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FACULTAD DE MEDICINA
INTEGRANTES:
ASIGNATURA:
BIOLOGÍA MOLECULAR
DOCENTE:
2017- 2018
¿Que son los ácidos nucleicos?
Los ácidos nucleicos son grandes polímeros formados por la repetición de monómeros
denominados nucleótidos, unidos mediante enlaces fosfodiéster. Se forman largas cadenas;
algunas moléculas de ácidos nucleicos llegan a alcanzar tamaños gigantescos, de millones de
nucleótidos encadenados. Existen dos tipos básicos, el ADN y el ARN.
El descubrimiento de los ácidos nucleicos se debe a Johann Friedrich Miescher, que en el año
1869 aisló los núcleos de las células una sustancia ácida a la que llamó nucleina nombre que
posteriormente se cambió a ácido nucleico. Posteriormente, en 1953, James Watson y Francis
Crick descubrieron la estructura del ADN, empleando la técnica de difracción de rayos X.
¿Qué es un nucleótido?
Los nucleótidos son moléculas orgánicas formadas por la unión covalente de un monosacárido
de cinco carbonos (pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato.
Son los monómeros de los ácidos nucleicos (ADN y ARN) en los cuales forman cadenas lineales
de miles o millones de nucleótidos, pero también realizan funciones importantes como moléculas
libres (por ejemplo, el ATP o el GTP).
Estructura de un nucleótido
Un nucleótido está formado por 3 componentes, un grupo fosfato, una pentosa ( 5 carbonos) y
bases nitrogenadas.
GRUPO FOSFATO
En los nucleótidos nosotros vamos a encontrar hasta más de un grupo fosfato hasta 3, estos se
unen a través de un enlace fosfodiester.
Existen también diferentes tipos de fosfato como el fosforescer o fosfodiester, un grupo con dos o
más enlaces de fosfato es buen conductor de energía. Moléculas como el ATP son buenos
donadores de energía en reacciones dentro de la célula.
AZUCARES
El azúcar que encontramos en los ácidos nucleicos es una pentosa formado por 5 carbonos, la
diferencia entre el azúcar del ADN y ARN es que la del ADN carece un átomo de oxigeno de allí
su nombre.
Esta diferencia de un oxigeno entre el ADN y el ARN nos es muy útil ya que nos permite
identificar de qué clase de nucleótido estamos hablando.
BASE NITROGENADA
Las bases nitrogenadas también son componente de los ácidos nucleicos, y están bases se
clasifican en:
Bases purinas._ Este tipo de base contiene dos anillos unos de cinco átomos y otro de seis
átomos.
Adenina y guanina son bases purinas mientras que la citosina y timina son bases pirimidinas, en
el ARN se sigue el mismo patrón pero con uracilo.
¿Que es un nucleosido ?
Un nucleósido es una molécula monomérica orgánica que integra las macromoléculas de ácidos
nucleicos que resultan de la unión covalente entre una base nitrogenada con una pentosa que
puede ser ribosa o desoxirribosa
NOMENCLATURA
Para nombrar a los nucleótidos lo podemos hacer de la siguiente manera:
a) Como ésteres fosfato del nucleósido. Por ejemplo: adenosina-monofosfato, guanosina-difosfato,
b) Como ácidos, sustituyendo la terminación del nombre de la base por el sufijo –ílico. Este criterio
sólo se utiliza normalmente para los nucleósidos-monofosfato. Por ejemplo: ácido adenílico, ácido
guanílico, ácido uridílico, etc. (respectivamente, para AMP, GMP y UMP). En el caso de
nucleósidos-difosfato y –trifosfato, se emplearían los nombres diadenílico, triadenílico, diguanílico,
etc. (para ADP, ATP y GDP). Si se quiere tener en cuenta que los restos fosfato están ionizados a
pH fisiológico, se utiliza el sufijo –ilato: adenilato, guanilato, uridilato, etc. (HERRAEZ s.f.)
Abreviatura A G U T C
común
Muchos nucleótidos actúan en todo tipo de células y en multitud de procesos metabólicos como
compuestos ricos en energía, entre ellos los nucleosidos trifosfato intervienen como percusores de
HIDROLISIS
Los nucleosidos y nucleótidos pueden ser hidrolizados a sus componentes, en un medio acido o
alcalino.
