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Art. Revisión.

MICROORGANISMOS Y SU
APLICACIÓN INDUSTRIAL POR MEDIO
DE LA BIOTECNOLOGÍA.
Biological Systems And Industrial
Application Through Biotechnology.

HURTADO SÁENZ ANDRES AUGUSTO1


1 Colombia. Universidad de los Llanos, Facultad de Ciencias Básicas e Ingeniería, Programa Biología,
Electiva II: Ecología Microbiología. Cód. 164003415. andres.hurtado@unillanos.edu.co

RESUMEN
The discoveries over the last decade have
Los descubrimientos de la última década han demonstrated that microbiology is a central
demostrado que la microbiología es una scientific discipline with practical applications in
disciplina científica central con aplicaciones agriculture, medicine, bioremediation,
prácticas en la agricultura, la medicina, biotechnology, engineering, and other fields. It
biorremediación, biotecnología, ingeniería y is clear that the roles of microbes in nature are
otros campos. Es claro que el papel de los so diverse that the process of mining this
microorganismos en la naturaleza es tan genetic variation for new applications will
diverso que el proceso de exploración de esta continue long time into the future. However,
variación genética para nuevas aplicaciones these opportunities demand a deep
continuará por mucho tiempo en el futuro. Sin understanding of basic microbial physiology,
embargo, estas posibilidades exigen un genetics, and ecology. Major challenges that
profundo conocimiento de la fisiología básica lay ahead are to impart the broad training
microbiana, la genética y la ecología. Los needed to entice and enable the next
principales desafíos que se avecinan son generation of microbiologists, and to educate
impartir una amplia formación necesaria para the public and government representatives
atraer y activar la siguiente generación de about the continued and critical importance of
microbiólogos, y educar a los representantes this field for health and the economy.
públicos y gubernamentales sobre la
importancia crítica y continuidad de este campo Keywords: Biotechnology, Bioremediation,
de la salud y la economía. recombinant DNA plasmids, genes, metabolic
pathways engineering.
Palabras clave: Biotecnología,
Biorremediación, ADN recombinante,
plásmidos, genes, Ingeniería de vías DE LA GENÉTICA CLÁSICA A LA ERA
metabólicas. GENÓMICA
ABSTRACT

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La forma de estudiar la genética ha progresado conjunto pretenden comprender de manera


notablemente en las últimas décadas. El integral la función de todos los componentes
desarrollo de nuevas y potentes tecnologías en del genoma y sus productos. (Michán y Castillo,
el período post Segunda Guerra Mundial llevó a 2011).
una revolución en la biología. La introducción
de herramientas genéticas tales como Entender la forma en la que se encuentra
transposones, junto con la capacidad para codificada la información genética promovió el
clonar genes y determinar secuencias de ADN, desarrollo de la tecnología de ADN
y la posterior explosión de técnicas basadas en recombinante, lo cual permitió aislar, manipular
estos métodos hizo posible diseccionar la y editar material genético; obtener un gran
genética molecular de esencialmente cualquier número de copias de fragmentos específicos
organismo. (Maloy y Schaechter, 2006; Michán de este ácido nucleico para su estudio; clonar
y Castillo, 2011). Sus orígenes se remontan al genes en vectores y estudiar su estructura,
estudio de los caracteres hereditarios, seguido organización, función y expresión. (Maloy y
por el descubrimiento de los genes y los Schaechter, 2006; Gamboa y Trujillo 2009;
cromosomas hasta conocer la estructura del Michán y Castillo, 2011). Posteriormente se
ADN. (Gamboa y Trujillo 2009; Michán y describió la secuencia de todo el material
Castillo, 2011). Los factores fundamentales de genético o “genoma” contenido en los mismos,
la herencia. El estudio de la herencia biológica incluyendo el ADN del núcleo, mitocondria y los
ha sido un tema de interés a lo largo de la diferentes tipos de plástidos. En 1977 se
historia pero fue a mediados del siglo XIX con publicó la secuencia completa del primer
los experimentos realizados por Mendel cuando genoma, la del fago X174 de 5368 pb y pocos
se lograron establecer las primeras respuestas años después se dieron a conocer las 16.569
a este enigma. Mendel observó que las pb que constituyen el genoma de la mitocondria
características de los organismos eran humana. Posteriormente se desarrolló la
heredables de padres a hijos y de una forma secuenciación automatizada, la cual permitió
independiente, lo cual dio origen al concepto de secuenciar ADN con mayor eficiencia, rapidez y
unidades de la herencia, los genes. (Michán y a gran escala. (Michán y Castillo, 2011).
Castillo, 2011).
La biotecnología ha impactado el área de la
En la primera década del siglo XX, Thomas medicina, principalmente con su contribución al
Morgan sugirió que los genes se localizaban conocimiento a nivel molecular de la causa de
físicamente en los cromosomas con base en diversas enfermedades, lo cual ha generado
observaciones de transmisión de caracteres una revolución en la industria farmacéutica con
ligados al sexo en la mosca de la fruta la producción de biofármacos contra
Drosophila melanogaster. (Michán y Castillo, enfermedades específicas. (Gamboa y Trujillo
2011). Todos estos descubrimientos han 2009). Estos acontecimientos nos permiten
promovido la evolución de la biomedicina hacia responder a las preguntas que se consideraban
las eras de la genómica y posgenómica en las anteriormente incomprensibles, y tuvo un gran
que el uso de la genética reversa impera sobre impacto en todas las disciplinas de la biología.
la genética básica o directa. (Gamboa y Trujillo (Maloy y Schaechter, 2006; Gamboa y Trujillo
2009; Michán y Castillo, 2011). Además, surge 2009). Un biofármaco es una molécula
la genética molecular, la genómica funcional y biológica con fines terapéuticos obtenida a
las diversas tecnologías “ómicas” que en partir de un organismo vivo, ya sea a partir de

