INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL

SECRETARÍA ACADÉMICA

DIRECCIÓN DE EDUCACIÓN SUPERIOR

PROGRAMA SINTÉTICO

UNIDAD ACADÉMICA: UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE BIOTECNOLOGÍA

PROGRAMA ACADÉMICO: Ingeniería Biotecnológica

UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de Biotecnologia II NIVEL: VI

OBJETIVO GENERAL:

El alumno aplicará las herramientas de la Bioinformática y de la Ingeniería Genética en el estudio de casos

concretos para el desarrollo de la Biotecnología. Identificando la interrelación que existe entre ambas y explicando
la importancia de dichas áreas y el papel que desempeñan como herramienta en el desarrollo de la Biotecnología.

DESCRIPCIÓN GENERAL DE CONTENIDOS:

La unidad de aprendizaje Tópicos Selectos Biotecnología II consta de cinco unidades temáticas:

I Bioinformática. Alineamiento de pares de bases

II Aplicaciones de la bioinformática
III Ingeniería genética de procariotes y levaduras
IV Producción de plantas genéticamente modificadas
V Producción de animales genéticamente modificados

ORIENTACIÓN DIDÁCTICA:

Exposición de temas centrales por el profesor, ilustración de conceptos con estudios de caso, elaboración de
resúmenes escritos, búsqueda de casos de aplicación, inducción al aprendizaje significativo.

EVALUACIÓN Y ACREDITACIÓN:

Se aplicará metodología de evaluación continua: formativa y sumativa, mediante las siguientes actividades:
Aplicación de exámenes escritos, resolución de problemas en clase, entrega de resúmenes y cuadros sinópticos y
presentaciones en Power Point

BIBLIOGRAFÍA:
Ausubel F. M. 2003. Current Protocols in Molecular Biology. John Wiley and Sons, Inc. New York, USA
Brown S. M. 2000. Bioinformatics. A biologist’s guide to biocomputing and the Internet. Eaton Publishing Group,
New York, USA. 188 págs.
Lesk A. M. 2002. Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press, Inc. New York, USA. 283 págs.
Parekh, S. R. and Vinci, V. A. (2003). Handbook of Industrial Cell Culture: Mammalian, Microbial, and Plant Cells.
Humana Press, Totowa, NJ. Estados Unidos de América.
Sambrook, J. y Russell, D. W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 3ª ed. Ed Cold Spring Harbor
Laboratories. Nueva York. USA 2001. 2344 págs.
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DIRECCIÓN DE EDUCACIÓN SUPERIOR

UNIDAD ACADÉMICA: Unidad Profesional UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de

Interdisciplinaria de Biotecnología Biotecnología II

PROGRAMA ACADÉMICO: Ingeniería

Biotecnológica TIPO DE UNIDAD DE APRENDIZAJE: Teórica / Optativa

OPCIÓN: VIGENCIA: Enero 2009

PROFESIONAL ASOCIADO: NIVEL: VI

ÁREA FORMATIVA: Profesional CRÉDITOS: 6.0

MODALIDAD: Presencial

PROPÓSITO GENERAL

La unidad de aprendizaje Tópicos Selectos de Biotecnología II reúne conocimientos relacionados con la Bioinformática
y la Ingeniería Genética y plantea las estrategias generales de la Ingeniería Genética, para obtener organismos
genéticamente modificados (OGM) procarióticos y eucarióticos, así como sus aplicaciones en las áreas de Alimentos,
Salud y Medio Ambiente. Los aspectos teóricos de la modificación genética de procariotas, levaduras, plantas y
animales, así como los aspectos teóricos y prácticos de la bioinformática se abordan en la presente unidad de
aprendizaje

El curso tiene como antecedente directo a Fisiología Celular y Tecnología de la Recombinación Genética, donde se
introdujo al alumno a los aspectos teóricos de herramientas moleculares útiles para la transformación genética de
organismos. Asimismo, el curso se apoya en los contenidos del Laboratorio de Biotecnología Molecular para la
modificación genética de organismos procarióticos y eucarióticos.

