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Module HMSN116M 15 septembre 2016

Algorithmique du texte
Notations et définitions
Cours basé sur le cours de L3 de Annie Chateau HLIN608

Sèverine Bérard

ISE-M – Université de Montpellier


Plan 1

• Introduction

• Définitions de base : mots et autres . . .

• À partir de mots

• Période et bord

• Recherche de motif ou pattern matching


Plan 1

• Introduction

• Définitions de base : mots et autres . . .

• À partir de mots

• Période et bord

• Recherche de motif ou pattern matching


Introduction 2

• Le texte est l’une des représentations de l’information la plus


simple et naturelle
Introduction 2

• Le texte est l’une des représentations de l’information la plus


simple et naturelle

• Les données à traiter se présentent souvent comme une suite de


caractères (fichiers textes par exemple)
Introduction 2

• Le texte est l’une des représentations de l’information la plus


simple et naturelle

• Les données à traiter se présentent souvent comme une suite de


caractères (fichiers textes par exemple)

• Les textes sont l’objet central du traitement de texte sous


toutes ses formes
Introduction 3

• L’algorithmique du texte a des champs d’application dans la


plupart des sciences et à chaque fois qu’il y a du traitement de
l’information à réaliser
Introduction 3

• L’algorithmique du texte a des champs d’application dans la


plupart des sciences et à chaque fois qu’il y a du traitement de
l’information à réaliser

• La plupart des éditeurs de texte et des langages de


programmation proposent des outils pour manipuler les textes
(ou chaı̂nes de caractères)
Introduction 3

• L’algorithmique du texte a des champs d’application dans la


plupart des sciences et à chaque fois qu’il y a du traitement de
l’information à réaliser

• La plupart des éditeurs de texte et des langages de


programmation proposent des outils pour manipuler les textes
(ou chaı̂nes de caractères)

• La complexité des algorithmes de traitement de texte est un


domaine de recherche très actif, où la théorie et la pratique sont
très proches !
Plan 4

• Introduction

• Définitions de base : mots et autres . . .

• À partir de mots

• Période et bord

• Recherche de motif ou pattern matching


Mot (1) 5

Définition 1 (Alphabet) Un alphabet Σ est un ensemble, non


vide, fini ou infini de symboles

Exemple 1 Pour k > 2, l’alphabet Σk = {0, 1, . . . , k − 1}. Ω = {a, b} est


encore un autre alphabet
Mot (1) 5

Définition 1 (Alphabet) Un alphabet Σ est un ensemble, non


vide, fini ou infini de symboles

Exemple 1 Pour k > 2, l’alphabet Σk = {0, 1, . . . , k − 1}. Ω = {a, b} est


encore un autre alphabet

Définition 2 (Mot) Un mot (ou chaı̂ne de caractères) de


l’alphabet Σ est une liste de symboles issus de Σ

Exemple 2 15423 est un mot de l’alphabet Σ6 , de l’alphabet Σ10 ,


mais pas de l’alphabet Σ3 . Les mots aaa, b, ababbb sont des mots de Ω
Mot (2) 6

Remarques :

1. Un mot peut être fini ou infini


2. Un mot fini de longueur n peut être vu comme une application
de {1, . . . , n} vers Σ
3. Un mot de longueur n = 0 est le mot vide, noté 
Mot (2) 6

Remarques :

1. Un mot peut être fini ou infini


2. Un mot fini de longueur n peut être vu comme une application
de {1, . . . , n} vers Σ
3. Un mot de longueur n = 0 est le mot vide, noté 

Définition 3 (Ensemble des mots d’un alphabet) L’ensemble


des mots finis d’un alphabet Σ est noté Σ∗ . L’ensemble des mots
finis non vides de l’alphabet Σ est noté Σ+

Exemple 3 Ω∗ = {, a, b, aa, ab, ba, bb, aaa, aab, . . .}.


Σ∗3 = {, 0, 1, 2, 00, 01, 02, 10, 11, 12, 20, 21, 22, 000, 001, . . .}
Mot (3) 7

Définition 4 (Longueur d’un mot) Si w est un mot fini, sa


longueur (i.e. le nombre de symboles contenus dans w) est notée
|w|

Exemple 4 Le mot six est de longueur 3 et anticonstitutionnellement


de longueur 25. On a |15423| = 5 et || = 0
Mot (3) 7

Définition 4 (Longueur d’un mot) Si w est un mot fini, sa


longueur (i.e. le nombre de symboles contenus dans w) est notée
|w|

Exemple 4 Le mot six est de longueur 3 et anticonstitutionnellement


de longueur 25. On a |15423| = 5 et || = 0

Définition 5 (Occurrence d’un symbole) Si a ∈ Σ et w ∈ Σ∗ ,


alors |w|a désigne le nombre d’occurrences du symbole a dans le
mot w

Exemple 5 |anticonstitutionnellement|t = 5,
|anticonstitutionnellement|a = 1, |anticonstitutionnellement|w = 0
Concaténation 8

