Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira

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Última atualização do currículo em 16/01/2019

Bacharel em Biomedicina pela Universidade Federal do Rio Grande do Norte (2014), onde desenvolveu
pesquisa com ênfase em bioinformática aplicada a ácidos nucleicos. Mestre em bioquímica pelo Programa de
Pós-Graduação em Bioquímica, da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (2017). Atualmente aluno de
doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática pela mesma universidade. (Texto informado pelo
autor)

Identificação
Nome Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira
Nome em citações bibliográficas OLIVEIRA, R. A. C.;OLIVEIRA, RAFFAEL AC;OLIVEIRA, RAFFAEL A.C.;AZEVEDO,
R.;OLIVEIRA, RAFFAEL AZEVEDO DE CARVALHO

Endereço
Endereço Profissional Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Instituto Metrópole Digital, Centro
Multiusuário de Bioinformática - BioME.
Avenida Odilon Gomes de Lima
Capim Macio
59078400 - Natal, RN - Brasil
Telefone: (84) 33422216
Ramal: 123

Formação acadêmica/titulação
2017 Doutorado em andamento em Bioinformática.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin.
2015 - 2017 Mestrado em Bioquimica.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Título: Análise Evolutiva do Sistêma Gênico Antioxidante de Arabidopsis thaliana,Ano de
Obtenção: 2017.
Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES,
Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2010 - 2014 Graduação em Biomedicina.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Título: Identificação de variações em sequências de ácidos nucleicos utilizando curvas de
desnaturação de RNA simples-fita: uma abordagem in silico.
Orientador: Daniel Carlos Ferreira Lanza.

Formação Complementar
2018 - 2018 Integração de Dados e Biologia de Sistemas. (Carga horária: 6h).
Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.
2017 - 2017 Dominando o Terminal Linux - Curso de Bash. (Carga horária: 5h).
eAD Diolinux, EAD DIOLINUX, Brasil.
2011 - 2011 Minicurso de Perícia Criminal. (Carga horária: 10h).
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
2010 - 2010 Minicurso de Reflexologia. (Carga horária: 15h).
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Atuação Profissional

Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.

Vínculo institucional
2017 - Atual Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40, Regime:
Dedicação exclusiva.
Vínculo institucional
2015 - 2017 Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrando, Carga horária: 40, Regime:
Dedicação exclusiva.
Vínculo institucional
2013 - 2015 Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

Projetos de pesquisa
2017 - Atual Construção de rede transcricional para a identificação de reguladores mestres de sepse
humana utilizando dados transcricionais de repositórios públicos
Descrição: A sepse é uma síndrome complexa, disparada pela infecção microbiana e
induzida pela ativação sistêmica de múltiplas vias de resposta inflamatória, resultando na
disfunção aguda de alguns órgãos e culminando em falência múltipla (Rinaldi et al., 2009).
Levando em conta as características complexas da progressão da doença, a avaliação
sistêmica da atividade transcricional destes pacientes pode auxiliar na compreensão da
fisiopatologia da doença. A construção das redes regulatórias específicas à doença
possibilitará a identificação dos principais fatores de transcrição envolvidos na progressão
do quadro patológico. A aplicação dessa metodologia poderá auxiliar não só na
compreensão da sepse como também na indicação de possíveis estratégias de
intervenção. A avaliação da sepse sob uma óptica de biologia de sistemas pode contribuir
na compreensão da doença por trazer uma visão de quais os sistemas celulares estão
sendo modulados no processo de progressão da resposta fisiológica do paciente, ao invés
da identificação de quais genes estão sendo mais ou menos transcritos. Embora
aparentemente sutil, a diferença entre estas duas abordagens reflete diretamente no
entendimento organizacional da resposta do paciente frente à patologia. Da mesma forma,
a reconstrução da rede regulatória da doença possibilitará a eleição de qual fator de
transcrição está envolvido na modulação dos sistemas celulares responsivos à sepse.
Assim, não só teremos uma maior compreensão dos sistemas celulares envolvidos na
fisiopatologia da sepse, como também poderemos abordar a regulação destes sistemas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira - Integrante / Rodrigo Juliani Siqueira