OBJETIVO GENERAL

El alumno aplicará las herramientas de la Bioinformática y de la Ingeniería Genética en el estudio de casos concretos
para el desarrollo de la Biotecnología. Identificando la interrelación que existe entre ambas y explicando la importancia
de dichas áreas y el papel que desempeñan como herramienta en el desarrollo de la Biotecnología.

TIEMPOS ASIGNADOS UNIDAD DE APRENDIZAJE AUTORIZADO POR:

HORAS TEORÍA/SEMANA: 4.5
HORAS PRÁCTICA/SEMANA:
HORAS TEORÍA/NIVEL: 81
HORAS PRÁCTICA/SEMESTRE:
HORAS TOTALES/NIVEL: 81
DISEÑADA POR: Comisión de Programas
Academia de Biotecnología Académicos del Consejo
General Consultivo del IPN.
REVISADA POR:
Subdirección Académica
APROBADA POR:
Consejo Técnico Consultivo Escolar el
13 de noviembre de 2008.

Dr. David Jaramillo Vigueras

Secretario Técnico de la
Dr. Enrique Durán Páramo Comisión de Programas
Presidente del CTCE Académicos.
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UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de Biotecnología II HOJA: 2 DE: 7

N° UNIDAD TEMÁTICA: I NOMBRE: Bioinformática. Alineamiento de pares de bases

OBJETIVOS PARTICULARES

El alumno desarrollará habilidades esenciales para la consulta, procesamiento y análisis de secuencias (DNA y
polipéptidos) por medio de las herramientas de la bioinformática para su uso en las diferentes áreas de la
biotecnología.

CLAVE
No. CONTENIDOS T P TAA BIBLIOGRÁFICA

1.1 Introducción de la Bioinformática 3.0 1.5 3B, 4B,

6C
1.2 Bases de datos moleculares.

1.2.1 Un paseo por algunas de las bases de datos más importantes 6.0 3.0
NCBI, TIGR, COG, EBI, EMBL, DDBJ, PDB 3B, 4B,
6C
1.2.2 Técnicas de Bioinformática

1.2.3 Uso básico de BLAST en línea en NCBI.

1.3 Uso de programas para alineamiento múltiple de secuencias de 6.0 3.0

ácidos nucleicos y proteínas (Vector, Workbench, etc.).
3B, 4B,
6C

Subtotal de horas 15.0 7.5

ESTRATEGIAS DE APRENDIZAJE

El profesor realizará el encuadre del curso. Realizará la Introducción a los conceptos de Bioinformática. El alumno
realizará un trabajo relacionado con las bases de datos empleadas en el campo de la genómica y de la proteómica.
Realizará ejercicios extractase de alineamiento de secuencias de ácidos nucleicos y de proteínas. .

EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES

Examen escrito 40%

Entrega del trabajo escrito 30%.
Entrega de ejercicios extraclase 30%.
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UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de Biotecnología II HOJA: 3 DE: 7

N° UNIDAD TEMÁTICA: II NOMBRE: Aplicaciones de la Bioinformática

OBJETIVOS PARTICULARES

El alumno comparará diferentes programas utilizados en el área de la bioinformática y determinará cual es el más
adecuado para realizar, análisis de secuencias nucleotídicas, análisis filogenéticos, visualización de proteínas,

CLAVE
No. CONTENIDOS T P TAA BIBLIOGRÁFICA

2.1 Análisis de secuencias de nucleótidos y aminoácidos 6 3 3B, 4B,

6C
2.1.1 Determinación de regiones conservadas en secuencias de
nucleótidos y aminoácidos
2.1.2 Determinación de SNP,s y STR´s
2.1.3 Determinación de secuencias quiméricas
2.2 Análisis Filogenético. 6 3 3B, 4B,
2.2.1 Depuración de secuencias 6C
2.2.2 Interpretación de árboles filogenéticos

2.3 Visualización de estructuras de proteínas. 4.5 3 2B, 3B, 4B

2.3.1 Uso de programas para visualizar la estructura 3D de proteínas
2.3.2 Uso de programas para predecir la estructura 3D de proteínas

Subtotal de horas 16.5 9

ESTRATEGIAS DE APRENDIZAJE

El profesor enseñará a utilizar los diferentes programas de computo que sirven para realizar análisis filogenéticos y
visualización de proteínas. El alumno discutirá el uso y aplicaciones de diferentes programas. Realizará ejercicios
utilizando los programas de cómputo analizados en clase.

EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES

Examen escrito 40%

Discusión de los diferentes programas 20%.
Entrega de ejercicios 40%.
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UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de Biotecnología II HOJA: 4 DE: 7

N° UNIDAD TEMÁTICA: III NOMBRE: Ingeniería genética de procariotes y levaduras

OBJETIVOS PARTICULARES

El alumno analizará las diferentes herramientas que han permitido el desarrollo de la Ingeniería Genética de
procariotes y levaduras. También explicará las principales aplicaciones en Biotecnología de los procariotes y
levaduras modificados mediante Ingeniería Genética.

CLAVE
No. CONTENIDOS T P TAA BIBLIOGRÁFICA

3.1 Introducción a la Ingeniería Genética 6.0 3.0 1C, 2B,

3.1.1 Enzimas de restricción 5C, 9B
3.1.2 Estrategias de clonación
3.1.3 Secuenciación de DNA
3.1.4 Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

3.2 Introducción a la Biología de Plásmidos 1.5 0.5 2B, 9B

3.3 Modificación genética de procariotes 4.5 2.0 1C, 2B,

3.3.1 Vectores de clonación para procariotes 9B
3.3.2 Métodos para introducir vectores a la célula procariota
3.3.3 Aplicaciones de la modificación genética en procariotes

3.4 Modificación genética de levaduras 4.5 2.0 2B, 5C,

3.4.1 Vectores de clonación para levaduras 9B
3.4.2 Métodos para introducir vectores a las células de levadura
3.4.3 Aplicaciones de la modificación genética en levaduras

Subtotal de horas 16.5 7.5

ESTRATEGIAS DE APRENDIZAJE

El profesor explicará los conceptos fundamentales de la Ingeniería Genética. Ilustrará con diapositivas las
herramientas usadas en la Ingeniería Genética. El alumno realizará presentaciones en Power Point acerca de las
estrategias utilizadas para la modificación genética de procariotes y levaduras. Realizará cuadros sinópticos
relacionados con el avance de la Ingeniería Genética en los últimos 20 años y discutirá en aula la importancia y
aplicación de ésta.

EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES

Examen escrito 70%

Entrega de cuadros sinópticos 10%
Discusión de los resúmenes 10%
Presentaciones en Power Point 10%
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UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de Biotecnología II HOJA: 5 DE: 7

N° UNIDAD TEMÁTICA: IV NOMBRE: Producción de plantas genéticamente modificadas

OBJETIVOS PARTICULARES

El alumno explicará los fundamentos de la modificación genética de plantas y cuáles son las principales aplicaciones
de ésta en la resolución de problemas actuales en las áreas de salud, alimentos y ambiental. Analizará también cuáles
son las principales limitantes de las plantas transgénicas y los aspectos de aceptación social que éstas generan.

CLAVE
No. CONTENIDOS T P TAA BIBLIOGRÁFICA

4.1 Introducción a la modificación genética de plantas 3.0 1.5 2B, 8C,

4.1.1 Perspectiva histórica de la modificación genética de plantas 9B

4.2 Ingeniería genética del genoma nuclear 6.0 3.0 2B, 8C,
4.2.1 Métodos para la modificación genética de plantas 9B
4.2.2 Vectores para la modificación genética de plantas
4.2.3 Aplicaciones de plantas generadas mediante Ingeniería Genética
del genoma nuclear

