ARN de transferencia, su estructura y función

Definición: El ARN de transferencia o ARNt es un elemento clave en la traducción de la

información que porta el ARN mensajero a una secuencia de proteínas. Por un lado se une
de forma específica a un aminoácido concreto y por otro reconoce un triplete de nucleótidos
que codifica ese aminoácido en el ARN mensajero. En el proceso de síntesis de proteínas el
ARNt es un transductor de información capaz de pasar de nucleótidos a aminoácidos y que
por tanto traduce ARNm a proteína.

Es una molécula con estructura consistente en una serie de horquillas y bucles formando
brazos, en forma de L. Hay, al menos, un ARNt para cada aminoácido. Se sintetiza en el
nucleoplasma por la ARN polimerasa III. Sufre maduración postranscipcional.

El ARN de transferencia o ARNt es el ARN que funciona como molécula transductora de

ARN a proteína haciendo posible que se traduzca la información de la secuencia del ARNm
a una secuencia de aminoácidos.

Hay al menos un ARNt para cada aminoácido. Cada ARNt por una parte reconoce y se une
a su aminoácido, lo activa y lo transporta al ribosoma, y por otra reconoce un triplete de
nucleótidos que codifica ese aminoácido en el ARNm. El ARNt hace posible que en cada
posición se una el aminoácido correcto a la cadena naciente de proteína durante la
traducción.

El código genético es degenerado y algunos aminoácidos están codificados por más de un

codón. Con frecuencia los codones que codifican un mismo aminoácido comparten las 2
primeras bases del codón. En estos casos un mismo ARNt puede ser capaz de reconocer a
los diferentes codones que codifican su aminoácido basando su reconocimento en las 2
primeras bases compartidas. En otros casos es necesario que haya un ARNt diferente para
reconocer cada codón.

El ARNt se sintetiza en el nucleoplasma por la ARN polimerasa III. Sufre distintos

procesos de maduración de ARN: eliminación de nucleótidos en 5' por la ribonucleasa P,
eliminación de nucleótidos en 3' por la RNasa D y adición de la secuencia “CCA” en dicho
extremo, corte y eliminación de intrones en la zona del anticodón, y modificaciones de
bases nitrogenadas (metilación, isomerización, reducción).

El ARNt presenta una estructura terciaria en forma de L, con cuatro "brazos" en forma de
trébol en su estructura secundaria. Son horquillas y bucles formados gracias al
emparejamiento entre bases. Uno de los extremos de la “L” es el aceptor del aminoácido
que contiene una secuencia CCA imprescindible para la unión del aminoácido. El otro
extremo de la “L” contiene el anticodón con los tres nucleótidos complementarios a los del
codón que codifica su aminoácido. El correcto plegamiento del ARNt es indispensable para
llevar a cabo sus funciones. La unión del aminoácido al ARNt se produce gracias a las
enzimas aminoacil-ARNt-sintetasas. Existe una aminoacil-ARNt-sintetasa para cada
aminoácido. Estas enzimas son las verdaderas protagonistas de la traducción ya que
colocan el aminoácido correcto en el ARN de transferencia con el anticodón específico para
ese aminoácido. Estas enzimas son en realidad las que cambian el código de nucleótidos
(anticodón) a código de aminoácidos y por tanto son los elementos clave de la traducción.

En relación a las aminoacil-ARNt-sintetasas hay un conjunto de enfermedades autoinmunes

englobadas en el síndrome antisintetasa. El síndrome antisintetasa (SAS) es un trastorno
infrecuente que se caracteriza por la presencia de anticuerpos antisintetasa (ACAS) que son
anticuerpos contra las aminoacil-ARNt-sintetasas. El más común es el autoanticuerpo
contra la histidil-ARNt-sintetasa.

El antibiótico puromicina es un análogo del aminoacil-ARNt. Se une al sitio A del

ribosoma e impide la unión del aminoacil-ARNt. El resultado es una terminación prematura
de la traducción.

RNA de transferencia, tRNA

Es la molécula encargada de unirse a los aminoácidos para su entrada en la

biosíntesis de proteína. Se trata de una molécula pequeña, que consta de 75-90
nucleótidos, y es la encargada de asociar al aminoácido con su codificación
genética sobre la superficie del ribosoma. Vamos a ver la estructura del RNA de
transferencia, serina (tRNASer) .