NUCLEOTIDOS CICLICOS
Son nucleosidos-monofosfato en los que un mismo fosfato se une a dos porciones de azúcar,
generalmente 3-5, actúan como segundos mensajeros transmitiendo señales desde el entorno al
interior celular.
Tradicionalmente se considera que los ácidos nucleicos forman parte de los nucleoproteidos el
grupo más grande de las proteínas conjugadas entre los que también se incluyen los glicoproteidos.
proteínas (histonas, protaminas) y los grupos fosfato de los ácidos nucleicos. Los ácidos nucleicos
se diferencian de las proteínas por su concentrado de fosforo al 100% y por no contener nada de
azufre
Existen dos tipos de ácidos nucleicos denominados ribonucleico y desoxirribonucleico que difieren
en los nucleótidos componentes, ambos ácidos se encuentran en todo tipo de célula tanto procariota
como eucariota con excepción de los virus que contienen ADN o ARN. En todos los casos sus
NIVELES ESTRUCTURALES
Se engloban bajo este término todas aquellas estructuras tridimensionales que surgen a partir de
los niveles primario y secundario, en eucariotas son complejas, variables y en casos muy escasas.
En el caso del ADN se pueden incluir aquí aquellas resultantes del supe enrollamiento y de la
eucariotas.
ESTRUCTURA PRIMARIA
El ADN está compuesto por una secuencia de nucleótidos formados por desoxirribosa. Las bases
son Adenina, Guanina, Citosina y Timina. No aparece Uracilo. Los nucleótidos se unen entre sí
mediante el grupo fosfato del segundo nucleótido, que sirve de puente de unión entre el carbono
Como el primer nucleótido tiene libre el carbono 5' y el siguiente nucleótido tiene libre el carbono
3', se dice que la secuencia de nucleótidos se ordena desde 5' a 3' (5' → 3').
FORMAS DE REPRESENTACIÓN LINEAL DE LOS ACIDOS NUCLEICOS:
Pueden emplearse hasta 6 niveles, de simplificación creciente. En general e hace uso de la letra inicial de
las bases, en mayúsculas, para representar a éstas o a sus nucleótidos. Ejemplo:
ARN: azúcar- ribosa; bases- A,G,U,C.
ADN: azúcar-desoxirribosa; bases-A,G,T,C
La fórmula completa: es la manera más detallada de representar una cadena polinucleotídica, pero es
donde se pueden cometer errores con más facilidad. Por razones de espacio y tamaño de enlaces, la forma
que se suele emplear es una representación vertical en el que el nucleótido superior es el que tiene el
extremo 5’ y el inferior el 3’OH.
Representación esquemática: da más detalle, puesto que cada letra representa la base, la pentosa se
simplifica mediante un solo trazo vertical cuyo extremos superior corresponde al C1’ y el inferior al C5’.
La forma en la que se tratan los fosfatos puede variar de dos maneras: una, en la que se especifican todos
los que hay, y otra en la que los fosfatos se representan como un trazo inclinado excepto el primero, que sí
se representa explícitamente.
Forma abreviada: es la más sencilla, pues cada letra representa un nucleósido o un nucleótido,
dependiendo de dónde se quiera realizar en énfasis. En este sistema, el polinucleótido es una sucesión de
letras mayúsculas en el que el primero tiene un fosfato en el extremo 5’ y el último termina en un 3’-OH.
AGATCGTGCACT
A veces se quiere hacer hincapié sobre el hecho de que el primer nucleótido empieza por un 5’-fosfato,
con lo que la representación abreviada se pone como:
pAGATCGTGCACT
La forma más detallada dentro de las abreviadas es aquella en la que se especifican todos los fosfatos, con
lo que la letra hace referencia sólo al nucleósido. El convenio es que el fosfato «pertenece» al nucleósido
que le sigue. Así la secuencia anterior nos quedaría como:
pApGpApTpCpGpTpGpCpApCpT
PROPIEDADES FISICOQUÍMICAS DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS:
Los ácidos nucleicos presentan propiedades importantes en relación con sus funciones de
almacenamiento, transmisión y expresión de la infomación genética.
Propiedades en disolución:
Las cadenas polinucleotidas de ADN y ARN son hidorofílicas , debido a la posibilidad de formación de
enlaces de hidrógeno con el agua por parte de los numerosos grupos fosfato y -OH libres del azúcar a lo
largo del esqueleto.
