- Explicar los mecanismos químicos y físicos de la mutación, utilizando como
ejemplo los siguientes mutágenos químicos (5-bromouracilo, 2-aminopurina, ácido nitroso, hidroxilamina y acridina) Mutágenos físicos: son radiaciones que pueden alterar la secuencia y estructura del ADN. Son ejemplos la radiación ultravioleta que origina dímeros de pirimidina (generalmente de timina), y la radiación gamma y la alfa que son ionizantes. También se considerar agentes físicos los ultrasonidos, con 400.000 vibraciones por segundo, que han inducido mutaciones en Drosophila y en algunas plantas superiores, y centrifugación, que también producen variaciones cromosómicas estructurales.
Mutágenos químicos: son compuestos químicos capaces de alterar las
estructuras del ADN de forma brusca. Ejemplo 5-bromouracilo (5BU) es una sustancia análoga de timina, las DNA polimerasas no pueden distinguir estos análogos de base; por consiguiente, si esta está base análoga durante la replicación, puede ser incorporada a las moléculas de DNA recién sintetizada. La 2-aminopurina (2AP) se comporta como Adenina, pero con frecuencia se tautomeriza y se aparea con la Citosina. Óxido nitroso: induce la desaminación de la citocina, lo que genera uracilo, que en la siguiente ronda de replicación se aparea con adenina, lo que produce una mutación de transición C G ---- T A. El ácido nitroso transforma la adenina en hipoxantina, se aparea con citocina e induce la transición T A ----- C G.
Hidroxilamina: es un mutágeno modificador de bases muy específico
que agrega un grupo hidroxilo a la citocina y la convierte en hidroxilaminacitosina. Esta conversión aumenta la frecuencia de un tautomero raro que se aparecerá con adenina en lugar de con guanina. La hidroxilamina no revertirá las mutaciones que provoca. Acridina: es un agente intercalante que provoca mutaciones al intercalarse entre bases adyacentes de DNA, lo que distorsiona la estructura tridimensional de lesiones de la hélice y causa inserciones y deleciones de nucleótido único durante la replicación. Estas inserciones suelen provocar mutaciones de marco de lectura, de manera que los efectos mutágenos a menudo no son graves.
10.- Explicar las mutagénesis dirigidas o mutación específica
La genética inversa depende de la capacidad de crear mutaciones, no de manera aleatoria sino en secuencias particulares de DNA y después estudiar los efectos de estas mutaciones en el organismo. Se inducen mutaciones en localizaciones específicas mediante un proceso denominado mutagénesis dirigida al sitio. Existe una serie de estrategias diferentes para la mutagénesis dirigida al sitio. Una estrategia que se suele utilizarse las bacterias consiste en cortar con enzimas de restricción una secuencia corta de nucleótidos y reemplazarla por un oligonucleótido cortos sintético que contiene la secuencia multada deseada. El éxito de este método depende de la disponibilidad de sitios de restricción que flaquean la secuencia que ser alterada. Si no se dispone de sitios de restricción apropiados, es posible utilizar mutagénesis dirigida por oligonucleótido. En este método se produce un oligonucleótido monocatenario que difiere de la secuencia diana en una o unas pocas bases. Cómo difieren sólo en algunas bases, él DNA diana y oligonucleótido se aparearán. El oligonucleótido, cuando se aparece de manera exitosa con el DNA diana, puede actuar como un cebador para iniciar la síntesis de DNA, lo que produce una molécula bicatenaria con un error de apareamiento en la región del cebado. Cuando este DNA se transfiera las células bacterianas, las bases aparejadas de manera incorrecta serán reparadas por enzimas bacterianas.
11.- Explicar los fundamentos bioquímicos de la extracción de ADN
El primer paso en cualquier protocolo de separación es el rompimiento del material inicial ya sea de origen viral, bacteriano, vegetal o animal. El método utilizado para romper la célula debe ser tan leve como sea posible con el fin de causar el menor daño posible al ADN. La lisis celular se puede hacer por acción mecánica, pulverizando el tejido con hielo seco o nitrógeno líquido, también se puede utilizar la degradación enzimática de la pared celular (si está presente) y lisis con detergentes de las membranas celulares. Seguido al rompimiento celular la mayoría de métodos involucran una desproteinización, lo cual se lleva a cabo con un solvente orgánico, seguido de una precipitación con isopropanol o etanol y posterior solubilización con agua o tampón.