil para el diagnóstico. Cada vez que se enfrentan a problemas con el DropSense 96 es
importante para enviar los experimentos en los que el problema ocurrió por primera vez a su distribuidor local.
• Importar base de datos - Ya que es posible utilizar tanto DropQuant y DataViewer como software independiente, puede también
experimentos de importación guardado en un equipo diferente.
Después de una medición, son posibles dos opciones dependiendo del método seleccionado en la definición experimento
de DropQuant.
Por defecto, DropQuant DataViewer comienza, lo que permite al usuario acceder a las opciones diseñadas para ayudar a interpretar las
mediciones realizadas con el DropSense 96.
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96-Bueno Display
Esta ventana permite al usuario tener una visión clásica de las muestras medidas.
columna de visualización
Al igual que en la pantalla 96-Bueno, pero con una vista de la columna en su lugar.
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Bueno sola pantalla
Probablemente la vista más interesante en la ventana de resultados, ya que permite al usuario cambiar los parámetros con el fin de
analizar los resultados. También permite al usuario tener una vista más detallada, que no es posible con otras fichas.
Concentración
Bien entrada de
selección
Plato
isión de conjunto Blanco
corrección de
Botón de exportación
fondo
En la parte superior, el cliente puede seleccionar la opción “Mostrar cursor”. Esto mostrará un cursor en la ventana de vista de espectro, lo
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Bien entrada de selección - ya que es posible seleccionar un solo pozo para ser visualizados en esta ventana, también es posible seleccionar
Blanco - Cuando se utiliza una muestra en blanco, que se resta automáticamente de la absorbancia de la muestra antes del cálculo de la
concentración. Esta característica se puede desactivar de modo que el cálculo de la forma y concentración espectral se muestra sin
compensación en blanco. En este modo, la forma de la misma espectro en blanco puede ser analizado. Cuando la sustracción en blanco se
apaga, todas las demás pantallas generarán datos sin sustracción en blanco.
Estos ajustes no se almacenan en los DropFiles: la próxima vez que se abra la DropFile, se muestran los datos
utilizando la configuración original a la hora de definir el experimento.
También es importante que todas las piezas en bruto contienen MQ (o similar) de agua solamente.
Corrección de fondo - el método de corrección de fondo, se puede seleccionar en el panel “Iniciar nueva medición”, mientras que
la creación de un nuevo experimento. La información de fondo se deriva a partir del espectro RAW OD medido. En sus Configuración
predeterminada , un lineal encaja a través de la región de 400-600 nm del espectro de transmisión se resta del espectro completo.
Sobre el punto único
el modo, el nivel de fondo de una longitud de onda de elección se resta del espectro completo.
Mostrar informe
42
En esta ventana se muestra un pequeño informe que incluya toda la información necesaria para una medida clásica. Aquí también es
posible cambiar la descripción experimento. Alguna información adicional, como la fecha de medición, el tipo utilizado DropPlate,
realizado por, entre otros, también se puede encontrar en esta pantalla.
Esta información también podría ser importante para fines de diagnóstico cuando aparece un problema.
43
Capítulo 5: La exportación de datos
La exportación de datos 5
En DropQuant DataViewer, exportador no podía ser más sencillo. Casi en todas las pantallas es posible exportar los datos medidos, ya sea
para sobresalir o uno de los muchos otros tipos de archivos que tenemos disponibles, o en un sistema LIMS.
resultados de exportación
Al exportar los resultados, es posible seleccionar de antemano la información que desea exportar.
columnas
disponibles
ajustes de
exportación
Las columnas
seleccionadas
Las columnas
seleccionadas
Todas las columnas disponibles - Aquí es posible encontrar varios campos con los datos disponibles para la exportación. También es posible
mover los campos de arriba a abajo, de esta manera la organización de la columnas seleccionadas tabla anterior.
Configuración de exportación - También es posible definir algunas configuraciones adicionales con respecto al formato del archivo final. Es
posible elegir entre 4 tipos de archivos e impresión directa, para incluir un resumen y el diseño de la placa, y alguna información adicional
44
Los valores extremos de exportación
También es posible exportar los valores extremos de su experimento. En esta pantalla, es posible definir qué exportar, y
cuáles son los rangos que desee utilizar como filtro.
La normalización de exportación
La última pestaña en la ventana de exportación permite al cliente para calcular las cantidades de muestra y el tampón para ser mezclado
para lograr la normalización: el objetivo es diluir las muestras para igualar la concentración de todas las muestras a la misma concentración
(y opcionalmente también mismo volumen) .
45
Hay dos modos de funcionamiento diferentes.