Por otro lado a pH fisiológico los grupos fosfato (próximo a 6) se ionizan casi por completo, haciendo que
las moléculas de ADN y ARN se comportan como ácidos y tengan numerosas cargas negativas ; por esta
razón los ácidos nucleicos se encuentran casi siempre neutralizados por interacción ionica con otras
moléculas.
Como resultado experimental de esta propiedad, la cristalización de ácidos nucleicos si su carga negativa
se compesa por la unión de iones metálicos.
Esta propiedad tiene interés en relación con el estudio del proceso de desnaturalización.
Reactividad:
Los ácidos nucleicos son químicamente muy estables, especialmente en el caso el ADN. Esto se debe a
que la desoxirribosa carece de grupos reactivos; el 4` -OH esta comprometido en el cierre del anillo y los
3` -OH y 5` -OH estan formando enlaces fosfodiester. El ARN es algo más rectivo; debido a los grupos 2`
-OH.
Hidrólisis química de ácidos nucleicos:
Ácidos fuertes: escinden tanto los enlaces fosodiester entre nucleósidos como los enlaces N- glucosídicos
de cada nucleótido. Esto sirve para analizar la composición de bases de un ácido nucleico.
Ácidos débiles: respetan los fosfodiéster, pero rompen la unión N-glucosídica. Este enlace es más lábil
con purinas que con pirimidinas , por lo que se puede obtener (pH=3) escindir selectivamente las bases
purínicas, dando lugar ácidos apurínicos. En caso especiales se han `presentado casos de ácidos nucleicos
apirimidinicos, por medio de condiciones químicas diferentes.
Hidrólisis alcalina:
Mediante hidrólisis alcalina en NaOH diluido se rompe el enlace fosfodiéster en 5’ puesto que el 2’-OH
ataca al P y forma un intermediario cíclico 2’-3’-fosfato que luego se hidroliza por igual a 3’ o 2’ fosfato.
Esta hidrólisis solo ocurre en el RNA puesto que es absolutamente dependiente del 2’-OH. De manera
contraria a lo que ocurre con la hidrólisis ácida del enlace N-glucosídico, las purinas son más resistentes a
hidrolizar el 3’ fosfato de su nucleótido que las pirimidinas.
Cuando la base nitrogenada tiene ciertas modificaciones químicas, el medio alcalino puede acabar también
afectando al enlace β-N-glucosídico, pero es un comportamiento marginal.
Absorción en el ultravioleta:
La similitud en el valor máximo de absorbancia de las distintas bases puede utilizarse para detectar y
cuantificar las bases, los nucleótidos, los nucleósidos, sino específicamente para detectar la concentración
de los ácidos nucleicos; para esta concentración solo basta medir el valor de A260 en una disolución
diluida, suficientemente transparente de ADN o ARN.
Los máximos de absorción son características de cada uno de los compuestos; es decir 260 nm para ácidos
nucleicos y 280nm para proteína. Es necesario para corregir la interferencia mutua emplear ambos valores
de absorbancia para asi determinar las concentraciones de acido nucleico y de proteína.
De acuerdo con este modelo, el ADN es una macromolécula constituida por dos hebras o filamentos
enrollados uno sobre otro en sentido dextrógiro (es decir, en el del movimiento de las agujas del
reloj), formando así una doble hélice. Cada hebra está constituida por una larga secuencia de
nucleótidos, que forman el esqueleto de la macromolécula de ADN. Los nucleótidos se unen entre
sí por un enlace fosfodiéster entre los azúcares (es decir, entre un grupo fosfato, PO4-3, enlazado
a un azúcar y un hidroxilo, OH, del azúcar del nucleótido precedente). La información genética
está contenida en las distintas secuencias de nucleótidos del esqueleto del ADN. Las dos hélices de
ADN se mantienen unidas por enlaces débiles de naturaleza física, los enlaces de hidrógeno, y por
enlaces químicos débiles, los enlaces de Van der Waals. Los pares de bases son perpendiculares al
eje principal de la molécula: una vuelta completa de la hélice sobre sí misma comprende diez pares
de bases. Las dos hélices están polarizadas, es decir, poseen una dirección, que viene determinada
por el extremo libre del último nucleótido, el cual puede ser el carbono número 3 o el número 5 de
la molécula de desoxirribosa; en consecuencia, cada hebra de ADN poseerá una extremidad 5' - 3'
y la otra en dirección 3' - 5', y se dice que son antiparalelas.