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bacterias, hongos, células animales, levaduras, en microscopía, la nanotecnología y la biología


entre otros. Estas moléculas presentan mayor estructural permiten el análisis de los
acción terapéutica y menos reacciones mecanismos químicos subyacentes a un nivel
secundarias, al ser prácticamente homólogas a más profundo y más profundo. (Maloy y
las producidas por el organismo. La gran Schaechter, 2006).
mayoría de estos biofármacos son proteínas
recombinantes. (Gamboa y Trujillo 2009). El área de la biotecnología que se relaciona al
estudio y la modificación del metabolismo es la
La obtención de proteínas recombinantes se ingeniería de vías metabólicas (IVM). Ésta
logra mediante la inserción del gen que puede definirse como la modificación racional y
expresa la proteína de interés en un organismo directa de las reacciones que constituyen el
diferente. (Gamboa y Trujillo, 2009; Michán y metabolismo de un organismo, con el propósito
Castillo, 2011). La elección del microorganismo de mejorar sus propiedades o su productividad.
para expresar la proteína de interés depende (Martinez y Gosset, 2007; Gamboa y Trujillo
en gran medida de las características 2009). La IVM surge como una nueva área
fisicoquímicas de la proteína a producir. Los dentro de la biotecnología como resultado del
sistemas procariontes expresan proteínas cúmulo de conocimientos generados por varias
solubles o en forma de agregados disciplinas biológicas que incluyen
intracelulares o cuerpos de inclusión, sin principalmente a la bioquímica, la genética, la
plegamiento, lo que implica su estructuración biología molecular y las ciencias genómicas.
in-vitro. (Gamboa y Trujillo, 2009). (Martinez y Gosset, 2007).

La expresión de estas proteínas se ha MICROORGANISMOS Y APLICACIONES DE


convertido en una herramienta muy popular, ya INTERES.
que es posible obtener altas cantidades de
proteína con bajos costos de producción y altas Los microorganismos en la biosfera, mediante
purezas de una o varias proteínas de interés. sus propios metabolismos y las interacciones
(Gamboa y Trujillo, 2009; Michán y Castillo, con otros organismos bióticos y abióticos,
2011). El desarrollo de la tecnología del ADN conllevan al mantenimiento del equilibrio y a la
recombinante y de la secuenciación masiva y dinámica en los ecosistemas y a la vida misma
automatizada, permitieron determinar en el planeta. En la actualidad sólo se conoce
posteriormente la anatomía de los genomas. el 10% de las bacterias de la naturaleza, con la
(Michán y Castillo, 2011). desventaja de que la mayoría de éstas no son
cultivables, posiblemente por los
Las bases de datos que alojaban secuencias requerimientos nutricionales y condiciones
de genes crecieron rápidamente, al tiempo que fisicoquímicas de su entorno, las cuales no se
se iniciaron varios proyectos para secuenciar pueden reproducir en el laboratorio, y tampoco
genomas de diversas especies, incluyendo el recrear in vitro las interrelaciones simbióticas y
del ser humano, el cual empezó en 1990 y antagónicas en las que ellas sobreviven. Las
concluyó una década después. A la fecha se técnicas de biología molecular para caracterizar
conocen un total de 3.918 genomas completos el ADN microbiano son consideradas
de los cuales 40 pertenecen a eucariontes, complementarias a las técnicas
1.377 a procariontes, 2.460 a virus y 41 a microbiológicas. La unión de estos métodos,
viroides. (Michán y Castillo, 2011). Los avances permiten validar en forma más efectiva la

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identificación microbiana, sobre todo para bacterianas con la capacidad de producir


microorganismos que son de difícil desarrollo in cantidades elevadas de proteínas terapéuticas,
vitro. (Gutiérrez et al., 2009) como es el caso de la insulina y la hormona de
crecimiento humanas. (Martinez y Gosset,
La capacidad de manipular ADN y conocer las 2007).
secuencias de los genes en combinación con la
necesidad de entender en detalle su estructura Bioremediación
y función de los mismos, ha revolucionado la Desde hace un tiempo, se han comenzado a
forma de aproximarnos a la genética y estudiar, como alternativa, una serie de
promovido el desarrollo de un nuevo campo de métodos biológicos utilizando microorganismos.
la biología, la genética molecular. (Michán y El uso de los mismos para tratar aguas
Castillo, 2011; Gericke, 2012). En la revolución residuales contaminadas con metales es un
genómica el objeto de estudio principal se campo emergente, ya que en un principio se
enfocó a los genomas más que a los genes y desarrollaron para remediar las aguas
este interés permitió esclarecer detalladamente contaminadas con metales e hidrocarburos,
la composición de la molécula esencial que pero actualmente se utilizan como alternativa
forma a los seres vivos, dejando atrás aquello de tratamiento. Éstos podrían reducir
que hace un siglo y medio se planteaba como significativamente los costos de los productos
un enigma. (Maloy y Schaechter, 2006; Michán químicos y el consumo de energía, en
y Castillo, 2011; Gericke, 2012). La capacidad comparación con los procesos convencionales
de estudiar microorganismos en su propio de tratamiento fisicoquímico. (Panigatti et al.,
entorno en lugar del tubo de ensayo, junto con 2011).
la capacidad para diseccionar los detalles
moleculares de las células microbianas ha La presencia de salinidad y sodio en los suelos
hecho de la biología microbiana fundamental interfiere en el crecimiento adecuado de la
para casi todas las disciplinas de la ciencia. mayoría de los cultivos y por lo tanto constituye
(Maloy y Schaechter, 2006). Las hidrolasas uno de los problemas más serios que enfrenta
producidas por microorganismos halófilos han la agricultura sostenible a nivel de todo nuestro
sido usadas en la industria farmacéutica para la planeta. Las prácticas agrícolas inadecuadas
elaboración de algunos medicamentos como han sido la causa del aumento de los suelos
antibióticos, hormonas y pesticidas también salinos–sódicos en todo el planeta. Su
han sido usadas para el tratamiento de recuperación se ha hecho principalmente
superficies marinas contaminadas con petróleo. cambiando el sodio por otro catión,
(Castillo y Barragan, 2001). generalmente calcio, remediando en forma
mecánica y usando plantas halotolerantes. Sin
La ingeniería genética y sus técnicas de ADN embargo, no es fácil ni económico eliminar o
recombinante surge en los años setenta como disminuir las concentraciones de sodio del
resultado del conocimiento acumulado en el suelo (Sánchez y Arguello, 2006).
campo de la biología molecular. Con ello se
abre la posibilidad de aislar, editar y modificar En la actualidad está creciendo el interés por
el material genético, lográndose incluso el conocer mejor la diversidad de
trasplante de genes entre especies diferentes. microorganismos halófilos es decir que
Una importante aplicación de la ingeniería dependen para su supervivencia del sodio, y
genética ha sido el desarrollo de cepas cada vez es mayor el número de