Dalmolin - Coordenador.
2015 - 2017 Análise evolutiva do sistema de peroxidases classe III utilizando Arabdopsis thaliana como
modelo vegetal
Descrição: As peroxidases de classe III (EC 1.11.17) constituem um amplo grupo de
isoenzimas exclusivas de plantas, responsáveis pelas mais diversas funções, desde a
formação de ligações cruzadas de lignina, no fortalecimento da parede celular, proteção
contra patógenos e remoção de espécies reativas de oxigênio (EROs). Diferentes
espécies apresentam números variáveis de isoenzimas. Esta abundância variada reflete
etapas evolutivas diferentes, que determinadas espécies passam, em detrimento de
outras. O modelo estudado neste projeto, Arabidopsis thaliana, possui 73 isoenzimas
catalogadas, de acordo com o PeroxiBase. O objetivo do projeto é compreender como
evoluiram as diferentes isoenzimas de peroxidases classe III em Arabidopsis, inferindo a
origem evolutiva de cada isoenzima utilizando ferramentas de ontologia, como o Gene
Ontology e o STRINGdb. A compreensão da origem evolutiva pode elucidar a função de
algumas das isoenzimas das peroxidases classe III (que hoje têm apenas funções
preditas anotadas, baseadas em estrutura), bem como compreender como estas enzimas
se comportam nos sistemas redox de plantas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira - Integrante / Rodrigo Juliani Siqueira

Dalmolin - Coordenador / Danilo Oliveira Imparato - Integrante.
2013 - 2014 Estudo de regiões estáveis no genoma do IMNV: filogenia molecular e identificação
genética.
Descrição: A Mionecrose infecciosa doença é uma das principais doenças virais que
acomete a carcinicultura na região nordeste desde o seu surgimento. Estima-se uma
perda de aproximadamente 105.000 (cento e cinco mil) toneladas de camarão por ação da
IMN desde o surgimento da doença até 2005, com prejuízos próximos a 400 milhões de
dólares naquele período (Rocha, 2005a,b; Madrid, 2005a,b). Uma das grandes
 dificuldades existentes hoje para identificação do IMNV e que nem sempre sua presença é
indicada por sinais clínicos nos estágios iniciais de infecção, e os prejuízos só são
constatados tardiamente, quando já foram consumidos mais recursos e mais tempo,
aumentando muito os prejuízos. Além disso, nenhum dos sistemas existentes hoje para a
identificação do IMNV por PCR levou em consideração a variabilidade genética do vírus
para o seu desenvolvimento. A realização deste projeto é fundamental para o
desenvolvimento de um sistema para identificação genética do IMNV. A partir do estudo
das regiões do genoma e da filogenia, será possível o desenvolvimento de um sistema
robusto para identificação do vírus. Sob o aspecto ambiental, a importância deste projeto
se justifica principalmente considerando que o IMNV é um vírus endêmico do Brasil
(Lightner et al., 2004ab; Poulos et al., 2006) e muito pouco se sabe sobre sua biologia. A
partir desses estudos poderão surgir indícios sobre a origem e os possíveis reservatórios
naturais do vírus..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .

Integrantes: Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira - Integrante / Daniel Carlos Ferreira

Lanza - Coordenador.

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Idiomas
Português Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Inglês Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Produções

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos

Ordenar por

Ordem Cronológica

1. XAVIER, LUÍZA ARAÚJO DA COSTA ; BEZERRA, JOÃO FELIPE ; DE REZENDE, ADRIANA AUGUSTO ;
OLIVEIRA, RAFFAEL AZEVEDO DE CARVALHO ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA ; DO AMARAL, VIVIANE
SOUZA . Analysis of genome instability biomarkers in children with non-syndromic orofacial clefts. Mutagenesis , v. 00, p.
gew068, 2017.
2. AMARAL, V.S. ; XAVIER, L.A. ; BEZERRA, J.F. ; REZENDE, A.A. ; AZEVEDO, R. ; DALMOLIN, R.J. . Genome
instability biomarkers in children with non-syndromic orofacial clefts. Toxicology Letters , v. 258, p. S295, 2016.
3. DANTAS, MÁRCIA DANIELLE A. ; CAVALCANTE, GUSTAVO HENRIQUE O. ; OLIVEIRA, RAFFAEL A.C. ; LANZA,
DANIEL C.F. . New insights about ORF1 coding regions support the proposition of a new genus comprising arthropod
viruses in the family Totiviridae. Virus Research (Print) , v. 211, p. 159-164, 2015.
Citações: 3 | 3
4. OLIVEIRA, RAFFAEL AC; ALMEIDA, RICARDO VM ; DA DANTAS, MÁRCIA ; CASTRO, FELIPE N ; LIMA,
JOÃO PAULO ; LANZA, DANIEL CF . In silico single strand melting curve: a new approach to identify nucleic acid
polymorphisms in Totiviridae. BMC Bioinformatics , v. 15, p. 243, 2014.
Citações: 1 | 3

