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BIOLOGIE
L’ESSENTIEL EN FICHES
2e édition
Daniel Richard
Ancien Professeur de biologie à l’université Toulouse III
Patrick Chevalet
Maître de conférences à l’université Toulouse II
Thierry Soubaya
Professeur agrégé en classes préparatoires BCPST
Retrouvez les compléments en ligne de l’ouvrage sur
www.dunod.com/contenus-complementaires/9782100705399
Illustrations de couverture :
Cellules de pelure d’Oignon © Hubert Isselée-fotolia.com
Perroquet et œil de Caméléon © Anna Omelchenko-fotolia.com
1.1 La cellule 2
Fiche 1 Les constituants chimiques du vivant 2
Fiche 2 L’organisation de la cellule chez les Eumétazoaires 3
Fiche 3 La cellule de la lignée verte 4
Fiche 4 La cellule des Eubactéries et des Archées 5
Fiche 5 Les virus 6
Fiche 6 La membrane plasmique 7
Fiche 7 Les échanges transmembranaires 8
Fiche 8 La pompe Na+/K+ 9
Fiche 9 La membrane plasmique et les gradients électrochimiques 10
Fiche 10 Les propriétés électriques de la membrane plasmique 11
Fiche 11 L’utilisation de l’énergie potentielle membranaire 12
Fiche 12 La mitochondrie 13
Fiche 13 La respiration cellulaire et la synthèse d’ATP 14
Fiche 14 Les réseaux membranaires intracellulaires 15
Fiche 15 Le noyau 16
Fiche 16 La structure du cytosquelette 17
Fiche 17 Le métabolisme intermédiaire 18
Fiche 18 La compartimentation des voies métaboliques 19
Fiche 19 Le catabolisme des glucides 20
Fiche 20 L’adressage des protéines 22
Fiche 21 Le transport vésiculaire des protéines 23
Fiche 22 Le chloroplaste 24
Fiche 23 La photosynthèse 25
Fiche 24 La fixation du CO2 lors de la photosynthèse 26
Fiche 25 Du mésenchyme au myocyte 27
Fiche 26 Le cycle cellulaire 28
III
Table des matières
Fiche 27 Le contrôle du cycle cellulaire 29
Fiche 28 La mitose 30
Fiche 29 La méiose 33
Fiche 30 La mort cellulaire et l’apoptose 34
Fiche 31 La localisation des divisions cellulaires dans l’organisme 35
IV
Table des matières
1.3 L’organisme
Fiche 63 L’évolution, théorie unificatrice de la biologie 74
Fiche 64 L’évolution, aujourd’hui 75
Fiche 65 Les grandes étapes de l’évolution 76
Fiche 66 Évolution et phylogénétique 77
Fiche 67 Phylogénétique et homologies primaires 78
Fiche 68 Nomenclature et classification actuelles 79
Fiche 69 Métazoaires et Eumétazoaires 80
Fiche 70 Les Cnidaires 81
Fiche 71 Le mésoderme et le coelome 82
Fiche 72 La métamérie 83
Fiche 73 Les Cordés 84
Fiche 74 Les Eumycètes 85
Fiche 75 Les Bryophytes 86
Fiche 76 Les Filicophytes 87
Fiche 77 Les Spermatophytes 88
V
Table des matières
Partie 2 Les fonctions de nutrition
2.1 Les milieux liquidiens et la circulation
Fiche 93 La sève brute 106
Fiche 94 La sève élaborée 107
Fiche 95 Le fonctionnement des stomates 108
Fiche 96 La circulation des sèves 109
Fiche 97 Les moteurs de la circulation des sèves 110
Fiche 98 Le sang 111
Fiche 99 L’anatomie du cœur des Mammifères 112
Fiche 100 L’activité cardiaque chez l’Homme 113
Fiche 101 Cellules myocardiques et contraction cardiaque 114
Fiche 102 Les vaisseaux 115
Fiche 103 La circulation des liquides internes 116
Fiche 104 Les pompes cardiaques 117
Fiche 105 La pression artérielle 118
Fiche 106 La régulation de la pression artérielle 119
2.2 L’homéostasie
Fiche 107 La notion d’homéostasie 120
Fiche 108 La glycémie 121
Fiche 109 La calcémie 122
Fiche 110 Le pH plasmatique 123
Fiche 111 L’osmorégulation 124
Fiche 112 La thermorégulation 126
Fiche 113 L’équilibre hydro-minéral chez les plantes 127