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investigaciones relacionadas con el tema ya La contaminación causada por metales


que estos organismos producen una amplia pesados en aguas superficiales ha sido
variedad de metabolitos secundarios estables siempre un problema muy grave, ya que estos
que pueden tener aplicaciones prácticas. elementos no son biodegradables y se
(Castillo y Barragan, 2001; Sánchez y Arguello, acumulan en los tejidos vivos. El cromo es
2006). Las aplicaciones biotecnológicas de los ampliamente utilizado en diversas aplicaciones
microorganismos extremófilos halófilos son industriales como la producción de acero,
diversas entre las cuales se pueden citar: galvanoplastía, curtido de pieles, industrias
producción de alimentos fermentados, textil, de conservación de la madera, de
producción de salsa de soya, colorantes, aluminio anodizado y refrigeración por agua. El
extremozimas resistentes a altas tratamiento de suelos contaminados con
concentraciones de sal (amilasas, proteasas, hidrocarburos también es esencial para
etc.), aditivos utiliza-dos en cosméticos, mantener la calidad del medio ambiente.
plásticos biodegradables y producción de Muchos microorganismos son conocidos por
agentes gelificantes como exopolisacáridos. ser capaces de concentrar especies de metales
(Castillo y Barragan, 2001). de soluciones acuosas diluidas y de
acumularlas dentro de su estructura celular.
Estos microorganismos pertenecientes a la Estos microorganismos incluyen levaduras,
familia Halobacteriaceae abundan en salinas y hongos, algas y bacterias. Los
lagos hipersalinos, ambientes bajo los cuales microorganismos pueden movilizar o
muy pocos seres vivos pueden crecer. Una inmovilizar metales, metaloides y compuestos
característica fundamental de los miembros de organometálicos a partir de procesos de
esta familia es que son halófilos obligados, oxidación y reducción. La presencia de
necesitando concentraciones de NaCl mayores residuos y de metabolitos de plaguicidas en el
de 1.5 M para crecer, además, toleran bastante alimento, agua y suelo representa actualmente
bien las temperaturas elevadas, ya que los uno de los temas importantes para la química
ambientes que habitan, por la posición ambiental. Existe una gran variedad de
geográfica y por tratarse de aguas estancadas, métodos físicos y químicos para tratar los
suelen ser lugares muy cálidos con suelos y mantos acuíferos contaminados, pero
temperaturas que pueden llegar a mas de muchos de estos tratamientos no destruyen los
50°C. (Castillo y Barragan, 2001). Estudios compuestos peligrosos sino que los transfieren
actuales exploran la posibilidad de usar estos de una fase a otra, por lo que el tratamiento
microorganismos bacterianos con capacidad biológico en el que se transforman estos
halófila, podrían ser utilizados como posibles compuestos peligrosos en compuestos más
remediadores de suelos sódicos y salinos. simples sigue siendo un desafío importante en
(Sánchez y Arguello, 2006). Estudios han la actualidad. Especies tales como
demostrado que los microorganismos halófilos Acinetobacter sp. Pseudomonas sp., Bacillus
cuentan con estrategias que les permiten coagulans, E. coli ATCC 33456 y
enfrentar el estrés osmótico manteniendo altas Desulfomicrobium norvegicum fueron
concentraciones intracelulares de sal y estudiados bajo diferentes condiciones
sintetizando solutos compatibles que les operativas, en el estudio de la reducción de Cr
permiten balancear su presión osmótica. (VI), tanto en sistemas de suspensión como
(Castillo y Barragan, 2001). adheridos. Los mecanismos fisiológicos
involucrados en la reducción de cromo

