ANÁLISIS

MICROBIOLOGÍCO
TIPOS DE MUESTRAS

Camilo Moreno
Microbiología & Enfermedades Infecciosas
Facultad de Medicina
Universidad Antonio Nariño
 Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico
microbiológico de las infecciones más comunes

Tipo de Infección Muestra Comentarios

Bacteriemia Hemocultivos

Infecciones cardiovasculares y asociadas a dispositivos intravasculares (IV)

Endocarditis Hemocultivos / Válvulas

Infección de catéter Catéter IV, pies, peri catéter,

conexión del catéter

Pericarditis Liquido pericardico

Infecciones del SNC

Meningitis LCR

Abscesos cerebrales Aspirado de abscesos

 Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico
microbiológico de las infecciones más comunes

Tipo de Infección Muestra Comentarios

Tracto respiratorio

Faringoamigdalitis Exudado faríngeo

Sinusitis Aspirado sinusal No validos exudados nasales

Otitis media Timpanocentesis

Otitis externa Exudado oído externo

Neumonia Esputo, muestras obtenidas por

fibrobroncoscopia, punción
transtorácica aspirativa,
punción transtraqueal,
broncoaspirado

Empiema y abscesos Líquido pleural, aspirados de

pulmonares abscesos
 Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico
microbiológico de las infecciones más comunes

Tipo de Infección Muestra Comentarios

Infecciones oculares
Conjuntivitis Exudado conjuntival/raspado

Queratitis Raspado corneal

Endoftalmitis Líquido intraocular
Infecciones gastrointestinales

Diarrea Heces/Biopsia intestinal/

Aspirado duodenal
Infecciones intraabdominales

Peritonitis Líquido peritoneal

Abscesos intraperitoneales y Aspirados de abscesos
abscesos viscerales
Colecistitis Líquido biliar
Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico
microbiológico de las infecciones más comunes
Tipo de Infección Muestra Comentarios
Tracto urinario
Infección urinaria Orina (micción media, sonda)
Orina obtenida mediante Diagnóstico de bacteriuria por
punción suprapúbica anaerobios y de ITU en niños
Tracto genital
Úlceras genitales Raspado de la úlcera

Nódulos genitales Aspirado del nódulo

Uretritis Exudado uretral
Vulvovaginitis Exudado vaginal Detección
de S.agalactiae (también
exudado rectal )
Cervicitis Exudado endocervical
Prostatitis Secreción prostática Acompañada de orina pre y
post masaje prostático
 Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico
microbiológico de las infecciones más comunes

Tipo de Infección Muestra Comentarios

Piel y tejidos blandos

Impétigo, foliculitis, Preferiblemente aspirados

erisipela, celulitis, tomados con jeringa y
úlceras, infecciones biopsias de tejido. Son
gangrenosas, abscesos menos recomendables las
cutáneos, heridas y muestras tomadas con
quemaduras torundas
Hueso y articulaciones

Artritis Líquido sinovial

Osteomielitis Biopsia ósea o exudado

TRACTO RESPIRATORIO SUPERIOR (TRS)
TRACTO RESPIRATORIO SUPERIOR (TRS)
TRACTO RESPIRATORIO SUPERIOR (TRS)

 Medico
 Bacteriólogo
 Terapeuta

 Hisopado de cavidad oral.

 Hisopado nasofaringeo.
 Hisopado de amígdalas.
 Hisopado parte post. de
faringe.
 Lavado sinusal.
Secreción ótica
TRACTO RESPIRATORIO SUPERIOR (TRS)
FROTIS FARINGEO

