1er CURSO SOBRE SOLUCIONES A LA

CONTAMINACIÓN DE SUELO Y ACUÍFEROS

BASES BIOQUÍMICAS
Í
DE LA BIORREMEDIACIÓN
14 de marzo de 2013

Dra. Susana Saval

 BIORREMEDIACIÓN

Técnicas p
para el saneamiento de
suelos contaminados mediante el uso
de microorganismos
g vivos q
que sean
capaces de degradar o transformar
contaminantes a compuestos
p inocuos

Técnica de mayor elección para 
suelos contaminados con hidrocarburos, 
aprobada por la DGGIMAR/SEMARNAT 
En general, la biorremediación se concibe como una caja negra ….

…. y poco se conoce de
d la
l complejidad
l jid d del
d l proceso

? ?

Vamos a abrir la caja negra … para ver qué encontramos

Para que ocurra la biorremediación se requiere ....

1. Microorganismos 2. Contaminantes
2
degradadores biodegradables
(sustratos)

4. Condiciones
3. Nutrientes microambientales
bá i
básicos favorables
 MICROORGANISMOS INVOLUCRADOS
EN LA BIODEGRADACIÓN O BIOTRANSFORMACIÓN
DE CONTAMINANTES AMBIENTALES

• BACTERIAS √

• Hongos

• Levaduras

• Actinomicetos

• Algas
l
 ATRIBUTOS DE LAS BACTERIAS

o Fueron los primeros organismos pobladores del planeta

o Están adheridas a la matriz del suelo

o Tienen una velocidad de crecimiento mayor que la de cualquier

otro tipo de microorganismo

o Tienen la más amplia versatilidad bioquímica, por ello se han

adaptado en forma natural a una gran variedad de compuestos de
tipo orgánico que satisfacen sus requerimientos nutricionales

Por lo tanto:

 Sobreviven en condiciones microambientales extremas

((lluvia/estiaje;
/ j ; frío/calor;
/ ; día/noche;
/ ; abundancia/inanición)
/ )

 Adaptan su “maquinaria enzimática” para degradar una amplia

variedad de sustratos incluyendo los “xenobióticos”
(compuestos de origen sintético, ajenos a la naturaleza)
Nutrientes básicos
para el desarrollo
p
ENZIMAS
microbiano

aminoácidos
PROTEÍNAS
NH4+ ESTRUCTURALES
ácidos nucléicos

PO43- ADN ARN

compuestos de alta energía

FUENTE DE
CARBONO
donador de electrones
Y ENERGÍA (contaminantes orgánicos)

aceptor de electrones
O2
 Tipos de hidrocarburos

Hidrocarburos

Saturados Insaturados
(Alifáticos)

Cicloalcanos
(Alicíclicos)
Alcanos
Aromáticos

Lineal

Ramificado Mononucleares Polinucleares

 Cómo funcionan las bacterias?

Al igual que todo ser vivo, mediante reacciones

químicas que son mediadas por enzimas

SUSTRATO PRODUCTO

ENZIMA
 Que son las ENZIMAS?

Catalizadores de origen biológico

Moléculas de origen proteico que se acoplan a un

sustrato específico para llevar a cabo una
reacción específica que rinde un producto específico
necesario para la sobrevivencia del
organismo que las produce

Esta característica se denomina

ESPECIFICIDAD
TIPOS DE ENZIMAS EN LAS BACTERIAS SEGÚN SU FUNCIÓN

• DEGRADATIVAS
Le permiten a la célula utilizar compuestos
√
orgánicos como sustrato (alimento)

• FUNCIONALES
Sirven para el transporte de nutrientes y de productos
a través de la membrana celular

• SINTÉTICAS
Trabajan para reponer células dañadas y para
crear nuevas células

En BIORREMEDIACIÓN actúan todos los tipos de enzimas, pero sobresalen las 
degradativas porque son las encargadas de reducir la concentración de 
contaminantes 
 OTRAS CARACTERÍSTICAS DE LAS ENZIMAS

Las ENZIMAS mantienen

L ti la
l vida
id de
d un organismo,
i
aunque también actúan para su destrucción.

Algunas están presentes todo el tiempo, a diferencia

de otras cuya
y síntesis ocurre cuando un organismo
g
“enciende” una señal.

