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Revisão sobre ácidos

nucleicos, seu e síntese


de proteínas

Profa. Leila Larisa Medeiros Marques


Fluxo da
informação
genética
Estrutura dos ácidos nucléicos
Estrutura geral dos nucleotídeos
Estrutura geral dos nucleotídeos
lllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll
lllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll
lllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll
llllllllllll
Nucleotídeos: ligações fosfodiéster
Nucleotídeos: pares de base
CH3
2.8 Å
O C
H H
H C C
N
Adenina 3.0 Å Timina
C N N
N H
C N C C1’
HC
O As pontes de
C C
N N H hidrogênio entre
C1’ 11.1 Å as bases
H H permitem uma
Citosina
2.9 Å
associação de
N C H
H C C duas fitas
O
Guanina 3.0 Å complementares
C N N
N H
C C
N C1’
HC
O
C C H
N N N 2.9 Å

C1’
H

10.8 Å
DNA: Modelo tridimensional
5’ 3’

Sulco
menor

Sulco
maior

5’ 3’
DNA supertorcido
DNA supertorcido
RNA: fita simples 3’

Conformação helicoidal à
direita

Interações de empilhamento de
bases

Substituição de timina por uracila e a pentose


é a ribose

5’
RNA
RNA transportador:estrutura
em folha de trevo
Sítio do
aminoácido

Braço TC

Braço D

Anticódom
Replicação do DNA
DNA e genes
Replicação
semiconservativa: cada fita
preexistente funciona
como molde para síntese
3’
da fita complementar
5’
Nova Nova

Replicação:
1 - Separação da 2 fitas

2 - Síntese de uma fita complementar


para cada uma, unindo os nucleotídeos
complementares (G com C e A com T)

Fita Fitas Fita


parental filhas parental
Modelo de replicação das fitas
complementares de DNA
Replicação do DNA

dupla hélice = “zíper”


que se abre devido à
ação da enzima
helicase (quebra
pontes de H)
Replicação do DNA
Replicação do DNA

Velocidade estimada em humanos: 2.000 pb/min.


Velocidade estimada em bactérias: 50.000 pb/min.
Como as DNA polimerases só sintetizam novas fitas na direção
5’- 3’ e as cadeias do DNA são antiparalelas, a síntese de uma
das fitas é descontínua

Fita contínua ou
líder: direção 5’-
3’

Fita descontínua
ou atrasada: Gera
muitos fragmentos
fragmentos são de Okasaki
sintetizados na
direção 5’- 3’
Proteínas presentes na forquilha de Replicação de E.coli

SSB Liga a fita simples de DNA


DnaB (helicase) Desenrola o DNA
Primase (DnaG) Sintetiza os primers de RNA
DNA Polimerase III Sintese da fita nova
DNA Polimerase I Preenche as lacunas e excisa os primers
DNA Ligase Liga os fragmentos
DNA girase Superenrolamento
(topoisomerase)
Origem de replicação do DNA
Origem de replicação do DNA (eucariontes)
Origem de replicação do DNA
Transcrição do DNA

Processo pelo qual uma molécula de RNA é


sintetizada a partir da informação contida
na seqüência de nucleotídeos de uma
molécula de DNA fita dupla.
Dogma Central da Biologia
Como o DNA se relaciona
com as proteínas?

• É feita uma cópia


(negativa) de um trecho
de DNA (transcrição)
• mRNA é traduzido em
proteínas (tradução)
A estrutura de um gene de procarioto
São segmentos úteis de DNA (ou RNA – em alguns
organismos). Toda seqüência de nucleotídeos
necessária para a síntese de uma cadeia polipeptídica
ou de RNA funcionais.
A estrutura de um gene de eucarioto m
gene de eucarioto
Transcrição do DNA
• Apenas uma das fitas do DNA é utilizada como molde, portanto, a
molécula de RNA sintetizada é complementar à fita de DNA que lhe
deu origem e idêntica à outra fita de DNA, sendo as timinas
substituídas por uracilas

• Em 1960, Hurwitz, Stevens e Weiss descobriram,


independentemente, uma enzima capaz de sintetizar RNA na
presença de DNA fita dupla e dos nucleotídeos A, U, C, G.