4.3 Ingeniería genética del genoma de cloroplastos 4.5 3.0 2B, 8C,
4.3.1 Métodos para la modificación genética del cloroplasto 9B
4.3.2 Vectores para la modificación genética de cloroplastos
4.3.3 Aplicaciones de la plantas generadas mediante Ingeniería
Genética del genoma del cloroplasto

4.4 Aspectos éticos y sociales entorno a las plantas modificadas 3.0 1.5 2B, 8C,
genéticamente. 9B

Subtotal de horas 16.5 9.0

ESTRATEGIAS DE APRENDIZAJE

El profesor expondrá los aspectos relativos a la modificación genética de plantas. El alumno investigará la perspectiva
histórica de la modificación genética de plantas y entregará un resumen. Presentará con diapositivas los métodos
utilizados para la modificación genética de plantas. Discutirá casos ilustrativos de aplicaciones en biotecnología de las
plantas modificadas genéticamente.

EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES

Examen escrito 40%

Entrega de resumen 20%
Presentaciones en Power Point 20%
Discusión de casos 20%
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UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de Biotecnología II HOJA: 6 DE: 7

N° UNIDAD TEMÁTICA: V NOMBRE: Producción de animales genéticamente

modificados

OBJETIVOS PARTICULARES

El alumno explicará los fundamentos de la modificación genética de animales y cuales son las principales
aplicaciones de ésta en la resolución de problemas actuales en las áreas de salud y alimentos. Analizará cuales son
las principales limitantes de los animales transgénicos y los aspectos de bioética que éstos generan.

CLAVE
No. CONTENIDOS T P TAA BIBLIOGRÁFICA

5.1 Introducción a la modificación genética de animales 6.0 3.0 7B, 8C

5.1.1 Perspectiva histórica de la modificación genética de animales

5.2 Ingeniería genética del genoma nuclear 6.0 3.0

7B, 8C
5.2.1 Métodos para la modificación genética de animales
5.2.2 Vectores para la modificación genética de animales
5.2.3 Aplicaciones de animales generados mediante Ingeniería Genética
del genoma nuclear
5.2.4 Terapia Génica

5.3 Aspectos éticos y sociales entorno a los animales modificados 4.5 3.0 7B, 8C
genéticamente.

Subtotal de horas 16.5 9.0

ESTRATEGIAS DE APRENDIZAJE

El profesor expondrá los aspectos relativos a la modificación genética de animales. El alumno investigará la
perspectiva histórica de la modificación genética de animales y entregará un resumen. Presentará con diapositivas los
métodos utilizados para la modificación genética de animales. Discutirá casos ilustrativos de aplicaciones en
biotecnología de los animales modificados genéticamente.

EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES

Examen escrito 40%

Entrega de resumen 20%
Presentaciones en Power Point 20%
Discusión de casos 20%
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UNIDAD DE APRENDIZAJE: Tópicos Selectos de Biotecnología II HOJA: 7 DE: 7

PERÍODO UNIDAD PROCEDIMIENTO DE EVALUACIÓN

1 I Examen escrito 40%
Entrega del trabajo escrito 30%.
Entrega de ejercicios extraclase 30%.
1 II Examen escrito 40%
Discusión de los diferentes programas 20%.
Entrega de ejercicios 40%.

2 III Examen escrito 70%

Entrega de cuadros sinópticos 10%
Discusión de los resúmenes 10%
Presentaciones en Power Point 10%
3 IV Examen escrito 40%
Entrega de resumen 20%
Presentaciones en Power Point 20%
Discusión de casos 20%
3 V Examen escrito 40%
Entrega de resumen 20%
Presentaciones en Power Point 20%
Discusión de casos 20%
4 I, II y III, IV y V Examen extraordinario, que incluye todos los temas impartidos en el curso, será para
obtener una mayor calificación global; en caso de que el alumno no alcance la
calificación mínima aprobatoria, reprobará la asignatura.
La calificación final del curso, será el promedio de la calificación obtenida en los tres
exámenes ordinarios que incluirá el porcentaje de calificación de la evaluación
continua.

