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Aminoácidos
Son las unidades monoméricas constitutivas de los
péptidos y de las proteínas, ellas forman parte de “las
moléculas orgánicas más importantes del organismo”.
Tienen gran importancia porque constituyen las
proteínas, así que tienen función estructural, un ejemplo
Fig. 1 «Estructura de un clave seria mencionar que la musculatura está formada
Aminoácido» netamente por proteínas, y también forman algunos
compuestos no proteicos como neurotransmisores,
hormonas e incluso inmunoglobulinas. Su composición química es: un Grupo
Amino (NH3), un carbono α (-CH-), un carbono carboxilo (COOH), y una cadena
lateral R.
«Serina»
«Asparagina»
«Glutamato»
«Tirosina» «Aspartato»
«Prolina
»
«Treonina» «Glutamina»
«Arginina» «Histidina»
Este capítulo fue elaborado con base en
Harper, Bioquímica ilusrtada, Capítulo 3, 4 y 5
“Aminoácidos, péptidos y proteínas”
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Aminoácidos, Péptido y Proteínas 3
Bioquímica de Pastor 2011
Serina
Tirosina
Cisteína
Prolina.
Glicina
Alanina
Leucina
Isoleucina
Valina
Fenilalanina
Triptófano
TIROSINA
Serina
Treonina
TIROSINA
Cisteína
Metionina
Prolina
Histidina
Arginina
Lisina
Glutamina
Asparagina
Glutamato
Aspartato
Lisina
Arginina
Histidina
Glicina
Alanina
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Leucina
Isoleucina
Valina
Metionina
Triptófano
Prolina
Fenilalanina
Glutamina
Asparagina
Serina
Tirosina
Treonina
Cisteína
Ejemplo:
- la transaminación del
glutamato y el oxaloacetato
que producen
alfacetoglutarato y aspartato
(Véase Fig. 3)
Fig. 3 «Transaminacion del Glutamato con un
Este capítulo fue elaborado con base en cetoácido»
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Aminoácidos, Péptido y Proteínas 7
Bioquímica de Pastor 2011
Otros Ejemplos:
Desaminación oxidativa: aminoácidos reaccionan con α -oxoglutarato y el
producto es α -oxácidos y glutamato, donde actuará la glutamato
deshidrogenasa (se encuentra en citoplasma de mitocondrias) ésta
enzima usa de cosustrato a NAD+ y NADP+, que los utilizara como agente
oxidante, y formarán hidridiones convirtiéndose en NADH y NADPH (véase
fig. 5) que luego capta agua del exterior, y así el oxígeno desplazará el
amonio (es muy toxico) y antes de ser liberado en la mitocondria es
reconvertido en urea (por el ciclo de la urea) que es menos tóxica que el
amonio (NH4).
- Descarboxilación:
La descarboxilación es una
reacción química en la cual un
grupo carboxilo es eliminado de
un compuesto en forma
de dióxido de carbono (CO2).
(Véase Fig. 7) La
Descarboxilación es una
reacción metabólica fundament Fig. 7 «Descarboxilación»
al durante la oxidación de
moléculas orgánicas, catalizada por enzimas del tipo descarboxilasa.
Ejemplo:
La descarboxilación del piruvato es una reacción clave de la respiración
aeróbica en la cual una molécula de piruvato pierde su grupo carboxilo en
forma de CO2 y rinde acetil CoA, que ingresa en el ciclo de krebs; en el
ciclo de krebs se producen
descarboxilaciones adicionales. (Véase Fig.
8)
Ejemplo:
La descarboxilación de la histidina hasta histamina o
El acetoacetato (un cuerpo cetónico) sufre una descarboxilación
espontánea, no enzimática hasta acetona.
“Hay aminoácidos que pueden tener dos o tres pKa, y el pKa va a regir las
formas iónicas que puede presentar dicho aminoácido” (Véase Figs. 10, 11, 12)
Punto isoeléctrico: es
el pH al que
una sustancia anfótera o
anfión (es aquella que
puede reaccionar ya
Fig. 13 «Catión»
sea como un ácido o
como una base) tiene carga neta cero, A este valor de
pH la solubilidad de la sustancia es casi nula. El PI es
Fig. 14 «Anión»
el pH en el cual el aminoácido se encuentra 100% en
forma zwiterión, es decir que no migra en un campo eléctrico y tiene mínimo
poder amortiguador o buffer y mínima solubilidad para calcularlo se deben
utilizar los pka (Véase Fig. 20).