Añadir tampón de la muestra para lograr una concentración objetivo - Se supone que todas las muestras están disponibles en el
mismo volumen. Para este modo, seleccione volumen de muestra máximo . Tenga en cuenta que la normalización no se puede hacer si la
concentración de la muestra es menor que la concentración objetivo. En ese caso, el valor de la volumen de tampón añadido en la tabla
aparecerá como un guión (-). Para tener una solución la concentración normalizada debe ser menor que la menor concentración medida
en el conjunto de muestras. DropQuant incluye la opción de establecer la concentración diana a la concentración más pequeña de la serie
de muestras. En ese caso, la muestra más pequeña no necesita ninguna dilución. Entonces el volumen de tampón añadido debe ser 0.
Tome alícuota de la muestra y mezclar con tampón para lograr muestra normalizada con el volumen objetivo y concentración
objetivo - El volumen de la alícuota tomada de la muestra se identificó como el aquí
volumen de la muestra usado ; el volumen de tampón que se añade es la volumen de tampón añadido . Para este modo, ajustar el volumen final
hasta el valor deseado. Aquí, no existe una solución si el volumen de la muestra de destino es demasiado grande y / o si la concentración objetivo
es demasiado grande.
Una vez que esto se ha seleccionado, los volúmenes de muestra y tampón requeridos se calculan automáticamente.
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exportación rápida
Para mayor comodidad del usuario DropQuant DataViewer también permite exportar rápidamente los datos a formato .xls. Tenga en
cuenta que esta función sólo está disponible en la ventana de visualización bien sola, y que con el fin de exportar más de una medición /
pocillo, la columna de la izquierda tiene que tener las medidas deseadas seleccionado.
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Capítulo 6: Software - funcionalidades extra
La funcionalidad del software DropQuant depende del nivel de usuario al iniciar la sesión.
• Huésped - funcionalidad mínima: puede realizar mediciones, no se requiere contraseña.
• Usuario - este es el nivel de usuario por defecto, que ofrece la funcionalidad completa del software para iniciar las mediciones y
• Administrador (en las versiones anteriores gerente de laboratorio) - tiene más derechos para cambiar los ajustes tales como la base
de datos de usuario y la ubicación de la base de datos de medición. La adición de más usuarios de nivel de administrador de inicio de
• el nivel de acceso para el mantenimiento y resolución de problemas del instrumento DropSense - servicio. Este nivel requiere un
En el inicio, se crean una serie de usuarios por defecto. Se recomienda añadir más usuarios de nivel de administrador durante
el proceso de instalación y cambiar la contraseña por defecto. No se olvide de escribirlo en un lugar seguro.
El usuario es el “dueño” de sus propias mediciones; esto tiene un impacto en la visibilidad de los experimentos. Por defecto
experimentos sólo son visibles para el propietario de la medición, y por lo tanto no son visibles para otros usuarios. Esto protege
a los resultados del experimento. Hay dos excepciones:
• Los usuarios siempre pueden abrir y analizar las mediciones de propiedad de un usuario de un usuario de nivel inferior. Por ejemplo:
todo el mundo puede analizar las mediciones realizadas por el invitado, los ingenieros de servicio pueden abrir y analizar las
• Es posible dar a un usuario acceso a todas las mediciones de propiedad de todos los demás usuarios hasta el nivel de
administrador.
Los productos desechables de 96 pocillos todos tienen un código de barras con una etiqueta única. El instrumento DropSense se puede
ampliar con un escáner de código de barras interno y el software DropQuant incluye una gran cantidad de funciones relacionadas con el
código de barras.
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El código de barras en la DropPlate
El tipo de código de barras en los DropPlates es un código universal, tipo de código 128, 2 puntos, y 14 caracteres. Este código puede
ser leído por todos los escáneres de códigos de barras. La sintaxis del código único es ABCCCDDEEFFFFF; con
• A es el número de producto
• B es el número de revisión de ingeniería
Trinean define este código; no hay posibilidad de pedir DropPlates con códigos definidos por el usuario.
• Compruebe si la placa se ha utilizado antes, y desactivar los pozos que se han utilizado antes.
La definición experimento
Al definir un experimento, el cliente puede optar por utilizar el escáner de código de barras interno o no. Cuando se selecciona esta
opción, el software DropQuant automáticamente leerá el código de barras cuando se carga el desechable, y comprobar si esto está de
acuerdo con la definición de placa (o añadir el código de barras para la definición de placa).
Al definir las placas en el experimento, el usuario debe introducir la etiqueta de código de barras como nombre para la placa. Hay 3
opciones:
• De entrada a través del teclado: haga doble clic en el nombre por defecto y editar el nombre.
49
• El escáner de código de barras interno: haga clic en el botón “código de barras escaneado” y el código se escaneará y se
llena automáticamente en la tabla. Si no hay una placa en el instrumento, la bandeja se abre automáticamente y el cliente
puede cargar la placa.
