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EJERCICIOS DE JOAQUINA
, JO 15-16
Páginas de docencia de Joaquina de la Torre Escudero
1.- Calcula FST entre las tres poblaciones que se muestran en la tabla basándote en las
frecuencias génicas especificadas. ¿Cuál es el valor máximo de FST en esta situación?
(Tomado del libro de Hartl & Clark (1997): Principles of population genetics, 3rd Ed. Solución:
capítulo 4 – problema 3)
2.- Calcula FIS, FST y FIT para las poblaciones con las frecuencias genotípicas que se muestran
en la tabla:
Población 1 Población 2
AA 0.056 0.072
Genotipos Aa 0.288 0.256
aa 0.656 0.672
(Tomado del libro de Hartl & Clark (1997): Principles of population genetics, 3rd Ed. Solución:
capítulo 4 – problema 4)
3.- Levin (1978) estimó las frecuencias génicas para el locus Pgm-2 en 43 subpoblaciones de
Phlox cuspidata (una especie vegetal auto-compatible con capacidad de autofecundación) en
Texas. 40 de estas subpoblaciones estaban fijadas para el alelo b (aparecen agrupadas en la
primera fila de la tabla). En las otras tres subpoblaciones, se recoge la frecuencia del alelo b y
la frecuencia observada de heterocigotos.
Subpoblación p H0
1-40 1 0
41 0.49 0.17
42 0.83 0.06
43 0.91 0.06
(a) A partir de estos datos, calcula HI, HS y HT y los tres estadísticos F de Wright.
(b) ¿Cómo interpretas el valor de FIS? Valora la contribución relativa de las 43 subpoblaciones
analizadas a FIS.
(c) ¿Cómo interpretas el valor de FST? ¿Qué población(es) dirías que contribuye más al valor
de FST? ¿Por qué?
Páginas de docencia de Joaquina de la Torre Escudero
4.- La siguiente tabla muestra los resultados de otro estudio similar llevado a cabo por Levin
(1978) para el locus enzimático 6-pgd en 73 subpoblaciones de Phlox drummondii (especie
vegetal en este caso auto-incompatible).
Subpoblación p H0
1-66 1 0
67 0.86 0.06
68 0.80 0.12
69 0.70 0.20
70 0.96 0.03
71 0.96 0.09
72 0.73 0.15
73 0.91 0.06
(a) Calcula los tres estadísticos F y comprueba que mantienen entre ellos la relación
matemática correcta.
(b) Compara estos resultados con los obtenidos para la especie Phlox cuspidata en el ejercicio
anterior. ¿Se ajustan estas comparaciones a lo esperado teniendo en cuenta los sistemas
de cruzamiento de estas dos especies? ¿Por qué? En caso de respuesta negativa, ¿tienes
alguna hipótesis que pudiera explicar la falta de congruencia observada?
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6.- El bacalao tiene dos formas de hemoglobina, determinadas por los alelos a y b de un
locus. De una muestra tomada en las costas de Noruega se obtuvieron las siguientes
frecuencias de los tres genotipos:
aa ab bb Total
130 763 1.698 2.591
¿Son estas frecuencias compatibles con que la muestra haya sido tomada de una población
con reproducción panmíctica? ¿Qué sugieren acerca de la estructura reproductiva de la
población?
(Tomado del libro de Falconer & Mackay (1996): Introducción a la genética cuantitativa.
Solución 3)
7.- Mediante diferencias anatómicas de los otolitos se pueden reconocer dos razas distintas
entre los bacalaos descritos en el ejercicio 6. Cuando estas dos razas, llamadas “ártica” y
“costera”, se separaron en la muestra, se encontraron las siguientes frecuencias:
aa ab bb Total
Ártica 23 250 946 1.219
Costera 107 513 752 1.372
10.- Si se juntaran los números de los tres genotipos contados por cada uno de los
estudiantes en el experimento del ejercicio 9, ¿cuáles serían las frecuencias genotípicas
globales?
(Tomado del libro de Falconer & Mackay (1996): Introducción a la genética cuantitativa.
Solución 43)
11.- Una población de ratones consistía en 18 líneas derivadas de la misma población base,
pero reproducidas después por separado. La población era polimórfica para un locus
enzimático autosómico, Got-1, con dos alelos, a y b. Tras 27 generaciones se analizaron
mediante electroforesis los genotipos de este locus en ratones de todas las líneas y se
encontraron los siguientes números:
aa ab bb Total
42 76 448 566
apareamientos produjeron los siguientes números de hijos que se utilizaron como padres: 0,
1, 1, 2, 2, 3, 3, 4. ¿Cuál es el censo efectivo de la población en esta generación?
(Tomado del libro de Falconer & Mackay (1996): Introducción a la genética cuantitativa.