Con un hisopo de dacrón o de rayón con mango

de plástico, hacer un raspado firme, haciendo
girar el hisopo, en las áreas dañadas que deben
verse hiperémicas, purulentas o necróticas y
también en las membranas formadas sobre las
lesiones
TRACTO RESPIRATORIO INFERIOR (TRI)
TRACTO RESPIRATORIO INFERIOR (TRI)
Bronquitis
Inflamación aguda del árbol
traqueobranquial
Neumonía
Inflamación del tracto respiratorio
inferior que compromete vías aéreas del
pulmón y estructuras de sostén
Infección Pleural
Resultado de infección pulmonar y
posterior ingreso del agente a la cavidad
pleural
parainfluenza, influenza,
respiratorio sincitial,
adenovirus, sarampión,
Bordetella pertussis, B.
parapertussis(lactantes y niños
pequeños), Haemophilus influenzae,
Mycoplasma pneumoniae
Histoplasma capsulatum,
Blastomyces dermatitidis,
Paracoccidioides
brasiliensis, Coccidioides immitis,
Cryptococcus neoformans,
Aspergillus fumigatus
: Mycoplasma pneumoniae,
Chlamydophila pneumoniae, H.
influenzae, S. aureus, Legionella
pneumophila, Klebsiella pneumoniae y
otras enterobacterias, Pseudomonas,
Acinetobacter, Branhamella catarrhalis
TRACTO RESPIRATORIO INFERIOR (TRI)

• Se aspira con sonda el contenido del estómago antes

ASPIRADO GASTRICO de que el paciente se levante

BIOPSIA DE PULMON

• Se obtiene con aguja y jeringa introducida a través de

TORACOCENTESIS la piel del tórax

• Introducir catéter hasta árbol bronquial

ASPIRADO TRAQUEAL (Traqueostomía)

ASPIRADO • Introducir en tráquea pequeño catéter de plástico por

TRANSTRAQUEAL medio de aguja y succionar

• Permite visualizar mucosa (fibra óptica) y obtener

BRONCOSCOPIA biopsia

ESPUTO Y LAVADO
BRONCOALVEOLAR (BAL)
 TRACTO RESPIRATORIO INFERIOR (TRI)
ESPUTO
NÚMERO 1

DIFÍCIL ACCESO 3 MUESTRAS NÚMERO 2 1 HORA

NÚMERO 3
SEGÚN LA
ACCESIBILIDAD
A EL PACIENTE NÚMERO 1:
Muestra inmediata
“in situ”

NÚMERO 2:
FÁCIL ACCESO 3 MUESTRAS
Muestra matutina

NÚMERO 3:
•Recoger en ayunas (Previo lavado bucal) Muestra inmediata
•Ejercicio respiración.
•Depositar una sola muestra.
TRACTO RESPIRATORIO INFERIOR (TRI)
ESPUTO
 TRACTO GASTROINTESTINAL

Gastroenteritis
Diarrea
Disentería
Enterocolitis

Acidez del estómago

Peristaltismo
Mucosa
IgA secretora
Presencia de eosinófilos

HISOPADO RECTAL

CULTIVO DE MATERIA FECAL

 LIQUIDOS CORPORALES

LIQUIDO SEROSO (Entre membrana parietal y visceral)

de las cavidades serosas
 LIQUIDOS CORPORALES

LIQUIDO
SANGRE ORINA
SEMINAL

LIQUIDO LIQUIDO LIQUIDO

AMNIOTICO PERITONEAL PERICARDICO

LIQUIDO LIQUIDO
PLEURAL SINOVIAL
Aumento de la presión
Permeabilidad capilar aumentada o
Hidrostática de los capilares
reabsorción de vasos linfáticos
pleurales o disminución de la
disminuida
presión oncótica en el plasma

Trasudado Exudado

Aumento de la Síndrome nefrotico Infección pleural

Aumento de la
presion
permeabilidad
microvascular
Falla CC Neoplasias

Condiciones
Cirrosis hepática inflamatorias
sépticas
 LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO PLEURAL