• Utilizar un escáner de código de barras externo conectado al PC. Esto se explica en el siguiente párrafo.
En el caso de las etiquetas de código de barras no se conocen en la definición del experimento, el cliente puede utilizar los nombres
predeterminados. Durante las mediciones, el programa analizará el código, detecta que el nombre no se corresponde con los nombres
de placas definidas en el experimento, y pedir al cliente para sobrescribir el nombre de la placa con el código escaneado. Tenga en
cuenta que en este caso el DropQuant comprobará el tipo DropPlate y fecha de caducidad durante la medición (no antes del comienzo
de la medición).
En ese caso, es responsabilidad del cliente para conectar los resultados de la medición DropQuant con la información de
origen de la placa / posición. Se supone que el cliente haya guardado esta información durante la dispensación.
El escáner de código de barras interno es una opción del instrumento DropSense. Póngase en contacto con el técnico de servicio para
El uso de un escáner externo para escanear el código de barras para su uso en la definición de placa
Es posible utilizar parte de la funcionalidad de código de barras cuando se utiliza un escáner de código de barras externo que actúa como un
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• El nombre puede ser explorado de una manera conveniente y el programa DropQuant comprobará el tipo de fecha
desechable y expiración del DropPlate
• El nombre puede ser escaneado y se comprobará la base de datos de pozos disponibles para desactivar los pozos en ese
plato que se han usado antes.
No es posible comprobar el orden de las placas insertadas en el instrumento cuando se hace un experimento con
múltiples DropPlates. Esta verificación se encuentra disponible para el escáner de código de barras interno.
Hay muchos tipos de escáneres de código de barras externas que actúan como un teclado: en primer lugar, haga clic con el ratón en el campo
de entrada en el software DropQuant, de modo que el cursor esté en la buena posición. A continuación, escanear el código de barras: el código
Asegúrese de ajustar los parámetros correctos para el escáner (tipo de código de barras, el tipo de idioma para el teclado, etc.).
En caso de que el usuario utiliza placas de formato DP96 y un escáner de código de barras interno, DropQuant está listo para realizar un
seguimiento de las placas y los pozos utilizados por el sistema. DropQuant incluye el software para realizar un seguimiento de los pozos utilizados.
Después de escanear una placa de código de barras, DropQuant será operaciones de búsqueda inmediatamente este código de barras en la
base de datos bien utilizados y mostrar un icono-cruz para los pocillos que ya se utilizan.
Esta función también está disponible para la operación manual del escáner de código de barras.
limitaciones
• Esta función está disponible para la placa DP96 solamente. Para los clientes que utilizan la placa de formato DP16 sobre aluminio
• Si el cliente utiliza varios ordenadores conectados a DropSense, entonces estos equipos deben compartir la misma base de datos
de pozos disponibles. Selección de la base de datos bien utilizado se explica en el párrafo siguiente.
51
Capítulo 7: Software - configuración avanzada
Este botón abre una nueva ventana que contiene dos pestañas de información del sistema, herramientas de diagnóstico y opciones de
configuración de software.
Diagnóstico / Estado
Comprobar Capítulo 8: Las herramientas de diagnóstico
IQOQ
En la pantalla anterior, se puede encontrar un “informe Crear IQOQ”. El software automatiza el IQOQ tanto como sea posible, guiando
al usuario a través de la validación y la creación de un informe. Después de pulsar el botón, una pantalla pop-up preguntando por el
código IQOQ que se pueden comprar en su distribuidor local.
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Editar ajustes
Los ajustes del software se almacenan en un número de diferentes archivos .ini. El usuario administrador puede editar, exportar e
importar estos ajustes, para mantener el sistema actualizado.
cuentas
La base de datos de edición de usuario permite añadir nuevos usuarios y editar los ajustes de los usuarios actuales.
Sólo los usuarios de nivel de administrador puede crear nuevos usuarios. La única información requerida es el nombre de usuario, la
contraseña y la opción de dar al nuevo usuario acceso a todos los experimentos. Cuando se selecciona el “acceso a todos los experimentos”,
que el usuario puede abrir todos los experimentos por los niveles huésped usuario, usuario y administrador. También los informes pueden ser
creados a partir de estos experimentos. nivel de servicio es necesario para crear nuevos usuarios administradores. Póngase en contacto con
el servicio técnico.
por experimento, con todos los datos en bruto. La ubicación de este directorio se puede cambiar haciendo clic en el botón “ubicación de la
base de medición”.