2.3 La nutrition
Fiche 114 La prise alimentaire 128
Fiche 115 L’appareil digestif des Mammifères 130
Fiche 116 La digestion 131
Fiche 117 L’absorption intestinale 132
Fiche 118 Les états nutritionnels 134
Fiche 119 Les besoins alimentaires 135
Fiche 120 L’absorption des solutés du sol 136
Fiche 121 L’absorption de l’azote du sol 137
Fiche 122 L’absorption du diazote 138
VI
Table des matières
2.4 La respiration
Fiche 123 Le fonctionnement des échangeurs respiratoires 139
Fiche 124 Les branchies 140
Fiche 125 La respiration chez les Mammifères 142
Fiche 126 La diversité des poumons 144
Fiche 127 Le système trachéen 146
Fiche 128 Les pigments respiratoires 147
Fiche 129 Le transport des gaz respiratoires 148
Fiche 130 Le contrôle des échanges respiratoires 149
2.5 L’excrétion
Fiche 131 Les produits de l’excrétion azotée 150
Fiche 132 Les principaux types d’appareils excréteurs 151
Fiche 133 Les modalités de fonctionnement des appareils excréteurs 152
Fiche 134 L’organisation générale du rein des Mammifères 153
Fiche 135 Le fonctionnement du néphron des Vertébrés 154
Fiche 136 L’excrétion azotée et le milieu de vie 156
3.1 La sensibilité
Fiche 137 Le fonctionnement des systèmes sensoriels 158
Fiche 138 La sensibilité visuelle chez l’Homme 159
Fiche 139 L’œil humain 160
Fiche 140 La rétine 161
Fiche 141 De la molécule photoréceptrice à l’œil 162
Fiche 142 La transduction du signal lumineux 163
Fiche 143 Le traitement de l’information visuelle au niveau de la rétine 164
Fiche 144 Le traitement de l’information visuelle par le cortex visuel 165
Fiche 145 La sensibilité mécanique 166
Fiche 146 Le codage et le traitement de l’information de contact 167
Fiche 147 La sensibilité à la position du corps dans l’espace 168
Fiche 148 La sensibilité chimique 170
Fiche 149 La sensibilité thermique 172
VII
Table des matières
Fiche 150 La sensibilité auditive 173
Fiche 151 L’oreille interne 174
Fiche 152 La transduction auditive 176
Fiche 153 Le traitement central de l’information auditive 177
Fiche 154 La douleur 178
Fiche 155 Le déterminisme de la floraison 179
Fiche 156 Le déterminisme de la germination 180
Fiche 157 Les tropismes 181
3.2 La motricité
Fiche 158 Le muscle et la fibre musculaire 182
Fiche 159 Le couplage excitation-contraction 184
Fiche 160 La contraction musculaire 186
Fiche 161 Le réflexe de flexion 187
Fiche 162 Le réflexe myotatique 188
Fiche 163 La posture 189
Fiche 164 Le mouvement volontaire 190
Fiche 165 La programmation et le contrôle du mouvement volontaire 191
Fiche 166 L’exercice physique 192
4.1 La reproduction
Fiche 187 La reproduction sexuée et asexuée 214
Fiche 188 L’appareil reproducteur femelle chez les mammifères 216
Fiche 189 L’appareil reproducteur mâle chez les mammifères 217
Fiche 190 Le cycle menstruel chez la femme 218
Fiche 191 La gamétogenèse chez l’Homme 219
Fiche 192 La fécondation 220
Fiche 193 De la fécondation à la nidation 221
Fiche 194 La gestation 222
Fiche 195 La naissance chez les Mammifères 223
Fiche 196 La lactation 224
Fiche 197 La formation du gamétophyte chez les Angiospermes 225
Fiche 198 L’appareil reproducteur des Angiospermes 226
Fiche 199 Les pièces fertiles chez les Angiospermes 228
Fiche 200 La pollinisation 230
Fiche 201 La fécondation chez les Angiospermes 231
Fiche 202 La formation de la graine 232
Fiche 203 La diversité des fruits 233
Classification 244
Index 245
Crédits photographiques 249
IX
Comment utiliser cet ouvrage ?
