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Cucurbita pepo
BIOLOGIA MOLECULAR
Dr. Octavio Guerrero Andrade
Quinto Semestre
Callejas Polo Alondra, Mejía de la Rosa Asiel Salomón, Mejía Nieto Diana Magali, Mejía
Olvera Samira Lizeth, Valdenegro Tornez Rancel
INTRODUCCIÓN
JUSTIFICACIÓN
MARCO TEÓRICO
INFORMACIÓN TAXONÓMICA
Reino: Plantae
División: Magnoliophyta
Clase: Magnoliopsida
Orden : Violales
Familia: Cucurbitácea
Género: Cucurbita L., 1753
Especie: Pepo L., 1753
Subespecie: Pepo Na
CICLO AGRÍCOLA
En México se presentan dos ciclos agrícolas, el primero (de temporal) durante la
época de lluvias y el segundo ciclo durante la época más seca del año en terrenos
denominados de cajete, muy planos y húmedos, ubicados en pequeños valles que
se dice estuvieron antiguamente ocupados por lagos. También puede realizarse
durante la temporada de secas en cualquier región, pero siempre asociado a riego
(Lira & Montes-Hernández, 1994; Lira, 1995; AgroNet: Calabacita).
Descripción morfológica.
Raíz
La planta de calabacín presenta una raíz axonomorfa, con una raíz principal que
alcanza un gran desarrollo si se compara con las raíces secundarias que la
acompañan, el desarrollo de estas últimas en el suelo está determinado por el tipo
de cultivo y el aporte de agua y nutrientes que se realice.
Si el tallo entra en contacto con tierra húmeda puede desarrollar raíces adventicias
en los entrenudos de los tallos.
Tallo
La planta de calabacín presenta dominancia apical, con un tallo principal con atrofia
de brotaciones secundarias en la mayoría de las ocasiones. Tiene forma cilíndrica,
es áspero al tacto debido a la superficie pelosa que tiene y es bastante consistente.
Los entrenudos son, en general, cortos y desde ellos parten las hojas, las flores y
los frutos. Debido al porte rastrero, y en función del tipo de cultivo que se esté
realizando, se aconseja la realización del entutorado con el fin de optimizar el
rendimiento de la cosecha tanto en cantidad como en calidad.
Hojas
El calabacín presenta grandes hojas palmeadas de color verde que parten
directamente del tallo a través del peciolo de manera helicoidal y alterna. El limbo
presenta una cara superior suave al tacto y cara inferior muy áspera, con pelos
cortos y fuertes. El borde de la hoja es dentado y presenta cinco lóbulos. Isabel Mª
Andrés Ruiz 21
Flores
El calabacín es una planta monoica al presentar flores masculinas y femeninas en
el mismo pie. Sus flores son grandes, de color amarillo intenso y con forma
acampanada. Se disponen alrededor del tallo al que se unen a través de un largo
pedúnculo, ya que nacen en las axilas de las hojas.
En los primeros estadios de desarrollo de la planta la mayoría de las flores son
masculinas, con el paso de los días van apareciendo las flores femeninas, hasta
que estas últimas acaban siendo mayoritarias en la última fase del ciclo productivo.
La apertura de la flor se produce en las primeras horas de la mañana y solo se
mantiene viable varias horas, para realizar la fecundación es necesaria la
intervención de colmenas, por lo que se produce una polinización cruzada.
Frutos
El calabacín es un fruto carnoso, cilíndrico, alargado y sin cavidad central. En
general es de color verde.
La recolección para su comercialización se lleva a cabo cuando el fruto aun esta
inmadura, atendiendo a los requerimientos del mercado en lo que a calidad se
refiere, ya que el fruto maduro no tiene las características organolépticas
demandadas para su comercialización: dureza, sabor, aparición de semillas...etc.
