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Reporte sobre la construcción manual de moléculas orgánicas, y construcción y

optimización de la geometría de las mismas mediante el uso de apps en


teléfonos móviles.

Las propiedades químicas de un elemento se determinan mediante el número de


protones en el núcleo y el número de electrones alrededor de éste. Los electrones
forman enlaces y determinan la estructura de las moléculas.

Los electrones que están alrededor del núcleo se encuentran en orbitales. Un orbital es
́ permitido para un electrón. El principio de incertidumbre de
un estado de energia
Heisenberg establece que nunca podremos determinar en dónde se encuentra un
electrón, pero podemos determinar la probabilidad de encontrar al electrón en una
parte especif́ ica de un orbital. Los orbitales atómicos se agrupan en distintas capas a
diferentes distancias del núcleo. Cada capa se identifica mediante un número cuántico
́ y más cercana al núcleo. En
principal (n) con n = 1 para la capa de menor energia
́ y son capaces de albergar a
medida que n aumenta, los orbitales tienen mayor energia
más electrones.

La primera capa electrónica sólo contiene al orbital 1s .Todos los orbitales s son
simétricamente esféricos, osea que son no direccionales.

La segunda capa electrónica consiste en los orbitales 2s y 2p. El orbital 2s es simétri


camente esférico como el orbital 1s.

La segunda capa también contiene tres orbitales atómicos 2p, orientados en cada una
de las tres direcciones espaciales. Estos orbitales son 2px, 2py y 2pz, de acuerdo con
la dirección que tomen en los ejes x, y , z. Los orbitales 2p tienen mayor energia
́ que
los 2s, ya que la ubicación de un electrón en un orbital 2p se encuentra más alejada del
núcleo.

En química orgánica, la hibridación es la interacción de orbitales atómicos puros dentro


de un átomo para formar nuevos orbitales híbridos equivalentes con orientaciones
determinadas en el espacio. Los orbitales híbridos son los que se superponen en la
formación de los enlaces. Existen 3 tipos de orbitales hibridos ( sp , sp2, sp3).

́ rido sp tiene su densidad electrónica concentrada en un lado del átomo.


El orbital hib
́ ridos tienen una mayor densidad electrónica en la región en la que
Estos orbitales hib
forman un enlace sigma a la izquierda y a la derecha del atomo, tienen un ángulo de
enlace de 180° y los electrones se encuentran lo más separados posible. Normalmente
la hibridación sp da como resultado un enlace lineal.

Figura 1. Orbital sp.

Los orbitales sp2 están formados por un orbital s y dos orbitales p. Estos orbitales
tienen una orientación de 120º a este arreglo se le conoce como geometría trigonal.
Figura 2. Orbital sp2.

Los orbitales sp3 están compuestos de un orbital s con tres orbitales p. Tienen la forma
de un tetraedro y tienen angulos de enlace de 109.5 º.

Figura 3. Orbital sp3.

Al construir los modelos atómicos a no tome en cuenta los ángulos que habían en los
enlaces a diferencia de mis compañeros que si lo hicieron. A mi aun se me dificulta
relacionar el modelo a mano con la representación linear de cuñas.

El software de molecular constructor tiene una interfaz muy amigable. Al momento de


construir los compuestos no tome en cuenta la geometría y los angulos que este tenia
que llevar.El botón Shaping del software le da al compuesto la estructura (geometría,
ángulos) que debe tener de acuerdo a las moléculas y al tipo de enlace que agregues.
El modelo generado por molecular constructor es mucho más exacto que el que yo
realice a mano. Cuando se trata de dibujar moléculas tridimensionales, la
representación linear de cuñas te da una vaga idea de la geometría del compuesto ya
que dependiendo del tipo de línea que se traza tienes una perspectiva de la
profundidad que tiene dicho compuesto. Si fue mas fácil relacionar el modelo virtual con
cuñas.

Modelos hechos a mano:

Ejercicio: Construya el nucelótido ATP con molecular constructor (enviar una captura
de pantalla en su reporte).
Bibliografía:

L.G. Wade, Jr. (2011). QUÍ MICA ORGÁNICA. México: Pearson.