Partie
4 La reproduction
et le développement
4 parties
Les grands axes de la biologie
Fleur de Cognassier
Sommaire
4.1 - La reproduction
4.1 - La croissance et le développement
fiche
212 fiches réparties en 3 La cellule de la lignée verte
15 chapitres
La cellule
Cytoplasme
Paroi
Noyau
Chloroplastes
Cytoplasme repoussé
Paroi le long de la paroi
en couleur La cellule des Embryophytes possède, globalement, les mêmes organites que la cellule
des Eumétazoaires. Néanmoins, elle se caractérise par la présence d’une paroi pecto-
cellulosique, de plastes et de vacuoles, ainsi que par l’absence de centrioles.
importante
Lysosome Tonoplaste
Méat
Plasmodesme
Microtubules
Peroxysome Microfilaments
Parois
Plaste
Gouttelette
lipidique
Et aussi…
Amidon
• Un index complet
X
Avant-propos
• De la cellule à l’organisme ;
• Les fonctions de nutrition ;
• Les fonctions de relation ;
• La reproduction et le développement.
Ces grands axes permettent d’aborder l’ensemble des aspects de la biologie
sous la forme de plus de 200 fiches synthétiques, illustrées de 600 schémas
et photos en couleur. Ces fiches sont accompagnées d’un glossaire des abré-
viations employées dans l’ouvrage et d’un index complet.
Ce livre est conçu comme un instrument de révision, permettant de synthé-
tiser les notions développées dans un ouvrage compagnon, plus complet :
Biologie (Licence), tout le cours en fiches.
D’un niveau scientifique correspondant à la Licence de sciences de la vie,
il permettra également aux étudiants de Master préparant les concours de
réviser simplement et rapidement leurs connaissances.
Cette deuxième édition entièrement actualisée s’enrichit de nouvelles fiches.
Enfin, une sélection de schémas et de photos à légender est accessible sur
le site Internet des éditions Dunod (www.dunod.com/contenus-complemen-
taires/9782100705399) pour tester ses connaissances.
XI
Abréviations
5HT 5 hydroxytryptamine – sérotonine Asp Aspartate
A Adrénaline ATP Adénosine triphosphate
ABA Acide abscissique BCR B cell receptor
ABP Auxine binding protein BER Réparation par excision de bases
AC Adenylyl cyclase BR Brassinostéroïde
Ac Anticorps CAM Molécule d’adhésion cellulaire
Acétyl-CoA Acétyl coenzyme A CAM Crassulacean acid metabolism
Ach Acétylcholine CASPASE Cysteine aspartate specific protease
ACTH Adrenal corticotrophin hormone - CCK-PZ Cholécystokinine-pancréozymine
Corticotrophine
Cdk Cyclin dependant kinase
ADH Hormone antidiurétique
Cdc6 Cell division cycle 6
ADN (DNA) Acide désoxyribonucléique
CGL Corps genouillé latéral du thalamus
ADP Adénosine diphosphate
CK Cytokinine
AER Crête ectodermique apicale
CLIP Class I- associated invariant chain
Ag Antigène peptide
AIA Acide indole-3 acétique CMH Complexe majeur d’histocompatibilité
AJ Acide jasmonique CO Gène Constans
AMPA α-amino-3-hydroxy-5-méthylisoazol- COP Coat protein
4-propionate
CPA Cellule présentatrice de l’antigène
AMPc Adénosine monophosphate cyclique
CPEB CPE binding protein
ANF Facteur natriurétique ventriculaire
CR Récepteur du complement
AP Adaptine
CRH Corticolibérine
APC Cellule présentatrice de l’antigène
Cdt1 cdc10 dependent transcript 1
ARF Afférents du réflexe de flexion
DA Dopamine
ARN (RNA) Acide ribonucléique
DAG Di-acyl glycérol
ARNi ARN interférent
DBD DNA binding domain
ARNm ARN messager
DC Cellule dendritique
ARNmi micro-ARN
DDCP DNA damage checkpoint
ARNsi small interfering ARN
ddp Différence de potentiel
ARNt ARN de transfert
DHPR Récepteur aux dihydropyridines
AS Acide salicylique
ECG Électrocardiogramme
ASC Canal sensible à l’amiloride
ETR Récepteur à l’éthylène
ASIC Canal ionique sensible à l’acide
FAD Flavine adénine dinucléotide
XII
Abréviations
FGF Facteur de croissance fibroblastique LBD Ligand binding domain
FLC Gène Flowering Locus C LDL Low density lipoprotein
FRI Gène Frigida LFA Leucocyte function antigene
FSH Hormone folliculo-stimulante LH Hormone lutéinisante
GABA Acide gamma amino-butyrique MALT Tissu lymphoïde associé aux