Según el modelo de Watson y Crick, existen pequeñas diferencias locales en la estructura del ADN
dependiendo de los nucleótidos integrantes.
II. Palíndromos.
Una región del ADN es palindrómica cuando la secuencia de una hebra, es igual que la de la otra
hebra. Por lo tanto los palíndromos se observan en ambas cadenas de forma conjunta.
Entre tanto la dos hebras resultan que las secuencias de una misma hebra que queda a ambos
lados del centro de simetría son complementarias entre si, se dice que es una secuencia
palíndromica es auto complementarias.
Repeticiones de secuencias
Repeticiones invertidas:
El término palíndromo se lo entiende en ocasiones como repetición invertida. Y al leerlos
en sentidos opuestos las dos sesiones tienen la misma secuencia. Ya sea con centro de
simetría puntual o no.
Repeticiones directas:
En donde hay una secuencia es leída siempre en el mismo sentido. Aunque no son
palíndromos, puesto que no cumple el criterio de igualdad de secuencias en sentido opuesto,
ni hay centro de simetría. Pero son de gran interés porque aparecen con enorme frecuencia
en el genoma, tanto en posiciones contiguas o adyacentes (repeticiones en tándem), como
separadas por un numero grande de pares bases (repeticiones dispersas).
Repeticiones especulares:
Cuando la secuencia se repite, de forma invertida, dentro de la misma hebra. No se
consideran palíndromos, puesto que no presenta centro de simetría rotacional, sino más bien
un plano de simetría especular.
Palíndromos en moléculas de hebra sencilla
Para los ácidos nucleicos de hebra sencilla, estrictamente hablando no se puede aplicar el termino
palíndromo. Pero al tener una relación de complementariedad entre la secuencia de un ARN si es
codificada por un ADN palindrómico es auto complementaria, por lo tanto se le considera como
palíndromo. Bajo este criterio cada una de las dos hebras de un ADN palindrómico también es una
secuencia palindrómica de hebra sencilla.
Es una situación poco habitual, formada por 3 hebras, es decir, una triple hélice, triplex o tríplice.
Se las encuentra con más frecuencia en el ADN, pero también se presentan en el ARN.
Luque, J. (2000). Biologia molecular e ingenieria genetica. En J. Luque. Madrid: Elseviers Sciencie.
http://sebbm.es/BioROM/contenido/av_bma/apuntes/T2/estruct1.htm
https://drive.google.com/file/d/0B-nnmXMkWdY5UklJUGV3TkFpeFU/view
https://catedrabiologiamolecularusal.files.wordpress.com/2014/12/texto-ilustrado-de-biologia-
molecular-y-genetica-medica.pdf
PREGUNTAS:
1. ¿Que son los ácidos nucleicos?
Los ácidos nucleicos son grandes polímeros formados por la repetición de monómeros
denominados nucleótidos, unidos mediante enlaces fosfodiéster. Se forman largas cadenas;
algunas moléculas de ácidos nucleicos llegan a alcanzar tamaños gigantescos, de millones de
nucleótidos encadenados. Existen dos tipos básicos, el ADN y el ARN.
2. ¿Qué es un nucleótido?
Los nucleótidos son moléculas orgánicas formadas por la unión covalente de un monosacárido
de cinco carbonos (pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato.
Son los monómeros de los ácidos nucleicos (ADN y ARN) en los cuales forman cadenas
lineales de miles o millones de nucleótidos, pero también realizan funciones importantes como
moléculas libres (por ejemplo, el ATP o el GTP).
3. ¿Cual es el tipo de azúcar que contiene el ARN?
Los nucleótidos son moléculas orgánicas formadas por la unión covalente de un monosacárido
de cinco carbonos (pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato.
Son los monómeros de los ácidos nucleicos (ADN y ARN) en los cuales forman cadenas
lineales de miles o millones de nucleótidos, pero también realizan funciones importantes como
moléculas libres (por ejemplo, el ATP o el GTP).
6. ¿Que son los nucleótidos cíclicos?
Son nucleosidos mono fosfato en los que un grupo fosfato se une a dos azucares generalmente
3-5 y estos actúan como segundos mensajeros transmitiendo señales desde el entorno al medio
intercelular.
7. ¿Cual es la diferencia entre las bases nitrogenadas del ADN y ARN?