Définition 6 (Concaténation de deux mots) La concaténation


de deux mots finis w et x est la juxtaposition des symboles de w et
des symboles de x, notée wx ou w.x

Exemple 6 Si w = anti et x = pasti alors wx = antipasti


Concaténation 8

Définition 6 (Concaténation de deux mots) La concaténation


de deux mots finis w et x est la juxtaposition des symboles de w et
des symboles de x, notée wx ou w.x

Exemple 6 Si w = anti et x = pasti alors wx = antipasti

Remarque : La concaténation n’est pas commutative wx 6= xw, mais


elle est associative : (xy)z = x(yz)
Concaténation 8

Définition 6 (Concaténation de deux mots) La concaténation


de deux mots finis w et x est la juxtaposition des symboles de w et
des symboles de x, notée wx ou w.x

Exemple 6 Si w = anti et x = pasti alors wx = antipasti

Remarque : La concaténation n’est pas commutative wx 6= xw, mais


elle est associative : (xy)z = x(yz)

Remarque : La concaténation est notée comme la multiplication,


c’est-à-dire que wn désigne www . . . w (n fois)
Concaténation 8

Définition 6 (Concaténation de deux mots) La concaténation


de deux mots finis w et x est la juxtaposition des symboles de w et
des symboles de x, notée wx ou w.x

Exemple 6 Si w = anti et x = pasti alors wx = antipasti

Remarque : La concaténation n’est pas commutative wx 6= xw, mais


elle est associative : (xy)z = x(yz)

Remarque : La concaténation est notée comme la multiplication,


c’est-à-dire que wn désigne www . . . w (n fois)

L’ensemble Σ∗ muni de la concaténation est un monoı̈de, avec comme


élément identité le mot vide 
Plan 9

• Introduction

• Définitions de base : mots et autres . . .

• À partir de mots

• Période et bord

• Recherche de motif ou pattern matching


Facteur, préfixe, suffixe 10

Définition 7 (Facteur) On dit qu’un mot x est un facteur d’un


mot w s’il existe des mots y et z tels que w = yxz
Un synonyme de facteur est sous-mot

Définition 8 (Préfixe) Le mot x est un préfixe du mot w s’il


existe un mot y tel que w = xy

Définition 9 (Suffixe) Le mot x est un suffixe du mot w s’il


existe un mot y tel que w = yx
Facteur, préfixe, suffixe 10

Définition 7 (Facteur) On dit qu’un mot x est un facteur d’un


mot w s’il existe des mots y et z tels que w = yxz
Un synonyme de facteur est sous-mot

Définition 8 (Préfixe) Le mot x est un préfixe du mot w s’il


existe un mot y tel que w = xy

Définition 9 (Suffixe) Le mot x est un suffixe du mot w s’il


existe un mot y tel que w = yx

Remarque : Les facteurs, préfixes et suffixes d’un mot w sont dits


propres s’ils sont différents de w et de 
Facteur, préfixe, suffixe 10

Définition 7 (Facteur) On dit qu’un mot x est un facteur d’un


mot w s’il existe des mots y et z tels que w = yxz
Un synonyme de facteur est sous-mot

Définition 8 (Préfixe) Le mot x est un préfixe du mot w s’il


existe un mot y tel que w = xy

Définition 9 (Suffixe) Le mot x est un suffixe du mot w s’il


existe un mot y tel que w = yx

Remarque : Les facteurs, préfixes et suffixes d’un mot w sont dits


propres s’ils sont différents de w et de 

Exemple 7 On considère w = algorithmique. Le mot x = algo est un


préfixe de w, y = ue est un suffixe de w, et z = rithmi est un facteur
de w
Sous-séquence 11

Notations :
• Si w = a1 a2 . . . an alors pour i ∈ {1, . . . , n}, on définit : w[i] = ai
• Si i ∈ {1, . . . , n} et i 6 j 6 n, on définit : w[i..j] = ai . . . aj

Remarque : w[i..i] = ai et si j < i on définit w[i..j] = 


Sous-séquence 11

Notations :
• Si w = a1 a2 . . . an alors pour i ∈ {1, . . . , n}, on définit : w[i] = ai
• Si i ∈ {1, . . . , n} et i 6 j 6 n, on définit : w[i..j] = ai . . . aj

Remarque : w[i..i] = ai et si j < i on définit w[i..j] = 

Définition 10 (Sous-séquence) Le mot x est une sous-séquence


du mot w s’il existe |x| + 1 mots y0 , y1 , . . . , y|x| tels que
w = y0 x[1]y1 x[2] . . . y|x|−1 x[|x|]y|x|

Exemple 8 Toujours avec w = algorithmique. Les mots x = amie et


y = aoiie sont des sous-séquences de w

Attention : Sous-séquence 6= sous-mot !