Indexación de grandes bases de datos puede tomar mucho tiempo, especialmente cuando la ubicación de la base de
53
formatos
Los formatos no son comunes para todos los usuarios DropQuant. Cada usuario define sus formatos y estas son por defecto no visible para
otros usuarios DropQuant. Sin embargo, el administrador puede hacer que uno o más de sus formatos visible para todos los usuarios
DropQuant.
los usuarios de nivel de administrador tienen acceso a las herramientas de gestión de base de datos bien utilizados a través de la
El usuario puede desactivar esta función y cambiar su ubicación. Se recomienda seleccionar una unidad de red para esto, así que
los diferentes PCs pueden tener acceso a la misma base de datos pozos disponibles.
También es posible:
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ajustes de importación y exportación
El programa DropQuant almacena un número de configuración de usuario en archivos .ini. Al instalar el software DropQuant en un PC nuevo,
el usuario tiene que transferir la configuración de la PC vieja a la nueva PC. La sección de configuración y herramientas incluye herramientas
La ventana de importación también permite importar una base de datos desechables. Esto en caso de Trinean actualiza la
base de datos disponible (por ejemplo, cuando se ponen en marcha nuevos tipos de materiales desechables). A medida
que el usuario no puede editar la base de datos disponible, no existe un método para exportar esa información.
El uso de formatos no está disponible para todos los usuarios DropQuant. Cada usuario define sus formatos y estas son por defecto no visible
para otros usuarios DropQuant. Sin embargo, el administrador puede hacer que uno o más de sus formatos visible para todos los usuarios
DropQuant.
Licencia
Algunas extensiones de software para el software DropQuant requieren un dongle USB y código de activación. El dispositivo de seguridad y el
código se envían al ordenar las extensiones de software, tales como la API de software cDrop. tiendas DropQuant la información del código de
activación para que el usuario no tiene que introducir el código de activación cada vez que se inicia el software de complemento (insertar el
dispositivo de seguridad siempre se requiere). El DropQuant puede almacenar varios códigos de activación, y detecta automáticamente si uno de
55
funciones adicionales de visualización de datos
Cambiar usuario
Este servicio está disponible para todas las mediciones de propiedad de los niveles de usuario invitado, usuario y
administrador. Si, por ejemplo, las mediciones son realizadas por un técnico de servicio, a continuación, el administrador
no es capaz de cambiar el propietario de estas mediciones.
Elimina los datos en bruto de los experimentos en el disco, y elimina las entradas de la base de datos.
Esto elimina por completo los experimentos. No hay manera de recuperar los datos después.
Esta función importa un conjunto de experimentos de una carpeta. Los experimentos deben copiarse en un directorio temporal (y
descomprimidos en el caso de estos nuevos experimentos están en zip).
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Capítulo 8: Diagnóstico y calibración de herramientas
Con el fin de hacer la longitud de onda (óptico) de calibración, por favor siga las siguientes instrucciones.
botón.
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verificación de dicromato de potasio
DropQuant de software incluye un procedimiento de validación del rendimiento como un fácil chequeo de las actuaciones de la
DropSense96. La comprobación se basa en la medición de una solución de dicromato de potasio acuoso (K2Cr2O7) con una
concentración verificado (Trinean número de producto 301010).
Es una buena práctica para comprobar el rendimiento del instrumento cada cuatro meses (dependiendo de la cantidad de muestras de
medida) con un vial nuevo de K2Cr2O7.
3 Pulsar el botón “prueba de dicromato de potasio”, una nueva pantalla aparece con Potasio
dicromato entrado automáticamente como “material de muestra”.
4 Introduzca la DropPlate de elección (DropPlate-D + o DropPlate-S) y el “absorbancia objetivo”
de la solución, propuesta por el fabricante, normalizada para una longitud de trayectoria de 1 mm (esta información se puede
encontrar en el lable vial). El software DropQuant calculará automáticamente los valores de DO esperados para todas las
longitudes de ruta usados en el DropPlate.
5 Cargar la solución de dicromato en blanco y potasio en un DropPlate como se indica en la
pantalla. Use agua MQ para este propósito.
La “visualización del informe”, el software DropQuant mostrará los resultados del procedimiento de validación. Se muestran todos los valores
de la DO medidos por los 4 sistemas ópticos en la DropSense96.
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Por cada sistema óptico, la media de todas las mediciones se calculan y se compara con el valor OD esperado de la
solución de dicromato de potasio. indicaciones de color se muestran dar una visión clara:
• El color verde: indica que la medida está dentro de la variación de medida esperada. El DropSense96
realiza dentro de las especificaciones.
• Color rojo: indica que la medida no está comprendida en la variación esperada. Póngase en contacto con
su distribuidor local para un sistemas de chequeo.
Un informe (txt, xls, pdf), se puede crear utilizando el botón de “exportación”. Este informe se puede guardar para referencia futura.