Es decir el PKa carboxílico y el PKa del grupo amino, que son valores ya
determinados para cada aminoácido proteico.
1)
2)
3)
Nota: estos valores de pka, pueden cambiar dependiendo de la literatura, deben tomarse
sólo como valores de referencia, más no como valores absolutos. No es parte de ningún
programa de estudio memorizar dichas cifras, y para cuando realicen los ejercicios en el
exámen la asignatura coloca los valores de pka en los ejercicios obligatoriamente
Curva de titulación
Ejercicio de titulación
Péptidos
Son menos de cien aminoácidos, se les llama
cadenas polipeptídicas largas, están formados
por la unión de varios aminoácidos unidos
entre sí por enlace peptídico, los péptidos al
igual que las proteínas están presentes en la naturaleza (Véase Fig. 25).
Proteínas
Son macromoléculas orgánicas constituidas por
cadenas polipeptídicas, que poseen un peso
molecular mayor a 100 mil Dalton, y que
constituyen las moléculas más importante y la
más abundante del organismo, la síntesis
proteica se da a nivel ribosomal y es un proceso
complejo ejecutado por la célula gracias a la
información suministrada por los genes, su composición obviamente son
aminoácidos, pero también tiene oxígeno, hidrógeno, nitrógeno y casi todas
también poseen azufre. A pesar de solo ser 20 aminoácidos las combinaciones
para formar polipéptidos y proteínas son infinitas.
Proteína Fibrosa: son moléculas largas, con forma de varilla que son
insolubles en agua y físicamente correosas, tiene función estructural y
protectora, son hidrófobas.
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Colágeno:
Forma la matriz de los huesos
Constituyen la mayor parte de los tendones
Es constituyente importante de la piel y de las
encías
Forma el ligamento periodontal y conforma la
gónfosis dentaria. (Véase Fig. 28)
Este capítulo fue elaborado con base en Fig. 30 «Proteína Globular, composición
Harper, Bioquímica ilusrtada, Capítulo 3, 4 y 5 aminoacídica»
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Aminoácidos, Péptido y Proteínas 23
Bioquímica de Pastor 2011
Niveles de conformación
Organización estructural de la
Conformación secundaria:
Conformación de alfa-hélice:
Fig. 32 «Conformación Nativa»
el plegamiento se da en forma de
escaleta de caracol, de manera repetitiva, esto sucede cuando en cada
carbono alfa de la cadena polipeptídica se tuerce en la mima posición, los
enlaces de esta estructuras son enlaces
INTRACATENARIOS, los puentes de hidrógeno
se dan entre los enlaces peptídicos, esto le da a
la alfa hélice un carácter hidrofóbica, y son
paralelos al plano de simetría o eje de la hélice.
(Véase Fig. 33).
Estructura Supersecundaria:
se refiere a un agrupamiento de los
elementos de la conformación
proteica secundaria, es decir alfa
hélice y beta lámina.
Fig. 34 «B-Lámina»
Se estabilizan por:
Fig. 35 «Estructura Supersecundaria»
Interacciones hidrofóbicas
Interacciones electroestáticas
denominadas puentes salinos
Enlaces de hidrogeno
AUTOEVALUACIÓN
1) Con respecto a la Transaminación de los aminoácidos Diga lo
CORRECTO
a) Es catalizado por las transaminasas
b) Es una reacción entre un aminoácido y un alfa-cetoácido
c) La Transaminación del Glutamato con el ácido pirúvico forma Alanina
d) Todas las anteriores son correctas
1) Los Aminoácidos se unen entre sí, por enlaces peptídicos para forman
oligopeptidos, polipéptidos y proteínas. V_____ F______
4) En enlace tipo peptídico (CONH) por ser tipo amida es menos estable y es
propenso a girar y es por esto que se forman estructuras como plegadas de
proteínas. V_____ F______
5) Los haces de fibras de colágeno del ligamento periodontal son estructuras
cuaternarias de las proteínas. V____ F____
«Alanina»
«Glicina»
«Glutamato»
«Lisina»