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hexavalente varían ampliamente entre las disponibilidad será limitada. Por estos motivos,
diferentes especies. En algunos casos la ha surgido el interés en la búsqueda de
reacción es catalizada por enzimas asociadas a alternativas tecnológicas para producir
la membrana celular, mientras que en otros las compuestos útiles mediante procesos no
mismas se encuentran en la fracción soluble. contaminantes y que no dependan del petróleo.
En particular, la reducción biológica de Cr (VI) a Una de las alternativas más promisorias es la
Cr (III) permite considerar a los biotecnología. (Martinez y Gosset, 2007).
microorganismos como una herramienta
biotecnológica para el tratamiento de las aguas El surgimiento de nuevas enfermedades en el
residuales contaminadas con cromatos. mundo moderno (enfermedades emergentes y
(Panigatti et al., 2011). reemergentes) y la aparición cada vez mayor
de patógenos antibiótico-resistentes, han
Biofarmaceutica generado la necesidad de evaluar diversos
Desde el descubrimiento del modelo del ADN compuestos naturales con actividad
por Watson y Crick en el año 1953 se ha antimicrobiana como una alternativa en el
avanzado mucho en su manipulación y tratamiento de enfermedades
aplicaciones. Numerosas investigaciones han infectocontagiosas y, de esta manera,
permitido un mejor entendimiento de como el contrarrestar algunos de estos problemas de
ADN y otras moléculas portan y transmiten la salud pública y veterinaria. (León et al., 2010).
información genética. Desde comienzos del Un claro ejemplo de esto es el interferónbeta
siglo pasado, se sabe que algunas 1a y 1b, el cual ha elevado la calidad de vida
enfermedades ocurren debido a fallas de los pacientes diagnosticados con esclerosis
metabólicas, por deficiencia en una enzima, múltiple.4,5 En diversos estudios se ha
proteína ausente o menos activa que la demostrado que la importancia de las proteínas
proteína normal; lo anterior es debido a terapéuticas recombinantes se ha
mutaciones en los genes que codifican la incrementado exponencialmente en los últimos
síntesis de esas proteínas. Este conocimiento 30 años. (Gamboa Trujillo 2009).
ha estimulado a muchos investigadores en la
búsqueda de alternativas para el tratamiento de Muchos organismos marinos que incluyen
enfermedades genéticas empleando la terapia bacterias, hongos, fitoplancton y algas
de reemplazo enzimático. (Córdoba et al., mayores, así como algunos invertebrados son
2003). actualmente considerados como virtuales
fuentes promisorias de substancias bioactivas.
Actualmente, algunas moléculas de interés Hallazgos de nuevos microorganismos marinos
farmacológico se obtienen mediante procesos muestran la existencia de cepas nativas que
basados en refinación y síntesis química o a producen una variedad de metabolitos
partir del petróleo y derivados. Esto permite secundarios química y biológicamente
producir estos compuestos útiles con un costo interesantes para el desarrollo y producción de
de producción relativamente bajo. Sin embargo, nuevos compuestos de importancia en la
la mayoría de estos procesos generan industria farmacológica, cosmética, de
subproductos que contaminan el medio suplementos nutricionales, biomoléculas,
ambiente. Por otra parte, depender del petróleo biocatalizadores, agroquímicos, química fina,
como materia prima tiene la desventaja de que entre otras. Tradicionalmente las algas han
no es renovable, por lo tanto, en el futuro su sido fuentes de aislamiento de metabolitos con

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principios activos útiles en medicina. (León et microorganismos como Escherichia coli y


al., 2010; Martinez y Gosset, 2007). Saccharomyces cerevisiae, sin embargo los
sistemas basados en biotecnología vegetal en
Estudios sobre las interacciones microbio- algunos casos ofrecen ventajas tanto en
anfitrión indican que los microbios influyen en el producción, como en bioseguridad y economía.
anfitrión en formas que nunca se imaginaba. Esas biotecnologías basadas en plantas
Por ejemplo, la presencia de la biota pueden utilizar plantas transgénicas completas
microbiana normal en el intestino de los ratones o sus células, tejidos u órganos cultivados en
promueve el desarrollo adecuado del tejido biorreactores de manera similar a los sistemas
vascular, así como la inmunidad del huésped de fermentación para microorganismos. (García
frente a patógenos invasores. (Maloy y et al, 2010).
Schaechter, 2006). Estos descubrimientos nos
proporcionan nuevos conocimientos sobre las La melanina es uno de los pigmentos más
interacciones huésped-microbio, beneficiosos comunes y de mayor distribución en la
que pueden conducir al diseño racional de los naturaleza. Es responsable de la coloración de
probióticos. Sin embargo, también estamos plantas y animales; se encuentra en los ojos, el
empezando a aprender que los microbios cabello, la piel, el plumaje, la cáscara de los
pueden causar enfermedades crónicas que se huevos, la cutícula de los insectos, la tinta de
pensaba previamente que a debido a la los cefalópodos y en la pared y el citoplasma
genética o dolencias medio ambiente tales de muchos microorganismos. En los humanos
como úlceras y cáncer de estómago causadas este pigmento se ha encontrado también fuera
por Helicobacter pylori, artritis causada por de la piel, en las neuronas de la sustancia
Borrelia burgdorferi, y muchas otras negra y en los hepatocitos. Hasta el momento
enfermedades. (Maloy y Schaechter, 2006). han sido muchas las características que se le
ha conferido a la melanina. Se sabe que
La insulina es una proteína con actividad protege las bacterias como Vibrio cholerae del
hormonal que regula los niveles de glucosa en choque térmico e hiperosmolar en los
la sangre, aunque también participa en la estuarios, generando así bacterias resistentes
regulación de otros procesos fisiológicos como estos cambios ambientales. En relación con los
la utilización de algunos nutrientes, hongos, se han estudiado tanto en aquellos
estimulación de la síntesis de glucógeno, patógenos de importancia para el humano, co-
aminoácidos, proteínas y consumo de lípidos. mo en otros de tipo ambiental y de interés
Las deficiencias en su modo de acción se dan biotecnológico, en los cuales se ha encontrado
cuando su biosíntesis es insuficiente y que las melaninas son importantes para la
deficiente, provocando alteraciones en sus supervivencia y la longevidad de las propágulas
funciones fisiológicas, directamente la micóticas. La melanina también funciona como
concentración de glucosa en la sangre, sistema de evasión de los mecanismos
produciendo así el padecimiento conocido inmunológicos del huésped. (Uran y Cano,
como diabetes. La insulina humana 2008).
recombinante se ha expresado en diversos
organismos, incluyendo bacterias, levadura, La tirosinasa (monofenol monooxigenasa EC
hongos, células y órganos de animales y 1.14.18.1) es una enzima que contiene cobre
plantas transgénicas. Actualmente su que participan en la síntesis de melanina. El
producción comercial se ha limitado a uso de oxígeno molecular, esta enzima cataliza