6 Las bombas que realizan fuera de las especificaciones (ver indicaciones de color en la vista en miniatura)
7 El rendimiento óptico del DropSense96 está fuera de especificaciones
8 Cuando se muestran los valores de rojo, repetir la prueba de validación con el vial abierto (si repetición puede
hacerse dentro de los 30 minutos de la prueba), o con un vial fresco. Si el resultado es consistente con la primera prueba, por favor,
Comprobación rápida
Esta herramienta realiza una comprobación rápida del módulo de espectrofotómetro y el módulo de la bomba en el DropSense96. Esta
comprobación rápida se inicia automáticamente cuando se activa y se tarda unos 30 segundos. La comprobación del sistema rápida consiste en:
2 Bomba de comprobación del sistema - la presión de salida de las bombas se mide utilizando el interno
sensores de presión, y en comparación con los valores en la calibración. Esto permite la comprobación de la degradación de las
bombas.
3 Controlar el motor - la función de los motores y los finales de carrera está marcada.
4 El funcionamiento del sensor de luz de fondo interno y la temperatura interna
sensor se comprueba.
Después de la comprobación, una ventana emergente muestra los resultados más importantes. Un informe de Excel se pueden crear
utilizando el botón “Crear informe”. Este informe se puede guardar para referencia futura.
Al instrumento puesta en marcha o la cuenta de inicio de sesión, el DropSense96 realiza automáticamente comprobaciones de diagnóstico para
asegurar que está funcionando dentro de las especificaciones. Cuando uno de los parámetros está fuera
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de la especificación aparece una pantalla de advertencia. Por favor, póngase en contacto con su distribuidor local para una
recalibración DropSense96.
a pesar útil, siempre debe ser complementado con los archivos de experimento.
60
Capítulo 9: Solución de problemas
Solución de problemas 9
La solución de un problema
En caso de problemas con el instrumento que no están incluidos en nuestra lista de preguntas frecuentes, por favor, póngase en contacto
Con el fin de tener este proceso que se ejecuta sin problemas, por favor, siga estos pasos:
1 Exportación y cierre de los experimentos cuando el tema comenzó a ocurrir. También incluir al menos
Un experimento justo antes de que el problema apareció por primera vez.
2 En caso de problemas de inicio, por favor genere un archivo ZIP.
3 Escribir en detalle lo que se suponía que ver en ese experimento. Algunas de las cuestiones
podría estar relacionado con un ensayo específico y no al hardware.
En nuestra página web se puede encontrar en la sección de soporte una lista para ser enviada al distribuidor en caso de problemas.
Por favor, tenga en cuenta que esta lista se actualiza constantemente. Para obtener una lista completa FAQ, por favor consulte nuestra
página web.
8 ¿Puedo usar mi dispositivo de seguridad después de una actualización del programa de software adicional?
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1 La fecha de caducidad es desechables horas extras.
La fecha de caducidad es de 12 meses (un aumento de 6 a 12 meses en la Q2 2011). No se recomienda utilizar los
desechables después de la fecha de caducidad. El cliente debe utilizar el desechable antes del final del mes indicado
en la fecha de caducidad.
DP-S DP-D +
excesivo mediciones malas. La probabilidad de sobrecarga es bastante pequeña (pocos pozos max por placa de 96 pocillos), pero
demasiado grandes para garantizar un funcionamiento libre de errores de las placas cuando se carga con volumen de muestra
demasiado.
No, no es posible volver a utilizar un desechable: aumenta el riesgo de contaminación cruzada de muestras y de las
propiedades de auto-carga desaparece, lo que resulta en bajo rendimiento del proceso de bombeo de la muestra. No es
ni posible hacer una segunda medición en el desechable con las mismas muestras. El algoritmo de medición asume la
muestra está en el meandro y el depósito de medición está vacío al inicio de la medición, y compara la transmisión óptica
del depósito lleno de la transmisión del depósito de vacío. Este proceso falla si los embalses ya están llenos al comienzo
del proceso de medición.
rango de temperatura de operación es de 15 - 35deg C (~ temperatura ambiente) (esto es 59-95 ° F). Rango de humedad es del 10%
Trinean tiene un complemento de producto de software que automatiza el procedimiento IQOQ tanto como sea posible. Se guía
al usuario a través del proceso de validación y crea un informe. El software permite la validación del sistema para los próximos
aplicaciones:
• Calificar el instrumento DropSense instalado y el software DropQuant como sistema genérico UV / VIS para la
cuantificación de muestras microlitro.
• Calificar el instrumento DropSense instalado con un escáner de código de barras y el software interno DropQuant como
sistema genérico UV / VIS para la cuantificación de muestras microlitro.
62
• Verificación de los perfiles de la bomba es parte de la prueba de rendimiento OD.