CLAVE B C BIBLIOGRAFÍA
Alberts, B., Jonson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K. y Walter, P. Molecular biology
1 X of the cell. 4a. ed. Ed. Garland Science. Nueva York. EUA. 2001. 1570 págs. ISBN
978-0815332183
Ausubel F. M. 2003. Current Protocols in Molecular Biology. John Wiley and Sons,
2 X
Inc. New York, USA
Brown S. M. 2000. Bioinformatics. A biologist’s guide to biocomputing and the
3 X
Internet. Eaton Publishing Group, New York, USA. 188 págs.
Lesk A.M. 2002. Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press, Inc. New
4 X
York, USA. 283 págs.
5 X Lewin, B. Genes VII. Ed. Oxford University Press. Nueva York. EUA. 2000. 990 págs.
Mount D.W. 2004. Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. 2nd ed. Cold
6 X Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York. 692 págs. ISBN 0-
87969-687-7.
Parekh, S. R. The GOM Handbook of Genetically modifies Animals, Microbes and
7 X
Plants in Biotechnology. Humann Press 1ra ed. 2004. ISBN-10 1588293076.
Parekh, S. R. and Vinci, V. A. (2003). Handbook of Industrial Cell Culture:
8 X Mammalian, Microbial, and Plant Cells. Humana Press, Totowa, NJ. Estados Unidos
de América.
Sambrook, J. y Russell, D. W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 3ª ed. Ed
9 X
Cold Spring Harbor Laboratories. Nueva York. USA 2001. 2344 págs.
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DIRECCIÓN DE EDUCACIÓN SUPERIOR

PERFIL DOCENTE POR ASIGNATURA

1. DATOS GENERALES

ESCUELA: UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE BIOTECNOLOGÍA

PROGRAMA ACADÉMICO: Ingeniería Biotecnológica NIVEL VI

ÁREA: BÁSICAS C. INGENIERÍA D. INGENIERÍA C. SOC. y HUM.

ACADEMIA: Biotecnología ASIGNATURA: Tópicos Selectos de Biotecnologia II

ESPECIALIDAD Y NIVEL ACADÉMICO REQUERIDO: Ingeniero Biotecnólogo o Ing. Bioquímico con maestría
y/o doctorado en un área que abarque Ingeniería
Genética y Bioinformática.

2. OBJETIVOS DE LA ASIGNATURA

El alumno aplicará las herramientas de la Bioinformática y de la Ingeniería Genética en el estudio de casos

concretos para el desarrollo de la Biotecnología. Identificando la interrelación que existe entre ambas y
explicando la importancia de dichas áreas y el papel que desempeñan como herramienta en el desarrollo de la
Biotecnología.

3. PERFIL DOCENTE

CONOCIMIENTOS
1) Fundamentos de
Biología molecular.
2) Dominio de las técnicas
de Ingeniería Genética.
3) Dominio de las
herramientas de la
Bioinformática.
4) Diseño didáctico.
EXPERIENCIA
HABILIDADES ACTITUDES
PROFESIONAL
1) Haber impartido con 1) Facilidad de expresión 1) Responsabilidad.
anterioridad asignaturas oral. 2) Compromiso Social.
similares a nivel superior o 3) Respeto.
posgrado. 2) Docencia centrada en el 4) Actualización permanente.
aprendizaje. 5) Tolerancia.
2) Tener formación 6) Honestidad.
docente demostrable 3) Resolución de 7) Facilidad de adaptación a
(cursos o diplomados). problemas de ingeniería. grupos de trabajo.
8) Propositiva en la facilitación
4) Trabajo en equipo. del aprendizaje.
9) Acción tutorial
5) Manejo de las TICs.

ELABORÓ REVISÓ AUTORIZÓ

María del Carmen Oliver Salvador Ing. Yesica Ma. Domínguez Galicia Dr. Enrique Durán Páramo
PRESIDENTA DE ACADEMIA SUBDIRECTORA ACADÉMICA DIRECTOR DEL PLANTEL

FECHA: Septiembre de 2008