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la hidroxilación de L-tirosina a L- año), por las cantidades necesarias para


dihidroxifenilalanina (L-dopa) (actividad colmar la demanda mundial. En la industria
cresolasa), su posterior oxidación para biofarmacéutica, parece ser que un par de
dopacromo (actividad catecolasa), que a través miles de litros son los volúmenes más grandes
de una serie de reacciones de óxido-reducción a ser utilizados y el volumen de cultivo está
no enzimáticamente catalizadas se polimeriza normalmente limitado a la estabilidad de la
para formar melanina. En la forma silvestre clona o a los fenómenos de transferencias de
Escherichia coli no tiene el gen que codifica oxígeno y calor para mantener el cultivo en
para la tirosina y por lo tanto no puede condiciones óptimas. (Gamboa y Trujillo 2009).
sintetizar melanina. (Cabrera et al., 2005; Uran
y Cano 2008). Las técnicas de ingeniería La vitamina C es un derivado de una hexosa,
genética permiten el aislamiento de genes de sintetizada por las plantas a partir de la glucosa
cualquier organismo y su modificación para que y la galactosa. El ser humano y algunas
sean funcionales en otra especie. Siguiendo especies animales carecen de las enzimas
este esquema, ha sido posible generar cepas capaces de catalizar la conversión de la
de E. coli con la capacidad de sintetizar glucosa en vitamina C (ácido L-ascórbico), por
proteínas humanas de uso terapéutico. De la lo que requiere ser ingerida en la dieta. El 2,5-
misma manera, se ha logrado la transferencia a Diketo-D-Gluconato es un compuesto
E. coli de genes que codifican para enzimas y intermediario para la síntesis de vitamina C,
con esto modificar su metabolismo. Es así que se puede obtener por un proceso de
como se abre la posibilidad de dotar a esta transformación microbiana a partir de la
bacteria con la capacidad de sintetizar glucosa, las bacterias comprometidas en este
metabolitos que se encontrarían normalmente proceso como Pseudomonas oryzihabitans y
fuera de su repertorio natural. En el caso de los Pseudomonas cepacia son aisladas del suelo y
compuestos aromáticos, existen ya varios de las frutas en descomposición. Se ha
ejemplos de cómo se pueden extender las vías demostrado que estas bacterias
biosintéticas naturales para que este individualmente no tienen funcionalidad, es así
microorganismo pueda sintetizar nuevos como en el proceso de producción de la
compuestos. (Robledo et al., 2007; Martinez y vitamina las cepas se disponen en un cultivo
Gosset 2007; Urán y Cano, 2008; Sabido et al., mixto (Gutiérrez et al., 2009).
2009). Más recientemente, tirosinasas de
orígenes bacterianos se han reportado y Biotecnología alimentaria.
caracterizado bioquímicamente. Estos estudios Los microorganismos halófilos juegan un
proporcionan información útil sobre la importante papel en los procesos de
diversidad bioquímica en esta familia de fermentación que ocurren en presencia de sal;
enzimas y su potencial para la aplicación en la estos microorganismos catalizan la
industria. (Cabrera et al., 2005). fermentación y generan los compuestos
encargados de dar características de sabor,
Mientras algunas proteínas recombinantes consistencia y aroma a los productos
necesitan producirse en grandes cantidades, resultantes, adicionalmente los
como la insulina, de la que se planea una microorganismos halófilos producen
demanda de 16,000 kilogramos en 2012 la compuestos que pueden servir como control de
mayoría de biofarmacéuticos son producidos microorganismos no deseados. Estos
en bajas cantidades (algunos kilogramos por microorganismos han sido usados para la

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producción de suplementos alimenticios y El etanol anhidro o etanol carburante es un


colorantes para alimentos; una alternativa excelente combustible que, además, puede
promisoria para la producción de ácidos grasos usarse como oxigenante de combustibles
poliinsaturados de cadena larga, son las fósiles, o bien como sustituto de gasolina. Los
bacterias marinas, las cuales permiten combustibles fósiles tienen una disponibilidad
procesos de purificación convencionales, finita y, dado el extensivo uso que actualmente
rápidos rangos de producción y buena se hace de ellos, se agotarán en el presente
consistencia del producto y rendimiento. En el siglo. (Martínez y Gosset 2007). El etanol
caso de los colorantes, los β-carotenos son carburante se produce mediante tecnologías
usados en la industria de alimentos como biológicas a partir de material renovable, no es
colorantes naturales, como precursores de la contaminante como el petróleo, su uso no
vitamina A, como aditivos en cosméticos, incrementa la concentración neta de bióxido de
preparaciones multivitamínicas, y productos carbono en la atmósfera. Por tanto, el uso del
saludables. Se ha reportado que las bacterias etanol carburante no propicia el incremento de
halófilas extremas tienen un óptimo crecimiento temperatura ni el cambio climático en el
y un buen rendimiento en la producción de planeta. (Martínez y Gosset 2007; Peña y
carotenoides en presencia de 25% de NaCl Arango, 2008). Actualmente existen
(Castillo y Barragan, 2001). tecnologías consolidadas y bien desarrolladas
para producir etanol carburante. Dichas
La riboflavina es una vitamina hidrosoluble tecnologías utilizan como fuente de carbono a
ampliamente distribuida en el reino vegetal y la sacarosa proveniente de la caña de azúcar,
animal, habiendo sido obtenida por primera vez en Brasil, y a la glucosa proveniente del
a partir del suero de leche por Giorgy y almidón de maíz. En EE.UU. México no es
colaboradores en 1.933. La síntesis de autosuficiente en la producción de maíz, es
riboflavina por microorganismos puede ser más, se importan más de ocho millones de
dividida según el grado de acumulación de la toneladas al año de este grano para satisfacer
vitamina; así, se encuentran sobreproducciones las necesidades directas de alimentación de la
débiles, moderadas y fuertes, tal como la población, o indirectas a través de la engorda
presentan varias bacterias, algunas levaduras y de ganado para consumo humano. Entonces
hongos. Esta vitamina es de gran importancia esta materia prima no es viable para la
terapéutica y alimenticia, es utilizada para el producción de etanol carburante. Por su
consumo humano, la cual es producida abundancia y capacidad de renovación
comercialmente por síntesis química, los sustentable, las materias primas más viables
procesos fermentativos con el empleo de para la producción de biocombustibles resultan
microorganismos, originan la forma que tiene ser los azúcares presentes en los residuos
aplicación como suplemento en los piensos agroindustriales (la lignocelulosa o biomasa),
concentrados para la alimentación animal, este siendo su bajo o nulo costo otro factor que
es un proceso mucho más económico que la favorece su uso. Los residuos de la industria
síntesis química y no ha sido explotado a azucarera, y potencialmente cualquier residuo
cabalidad. (Lara et al., 2001). agroindustrial, son sustratos más económicos,
pero más complejos que la glucosa y la
Fermentación mediante la introducción de sacarosa, y pueden ser convertidos en
genes heterólogos (etanol carburante) productos útiles mediante procesos de
fermentación. (Martínez y Gosset 2007). La