Solución 123)
16.- El plan de reproducción para cada una de las líneas de ratón descritas en el ejercicio 11
consistía en aparear 8 parejas al azar y usar dos hijos de cada pareja como padres en la
siguiente generación. Si este plan se hubiera llevado a cabo de forma estricta, ¿cuál habría
sido el censo efectivo de las líneas? ¿Cuál fue el censo efectivo real indicado por los datos
del ejercicio 11?
(Tomado del libro de Falconer & Mackay (1996): Introducción a la genética cuantitativa.
Solución 133)
17.- Se realizó una simulación por ordenador del proceso de deriva genética con 8000 líneas
endógamas, derivadas de una población base inicial grande, y en las que se mantuvo un
tamaño de población constante (2N = 8). Se muestra la distribución de sub-poblaciones en
función de su número de alelos A en sucesivas generaciones de muestreo (G).
(a) ¿Cuál dirías que era la frecuencia alélica original de A (p0) en la población base inicial de
partida a partir de la que se originaron las subpoblaciones?
(b) ¿Cómo describirías la distribución esperada de subpoblaciones en cuanto a su número de
alelos A en estas generaciones?
(c) ¿En qué generación dirías que se alcanza la fase plana?
(Tomado del libro de Spiess (1977): Genes in populations. Solución en:
http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Genetica%20evolutiva/Deriva/Ej
emplos.htm )
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(Solución:
http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Genetica%20evolutiva/Deriva/Ej
emplos.htm )
(Solución: http://atlasgeneticsoncology.org/Educ/ConsangGenealSS.html )
3.- El director de un parque zoológico pide opinión a un asesor técnico para una adecuada
gestión de los cruzamientos en sus colonias de cría. El asesor recomienda prohibir los
cruzamientos entre “primos hermanos” y permitirlos entre “tío” y “sobrina”. Desde el punto
de vista genético, ¿te parece razonable la opinión del experto? Razona tu respuesta utilizando
la formulación apropiada y analizando el incremento en la incidencia de anomalías genéticas
raras asociadas a alelos recesivos que se espera en ambos casos, con respecto a la esperada
en condiciones de panmixia. Para tu razonamiento considera que el alelo recesivo causante
de la anomalía se encuentra en frecuencia q=0,001.
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4.- Se cruzan dos líneas puras AABB y aabb para fundar una población panmíctica. Contestar
a las siguientes preguntas en los dos supuestos siguientes: 1) independencia entre los loci y
2) cuando la fracción de recombinación entre ellos es 0.2:
(a) ¿Cuáles serán las frecuencias génicas, gaméticas y genotípicas de esta población en
equilibrio?
(b) ¿Cuáles serán las frecuencias génicas, gaméticas y genotípicas en la primera, segunda y
tercera generación?
(c) ¿Cuál es el valor del desequilibrio gamético en estas generaciones?
(d) ¿Cuánto tiempo tarda en reducirse a la mitad dicho desequilibrio?
OJO: El ejercicio dice que se cruzan dos líneas puras: AABB x aabb
(Tomado del libro de Fontdevila y Moya (1999): Introducción a la genética de poblaciones.
Solución: capítulo 3 – ejercicio 13)
5.- Consideremos un gen A con dos alelos (A1 y A2) en frecuencias p1 y p2, respectivamente, y
un gen B con dos alelos (B1 y B2) en frecuencias q1 y q2, respectivamente. Sea p1 = 0.7 y q1 =
0.3.
(a) ¿Cuáles son las frecuencias de todos los tipos posibles de gametos asumiendo equilibrio
gamético?
(b) ¿Cuáles son las frecuencias de todos los tipos posibles de gametos si hay desequilibrio
gamético, y D es igual al 50% de su máximo teórico?
(Tomado del libro de Hartl y Clark (1997): Principles of population genetics, 3rd Ed. Solución:
capítulo 3 – problema 16)
6.- El sistema de grupos sanguíneos MN está determinado por un gen con dos alelos (M y N).
Otro sistema sanguíneo, relacionado con el MN, es el sistema Ss, determinado por otro gen
con dos alelos (S y s). Asumiendo que la fracción de recombinación entre estos genes es
c=0.01. (1) ¿Qué tipos y frecuencias de gametos produciría un individuo MS/Ns? (2) ¿Y un
individuo Ms/NS?
(Tomado del libro de Hartl (1988): A primer of population genetics, 2nd Ed. capítulo 1 –
problema 16)
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EJERCICIOS – VARIABILIDAD
1.- Los siguientes datos genotípicos se obtuvieron a partir del análisis de 34 loci enzimáticos
en una muestra de osos pardos procedentes del territorio continental de Alaska y Canadá.
Completa la tabla que aparece más abajo. ¿Consideras que estos genotipos difieren de las
proporciones esperadas de Hardy-Weinberg? El alelo más común de cada locus se designa
como 1.
Calcula la heterocigosidad media esperada (He), y la proporción de loci polimórficos (P) para
esta muestra poblacional atendiendo al criterio del 95%.
