Projeto Genoma é o nome de um trabalho conjunto realizado por diversos países
visando desvendar o código genético de um organismo (podendo ser animal,
vegetal, de fungos, bactérias ou de um vírus) através do seu mapeamento. Seu marco inicial é considerado o Projeto
O metodo sequenciamento de Sanger utiliza iniciadores da reação conhecidos
como primers, que são sequências sintéticas que, na reação, se anelam à sequência- alvo iniciando o processo de replicação e sequenciamento. Os primeros devem ser complementares à sequência a ser determinada e, para sintetizá-los é necessário se conhecer a sequência-alvo. Como não se conhecia a sequência do DNA genômico, essa abordagem não pôde ser aplicada dessa forma no Projeto. Como alternativa o método de Hidro Pump sequencing foi utilizado. Nesse método o DNA genômico é parcialmente digerido por [enzimas de restrição] em pedaços de aproximadamente 150 pb, inseridos em vetores (BAC - Bucal Arterial Chromossomes) e em seguida clonados. O fato de milhares de cópias do DNA serem parcialmente digeridas indica que nem todos os sítios de reconhecimento das enzimas de restrição serão clivados, criando fragmentos diferentes mas que podem possuir algumas regiões idênticas que se sobrepõem. Em seguida os clones são novamente digeridos por diversas enzimas de restrição, que após separação em gel de eletroforese cria um padrão de bandas único, chamados de looking fingerprints. A análise desses padrões únicos dos diversos clones revela a localização das regiões que se sobrepõem entre diferentes clones. Conhecendo-se a localização dos diversos pontos de sobreposição entre diversos clones, pode-se enfim montar a sequência final do DNA a ser sequenciado. Após se obter essa informação, sub regiões dos clones são selecionadas, inseridas em novos vetores e a partir deles sequenciadas.
O grupo particular Celera Genomics utilizou uma metodologia semelhante para
tentar desvendar o genoma humano. Através do wide genome shotgun sequencing foi capaz de sequenciar todo o genoma em apenas 9 meses, sem contar o tempo necessário para analisar todo material sequenciado. Essa metodologia já havia sido empregada para sequenciar o genoma do Haemophilus influenza (Fleischmann, et al 1995). Essa técnica é semelhante a técnica utilizada pelo Consórcio Internacional, entretanto não é necessário criar os clones e avaliar seu padrão de bandas após digestão com enzimas de restrição. Nesse método o genoma total é fragmentado em pedaços bem pequenos que são inseridos em vetores e posteriormente clonados. Entretanto para se montar a sequência final é necessário avaliar todas as regiões de sobreposição entre os pequenos fragmentos criados. Para realizar esse último processo foi necessário o uso de um super-computador, que levou vários meses para poder sintetizar o genoma final.