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mayoría de los microorganismos en la hidrolizados del bagazo de caña de azúcar en


naturaleza utilizan glucosa para llevar a cabo etanol con rendimientos mayores a 90% del
sus actividades metabólicas. No obstante, la teórico, con concentraciones de etanol de 45
variedad de microorganismos que metabolizan g/L. Sorprendentemente, esta cepa en cultivos
pentosas y otras hexosas, diferentes a la anaerobios con glucosa o xilosa incrementa
glucosa, es restringida; más aún, no existen sustancialmente su velocidad específica de
microorganismos silvestres capaces de crecimiento, el flujo glicolítico y de consumo de
metabolizar eficientemente xilosa o arabinosa o azúcares. (Martínez y Gosset 2007).
mezclas de glucosa-xilosa o glucosa-celobiosa
en productos de fermentación. Los Bacterias productoras de plásticos
microorganismos más eficientes en la biodegradables.
producción de etanol, la levadura Algunas de las propiedades del plástico que lo
Saccharomyces cerevisiae y la bacteria ha hecho tan ampliamente consumido en la
Zymomonas mobilis, únicamente pueden usar actualidad son: la facilidad con que pueden ser
glucosa, sacarosa y fructosa para producir trabajados o moldeados, su impermeabilidad,
etanol, pero no tienen la capacidad de su baja densidad (pesan poco con relación al
metabolizar xilosa, arabinosa y celobiosa, o volumen), baja conductividad eléctrica,
mezclas de ellas. Mediante el uso de la IVM se resistencia a la corrosión y a la intemperie, su
pueden diseñar y desarrollar cepas de resistencia a diversos factores químicos y
bacterias y levaduras con el propósito de biológicos y, en buena medida, su bajo costo.
metabolizar y canalizar el flujo de esqueletos La palabra plástico se refiere a ciertos tipos de
de carbono hacia la formación de etanol a partir materiales sintéticos obtenidos mediante
de pentosas como xilosa y arabinosa. (Martínez fenómenos de polimerización o multiplicación
y Gosset 2007; Peña y Arango, 2008). artificial de los átomos de carbono en largas
cadenas moleculares de compuestos
Desde el punto de vista técnico e industrial, las orgánicos. En general, son derivados del
cepas más exitosas han sido las construidas petróleo, aunque algunos se pueden obtener a
por IVM a partir de E. coli mediante la partir de otras sustancias naturales. Sin
introducción de vías foráneas para producir embargo, aún con propiedades, favorables
etanol. Entre las estrategias utilizadas están: la desde el punto de vista de las aplicaciones, se
integración a cromosoma de los genes que han presentado inconvenientes para el manejo
codifican para la piruvato descarboxilasa (pdc) de los desechos que se generan con el uso
y alcohol deshidrogenasa (adh) de Zymomonas creciente de este material. La degradación de
mobilis, la interrupción de vías que compiten los plásticos sintéticos es muy lenta. Como
con el piruvato por la producción de etanol y la ejemplo, la descomposición de productos
construcción de cepas que eliminen el orgánicos tarda 3 ó 4 semanas, la de telas de
fenómeno de represión catabólica y puedan algodón 5 meses, mientras que la del plástico
metabolizar pentosas y hexosas puede tardar 500 años. Incluso su
simultáneamente. Una de los microorganismos “degradación” simplemente genera
más exitosos que pretende ser utilizado a partículas de plástico más pequeñas que, a
escala industrial para producir etanol a partir de pesar de ya no ser evidentes, se acumulan en
hidrolizados de residuos agroindustriales es la los ecosistemas. (Segura et al., 2011).
cepa E. coli KO11. Esta cepa es capaz de
convertir todos los azúcares presentes en los