Para obtener más información sobre los requisitos del sistema y los detalles de la compra, por favor, póngase en contacto con soporte comercial
en el sales@trinean.com
• cDrop
• DropControl
• Servicio
8 ¿Puedo usar mi dispositivo de seguridad después de una actualización del programa de software adicional?
Puede actualizar el software del programa de complemento a las versiones más recientes, y seguir utilizando el antiguo código de llave y la
activación: usted tendrá acceso a todas las funciones que están permitidos por el dispositivo de protección.
La mochila es único: no hay copias disponibles. Esto significa que usted tiene que comprar un nuevo dispositivo de seguridad.
No.
Comprobar si las mediciones son realizadas por la misma cuenta de usuario. Si las mediciones en la base de datos se miden por el usuario
diferente del usuario que ha iniciado sesión en el software DropQuant, entonces no van a ser visibles.
Cambie a la cuenta de administrador para ver todas las mediciones definidas en la base de datos de usuario de dicha instalación DropQuant. Las
mediciones realizadas por el servicio nunca son visibles por el gerente de laboratorio o los usuarios estándar. Estas mediciones son visibles por
el nivel de servicio solo. Esto puede suceder cuando se hace intervenciones de los servicios, en los que las mediciones se hacen debajo servicio
DropQuant (y cDrop) no pueden importar experimentos con cremallera. El software sólo puede importar el directorio
experimento (normalmente un directorio con el nombre / experiment_1234). Lo más probable es la versión del DropFile es más
reciente que la versión del software DropQuant.
Puede comprobar la versión del DropQuant instalado desde la “configuración y herramientas” (registrado como administrador). No se
puede comprobar la versión del DropFile. También es posible consultar la versión DropQuant que se utilizó durante las mediciones.
Usted puede encontrar esto al abrir el archivo de registro que forma parte del directorio experimento.
63
14 ¿Puedo corregir errores en la definición de las muestras después de la medición?
No, esto no puede hacerse en el software DropQuant: no es posible editar la definición experimento después (tipo de placa, tipo
de material, la posición de los espacios en blanco, etc.). Tengo varios rojos etiquetados resultados Razones para esto pueden
ser varias:
La solución es sencilla: poner el fondo en ningún fondo, o longitud de onda única corrección de fondo (la selección de
una longitud de onda a la que la muestra no está absorbiendo).
64
Anexo A: Teoría
Teoría UN
ADN / ARN concentración y determinación de la pureza
muestras de ácido nucleico se pueden comprobar para la concentración y la calidad utilizando el espectrofotómetro DropSense96. Los
ácidos nucleicos que tienen un máximo de absorción a 260 nm (A260) y la lectura espectrográfico en esta longitud de onda es el método
más común para la detección de ADN de doble cadena, ssDNA, RNA y oligonucleótidos en una solución. La concentración de ácido
nucleico se calcula usando la ley de Beer-Lambert (ver más abajo), que predice un cambio lineal de la absorbancia con la concentración.
Usando esta ecuación con un 1 cm de longitud de trayectoria, una lectura A260 de 1.0 es equivalente a ~ 50 ng / l dsDNA, ~ 33 ng / l o ~
40 ng / l de ARN de cadena sencilla.
Ley de Beer-Lambert: A =
ε.cl
Los datos de absorbancia se archiva en la base de datos y se visualiza en la pantalla del software después de cada medición. En
la aplicación de ácido nucleico, el software elige automáticamente qué trayectoria longitud genera los mejores valores de
absorbancia y normaliza esta medición a un 1,0 cm (10,0 mm) camino. Estos se muestran en el software para el análisis de datos
adicionales.
/ ARN determinación de la pureza de ADN - contaminantes celulares residuales como proteínas o compuestos usados en la preparación de
ADN / ARN con frecuencia permanecen presentes en la solución de ADN y, a menudo interfieren con la medición a 260 nm conduce a resultados
incorrectos. Tanto la proteína y el ADN absorber la luz UV pero tienen diferentes curvas de absorbancia. El pico de absorción de la luz para el
ADN es a 260 nm, mientras que las proteínas absorben fuertemente a 280 nm, debido principalmente a cadenas de triptófano y laterales de
tirosina. Por lo tanto, la pureza de una muestra de ADN se puede calcular mediante el examen de la relación de los dos valores de absorbancia.
los valores de A260 / A280 de ~ 1,7 a 1,8 predicen “limpiar” ADN; ARN buena calidad tendrá una relación de 260/280 ~ 1,8-2,0. Los valores más
bajos pueden ser indicativos de proteína significativo, fenol u otra contaminación compuesto aromático.