Función:
Lubricar la pleura durante los
movimientos respiratorios
 Procedimiento de obtención:
Toracocentesis (derrame pleural
de mas de 11 mm de espesor en
los rayos x) Tomar en tubos
heparinizados (fibrinógeno)
 Volumen: 5 - 15 mL
 Secretado por la pleura
parietal y reabsorbido por la
pleura visceral en proceso
continuo
 LIQUIDOS CORPORALES
CRITERIOS DE LIGHT LIQUIDO PLEURAL

Trasudado: Fuga masiva de liquido hacia el espacio pleural

Exudado: Secreción inflamatoria activa de liquido
 LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO PERITONEAL

 Serosa
Peritonitis – PBE
 Diálisis peritoneal
 Aspirado por punción
(intraoperatorio)

Trasudado

Exudado
LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO PERICARDICO

 Pericarditis
 Taponamiento cardiaco

PERIOCARDIOCENTESIS
 LIQUIDOS CORPORALES
La muestra de LCR debe recogerse
en tres tubos estériles de forma
secuencial.
I. Bioquímica e inmunológia
II. Microbiológico
III. Estudio citológico
LIQUIDO CEFALORRAQUIDEO
Indicaciones
a) Sospecha de meningitis, hemorragia subaracnoidea,
absceso cerebral, encefalitis, leucemias con afectación
del SNC, neoplasias, síndrome de Guillain-Barré.
b) Para realizar el diagnóstico diferencial entre hemorragia
in- tracraneal e infarto.
c) Enfermedades desmielinizantes
LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO CEFALORRAQUIDEO
 LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO SINOVIAL

ARTROCENTESIS : < 2 mL
Dializado del plasma mezclado con ácido
Hialurónico (hialuronidasa: PMN – AR séptica)

Permite establecer el diagnóstico de:

 Artropatías por cristales,
 Apoya el diagnóstico de las artritis
sépticas
 Derrames articulares.

El estudio completo del LS incluye los

siguientes análisis:
1) Macroscópico,
2) Microscópico y
3) Uso de tinciones específicas
 LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO SEMINAL

 Viscosidad
 Licuefacción
 pH
 Concentración esp
 Nº esp eyaculados
 Movilidad
 Morfología
 Vitalidad

Por masturbación el mismo día del examen

Frasco de vidrio o de plástico atemperado 20-
40 ºC, de boca amplia
Sólo una eyaculación
Se recomienda: abstinencia de 3-7 días.
 LIQUIDOS CORPORALES
SANGRE

SEPSIS

BACTEREMIA (Aerobios + anaerobios)

FUNGEMIA

INDICACIONES

• Picos febriles
• Hipotermia
• Leucocitosis > 10.000 /mm
• Granulocitopenia
• Hipotensión
• Infecciones localizadas

Sangre venosa
 LIQUIDOS CORPORALES
SANGRE

ADULTOS
PROTOCOLO COLOMBIA
10 mL sangre/botella

2 stes (4 botellas)

NIÑOS

2 mL sangre botella
BOTELLA 1 2 3 4 (3 botellas)
Sangre (mL) 5 10 15 20
Recuperación microbiana (%) 10 40 60 70
 LIQUIDOS CORPORALES
SANGRE

TERAPIA EMPIRICA
ANTIBIOTICA
INADECUEDA

Canida spp

Acinetobacter
baumanii
Pseudomonas
aeruginosa
E.Coli K.pneumoniae
BLEES

MRSA

Stenotrepomona
maltophila
LIQUIDOS CORPORALES
SANGRE
LIQUIDOS CORPORALES
SANGRE
LIQUIDOS CORPORALES
SANGRE
LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO AMNIOTICO

Análisis pre-gestacional
AMNIOCENTESIS
LIQUIDOS CORPORALES
LIQUIDO AMNIOTICO

• Cultivo de amniócitos

Análisis Químico y celular

• Cariotipo
• Estudios
citomoleculares
• Análisis bioquímico
• Alfa fetoproteina
(DTN)
• Relación
lecitina/esfingomielina
• Bilirrubinas