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Síntesis de purinas
La
Lasíntesis
síntesisde
denovo
novode
de purinas
purinasrequiere
requierePRPP,
PRPP,la
lafundación
fundación
sobre
sobrelalaque
quese
seconstruye
construyelalabase
basepaso
pasoaapaso.
paso.
**ooribosa
ribosaPPpirofosfokinasa
pirofosfokinasa
El primer paso dedicado es el
desplazamiento del PPi por
amonio.para producir 5-
phosphoribosil-1-amina, con la
amina en configuración ß. La
amidotransferasa asume la Gln PRPP
conformación activa sólo luego de amino
transferasa
que se unen el PRPP y la
glutamina. Al igual que en la
carbamil fosfato sintetasa, el
amonio que se genera por
hidrólisis de Gln pasa por un canal
interno para alcanzar al PRPP sin
llegar a estar en solución.
El grupo carboxilato de una Gly es activado por fosforilación y
El grupo carboxilato de una Gly es activado por fosforilación y
luego ligado al grupo amino de la fosforibosilamina. Se forma
luego ligado al grupo amino de la fosforibosilamina. Se forma
un nuevo enlace amida y el grupo amino de la glicina actuará
un nuevo enlace amida y el grupo amino de la glicina actuará
como nucleófilo en el próximo paso.
como nucleófilo en el próximo paso.
GAR sintasa
GAR
Se activa un formato que se añade al grupo amino para formar
Se activa un formato que se añade al grupo amino para formar
FGAR. En algunos organismos se requieren 2 enzimas para
FGAR. En algunos organismos se requieren 2 enzimas para
este paso. Una transfiere en grupo formilo desde el N10-
este paso. Una transfiere en grupo formilo desde el N10-
formiltetrahidrofolato. La otra activa al formato como formil
formiltetrahidrofolato. La otra activa al formato como formil
fosfato, que se añade directamente al grupo amino de la Gli.
fosfato, que se añade directamente al grupo amino de la Gli.
GAR trans
formilasa
FGAR
El grupo amida interno se activa y convierte en
El grupo amida interno se activa y convierte en
una amidina mediante la adición de amonio que
una amidina mediante la adición de amonio que
viene de Gln.
viene de Gln.
Amido transferasa
FGAM
El producto de esta reacción, el FGAM, se cicla
mediante una ciclasa (o aminoimidazol ribótido
sintasa) para dar el anillo imidazol de las purinas.
Aunque el paso es termodinamicamente
favorable, se gasta un ATP para asegurar la
irreversibilidad. Se añade un P del ATP para
activar el grupo carbonilo y es desplazado por el
N unido a la ribosa. Hay una reación
intramolecular en la cual el nucleófilo y el
carbono activado con P están en la misma
molécula.
AIR
El bicarbonato es activado por fosforilación y luego atacado
El bicarbonato es activado por fosforilación y luego atacado
por un grupo amino exociclico. En mamíferos la reacción no
por un grupo amino exociclico. En mamíferos la reacción no
requiere ATP.
requiere ATP.
aminoimidazol ribótido
carboxilasa
El producto de la reacción se rearregla para transferir el carboxilato al
El producto de la reacción se rearregla para transferir el carboxilato al
anillo.
anillo.
CAIR
CAIR
SAICAR
Se elimina fumarato, un intermediario del CK, dejando el átomo de N
Se elimina fumarato, un intermediario del CK, dejando el átomo de N
unido al anillo imidazólico. Este paso es parecido al de la conversion
unido al anillo imidazólico. Este paso es parecido al de la conversion
de citrulina en Arg en el ciclo de la urea y las enzimas son homólogas.
de citrulina en Arg en el ciclo de la urea y las enzimas son homólogas.
AICAR SAICAR
adenylosuccinate lyase
Se añade un grupo formilo donado por N10-
Se añade un grupo formilo donado por N10-
formiltetrahidrofolato para formar un intermediario que se cicla
formiltetrahidrofolato para formar un intermediario que se cicla
perdiendo agua para formar inosinato.
perdiendo agua para formar inosinato.
FAICAR
aminoimidazol carboxamida
ribótido transformilasa
Deshidratación
Deshidrataciónespontánea
espontáneaseguida
seguidade
deciclización
ciclización
IMP ciclohidrolasa
La
Lavía
víase
seramifica
ramificapara
paraformar
formarAMP
AMPyyGMP
GMP
Adenilo succinato
sintasa
Adenilo succinato
liasa
GMP sintetasa
IMP DH
Regulación
Regulaciónde
delalavía
vía
carbamil aspartato
dehidratasa
dihidroorotato DH
orotato fosforibosil
transferasa
Esta carboxilasa es una de las enzimas más eficientes que existen.
En su ausencia, la decarboxilación tendría lugar 1 vez cada 78
millones de años; en su presencia 1 vez por segundo, es decir un
incremento en la velocidad de 1017 veces.
orotidina-5'-fosfato
carboxilasa
CTP sintetasa
Los NMP son interconvertibles
UMP kinasa
UMP + ATP ' UDP + ADP Alta especificidad
NDP kinasa
XDP + YTP ' XTP + YDP Amplia especificidad
Síntesis de timidilato
Timidilato sintasa
N5, N10-metilenTHF
glicina
Ser OH DHFR
Metil transferasa
serina
Síntesis de desoxirribonucleótidos
Las RN reductasas de distintos organismos son una familia con
una marcada diversidad, pero todas poseen el mismo
mecanismo y su estructura tridimensional indica que son
homólogas. La de E. coli en aerobiosis es una de las más
estudidas y consiste de dos subunidades: R1 (dímero de 87-kd)
y R2 ( dímero de 43-kd)
R1, donde
ocurre la
reducción
R2, donde se genera un radical libre
metotrexato
El AB trimetoprim, un análogo de folato que se
une mucho más fuertemente a la DHF
reductasa bacteriana que a la de mamíferos
Trimetoprim
Excretado por:
Ac. Úrico: Primates, aves,
Reptiles, insectos
urato
oxidasa
alantoinasa
alantoicasa
glioxilato
ureasa
Invertebrados marinos
Evolución de estrategias secretorias y de osmoregulación
Mamíferos
marinos y del desierto
Aves y tortugas
marinas Riñones de
alta efic.
Glándulas Mamíferos
de sal Anfibios La mayoría de los
invertebrados, insectos
Aves acuát. y peces
Peces
pulmonados
Tiburones tolerancia
a la urea
Insectos Osmoconformeros
tubos de Malpighi