Resumos publicados em anais de congressos

1. OLIVEIRA, R. A. C.; DALMOLIN, R.J.S. . Construção e análise sistêmica da rede regulatória da sepse. In: III Simpósio
Norte-Nordeste de Bioinformática, 2018, Recife. Anais do III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2018. v. 3. p. 26-
26.
2. Reis, C.F. ; Souza, I. D. ; Morais, D.A.A. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; DALMOLIN, R.J.S. . Chumbo grosso -
Transcriptogramer analisa o efeito progressivo da intoxicação por chumbo nos sistemas genéticos de células progenitoras
neurais. In: III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2018, Recife. Anais do III Simpósio Norte-Nordeste de
Bioinformática, 2018. v. 3. p. 115-115.
3.
 IMPARATO, D. O. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; ANDRADE, A. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; DALMOLIN, R.J.S. . Power law
correlation between gene connectivity and number of citations. In: 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de
Bioquímica e Biologia Molecular, 2016, Natal. 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia
Molecular, 2016.
4. ANDRADE, A. S. ; SOUZA, N. C. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; PASQUALI, M. A. B. ; JERONIMO, S. M. B. ;
DALMOLIN, R.J. . Macrophage antioxidant mechanisms modulation in Leishmanis infection. In: 45a Reunião Anual da
Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular,, 2016, Natal. 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de
Bioquímica e Biologia Molecular,, 2016.
5. OLIVEIRA, R. A. C.; IMPARATO, D. O. ; LIMA, J. G. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; LIMA, J. P. M. S. ; DALMOLIN, R.J. .
Antioxidant Gene Network of Arabidopsis thaliana and its response towards heat stress. In: 45a Reunião Anual da
Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular,, 2016, Natal. 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de
Bioquímica e Biologia Molecular,, 2016.
6. OLIVEIRA, R. A. C.; IMPARATO, D. O. ; LIMA, J. G. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; LIMA, J. P. M. S. ; DALMOLIN, R.J.S. . A
Systems Biology Approach to Characterize Arabidopsis thaliana antioxidant network. In: I Simpósio Norte-Nordeste de
Bioinformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática - Livro de Resumos, 2016.
7. IMPARATO, D. O. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; ANDRADE, A. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; DALMOLIN, R.J.S. . Gene citations and
number of interactions follow a power law. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-
Nordeste de BioInformática - Livro de Resumos, 2016.
8. ANDRADE, A. S. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; PASQUALI, M. A. B. ; DALMOLIN, R.J.S. . Macrophage redox
metabolism activation during Leishmania infection. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio
Norte-Nordeste de BioInformática - Livro de Resumos, 2016.
9. DANTAS, M. D. A. ; CAVALCANTE, G. H. O. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; LANZA, D. C. F. . New Evidences Support the
Proposition of a New Genus Comprising Arthropod Viruses in the Family Totiviridae. In: 45a. Reunião Anual a Sociedade
Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2016, Natal. 45a. Reunião Anual a Sociedade Brasileira de
Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2016.
10. OLIVEIRA, R. A. C.; IMPARATO, D. O. ; LIMA, J. G. S. ; LIMA, J. P. M. S. ; DALMOLIN, R.J.S. . Functional Analysis of
Arabidopsis thaliana antioxidant gene network. In: I SB-Meeting - From Algorithms to Disease: Translational Research in
Bioinformatics and Systems Biology, 2016, Natal. I SB-Meeting Abstract Book, 2016.
11. OLIVEIRA, R. A. C.; LIMA, J. G. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; LIMA, J. P. M. S. ; DALMOLIN, R.J.S. . ANALYSIS OF
INTEGRATIVE ANTIOXIDANT GENES IN A PROTEIN-PROTEIN INTERACTION NETWORK OF Arabidopsis sp. FROM
PUBLIC DATABASES. In: 23rd Congress of the International Union for Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB), 2015,
Foz do Iguaçu. Abstracts Book, 2015.
12. DANTAS, M. D. A. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; SILVA, D. C. D. ; NUNES, A. R. D. ; LANZA, D. C. F. . Detecção de vírus que
acometem a carcinicultura. In: 3º Congresso FAPERN de CTI, 2014, Natal. Ciência Sempre - Revista FAPERN, 2014. v. 28.
p. 54.
13. DANTAS, M. D. A. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; ALMEIDA, R. V. M. ; CASTRO, F. N. ; TEIXEIRA, D. I. A. ; LIMA, J. P. M. S. ;
LANZA, D. C. F. . Infectious Myonecrosis Virus: Phylogenetic Analisys and New Insights about Genome Organization. In: XII
Reunião Regional Nordeste da SBBq, 2014, Natal. XII Reunião Regional Nordeste da SBBq, 2014.
14. OLIVEIRA, R. A. C.; DANTAS, M. D. A. ; ALMEIDA, R. V. M. ; LIMA, J. P. M. S. ; LANZA, D. C. F. . Identifying variations in
nucleic acid sequences using in silico single strand melting curve. In: X-Meeting, 2013, Recife. BSB & X-Meeting Abstract
Book, 2013.