• Esta enzima foi denominada RNA polimerase.

Diferentemente da DNA polimerase, a RNA


polimerase não necessita de um iniciador
(primer) para processar a síntese da nova fita
TRANSCRIÇÃO
• 1.INÍCIO
• Reconhecimento de seqüências
específicas no DNA

• 2. ALONGAMENTO
• Incorporação dos ribonucleotídeos

• 3. TERMINAÇÃO
• Seqüências no DNA são reconhecidas e
a síntese é interrompida
Processamento do RNAm
Tradução

Como as 4 bases nitrogenadas do


RNA podem determinar a
sequência de mais de 20 tipos de
aminoácidos em uma cadeia
polipeptídica?
Energia e velocidade da síntese de
proteínas
A síntese de proteínas pode ser responsável por
até 90% da energia química usada por uma célula
para todas as reações biossintetizantes. As
proteínas são sintetizadas em velocidades
extremamente altas. Uma cadeia polipeptídica
completa de 100 resíduos é sintetizada numa E.
coli, a 37ºC em cerca de 5 s.
O código é
O código genético "degenerado": três
aminoácidos, Arg,
Leu, Ser, tem seis
códons; outros tem 3
ou 4 códons; apenas
Met tem um único
códon

AUG é
também sinal
de iniciação

Um códon é uma
sequência de três
nucleotídeos que
corresponde a um
determinado aminoácido
Genes sobrepostos – raros.
Encontrados em bactérias e
bateriófagos O gene B está
totalmente contido no A
O gene E está
totalmente contido no D
O final dos genes D e E
contém o sinal de
iniciação para o gen J!

Genes sobrepostos
podem ser considerados
uma economia
necessária em
organismos que têm que
fazer máximo uso dos
seus DNAs pequenos
Modelo tridimensional do
ribossomo de E. coli,
deduzido
matematicamente por
combinação de imagens
bidimensionais ao
microscópio eletrônico

A subunidade menor (acima)


combina-se com a
subunidade maior para
formar o ribossomo
completo (em baixo)
Costuma-se dividir a síntese de proteínas em três etapas:
iniciação, elongação e terminação
Em procariotos o sinal de início é AUG (ou
GUG), precedido de várias bases que pareiam
com o rRNA 16S
Pareamento de bases entre a região rica em
purinas (azul) e a terminação 3‘ do rRNA 16S
(vermelho)

O códon AUG define o início da proteína; este é o


códon da Met, mas em procariotos o início
sempre se dá com um derivado da Met a formil-
Met; existe um tRNA específico para fMet e outro
para Met
Vários ribossomos podem traduzir simultaneamente
uma molécula de mRNA

Os ribossomos movem-se ao longo


de um mRNA na direção 5'3'

O conjunto é conhecido como


polissomo ou polirribossomo
Cada ribossomo funciona
independentemente dos demais
Tradução
Tradução:
aa livre
Gly
Ribossomo Phe His
Glu
Proteína Asp
Met
Ala Cys
tRNA
5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA

Molécula de mRNA
codon

Direção do avanço do ribossomo


Gly
Phe His
Glu
Asp
Met
Ala Cys

5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA
Gly
Phe His
Glu
Met
Ala
Cys Asp

5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA
His
Gly
Met Phe
Ala
Cys
Asp Glu

5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA
Ile
Met His
Ala Gly
Cys
Asp
Glu
Phe

5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA
Lys
Met
Ala Ile
Cys His
Asp
Glu
Phe
Gly

5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA
Met
Ala Lys
Cys
Asp Ile
Glu
Phe
Gly
His

5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA
Met
Ala
Cys Lys
Asp
Glu
Phe
Gly
His
Ile

5’ 3’
AU G G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUA
Met
Ala
Cys
Asp Leu
Glu
Phe
Gly
His
Ile
Lys

5’ 3’
G CAU G C GAC GAAU U C G GACACAUAAAA
Met
Ala
Cys
Asp Met
Glu
Phe
Gly
His
Ile
Lys Leu