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La problemática generada por el uso que también los hacen interesantes. Una de
indiscriminado de plásticos sintéticos y su ellas es que no causan efectos tóxicos, son
permanencia en el ambiente ha estimulado la biocompatibles. Esto permite utilizarlos en la
investigación para desarrollar nuevos producción de materiales para aplicaciones
materiales y métodos de producción que médicas, como por ejemplo en la generación
permitan generar plásticos que presenten las de implantes, que con el tiempo pueden ser
mismas propiedades pero que tengan un eliminados del cuerpo espontáneamente por
periodo de degradación más corto. Esto se ha degradación, o implantes con fármacos
logrado con la creación de plásticos con encapsulados para su liberación controlada, o
componentes completamente degradables bien en la obtención de telas hechas con fibras
naturalmente, entre los que se encuentran los de PHA para el tratamiento de heridas.
ácidos poliláctidos, los poliésteres alifáticos, los Adicionalmente se han investigado aplicaciones
polisacáridos y copolímeros derivados de ellos, de los PHA en un área nueva de la medicina, la
y los polihidroxialcanoatos (PHA). Los PHA son ingeniería de tejidos. La idea es generar
polímeros naturales producidos por bacterias. tejidos, y potencialmente órganos, en cultivos
Son poliésteres conformados por unidades o sumergidos de células troncales totipotenciales
monómeros de hidroxiacilos polimerizados en que crecerían sobre estructuras de PHA
forma lineal. Las bacterias que los producen los preformados que funcionarían como
utilizan como reserva de nutrientes. (Segura et “moldes”al ser recubiertos con factores de
al., 2011). crecimiento y
morfógenos. En la agricultura los PHA también
Desde que en 1926 se descubrió que la pueden tener aplicaciones. Un ejemplo sería el
bacteria Bacillus megaterium produce el PHA de los dispositivos en los que la degradación
denominado, se han reportado más de 300 natural de los PHA permite la liberación de
bacterias capaces de producir PHA. Las compuestos químicos de manera dosificada,
bacterias productoras los usan como material para aplicación de fertilizantes, fungicidas,
de reserva que puede ser utilizado herbicidas, etc. (Segura et al., 2011).
posteriormente, bajo condiciones de limitación
de nutrientes, para mantener su metabolismo.
Desde 1982 se ha creado plástico a partir de REPLICACIÓN DE LOS PLÁSMIDOS
PHA y se ha comercializado hasta la fecha BACTERIANOS Y EL PROCESO DE
siendo usado para la fabricación de botellas, PRODUCCIÓN DE PROTEÍNAS
fibras, rastrillos desechables y varios productos RECOMBINANTES
de empaquetamiento de alimentos, de aceite
para motores, de shampoo y cosméticos cuyo Ingeniería metabólica se denomina
principal atractivo es el de ser ambientalmente generalmente como la alteración específica y
mas amigables. (Segura et al., 2011). deliberada de las vías metabólicas que se
encuentra en un organismo con el fin de
La mayor parte de las investigaciones sobre entender mejor y utilizar vías celulares para la
PHA se ha hecho con la intención de transformación química, la transducción de
introducirlos en el mercado de los plásticos energía, y el montaje supramolecular. Este
industriales de gran demanda. Sin embargo, los campo multidisciplinario dibuja principios de la
PHA, además de ser biodegradables y ingeniería química, ciencias computacionales,
renovables, tienen características adicionales bioquímica y la biología molecular. En esencia,

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la ingeniería metabólica es la aplicación de desde unas cuantas proteínas hasta cientos de


principios de ingeniería de diseño y análisis de ellas. (Loeza et al., 2004). Éstos, portan
las rutas metabólicas con el fin de lograr un información genética para muchas funciones
objetivo particular. (Yang et al., 1998). que no son esenciales para la célula en
condiciones normales de crecimiento. (Loeza et
A partir del desarrollo de tecnologías como la al., 2004; Gamboa y Trujillo 2009). Los
del DNA recombinante ha sido posible la plásmidos varían ampliamente en tamaño,
generación de microorganismos con la desde miles a cientos de miles de pares de
capacidad de sobreproducir compuestos de bases (un tamaño comparable al cromosoma
interés industrial. La bacteria Escherichia coli bacteriano) y son, con mayor frecuencia,
ha sido utilizado en procesos biotecnológicos, moléculas circulares de ADN de doble cadena.
como cepa hospedero para la expresión de (Loeza et al., 2004). En términos bioquímicos la
genes propios, así como de otras especies composición y estructura de los ácidos
(heterólogos) con el objetivo de producir nucleicos bacterianos, es la misma que para
proteínas y metabolitos específicos. (Yang et cualquier célula. Conviene recordar
al., 1998; Sabido et al., 2011). Las estrategias a brevemente, que los ácidos nucleicos son
considerar para incrementar la producción de macromoléculas compuestas de nucleótidos
un metabolito de interés en el contexto de la unidos en forma covalente por medio de
IVM son: 1° incremento de la disponibilidad de enlaces fosfodiester entre los carbonos de las
la fuente de carbono utilizada como sustrato posiciones 3´ y 5´ de dos residuos de azúcares
para la obtención de precursores utilizados adyacentes. Esta estructura forma un esqueleto
para la biosíntesis de productos de interés; 2° de azúcares y fosfatos constante en toda la
incremento en la disponibilidad de los macromolécula. (Gamboa y Trujillo 2009). La
intermediarios obtenidos del catabolismo de la transferencia de la información genética
fuente de carbono, a través del metabolismo contenida en el plásmido de una bacteria
central de carbono; 3° mejoramiento de la donadora a una receptora se conoce con el
reacción que cataliza la canalización de los nombre de conjugación. Este proceso requiere
intermediarios del metabolismo central de de la expresión de genes y de la presencia de
carbono (MCC), a la vía de interés; 4° regiones en el ADN del plásmido necesarios
eliminación de los mecanismos de control para su movilización. El plásmido se moviliza a
transcripcional y alostérico de la vía; 5° través de un puente de conjugación entre las
identificación y eliminación de reacciones células. (Loeza et al., 2004).
limitantes de la vía; y 6° prevención de la
pérdida de carbono hacia otras vías. (Escalante Desde los puntos de vista básico y aplicado, los
et al., 2001). plásmidos han servido como herramientas
importantes en estudios de Biología Molecular
Muchas bacterias poseen además ADN y Biotecnología. En este sentido, la mayoría de
extracromosómico, también circular y cerrado, los plásmidos naturales no son vectores de
denominado ADN plasmídico. (Gamboa y clonación o de expresión convenientes. Sin
Trujillo 2009). Los plásmidos son elementos embargo, pueden ser modificados para su uso
genéticos extracromosómicos que se han como tales. Para lograr el diseño y
encontrado esencialmente en todos los tipos de construcción de vectores de clonación, es
bacterias estudiadas hasta la fecha. necesario conocer las características o factores
Dependiendo de su tamaño pueden codificar moleculares que les permiten a estos