Plan 12

• Introduction

• Définitions de base : mots et autres . . .

• À partir de mots

• Période et bord

• Recherche de motif ou pattern matching


Période 13

Définition 11 (Période) Une période d’un mot w est un entier


0 < p 6 |w| tel que

∀i ∈ {1, . . . , |w| − p} w[i] = w[i + p]

On note period(w) la plus petite période de w

Exemple 9 Les périodes de aataataa (de longueur 8) sont 3, 6, 7 et 8


Période 13

Définition 11 (Période) Une période d’un mot w est un entier


0 < p 6 |w| tel que

∀i ∈ {1, . . . , |w| − p} w[i] = w[i + p]

On note period(w) la plus petite période de w

Exemple 9 Les périodes de aataataa (de longueur 8) sont 3, 6, 7 et 8

a a t a a t a a
Période 3 a a t a a t a a
Période 6 a a t a a t a a
Période 7 a a t a a t a a
Période 8 a a t a a t a a
1 2 3 4 5 6 7 8
Propriétés des périodes 14

Proposition 1 Soient x un mot non vide et p un entier tel que


0 < p 6 |x|. Alors les 5 propriétés suivantes sont équivalentes :

1. L’entier p est une période de x

2. Il existe deux mots u et v 6=  et un entier k > 0 tels que


x = (uv)k u avec |uv| = p

3. Il existe un mot t et un entier k > 0 tels que x est un préfixe de


tk avec |t| = p

4. Il existe trois mots u, v et w tels que x = uw = wv et |u| = |v| = p

5. Il existe un mot t tel que x est préfixe de tx et |t| = p


Bord 15

Définition 12 (Bord) Un bord du mot x est un facteur de x,


différent de x, qui est à la fois un préfixe et un suffixe de x

Exemple 10 Les bords du mot aataataa sont aataa, aa, a et 


Bord 15

Définition 12 (Bord) Un bord du mot x est un facteur de x,


différent de x, qui est à la fois un préfixe et un suffixe de x

Exemple 10 Les bords du mot aataataa sont aataa, aa, a et 

Remarque : Bord et période sont des notions duales

Périodes Bords
3 aataa
6 aa
7 a
8 
Périodes et bords du mot aataataa de longueur 8
Bord maximal 16

Définition 13 (Bord maximal) Soit x un mot non vide. On note


border(x) le plus grand bord de x
On dit que x est sans bord si border(x) = 
Bord maximal 16

Définition 13 (Bord maximal) Soit x un mot non vide. On note


border(x) le plus grand bord de x
On dit que x est sans bord si border(x) = 

Remarque : Le bord maximal d’un mot est le plus long


chevauchement non trivial quand on essaye de faire coı̈ncider x avec
lui-même
Bord maximal 16

Définition 13 (Bord maximal) Soit x un mot non vide. On note


border(x) le plus grand bord de x
On dit que x est sans bord si border(x) = 

Remarque : Le bord maximal d’un mot est le plus long


chevauchement non trivial quand on essaye de faire coı̈ncider x avec
lui-même

Remarque : Puisque border(x) est strictement plus petit que x, si on


itère le processus on finit par tomber sur le mot vide .
Propriétés des bords 17

Proposition 2 Soit x un mot et k > 0 le plus petit entier tel que


borderk (x) est vide. Alors

(border(x), border2 (x), . . . , borderk (x))

est la suite de tous les bords de x ordonnés par longueur décroissante,


et
(|x| − |border(x)|, |x| − |border2 (x)|, . . . , |x| − |borderk (x)|)
est l’ensemble de toutes les périodes de x en ordre croissant
Propriétés des bords 17

Proposition 2 Soit x un mot et k > 0 le plus petit entier tel que


borderk (x) est vide. Alors

(border(x), border2 (x), . . . , borderk (x))

est la suite de tous les bords de x ordonnés par longueur décroissante,


et
(|x| − |border(x)|, |x| − |border2 (x)|, . . . , |x| − |borderk (x)|)
est l’ensemble de toutes les périodes de x en ordre croissant

Remarque : On a exactement period(x) = |x| − |border(x)|


Périodicité 18

Les résultats suivants sont utilisés dans les preuves combinatoires sur
les mots.

Lemme 1 (Périodicité faible) Soient p et q deux périodes d’un mot


x. Si p + q 6 |x|, alors pgcd(p, q) est aussi une période de x.