muqueuses
GAP GTPase activating protein
MAP Microtubule associated protein
GDP Guanosine diphosphate
MASP MBP associated protein
GH Hormone de croissance
MBP Mannose binding protein
GHIH Somatostatine
Mcm Minichromosome maintenance
GHRH Somatocrinine
MCP Mitotic checkpoint
Glu Glutamate
MEB Microscope électronique à balayage
GluT Transporteur de glucose
MEC Matrice extracellulaire
GMPc Guanosine monophosphate cyclique
MET Microscope électronique à
GnRH Gonadolibérine transmission
GNRP Guanine nucleotide releasing protein M.O. Microscope optique
GTP Guanosine triphosphate NA Noradrénaline
H Histamine NAD Nicotinamide adénine dinucléotide
Hb Hémoglobine NADP Nicotinamide adénine dinucléotide
phosphate
HLA Human leucocyte antigen
NCR Natural cytotoxicity receptors
HR Hypersensitive response
NER Réparation par excision de
Hsp Protéine de choc thermique
nucléotides
ICAM Inter cellular adhesion molecule
NiR Nitrite réductase
Ig Immunoglobline
NLS Séquence de localisation nucléaire
IL Interleukine
NK Natural killer
ILT Ig-like transcripts
NKR NK cells receptors
IP3 Inositol tri-phosphate
NMDA N-méthyl-D-aspartate
ISR Induced systemic resistance
NO Oxyde nitrique
ITAM Immunoreceptor tyrosine-based
NR Nitrate réductase
activating motif
NSF N-ethylmaleimide sensitive factor
ITIM Immunoreceptor tyrosine-based
inhibition motif NTS Noyau du tractus solitaire
JH Hormone juvenile ORC Origin recognition complex
LAR Local acquired resistance PAF Platelet activating factor
XIII
Abréviations
PAMP Pathogen associated molecular SNARE SNAP receptor
pattern
SnRP Small nuclear ribonucleoprotein
PCNA Proliferating cell nuclear antigen
SNV Système neurovégétatif
PDE Phosphodiestérase
SP Substance P
PEP Phosphoénol pyruvate
SRP Signal recognition protein
PI Phosphatidyl-inositol
T3 Tri-iodothyronine
Pi Phosphate inorganique
T4 Tétra-iodothynonine – thyroxine
PIH Prolactine inhibitory hormone
TAF TBP associated factor
PIP3 Phosphatidyl-inositol tri phosphate
TAP Transporter associated with antigen
PKA Protéine kinase AMPc-dépendante processing
PKC Phosphokinase C TATA box Succession de 4 bases présente au
niveau de la séquence promotrice des
PLC Phospholipase C Eucaryotes
PPSE Potentiel post synaptique excitateur TBP TATA box binding protein
PPSI Potentiel post synaptique inhibiteur TCR T cell receptor
PRH Prolactine releasing hormone TF Facteur de transcription
PRR Pattern recognition receptor TGF Facteur de croissance transformant
PTH Parathormone TGN Trans golgian nertwork
PTTH Hormone prothoracicotrope Th Lymphocyte T helper
RCP Replication checkpoint TK Tacchykinine
RER ou REG Réticulum endoplasmique rugueux ou TLR Toll like receptor
granuleux
TNF Tumor necrosis factor
RF-c Replicating factor C
TRH Thyréolibérine
RISC RNA induced silencing complex
TRP Transient receptor potential
ROI Reactive oxygen intermediates
TSH Thyréotrophine
RPA Replicating protein A
UCP Uncoupled protein
RubisCO Ribulose 1,5 bisphosphate
carboxylase/oxygénase UDP Uridine diphosphate
RyR Récepteur à la ryanodine UTP Uridine triphosphate
SAR Systemic acquired resistance UTR UnTranslated Region
SGLT Sodium Glucose Linked Transporter VLDL Very low density lipoprotein
Shh Gène sonic hedgehog ZPA Zone d’activité polarisante
SNA Système nerveux autonome ZO Zonula occludens
SNAP Soluble NSF attachement protein
XIV
Partie
De la cellule
1 à l’organisme
Sommaire
1.1 - La cellule 1.3 - L’organisme
1.2 - L
es tissus et la 1.4 - L
’information génétique
communication et son expression
intercellulaire
fiche
1 Les constituants chimiques du vivant
La cellule
COO-
CH2
Base Les molécules biologiques
(Thymine)
CH2
CH2OH
sont formées à partir de squelettes
O
COO-
O
CH2
NH3+ CH2
H
carbonés dans lesquels les atomes
HN
H CH2
H CH
CH2
O Ribose
HO
OH H
OH CH2
N
OH OH de carbone sont liés entre eux
CH2 CH3
H OH CH2 O Phosphate ou avec des atomes d’oxygène,
CH2
Acide aminé CH2 O
d’hydrogène, d’azote,
Glucide CH2
CH2
(Alanine)
O P
O
OH
de phosphore ou de soufre.