(Tomado del libro de Allendorf y Luikart (2007): Conservation and the Genetics of populations.
capítulo 5 – ejercicio 5.3)
2.- Dada la siguiente tabla de frecuencias alélicas:
GEN
1 2 3 4 5
Alelo 1 0.63 0.94 0.995 1.0 0.78
Alelo 2 0.37 0.06 0.005 - 0.12
Alelo 3 - - - - 0.06
Alelo 4 - - - - 0.04
(a) ¿Cuál es la proporción (P) de genes polimórficos (utilizando el criterio del 95%)?
(b) Asumiendo apareamiento aleatorio, ¿cuál es la heterocigosidad media (H) para este
conjunto de genes?
(Tomado del libro de Hartl y Clark (1997): Principles of population genetics. 3rd Ed. capítulo 3
– ejercicio 12)
3.- En la siguiente tabla, se muestran los resultados obtenidos tras el análisis de seis loci
enzimáticos en poblaciones naturales de dos especies vegetales del género Mimulus (M.
guttatus y M. platycalyx).
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M.guttatus M.platycalyx
Locus Nº de individuos Nº de individuos
GAP-1 0 29 1 0 28 2
TPI-1 10 6 14 7 13 10
IDH-1 30 0 0 29 0 1
HDBH-1 0 28 2 0 29 1
GDP-1 2 16 12 11 9 10
PGM-1 29 0 1 29 0 1
a) ¿Cuáles son las frecuencias génicas (o alélicas) y genotípicas para cada locus y en cada
población?
b) ¿Cuál es el nivel de polimorfismo en cada población utilizando el criterio del 95%? ¿Y el
número medio de alelos por locus?
c) ¿Cuál es la heterocigosidad media observada y esperada en cada población? Calcular el
coeficiente de endogamia en cada población.
d) A juzgar por estos resultados ¿qué sugerirías en cuanto al sistema de cruzamientos propio
de cada especie? En función de las características que sugieres, ¿cómo explicas las
semejanzas y/o diferencias encontradas entre ambas especies en cuanto a los niveles de
polimorfismo y heterocigosidad? Razona las respuestas.
e) ¿En qué sentido esperarías que estas especies difirieran en la magnitud de depresión por
endogamia si analizaras, en ambos casos, la supervivencia o la producción de semillas en
la descendencia de cruzamientos entre hermanos? Razona la respuesta.
4.- Asume que las siguientes secuencias de mtDNA se encontraron en cinco individuos
distintos:
A A T C G A G A C T T T A G C
A T T C C A G A T T T A A G C
A T T C C A G A T T T A A G C
A A T C G A G A C T T T A G C
T A T C G A G A C T A T C C C
EJERCICIOS – HARDY-WEINBERG
1.- Dos poblaciones aisladas y de igual tamaño se encuentran en equilibrio Hardy-Weinberg
para un locus autosómico con dos alelos (A, a). En la población que denominaremos I la
frecuencia del alelo que denominaremos A es 0,6; mientras que en la población II esta
frecuencia es igual a 0,2.
(a) Si una muestra al azar de hembras de una población se cruza con una muestra al azar de
machos de la otra población, ¿cuáles serán las frecuencias génicas y genotípicas de la
descendencia? Si ahora dejamos que esta descendencia se aparee al azar, ¿cuáles serán las
frecuencias génicas y genotípicas de la siguiente generación?
(b) Si tomamos una muestra de igual tamaño para machos y hembras en las dos poblaciones
(I y II) y dejamos que los individuos se apareen al azar, ¿cuáles serán las frecuencias génicas y
genotípicas de la descendencia? Si, como en el caso anterior, dejamos que esta
descendencia se aparee al azar, ¿cuáles serán las frecuencias génicas y genotípicas de la
siguiente generación?
(c) ¿En qué caso de los dos anteriores ser alcanza el equilibrio Hardy-Weinberg?
(Tomado del libro de Fontdevila y Moya (1999): Introducción a la genética de poblaciones.
Solución: capítulo 3 – ejercicio 5)
2.- En el análisis de un SNP que segrega para los nucleótidos C y G en una población de
chimpancés se encontraron los siguientes números para los diferentes genotipos:
CC CG GG
11 42 64
¿Cuál es la frecuencia de G y cuáles serían los números esperados de los tres genotipos bajo
condiciones de panmixia?
(Tomado del libro de Hedrick (2005): Genetics of populations. 3rd Ed. Solución: capítulo 2 –
ejercicio 1)
3.- El análisis poblacional de un locus microsatélite en una población de Drosophila mostró
los siguientes números de los diferentes genotipos:
A 1A 1 A 1A 2 A 1A 3 A 2A 2 A 2A 3 A 3A 3
8 38 121 27 252 401
Calcula las frecuencias alélicas de todos los alelos y analiza si las frecuencias genotípicas se
desvían significativamente de las proporciones Hardy-Weinberg.
(Tomado del libro de Hedrick (2005): Genetics of populations. 3rd Ed. Solución: capítulo 2 –
ejercicio 2)