Las bases nitrogenadas del ADN son:
Adenina, Guanina, Citosina y Timina pero estas cambian en el ARN donde la Timina es
reemplazada por Uracilo.
8. Nombre una diferencia entre ADN y ARN
La cadena que forma el ADN es larga y se enrolla para formar la estructura helicoidal, mientras
que la del ADN es una cadena simp
9. ¿A qué forma de representación lineal de los ácidos nucleicos pertenece el siguiente
modelo?
AGATCGTGCACT
Pertenece a la representación abreviada de los ácidos nucleicos ya que cada letra representa un
nucleósido o un nucleótido.
10. ¿ A qué se debe que el ADN es más resistente que el ARN a la hidolisis en medio alcalino?
Se debe a la ausencia d elos grupos 2`-OH en las unidades de desoxirribosa.
11. ¿Cuál es el máximo de absorción ultravioleta de los acidos nucleicos y de las proteinas?
Los maximos de absorción son 260 nm para ácidos nucleicos y 280nm para proteína.
12. ¿Qué se pensaba acerca de los ácidos nucleicos?.
Se pensaba que los ácidos nucleicos que eran la repetición monotona de un tetranucleótido.
13. ¿ Que observó Erwin Chargaff conjuntamente con otros colaboradores?
Chargaff observo distintas proporciones de los 4 nucleótidos en diversos organismos.
14. ¿Cuál relación que estableció Chargaff definió la complemetaridad de bases?
Fue la regla sobre la relación de bases ya que consiste que el contenido de andenia se aproxima al
de timina y el contenido de guanina se aproxima al de citocina; lo que ayudó a Watson y Crick
postulasen los pares AT y GC.
15. ¿En qué consiste la regla de Chargaff acerca de la relacion entre purinas y pirmidinas?
Consiste en que el contenido de las bases purinicas (A+G) se aproxima al de bases pirimidínicas
(T+C), es decir que hay un 50% de purinas y 50% de pirimidinas.
16. ¿En qué año Watson y Crick establecieron el modelo del ADN de la doble Hélice?
Fue establecida en 1953
17. ¿Qué es la complementariedad de las bases nitrogenadas?
La estructura química de las bases permite la formación de enlaces por puente de hidrogeno (2
átomos electronegativos, como N y O comparten un átomo de hidrogeno). Dos nucleótidos
pueden interaccionar a esto se le conoce como bases complementarias
18. ¿Los cambios de ph afectan la ionización de los grupos funcionales de las bases
nitrogenadas y al equilibrio de tautomeros?
Si, afectan
19. ¿Qué es el antiparalelismo?
Las dos hebras sean complementarias deben disponerse en sentidos opuestos, si una avanza de
5´a 3´la otra debe hacerlo de 3´a 5
20. ¿Qué es la helicidad?
El apareamiento completo de las dos hebras solo se pueden establecer si los pares de bases
sucesivos van girando (34,6°), las hebras de ADN adoptan una disposición helicoidal
21. ¿ Como consecuencia de la proximidad y paralelismo de los anillos aromáticos se originan
fuerzas de atracción como se llaman?
Fuerza de tipo Van der Waals o Fuerzas hidrofóbicas
22. ¿ Como consecuencia a todo lo largo de la estructura en doble hélice se forman dos surcos
como se llaman ?
Uno mayor (o hendidura profunda) y menor o hendidura pequeña que van girando}
26. ¿Por qué el interés de la triple hélice para las terapias génicas?
Debido a que puede inhibir la expresión de un gen deseado, al usa un oligonucleótido sintético
en la doble hebra de ADN en una región promotora del gen, formando un TRIPLEX
27. ¿Qué es una secuencia palindrómica?
Son regiones de un ADN cuya secuencia es la misma en ambas hebras, con ejes de simetrías.
28. Bajo qué criterio se puede considerar al ARN un palindrómio:
Es considerada si presenta una relación de complementariedad entre la secuencia de un ARN y
si es codificada por un ADN palindrómico
29. En que regiones del ADN se puede presentar una triple hélice:
Se puede dar en regiones ricas en bases pirimidica (CT) en una hebra, y en su hebra
complementaria es rica en bases puricas(AT).
30. Si las hebras de un palíndromo se separa y se reasocia,¿qué forma toma?:
Al re asociarse puede generar estructuras de doble horquilla o cruciformes.