(Glucose) CH2
On distingue quatre grands types
CH2 Acide nucléique
CH2
(Nucléotide) de molécules : les glucides,
CH2
les lipides, les acides aminés et
Lipide les acides nucléiques.
(Acide palmitique)
Coude β Chaîne β2
Chaîne β1
Feuillet β
Hélice α Hémoglobine
La cellule
Membrane plasmique
Réseau
Canalicule de sécrétion endomembranaire
Noyau :
Membrane
Granules nucléaire
de secrétion Nucléole
Condensation
de chromatine
Cytoplasme
10 µm
La cellule constitue l’unité fonctionnelle de tout organisme vivant. Chez les Eumétazoaires,
elle est limitée par la membrane plasmique. Le compartiment intracellulaire constitue
le cytoplasme, incluant différents organites. Le noyau, délimité par une double membrane,
contient l’ADN, support de l’information génétique.
Peroxysome
Centriole
Cytoplasme
Lysosome
Membrane plasmique
Réticulum Microtubules
endoplasmique lisse Microfilaments
Filaments intermédiaires
Réticulum
endoplasmique granulaire
Dictyosome
Noyau
Gouttelette lipidique
Nucléole
Mitochondrie
Ribosomes
Cytoplasme
Paroi
Vacuole
50 µm
50 µm
Grande vacuole
Épiderme d’Oignon (M.O.)
La cellule des Embryophytes possède, globalement, les mêmes organites que la cellule
des Eumétazoaires. Néanmoins, elle se caractérise par la présence d’une paroi pecto-
cellulosique, de plastes et de vacuoles, ainsi que par l’absence de centrioles.
Microtubules
Peroxysome Microfilaments
Parois
Plaste
Gouttelette
lipidique
Amidon
Cytoplasme
Nucléole Mitochondrie
Plasmalemme Ribosomes Noyau Réticulum endoplasmique
Dictyosome granulaire
La cellule
unicellulaires dépourvus de noyau.
Il y a absence d’une véritable sexualité, les échanges
d’ADN se faisant par simple tranfert entre cellules.
Ces échanges d’ADN sont cependant possibles entre
individus appartenant à des groupes génétiquement
très distants.
H 3C CH H NH H NH Pont
interpeptidique
C O C O C O
R CH3 CH3
Les Archées sont caractérisées, en particulier, par leurs séquences d’ARN ribosomique
16S. Leur membrane plasmique contient des acides gras liés au squelette de glycérol par
des liaisons éther et non ester comme chez les autres être vivants.
Chez certaines, les acides gras forment des groupements tétra-éther à l’origine
de lipides bipolaires leur permettant de résister aux fortes températures.
La plupart des Archées sont entourées d’une paroi rigide dont la couche de surface
(S-layer) est constituée de polymères protéiques ou glycoprotéiques ne contenant pas de
peptidoglycane, contrairement aux Eubactéries.
CH – O CH – O O – CH
CH2 – OH CH2 – OH
5
fiche
5 Les virus
La cellule
Capside
1 - Adsorpsion sur 2 - Pénétration du génome viral dans la cellule hôte
la cellule hôte Acide nucléique
Cellule hôte
3 - Expression et réplication
du génome viral
dans la cellule hôte
4 - Morphogenèse
5 - Libération des particules virales Multiplication virale selon plusieurs étapes successives
6
fiche
La membrane plasmique 6
La cellule
Espace
inter-membranaire
Cellule 1
Jonction serrée
Cellule 2
Membrane plasmique
(bicouche de phospholipides)
Membranes plasmiques
de deux cellules adjacentes
(MET)
Protéine
Phospholipides
Ext.
Phospholipides
Protéine ancrée
Segment protéique par une chaîne lipidique
en hélice α