Lemme 2 (Périodicité) Soient p et q deux périodes d’un mot x. Si


p + q − pgcd(p, q) 6 |x|, alors pgcd(p, q) est aussi une période de x.
Plan 19

• Introduction

• Définitions de base : mots et autres . . .

• À partir de mots

• Période et bord

• Recherche de motif ou pattern matching


La recherche de motif ou pattern matching 20

• Le problème le plus fondamental en algorithmique du texte est


le pattern matching, ou recherche de motif dans un texte
La recherche de motif ou pattern matching 20

• Le problème le plus fondamental en algorithmique du texte est


le pattern matching, ou recherche de motif dans un texte

• Il est nécessaire pour accéder à l’information


La recherche de motif ou pattern matching 20

• Le problème le plus fondamental en algorithmique du texte est


le pattern matching, ou recherche de motif dans un texte

• Il est nécessaire pour accéder à l’information

• Il est comparable, en terme d’utilité, aux tris sur les structures


de données, ou aux opérations arithmétiques . . .
La recherche de motif ou pattern matching 20

• Le problème le plus fondamental en algorithmique du texte est


le pattern matching, ou recherche de motif dans un texte

• Il est nécessaire pour accéder à l’information

• Il est comparable, en terme d’utilité, aux tris sur les structures


de données, ou aux opérations arithmétiques . . .

• L’expression la plus simple du problème : on recherche une


chaı̂ne de caractères de longueur m, le motif ou pattern, dans
une autre chaı̂ne de caractères de longueur n > m, le texte
La recherche de motif ou pattern matching 20

• Le problème le plus fondamental en algorithmique du texte est


le pattern matching, ou recherche de motif dans un texte

• Il est nécessaire pour accéder à l’information

• Il est comparable, en terme d’utilité, aux tris sur les structures


de données, ou aux opérations arithmétiques . . .

• L’expression la plus simple du problème : on recherche une


chaı̂ne de caractères de longueur m, le motif ou pattern, dans
une autre chaı̂ne de caractères de longueur n > m, le texte

• La longueur du motif et celle du texte peuvent être très grandes


⇒ il est impératif de considérer la complexité des algorithmes
Quels types de recherche ? 21

Le motif peut être décrit simplement (motif exact) ou de manière à


désigner plusieurs chaı̂nes de caractères (motif approché)
Quels types de recherche ? 21

Le motif peut être décrit simplement (motif exact) ou de manière à


désigner plusieurs chaı̂nes de caractères (motif approché)

• Recherche d’expression régulière (regexp) (grep)


Quels types de recherche ? 21

Le motif peut être décrit simplement (motif exact) ou de manière à


désigner plusieurs chaı̂nes de caractères (motif approché)

• Recherche d’expression régulière (regexp) (grep)

• Recherche de répétitions ou plus généralement de régularité


(sed)
Quels types de recherche ? 21

Le motif peut être décrit simplement (motif exact) ou de manière à


désigner plusieurs chaı̂nes de caractères (motif approché)

• Recherche d’expression régulière (regexp) (grep)

• Recherche de répétitions ou plus généralement de régularité


(sed)

• Recherche de motifs multiples (awk)


Quels types de recherche ? 21

Le motif peut être décrit simplement (motif exact) ou de manière à


désigner plusieurs chaı̂nes de caractères (motif approché)

• Recherche d’expression régulière (regexp) (grep)

• Recherche de répétitions ou plus généralement de régularité


(sed)

• Recherche de motifs multiples (awk)

• Recherche de motifs arborescents (lex)


Quels types de recherche ? 21

Le motif peut être décrit simplement (motif exact) ou de manière à


désigner plusieurs chaı̂nes de caractères (motif approché)

• Recherche d’expression régulière (regexp) (grep)

• Recherche de répétitions ou plus généralement de régularité


(sed)

• Recherche de motifs multiples (awk)

• Recherche de motifs arborescents (lex)

• Comparaison de textes : plus longue sous-séquence commune


(PLSC) (diff) ou calcul de la distance d’édition (diff -ed)
Recherche de motif exact 22

Voici le problème que nous allons aborder lors des prochaines


séances :

Trouver toutes les occurrences d’un motif P de longueur m à


l’intérieur d’un texte T de longueur n
Recherche de motif exact 22

Voici le problème que nous allons aborder lors des prochaines


séances :

Trouver toutes les occurrences d’un motif P de longueur m à


l’intérieur d’un texte T de longueur n

1. Algorithme naı̈f

2. Algorithmes de Morris-Pratt (MP) et Knuth-Morris-Pratt


(KMP)

3. Algorithme de Boyer-Moore

4. Tour d’horizon des autres algorithmes de recherche exacte de


motif

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