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plásmidos colonizar y mantenerse en diferentes Escherichia coli (E. coli) es ampliamente


hospederos;de ahí la importancia de estudiar utilizada en la industria biotecnológica para la
los mecanismos de replicación. (Loeza et al., producción de proteínas recombinantes con
2004). fines diagnósticos, terapéuticos o vacúnales,
por procedimientos relativamente baratos, ya
El proceso general de producción de proteínas que ha sido muy bien caracterizada desde el
recombinantes comienza con la selección e punto de vista genético y fisiológico. Entre las
identificación del gen responsable de la ventajas que este microorganismo brinda como
producción de la proteína de interés. Después hospedero están: mayor velocidad específica
de la identificación y selección, se deben de crecimiento que las levaduras y células de
colocar en plásmidos e insertarlos dentro del mamíferos; fácil manipulación genética, no
hospedero que puede ser una bacteria, posee requerimientos costosos asociados a
levadura o célula animal. (Yang et al., 1998; medios de cultivo o equipamiento a diferencia
Gamboa y Trujillo 2009). Una vez expresado el de las células de organismos superiores;
gen de interés en la célula, la proteína existencia de gran variedad de vectores de
resultante puede proveer al hospedero de expresión estables, y ser un microorganismo
nuevas capacidades metabólicas, como son la aprobado por las entidades reguladoras para
habilidad de producir nuevos metabolitos o bien su utilización como hospedero en la producción
sobreproducir compuestos nativos. (Yang et al., de biofármacos. Entre los parámetros más
1998; Martinez y Gosset 2007; Sabido et al., importantes en la producción exitosa de
2011). proteínas recombinantes en E. coli se
encuentran: la eficiencia transcripcional y
A pesar de la versatilidad y utilidad de los traduccional, la estabilidad del vector de
plásmidos como vectores de clonación, es expresión y de los ácidos ribonucleicos (ARN)
sabido que la presencia de múltiples copias y la transcriptos, la estabilidad de las moléculas
alta expresión del DNA que contienen, ante el ambiente proteolítico del hospedero y la
representa una “carga metabólica” para el localización y plegamiento de la proteína.
organismo hospedero, ocasionando También es necesario hacer un estudio con
frecuentemente efectos adversos en su diferentes cepas del organismo hospedero, con
metabolismo, como lo es una disminución en la vistas a seleccionar la más adecuada para la
tasa específica de crecimiento (μ) de la expresión de la proteína recombinante
bacteria. Sin embargo, si el interés es obtener deseada, ya que estudios muestran que esta
una gran cantidad de una proteína en puede variar al usar una cepa determinada u
particular, entonces resulta conveniente el uso otra. (García et al., 2013).
de vectores de expresión en multicopia.
(Martinez y Gosset 2007; Sabido et al., 2011). CONCLUSIONES

Biotecnología y Escherichia coli Los microorganismos presentan un gran


La expresión de proteínas recombinantes se ha potencial de aplicación en diferentes campos
favorecido con el uso de Escherichia coli de la biotecnología, el uso de microorganismos
debido a su relativo bajo costo, alta densidad para la degradación de contaminantes es un
de cultivo, su fácil manipulación genética y a campo de investigación en desarrollo. El uso de
las diversas herramientas biotecnológicas microorganismo para la obtención de
disponibles que son compatibles. La bacteria metabolitos o enzimas presenta ventajas

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biotecnológicas debido a que las condiciones the encoded tyrosinase. elsevier inc. all rights
extremas requeridas para su crecimiento reserved. doi: 10.1016.
impiden los problemas de contaminación
inherentes a los procesos fermentativos. 2. CASTILLO L, BARRAGAN B. 2001. Aplicaciones
biotecnologicas de microorganismos halófitos.
Sistemas ambientales vol. 4 no 2, p 45-54.
Hay que destacar que aunque la secuencia de
los genomas ya es un conocimiento finito, aún 3. CÓRDOBA H, ALGECIRA N, POUTOU R,
sigue siendo incalculable lo que desconocemos BARRERA L. 2003. Proteínas humanas
sobre la organización y función de todos los recombinantes, estrategias de fermentación.
elementos contenidos en éstos, incluyendo los Revista Colombiana de Bioteconología, Volúmen
5 (2).
genes, diferentes secuencias codificantes y no
codificantes; sus interacciones y su regulación 4. ESCALANTE A, VALDIVIA A, GOSSET G,
transcripcional; el funcionamiento de los BOLÍVAR F. 2001. Ingeniería de vías
productos codificantes; los mecanismos metabólicas en escherichia coli pts para la
traduccionales y postraduccionales que los obtención de cepas sobreproductoras de
regulan; y el diálogo que se establece entre shikimato. Instituto de biotecnología universidad
nacional autónoma de méxico. Issn-0188-137.
éstos y sus reguladores para coordinar y
mantener la homeostasis de las funciones
5. GAMBOA A, TRUJILLO M. 2009. un
celulares en los seres vivos. acercamiento a la producción de proteínas
recombinantes terapéuticas de uso humano. El
El mejoramiento genético de las cepas, los residente, vol. 4 número 3: 87-91.
vectores de expresión y los métodos de cultivo
y purificación de estas proteínas utilizadas en 6. GARCÍA B, MONTES M, RAMOS E, ARIZA A,
las diferentes investigaciones, se han ido PÉREZ J, GÓMEZ O, CALVA G. 2010.
perfeccionando a través de los años. Sin Clonación del cdna del gen de la insulina
embargo, aún existen retos que deben humana en raíces aéreas de brassica oleracea
var italica (brócoli). Revista cenic. Ciencias
afrontarse, entre los que se encuentran:
biológicas, vol. 41, p. 1-9.
superar los niveles de expresión de proteínas
alcanzados; realizar un adecuado estudio del 7. GARCÍA J, SANTANA Z, ZUMALACÁRREGUIL,
espacio de diseño durante la etapa de QUINTANA M, GONZÁLEZ D, FURRAZOLA G,
desarrollo de los procesos de fermentación y CRUZ O. 2013. Estrategias de obtención de
recobrado, para establecer los parámetros que proteínas recombinantes en Escherichia coli.
influyen significativamente en su eficiencia; Finlay ediciones, VacciMonitor; 22(2) p 30-39.
realizar una adecuada selección del medio de
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