La molécula que tenemos en pantalla es el tRNA del aminoácido serina en la

levadura Saccharomyces cerevisiae. Hemos de tener en cuenta que, debido a la
degeneración del Código Genético, pueden existir en la célula varios tRNAs
distintos para un mismo aminoácido (tRNAs isoaceptores). Es una molécula
pequeña, de 85 nucleótidos, cuya estructura tridimensional asemeja a una L.
Téngase en cuenta que esta forma resulta del plegamiento en el espacio del
modelo clásico en "hoja de trébol". Las dos ramas de la L son las siguientes:

- Una, el brazo aceptor, así llamado por contener el lugar de unión del
aminoácido (que es el término 3'):

- Otra, el brazo anticodon, que contiene el anticodon, es decir, la secuencia de

nucleótidos complementaria al código genético del aminoácido en cuestión (en
este caso serina):

En el extremo 5', el tRNA presenta invariablemente un residuo de G fosforilado en

5':

En el extremo 3', al que se une el aminoácido mediante un enlace éster al -OH en

2', el tRNA presenta invariablemente la secuencia CCA:
Se trata de un solo polinucleótido: que podemos colorear mediante el patrón
group, al igual que las proteínas: de manera que el término 5' aparece coloreado
en azul y el 3' en rojo, pasando por toda la gama intermedia de colores.

Aproximadamente el 50 % de esta estructura está formando una doble hélice a

través de autocomplementaridad en la misma molécula. Determinadas porciones
no están en doble hélice, sino que forman los llamados lazos o bucles, que tienen
una serie de características comunes en todos los tRNAs. En sentido 5' a 3',
serían:

- El lazo DHU, así llamado por tener varios restos de la base anómala
dihidrouracilo:

- El lazo anticodon, que contiene la secuencia complementaria al código genético

del aminoácido: En todos los tRNA hay una cierta regularidad en la secuencia de
este lazo: Py-Py-X-X-X-*A-Y, siendo Py una pirimidina, X-X-X el anticodon
propiamente dicho, *A una adenina modificada (en este caso isoprenilada) e Y una
base cualquiera. El anticodon en este caso es IGA, complementario al codon de
serina UCC (téngase en cuenta que la inosina se comporta como guanina a
efectos de apareamiento de bases, y que el sentido de lectura es contrario en
codon y anticodon)

- El lazo variable, diferente entre los distintos tRNAs, que en este caso
comprende nueve bases:

- El lazo T-Psi-C, así llamado por contener invariablemente esta secuencia, es

decir: ribotimidina-pseudouridina-citidina:

Otra característica del tRNA es la abundancia de bases anómalas. Derivan de la

metilación de las bases normales o bien otras modificaciones. Asimismo, como ya
hemos visto, en el tRNA hay (invariablemente) ribotimidina y en este caso, inosina.
Algunas bases modificadas que podemos ver en esta molécula son las siguientes:

- 4-Acetil citidina:

- Dihidrouridina:

- 2'-O-Metil guanosina:

- N(2)-Dimetil guanosina:

- Pseudouridina: La pseudouridina es un nucleósido anómalo; el enlace

glicosídico entre base y pentosa se establece entre la pentosa y el carbono 5 de la
base (y no con el N1, que sería lo normal)

ARN de transferencia
Todos los ARN de transferencia presentan una estructura tridimensional similar, pues
realizan la misma función.

Los ARNt constituyen una familia de especies moleculares cuya función es la de

transportar los aminoácidos hacia los ribosomas durante la síntesis de proteínas, por lo que
deben existir tantos ARNt como aminoácidos diferentes contengan las proteínas; todos
ellos presentan regularidades estructurales que permiten generalizar una estructura
relacionada con su función.

Estructura primaria. Los ARNt son polinucleótidos peque?os que contienen de 60 a 95

nucleótidos, aunque la mayoría tiene 76. Lo más sobresaliente en su composición de bases
es la presencia de numerosas bases modificadas que llegan a constituir hasta el 20 % de la
molécula. La razón de esta elevada proporción se desconoce, pero pudiera de alguna
manera contribuir a la formación de estructuras tridimensionales, unas veces en función
favorable y otras impidiendo la formación de interacciones entre las bases.

El estudio de la secuencia de bases de ARNt fue realizado por primera vez en 1965 por
Robert Holley, en el ARNt de la alanina procedente de levaduras. Para este trabajo Holley
tuvo que vencer numerosas dificultades técnicas, pero a partir de él se ha desarrollado una
tecnología que permite realizar ese trabajo en pocos días, lo cual ha hecho que ya se
conozca la secuencia de bases de más de 300 ARNt de diferentes especies.

El estudio comparativo de estas secuencias ha permitido llegar a conclusiones importantes.

En todos ellos existen 13 bases invariantes, es decir, todos tienen la misma base en
posiciones equivalentes y hay ocho bases semiinvariantes, o sea, en posiciones equivalentes
siempre hay una purina o una pirimidina. En el extremo 3' siempre aparece el trío CCA.

Estructura secundaria. Holley estableció la estructura secundaria del ARNt de la alanina

y observó que el grado máximo de apareamiento se lograba cuando la cadena
polinucleotídica se representaba en forma de una hoja de trébol (Fig. 11.19).