U
Una señal
ñ l puede
d ser lla presencia
i de
d un sustrato
t t
específico.

Su estructura molecular es susceptible a

condiciones microambientales extremas.
 RESPUESTA DE LOS EFECTORES SOBRE LA ACTIVIDAD
MICROBIANA / ENZIMÁTICA / METABÓLICA / DEGRADADORA

A A

Agua disponible pH

A A

Temperatura Inhibidores
 DISPONIBILIDAD DE OXÍGENO
Í
COMO ACEPTOR FINAL DE ELECTRONES

Potencial de oxido-reducción

Eh

50 mV 400 mV 800 mV

Oxígeno limitante Oxígeno abundante

Condiciones ideales para el

desarrollo de microorganismos aerobios
 FUENTE DE CARBONO Y ENERGÍA
(donador de electrones)

FERMENTACIÓN
RESPIRACIÓN Aceptor orgánico
Aceptor inorgánico
Ácidos orgánicos

Metabolismo aerobio Metabolismo anaerobio

Aceptor final
OXÍGENO NO3- Fe3+ SO42- CO2
de electrones

mayor velocidad
de reacción

La naturaleza del ACEPTOR FINAL DE ELECTRONES determina el tipo de metabolismo

SUSTRATO ORIGINAL (SUSTRATO 1)

enzima 1

PRODUCTO 1 (SUSTRATO 2)

enzima 2 BASE DE
FUNCIONAMIENTO
PRODUCTO 2 (SUSTRATO 3) DE LA
BIORREMEDIACIÓN:
enzima “n”
n Reacciones
enzimáticas
secuenciales
PRODUCTO “n” (SUSTRATO x) hasta llegar
g al
producto final

enzima
e az

PRODUCTO FINAL
 polisacáridos GLICÓLISIS

NES
RIENTES COMUN
piruvato
i

proteínas

NUTR acetil CoA

grasas

CICLO DE LOS 
ÁCIDOS 
RUTA METABÓLICA TRICARBOXÍLICOS

TÍPICA DE
CO
CO22
ORGANISMOS CADENA DE
AEROBIOS TRANSPORTE DE
TRANSPORTE DE
ELECTRONES

oxígeno FOSFORILACIÓN Compuestos

OXIDATIVA de alta energía
GASOLINA
DIESEL Cualquier combustible
derivado del petróleo y
el mismo petróleo
tienen más de 100
hidrocarburos
químicamente
diferentes.

En biorremediación
cada hidrocarburo
representa un sustrato
a degradar.

PETRÓLEO CRUDO
Y cada sustrato
requiere de varias
enzimas específicas.

Por lo tanto se requiere

un gran número de
enzimas.
 METABOLISMO
p-xileno m-xileno
o-xileno AEROBIO
metilcatecol DE ALGUNOS
tolueno benceno HIDROCARBUROS
dimetilcatecol

piruvato
i
catecol
naftaleno

cetoadipato

acetil CoA dihidroxinaftaleno
propionaldehído
succinato

ácido hidroxinaftóico
CICLO DE LOS 
ÁCIDOS 
TRICARBOXÍLICOS
fenantreno antraceno
CO2
CADENA DE
TRANSPORTE DE
TRANSPORTE DE
ELECTRONES

oxígeno FOSFORILACIÓN Compuestos de alta energía

OXIDATIVA
REACCIONES INICIALES EN LA BIODEGRADACIÓN DE BENCENO

Benceno

OH cis-bencenohihidrodiol
OH

OH
Catecol

OH
 CH3

Tolueno REACCIONES
INICIALES
CH2OH EN LA
Alcohol bencílico
í BIODEGRADACIÓN
DE TOLUENO
CHO

Benzaldehído

COO-

Benzoato

HOOC OH
OH

OH

OH
OH
Catecol
REACCIONES INICIALES EN LA BIODEGRADACIÓN DE para-, meta- y orto-XILENO
para-XILENO meta-XILENO orto-XILENO
CH3 CH3 CH3