5’ 3’
U G C GAC GAAU U C G GACACAUAAAAU UA
Met
Ala
Cys
Asp
Glu Asn
Phe
Gly
His
Ile
Lys
Leu Met

5’ 3’
GAC GAAU U C G GACACAUAAAAU UAAU G
Met Ala
Cys
Asp
Glu
Phe Pro
Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met Asn

5’ 3’
GAAU U C G GACACAUAAAAU UAAU GAAC
Met Ala Cys
Asp
Glu
Phe
Gly Gln
His
Ile
Lys
Leu
Met
Asn Pro

5’ 3’
U U C G GACACAUAAAAU UAAU GAAC C CA
Met Ala Cys Asp
Glu
Phe
Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met
Asn
Pro Gln

5’ 3’
G GACACAUAAAAU UAAU GAAC C CACAA
Met Ala Cys Asp Glu
Phe
Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met
Asn
Pro
Gln

5’ STOP 3’

CACAUAAAAU UAAU GAAC C CACAAUAA


Ala Cys Asp Glu Phe
Met Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met
Asn
Pro
Gln

5’ STOP 3’
AUAAAAU UAAU GAAC C CACAAUAAAAA
Ala Cys Asp Glu Phe
Met Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met
Asn
Pro
Gln

5’ STOP 3’
AUAAAAU UAAU GAAC C CACAAUAATAC
Ala Cys Asp Glu Phe
Met Gly
His
Ile
Gln Lys
Pro Leu
Asn Met

5’ 3’
AUAAAAU UAAU GAAC C CACAAUAATAC
Propriedades do DNA
Elementos genéticos extracromossomais

• Transposons: também chamados genes saltadores, são


pedaços de DNA capazes de se movimentar pelo genoma
(plasmídio-plasmídio ou plasmídeo-cromossomo). Não se
auto-duplicam.

• Integrons: segmentos de DNA fita dupla, menores que os


transposons, não se auto-duplicam, também são elementos
genéticos móveis, e estão relacionados a captura e
expressão de genes de resistência a drogas antimicrobianas.
Variabilidade Genética em Bactérias
As bactérias podem apresentar variações que conduzem à formação de clones
com propriedades distintas do clone “selvagem” original. A variação se dá
através de mutação ou recombinação.
MUTAÇÃO => alteração na sequência de bases nitrogenadas do DNA, geralmente
resultante de deleção, inserção ou substituição de um ou mais nucleotídeos; esta
alteração genética pode modificar o produto (proteína).
As mutações podem ser neutras, desvantajosas ou benéficas.

RECOMBINAÇÃO => processo de variabilidade genética que envolve transferência


de material genético entre duas células.
DNA: informação genética
Referências
• ALBERTS, B.; BRAY, D.; LEWIS, J.; RAFF, M.; ROBERTS, K.; WALSON, J.D. Biologia
Molecular da Célula. Porto Alegre: Artes Médicas, 1997.

• De ROBERTIS, E.D.P.; De ROBERTIS Jr.; E.M.F. Bases da Biologia Celular e


Molecular. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan. 1993. 97p.

• LEWIN, B. Genes V. Oxford. Nova York:: Oxford. University Press, 1994. 1272p.

• LEHNINGER, A. L.; NELSON, D.L.; COX, M.M. Princípios de bioquímica. São Paulo:
Sarvier, 1995.

• GARDNER, E.J.; SIMMONS, M.J.; SNUSTAD, D.P. Principles of genetics. 8a ed. New
York: J. Wiley & Sons. 1991. 119p.
Referências
Vídeos:
• Projeto genoma humano:
http://www.youtube.com/watch?v=Bu6rbC2cnTM&feature=related

• Empacotamento e replicação do DNA:


https://www.youtube.com/watch?v=OjPcT1uUZiE

• Replicação:
http://www.youtube.com/watch?v=qF-BGYz7wNc

• Transcrição do DNA:
http://www.youtube.com/watch?v=nNjbYfhfgIo

• Tradução:
http://www.youtube.com/watch?v=DcCnmPeutP4

Link com animações, livros online e etc: http://www.biocistron.blogspot.com/

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