Sin embargo, la relación A260 / 280 no siempre es una representación exacta de la pureza de ADN. Otras sustancias contaminantes como
EDTA y los hidratos de carbono tienen una baja absorción de 280 nm pero absorben la luz UV alrededor de 230 nm. Además, algunas
proteínas que contienen pocos residuos aromáticos tienen poco absorbancia a 280 nm, mientras que todas las proteínas tienen un pico de
absorción clara a 228 nm debido a sus enlaces peptídicos. Esto hace que la relación de 260/230 a menudo un indicador más constante de la
presencia de proteína en una muestra de ácido nucleico. Por lo tanto, las lecturas de absorbancia medidos ambos a 230 nm y a 280 nm
proporcionar una estimación más precisa de contaminantes que pueden estar presentes en muestras de ácido nucleico. La relación de la A260
/ A230 debe ser ~ 1,8 o mayor ya que los ácidos nucleicos tienen una minima absorbancia a 230 nm.
sesenta y cinco
Se recomienda utilizar las lecturas de absorbancia a A260, 280, y 230 y el examen de los dos A260 / 280 y A260 / 230
relaciones para cada muestra. Como regla general, una relación de 260/280 de ~ 1,8 y una relación de 260/230 de ~ 2,0
o mayor predecir ADN 'limpia'; buena calidad del ARN tendrá una relación de 260/280 de ~ 1,8-2,0 y una relación OD
260/230 de ~ 2,0 o mayor.
La relación 260/280 puede diferir dependiendo del espectrofotómetro utilizado. Es depende tanto de las características de la muestra (pH,
fuerza iónica) y la precisión de la longitud de onda del espectrofotómetro utilizado. Dado que el pico de absorción de ADN muestra una
pendiente empinada a 280 nm, un ligero cambio en la precisión de la longitud de onda (+/- 1 nm) puede resultar en ~ 0,2 cambio en la
relación 260/280.
La concentración de proteínas como ácidos nucleicos, puede ser determinada midiendo su absorbancia UV a 280 nm y calculando la
concentración usando el coeficiente de extinción de la proteína en la ecuación de Beer-Lambert. Este método es adecuado para
cuantificar proteínas purificadas.
Sin embargo, la absorción de 280 nm de las proteínas depende de la presencia de aminoácidos aromáticos (Trp, Tyr y Phe) y
enlaces disulfuro Cys-Cys. La absorción UV de las proteínas es muy variable y depende de la concentración de aminoácido
particular de la proteína. Además, tipo de tampón, fuerza iónica y pH afectar la absorción UV e incluso soluciones de proteínas
puras pueden tener diferentes conformaciones y modificaciones. Al realizar mediciones de la concentración A280 proteína, el
mejor enfoque es derivar empíricamente el coeficiente de extinción para la proteína de interés, o buscar los coeficientes de
extinción de proteínas publicados (ejemplos en el Manual práctico de Bioquímica y Biología Molecular). Alternativamente, si la
secuencia de la proteína de la proteína a ser medido es conocido, el coeficiente de extinción molar teórico se puede calcular
usando la ecuación:
ε = el coeficiente de extinción
# = Número de
Trp = triptófano, Tyr = Tirosinas, Cys = cisteínas
Una concentración de proteína muy áspera puede obtenerse haciendo la suposición de que la muestra de proteína tiene un coeficiente de
extinción de 1, por lo 1 OD = 1 mg / ml de proteína.
En combinación con el DropPlate-D + consumible, la DropSense96 realiza una medición de doble vía, con longitudes de
trayectoria de 0,7 y 0,1 mm para permitir la cuantificación de proteínas con un amplio rango de concentración sin necesidad de
dilución. Utilizando los DropPlate-S con una sola micro-cubeta (camino de 0,5 mm) en el DropSense96 es ideal para el análisis
rápido de muestras de proteínas dentro de un rango de medición más limitada.
Los datos de absorbancia se archiva en la base de datos y se visualiza en la pantalla del software después de la medición. En la
aplicación A280 proteína, el software elige automáticamente que longitud de la trayectoria genera los mejores valores de
absorbancia y normaliza esta medición a un 1.0 cm (10,0
mm) camino.
66
Puesto que la absorción UV de los ácidos nucleicos a 280 nm puede ser tanto como 10 veces el de una proteína, un pequeño
porcentaje de ácidos nucleicos en la muestra puede distorsionar considerablemente la cuantificación de proteínas. Por lo tanto, la
muestra de pureza de proteína debe ser determinado usando la relación A260 / A280. Una proporción A260 / A280 <1 indica
proteína “puro”, mientras que un valor mayor indica contaminación de ácido nucleico.