Apresentações de Trabalho
1. DANTAS, M. D. A. ; CAVALCANTE, G. H. O. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; LANZA, D. C. F. . New Evidences Support the
Proposition of a New Genus Comprising Arthropod Viruses in the Family Totiviridae. 2016. (Apresentação de
Trabalho/Congresso).
2. DANTAS, M. D. A. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; ALMEIDA, R. V. M. ; CASTRO, F. N. ; TEIXEIRA, D. I. A. ; LANZA, D. C. F. .
Infectious Myonecrosis Virus: Phylogenetic Analisys and New Insights about Genome Organization. 2014. (Apresentação de
Trabalho/Congresso).

Eventos

Participação em eventos, congressos, exposições e feiras

1. III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.Construção e análise sistêmica da rede regulatória da sepse. 2018.
(Simpósio).
2. III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.Construção e análise sistêmica da rede regulatória da sepse. 2018.
(Simpósio).
3. I Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.A Systems Biology Approach to Characterize Arabidopsis thaliana Antioxidant
Network. 2016. (Simpósio).
4. SB-Meeting.Functional Analysis of Arabidopsis thaliana antioxidant gene network. 2016. (Simpósio).
5. XIV SIMPÓSIO DO CENTRO DE BIOCIÊNCIAS: BIOECONOMIA: IMPACTOS DA BIOTECNOLOGIA NO
DESENVOLVIMENTO REGIONAL.Análise evolutiva da rede gênica antioxidante de Arabidopsis thaliana. 2016. (Simpósio).
6. SBBQ - IUBMB. Analysis of integrative antioxidant genes in a protein-protein interaction network of Arabidopsis thaliana
from public databases. 2015. (Congresso).
7. I Simposío de Inovação e Pós-Graduação. 2014. (Simpósio).
8. V Encontro Nacional das Licensiaturas.SID - AVALIAÇÃO DA EXPECTATIVA DOS MONITORES INTEGRADOS EM
GENÉTICA E DE BIOLOGIA CELULAR E MOLECULAR NA UFRN DO PONTO DE VISTA DOS ACADÊMICOS. 2014.
 (Seminário).
9. XXV CICT Congresso de Iniciação Científica da UFRN. Estudo de regiões estáveis nos genoma de vírus da família
Totiviridae: filogenia molecular e identificação genética.. 2014. (Congresso).
10. X-Meeting. Identifying variations in nucleic acid sequences using in silico single strand melting curve. 2013. (Congresso).

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