También supuso que si todos los ARNt cumplían la misma función, debían poseer
estructuras muy similares, lo cual ha sido confirmado posteriormente con el estudio de
numerosos ARNt.
 Fig. 11.19. Estructura generalizada de los ARNt. La estructura en hoja de trébol de los
ARNt. Las zonas apareadas se presentan con el número de pares típicos de cada asa. Las
bases conservadas se presentan con sus iniciales. Las posiciones semiconservadas se
representan por R para las purinas y Y para las pirimidinas; y se representa la seudo-
uridina. Las bases del anticodon aparecen sombreadas.

Según el modelo, la cadena se pliega formando cuatro sectores de apareamiento de bases

llamados tallos, tres de esos tallos terminan en zonas ensanchadas no apareadas, llamadas
asas. Un tallo y su asa correspondiente forman un brazo; cada brazo tiene una disposición y
longitud características. Existe un quinto brazo que es variable en su longitud y
composición, este hace que el número de nucleótidos en los distintos ARNt varíe de 60 a
95.

Una estructura generalizada de los ARNt debe contener los elementos siguientes, derivados
del análisis comparativo de las moléculas estudiadas:

1. El extremo 5' contiene un grupo fosfato y el extremo 3' termina con la secuencia
CCA que no está apareada.
2. Las secuencias inmediatas a los extremos forman un tallo que incluye 7 pb, entre
ellos el G-U. Este es el tallo aminoacídico o aceptor.
 3. Existen tres brazos constantes que, siguiendo la molécula en dirección 5' ? 3', son
los siguientes: el brazo D, formado por un tallo de 4 o 5 pb y un asa con
dihidrouridina; el brazo anticodon constituido por un tallo de 5 pb y el asa contiene
el triplete anticodon; el brazo TyC, que está formado por un tallo de 5 pb y el asa
contiene la secuencia invariante ribotimidina (T), seudouridina (y) y citosina (C); a
esto debe sumarse el brazo variable ubicado entre el del anticodon y el TyC, que
puede contener de 3 a 21 nucleótidos con un tallo de hasta 7 pb.

Cuando se habla de posiciones equivalentes se hace referencia a la localización en la

estructura secundaria y no en la primaria, pues esta última puede variar con la longitud del
brazo variable, por ejemplo, la ribotimidina siempre se encuentra al inicio del asa TyC,
independiente de su localización en la estructura primaria.

Como se puede observar en la figura 11.19 casi todas las bases invariantes y
semiinvariantes aparecen localizadas en las asas.

Estructura terciaria. Después de numerosos esfuerzos infructuosos por determinar la

estructura tridimensional de los ARNt, en 1974 Alexander Rich y Sung Hou Kim, por una
parte, y Aaron Klug por otra, mediante estudios de difracción de rayos X, lograron
dilucidar la estructura del ARNt de fenilalanina de levadura, con una resolución de 0,25
nm. Los resultados mostraron que la molécula adopta la forma de una letra L invertida (G);
el lado vertical se forma por el brazo D y el anticodon, en tanto el lado horizontal lo
constituyen el brazo TyC y el tallo aceptor. En ambos lados la molécula forma una doble
hélice similar al ADN A, pero con apareamientos menos estrictos. Cada lado tiene una
longitud de 6 nm y un ancho de 2 a 2,5 nm. Los dos extremos de la L, formados por el
anticodon y el CCA del aceptor, están separados unos 7,6 nm (Fig. 11.20).

La estructura se mantiene gracias a numerosas interacciones que se establecen entre sus

componentes. Una proporción elevada de las bases participa en la formación de
empalizados, otras forman pares de bases cruzados, que por lo general no son del tipo
Watson y Crick. La mayoría de las bases involucradas en estas interacciones son las
invariantes o semiinvariantes. También participan en la estabilidad de las moléculas
puentes de hidrógeno entre las bases y grupos fosfatos, en unos casos y en otros con el C2'-
OH de la ribosa.
 Fig. 11.20. Estructura terciaria de los ARNt. Las moléculas de los ARNt adoptan en el
espacio una estructura que recuerda a una letra L invertida. En rojo se representa el asa del
anticodon. En azul, el asa TyC, y en verde, el asa de la dihidrouridina. Los pares de bases
no siempre son del tipo Watson y Crick, además, las bases pueden interactuar con las
ribosas y los fosfatos.

El hecho de que la estructura se establece principalmente por las bases invariantes y

semiinvariantes sugiere que todos los ARNt tienen la misma estructura tridi-mensional. En
el capítulo 30 se verá que esta forma tridimensional del ARN se adapta perfectamente a su
función de transferir aminoácidos a los ribosomas durante la síntesis de proteínas.