OBJETIVOS
Objetivo general
Objetivos específicos
METODOS
PCR son las siglas por las que se conoce a la reacción en cadena de la polimerasa
(en inglés Polymerase Chain Reaction), una técnica científica avanzada que fue
inventada por el bioquímico estadounidense Kary Mullis en 1985. Esta técnica
permite amplificar pequeñas regiones específicas del ADN en laboratorio. Es decir,
consigue que un pequeño segmento de ADN que pasaría desapercibido en un
análisis cualquiera se multiplique millones de veces y así sea fácil de detectar.
La técnica clásica utiliza una tira recubierta de una sustancia porosa impregnada de
un electrolito. Sus extremos se sumergen en dos depósitos independientes que
contienen ambos al electrolito y están unidos a los electrodos del generador de
corriente. La muestra se deposita en forma de un pequeño trazo transversal en la
tira. La distancia de migración se mide en relación un marcador interno. Las placas
son reveladas con sales de plata, azul de Coomassie, o reactivos en particular.
Técnicas Electroforéticas
Con el marcador rbcl podemos observar que hay poca diferencia entre las
variedades de voucher y las him sin embargo existen dos variedades las cuales
tienen mayor variación como lo son las c. pepo rll y c. pepo ribulose. Los cual radica
principalmente en el origen de la toma de la muestra como lo observamos en el gen
bank.
Nombre Tamaño % de
identidad
Cucurbita pepo catalase mRNA, partial cds 492 100
PREDICTED: Cucurbita pepo subsp. pepo catalase 1763 99
isozyme 3 (LOC111799285)
Cucurbita maxima catalase (CAT3), complete cds 1593 99
Cucurbita pepo for catalase (cat3), complete cds 1804 99
PREDICTED: Cucurbita maxima catalase isozyme 3 1801 99
(LOC111496591)
PREDICTED: Cucurbita moschata catalase isozyme 3 1785 99
(LOC111454551)
Cucurbita moschata catalase (CAT3), complete cds 1601 99
PREDICTED: Cucurbita maxima catalase isozyme 2 1811 89
(LOC111493962)
PREDICTED: Cucurbita moschata catalase isozyme 2 1816 89
(LOC111450353)
Cucurbita maxima catalase (CAT2) partial cds 1679 89
Cucurbita moschata catalase (CAT2), partial cds 1679 89
Cucurbita pepo mRNA for catalase (cat2), complete 1785 89
cds
Cucurbita pepo mRNA for catalase (cat2), complete 1921 89
cds
PREDICTED: Cucurbita pepo subsp. pepo catalase 1810 89
isozyme 2 (LOC111805312)
BIBLIOGRAFIA
ANEXOS
CpepovoucherHO4
TGAGACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGGGTTCC 119
Cpeporll
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 120
CpepofraternavoucherPI614683
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
CpepovoucherPI531323
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
CpepotexanavoucherPI614691
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
CpepoozarkanavoucherAmes26624
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
Cpepovoucher44373HIM
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
Cpeporibulose
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 120
Cpepo15279HIM
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
CpepoisolateHIMS776-12
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
Cpepo15278HIM
TGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCC 119
*** ************************************************** *****
CpepovoucherHO4
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Cpeporll
ACCCGAGGAAGCGGGGGCCGCCGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 180
CpepofraternavoucherPI614683
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
CpepovoucherPI531323
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
CpepotexanavoucherPI614691
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
CpepoozarkanavoucherAmes26624
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
Cpepovoucher44373HIM
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
Cpeporibulose
ACCCGAGGAAGCGGGGGCCGCCGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 180
Cpepo15279HIM
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
CpepoisolateHIMS776-12
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
Cpepo15278HIM
ACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGT 179
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CpepovoucherHO4
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTATGGGATCGAACC 239
Cpeporll
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 240
CpepofraternavoucherPI614683
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
CpepovoucherPI531323
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
CpepotexanavoucherPI614691
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
CpepoozarkanavoucherAmes26624
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
Cpepovoucher44373HIM
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
Cpeporibulose
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 240
Cpepo15279HIM
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
CpepoisolateHIMS776-12
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
Cpepo15278HIM
GTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGAATCGAGCC 239
*************************************** *********** ***** **
CpepovoucherHO4
TGTTCCTGGAGAGGAGAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCCTAGACCTTTTTGA 299
Cpeporll
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCCTAGACCTTTTTGA 300
CpepofraternavoucherPI614683
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CpepovoucherPI531323
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTCTAGACCTTTTTGA 299
CpepotexanavoucherPI614691
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTCTAGACCTTTTTGA 299
CpepoozarkanavoucherAmes26624
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTCTAGACCTTTTTGA 299
Cpepovoucher44373HIM
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTCTAGACCTTTTTGA 299
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTCTAGACCTTTTTGA 299
Cpeporibulose
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCCTAGACCTTTTTGA 300
Cpepo15279HIM
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCCTAGACCTTTTTGA 299
CpepoisolateHIMS776-12
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Cpepo15278HIM
TGTTCCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTCTAGACCTTTTTGA 299
************ ** ***************************** **************
CpepovoucherHO4
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Cpeporll
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CpepofraternavoucherPI614683
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CpepovoucherPI531323
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CpepotexanavoucherPI614691
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CpepoozarkanavoucherAmes26624
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Cpepovoucher44373HIM
AGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGATTCAAGGC 359
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
AGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGATTCAAGGC 359
Cpeporibulose
AGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGATTCAAGGC 360
Cpepo15279HIM
AGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGATTCAAGGC 359
CpepoisolateHIMS776-12
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Cpepo15278HIM
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*************** *********************** ********************
CpepovoucherHO4
TCTGCGTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACATTCCA 419
Cpeporll
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CpepofraternavoucherPI614683
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CpepovoucherPI531323
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CpepoozarkanavoucherAmes26624
TCTGCGTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCA 419
Cpepovoucher44373HIM
TCTGCGTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCA 419
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
TCTGCGTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCA 419
Cpeporibulose TCTG-
GTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCA 419
Cpepo15279HIM TCTG-
CTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCA 418
CpepoisolateHIMS776-12 TCTG-
CTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCA 418
Cpepo15278HIM TCTG-
CTGCTCTACGTCTGGAGGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCA 418
**** ************************************************ *****
CpepovoucherHO4
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Cpeporll
AGGCCCGCCTCATGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCTCT480
CpepofraternavoucherPI614683
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CpepovoucherPI531323
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CpepoozarkanavoucherAmes26624
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Cpepovoucher44373HIM
AGGCCCGCCTCATGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCTCT479
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
AGGCCCGCCTCATGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCTCT479
Cpeporibulose
AGGCCCGCCTCATGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCTCT479
Cpepo15279HIM
AGGCCCGCCTCATGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCTCT478
CpepoisolateHIMS776-12
AGGCCCGCCTCATGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCTCT478
Cpepo15278HIM
AGGCCCGCCTCATGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCTCT478
*************************************************** ********
CpepovoucherHO4
ATTGGGGTGTACAATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGCAGAGCAGT 539
Cpeporll
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ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 539
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ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 539
CpepoozarkanavoucherAmes26624
ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 539
Cpepovoucher44373HIM
ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 539
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 539
Cpeporibulose
ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 539
Cpepo15279HIM
ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 538
CpepoisolateHIMS776-12
ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 538
Cpepo15278HIM
ATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAATTATGGTAGAGCAGT 538
****** ***** ************************************** ********
CpepovoucherHO4
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Cpeporll
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CpepovoucherPI531323
TTATGAATGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTGAATTCCCA 599
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TTATGAATGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTGAATTCCCA 599
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TTATGAATGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTGAATTCCCA 599
Cpepovoucher44373HIM TTATGAATGTCTA----------------------------------------------- 552
CpeposubspoviferavoucherIU91-196
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Cpeporibulose
TTATGAATGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTGAATTCCCA 599
Cpepo15279HIM TTATGAATGTCTA----------------------------------------------- 551
CpepoisolateHIMS776-12 TTATGAATGTCTA----------------------------------------------- 551
Cpepo15278HIM TTATGAATGTCTA----------------------------------------------- 551
****** ******