CH3

CH3
CH3

CH2OH CH3
CH2OH
OH CH3

alcohol
m-metilbencílico CH3 OH
alcohol
p-metilbencílico CH3 3,4-dimetilcatecol

acetato

COOH COOH

COOH

ácido m-tolúico
O
CH3
á id p-tolúico
ácido lúi
CH3

OH OH

OH OH
COOH

CH3 OH O
3-metilcatecol
4-metilcatecol
CH3
i ld híd
propionaldehído
+
piruvato

RUPTURA DE ANILLO
Hoja 1 de 2
VÍA CETO ADIPATO VÍA META-FISIÓN
catecol
OH

OH

OH
-
COO
-
- COO
COO
cis-cis miconato semialdehído
O 2-hidroximucónico

formato
O -
COO HO O
-
COO
-
CH3 COO
ceto-adipato
p 3-hidroxi 2-cetovalerato

CoA

succinato
i t acetaldehído
t ld híd
+ +
acetil CoA piruvato
Hoja 2 de 2
 OXIDACIÓN
TERMINAL
OXIDACIÓN
CH3 - (CH2)n - CH3 SUBTERMINAL
OH
CH3 - (CH2)n - CH2OH CH3 - (CH2)n - CH -CH3

O
CH3 - (CH2)n - CHO CH3 - (CH2)n - C -CH3
ω -oxidación
O
CH3 - (CH2)n - COOH
HOCH2 - (CH2)n - COOH CH3 - (CH2)n-1 - CH2 - O - C -CH3

HOOC - (CH2)n - COOH

CH3 - (CH2)n-1 - CH2OH + HOOC - CH3

CH3 - (CH2)n-1 - COOH

Ciclo de los
- oxidación Ácidos Tricarboxílicos

Biodegradación de n-alcanos
 POTENCIAL RELATIVO DE BIODEGRADACIÓN
Más biodegradables

Monoaromáticos

Alcanos de cadena lineal

Alcanos ramificados

Cicloalcanos saturados

Poliaromáticos

Menos biodegradables
DESARROLLO EN ARMONÍA:
BACTERIAS EN PLENO DESARROLLO Y ACTIVIDAD DEGRADADORA

Y CO2

(HCs)
Cuando hay un desarrollo en armonía un suelo sometido
a biorremediación puede recuperar su vocación natural
 PRODUCTOS FRACCIÓN POSIBILIDADES DE
BIODEGRADACIÓN

GASOLINA

Aplicaciones de la  GASAVIÓN BUENAS (90%),

AUNQUE SE DA
biorremediación GASNAFTA
LIGERA
NATURALMENTE
PÉRDIDA POR
GASOLVENTE VOLATILIZACIÓN

QUEROSINA

TURBOSINA
MUY ALTAS ((100%))
DIESEL MEDIA

GASÓLEO

ACEITES REGULARES (50%)

El sobrecalentamiento COMBUSTÓLEO
genera hidrocarburos PRÁCTICAMENTE NULAS
muy complejos, por
ejemplo los poliaromáticos ASFALTO PESADA NINGUNA

PETRÓLEO
Ó CRUDO REGULARES (MÁX.
Á 60%)
EN PRESENCIA DE
SURFACTANTES
 CONTAMINANTES + MICROORGANISMOS + NUTRIENTES

condiciones favorables
(pH, oxígeno, humedad, temperatura)

COMPUESTOS QUÍMICAMENTE 
BIÓXIDO DE CARBONO 
DIFERENTES
(MINERALIZACIÓN) (deseablemente de menor riesgo)

BIODEGRADACIÓN BIOTRANSFORMACIÓN
En conclusión

‐ Los microorganismos no comen petróleo, sólo degradan los hidrocarburos para los 
cuales existe una ruta metabólica, es decir, para los cuales existen las enzimas 
necesarias para las reacciones de degradación
necesarias para las reacciones de degradación.

‐ Sólo cuando hay participación de microrganismos en la degradación se llama  
biorremediación, de lo contrario se trata de otra técnica diferente.
biorremediación, de lo contrario se trata de otra técnica diferente.

‐ La biorremediación ocurre sólo si: existen microorganismos degradadores, si los 
sustratos son biodegradables, si hay nutrientes básicos y si las condiciones 
g , y y
microambientales son favorables (pH, temperatura, humedad, oxígeno).

‐ Las preparaciones comerciales no tienen las enzimas que llevan a cabo las 
reacciones de degradación de hidrocarburos.
 Dra. Susana Saval
MUCHAS GRACIAS Coordinación de Ingeniería Ambiental
POR SU ATENCIÓN!!! ssavalb@iingen.unam.mx
g