Un método alternativo para la cuantificación de proteínas es un ensayo de proteína colorimétrico, tal como un BCA, Bradford, y el ensayo de
Lowry. Estos se utilizan comúnmente para la cuantificación de soluciones de proteínas y los lisados celulares. Estos tipos de ensayos se
pueden realizar fácilmente con el DropSense96, usando el 'modo general, UV / vis' el en el software. Exportación rápida de los datos a Excel
permite la generación rápida de una determinación de la curva y la concentración estándar.
General de UV / Vis
En la aplicación general UV-Vis, la DropSense96, funciona como un espectrofotómetro convencional. Una exploración de absorbancia
de los 230 a 750 nm de las muestras líquidas se puede analizar, lo que permite la identificación simple de alturas de los picos de
absorción y posiciones. Un número ilimitado de longitudes de onda puede ser designado de antemano para la vigilancia de absorbancia
y la inclusión en el informe.
Tenga en cuenta que los valores reportados no se normalizan a una longitud de recorrido de 10 mm, por lo que si la comparación se hace
con otros sistemas el factor apropiado se debe utilizar para convertirlos.
El método de la curva estándar ofrece un enfoque alternativo. El punto de partida es un conjunto de muestra de referencia con
concentración conocida. El sistema DropSense mide los espectros de absorción, y construye una curva estándar: esta es la
relación entre la concentración de referencia y el OD se mide a una longitud de onda determinada. Las muestras con
concentración desconocida se miden también, la DO a la longitud de onda de referencia se mide, y la curva estándar se utiliza
para calcular la concentración de la muestra desconocida.
Este método se utiliza típicamente en el caso de ensayos colorimétricos, donde el OD depende de factores locales tales como
temperatura, valor de pH y así sucesivamente. Estos factores se calibran en la curva estándar.
• Se utiliza una curva estándar de una medición anterior. El cliente puede ahorrar una curva estándar para un uso futuro al abrir un
experimento de curva estándar en la ventana de post-procesamiento. Una vez que esto se guarda, que está disponible para todos los
usuarios DropQuant. Tenga en cuenta el uso de las curvas de calibración de más edad en los nuevos experimentos puede dar lugar a
imprecisiones en caso de que las viejas muestras de referencia no es representativa de las muestras desconocidas más nuevos. Por tanto,
67
El proceso típico de la medición de las muestras utilizando el método de las curvas de calibración (donde las muestras de
definición de la muestra.
• El DropSense mide la placa, y por lo tanto la absorción óptica para cada muestra.
• El software calcula la curva estándar: esta es la relación entre OD (medido) y (entrada) concentración de
referencia. El usuario puede seleccionar el tipo de curva (lineal, polinómica, etc). La curva estándar se muestra
como OD = f (concentración).
• Basándose en esta curva estándar, se calcula la concentración de las otras muestras (desconocido) (a partir del
valor OD medido y la curva estándar construida). Así concentración = f- 1 ( SOBREDOSIS).
(0,0)
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Anexo B: Mantenimiento
Mantenimiento segundo
Los siguientes procedimientos de mantenimiento y controles de funcionamiento deben llevarse a cabo para garantizar un funcionamiento fiable
de la DropSense 96.
Importante: Apague el instrumento y desconecte el cable de alimentación de la línea de la toma de corriente antes de limpiarlo.
• 70% de etanol
Mantenimiento
Instrucciones generales
No utilice botellas de aerosol para pulverizar líquidos de limpieza o desinfectante a las superficies de la DropSense
96.
Si disolventes o salinas, o soluciones alcalinas ácidas se derramen en el DropSense 96, limpie el líquido inmediatamente.
Siga las instrucciones de seguridad del fabricante para el manejo de productos de limpieza.
Siga las instrucciones del fabricante para el tiempo de remojo y la concentración de los agentes de limpieza: la exposición durante más
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Anexo X: Glosario
Glosario X
requisitos de tamaño de la muestra - Aunque el volumen de la muestra dispensado no es crítica, es esencial que una cantidad mínima
de muestra se dispensa para el correcto llenado de la cámara de medición que permite mediciones precisas. Extensas pruebas indica
que los volúmenes de muestra de 2 l son suficientes para garantizar la reproducibilidad. Aunque este rango de volumen tiene un error de
pipeteo en cuenta, lo mejor es utilizar una pipeta de precisión (por ejemplo 0,5-5 l) con puntas de precisión para asegurar que la cantidad
de muestra recomendado es dispensado.
sobredosis - absorción óptica medida por el instrumento. El OD10mm es la OD calculado como si la longitud del camino es de 10 mm (= la
longitud del camino de una cubeta estándar).
cantidad de muestra recomendado - volumen a dispensar en la entrada bien para garantizar mediciones buenos y de alto
rendimiento, con el rango de medida dado y tiempo de residencia de la muestra. Comprobar la exactitud de la pipeta y la punta
para evitar el volumen de muestra dispensado excede la cantidad de muestra máxima.
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